单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 5215 篇文献，本页显示第 1021 - 1040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2026-05-01 |
Single-Cell sequencing investigation of endoplasmic reticulum stress-related genes in gastric cancer prognostic models and identification of NOX5 as a novel therapeutic target
2026-Apr-20, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102780
PMID:42013548
|
研究论文 | 利用单细胞测序研究内质网应激相关基因在胃癌预后模型中的作用，并鉴定NOX5为新治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序分析构建基于内质网应激的胃癌预后模型，并发现NOX5作为新潜在治疗靶点 | NA | 开发基于单细胞分析的内质网应激相关预后标志物，并鉴定潜在治疗靶点 | 胃癌细胞系AGS和MKN-45 | 机器学习,自然语言处理 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归,LASSO | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1022 | 2026-04-20 |
Deciphering immune and cellular reprogramming during the progression from inflammatory bowel disease to colorectal cancer using multi-omics single-cell and spatial transcriptomics
2026-Apr-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08158-2
PMID:42001187
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1023 | 2026-05-01 |
A self-perpetuating cycle of Type H vessel proliferation and T-2 induced inflammation drives KBD pathogenesis
2026-Apr-16, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2026.04.004
PMID:42000119
|
研究论文 | 本研究探讨了T-2毒素诱导的H型血管增殖与炎症在大骨节病（KBD）发病机制中的作用，并验证了其形成自循环驱动KBD进展 | 首次发现H型血管在大骨节病发病中的关键中介作用，揭示了T-2毒素运输、炎症与软骨损伤之间的恶性循环机制 | 未明确说明 | 探究H型血管在大骨节病（KBD）发病机制中的作用 | 大鼠KBD模型、H型血管 | 机器学习 | 其他疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、qPCR、免疫荧光、组织病理学 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 大鼠分为四组：对照组、低硒+T-2组、低硒+T-2+Roxadustat组、低硒+T-2+Halofuginone组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1024 | 2026-05-01 |
Locat: Joint enrichment and depletion testing identifies localized marker genes in single-cell transcriptomics
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.716370
PMID:41993378
|
研究论文 | 提出一种名为Locat的框架，通过联合评估单细胞转录组数据中基因表达的富集和缺失，识别高度特异性的局部化标记基因 | 传统方法仅关注基因在候选群体内的富集，Locat同时检测表达在群体外是否显著缺失，并整合两者形成统一的局部化评分 | NA | 开发一种新的统计框架，以识别单细胞转录组数据中具有高度空间特异性的标记基因 | 单细胞转录组数据中的基因表达模式 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权高斯混合模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1025 | 2026-05-01 |
Spatial Transcriptomics and Dual Dye Mapping Identify Wnt-Driven BBB Protection in Endothelial EphA4-Deficiency
2026-Apr-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9261231/v1
PMID:41994141
|
研究论文 | 通过空间转录组学和双染料标记技术，揭示EphA4缺失内皮细胞中Wnt信号驱动的血脑屏障保护机制 | 首次结合双染料标记系统与空间转录组学，解析创伤性脑损伤后血脑屏障破坏的时空动态及EphA4/Wnt信号通路的作用 | 未明确说明局限性 | 研究创伤性脑损伤后血脑屏障破坏的分子和空间特征，以及EphA4/Wnt信号在保护血脑屏障中的作用 | 内皮细胞特异性EphA4基因敲除小鼠和野生型小鼠 | 数字病理学 | 创伤性脑损伤 | 空间转录组学, 双染料标记, 免疫组化 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | 小鼠样本，具体数量未提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1026 | 2026-05-01 |
Aging restricts maturation of CXCL13+ T follicular helper cells in human immunity
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.715992
PMID:41993471
|
研究论文 | 利用人类扁桃体类器官、单细胞RNA测序和CRISPR干扰技术，揭示了衰老通过限制CXCL13+滤泡辅助性T细胞的成熟来影响人类体液免疫 | 首次在人类特异性免疫衰老研究中发现衰老导致CXCL13 GC-Tfh细胞选择性缺失，并鉴定BACH2和SOX4为与年龄相关的分化转录调控因子 | 未明确说明限制条件 | 探究衰老对滤泡辅助性T细胞（Tfh）成熟的影响及其在抗体反应下降中的作用 | T滤泡辅助细胞（Tfh细胞）和B细胞 | 机器学习 | 老年病 | 单细胞RNA测序、CRISPR干扰 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 来自年轻和年长供体的人类扁桃体类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1027 | 2026-05-01 |
Defining the RNA Modification Landscape of Multiple Myeloma Reveals METTL3-Dependent m6A Regulation of NEAT1
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.04.716518
PMID:41993494
|
研究论文 | 通过整合质谱、Nanopore直接RNA测序和甲基化RNA免疫沉淀测序，定义了多发性骨髓瘤的RNA修饰景观，并揭示了METTL3依赖的m6A修饰对NEAT1的调控作用 | 首次系统描绘多发性骨髓瘤中RNA修饰的全景图谱，发现了超过15000个m6A位点，并鉴定了m6A修饰的长链非编码RNA NEAT1在疾病中的关键调控作用 | 未明确提及研究的局限点 | 解析多发性骨髓瘤中的RNA修饰图谱及m6A修饰的长链非编码RNA在疾病中的作用机制 | 多发性骨髓瘤细胞和健康细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 质谱, Nanopore直接RNA测序, 甲基化RNA免疫沉淀测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多发性骨髓瘤细胞和健康细胞样本 | Oxford Nanopore Technologies | Nanopore直接RNA测序, 单细胞RNA测序 | Nanopore测序平台 | Nanopore直接RNA测序用于鉴定RNA修饰类型和m6A位点 |
| 1028 | 2026-05-01 |
RETN exacerbates sepsis by GBP5/NLRP3 signaling pathway-mediated pyroptosis of macrophage
2026-04, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00387-1
PMID:41764353
|
研究论文 | 本研究揭示RETN通过GBP5/NLRP3信号通路介导巨噬细胞焦亡加重脓毒症的机制 | 首次阐明RETN/GBP5/NLRP3信号轴调控巨噬细胞焦亡从而加重脓毒症的机制，为脓毒症的病理机制研究和临床治疗提供新的潜在靶点和理论支持 | 未明确提及具体局限性 | 探究RETN在脓毒症病理生理过程中的具体作用机制 | 脓毒症患者和脓毒症小鼠模型中的巨噬细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞测序、RNA-seq | NA | 单细胞测序和RNA-seq数据 | 脓毒症患者样本及小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1029 | 2026-05-01 |
The AICL-KLRF1 axis supports CD4-CD8 T cell communication and cytokine competence in pre-exhausted CD8+ T cells
2026-Apr, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-026-00732-5
PMID:41851343
|
研究论文 | 该研究揭示了AICL-KLRF1轴在晚期分化CD8 T细胞中支持细胞因子产生，并促进CD4-CD8 T细胞通讯 | 首次发现KLRF1作为CD4-CD8通讯轴的一部分，通过识别其配体AICL来支持晚期分化CD8 T细胞的细胞因子产生能力 | 未详细说明研究的具体局限性 | 探究在慢性感染和癌症中，维持前体耗竭CD8 T细胞细胞因子产生的信号机制 | 人类CD8 T细胞、CD4 T细胞、肺腺癌组织及邻近组织 | 免疫学 | 肺癌 | 空间蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 表观遗传组数据 | 肺腺癌和邻近组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 和单细胞ATAC测序 |
| 1030 | 2026-03-21 |
scZiva: imputation method for single-cell RNA-seq data with zero-inflated variational autoencoder
2026-Mar-19, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06422-2
PMID:41857511
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1031 | 2026-03-20 |
Lactylation-related gene signature for prognosis prediction and immune infiltration assessment in lung adenocarcinoma via bulk and single-cell RNA sequencing
2026-Mar-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04845-0
PMID:41851557
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1032 | 2026-05-01 |
Heterogeneity and Regulatory Mechanisms of ALK-Mutant and Wild-Type Epithelial Cells in Non-Small-Cell Lung Cancer: Single-Cell Transcriptomics and Chromatin Accessibility
2026-Mar-12, Pharmacology
IF:2.9Q2
DOI:10.1159/000550967
PMID:41818350
|
研究论文 | 利用单细胞转录组和染色质可及性分析，揭示ALK突变型和野生型非小细胞肺癌上皮细胞的异质性与调控机制 | 首次整合scRNA-seq和scATAC-seq数据，比较ALK突变与野生型肿瘤的分子差异，并鉴定CEACAM6-AKT-EGR1信号轴在耐药和恶性进展中的作用 | 样本量较小，仅5例野生型和4例ALK突变型样本；未在动物模型中验证CEACAM6靶向治疗的疗效 | 解析ALK突变型和野生型NSCLC肿瘤上皮细胞的异质性和表观遗传调控差异 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织样本（5例ALK野生型，4例ALK突变型） | 机器学习, 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 9例非小细胞肺癌肿瘤组织样本（5例ALK野生型，4例ALK突变型） | Illumina | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | Illumina NovaSeq | 从GEO数据库获取GSE274934数据集的单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据 |
| 1033 | 2026-05-01 |
The landscape of B and plasma cells in breast cancer: insights from single-cell and spatial transcriptomics
2026-Mar-12, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-026-00917-0
PMID:41820356
|
研究论文 | 通过整合公开单细胞RNA测序数据和新生成的79份样本单细胞测序数据，构建了乳腺癌中B细胞和浆细胞的高分辨率图谱，揭示了其异质性和功能多样性 | 首次在乳腺癌中识别出两种肿瘤富集的B细胞亚群——CD200初始B细胞和ISG15非典型记忆B细胞，并验证了CD200 B细胞在抗肿瘤免疫和免疫检查点阻断治疗中的关键作用 | 未提及 | 解析乳腺癌中B细胞和浆细胞的异质性及其功能角色，探索其作为免疫治疗生物标志物和靶点的潜力 | 35名乳腺癌患者的79份样本（B细胞和浆细胞） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、单细胞BCR测序、空间转录组学 | 不适用 | 基因表达数据、BCR序列数据、空间转录组学数据 | 35名患者共79份样本 | 不适用 | 单细胞RNA测序、单细胞BCR测序、空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 1034 | 2026-05-01 |
Artificial intelligence assisted multi-model pathological diagnosis of breast cancer based on multispectral autofluorescence images
2026-Mar-12, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-026-00915-2
PMID:41820369
|
研究论文 | 提出一个结合多光谱自发荧光成像与优化深度学习架构的新框架，用于生成高质量、无标记、与苏木精-伊红染色等效的乳腺癌病理图像 | 通过引入显著性和全局特征一致性损失增强CycleGAN，实现无需像素级配准的非配对数据虚拟染色，且为非破坏性方法，同一组织切片可后续用于单细胞RNA测序或空间转录组学 | 未提及具体局限性 | 开发快速、非破坏性的诊断级乳腺癌病理图像生成方法，用于临床诊断和机制研究 | 临床样本、小鼠模型和类器官共培养样本 | 计算机视觉 | 乳腺癌 | 多光谱自发荧光成像 | CycleGAN | 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1035 | 2026-05-01 |
STHELAR, a multi-tissue dataset linking spatial transcriptomics and histology for cell type annotation
2026-Mar-12, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-06937-6
PMID:41820393
|
研究论文 | 介绍了一个整合空间转录组学与H&E组织学图像的多组织数据集STHELAR，用于细胞类型注释 | 首次构建了包含16种组织类型、超过1100万个细胞的大规模多组织空间转录组数据集，并关联了H&E全切片图像，为直接从组织学图像预测细胞类型提供了参考资源 | 未提及具体限制，但可能存在数据来源于特定平台（Xenium FFPE）和细胞类别为十种泛癌类别的泛化局限性 | 通过整合空间转录组学与组织学图像，开发用于细胞类型注释的大规模数据集，以促进肿瘤微环境研究 | 来自22名癌症患者和9名非癌症患者的31个人类Xenium FFPE组织切片，涵盖16种组织类型 | 数字病理学, 空间转录组学 | 肿瘤（泛癌） | 空间转录组学, H&E染色 | 人工智能模型（用于从组织学图像预测细胞类型注释） | 图像, 基因表达数据 | 31个组织切片，来自31名患者（22例癌症，9例非癌症），包含超过1100万个细胞和50万个组织图像块 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | 10x Xenium FFPE组织切片 |
| 1036 | 2026-05-01 |
Low-dose chemotherapy remodels hepatic immune landscape and potentiates antitumor response to immune checkpoint blockade in cholangiocarcinoma
2026-Mar-04, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001735
PMID:41779955
|
研究论文 | 该研究探索低剂量吉西他滨/顺铂联合抗PD-L1治疗肝内胆管癌的疗效和机制 | 首次揭示低剂量化疗通过重塑肝内免疫景观并解除SPP1-VLA-4信号轴对CD8+T细胞的抑制，增强抗PD-L1免疫治疗的抗肿瘤应答 | 尚未明确低剂量化疗在不同肝内胆管癌亚型中的效果差异及长期疗效数据 | 优化肝内胆管癌治疗策略，降低化疗毒性并提高免疫治疗疗效 | 多种肝内胆管癌小鼠模型及患者来源的肿瘤组织和临床样本 | 机器学习 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 体内/体外功能实验 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 多种小鼠模型及部分肝内胆管癌患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 1037 | 2026-05-01 |
A tumor-promoting inflammatory SPP1+ macrophage-IL-6-CRP axis drives immune dysfunction in bladder cancer
2026-Feb-27, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-1774
PMID:41747249
|
研究论文 | 本研究揭示了膀胱癌中SPP1+巨噬细胞通过IL-6-CRP轴驱动免疫功能障碍的促炎机制 | 首次将全身性炎症标志物（IL-6/CRP）与肿瘤微环境中的SPP1+巨噬细胞免疫抑制功能直接关联，并定义了驱动免疫检查点阻断治疗耐药的巨噬细胞轴 | 未明确说明样本量大小及队列种族多样性，且因果验证主要依赖相关性分析和功能实验，缺乏更直接的体内干预证据 | 探究膀胱癌中全身性炎症与肿瘤微环境免疫功能障碍的关联机制 | 接受免疫检查点阻断治疗的膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序平台，Illumina NovaSeq批量RNA测序 |
| 1038 | 2026-05-01 |
[Spatial omics in pulmonary fibrosis: advancing mechanistic insights and therapeutic strategies]
2026-02-25, Zhejiang da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Zhejiang University. Medical sciences
DOI:10.3724/zdxbyxb-2025-0785
PMID:41631436
|
综述 | 综述空间组学技术在肺纤维化研究中的应用进展，揭示其在理解疾病机制和开发治疗策略中的潜力 | 系统整合空间代谢组学、转录组学和蛋白质组学在肺纤维化研究中的最新成果，强调其保留组织空间上下文的高通量分析能力 | 未提及具体样本量和跨平台验证等方面的局限性 | 探讨空间组学技术如何推动肺纤维化精准诊断、治疗靶点发现和药物开发 | 肺纤维化疾病，特别是特发性肺纤维化的组织微环境 | 数字病理学 | 肺纤维化、特发性肺纤维化 | 空间代谢组学、空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | 图像、分子数据 | NA | NA | 空间代谢组学、空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1039 | 2026-05-01 |
Interferon stimulation and NKG2D expression drive enhanced natural killer cell antibody-dependent cellular cytotoxicity against viral infections
2026-Feb-09, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag019
PMID:41634919
|
研究论文 | 结合功能性ADCC检测和单细胞转录组学，分析COVID-19患者外周NK细胞中干扰素刺激和NKG2D表达对抗体依赖性细胞毒作用的增强机制 | 首次通过单细胞转录组学揭示高ADCC反应与低ADCC反应NK细胞的不同转录程序，发现干扰素刺激基因和NKG2D的高表达与ADCC增强相关，同时发现干扰素介导的NK细胞激活与抗体ADCC能力降低之间存在矛盾调节机制 | 未提供具体的限制信息 | 探究NK细胞内在因素和抗体在介导抗病毒ADCC反应中的相对贡献，揭示其分子决定因素 | COVID-19患者的外周NK细胞 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | COVID-19参与者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1040 | 2026-05-01 |
Hspa8 modulation of immune responses mitigates ischemic brain injury
2026-02, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00359-x
PMID:41176589
|
研究论文 | 本研究探讨热休克蛋白A8在缺血性脑损伤后调节免疫细胞动态变化中的作用 | 首次揭示Hspa8通过调节中性粒细胞浸润和活性氧产生来缓解缺血性脑损伤的免疫机制 | 未提及具体局限性 | 阐明Hspa8在缺血性脑损伤后免疫炎症反应中的调节作用 | 缺血性脑损伤模型中的T细胞、中性粒细胞和单核细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、流式细胞术、免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |