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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1181 | 2026-03-10 |
The Interaction Between Mitophagy Dysregulation and the Diabetic Bladder Microenvironment
2026-Mar, Journal of diabetes
IF:3.0Q2
DOI:10.1111/1753-0407.70199
PMID:41793088
|
综述 | 本文综述了线粒体自噬失调与糖尿病膀胱微环境之间的相互作用,提出了一个驱动糖尿病膀胱功能障碍进展的自我强化反馈环路 | 提出了一个连接高血糖、线粒体自噬失调、线粒体功能障碍和膀胱微环境损伤的自我强化反馈环路新模型,并探讨了针对该环路的多靶点联合治疗策略 | 该模型主要基于现有文献综述提出,其具体分子机制和临床转化仍需未来实验研究验证 | 阐明线粒体自噬在糖尿病膀胱功能障碍发病机制中的作用,并探索基于此的治疗策略 | 糖尿病膀胱功能障碍的分子与细胞病理机制 | 病理生理学 | 糖尿病并发症 | NA | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1182 | 2026-03-10 |
Assessment of dispersion metrics for estimating single-cell transcriptional variability
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014030
PMID:41770747
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研究论文 | 本文系统评估了用于估计单细胞转录变异性的多种离散度指标,并应用方差均值比(Fano因子)揭示了单细胞数据中的生物学相关信息 | 通过模拟单细胞数据系统比较了Gini指数、方差均值比、方差、变异系数(CV)、CV2和Shannon熵等统计指标对转录噪声的响应性,发现方差均值比在离散度增加时近似线性缩放且独立于数据集大小,而Gini指数在离散度减小时表现出反常行为,Shannon熵则不具有尺度不变性 | 研究基于模拟数据进行方法比较,可能未完全覆盖真实单细胞数据的所有复杂性;且未探讨其他潜在统计指标或模型 | 评估和比较用于测量单细胞转录变异性的统计方法,以揭示超越平均表达的生物学信息 | 单细胞RNA测序数据中的基因特异性转录变异性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计模型(包括Gini指数、方差均值比、方差、CV、CV2、Shannon熵) | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1183 | 2026-03-10 |
The protective up-regulation of metallothionein-2A in intervertebral disc degeneration inhibits nucleus pulposus cell ferroptosis through activation of the PI3K/AKT/mTOR pathway
2026-Feb-25, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-02972-9
PMID:41741409
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研究论文 | 本研究揭示了金属硫蛋白-2A(MT2A)在椎间盘退变中通过激活PI3K/AKT/mTOR通路抑制髓核细胞铁死亡,从而发挥保护作用 | 首次发现MT2A在椎间盘退变中保护性上调,并阐明其通过激活PI3K/AKT/mTOR通路抑制髓核细胞铁死亡的具体分子机制 | 研究主要基于细胞和动物模型,尚未在人体中进行验证;铁死亡在椎间盘退变中的具体作用机制仍需进一步探索 | 阐明MT2A如何抑制椎间盘退变的进展 | 椎间盘退变、髓核细胞 | 分子生物学与细胞生物学 | 椎间盘退变 | 单细胞测序分析、细胞培养、动物模型 | NA | 测序数据、细胞表型数据、动物影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1184 | 2026-03-10 |
WWP2 underlies ROS-induced granulosa cell apoptosis by promoting ubiquitination of BAK in polycystic ovary syndrome
2026-Feb-23, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08500-y
PMID:41730845
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研究论文 | 本研究揭示了在PCOS中,氧化应激通过WWP2介导的BAK泛素化调控颗粒细胞线粒体凋亡的分子机制 | 首次发现E3泛素连接酶WWP2在PCOS颗粒细胞中表达显著降低,并阐明其通过调控BAK的泛素化修饰影响颗粒细胞凋亡的新机制 | 研究主要基于KGN细胞系和PCOS小鼠模型,在人类PCOS患者中的直接验证仍需进一步开展 | 阐明PCOS中活性氧诱导颗粒细胞凋亡的分子机制 | 颗粒细胞、KGN细胞系、PCOS小鼠模型 | 分子生物学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序、泛素化分析、基因敲除/敲低 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据 | 公共单细胞RNA-seq数据及临床GC样本验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1185 | 2026-03-10 |
Advances in spatial omics for the analysis of prostate cancer
2026-Feb-21, Analytical and bioanalytical chemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1007/s00216-026-06396-3
PMID:41723338
|
综述 | 本文综述了空间组学技术在分析前列腺癌中的应用进展 | 整合了高维分子分析与保留的组织结构,揭示了前列腺癌进展中的关键特征,如基质重塑、免疫逃逸、脂质代谢重编程和治疗耐药性生态位 | NA | 探讨空间组学技术在前列腺癌研究中的最新进展、整合应用及临床转化挑战 | 前列腺癌 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间表观基因组学、空间代谢组学 | NA | 空间分子数据 | NA | NA | 单细胞空间组学 | NA | NA |
| 1186 | 2026-03-10 |
A Multimodal Single-Cell Epigenomic and 3D Genome Atlas of the Human Basal Ganglia
2026-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.12.705594
PMID:41726865
|
研究论文 | 本文构建了人类基底节的多模态单细胞表观基因组和3D基因组图谱,揭示了细胞类型和区域特异性的表观遗传差异 | 首次创建了人类基底节的多模态单细胞表观基因组和3D基因组图谱,整合了DNA甲基化、3D染色质构象、空间转录组学等多组学数据 | NA | 构建人类基底节的综合表观基因组图谱,以解析其细胞类型特异性的表观遗传调控机制 | 人类基底节的主要亚区和细胞类型 | 表观基因组学 | 神经精神疾病 | 多组学测序(snm3C-seq)、MERFISH空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据、空间转录组数据 | 197,003个细胞核(来自八个基底节亚区),整合后总计261,331个细胞 | NA | 单细胞多组学测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1187 | 2026-03-10 |
Genome-wide single-cell perturbation screens with VIPerturb-seq
2026-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.12.705613
PMID:41726924
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为VIPerturb-seq的新平台,旨在通过基于探针的检测工作流程,促进全基因组范围的Perturb-seq实验,以应对成本和高通量挑战 | VIPerturb-seq平台引入了分裂探针策略,用于在固定细胞中检测全基因组CRISPR文库,支持在单细胞分析前对重要扰动进行表型富集,并与组合索引工作流程兼容,将Perturb-seq通量提高50倍 | NA | 开发一个平台,以促进常规的全基因组Perturb-seq实验,解决现有方法在成本和通量方面的限制 | 全基因组CRISPRi文库(GuEST-List)以及相关的单细胞扰动筛选 | 单细胞测序技术 | NA | CRISPR-based screening, single-cell sequencing, probe-based detection, combinatorial indexing | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | Perturb-seq, single-cell RNA-seq | VIPerturb-seq | 基于探针的检测工作流程,支持全基因组CRISPR文库检测和表型富集 |
| 1188 | 2026-03-10 |
ADT-030, a novel PDE10 inhibitor, demonstrates potent antitumor activity in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.11.705411
PMID:41726934
|
研究论文 | 本研究评估了一种新型PDE10抑制剂ADT-030在胰腺导管腺癌中的抗肿瘤活性 | ADT-030是一种新型PDE10抑制剂,能有效抑制KRAS突变PDAC细胞增殖,并对抗KRAS抑制剂耐药细胞,同时重塑肿瘤微环境增强抗肿瘤免疫 | NA | 评估ADT-030在胰腺导管腺癌中的抗肿瘤效果及机制 | 胰腺导管腺癌细胞系、同基因和患者来源异种移植模型 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1189 | 2026-03-10 |
Parameter-free representations outperform single-cell foundation models on downstream benchmarks
2026-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.11.705358
PMID:41727141
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研究论文 | 本文比较了基于参数化表示的单细胞基础模型与简单线性方法在下游任务中的性能 | 研究发现,无需复杂深度学习表示,通过简单、可解释的线性方法即可在多个基准测试中达到或接近最先进性能,甚至在涉及新细胞类型和生物体的分布外任务中超越基础模型 | 未明确提及具体局限性,但暗示需要更严格的基准测试来评估模型 | 评估单细胞RNA测序数据表示方法的性能,特别是比较基础模型与简单线性方法在下游任务中的表现 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer, 线性方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1190 | 2026-03-10 |
Integration of Multi-Omics and Machine Learning Identifies TGFB1 and SERPINE1 as Biomarkers of Vascular Smooth Muscle Cell Senescence in Intracranial Aneurysms
2026-Feb-10, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-026-01419-8
PMID:41665703
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据、机器学习和实验验证,识别了TGFB1和SERPINE1作为颅内动脉瘤中血管平滑肌细胞衰老的生物标志物 | 首次探索血管平滑肌细胞衰老在颅内动脉瘤发病机制中的作用,并利用单细胞RNA测序、机器学习等方法识别了关键的衰老相关基因 | TGFB1和SERPINE1的具体作用机制需要进一步研究和验证 | 研究颅内动脉瘤中血管平滑肌细胞衰老的病理机制,并识别相关的生物标志物和治疗靶点 | 小鼠弹性蛋白酶诱导的颅内动脉瘤模型以及人类颅内动脉瘤组织 | 机器学习 | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 微阵列, 免疫组织化学分析 | 机器学习 | RNA测序数据, 微阵列数据, 图像数据 | 未明确指定样本数量,涉及小鼠模型和人类组织数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1191 | 2026-02-06 |
Analysis of microarray and single-cell RNA-seq finds gene co-expression, cell-cell communication, and tumor environment associated with cytoskeleton protein in epithelial-mesenchymal transition in ovarian cancer
2026-Feb-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04580-6
PMID:41639334
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1192 | 2026-03-10 |
Xiangpi Shengji Ointment Accelerates Anal Fistula Healing by Regulating Macrophage-Fibroblast Crosstalk Through the Nuclear Factor Kappa B/Hypoxia-Inducible Factor Alpha/Vascular Endothelial Growth Factor Signaling Axis
2026, Molecular and cellular biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1080/10985549.2025.2597464
PMID:41457935
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研究论文 | 本研究揭示了象皮生肌膏通过调控NF-κB/HIF-α/VEGF信号轴,促进巨噬细胞M1极化与成纤维细胞功能,从而加速肛瘘愈合的分子机制 | 首次结合网络药理学、转录组学及单细胞RNA测序技术,系统阐明了象皮生肌膏通过NF-κB/HIF-α/VEGF信号轴调控巨噬细胞-成纤维细胞互作促进肛瘘愈合的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,其结论在人体中的适用性及临床转化效果仍需进一步验证 | 探究象皮生肌膏促进肛瘘伤口愈合的分子机制 | 肛瘘愈合过程、巨噬细胞、成纤维细胞 | 生物信息学与分子生物学 | 肛瘘 | 网络药理学、转录组分析、单细胞RNA测序、CCK-8、ELISA、WB、RT-qPCR | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、体外细胞实验数据、体内动物模型数据 | 使用了公开数据集GSE28914和GSE203244,并建立了小鼠肛瘘模型进行体内验证 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1193 | 2026-03-10 |
Cochlear neural functional competence: an integrative transcriptomic module analysis of excitability, plasticity and microenvironmental support programs
2026, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2026.1776907
PMID:41797834
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研究论文 | 本研究通过整合分析多个耳蜗转录组数据集,构建了一个用于评估螺旋神经元功能状态的综合评分框架(CNFC) | 提出了一个整合神经元兴奋性、可塑性、营养/代谢支持和损伤/炎症等转录程序的模块化分析框架,并开发了可量化的CNFC评分,超越了传统的神经元存活率预测 | MSC治疗的功能性后果尚未明确建立,部分结论仍需进一步机制验证 | 开发一个从转录组数据中总结耳蜗神经元功能状态的透明、可生成假设的分析框架,以补充传统的存活率指标 | 螺旋神经元、毛细胞及耳蜗组织 | 转录组学 | 听力损失 | RNA-seq, 微阵列, 空间转录组学 | 模块化基因评分框架 | 转录组数据 | 多个公开数据集(涵盖发育期、成年期及损伤/退化期样本) | NA | RNA-seq, 微阵列, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1194 | 2026-03-09 |
Single-cell RNA sequencing analysis of bone cancer pain model induced by Lewis lung cancer cells in male mice
2026-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2636340
PMID:41758238
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了雄性小鼠中由Lewis肺癌细胞诱导的骨癌疼痛模型的脊髓细胞组成和分子特征 | 首次在骨癌疼痛模型中应用单细胞RNA测序技术,系统性地揭示了脊髓中多种细胞类型的比例变化和分子通路改变 | 研究仅针对雄性小鼠,未考虑性别差异;模型基于特定肺癌细胞系,可能无法完全代表其他癌症类型引起的骨痛 | 探究骨癌疼痛的分子机制,为开发新的治疗方法提供依据 | 雄性小鼠的L2-L4脊髓组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1195 | 2026-03-09 |
TimeVault turns vault particles into molecular memory of transcriptional states: how to decode the cellular black box
2026-Dec, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2026.2639760
PMID:41789510
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TimeVault的新技术,该技术能够将细胞内的转录状态以分子记忆的形式存储于活细胞中 | 通过重新利用穹窿核糖核蛋白颗粒来捕获和稳定多聚腺苷酸化mRNA,实现了在活细胞内长期存储内源性转录组,从而能够回顾性重建分子历史 | NA | 开发一种能够在活细胞内长期存储转录状态分子记忆的技术,以揭示瞬时基因表达与长期表型结果之间的因果关系 | 活细胞(包括应激反应模型和癌症模型中的细胞) | 分子生物学 | 癌症 | TimeVault技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1196 | 2026-03-09 |
3D culture reveals dual role of ICAM-1 in mediating tissue-specific human MSC spheroid formation & enhanced immunomodulation
2026-Jul, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本研究探讨了三维培养系统如何影响人骨髓和胎盘来源间充质干细胞的免疫调节能力,并揭示了ICAM-1在介导球体形成和增强免疫调节中的双重作用 | 首次通过三维培养系统比较不同来源MSCs的免疫调节差异,并识别ICAM-1在球体形成和免疫调节中的关键双重功能 | 研究主要基于体外实验,体内验证有限,且仅聚焦于两种MSC来源,可能未涵盖其他组织来源的MSCs | 探究三维培养对MSCs免疫调节能力的影响及其机制,以优化干细胞治疗策略 | 人骨髓来源间充质干细胞和胎盘来源间充质干细胞 | 细胞生物学 | NA | qPCR、流式细胞术、单细胞RNA测序、生物信息学分析 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 两种来源的MSCs(骨髓和胎盘) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1197 | 2026-03-09 |
Automatic cell type identification methods for single-cell RNA sequencing based on coordinate convolutional neural network
2026-Jun, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种基于坐标卷积神经网络的单细胞RNA测序数据自动细胞类型识别方法BP-Coord,通过整合坐标信息提升模型的空间感知能力 | 提出BP-Coord方法,通过引入坐标信息作为额外通道和双三次插值上采样层,解决了CNN在单细胞RNA测序数据中因平移不变性导致的细胞类型误分类问题 | NA | 开发一种高效准确的单细胞RNA测序数据自动细胞类型识别方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | CNN | 基因表达数据 | 五个公共单细胞RNA测序基准数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1198 | 2026-03-09 |
MYB: A potential therapeutic target in triple-negative breast cancer based on the PI3K/AKT signaling pathway
2026-Jun, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示PI3K/AKT信号通路在三阴性乳腺癌与非三阴性乳腺癌预后差异中的关键作用,并识别MYB基因为潜在治疗靶点 | 首次通过整合多组学数据(包括单细胞RNA测序和空间转录组学)结合机器学习特征选择,系统阐明PI3K/AKT通路在TNBC预后差异中的核心机制,并发现传统中药桃红四物汤活性成分与MYB的强结合潜力 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏实验验证;分子对接结果需体外/体内实验确认;样本来源和批次效应可能影响结果泛化性 | 探究PI3K/AKT信号通路是否导致三阴性乳腺癌与非三阴性乳腺癌的预后差异,并寻找潜在治疗靶点 | 三阴性乳腺癌与非三阴性乳腺癌患者的转录组数据及MYB基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 转录组测序,单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接 | 机器学习特征选择算法 | 转录组数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 从GEO数据库下载的原始转录组数据集(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1199 | 2026-03-09 |
R-loop-driven molecular subtypes reveal prognostic and immunogenomic features in uterine corpus endometrial carcinoma
2026-Jun, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了R-loop活性在子宫体子宫内膜癌中的预后意义,并识别出CSDE1作为关键预测基因,其通过SPP1通路与免疫细胞相互作用,影响肿瘤进展和免疫抑制 | 首次将R-loop活性与UCEC的分子亚型、预后及免疫基因组特征关联,并发现CSDE1在成纤维细胞中的特异性表达及其通过SPP1通路介导的免疫抑制机制 | 研究主要基于公共数据库数据,缺乏大规模独立队列验证;功能实验仅限于CSDE1,其他R-loop基因的作用未深入探讨 | 阐明R-loop在子宫体子宫内膜癌中的预后价值和生物学机制,探索CSDE1作为潜在治疗靶点 | 子宫体子宫内膜癌患者样本及相关转录组、临床、突变和空间数据 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | 转录组分析、单细胞转录组学、空间转录组学、拷贝数变异分析、体细胞突变比较 | 预后模型 | 转录组数据、临床数据、突变数据、空间数据 | 来自TCGA及公共数据库的UCEC样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1200 | 2026-03-09 |
Electrocorticographic, astrocytic and transcriptomic signatures in the triple transgenic mouse model of Alzheimer's disease submitted to stearoyl-CoA desaturase inhibition
2026-May-15, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2026.110835
PMID:41539386
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研究论文 | 本研究探讨了在阿尔茨海默病三转基因小鼠模型中,抑制硬脂酰辅酶A去饱和酶对睡眠、脑电图活动、星形胶质细胞功能、脂质代谢和转录组的影响 | 首次结合脑电图记录、星形胶质细胞标记、脂滴分析和空间转录组学,全面评估SCD抑制对AD模型小鼠多维度病理特征的挽救作用 | 研究仅使用雌性小鼠,未涵盖性别差异;SCD抑制未能恢复AD小鼠的睡眠时间改变 | 探究SCD抑制是否能恢复AD模型小鼠的睡眠障碍,并评估其对脑脂质代谢、星形胶质细胞功能和转录组的影响 | 野生型和三转基因阿尔茨海默病雌性小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 脑电图记录、免疫组织化学、空间转录组学 | 三转基因小鼠模型 | 生理信号、图像、转录组数据 | 野生型和3xTg-AD雌性小鼠,接受SCD抑制剂或对照处理 | NA | NA | NA | NA |