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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1221 | 2026-04-27 |
Comprehensive Multi-Omics Characterization of CYP2R1 as a Diagnostic and Functional Biomarker in Hepatocellular Carcinoma
2026-Apr-01, Medical sciences (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/medsci14020178
PMID:42029602
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研究论文 | 系统分析了57个CYP基因在肝细胞癌中的表达,发现CYP2R1作为诊断和功能生物标志物具有高准确性和预后价值 | 首次全面描绘CYP基因家族在肝细胞癌中的失调图谱,并鉴定CYP2R1为连接代谢、DNA修复和免疫调节的新型生物标志物 | 未提及具体局限性 | 鉴定肝细胞癌中可靠分子生物标志物并阐明其功能意义 | 肝细胞癌患者多队列转录组数据 | 数字病理学, 机器学习 | 肝癌 | 转录组测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多队列数据,具体样本量未提供 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1222 | 2026-04-27 |
Exploring the immune environment of glioblastoma in humanized mouse models
2026-Mar-30, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag073
PMID:41913047
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研究论文 | 通过建立人源化小鼠模型,探索胶质母细胞瘤的免疫微环境 | 首次利用表达关键人细胞因子的免疫缺陷小鼠模型,结合患者来源异种移植物和单细胞RNA测序,成功构建了模拟复发胶质母细胞瘤免疫特征的人源化小鼠模型 | 未明确提及具体局限性,但可能包括模型对肿瘤异质性复制的有限性和人源化小鼠免疫系统完全重建的挑战 | 建立能够模拟人类复发胶质母细胞瘤免疫环境的动物模型,以促进新疗法特别是免疫疗法的研究 | 胶质母细胞瘤患者来源的异种移植物及人源化小鼠中的肿瘤和免疫细胞 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 未明确提及具体样本数量,涉及多个人源化小鼠模型和患者数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 1223 | 2026-04-27 |
A Composite interaction Score: Prioritizing cell-cell interactions from single-cell RNA-seq with application to pre-menopausal epithelial barriers
2026-Mar-22, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.046
PMID:41875947
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研究论文 | 提出Composite Interaction Score (CIS)方法,整合六种细胞-细胞相互作用预测工具,优先排序来自单细胞RNA-seq的相互作用 | 通过排名偏差精度加权工具间一致性,强调排名列表顶部的一致性,优于简单平均值基线,并应用于上皮屏障组织 | 未明确提及局限性 | 开发优先排序细胞-细胞相互作用的共识策略,强调可重复性和生物学相关性 | 肠、皮肤和子宫的上皮屏障组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 来自肠、皮肤和子宫的单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1224 | 2026-03-18 |
Single-cell sequencing combined with transcriptome sequencing to reveal the molecular mechanisms related to integrated stress responses in atherosclerosis
2026-Mar-17, Journal of cardiothoracic surgery
IF:1.5Q3
DOI:10.1186/s13019-026-03862-y
PMID:41840716
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1225 | 2026-03-19 |
Single-cell transcriptome analysis reveals DNMT1+ epithelial cells promote lymphatic metastasis via CXCL17-mediated TAM infiltration
2026-Mar-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08032-1
PMID:41845371
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1226 | 2026-04-27 |
AGPAT3 reshapes tumor cell vulnerability to IFNγ-mediated ferroptosis and enhances immunotherapy efficacy through lipid remodeling
2026-Mar-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013305
PMID:41807033
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研究论文 | 本研究揭示了AGPAT3通过脂质重塑调控肿瘤细胞对IFNγ介导的铁死亡易感性,并增强免疫检查点抑制剂疗效的机制 | 首次发现IFN-γ-IRF1-AGPAT3轴通过脂质重塑促进铁死亡,并构建了基于铁死亡相关基因的机器学习预测模型以提升免疫治疗效果 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,临床样本分析有限,且未深入探讨AGPAT3在其他免疫微环境细胞中的作用 | 探究铁死亡在增强免疫检查点抑制剂疗效中的潜力及其分子机制 | 肿瘤细胞(涉及IFN-γ信号通路和铁死亡敏感性) | 机器学习, 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 脂质组学, 转录组学, ChIP-seq, CUT&Tag | 机器学习模型(针对铁死亡相关基因) | 单细胞RNA测序数据, 脂质组数据, 转录组数据 | 大型单细胞RNA测序数据集(具体样本量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1227 | 2026-04-27 |
Dissecting the differentiation origins of intestinal metaplasia and early intestinal-type gastric cancer in gastric antrum by single-cell RNA profiling
2026-Mar-10, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01355-8
PMID:41807518
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序剖析胃窦肠上皮化生和早期肠型胃癌的分化起源 | 首次通过单细胞测序详细描绘了胃疾病不同阶段(非萎缩性胃炎、慢性萎缩性胃炎、肠上皮化生和早期肠型胃癌)中上皮细胞的分化轨迹,揭示了祖细胞、腺体粘液细胞和凹坑粘液细胞在不同阶段的分化潜能,并鉴定出KIAA0101PRAP1祖细胞可能是早期肠型胃癌的潜在起源 | 尚未明确阐述不同疾病阶段细胞分化的分子机制及其致癌潜力的具体调控通路 | 探讨胃疾病不同阶段的细胞分化起源及其致癌潜力,为肠型胃癌的分子机制研究提供新见解 | 胃窦活检组织中的上皮细胞,包括祖细胞、腺体粘液细胞、凹坑粘液细胞、肠样干细胞表型细胞、成熟肠细胞、分泌前细胞和杯状细胞等 | 单细胞转录组学 | 肠型胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自具有癌前病变和早期胃癌患者的胃窦活检样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1228 | 2026-04-27 |
The changing landscape of gene expression analysis
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag185
PMID:42028808
|
述评 | 综述了基因表达分析在过去25年中的技术演进,并展望了未来发展方向 | 通过分析707,831篇开放获取全文文章,将计算工具映射到统一时间线,并提出了三个未来方向:可搜索的转录组知识库、基因表达分析基础模型和可编程调控设计 | 未明确讨论现有技术在实际应用中的成本、可重复性和临床转化挑战 | 梳理基因表达分析的方法学里程碑和计算工具演进,并预测未来趋势 | 707,831篇开放获取全文文章中的生物信息学计算工具和文献计量学数据 | 自然语言处理, 机器学习 | NA | 表达序列标签, 微阵列, RNA测序, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | 统计学框架, 端到端分析生态系统 | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1229 | 2026-04-27 |
Metformin inhibits proliferation of residing fibroadipogenic progenitor cells from failing human hearts
2026-Feb-03, ESC heart failure
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/eschf/xvag001
PMID:41711740
|
研究论文 | 研究二甲双胍对人衰竭心脏中纤维脂肪祖细胞增殖的抑制作用 | 首次利用11C-二甲双胍PET成像在HFrEF患者中评估心肌二甲双胍分布,并通过单细胞RNA测序鉴定出心脏FAPs是二甲双胍的作用靶点 | 样本量较小,仅纳入7名HFrEF患者和4例对照心脏;体外实验可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探索二甲双胍在射血分数降低的心力衰竭(HFrEF)中的作用机制 | 7名HFrEF患者和4例对照心脏的细胞 | 机器学习和数字病理学 | 心血管疾病 | PET成像、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术 | NA | 图像、测序数据 | 7名HFrEF患者(平均射血分数36 ± 8%,中位年龄67岁)和4例对照人类心脏 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1230 | 2026-04-27 |
Ranitidine protects Müller cells against ferroptosis in diabetic retinopathy by regulating the AKT1/GSK3β pathway
2026-02-01, Indian journal of ophthalmology
IF:2.1Q2
DOI:10.4103/IJO.IJO_1522_25
PMID:41581041
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research paper | 研究雷尼替丁通过AKT1/GSK3β通路调控糖尿病视网膜病变中Müller细胞铁死亡的机制 | 首次揭示雷尼替丁通过AKT1/GSK3β信号通路抑制高糖诱导的Müller细胞铁死亡,为糖尿病视网膜病变治疗提供新靶点 | 仅限于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证,且未探讨临床患者样本的适用性 | 探索雷尼替丁对糖尿病视网膜病变的保护作用及潜在分子机制 | 小鼠视网膜Müller细胞系(rMC-1)和糖尿病小鼠 | machine learning | diabetic retinopathy | 单细胞测序, 网络药理学, 蛋白质印迹 | NA | 单细胞转录组数据, 细胞实验数据 | 使用rMC-1细胞系和糖尿病小鼠模型 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | SPIED3平台用于药物靶点预测 |
| 1231 | 2026-04-27 |
Epigenetic Programming of Macrophage Phenotypes by STING-IRF3 Drives Inflammation in Ascending Thoracic Aortic Dissection
2026-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.22.701198
PMID:41648393
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研究论文 | 该研究通过单细胞多组学技术揭示STING-IRF3信号轴介导的巨噬细胞表观遗传重编程驱动升主动脉夹层炎症 | 首次阐明STING-IRF3信号通过协调BRG1依赖的染色质开放和关闭,同时促进促炎基因程序并抑制吞噬基因表达,从而驱动巨噬细胞表观遗传重编程 | NA(摘要未明确提及局限性) | 探究表观遗传重编程是否调控巨噬细胞表型命运并促进升主动脉夹层发病机制 | 人类升主动脉组织(对照、升主动脉瘤患者、急性升主动脉夹层患者)和血管紧张素II输注的小鼠模型 | 单细胞组学 | 升主动脉夹层 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、单细胞染色质可及性数据、空间转录组数据 | 人类:对照、升主动脉瘤患者和急性升主动脉夹段患者;小鼠:Ang II输注模型及巨噬细胞特异性Sting-/-和Irf3-/-小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 | 10x Chromium | 用于单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序的10x Chromium平台 |
| 1232 | 2026-04-27 |
Network Hypoactivity in ALG13-CDG: Disrupted Developmental Pathways and E/I Imbalance as Early Drivers of Neurological Features in CDG
2026-01-14, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15020147
PMID:41597222
|
研究论文 | 研究ALG13-CDG中大脑特异性低糖基化对皮质网络功能的影响及其机制 | 首次结合多组学分析和MEA电生理记录,揭示ALG13-CDG中早期网络活动低下、神经元成熟时序异常和E/I失衡导致代偿性过度兴奋的机制 | 未提及 | 探究ALG13-CDG中大脑特异性低糖基化对神经发育路径和皮质网络功能障碍的直接影响 | ALG13-CDG患者来源的诱导多能干细胞分化的皮质类器官 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、糖蛋白质组学、N-聚糖成像、脂质组学、代谢组学、MEA电生理记录 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据、糖组数据、脂质组数据、代谢组数据、电生理数据 | ALG13-CDG患者来源的iPSC和皮质类器官样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'用于单细胞RNA测序 |
| 1233 | 2026-04-27 |
Mitochondrial dysfunction in diabetic cardiomyopathy: a review of pathogenic mechanisms and therapeutic strategies
2026, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2026.1751243
PMID:41908047
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综述 | 本文综述了线粒体功能障碍在糖尿病心肌病发病机制中的核心作用及潜在治疗策略 | 系统阐述了线粒体损伤通过能量代谢紊乱、氧化应激、炎症小体激活及凋亡/铁死亡通路驱动糖尿病心肌病的多维机制,并总结了线粒体靶向治疗的最新进展,包括小分子抗氧化剂、代谢调节剂、基因治疗、干细胞外泌体及生活方式干预 | 未详细讨论各治疗策略的临床试验阶段和具体疗效数据,对新兴技术如单细胞转录组学的应用前景仅作了简要提及 | 阐明线粒体功能障碍在糖尿病心肌病发病机制中的多维作用,并总结线粒体靶向治疗策略的研究进展 | 糖尿病心肌病患者及实验模型中的线粒体功能 | 机器学习 | 心血管疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1234 | 2026-04-27 |
Establishing an atherosclerosis diagnostic model based on WGCNA and machine learning algorithms with key genes in cholesterol metabolism and ferroptosis, and revealing the regulatory role of HMOX1 in cellular ferroptosis
2026, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2026.1715946
PMID:41908043
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研究论文 | 基于WGCNA和机器学习算法建立动脉粥样硬化诊断模型,揭示HMOX1在细胞铁死亡中的调控作用 | 整合胆固醇代谢和铁死亡相关基因,利用三种机器学习算法筛选核心特征基因,构建诊断模型并验证其鉴别能力 | 未提及具体局限性 | 建立动脉粥样硬化诊断模型并识别潜在生物标志物 | 动脉粥样硬化患者及ox-LDL诱导的THP-1细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组测序 | 逻辑回归 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1235 | 2026-04-27 |
Distinct diversity of skin cell populations of rhinophyma and hypertrophic scar illustrated by scRNA-seq
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1703469
PMID:41909715
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示酒渣鼻和肥厚性疤痕皮肤细胞群体的独特多样性 | 首次通过单细胞转录组学比较酒渣鼻与肥厚性疤痕的细胞和分子差异,解释为何酒渣鼻术后能恢复正常而不复发疤痕 | 文中未明确提及研究限制 | 利用单细胞测序技术揭示两种病理状态的细胞和分子差异,以解决临床悖论 | 酒渣鼻和肥厚性疤痕组织中的单细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1236 | 2026-04-27 |
Identification and Experimental Verification Reveal SLC2A3 Associated With Prognosis and Immune Infiltration in Colon Adenocarcinoma
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/8383379
PMID:42029110
|
研究论文 | 通过整合转录组分析鉴定与结肠腺癌预后和免疫浸润相关的parthanatos相关基因,并实验验证SLC2A3的作用 | 首次系统表征parthanatos相关基因在结肠腺癌中的分子亚型,构建基于parthanatos的预后评分系统,并实验验证SLC2A3对肿瘤细胞增殖和侵袭的促进作用 | 体外实验发现SLC2A3可能促进结肠腺癌细胞增殖和侵袭,但需要在其他模型中进行验证 | 阐明parthanatos在结肠腺癌中的临床相关性,并提供新的预后评估和治疗靶向框架 | 结肠腺癌患者 | 机器学习 | 结肠腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | TCGA和GEO队列的多个样本 | Illumina | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 1237 | 2026-04-27 |
Reappraisal of profibrotic phenotype and cell-cycle state of renal tubular epithelium after ischemia-reperfusion injury
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0347835
PMID:42030280
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研究论文 | 重新评估肾小管上皮细胞在缺血再灌注损伤后的促纤维化表型和细胞周期状态 | 发现肾小管上皮细胞的促纤维化表型并非仅由G2/M期阻滞细胞获得,正常细胞周期中的静息G0/G1期细胞也可获得此表型 | 基于小鼠模型和体外实验,可能不完全代表人类慢性肾病的复杂病理过程 | 探究肾小管上皮细胞在缺血再灌注损伤后促纤维化表型与细胞周期阻滞的关系,并为慢性肾病治疗提供新思路 | 肾小管上皮细胞 | 机器学习 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序、体外细胞实验 | NA | 基因表达数据 | γGT.Fucci2aR小鼠单侧缺血再灌注损伤模型;人肾-2细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 使用公开的小鼠单细胞RNA测序数据 |
| 1238 | 2026-04-25 |
Spatial transcriptomics unveils immune cellular ecosystems associated with patient survival in diffuse large B-cell lymphoma
2026-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2026.2660418
PMID:42010788
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示弥漫大B细胞淋巴瘤中与患者生存相关的免疫细胞生态系统 | 首次在空间水平上识别弥漫大B细胞淋巴瘤肿瘤微环境中六种反复出现的细胞生态系统,并发现具有相似免疫细胞丰度的生态系统表现出不同的功能状态和相反的临床关联,揭示了空间背景和局部相互作用对免疫功能的塑造作用 | 作为初步研究,样本量可能有限,且空间转录组技术仍存在分辨率限制,需进一步在更大队列中验证 | 阐明弥漫大B细胞淋巴瘤中恶性细胞和免疫细胞在肿瘤微环境中的空间组织及其对免疫功能和临床预后的影响 | 弥漫大B细胞淋巴瘤患者的原发性组织切片 | 数字病理学 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 超过1000例弥漫大B细胞淋巴瘤患者的独立队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1239 | 2026-04-25 |
Identification and multi-layered experimental validation of feature genes related to butyrate metabolism and oxidative stress in sepsis
2026-Dec, Artificial cells, nanomedicine, and biotechnology
DOI:10.1080/21691401.2026.2658990
PMID:42028810
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研究论文 | 该研究鉴定了与败血症中丁酸代谢和氧化应激相关的特征基因,并通过多层面实验验证了其表达和诊断价值 | 首次系统鉴定败血症中丁酸代谢和氧化应激相关的特征基因,并利用单细胞RNA测序揭示单核细胞在其中的关键作用 | 尚未提及具体限制,但可能存在样本量有限和机制研究不够深入的问题 | 阐明败血症中丁酸代谢和氧化应激相关基因的分子特征,寻找潜在治疗靶点 | 败血症相关基因、丁酸代谢和氧化应激相关基因 | 机器学习 | 败血症 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、CIBERSORT免疫浸润分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞数据 | 多个败血症相关数据集及前瞻性收集的临床样本 | Illumina | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | 未提供具体配置详情 |
| 1240 | 2026-04-25 |
Erchen decoction and its active flavonoids hesperidin and quercetin alleviate high-fat diet-induced neuroinflammation by targeting HK2-mediated microglial glycolysis
2026-Jul-15, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121603
PMID:41921767
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研究论文 | 本研究系统表征了二陈汤的活性植物化学物质,并阐明了其通过靶向HK2介导的小胶质细胞糖酵解缓解高脂饮食诱导的神经炎症的神经保护机制 | 首次揭示了二陈汤的活性成分橙皮苷和槲皮素通过直接结合并抑制己糖激酶2(HK2)、阻断HK2/HIF-1α轴、抑制小胶质细胞Warburg效应,从而缓解高脂饮食诱导的神经炎症的机制,将中医传统“化痰”理论与脑代谢稳态恢复相关联 | NA | 研究二陈汤的神经保护机制,特别是其对肥胖相关神经炎症的调控作用 | 二陈汤及其活性成分橙皮苷和槲皮素对高脂饮食小鼠神经炎症和小胶质细胞糖代谢的影响 | 机器学习 | NA | UPLC-MS,单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟,酶活性检测 | NA | 代谢组学数据,单细胞RNA测序数据 | 雄性C57BL/6J小鼠(数量未在摘要中指定) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |