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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1221 | 2026-01-17 |
The circ_0042103/TAF15/NER axis regulates inflammation and DNA damage in pulpitis
2026-Jan-13, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04817-1
PMID:41530875
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研究论文 | 本研究探讨了环状RNA circ_0042103通过结合TAF15蛋白,降低NER修复蛋白ERCC1和PCNA水平,从而增加DNA损伤和炎症,在牙髓炎进展中形成circ_0042103/TAF15/NER轴的作用机制 | 首次揭示了circ_0042103/TAF15/NER轴在牙髓炎中的调控作用,阐明了环状RNA通过影响DNA损伤修复通路加剧炎症的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;样本量较小,临床相关性需进一步确认 | 探究环状RNA在牙髓炎进展中的功能及其调控DNA损伤和炎症的分子机制 | 炎症牙髓组织、人牙髓干细胞(hDPSCs) | 分子生物学 | 牙髓炎 | 微阵列、单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blot、生物信息学分析、RNA FISH、pull-down实验、核质分离实验 | NA | RNA测序数据、基因表达数据、蛋白质印迹数据 | 未明确具体样本数量,涉及炎症牙髓组织和hDPSCs细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1222 | 2026-01-17 |
Fibroblast-derived alarmin promotes oral wound healing by activating regulatory T cells that relay pro-angiogenic and anti-inflammatory responses
2026-Jan-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116829
PMID:41533514
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研究论文 | 本研究揭示了口腔成纤维细胞通过分泌警报素IL-33激活调节性T细胞,从而促进血管生成和抗炎反应,加速口腔伤口愈合的机制 | 首次在小鼠口腔损伤模型中鉴定出PI16网状成纤维细胞富含IL-33,并证明其通过激活Treg细胞分泌MIF和TGF-β1来调控伤口愈合过程 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限,且具体信号通路细节有待进一步阐明 | 探究成纤维细胞在口腔伤口愈合中的免疫调节功能及其分子机制 | 小鼠口腔损伤模型、人类口腔黏膜组织 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1223 | 2026-01-17 |
Differentiation in the human urothelia is defined by distinct alternative polyadenylation
2026-Jan-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116839
PMID:41533515
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研究论文 | 本研究揭示了在人类尿路上皮分化过程中,选择性多聚腺苷酸化(APA)是转录组多样性的主要来源,独立于mRNA水平变化 | 首次在人类尿路上皮分化中系统性地将APA与细胞状态特异性转录组多样性联系起来,并通过单细胞成像和报告基因实验验证了APA对蛋白质表达的调控作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,APA事件的直接功能验证和具体分子机制仍需进一步探索 | 探究人类尿路上皮分化过程中转录组多样性的生成机制 | 人类输尿管尿路上皮细胞,包括基底祖细胞、中间细胞和终末分化的伞状细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞成像,报告基因实验 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 13,544个尿路上皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1224 | 2026-01-17 |
A brain-driven neural circuit contributes to tissue regeneration in joint cartilage
2026-Jan-13, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.004
PMID:41535204
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研究论文 | 本文通过多学科方法揭示了大脑通过神经回路调控关节软骨再生的机制 | 首次实验证实大脑通过特定神经回路(PVNCRH神经元至交感神经)调控组织再生,并识别了ADRB2受体在其中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和人类关节软骨外植体,临床转化需进一步验证 | 探究大脑是否及如何调控组织再生,以关节软骨为例 | 人类骨关节炎患者和小鼠模型的关节软骨组织 | 神经科学 | 骨关节炎 | 磁共振成像、多突触逆行追踪、化学遗传学/光遗传学操作、单细胞RNA测序 | NA | 图像、序列数据 | 人类患者和小鼠模型,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1225 | 2026-01-17 |
Prenatal glucocorticoids exposure disrupts maturation of a cluster of microglia, causing poor social memory and more repetitive behaviors
2026-Jan-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116820
PMID:41538329
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研究论文 | 本研究揭示了产前糖皮质激素暴露通过破坏MRC1小胶质细胞的成熟,导致后代出现社交记忆缺陷和重复行为增加的机制 | 首次发现产前糖皮质激素暴露会特异性导致MRC1小胶质细胞成熟停滞,并鉴定出F13a1作为关键调控因子和潜在治疗靶点 | 研究主要基于动物模型,人类样本证据仅来自脐带血检测,需要进一步临床验证 | 探究产前糖皮质激素暴露导致自闭症谱系障碍风险的分子机制 | 产前暴露于地塞米松的后代大鼠及其海马组织、人类脐带血样本 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | 动物行为学模型 | 基因表达数据、行为学数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及大鼠后代和人类脐带血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1226 | 2026-01-17 |
RAS/MEK/PI3K pathway inhibition augments response to CD40 agonism by targeting CD11b+ Bregs thereby overcoming melanoma PD1-resistance
2026-Jan-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67315-1
PMID:41526341
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研究论文 | 本研究探讨了通过联合RAS/MEK/PI3K通路抑制剂与CD40激动剂,靶向CD11b+ Bregs以克服黑色素瘤PD1耐药性的治疗策略 | 首次揭示RAS/MEK/PI3K通路抑制剂能抑制CD40激动剂诱导的CD11b+ PD-L1 Bregs,从而增强CD8 T细胞介导的肿瘤杀伤,为ICB耐药黑色素瘤提供新治疗选择 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证;样本量有限,未涵盖所有黑色素瘤亚型 | 开发针对ICB耐药BRAF/NRAS突变黑色素瘤的有效二线治疗方案 | BRAF/NRAS突变黑色素瘤肿瘤细胞、CD11b+ Bregs、CD8 T细胞 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | scRNA-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | C57BL/6小鼠模型及患者样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1227 | 2026-01-17 |
The non-metabolic role of MTHFD2 in regulating mitochondrial fission-dependent mitophagy via stabilizing TOP2A mRNA in glioblastoma
2026-Jan-12, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究揭示了代谢酶MTHFD2在胶质母细胞瘤中通过稳定TOP2A mRNA来调控线粒体分裂依赖性线粒体自噬的非代谢功能 | 首次发现代谢酶MTHFD2具有RNA结合功能,能直接结合并稳定TOP2A mRNA,从而调控线粒体分裂和线粒体自噬,这超出了其已知的代谢功能 | NA | 探究MTHFD2在胶质母细胞瘤中是否具有调控线粒体完整性和动力学的非代谢功能 | 胶质母细胞瘤细胞及原位小鼠模型 | 分子生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,mt-Keima线粒体自噬流测定,RNA免疫沉淀测序,荧光素酶报告基因检测 | NA | RNA测序数据,荧光信号数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1228 | 2026-01-17 |
GCLSC: Single-cell clustering model based on graph contrastive learning
2026-Jan-11, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种基于图对比学习的单细胞聚类模型GCLSC,用于解决单细胞RNA测序数据的高维、稀疏和技术噪声带来的聚类挑战 | 首次将图Transformer与图注意力网络(GAT)结合,共同建模局部细胞相互作用和全局拓扑依赖关系,并采用四种数据增强策略提升模型鲁棒性 | 未明确说明模型在超大规模数据集上的计算效率,也未讨论对特定技术批次效应的专门处理策略 | 开发一种能够有效处理单细胞RNA测序数据高维稀疏特性的鲁棒聚类方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 图对比学习模型(结合Graph Transformer和GAT) | 单细胞基因表达数据 | 九个真实世界scRNA-seq数据集(具体样本数未说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1229 | 2026-01-17 |
3D culture reveals dual role of ICAM-1 in mediating tissue-specific human MSC spheroid formation & enhanced immunomodulation
2026-Jan-09, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本研究探讨了3D培养对骨髓和胎盘来源间充质干细胞免疫调节能力的影响,揭示了ICAM-1在球体形成和免疫调节中的双重作用 | 首次通过3D培养系统比较不同来源MSCs的免疫调节差异,并识别ICAM-1在球体形成和免疫增强中的关键机制 | 研究主要基于体外实验,体内验证有限;样本来源和数量可能影响结论的普适性 | 评估3D培养对人间充质干细胞免疫调节能力的影响,并阐明其分子机制 | 骨髓来源和胎盘来源的人间充质干细胞 | 细胞生物学 | NA | qPCR, 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 两种来源的MSCs(骨髓和胎盘) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1230 | 2026-01-17 |
Curriculum-guided divergence scheduling improves single-cell clustering robustness
2026-Jan-09, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.neunet.2026.108592
PMID:41534329
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研究论文 | 本文提出了一种名为DAGCL的动态图嵌入框架,通过课程学习引导的调度机制,提高了单细胞RNA-seq数据聚类的鲁棒性 | 提出动态注意力增强图嵌入框架,将表示学习重构为从粗到细的进化过程,采用课程引导的调度机制动态调节注意力强度和监督严格度 | 未在摘要中明确说明 | 提高单细胞RNA-seq数据深度聚类的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 动态图嵌入框架(DAGCL) | 基因表达数据 | 27个基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1231 | 2026-01-17 |
Adaptive multi-view information bottleneck for multi-omics data clustering
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf717
PMID:41527852
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研究论文 | 本文提出了一种基于信息瓶颈原理的自适应多视图聚类框架(scAMVIB),用于解决多组学数据聚类任务 | 利用信息瓶颈原理学习多视图组学表示,同时捕获组学间关联和组学特定模式,并通过自适应权重分配优化聚类性能 | NA | 解决多组学数据聚类中互补信息有效整合与权重分配的挑战 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 自适应多视图信息瓶颈框架 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学 | NA | NA |
| 1232 | 2026-01-17 |
CSRefiner: a lightweight framework for fine-tuning cell segmentation models with small datasets
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf718
PMID:41527855
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研究论文 | 本文提出了一个名为CSRefiner的轻量级框架,用于在小数据集上微调细胞分割模型,以提升全组织单细胞空间表达分析的精度 | CSRefiner是一个轻量级且高效的微调框架,支持微调空间组学领域广泛使用的分割模型,并能在标注数据非常有限的情况下实现高精度,同时兼容多种主流模型 | 未在摘要中明确说明 | 解决现有微调方法通常需要大量重新训练或局限于特定模型架构的问题,为实际应用中的全组织单细胞空间表达分析提供一种实用解决方案 | 细胞分割模型 | 数字病理学 | NA | 空间组学技术 | 深度学习分割模型 | 图像(核或膜染色图像) | 小数据集(具体数量未在摘要中说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1233 | 2026-01-17 |
Integrating single-cell and bulk transcriptomes identifies B cell features associated with neoadjuvant chemoradiotherapy sensitivity in rectal cancer
2026-Jan-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-31068-0
PMID:41484196
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,识别了与直肠癌新辅助放化疗敏感性相关的B细胞亚群及其特征基因 | 应用Scissor算法整合单细胞RNA-seq和批量转录组数据,首次在直肠癌中鉴定出与nCRT反应相关的特定B细胞亚群,并基于此开发了机器学习预测模型 | 研究样本量有限,验证队列仅64例样本,且未进行实验验证B细胞亚群的功能机制 | 探究B细胞在直肠癌新辅助放化疗反应中的作用,并开发预测模型 | 直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 直肠癌 | 单细胞RNA-seq,批量转录组测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 未明确总样本数,验证队列包含64例样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1234 | 2026-01-17 |
Chronic Alcohol Consumption Enhances the Differentiation Capacity of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells into Osteoclast Precursors
2026-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.06.010
PMID:40683559
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研究论文 | 本研究探讨了长期酒精摄入如何增强造血干细胞和祖细胞向破骨细胞前体分化的能力,揭示了酒精导致骨密度降低和骨骼脆性的机制 | 首次在恒河猴模型中结合谱系流式细胞术和单细胞RNA测序,系统分析了长期酒精摄入对造血干细胞和祖细胞向破骨细胞分化能力的影响,并识别了相关的转录组和表观遗传变化 | 研究基于动物模型,结果可能不完全适用于人类;样本量未明确说明,可能影响统计效力;未探讨长期酒精摄入对其他骨细胞类型的影响 | 探究长期酒精摄入如何通过影响造血干细胞和祖细胞的分化能力,导致骨密度降低和骨骼疾病 | 恒河猴模型中的造血干细胞和祖细胞及其分化的单核细胞/巨噬细胞和破骨细胞前体 | 单细胞组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序,谱系流式细胞术,集落形成单位分析,抗酒石酸酸性磷酸酶染色 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1235 | 2026-01-17 |
Decoding innate lymphoid cell heterogeneity and plasticity in colorectal cancer
2026-Jan, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70593
PMID:41527493
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了结直肠癌中固有淋巴样细胞的异质性、可塑性及其在肿瘤微环境中的功能 | 揭示了肠道固有淋巴样细胞的两个不同起源,并发现骨髓来源的ILC2s在三级淋巴结构中富集,支持B细胞成熟,与更好的临床预后和免疫治疗反应相关 | NA | 阐明结直肠癌中固有淋巴样细胞的起源、异质性和功能,及其对疾病进展和治疗效果的影响 | 固有淋巴样细胞(ILCs)在结直肠癌中的角色 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 体外共培养, 批量RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据, 免疫荧光图像, 批量RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 来自多个组织(骨髓、血液和肠道)的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1236 | 2026-01-17 |
Network models for bridging denoising and identifying spatial domains of spatially resolved transcriptomics
2026-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013867
PMID:41529048
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研究论文 | 本文提出了一种名为stACN的集成网络模型,用于联合去噪空间转录组数据并识别空间域 | 首次通过图噪声模型学习干净的双细胞网络,并利用联合张量分解提取兼容的细胞特征,实现了去噪与空间域识别的统一框架 | 未明确说明模型对特定噪声类型或组织复杂度的适应性限制 | 解决空间转录组数据中技术噪声干扰与空间域识别分离处理导致的性能限制问题 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 图神经网络、张量分解 | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1237 | 2026-01-17 |
Integrated Mendelian Randomization and Single-Cell RNA Sequencing Analyses Reveal Lactate Metabolism as a Key Pathway in COVID-19-Induced Pulmonary Fibrosis
2026, Canadian respiratory journal
IF:2.1Q3
DOI:10.1155/carj/1049336
PMID:41532065
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序揭示了COVID-19诱导肺纤维化的关键机制,即乳酸代谢通路在肺上皮细胞中的核心作用 | 首次整合孟德尔随机化与单细胞RNA测序分析,系统性地揭示了COVID-19通过调节肺上皮细胞乳酸代谢促进肺纤维化的新机制,并确定了关键基因SLC16A4和PDGFC-PDGFRA信号轴的作用 | 研究未明确说明样本的具体来源和数量,且主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 探究COVID-19诱导肺纤维化的分子机制,寻找潜在的治疗靶点 | COVID-19感染与特发性肺纤维化(IPF)之间的因果关系及其中介通路 | 生物信息学 | 肺纤维化 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1238 | 2026-01-16 |
Unveiling CDKN1A and RELA: Machine learning-driven aging biomarkers for precision diagnosis and therapy in knee osteoarthritis
2026-Mar, Journal of orthopaedics
IF:1.5Q3
DOI:10.1016/j.jor.2025.11.045
PMID:41536554
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研究论文 | 本研究通过整合转录组数据和机器学习方法,鉴定出CDKN1A和RELA作为膝骨关节炎中下调的生物标志物,并进行了实验验证 | 首次结合多数据集、多种机器学习算法(LASSO、SVM-RFE、随机森林)和单细胞RNA测序分析,系统性地识别膝骨关节炎中与衰老相关的核心生物标志物,并探索其与免疫细胞浸润、代谢通路及潜在治疗化合物(姜黄素)的关联 | 研究主要基于公共数据集和生物信息学分析,实验验证仅在动物模型中进行,缺乏大规模临床样本验证;机器学习模型的泛化能力有待进一步在不同队列中验证 | 系统识别膝骨关节炎中与衰老相关的生物标志物,以用于精准诊断和治疗 | 膝骨关节炎(KOA)相关的基因表达数据、衰老相关基因、小鼠KOA模型 | 机器学习 | 骨关节炎 | 基因表达分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接、qRT-PCR、Western blotting | LASSO回归、SVM-RFE、随机森林 | 基因表达数据(微阵列、RNA-seq)、单细胞RNA测序数据 | 两个公共基因表达数据集(GSE12021、GSE169077)和一个单细胞RNA测序数据集(GSE176308),以及小鼠KOA模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1239 | 2026-01-16 |
Construction of a Prognostic and Diagnostic Gene Signature Based on the Characteristics of Cancer Stem-Like Cells for the Treatment Guidance of Hepatocellular Carcinoma
2026-Jan-15, Annals of human genetics
IF:1.0Q4
DOI:10.1111/ahg.70032
PMID:41536251
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研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌(HCC)患者样本的单细胞转录组数据,识别出具有癌症干细胞样特征的细胞群体,并构建了一个12基因特征用于预测患者生存和治疗反应 | 基于单细胞转录组数据识别HCC中的癌症干细胞样细胞,并开发了一个新的癌症干细胞样细胞风险评分(CARS),用于预测患者对索拉非尼和免疫检查点抑制剂的治疗反应 | 研究主要基于单细胞转录组数据,缺乏来自患者样本的直接实验验证,且样本量可能有限 | 构建基于癌症干细胞样细胞特征的预后和诊断基因特征,以指导肝细胞癌的治疗 | 肝细胞癌(HCC)患者样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | 基因特征评分模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1240 | 2026-01-16 |
Biomimetic Liposome Coloaded ES-Cu and PFK15 Amplify Cuproptosis through Inhibition of Glycolysis in Fibroblast-Like Synoviocytes for Rheumatoid Arthritis Therapy
2026-Jan-14, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c17592
PMID:41457948
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研究论文 | 本研究开发了一种仿生脂质体,通过共递送铜死亡诱导剂和糖酵解抑制剂,特异性靶向并杀死类风湿关节炎中的成纤维样滑膜细胞,以治疗类风湿关节炎 | 首次通过单细胞RNA测序揭示RAFLS中过度活跃的糖酵解是抵抗铜死亡的关键机制,并提出并验证了抑制糖酵解可放大铜死亡的假设,进而开发了融合RAFLS膜的仿生脂质体实现特异性靶向共递送 | NA | 开发一种通过放大铜死亡来治疗类风湿关节炎的新策略 | 类风湿关节炎中的成纤维样滑膜细胞 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |