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当前共找到 9342 篇文献,本页显示第 1061 - 1080 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1061 2026-09-14
Integration of single-cell and bulk RNA sequencing data identified an aortic dissection-enriched ANGPTL4+ macrophage subpopulation
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该研究整合了单细胞和批量RNA测序数据,识别出一个在主动脉夹层中富集的ANGPTL4+巨噬细胞亚群,并构建了临床预测模型 首次识别出主动脉夹层富集的ANGPTL4+巨噬细胞亚群,揭示了其糖酵解表型、早期单核细胞来源特征以及通过ANGPTL和SPP1信号通路与结构细胞的相互作用,并鉴定了ANGPTL4、PHLDA1和SERPINE1作为特征基因 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证,缺乏体内动物模型验证和更大规模的临床队列验证 探究主动脉夹层中巨噬细胞的分子和细胞机制,识别新的治疗靶点 主动脉夹层患者样本中的巨噬细胞亚群 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序,批量RNA测序 机器学习算法 基因表达数据 6个公开单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
1062 2026-09-14
Zinc and metallothionein dysregulation in B cells in multiple sclerosis, with disease-specific CXCR3+/CXCR3⁻ divergence in blood
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该文重新分析两个公开的人单细胞RNA测序数据集,研究多发性硬化症患者脑脊液和外周血B细胞中锌转运蛋白和金属硫蛋白基因表达的失调情况 首次在多发性硬化症中揭示了锌稳态通路异常作为B细胞的疾病相关特征,并发现外周血中CXCR3+和CXCR3- B细胞亚群之间存在疾病特异性差异 研究基于公开数据集的重新分析,样本量有限,未进行实验验证,锌/金属硫蛋白特征的具体功能机制尚不明确 探究多发性硬化症中致病性B细胞群体的锌稳态调控情况 多发性硬化症患者、临床孤立综合征患者及健康对照者的脑脊液和外周血B细胞 数字病理学 多发性硬化症 单细胞RNA测序 NA 文本 两个公开的人类单细胞RNA测序数据集,包含脑脊液和外周血B细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1063 2026-09-14
Multi-omics approaches in idiopathic pulmonary fibrosis: from molecular mechanisms to therapeutic targets and precision medicine
2026, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
综述 本文综述了多组学方法在特发性肺纤维化研究中的应用,涵盖基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组分析和单细胞测序,以揭示其分子机制并识别生物标志物和药物靶点 系统整合多组学数据以识别特发性肺纤维化的分子内型、候选生物标志物和潜在治疗靶点,推动精准医学发展 数据整合困难、组织异质性、队列规模有限以及缺乏功能验证,这些是临床转化的主要障碍 阐明特发性肺纤维化的分子机制,识别潜在生物标志物和药物靶点,推动精准医学和个性化治疗策略的发展 特发性肺纤维化患者及相关多组学数据 机器学习 肺纤维化 基因组学, 表观基因组学, 转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 微生物组分析, 单细胞测序 NA 文本 NA NA NA NA NA
1064 2026-09-14
Concurrent expression of glucose-6-phosphate dehydrogenase and secreted phosphoprotein 1 characterizes an aggressive and immunosuppressive tumor state in hepatocellular carcinoma
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 该研究整合单细胞转录组学、大规模批量转录组建模和独立临床验证,揭示肝细胞癌中G6PD与SPP1共表达表征一种侵袭性和免疫抑制性肿瘤状态 首次发现G6PD和SPP1在治疗进展病灶的肿瘤肝细胞中同时上调,构建了代谢-转录风险特征可有效分层HCC患者总体生存,并揭示其与'炎症但抑制'肿瘤微环境的关联 该关联对现代联合治疗的预测价值需要在接受治疗的队列中进行前瞻性验证 探索肝细胞癌治疗耐药的生物学特征 肝细胞癌患者肿瘤样本,包括一个治疗进展病灶和114例初治患者的独立回顾性队列 数字病理学 肝癌 单细胞转录组学,批量转录组学,免疫组织化学 NA 图像,文本 1个治疗进展病灶的单细胞转录组样本,TCGA-LIHC和ICGC LIRI-JP大队列,以及114例初治患者的独立回顾性验证队列 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
1065 2026-09-14
Bone formation niche dysfunction in osteoporosis: insights from single-cell and spatial transcriptomic studies
2026, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
综述 该综述综合了单细胞和空间转录组学的最新发现,提出了骨形成微环境的三区模型,并提出了骨质疏松症中“空间去分区化”的假设 提出了骨形成微环境的三区模型(骨髓侧基质区、逆转/过渡区、骨表面形成区),并首次提出“空间去分区化”作为骨质疏松症的假设生成框架,将骨重建隔室 canopy 假说从概念层面推进到分子层面 现有的人类空间图谱主要来源于骨关节炎股骨头,因此提供的是参考图谱而非骨质疏松症特异性微环境紊乱的直接证据 整合单细胞和空间转录组学证据,建立理解骨形成和骨质疏松症的空间框架,并提出微环境修复性治疗策略 骨形成微环境、间充质基质细胞、骨质疏松症中的骨形成生态位 空间转录组学、单细胞转录组学 骨质疏松症 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 转录组数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
1066 2026-09-14
Spatial dynamics of cancer-associated fibroblasts links fibroblastic differentiation to immune exclusion and tumor progression
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该研究通过整合单细胞分辨率空间转录组学和标准空间转录组学数据,构建计算框架,揭示了癌症相关成纤维细胞的空间动态及其与免疫细胞和肿瘤细胞的相互作用 提出了从成纤维细胞祖细胞到COL11A1表达型侵袭性CAF(aCAF)的连续转变模型,并揭示了aCAF在肿瘤边界富集、与免疫排斥及脂质相关巨噬细胞共定位的空间关联,同时开发了开源工具SpatialAttractor用于空间基因共表达分析 摘要中未明确说明样本量、具体肿瘤类型数量及平台细节,研究的普适性和临床转化价值仍需进一步验证 研究癌症相关成纤维细胞(CAF)的空间异质性及其在肿瘤微环境中与免疫细胞和肿瘤细胞的相互作用 多种肿瘤类型中的癌症相关成纤维细胞(CAFs)、肿瘤细胞及免疫细胞 空间转录组学, 数字病理学 泛癌种 单细胞分辨率空间转录组学, 标准空间转录组学 NA 空间转录组数据, 图像 NA NA 单细胞空间转录组学, 空间转录组学 NA NA
1067 2026-09-14
Clonal evolution in gastrointestinal cancers: multi-omics insights into tumor heterogeneity, microenvironmental selection, and translational biomarkers
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
综述 本文综述了肝细胞癌、食管鳞状细胞癌和胃癌中克隆演化的多组学研究,涵盖肿瘤异质性、微环境选择及转化生物标志物 系统整合了多区域和单细胞DNA测序、单细胞和空间转录组学、蛋白质组学及纵向液体活检等多组学技术,从克隆演化角度对比了三种胃肠道癌症在播散时间、选择压力和生物标志物成熟度上的差异,并批判性讨论了系统发育推断的假设和采样偏倚 受限于横断面肿瘤图谱的因果推断局限、克隆性造血干扰、采样偏倚对系统发育推断的约束,以及广泛多组学相对于聚焦检测的增量价值尚不明确;标志物指导干预的治疗获益仍取决于具体情境,自适应治疗和演化引导仍处于研究阶段 阐明胃肠道癌症中克隆演化的多组学特征,探讨肿瘤异质性、微环境选择及转化生物标志物的研究现状与挑战 肝细胞癌、食管鳞状细胞癌和胃癌 数字病理学, 机器学习 肝癌, 食管癌, 胃癌 多区域DNA测序, 单细胞DNA测序, 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 蛋白质组学, 纵向液体活检 NA 图像, 文本, 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞DNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq, 蛋白质组学 NA NA
1068 2026-09-14
Single-cell transcriptomics deciphers cancer-associated fibroblast heterogeneity and immune regulatory mechanisms in the bladder cancer tumor microenvironment
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过分析膀胱癌单细胞转录组数据,揭示了癌症相关成纤维细胞的异质性及其免疫调控机制,并构建了一个六基因myCAF评分进行验证 在膀胱癌邻近组织中鉴定出两种转录差异显著的成纤维细胞状态(稳态成纤维细胞和CCL2高表达活化样成纤维细胞),并通过扩散伪时间分析揭示CCL2高表达细胞处于更晚的分化状态 肿瘤样本中未保留成纤维细胞样细胞,myCAF评分在协变量调整后不能独立预测总生存期,且在独立队列GSE31684中未能重复验证,研究为探索性计算框架,需要前瞻性验证 解析膀胱癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞的异质性及其免疫调控机制 膀胱癌肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAFs),以及膀胱癌细胞系RT4和T24 数字病理学 膀胱癌 单细胞转录组测序,RT-qPCR NA 单细胞转录组数据,图像数据 9,253个质控后细胞(6,035个邻近组织细胞和3,218个肿瘤细胞),TCGA-BLCA bulk转录组数据408例(过滤后401例),GSE31684队列93例 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1069 2026-09-14
Progress and challenges in exploring the pathogenesis of depressive disorders via RNA sequencing
2026, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
综述 本文综述了利用RNA测序技术(包括bulk RNA-seq、scRNA-seq和snRNA-seq)探索抑郁症(包括MDD、PND、PMD和PSD)发病机制的最新进展 系统总结了不同类型抑郁症在转录组水平上的共享核心病理机制(免疫炎症激活、突触可塑性受损、线粒体能量代谢障碍)及各自特异的分子通路,并提出了未来研究方向 样本来源受限、数据异质性高、临床转化不足 综述RNA测序技术在探索抑郁症发病机制中的应用进展与挑战 抑郁症患者(包括重度抑郁症、围产期抑郁症、围绝经期抑郁症和卒中后抑郁症) 机器学习 抑郁症 bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq NA 文本 NA NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq NA NA
1070 2026-09-14
A multi-omics integrative analyses reveals CYBB-mediated apoptotic and immune dysregulation as a key target of berberine in diffuse large B-cell lymphoma
2026, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 通过整合遗传因果推断、多组学数据与功能验证,揭示小檗碱在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的关键靶点CYBB及其介导的凋亡和免疫失调机制 首次将孟德尔随机化、多组学整合分析与功能验证相结合,系统鉴定小檗碱相关基因与DLBCL的因果关联,并优先确定CYBB为小檗碱功能相关核心靶点,揭示小檗碱-CYBB轴在DLBCL中的潜在作用 缺乏挽救实验来确认CYBB靶向的特异性及其相对贡献 鉴定小檗碱在弥漫性大B细胞淋巴瘤中相关的分子靶点和作用机制 760个小檗碱相关候选基因及弥漫性大B细胞淋巴瘤 机器学习, 数字病理学 淋巴瘤 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 转录组测序, 分子对接, 分子动力学模拟 机器学习预后模型 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 图像 760个小檗碱相关候选基因(其中315个具有足够工具变量用于孟德尔随机化分析) NA 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 NA NA
1071 2026-09-14
Integrating single-cell transcriptomics to construct an oncogene-driven prognostic model and elucidate metabolic-immune crosstalk in hepatocellular carcinoma
2026, Molecular & cellular oncology IF:2.6Q3
研究论文 该研究整合TCGA与多中心单细胞转录组数据,构建了单细胞致癌基因评分系统及基于随机生存森林的肝细胞癌预后模型,并揭示了代谢-免疫串扰 开发了单细胞“致癌基因评分”系统以量化单个细胞的致癌活性,并构建了基于随机生存森林的预后模型,揭示了高致癌活性与单细胞代谢-免疫串扰的关联 研究主要基于计算框架和假设生成,需要进一步实验验证其机制和临床适用性 构建致癌基因驱动的预后模型,并阐明肝细胞癌中的代谢-免疫串扰机制 肝细胞癌患者样本,包括TCGA和多中心单细胞转录组数据 机器学习 肝癌 单细胞转录组测序 随机生存森林 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1072 2026-09-13
GenAR: Next-scale autoregressive generation for spatial gene expression prediction
2026-Nov, Medical image analysis IF:10.7Q1
研究论文 提出GenAR,一种多尺度自回归框架,从H&E染色图像预测空间基因表达,通过层次化基因分组和离散计数token生成实现由粗到细的预测 将基因聚类为层次化组以捕捉跨基因依赖关系;将表达建模为固定整数计数token词汇表上的离散token生成以直接预测原始计数;在融合的组织学和空间嵌入上条件化解码 摘要中未明确提及 从广泛可用的H&E染色图像预测空间基因表达,作为空间转录组学的低成本替代方案 五种不同组织类型的空间转录组学数据集 计算机视觉, 机器学习, 数字病理学 NA 空间转录组学, H&E染色 自回归模型, 多尺度自回归框架 图像, 基因表达计数数据 五个空间转录组学数据集 NA 空间转录组学 NA NA
1073 2026-09-13
Tumoral AMER1 driven dopamine synthesis triggers cancer cell pyroptosis and licenses CD8+ T cell immunity in colorectal cancer
2026-Oct-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 该研究发现结直肠癌中AMER1通过稳定DDC维持肿瘤多巴胺分泌,诱导GSDMD依赖的肿瘤细胞焦亡并重塑CD8+ T细胞免疫微环境 首次将AMER1定义为免疫代谢门控因子,揭示肿瘤多巴胺合成作为连接肿瘤抑制与免疫监视的保守神经代谢效应器,并提出神经递质代谢旁路作为结直肠癌治疗策略 摘要中未明确说明研究局限性 探究经典肿瘤抑制因子AMER1在结直肠癌中对肿瘤免疫代谢微环境的外在调控作用及其机制 结直肠癌患者样本、多种免疫背景的小鼠同种移植模型、结直肠癌细胞 数字病理, 机器学习 结直肠癌 单细胞RNA测序, 多组学整合分析, 生化追踪 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1074 2026-09-13
Therapy-associated lineage plasticity in DIPG following combined CDK4/6 inhibitor, temozolomide, and radiation
2026-Oct-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 评估CDK4/6抑制剂abemaciclib联合替莫唑胺和放疗在DIPG患者来源原位异种移植模型中的疗效及治疗相关细胞状态可塑性 揭示了不同疾病背景DIPG模型对联合治疗的反应差异及治疗耐受细胞状态,发现了放疗抵抗亚群及候选放疗增敏靶基因NPAS3、TBC1D15和INPP4B 仅基于两个患者来源原位异种移植模型,样本量有限,需要更大队列验证 探究abemaciclib联合替莫唑胺和放疗对DIPG的治疗效果及残余细胞状态可塑性变化 DIPG患者来源原位异种移植模型(IBs-9119DIPG来自初治活检,IBs-A0317DIPG来自既往治疗后的尸检肿瘤) 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 图像 2个患者来源原位异种移植模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1075 2026-09-13
Loss of PBRM1 accelerates pancreatic cancer progression by inducing acquisition of mesenchymal phenotype and inflammatory cancer-associated fibroblasts reprogramming
2026-Oct-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本文研究了PBRM1在胰腺导管腺癌(PDAC)中的抑癌作用,发现其缺失通过表观遗传重塑上调Zeb1,促进间充质表型获得和炎症性癌症相关成纤维细胞重编程,从而加速肿瘤进展 首次通过胰腺特异性Pbrm1敲除小鼠模型结合单细胞转录组学,揭示了PBRM1缺失通过表观遗传调控Zeb1表达,驱动PDAC肿瘤细胞间充质转化和基质炎症性CAF重编程的双重机制 未明确说明样本量及具体公共基因组数据集信息,机制研究主要依赖小鼠模型,人类PDAC样本验证有限 探究PBRM1在胰腺导管腺癌中的分子功能及其临床相关性 人类PDAC样本、公共基因组数据集、Kras驱动及Kras/Trp53突变PDAC小鼠模型 digital pathology 胰腺癌 单细胞转录组学、批量转录组学、表观遗传染色质重塑分析 NA 转录组数据、基因组数据 人类PDAC样本及公共基因组数据集(数量未明确),小鼠模型(数量未明确) NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1076 2026-09-13
Ophiopogonin D induced Plet1+ macrophage differentiation to treat acute lung injury through blocking the interaction between NCOR1 and PPARγ
2026-Oct-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 该研究发现麦冬皂苷D通过结合NCOR1并阻断NCOR1与PPARγ的相互作用,激活PPARγ,促进Plet1+巨噬细胞分化,从而改善LPS诱导的急性肺损伤 首次揭示OPD通过直接结合NCOR1、阻断NCOR1-PPARγ相互作用来激活PPARγ,进而诱导Plet1+巨噬细胞(一种M2样亚群)分化,阐明了OPD治疗ALI的新机制 研究主要基于小鼠LPS诱导的ALI模型,尚未在临床患者中验证OPD的疗效;Plet1+巨噬细胞在人体中的功能和OPD的临床转化潜力仍需进一步研究 探究OPD治疗急性肺损伤的疗效及其分子机制 LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型及巨噬细胞 机器学习 急性肺损伤 单细胞RNA测序, 热蛋白质组分析 NA 文本, 图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1077 2026-09-13
PLOD2 promotes colorectal cancer progression and immune escape via attenuating CD8+ T cells function
2026-Oct-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序和功能实验揭示了PLOD2通过稳定c-Myc上调PD-L1、抑制CD8+ T细胞功能从而促进结直肠癌进展和免疫逃逸的机制 首次阐明PLOD2通过与c-Myc直接互作并阻止其蛋白酶体降解,进而上调PD-L1表达,介导结直肠癌免疫逃逸;并证明靶向PLOD2可增强抗CTLA-4免疫治疗疗效 研究主要基于细胞系和小鼠模型,缺乏大规模临床样本验证;PLOD2作为生物标志物的临床应用价值尚需进一步前瞻性研究确认 探究PLOD2在结直肠癌免疫调节和免疫治疗响应中的作用及其分子机制 结直肠癌细胞系、小鼠肿瘤模型及结直肠癌组织 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1078 2026-09-13
Macrophage-associated TLR9 signaling contributes to chronic cardiac allograft fibrosis via macrophage-to-myofibroblast transition and paracrine fibroblast activation
2026-Oct-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 该研究揭示了受体TLR9信号通过巨噬细胞-肌成纤维细胞转化和旁分泌成纤维细胞活化促进慢性心脏移植物纤维化的机制,并评估了羟氯喹对该通路的药理调控作用 首次发现受体TLR9信号是巨噬细胞相关慢性心脏移植物纤维化重塑的重要调节因子,阐明了TLR9通过TGF-β1/Smad3轴驱动巨噬细胞-肌成纤维细胞转化以及通过IL-6/Stat3旁分泌途径激活成纤维细胞的双重机制,并证明羟氯喹可靶向该通路改善移植物存活 研究主要基于小鼠异位心脏移植模型,尚未在人类临床样本中验证TLR9通路的作用;羟氯喹的非特异性免疫调节效应可能涉及其他通路;单细胞RNA测序的细胞数量和时间点覆盖可能有限 探究受体TLR9信号在慢性同种异体移植物排斥反应中对巨噬细胞相关纤维化重塑的贡献,并评估药物调控该通路的治疗潜力 小鼠异位心脏移植模型中的巨噬细胞、成纤维细胞及移植物组织 数字病理学, 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1079 2026-09-13
MXRA7: A potential link between macrophage M1 polarization and epithelial Pyroptosis in ulcerative colitis
2026-Oct-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序分析、临床样本和DSS诱导小鼠结肠炎模型,揭示MXRA7通过抑制NF-κB通路减少巨噬细胞M1极化并缓解上皮细胞焦亡,从而减轻溃疡性结肠炎结肠组织损伤 首次揭示MXRA7在溃疡性结肠炎中通过双重调控机制发挥作用:一方面抑制NF-κB信号通路减少巨噬细胞M1极化,另一方面缓解M1型巨噬细胞诱导的结肠上皮细胞焦亡 摘要中未明确提及研究局限性 探究MXRA7在溃疡性结肠炎进展中的作用及其与巨噬细胞M1极化和结肠上皮细胞焦亡之间的相互作用机制 溃疡性结肠炎患者的临床结肠组织、DSS诱导的小鼠结肠炎模型、体外共培养细胞体系 机器学习, 数字病理学 溃疡性结肠炎 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 细胞间通讯分析, 基因敲低/过表达, 分子生物学实验, 体外细胞共培养 NA 图像, 文本 GSE214695单细胞RNA测序数据集、UC患者临床结肠组织及DSS诱导小鼠结肠炎模型组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1080 2026-09-13
Macrophage VISTA restrains inflammatory and antigen-presenting programs during alloimmune tissue injury
2026-Oct-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本文利用急性心脏同种异体移植排斥模型,发现巨噬细胞中VISTA(由Vsir编码)在移植排斥过程中表达下降,并揭示VISTA通过限制炎症和抗原呈递程序来抑制同种免疫组织损伤 首次将VISTA鉴定为巨噬细胞炎症编程的内在调控因子,并揭示了H3K4me3相关的染色质重塑是VISTA介导炎症抑制的调控层 摘要中未明确说明研究的局限性 探究限制巨噬细胞炎症编程的内在检查点机制,以及VISTA在巨噬细胞炎症和抗原呈递调控中的作用 急性心脏同种异体移植排斥模型中的移植物巨噬细胞 单细胞组学,免疫学 同种免疫组织损伤,心脏移植排斥 单细胞RNA测序,CUT&Tag,RNA-seq,假时序分析 NA 文本,图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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