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当前共找到 9342 篇文献，本页显示第 1201 - 1220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1201 | 2026-09-10 |
Multiplexed single-cell transcriptomics reveals diverse phenotypic outcomes for pathogenic SHP2 variants
2026-May-22, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea9389
PMID:42172315
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研究论文 | 结合单细胞转录组学、蛋白质生物化学、结构分析和细胞生物学，解析致病性SHP2变异如何扰乱信号传导并产生多种表型结果。 | 揭示催化失活的SHP2突变在基因表达水平上不模拟基因敲除表型，不同机制的突变可趋同于相似表型，相同热点残基的不同突变可导致分化的细胞状态。 | 摘要中未提及具体局限性。 | 阐明致病性SHP2变异如何扰乱Ras/丝裂原活化蛋白激酶信号传导，并解释其与人类疾病的关联。 | 表达临床不同SHP2变异的细胞。 | 单细胞转录组学 | Noonan综合征及多种癌症 | 单细胞转录组测序、蛋白质生物化学、结构分析、细胞生物学 | NA | 单细胞基因表达数据、蛋白质结构数据、生化数据 | 表达多种SHP2变异的细胞系（具体数量未在摘要中给出） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1202 | 2026-09-10 |
Single-Cell Sequencing Reveals That CCL2+ Adipose-Derived Stem Cells Promote Diabetic Wound Healing Through the CCL2-ACKR1 Signaling Axis
2026-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202601311R
PMID:42033160
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示CCL2+脂肪干细胞亚群通过CCL2-ACKR1信号轴促进糖尿病创面愈合的机制 | 首次通过单细胞测序鉴定出富集于肥胖个体中具有高干性和独特代谢特征的CCL2+ ADSC亚群，并证明其外泌体通过CCL2-ACKR1轴激活PI3K/AKT/mTOR/HIF-1α通路促进血管生成和创面愈合 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步在人体中验证其临床有效性和安全性 | 阐明ADSC在糖尿病创面中的异质性及功能调控机制，并评估CCL2+ ADSC衍生外泌体作为无细胞治疗策略的效果 | CCL2+脂肪干细胞亚群及其衍生外泌体在糖尿病创面愈合中的作用 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序、外泌体分离与表征、体外细胞实验、小鼠模型 | NA | 基因表达数据、图像 | 小样本量：人类样本数量和具体信息未在摘要中说明；糖尿病小鼠模型数量未知 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 1203 | 2026-09-10 |
Glomerular Endothelial Rarefaction Associated With Hypoxic Neutrophils Marks Renal Pathology Activity in Lupus Nephritis
2026-May-15, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70220
PMID:42138328
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和多重免疫荧光技术，探究狼疮性肾炎患者肾组织中缺氧和免疫介导损伤的特征，并与健康移植肾对照比较。 | 首次结合空间转录组学与多重免疫荧光技术，明确肾小球内皮稀疏与缺氧中性粒细胞相关，并表明尿液中性粒细胞货物可作为疾病活动性的液体活检标志物。 | 尚未提供明确的局限性信息。 | 研究狼疮性肾炎肾组织中缺氧与免疫介导损伤的机制及其与病理活动性的关联。 | 狼疮性肾炎患者和健康移植肾对照的肾活检组织，以及细胞系和原代中性粒细胞。 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 空间转录组学、多重循环免疫荧光、酶联免疫吸附测定 | NA | 基因表达、图像 | 健康对照来自肾移植，独立狼疮性肾炎队列；具体数量未提供。 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | 10x Visium空间转录组学分析 |
| 1204 | 2026-09-10 |
CNS1-dependent regulatory T cells shape recovery from acute lung injury
2026-May-14, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag119
PMID:42201839
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研究论文 | 该研究利用缺乏CNS1的小鼠模型，发现CNS1依赖性外周诱导调节性T细胞在急性肺损伤恢复中发挥关键作用，单细胞RNA测序揭示其未能完全激活支持抑制和修复功能的Treg转录程序。 | 首次阐明CNS1依赖性外周诱导Tregs在急性肺损伤恢复中的关键作用，并利用单细胞RNA测序揭示其转录机制。 | 研究主要基于小鼠模型，人类急性肺损伤中的相关机制有待进一步验证。 | 探讨CNS1依赖性外周诱导Tregs在急性肺损伤恢复中的作用及其机制。 | 缺乏CNS1的小鼠及流感诱导的急性肺损伤模型中的调节性T细胞。 | 免疫学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确（小鼠模型） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1205 | 2026-09-10 |
Single-cell and deep learning identify hypoxia-responsive lncRNAs predicting outcomes in colorectal cancer
2026-May-13, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01438-6
PMID:42129304
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研究论文 | 本研究通过单细胞和深度学习分析，识别出与结直肠癌预后相关的缺氧反应性长链非编码RNA分子标签（HRLPMS），并评估其治疗意义 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和多种机器学习/深度学习算法，构建了缺氧反应性lncRNA预后签名（HRLPMS），并揭示了其与肿瘤微环境、体细胞变异和药物敏感性的关联 | 未在文中明确提及局限性，可能包括样本量或验证范围有限 | 评估缺氧反应性lncRNA分子签名（HRLPMS）在结直肠癌中的预后价值及治疗意义 | 结直肠癌患者样本，包括批量转录组和蛋白质组数据、单细胞RNA测序、空间转录组学、治疗特异性临床队列及内部数据 | 数字病理学, 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Cox回归, 机器学习, 深度学习 | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 未明确给出具体样本数量，涉及多个队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1206 | 2026-09-10 |
Maternal opioid use and hepatitis C infection disrupt the placental immune landscape and structure
2026-05-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.199606
PMID:41842943
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术、组织学及空间和单细胞转录组学，探究了母亲阿片类药物使用障碍（OUD）对胎盘组织结构和免疫景观的影响，并进一步按母亲丙型肝炎病毒（HCV）感染状态进行分层分析。 | 首次利用空间和单细胞转录组学全面揭示OUD对胎盘组织免疫细胞和结构的影响，并结合HCV分层分析，揭示了OUD和HCV对胎盘血管发育及免疫调节的破坏作用。 | 研究样本量可能有限，且OUD与HCV的混合效应难以完全分离，需更多纵向研究验证。 | 探究母亲阿片类药物使用障碍对胎盘结构和免疫景观的破坏性影响，并评估HCV共感染的作用。 | 胎盘组织（包括滋养层细胞、内皮细胞、免疫细胞如蜕膜巨噬细胞和NK细胞） | 数字病理学 | 阿片类药物使用障碍和丙型肝炎感染 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、流式细胞术、组织学 | NA | 图像、转录组数据 | 未明确说明样本量 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 1207 | 2026-09-10 |
Focal adhesion proteins confer smooth muscle anoikis resistance and protection against aortic aneurysm and dissection
2026-05-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195291
PMID:41874580
|
研究论文 | 本研究探讨了黏着斑蛋白在平滑肌细胞失巢凋亡抵抗及胸主动脉瘤和夹层保护中的作用 | 首次证明黏着斑蛋白的表达而非激酶活性在对抗胸主动脉瘤和夹层进展及平滑肌细胞失巢凋亡中起关键作用 | 摘要中未提及明确的局限性 | 确定平滑肌细胞黏着斑蛋白在胸主动脉瘤和夹层发病机制中的作用 | 人类胸主动脉瘤组织及平滑肌细胞特异性基因敲除小鼠 | 数字病理学 | 胸主动脉瘤和夹层 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1208 | 2026-09-10 |
Base editing and nanoparticle transfection of airway cell types essential for treatment of cystic fibrosis
2026-05-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198563
PMID:42100873
|
研究论文 | 本研究通过碱基编辑和纳米颗粒递送技术修正囊性纤维化气道上皮细胞中的CFTR剪接位点变异，实现功能恢复，为CF治疗提供新平台。 | 利用碱基编辑RNA和聚合物纳米颗粒非病毒递送系统，成功修正原代气道上皮细胞中常见的CFTR剪接位点变异3120+1G>A，并在单细胞水平展示CFTR表达增加及相关细胞类型变化。 | 未完全阐述体内递送效率和长期安全性，且对部分细胞亚型的编辑效果有限。 | 开发并验证一种可扩展的非病毒平台，用于纠正CFTR基因变异，以治疗对CFTR调节剂无反应的囊性纤维化患者。 | 原代囊性纤维化气道上皮细胞、永生化细胞及分化的气道上皮培养物。 | 基因编辑、纳米技术、细胞治疗 | 囊性纤维化 | 碱基编辑、单细胞RNA测序、纳米颗粒递送 | 碱基编辑器（腺嘌呤碱基编辑器或胞嘧啶碱基编辑器） | 单细胞基因表达数据、细胞培养数据 | 未明确具体样本数量，多个原代和永生化细胞系。 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序以分析CFTR表达。 |
| 1209 | 2026-09-10 |
Computational identification of migrating T cells in spatial transcriptomics data
2026-05-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.192718
PMID:42100876
|
研究论文 | 开发了一种计算工具ReMiTT，利用空间转录组数据追踪肿瘤组织中T细胞的迁移模式，并分析其相关特征。 | 首次提出计算方法来追踪体内肿瘤组织中的T细胞迁移，并识别潜在的迁移轨迹及相关基因和通路。 | 未提及具体限制。 | 研究肿瘤微环境中T细胞迁移模式及其与肿瘤免疫逃逸的关联。 | 多种肿瘤样本中的T细胞。 | 计算生物学 | 肿瘤 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | 多种肿瘤样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1210 | 2026-09-10 |
Local transcriptional covariation produces accurate estimates of cell phenotype
2026-05-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag135
PMID:41915021
|
研究论文 | 介绍一种名为Sceodesic的新方法，利用基因共表达矩阵的黎曼流形结构，通过对数欧几里得度量从单细胞RNA测序数据中估计局部转录协变，以更准确地预测细胞表型 | 首次将微分几何中的对数欧几里得度量应用于单细胞基因共表达分析，以捕获细胞状态特异的局部协变模式，并将其组织为可解释的线性基因程序，优于传统全局方法 | 摘要中未明确提及局限性 | 从单细胞RNA测序数据中更准确地刻画细胞状态和表型 | 基因共表达模式、细胞状态、基因程序 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1211 | 2026-09-10 |
QCatch: a framework for quality control assessment and analysis of single-cell sequencing data
2026-05-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag184
PMID:41987571
|
研究论文 | 介绍QCatch，一个用于单细胞测序数据分析的质量控制评估和报告生成的Python命令行工具。 | QCatch专门为alevin-fry和simpleaf的输出设计，提供标准化的交互式HTML QC报告，并输出带有丰富注释的H5AD格式文件，便于下游分析集成。 | 摘要中未提及局限性，可能未涵盖所有单细胞数据处理场景。 | 开发一个标准化的QC报告工具，以提高单细胞测序数据分析的可靠性和可重复性。 | 单细胞测序数据，特别是由alevin-fry或simpleaf处理的结果。 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | alevin-fry, simpleaf | NA |
| 1212 | 2026-09-10 |
Reconstructing cell-cell interaction network in single-cell spatial transcriptomics via directed heterogeneous graph autoencoder
2026-05-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag130
PMID:41999209
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研究论文 | 提出一种基于有向异构图自编码器的方法DualCellChat，用于从单细胞空间转录组数据中重建细胞间相互作用网络 | 利用有向异构图自编码器，能够固有地建模细胞相互作用的方向性，超越了现有依赖于对称解码器或无向图架构的深度学习方法 | 未提及明确的局限性 | 从单细胞空间转录组数据中重建完整且准确的细胞间相互作用网络，并进行下游分析以推断参与细胞相互作用的标记基因和显著的配体-受体对 | 单细胞空间转录组数据中的细胞及其相互作用关系 | 机器学习和生物信息学 | NA | 单细胞空间转录组学 | 有向异构图自编码器 | 单细胞空间转录组数据 | 五个来自四种不同技术的单细胞空间数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1213 | 2026-09-10 |
GR2ST: spatial transcriptomics prediction based on graph-enhanced multimodal contrastive learning
2026-05-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag209
PMID:42036805
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研究论文 | 提出GR2ST，一种基于图增强多模态对比学习的深度学习方法，用于从组织学图像预测空间转录组。 | 设计动态阈值功能图和半径约束空间图的双分支图架构，并通过多模态对比学习对齐图像与基因表达，结合细胞类型引导的多分支回归头和上下文感知权重网络实现自适应基因表达生成。 | 摘要中未提及明确限制。 | 开发一种能够有效整合组织学图像和空间转录组数据，预测空间转录组的深度学习方法。 | 皮肤鳞状细胞癌和两个人类乳腺癌队列的空间转录组数据集。 | 数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌, 乳腺癌 | 空间转录组学 | 图神经网络、多模态对比学习 | 图像与基因表达数据 | 3个空间转录组数据集，包括皮肤鳞状细胞癌和两个人类乳腺癌队列（具体数量未提供） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1214 | 2026-09-10 |
Cell-o1 : training LLMs to solve single-cell reasoning puzzles with reinforcement learning
2026-05-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag208
PMID:42082388
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研究论文 | 提出Cell-o1模型，通过监督微调和强化学习训练大型语言模型解决单细胞RNA测序数据中的批量级细胞类型注释推理任务 | 首次将细胞类型注释重构为批量级推理任务，引入CellPuzzles基准测试，并采用强化学习训练7B参数的语言模型，显著超越现有基线 | 文章摘要中未明确提及局限性，可能包括对特定数据集或条件的依赖，以及模型在更广泛场景下的泛化能力有待进一步验证 | 提升大型语言模型在单细胞RNA测序数据细胞类型注释任务中的推理能力和准确性，通过批量级上下文推理实现更合理的注释 | 单细胞RNA测序数据中的批量级细胞类型注释任务 | 自然语言处理 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 大型语言模型（LLM） | 文本和单细胞表达数据 | 不适用（未指定样本数量） | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 1215 | 2026-09-10 |
REACTOR: REgulon Activity analysis and Comparison Tool for single-cell transcriptOmics Research
2026-05-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag203
PMID:42082398
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研究论文 | 介绍REACTOR，一种用于检测单细胞RNA测序数据中转录调控因子及其靶基因（调控子）差异活性的计算工具 | 引入稳健的统计检验来检测不同条件（如疾病与对照，含多个重复）之间的调控子差异活性，扩展了现有调控子分析框架 | 未在摘要中明确说明限制 | 开发一个工具以识别条件特异性和细胞类型特异性的调控子，用于单细胞转录组研究 | 转录调控因子及其靶基因（调控子）在单细胞RNA测序数据中的活性 | 计算生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 公开的COVID-19数据集（未指明样本数） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1216 | 2026-09-10 |
Lifestyle shapes preclinical social and microglial deficits in an Alzheimer's disease mouse model
2026-May, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03368-4
PMID:41388145
|
研究论文 | 本研究使用新型富集范式连续追踪App敲入小鼠至7月龄，探究阿尔茨海默病临床前期阶段中生活方式如何影响社会行为和微胶质细胞缺陷。 | 采用了全新的富集生活范式，在最小斑块负担和记忆未受损的情况下，早期发现社会行为缺陷与微胶质细胞免疫监视受损，首次揭示生活因素在临床前期通过神经可塑性、行为轨迹、社会性和免疫性多域互作影响早期病理。 | 该模型为还原性敲入模型，可能不能完全模拟人类AD复杂性；研究至7月龄，未覆盖更晚期阶段；未直接干预生活方式以验证因果关系。 | 阐明阿尔茨海默病临床前期阶段中生活方式因素对社会行为、神经可塑性和微胶质细胞免疫功能的影响及其早期病理关联。 | App敲入小鼠和海马微胶质细胞。 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、血浆蛋白谱分析 | CA | 转录组数据和蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1217 | 2026-09-10 |
Atypical memory B cell clonal expansion and inflammatory programs associate with platelet-activating antibody development in COVID-19
2026-04-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.201033
PMID:41746733
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和V(D)J测序，揭示了COVID-19患者中产生血小板激活抗体的免疫特征，包括非典型记忆B细胞克隆扩增和Th1型炎症程序。 | 首次关联了非典型记忆B细胞克隆扩增、RKH/Y5重链基序和Th1极化T细胞反应与COVID-19中血小板激活抗体的产生。 | 信息不足，摘要中未提及研究的局限性。 | 界定COVID-19患者中产生血小板激活抗体的免疫特征。 | 产生血小板激活抗体（PEA+）与不产生（PEA-）的COVID-19患者的B细胞和T细胞。 | 基因组学 | COVID-19 | 单细胞RNA-seq、单细胞V(D)J-seq、血浆细胞因子和趋化因子分析 | NA | 单细胞转录组、免疫组库、血浆蛋白数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1218 | 2026-09-10 |
FOSL2 regulates endothelial cell state and chromatin accessibility in systemic sclerosis pulmonary vascular remodeling
2026-04-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189107
PMID:42018656
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研究论文 | 本研究探讨转录因子FOSL2在系统性硬化症相关肺血管重塑中调控内皮细胞状态和染色质可及性的机制 | 利用多组学数据和深度学习模型揭示FOSL2通过调节AP-1结合位点影响内皮细胞基因表达，连接小鼠模型与人类疾病 | 摘要未提供明确的局限性信息 | 阐明FOSL2在系统性硬化症相关肺动脉高压肺血管重塑中的作用及其调控机制 | 系统性硬化症相关间质性肺病-肺动脉高压患者的肺组织、FOSL2转基因小鼠及原代人肺血管内皮细胞 | 基因组学、表观遗传学 | 系统性硬化症 | 单细胞多组学、RNA-seq、深度学习模型（ChromBPNet） | 深度学习模型（ChromBPNet） | 单细胞多组学数据、RNA-seq数据、染色质可及性数据 | 未在摘要中明确提及样本数量 | 未明确提及 | 单细胞多组学 | 未明确提及 | 未明确提及 |
| 1219 | 2026-09-10 |
Hypoxia inducible factor network reflects kidney disease progression in diabetes and sodium-glucose co-transporters inhibition
2026-Apr-21, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02653-0
PMID:42009641
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了缺氧诱导因子网络在糖尿病肾病进展中的作用，并验证了SGLT2抑制剂对该网络的保护效应 | 首次构建了基于启动子的HIF调控网络，涵盖237个基因和7个互连通路，并利用多组学数据验证其在糖尿病肾病进展中的变化及SGLT2i的治疗反应 | 研究对象仅限于青年2型糖尿病患者，且临床证据轻微，可能限制结论的普遍性 | 探究缺氧诱导因子网络在糖尿病肾病进展中的作用，并评估SGLT2抑制剂对肾脏缺氧响应的影响 | 患有2型糖尿病的青年肾脏组织及糖尿病肾病晚期患者样本 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞转录组学, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 空间转录组图像 | 青年T2D患者肾脏组织样本（具体数量未提供），以及KPMP项目中的晚期DKD样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'转录组, 10x Visium空间转录组 |
| 1220 | 2026-09-10 |
Immune modulation promotes heart regeneration through macrophage and Granulin functions in medaka
2026-Apr-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2524705123
PMID:41980096
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研究论文 | 该研究利用青鳉鱼模型，结合转录组学和功能实验，揭示免疫调节通过巨噬细胞和颗粒蛋白前体功能促进心脏再生 | 首次在非再生青鳉鱼模型中证明Toll样受体3激动剂poly I:C可通过加速免疫激活和巨噬细胞介导的碎片清除来促进心脏修复，并鉴定出与再生相关的巨噬细胞亚群及其高表达颗粒蛋白前体 | 未明确说明，但可能涉及研究模型与应用场景的差异 | 探究免疫调节如何加速心脏修复并揭示其机制 | 非再生青鳉鱼的心脏组织及免疫细胞 | 转录组学 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、杂交链式反应空间分析 | NA | 转录组数据、空间表达数据 | 青鳉鱼心脏样本，具体数量未在摘要中说明 | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |