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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1081 | 2026-01-20 |
Pig and human adult hematopoietic stem and progenitor cells are overall transcriptionally similar
2026-Feb, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.105334
PMID:41338433
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,比较了猪和人类成年造血干细胞和祖细胞的转录组相似性,并识别了共同的造血调控因子 | 首次在单细胞水平上系统比较猪和人类造血干细胞和祖细胞的转录组,揭示了它们在造血层级组织和调控上的高度相似性,并提供了猪HSPC群体的分选策略 | 研究主要基于转录组数据,功能验证和体内实验可能有限,且样本来源和数量未具体说明 | 研究猪造血干细胞和祖细胞的转录组特征,以支持猪作为异种移植和造血细胞治疗的潜在来源 | 猪骨髓细胞中的造血干细胞和祖细胞群体 | 单细胞组学 | 造血系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1082 | 2026-01-20 |
Periodontitis Induces Arterial Microbiota Shifts and Immune Dysregulation Contributing to Peripheral Vascular Inflammation
2026-Feb, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70055
PMID:41117288
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研究论文 | 本研究探讨牙周炎如何改变股动脉微生物群并影响免疫系统,以阐明牙周炎与周围动脉疾病(PADs)关联的机制 | 首次结合2bRAD测序和单细胞RNA测序分析牙周炎诱导的股动脉微生物群变化及其对免疫微环境的影响,并识别FABP4+内皮细胞为关键介质 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;样本量未明确说明;未探讨长期效应或临床干预 | 阐明牙周炎与周围动脉疾病(PADs)关联的机制 | 小鼠股动脉微生物群和免疫微环境 | 微生物组学与免疫学 | 牙周炎与周围动脉疾病 | 2bRAD测序用于微生物组分析,单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 微生物组序列数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1083 | 2026-01-20 |
Identification of COL8A2, MICAL2, and TNFSF10 as potential biomarkers associated with both exercise response and osteoarthritis: a multi-omics integration study
2026-Feb, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04685-9
PMID:41550487
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,识别出与骨关节炎病理和运动反应均相关的潜在分子生物标志物COL8A2、MICAL2和TNFSF10 | 首次通过整合骨关节炎相关基因、运动反应基因和单细胞分析鉴定的调节性软骨细胞标志物,利用机器学习、孟德尔随机化和分子对接等多种方法,系统性地识别并验证了同时关联骨关节炎和运动反应的三个关键基因 | 研究主要基于公共数据集和生物信息学分析,虽然在人骨关节炎软骨样本中进行了表达验证,但功能机制和临床转化潜力仍需进一步的实验研究和更大规模的队列验证 | 识别与骨关节炎病理和运动反应均相关的分子生物标志物 | 骨关节炎相关基因、运动反应基因、调节性软骨细胞 | 生物信息学 | 骨关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 孟德尔随机化, 分子对接 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 多个公共数据集及人骨关节炎软骨样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1084 | 2026-01-20 |
ASB5 is a specific marker for muscle satellite cells but dispensable for skeletal muscle development and regeneration
2026-Jan-19, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-025-00409-y
PMID:41549311
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq数据分析发现ASB5是肌肉卫星细胞的特定标记物,并通过CRISPR-Cas9基因编辑技术生成Asb5敲除小鼠,探究其在骨骼肌发育和再生中的作用 | 首次通过单细胞RNA-seq数据识别ASB5作为肌肉卫星细胞的特定标记物,并系统评估其功能缺失对骨骼肌发育和再生的影响 | 研究仅在小鼠模型中进行,未涉及人类样本;且未深入探讨ASB5在病理条件下的潜在作用 | 探究ASB5作为肌肉卫星细胞标记物的特异性及其在骨骼肌发育和再生中的功能 | 小鼠肌肉卫星细胞及Asb5敲除小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 肌肉相关疾病 | 单细胞RNA-seq, CRISPR-Cas9基因编辑, 实时PCR | NA | 单细胞RNA-seq数据, 基因表达数据 | 小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1085 | 2026-01-20 |
Angiogenic switching in cerebral cavernous malformations driven by MAP3K3-PIK3CA synergy
2026-Jan-19, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awag017
PMID:41552909
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1086 | 2026-01-20 |
ENPP1-Regulated Extracellular Purine Metabolism Drives Pancreatitis-Mediated Pancreatic Cancer
2026-Jan-19, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.09.032
PMID:41553309
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了ENPP1调控的细胞外嘌呤代谢在胰腺炎介导的胰腺癌发生中的关键作用 | 首次系统阐明了ENPP1通过调控细胞外嘌呤代谢驱动胰腺炎向胰腺癌转化的分子机制,并验证了ENPP1作为免疫治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,临床转化效果需进一步验证 | 探究慢性胰腺炎促进胰腺导管腺癌发生的分子机制 | 人类胰腺样本(慢性胰腺炎和胰腺癌患者)、基因工程小鼠模型 | NA | 胰腺癌 | 多组学分析(转录组、蛋白质组、代谢组)、单细胞测序 | NA | 多组学数据、单细胞测序数据 | 人类胰腺样本(CP和CP-PDAC患者)、Ptf1aCre/+; LSL-KrasG12D/+和Ptf1aCre/+; LSL-KrasG12D/+; Enpp1基因工程小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1087 | 2026-01-20 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals the Immune Dysregulation Characteristics of Mice Infected With Brucella abortus
2026-Jan-17, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf522
PMID:41074555
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了布鲁氏菌感染小鼠后免疫微环境的显著改变,并深入探究了其免疫逃避机制 | 首次在单细胞水平上系统描绘了布鲁氏菌感染小鼠的免疫图谱,并发现IFN-β信号通路和NK细胞免疫检查点CD94:NKG2A在感染过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,结果向人类疾病的直接转化需要进一步验证 | 阐明布鲁氏菌如何颠覆免疫反应以建立持续性感染的机制 | 感染布鲁氏流产杆菌的小鼠 | 单细胞组学 | 布鲁氏菌病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但使用了转基因细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1088 | 2026-01-20 |
Integrated Single-Nucleus and Spatial Transcriptomics Elucidate Heterogeneity and Hypoxia-Driven Organization of Supratentorial Ependymoma
2026-Jan-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-2694
PMID:41150895
|
研究论文 | 本研究通过整合单核和空间转录组学,揭示了幕上室管膜瘤的异质性和缺氧驱动的空间组织 | 首次结合单核与空间转录组学分析ST-EPN,发现两个与细胞外基质重塑和ZFTA融合身份相关的新转录程序,并开发了对混合点转录组敏感的空间评分算法以识别缺氧的空间驱动作用 | 样本量相对有限(单核n=63,空间n=30),且研究聚焦于ST-EPN,结果可能不适用于其他类型脑肿瘤 | 阐明ST-EPN的分子异质性和空间组织,以促进未来靶向治疗策略的开发 | 幕上室管膜瘤(ST-EPN)肿瘤样本 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单核转录组学,空间转录组学 | 空间评分算法 | 转录组数据 | 单核样本63个,空间样本30个 | NA | 单核RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1089 | 2026-01-20 |
Targeting the N-acetyltransferase 10/DKK2 axis enhances CD8+ T cell antitumor activity in colorectal cancer models
2026-Jan-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI196722
PMID:41542770
|
研究论文 | 本研究揭示了NAT10通过ac4C依赖性mRNA稳定化促进结直肠癌免疫逃逸的机制,并发现靶向NAT10/DKK2轴可增强CD8+ T细胞的抗肿瘤活性 | 首次阐明NAT10通过ac4C修饰稳定DKK2 mRNA,进而通过LRP6/AKT-mTOR通路诱导CD8+ T细胞胆固醇积累并损害其细胞毒性的新免疫逃逸机制 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本,需进一步在人体临床试验中验证NAT10/DKK2靶向治疗的疗效与安全性 | 探究NAT10在结直肠癌肿瘤微环境中的免疫调节作用及其分子机制 | 结直肠癌细胞、CD8+ T细胞、小鼠模型(MC38/CT-26)、患者来源类器官及临床样本 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、多组学整合分析、ac4C修饰检测 | 条件性基因敲除小鼠模型、患者来源类器官模型 | RNA-seq数据、临床病理数据、蛋白质表达数据 | 小鼠模型、患者来源类器官及临床标本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1090 | 2026-01-20 |
Discovery of a chemical small molecule inducing umbilical cord mesenchymal stem cell differentiation to vascular endothelial cells
2026-Jan-16, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00278-2
PMID:41543674
|
研究论文 | 本文发现了一种名为CPP的新型小分子化学物质,可高效诱导人脐带间充质干细胞分化为功能性血管内皮细胞 | 首次通过系统筛选鉴定出CPP这一新型小分子诱导剂,能在5天内实现>90%的高效分化,并通过单细胞RNA测序揭示了分化轨迹 | 未明确说明CPP的具体化学结构、长期安全性及在大型动物模型中的验证结果 | 开发高效诱导hUC-MSCs分化为血管内皮细胞的方法,以解决血管疾病治疗中成熟内皮细胞来源不足的问题 | 人脐带间充质干细胞(hUC-MSCs) | 干细胞与再生医学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、体外功能验证、体内功能验证 | NA | 基因表达数据、功能实验数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1091 | 2026-01-20 |
Cross-scale causal inference integrated with single-cell profiling and molecular simulations reveals a macrophage CSF1R-CD68-LYZ axis linking benzo[a]pyrene to erectile dysfunction
2026-Jan-16, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2026.109169
PMID:41548764
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、网络毒理学、分子模拟和单细胞RNA测序,揭示了苯并[a]芘通过巨噬细胞CSF1R-CD68-LYZ轴导致勃起功能障碍的分子机制 | 首次采用跨尺度因果推断方法,结合单细胞分析和分子模拟,系统阐明了环境污染物苯并[a]芘诱发勃起功能障碍的巨噬细胞介导机制,并识别出关键治疗靶点 | 研究结果主要基于计算分析和单细胞数据,未来需要通过实验验证靶点有效性,并探索针对巨噬细胞驱动炎症的具体治疗策略 | 探究环境污染物苯并[a]芘暴露与勃起功能障碍之间的因果关系及分子机制 | 勃起功能障碍患者相关数据、苯并[a]芘暴露人群、巨噬细胞及相关分子靶点 | 生物信息学与计算生物学 | 勃起功能障碍 | 孟德尔随机化、网络毒理学、分子模拟、单细胞RNA测序、虚拟基因敲除 | 因果推断模型、分子对接模拟、单细胞数据分析模型 | 基因组数据、单细胞转录组数据、分子结构数据、临床关联数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1092 | 2026-01-20 |
Current Overview of Multi-omics Analyses in Microscopic Polyangiitis and Granulomatosis with Polyangiitis
2026-Jan-15, Internal medicine (Tokyo, Japan)
DOI:10.2169/internalmedicine.5951-25
PMID:40866261
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综述 | 本文综述了多组学分析在显微镜下多血管炎和肉芽肿性多血管炎中的最新进展 | 整合了基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等多组学数据,以全面理解AAV的复杂病理生理机制 | 作为综述文章,未涉及原始研究数据,主要依赖现有文献总结,可能未涵盖所有最新研究 | 旨在通过多组学分析开发基于分子和遗传特征的个性化诊断与治疗策略 | 抗中性粒细胞胞浆抗体相关性血管炎(AAV),特别是显微镜下多血管炎和肉芽肿性多血管炎 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1093 | 2026-01-20 |
miR-22-Galectin-1 as an integral signaling axis in regulating metabolism and immunity in HCC
2026-Jan-15, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00838-3
PMID:41540504
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研究论文 | 本研究探讨了miR-22-Gal-1信号轴在肝细胞癌发展和治疗中的关键作用 | 揭示了miR-22-Gal-1轴作为HCC预后生物标志物的新功能,并阐明了其在调节代谢和肿瘤免疫中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和数据库分析,需要进一步临床验证 | 探究miR-22-Gal-1轴在HCC发展和治疗中的意义 | 肝细胞癌患者数据、小鼠HCC模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学、基因治疗、siRNA沉默、抑制剂治疗、转录组学分析 | NA | 基因表达数据、转录组数据、空间转录组数据 | 人类HCC患者数据(来自癌症基因组图谱数据库)、小鼠HCC模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1094 | 2026-01-20 |
IL-9 signaling redirects CAR T cell fate toward CD8+ memory and CD4+ cycling states, enhancing antitumor efficacy
2026-Jan-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.10.021
PMID:41274291
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研究论文 | 本研究通过赋予CAR T细胞异位IL-9信号,重塑其在抗原压力下的命运,从而增强其在实体瘤模型中的抗肿瘤疗效 | 首次证明通过共表达IL-9受体赋予CAR T细胞IL-9信号,可使其在抗原压力下避免功能障碍,转向CD8+记忆/效应状态和CD4+增殖状态,从而显著提升抗肿瘤效果 | 研究目前处于临床前模型阶段,尚未在人体临床试验中得到验证 | 克服实体瘤免疫抑制微环境对CAR T细胞疗法的限制,提升其抗肿瘤疗效 | 经过基因工程改造的CAR T细胞 | 免疫治疗 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析和RNA速率分析 | 单细胞转录组数据 | 临床前实体瘤模型(具体数量未明确说明) | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1095 | 2026-01-20 |
An innovative in vitro system unveils IGF1R signaling regulating Merkel cell generation
2026-Jan-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102756
PMID:41455470
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研究论文 | 本研究开发了新型体外培养系统,包括短期离体触须外植体、小鼠皮肤类器官和人干细胞来源的皮肤类器官,以研究Merkel细胞的发育过程 | 首次建立了包括短期离体触须外植体、小鼠皮肤类器官和人干细胞来源皮肤类器官的新型培养系统,并发现PRC抑制剂能有效促进Merkel细胞生成,同时识别IGF1R和FGFR2信号通路在其中的调控作用 | NA | 研究Merkel细胞的发育机制及其调控信号通路 | Merkel细胞、小鼠触须外植体、小鼠皮肤类器官、人干细胞来源皮肤类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学、药理学筛选 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1096 | 2026-01-20 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of neutrophils in intestinal ischemia-reperfusion injury in mice
2026-Jan-13, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2026.124208
PMID:41539463
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠肠道缺血再灌注损伤中中性粒细胞的功能异质性及其通过ATF4介导的内质网应激通路驱动损伤的机制 | 首次在肠道缺血再灌注损伤中利用单细胞RNA测序技术鉴定出一个具有促炎特性的中性粒细胞亚群(C5),并阐明其通过ATF4介导的内质网应激通路加剧损伤的具体分子机制 | 研究仅使用小鼠模型,结论在人体中的适用性有待验证;单细胞测序样本量相对有限;未深入探讨其他免疫细胞亚群的可能相互作用 | 阐明中性粒细胞在肠道缺血再灌注损伤中的具体作用机制和功能异质性 | C57BL/6小鼠的肠道组织 | 单细胞组学 | 肠道缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,使用小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1097 | 2026-01-20 |
Expression Atlas in 2026: enabling FAIR and open expression data through community collaboration and integration
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1238
PMID:41370097
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研究论文 | 本文介绍了Expression Atlas在2026年的更新,作为一个支持FAIR原则的开放表达数据知识库,通过社区协作和集成扩展了内容与功能 | 引入了新的标记基因分析模块用于批量基线实验,更新工作流以提高可重复性,并整合了单细胞RNA-seq实验和外部社区数据集如Tabula Sapiens | 未明确提及具体的技术或数据局限性 | 构建和维护一个全面、开放、可互操作的基因和蛋白质表达数据资源,支持基础和转化研究 | 基因和蛋白质表达数据,涵盖组织、细胞类型、条件和多种物种 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 超过4500项研究,涉及67个物种,包括数百个单细胞RNA-seq实验 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1098 | 2026-01-20 |
LOXL2⁺ cancer-associated fibroblasts shape WNT signaling to drive chemoresistance and poor outcomes in colorectal cancer: Insights from multi-omics and epidemiological analyses
2026-Jan-06, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101267
PMID:41496273
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与流行病学分析,揭示了LOXL2⁺癌症相关成纤维细胞通过激活WNT信号通路驱动结直肠癌化疗耐药和不良预后的机制 | 首次系统性地将LOXL2⁺ CAFs鉴定为结直肠癌化疗耐药的关键基质决定因素,并通过空间转录组学证实了其与WNT5A阳性癌细胞的物理相互作用 | 研究主要基于回顾性队列分析,需要前瞻性临床研究进一步验证LOXL2作为生物标志物的临床效用 | 阐明癌症相关成纤维细胞亚型在结直肠癌进展和治疗反应中的分子机制及临床意义 | 结直肠癌患者组织样本、癌症相关成纤维细胞亚型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、免疫荧光、功能实验 | NA | 转录组数据、空间转录组数据、临床数据 | 多个结直肠癌队列的患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1099 | 2026-01-20 |
Integration of in situ hybridization and scRNA-seq data provides a 2D topographical map of the developing retina across species
2026-Jan-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.04.697548
PMID:41509457
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研究论文 | 本研究结合多重原位杂交和单细胞转录组数据,构建了发育中视网膜的二维拓扑图,揭示了跨物种的保守轴基程序和精细空间组织差异 | 首次整合原位杂交和scRNA-seq数据进行空间重建,实现跨物种的二维基因表达拓扑映射,为研究发育组织的空间逻辑提供了通用策略 | 研究主要聚焦于脊椎动物视网膜,可能不直接适用于其他组织类型;依赖实验基准进行数据锚定,可能引入技术偏差 | 探究脊椎动物视网膜的区域模式形成和空间组织逻辑,特别是高敏锐度区域(HAA)的发育机制 | 鸡、小鼠和人类的发育中视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),多重原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据,空间基因表达数据 | 涉及鸡、小鼠和人类多个物种的发育中视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1100 | 2026-01-20 |
Differential molecular signatures in response to CD19-CAR T cell therapy compared with conventional pharmacotherapy in systemic lupus erythematosus
2026-Jan, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.06.2132
PMID:40701862
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研究论文 | 本研究比较了CD19-CAR T细胞疗法与传统药物治疗在系统性红斑狼疮患者中诱导的分子特征差异 | 首次在SLE中系统比较了CD19-CAR T细胞疗法与传统药物(利妥昔单抗、贝利木单抗、环磷酰胺)诱导缓解的分子特征差异,揭示了CAR T疗法对补体激活、I型干扰素等关键免疫通路的更强抑制作用 | 样本量较小(CAR T组仅7例),观察时间点有限,主要基于转录组数据,缺乏功能验证 | 比较CD19-CAR T细胞疗法与传统药物治疗在系统性红斑狼疮中诱导的生物学特征和分子改变 | 系统性红斑狼疮患者 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序,全血转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 7例接受CD19-CAR T治疗的SLE患者(治疗前后),30例传统药物治疗缓解的SLE患者,31例接受利妥昔单抗/贝利木单抗/环磷酰胺治疗的SLE患者(治疗前及6个月后) | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |