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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2026-05-01 |
RUNX2 drives adenoma-to-carcinoma transition in colon cancer
2026-Apr-29, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08801-2
PMID:42056097
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序等技术揭示RUNX2驱动结肠腺瘤向腺癌转变的关键机制 | 首次发现RUNX2通过CD8耗竭T细胞-TNF-α-TNFRSF1A通路驱动结肠腺瘤向腺癌转变,并验证了其特异性抑制剂CADD522的抑制作用 | 未明确说明实验样本量及临床转化验证的局限性 | 阐明结肠腺瘤向腺癌转变的分子机制 | 结肠腺瘤和腺癌组织中的CD8耗竭T细胞和上皮细胞 | 机器学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | 九基因风险评分模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1002 | 2026-05-01 |
Clec3b⁺ fibroblasts are the primary effectors of portal fibrosis following activation via a KLF4/periostin axis
2026-Apr-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72394-9
PMID:42056126
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和遗传谱系追踪,鉴定Clec3b⁺成纤维细胞为门脉纤维化的主要效应细胞,并揭示KLF4/Periostin轴调控其活化 | 首次明确Clec3b⁺成纤维细胞是胆道损伤后门脉纤维化的主要效应细胞,并发现KLF4/Periostin信号轴是调控其活化的关键机制 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全代表人类疾病,且未涉及其他慢性肝病中的门脉纤维化机制 | 探究胆道疾病中门脉纤维化的细胞和分子机制,特别是寻找关键效应细胞和调控通路 | 小鼠模型中的门脉成纤维细胞,特别是Clec3b⁺成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | 胆道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型样本,具体数量文中未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于小鼠门脉成纤维细胞分析 |
| 1003 | 2026-05-01 |
CXCL5 is associated with neutrophil-driven intestinal inflammation and IL-17-associated epithelial signaling in inflammatory bowel disease
2026-Apr-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-49523-x
PMID:42056229
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研究论文 | 探究CXCL5在炎症性肠病中的功能,重点关注其与IL-17信号通路的相互作用及中性粒细胞驱动的肠道炎症机制 | 首次揭示CXCL5在肠上皮细胞中的特异性表达及其与IL-17协同调控中性粒细胞趋化的阶段依赖性作用,提出CXCL5/IL-17轴作为IBD潜在治疗靶点 | 慢性结肠炎模型中CXCL5缺失未显著改变疾病严重程度,需要进一步机制研究阐明其阶段特异性作用的分子基础 | 阐明CXCL5在炎症性肠病发病机制中的作用及其与IL-17信号通路的交互关系 | IBD患者结肠组织样本、公开单细胞RNA测序数据、急性及慢性小鼠结肠炎模型、人肠上皮细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | IBD患者结肠组织样本及公开单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1004 | 2026-05-01 |
Spatial transcriptomic mapping of canine osteosarcoma reveals immune microenvironment features linked to survival
2026-Apr-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10152-9
PMID:42056464
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研究论文 | 利用空间转录组技术绘制犬骨肉瘤的免疫微环境图谱,揭示与生存相关的特征 | 首次使用10x Genomics Visium平台对犬骨肉瘤进行空间转录组分析,结合单细胞数据解卷积,识别与生存相关的免疫细胞空间共定位模式 | 样本量较小(11只犬的14个肿瘤样本),未提及技术重复或批次效应校正 | 探究犬骨肉瘤肿瘤内异质性和肿瘤微环境的空间特征,识别与生存相关的免疫微环境特征 | 11只犬的14个骨肉瘤肿瘤样本(包括原发、转移和复发肿瘤),按生存结果分层 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 11只犬的14个肿瘤样本,共18,834个组织斑点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium平台用于新鲜冷冻犬骨肉瘤组织切片的空间基因表达分析 |
| 1005 | 2026-05-01 |
Spatial atlas of diabetic kidney disease reveals a B cell-rich subgroup
2026-Apr-29, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10363-4
PMID:42056516
|
研究论文 | 利用Xenium和CosMx单细胞空间转录组学技术,结合单核RNA测序,构建糖尿病肾病空间图谱,揭示富含B细胞的亚型 | 首次通过跨平台空间转录组学构建可计算的肾脏组织架构,将组织微环境与预后、非侵入性检测及患者分层联系起来;发现了以B细胞为主的第三淋巴结构样免疫微环境,定义了独特的糖尿病肾病亚型 | NA | 探究糖尿病肾病的组织微环境异质性,识别可预测疾病进展的亚型及生物标志物 | 糖尿病肾病患者的肾脏组织样本 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞空间转录组学(Xenium、CosMx)、单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据、单核RNA测序数据 | NA | 10x Genomics, NanoString | 单细胞空间转录组学, 单核RNA测序 | Xenium, CosMx | Xenium和CosMx单细胞空间转录组平台 |
| 1006 | 2026-05-01 |
Single-cell transcriptomics reveals ADRB1 as a key immune checkpoint regulating T cell exhaustion in lung cancer and its prognostic value in lung cancer
2026-Apr-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05112-y
PMID:42056648
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示ADRB1作为肺癌中调节T细胞耗竭的关键免疫检查点及其预后价值 | 首次描述ADRB1作为参与肺癌T细胞耗竭的新型免疫检查点,并证明ADRB1+ T细胞为潜在生物标志物和治疗靶点 | 功能研究和临床试验仍需进行以验证该新概念在治疗策略中的可行性 | 研究ADRB1在肺癌T细胞耗竭中的作用及其预后价值 | 肺腺癌和肺鳞癌患者的肿瘤及癌旁组织 | 自然语言处理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,TCGA批量RNA-seq数据 | 未明确样本数量,涉及LUAD和LUSC患者的肿瘤及癌旁组织 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1007 | 2026-05-01 |
Integrated Genomic and Single-Cell Analysis Identifies Notch1 as a Metastasis Suppressor in Nasopharyngeal Carcinoma Targeted by the AKT/Smad3 Axis
2026-Apr-29, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-026-00341-5
PMID:42056895
|
研究论文 | 本研究系统探讨Notch1作为鼻咽癌转移抑制因子的功能及其通过AKT/Smad3轴调控上皮间质转化和转移的分子机制 | 首次通过整合基因组与单细胞分析揭示Notch1经AKT/Smad3轴抑制鼻咽癌转移的新型分子机制,并基于Notch1相关基因建立三种分子亚型(C1、C2、C3)用于预后分层 | 未明确提及具体局限性,但部分分析基于公共数据库(TCGA/GEO)及小样本临床验证,需进一步扩大样本验证 | 阐明Notch1在鼻咽癌侵袭转移中的抑癌功能及其分子机制 | 鼻咽癌临床组织样本、细胞系及裸鼠模型 | 机器学习和数字病理 | 鼻咽癌 | 免疫组化、单细胞RNA测序、TCGA/GEO数据整合分析、Western blot、co-IP、体内外功能实验 | 共识聚类、分子分型(C1/C2/C3) | 基因表达数据、单细胞转录组数据、临床组织微阵列数据 | 鼻咽癌组织微阵列(样本数未明确)、单细胞RNA测序临床样本(数量未明确)、多个细胞系及裸鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1008 | 2026-05-01 |
Therapeutic effects of mesenchymal stem cell-derived extracellular vesicles from different tissue sources on diminished ovarian reserve and the related mechanisms
2026-Apr-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04403-4
PMID:42057118
|
研究论文 | 该论文比较了脂肪组织和脐带来源的间充质干细胞外泌体对环磷酰胺诱导的卵巢储备功能减退小鼠模型的治疗作用及机制 | 首次系统比较不同组织来源的间充质干细胞外泌体在卵巢储备功能减退治疗中的效果差异,并揭示脐带来源外泌体具有更广泛调控作用 | 研究对象为小鼠模型,缺乏临床样本验证;外泌体长期疗效和安全性需进一步评估 | 探讨不同组织来源的间充质干细胞外泌体对卵巢储备功能减退的治疗效果及机制 | 环磷酰胺诱导的卵巢储备功能减退小鼠模型 | 数字病理学 | 生殖疾病 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 环磷酰胺诱导的卵巢储备功能减退小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1009 | 2026-05-01 |
Integrated bioinformatics analysis of the shared molecular mechanisms between Parkinson's disease and COVID-19
2026-Apr-28, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00908-25
PMID:41930954
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析和单细胞RNA测序,探讨帕金森病与COVID-19之间的共享分子机制 | 首次利用单细胞RNA测序揭示CHI3L1在星形胶质细胞中的表达增加是连接COVID-19与帕金森病的关键分子机制,并发现星形胶质细胞通过多种信号分子与神经细胞活跃通讯 | 研究基于公开数据库,样本量有限,且缺乏进一步的实验验证 | 揭示帕金森病与COVID-19共享的分子机制,为治疗靶点提供新见解 | 帕金森病和COVID-19患者的基因表达数据及脑组织单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 帕金森病,新冠肺炎 | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | 差异表达分析,蛋白质-蛋白质相互作用网络,细胞通讯分析 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 公开数据库中COVID-19和帕金森病患者的样本 | 不适用 | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 1010 | 2026-05-01 |
Enhancer-directed gene delivery for digit regeneration based on conserved epidermal factors
2026-Apr-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2532804123
PMID:41980086
|
研究论文 | 基于保守表皮因子的增强子导向基因递送平台促进小鼠指尖再生 | 利用多物种(斑马鱼、蝾螈、小鼠)再生能力对比,鉴定SP转录因子家族为保守表皮再生因子,并通过增强子导向的AAV载体实现时空特异性FGF8表达,部分挽救小鼠指尖再生缺陷 | 未提及在人体的验证有效性及长期安全性评估 | 开发基于保守再生因子的基因疗法促进哺乳动物肢体再生 | 小鼠指尖再生模型、斑马鱼尾鳍再生、蝾螈肢体再生 | 机器学习和数字病理 | 肢体缺失 | 单细胞RNA测序、AAV基因递送、条件性敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠(数量未明确)、斑马鱼(数量未明确)、蝾螈(数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 用于斑马鱼尾鳍再生组织的单细胞转录组测序 |
| 1011 | 2026-05-01 |
Targeting GPR34 in damage-associated macrophages enhances anti-tumor immunity and the efficacy of Surufatinib in pancreatic cancer
2026-Apr-28, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02641-4
PMID:42045172
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序识别出高表达GPR34的损伤相关巨噬细胞亚群,并证明靶向GPR34可增强胰腺癌抗肿瘤免疫和索凡替尼疗效 | 首次在胰腺癌中发现GPR34+损伤相关巨噬细胞亚群,揭示其通过释放LysoPS促进CXCL16分泌和胞葬作用导致CD8 T细胞耗竭的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养,尚需进一步的临床试验验证 | 探究靶向GPR34在胰腺癌免疫治疗中的潜在价值 | 胰腺导管腺癌患者标本、Gpr34小鼠模型及体外共培养体系 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 接受索凡替尼联合化疗的患者标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1012 | 2026-05-01 |
The emergence of neurogenic lineage motifs in building the vertebrate retina
2026-Apr-28, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102479
PMID:42054855
|
综述 | 该综述综合了分子和谱系逻辑,探讨脊椎动物视网膜单个祖细胞池如何产生神经元的多样性 | 发现并强调了神经源性谱系基序——跨物种的神经源性视网膜祖细胞可重复的神经元输出,揭示了兄弟细胞命运协调的基本约束,并作为理解细胞类型特化的基本单元 | 主要基于现有单细胞测序研究的整合,可能受限于不同研究间的技术差异和样本覆盖度 | 解析视网膜神经元多样性产生的分子和谱系逻辑 | 脊椎动物视网膜祖细胞及其产生的神经元类型 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组和表观遗传数据 | 多发育阶段的多种脊椎动物视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1013 | 2026-05-01 |
Retraction notice to "Gene expression profile of human placental villous pericytes in the first trimester -an analysis by single-cell RNA sequencing" [Reprod. Biol. 24 (2024) 100919]
2026-04-28, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2026.101214
PMID:42055852
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1014 | 2026-05-01 |
Deep profiling of lupus nephritis kidneys reveals dynamic changes in myeloid cells associated with disease progression
2026-Apr-28, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2026.03.004
PMID:42055919
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学深度分析狼疮性肾炎肾脏,揭示与疾病进展相关的髓系细胞动态变化 | 首次大规模结合scRNA-seq和空间转录组学,系统描绘狼疮性肾炎肾脏中髓系细胞亚群的动态变化及其与组织损伤和炎症的关系 | 未明确说明,但样本量有限(6例LN患者和2例对照用于空间转录组学) | 探究狼疮性肾炎中髓系细胞介导的免疫反应及其与组织学异质性的关联 | 狼疮性肾炎患者的肾脏样本(156例患者和30例健康对照用于scRNA-seq;6例患者和2例对照用于空间转录组学) | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 156例LN患者和30例健康对照(scRNA-seq),6例LN患者和2例对照(空间转录组学) | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1015 | 2026-05-01 |
Neutrophil-derived reactive oxygen species and bystander tissue damage in inflammatory bowel disease
2026-Apr-22, Free radical biology & medicine
|
综述 | 探讨中性粒细胞来源的活性氧在炎症性肠病中旁观者组织损伤的作用机制 | 整合了氧化还原蛋白质组学、空间转录组学、活体成像和单细胞分析等最新技术,揭示了中性粒细胞氧化损伤并非不可规避的炎症副产物,而是动态、情境依赖且具有治疗靶向潜力的过程 | 未明确指出具体的实验数据或临床验证,属于文献综述,缺乏原创实验证据 | 综述中性粒细胞氧化自由基生物学在胃肠道黏膜中的知识,评估减轻旁观者损伤同时保留宿主防御的治疗策略 | 中性粒细胞及其在炎症性肠病中产生的活性氧和活性氮物种 | 数字病理学, 机器学习, 自然语言处理 | 炎症性肠病 | 氧化还原蛋白质组学, 空间转录组学, 活体成像, 单细胞分析 | NA | 文本, 图像 | NA | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium空间转录组学平台,Illumina NovaSeq测序系统 |
| 1016 | 2026-05-01 |
Metabolic reprogramming and signalling networks in microglial activation: Implications for neurodegeneration
2026-Apr-22, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2026.103138
PMID:42031319
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评论 | 综述小胶质细胞激活中的代谢重编程和信号网络,及其在神经退行性疾病中的作用 | 提出将小胶质细胞激活视为代谢-炎症整合网络,并强调炎症消退失败而非持续激活是慢性神经炎症的关键 | 代谢抑制剂的临床不可行性,需转向TREM2免疫调节剂和消退激动剂 | 整合单细胞转录组学、空间蛋白质组学和代谢组学,提供小胶质细胞激活的综合视角 | 小胶质细胞,特别是疾病相关小胶质细胞 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1017 | 2026-05-01 |
From inflammation to malignancy: the dynamic evolution of cancer-associated fibroblasts in IBD-CRC
2026-Apr-21, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101310
PMID:42019096
|
综述 | 提出炎症相关结直肠癌中成纤维细胞从炎症到恶变动态演化的概念框架 | 提出“基质炎症记忆”假说,揭示PFKFB3介导的糖酵解转变和aPKC缺失驱动的上皮-基质互作机制 | 部分机制(如基质炎症记忆)仍处于假说阶段,缺乏直接实验证据验证 | 阐明炎症性肠病相关结直肠癌中癌症相关成纤维细胞的动态演化及其在肿瘤微环境中的作用 | 肠道成纤维细胞、癌症相关成纤维细胞亚群(iCAF、myCAF、apCAF) | 机器学习 | 结直肠癌 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1018 | 2026-05-01 |
Deciphering IFN signaling in gastric cancer: A single-cell and bulk transcriptomic integration reveals CXCR4 as a key immunomodulator and prognostic determinant
2026-Apr-21, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102778
PMID:42019279
|
研究论文 | 通过单细胞和批量转录组学整合,解析胃癌中干扰素信号通路,发现CXCR4作为关键免疫调节因子和预后决定因子 | 首次在单细胞分辨率下深入解析胃癌肿瘤微环境中干扰素信号网络,并识别出CXCR4作为与干扰素信号紧密相关的关键免疫调节因子和预后生物标志物 | 研究主要基于公开数据集和体外细胞实验,缺乏体内验证和临床队列的进一步证实 | 解析胃癌肿瘤微环境中干扰素信号通路的作用,识别可干预的靶点以优化免疫治疗策略 | 胃癌患者的肿瘤组织样本及AGS胃癌细胞系 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组分析、qRT-PCR、Western blot、流式细胞术、CCK-8、Transwell、划痕实验 | NA | 基因表达数据 | 多个胃癌患者样本数据集(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1019 | 2026-05-01 |
RARG promotes gastric cancer progression by activating PMEPA1 transcription and Wnt/β-catenin signalling
2026-Apr-21, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112552
PMID:42025891
|
research paper | 本研究揭示了RARG通过转录激活PMEPA1及增强Wnt/β-catenin信号通路促进胃癌进展的机制 | 首次发现RARG作为PMEPA1的转录调控因子,并通过双重机制(转录激活PMEPA1和直接结合β-catenin)促进胃癌进展 | 研究中未阐述RARG在胃癌微环境中的免疫调控作用,且临床样本验证规模有限 | 探究RARG在胃癌中的功能及其下游调控机制 | 胃癌细胞系、胃癌临床组织样本、小鼠模型 | machine learning | 胃癌 | CUT&Tag测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 胃癌组织样本(未明确数量) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞转录组分析 |
| 1020 | 2026-05-01 |
Immunoregulatory mechanisms underlying vitexin-mediated attenuation of concanavalin A-induced liver injury
2026-Apr-21, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158231
PMID:42054738
|
研究论文 | 本研究利用单细胞策略,结合质谱流式技术和单细胞RNA测序,系统解析了山奈酚苷在ConA诱导的小鼠自身免疫性肝炎模型中的免疫调节机制 | 首次整合CyTOF和scRNA-seq技术,从单细胞层面全面揭示山奈酚苷对T细胞亚群的重编程作用,特别是其在Runx2+CD4+效应T细胞和Cxcr6+CD4+组织驻留记忆T细胞中抑制IFN信号的新机制 | NA | 阐明山奈酚苷在自身免疫性肝炎中的免疫调节机制及其治疗潜力 | ConA诱导的自身免疫性肝炎小鼠模型的肝免疫微环境 | 计算生物学 | 自身免疫性肝炎 | 质谱流式技术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |