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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2026-07-04 |
Exosomal NEAT1 from tumor stem cells induces SIRPA+ macrophages to enhance immune evasion and glioblastoma progression via upregulating the HSP90B1/STAT3 axis
2026-May-11, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-026-03729-z
PMID:42116089
|
研究论文 | 发现肿瘤干细胞外泌体中的NEAT1通过HSP90B1/STAT3轴诱导SIRPA+巨噬细胞,促进胶质母细胞瘤的免疫逃逸和进展 | 首次揭示GSC来源的外泌体NEAT1通过稳定HSP90B1并增强其与STAT3相互作用来激活SIRPA转录,从而诱导巨噬细胞向免疫抑制表型转化 | 未充分阐明SIRPA+巨噬细胞在胶质母细胞瘤中诱导和发挥作用的确切信号通路 | 阐明SIRPA+巨噬细胞在胶质母细胞瘤中的诱导机制及其促进免疫逃逸和肿瘤进展的作用 | 胶质母细胞瘤干细胞来源的外泌体、SIRPA+巨噬细胞、肿瘤细胞和巨噬细胞的相互作用 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, qPCR, Western印迹, RIP, Co-IP, PLA, 双荧光素酶测定, ELISA, Transwell, CCK-8, 原位异种移植 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 公共单细胞RNA测序数据集(未明确样本数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1002 | 2026-07-04 |
Identification of PRRG1 as a possible molecular target of pancreatic cancer
2026-May-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08832-9
PMID:42108282
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研究论文 | 该研究探索了富含脯氨酸的γ-羧基谷氨酸蛋白1 (PRRG1) 在胰腺癌中的表达模式、生物学功能及分子机制 | 首次鉴定PRRG1作为胰腺癌潜在分子靶点,揭示KLF4转录因子调控PRRG1表达及其通过PI3K-Akt信号通路驱动肿瘤进展的机制,并发现低剂量华法林可抑制PRRG1过表达促癌作用 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型,临床样本量有限,且华法林剂量需进一步优化以平衡抗凝风险 | 明确PRRG1在胰腺癌发生发展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 胰腺癌组织和细胞系(CFPAC-1、PATU-8988T)、皮下异种移植模型、免疫健全小鼠模型 | 分子生物学 | 胰腺癌 | RNA测序、单细胞测序、shRNA沉默、慢病毒过表达、免疫组化 | NA | 基因表达数据、转录组数据、单细胞转录组数据 | 人胰腺癌组织样本及对应正常组织样本(具体数量未提及)、两种胰腺癌细胞系、皮下移植瘤模型小鼠 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 1003 | 2026-07-04 |
NCAPD3 promotes osteosarcoma progression by modulating macrophage polarization and tumor cell proliferation
2026-May-09, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08168-0
PMID:42106714
|
研究论文 | NCAPD3通过调节巨噬细胞极化和肿瘤细胞增殖促进骨肉瘤进展 | 首次揭示NCAPD3在骨肉瘤中通过协调影响肿瘤细胞增殖和抑制巨噬细胞介导的炎症反应来促进肿瘤进展,并识别出NCAPD3⁺巨噬细胞亚群 | 未明确指出具体局限性 | 探究NCAPD3在骨肉瘤进展和肿瘤免疫微环境中的作用 | 骨肉瘤组织和细胞、巨噬细胞(RAW264.7、原代小鼠巨噬细胞、THP-1来源巨噬细胞) | 机器学习 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因敲低、通路富集分析、药物敏感性预测 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | scRNA-seq分析使用6个样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1004 | 2026-07-04 |
Mesenchymal stem cell-derived extracellular vesicles attenuate liver transplantation-induced ischemia/reperfusion injury by suppressing hepatocellular complement C5 expression
2026-May-05, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04388-0
PMID:42087186
|
研究论文 | 间充质干细胞来源的细胞外囊泡通过抑制肝细胞补体C5表达减轻肝移植诱导的缺血再灌注损伤 | 首次通过单细胞多组学图谱揭示MSC-EV通过递送PTPN13抑制C5转录,阻断C5a-C5aR1通路减轻肝移植缺血再灌注损伤的机制 | 主要基于大鼠和小鼠模型,临床数据支持有限,需要进一步验证人类适用性 | 阐明MSC-EV减轻肝移植缺血再灌注损伤的机制,重点关注细胞间通讯和补体介导的炎症 | 大鼠肝移植和小鼠肝脏缺血再灌注模型 | 机器学习 | 肝移植缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 单核ATAC测序数据, 空间转录组数据 | 大鼠和小鼠肝脏样本,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 1005 | 2026-07-04 |
Spatial Multiomics Reveal Insights Into ADC Efficacy
2026-05, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70190
PMID:42083302
|
综述 | 本文综述了空间多组学技术在揭示抗体-药物偶联物疗效中的应用,特别是针对转移性尿路上皮癌 | 提出了一种结合空间转录组学和蛋白质组学与机器/深度学习分析的整合框架,用于患者分层、预测毒性和指导下一代ADC设计 | 该领域仍处于早期阶段,空间多组学技术的高通量和复杂性可能限制其临床转化 | 评估空间多组学在解码ADC作用机制和耐药性中的适用性,并提取生物学洞察 | 抗体-药物偶联物(ADC)及其在实体瘤(特别是转移性尿路上皮癌)中的应用 | 空间转录组学,计算病理学 | 尿路上皮癌 | 空间转录组学,蛋白质组学,高通量RNA测序,多重蛋白成像 | NA | 空间转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1006 | 2026-07-04 |
Mapping of Neutrophils in Cancers: Insights From Spatial Omics Technologies
2026-05, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70194
PMID:42095467
|
综述 | 综述空间组学技术在癌症中性粒细胞研究中的应用,探讨其表型可塑性和双重作用 | 系统总结空间转录组学技术进步及其在剖析肿瘤微环境中中性粒细胞调控机制的应用,并整合多组学策略以识别精准生物标志物 | 未详细讨论空间组学技术的分辨率局限性和数据分析挑战,且中性粒细胞研究的跨癌种比较可能存在样本和方法异质性 | 阐述空间组学技术如何推动癌症中性粒细胞生物学研究,并优化检测与分析策略 | 肿瘤微环境中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 各类癌症(如肺癌、前列腺癌等) | 空间转录组学、单细胞RNA测序、多组学整合 | NA | 空间转录组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 1007 | 2026-07-04 |
Spatial transcriptomics atlas of inflammatory bowel disease to guide implementation in research consortiums and clinical trials
2026-Apr-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72482-w
PMID:42049732
|
研究论文 | 构建包含超过三百万个细胞的空间分辨图谱,系统评估两种成像空间转录组学平台在炎症性肠病中的应用 | 首次在多个炎症性肠病研究联盟中系统比较CosMx和Xenium两种成像空间转录组学平台在结肠组织和回肠组织中的性能,验证CosMx在多中心研究中的操作可行性 | Xenium平台性能受组织类型、组织块质量和检测面板大小影响,且未提及单细胞空间转录组学在临床实践中的直接应用成本 | 为炎症性肠病研究联盟和临床试验建立单细胞分辨率空间转录组学的技术和生物学基准 | 非疾病对照、溃疡性结肠炎和克罗恩病患者的肠道组织切片 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 空间转录组学 | NA | 图像 | 超过一百个肠道组织切片 | CosMx, Xenium | 空间转录组学 | CosMx, Xenium | 成像空间转录组学平台 |
| 1008 | 2026-07-04 |
Uncovering Immune Niches in Health and Disease Using Spatial Transcriptomics
2026-04, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70185
PMID:41943872
|
综述 | 利用空间转录组学揭示健康和疾病状态下的免疫微环境 | 系统梳理了空间转录组学技术如何应用于解析免疫微环境的细胞和分子结构,特别是B细胞和T细胞克隆微环境的新兴研究 | 主要基于现有文献综述,缺乏原始实验数据支持 | 探讨空间转录组学在健康和疾病背景下解析免疫微环境中的应用与前景 | 肠道和肿瘤组织中的免疫微环境 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1009 | 2026-07-04 |
Cancer-immunity cycle-based molecular subtypes in breast cancer predict the response to immune checkpoint inhibitors
2026-Mar-05, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
|
研究论文 | 基于癌症免疫循环分子亚型预测乳腺癌对免疫检查点抑制剂的反应 | 首次基于癌症免疫循环构建分子亚型系统,并通过多组学分析(基因组学、代谢组学、单细胞RNA测序)揭示各亚型的肿瘤微环境、基因组和代谢特征差异,为精准免疫治疗提供新框架 | 未明确提及局限性(基于摘要信息无法推断) | 建立基于癌症免疫循环的分子亚型分类方法,评估乳腺癌免疫状态并预测免疫检查点抑制剂疗效 | 乳腺癌患者(队列n=752)及泛癌免疫检查点抑制剂治疗队列 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA测序、基因组学分析、代谢组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、基因组数据、代谢组数据、单细胞转录组数据 | 752例乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1010 | 2026-07-04 |
Single-Cell Profiling of Splenic Immune Ageing and Chronic Stress Adaptations in Mice With Natural Microbiota
2026-03, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70170
PMID:41817300
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术,对自然微生物群小鼠的脾脏免疫衰老和慢性应激适应进行了全面分析 | 首次通过跨队列单细胞研究,构建了包含超过27万脾细胞的综合图谱,揭示了脾脏免疫衰老的保守特征,并发现了慢性应激对年龄相关变化的有限对抗作用 | 未明确说明实验小鼠的品系和性别,以及慢性应激模型的具体构建方法,可能影响结果的普适性 | 探究脾脏免疫衰老及慢性应激适应过程的细胞和分子特征 | 年轻、老年和慢性应激的老年小鼠脾细胞 | 单细胞组学 | 免疫衰老相关疾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 来自3组小鼠的脾细胞,整合其他数据集后总计超过27万脾细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1011 | 2026-07-04 |
Multi-Omics Analysis Reveals Sex-Specific Signatures for BCG Vaccine Efficacy
2026-02, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70144
PMID:41677158
|
研究论文 | 利用多组学数据分析BCG疫苗效力的性别特异性特征 | 首次通过大规模多组学分析系统揭示性别差异对BCG疫苗效力的决定因素 | 仅基于单一队列的321名健康个体数据,可能无法推广到其他人群或疫苗 | 理解BCG疫苗效力的性别特异性差异,以优化疫苗效果 | 321名接种BCG疫苗的健康个体 | 机器学习 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞频率、单细胞RNA测序、血浆蛋白、代谢物、DNA甲基化数据 | 321名健康个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1012 | 2026-07-04 |
GeoMx and RNAscope: A Comparative Assessment of Their Utility for Spatial mRNA Expression Profiling in Formalin-Fixed Breast Cancer Tissue
2026-02, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.70020
PMID:41795633
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研究论文 | 比较GeoMx数字空间分析仪与RNAscope在福尔马林固定乳腺癌组织中进行空间mRNA表达分析的效用 | 首次系统比较GeoMx高多重空间转录组学技术与RNAscope原位杂交方法在福尔马林固定乳腺肿瘤组织中的定量表达一致性 | PD-L1表达仅在单个核心中较高,无法进行相关性分析;样本局限于乳腺癌组织,且仅评估三个基因的RNAscope探针 | 评估GeoMx与RNAscope两种空间表达谱分析技术的定量一致性及各自优势 | 两个组织微阵列中的乳腺癌症样本,包括三阴性乳腺癌(n=48)和不同ER/HER2状态样本(n=45) | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,原位杂交 | NA | 图像 | 93个乳腺癌症样本(两个组织微阵列) | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx Cancer Transcriptomics Atlas (CTA) 覆盖约1,800个基因 |
| 1013 | 2026-07-04 |
S100A8/A9 Promotes Fibrosis in Iatrogenic Laryngotracheal Stenosis
2026-01, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.70008
PMID:40776636
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光技术发现S100A8/A9在医源性喉气管狭窄中高表达,并在小鼠模型中证实其促进纤维化作用 | 首次通过体内实验明确S100A8/A9促进医源性喉气管狭窄纤维化的机制,并揭示其下游调控蛋白MYD88的参与 | 仅在小鼠模型验证,未在人样本中进行干预实验;样本量较小且未阐明S100A8/A9与其他免疫介质的相互作用 | 阐明S100A8/A9在医源性喉气管狭窄发病机制中的作用 | 人类喉气管狭窄组织标本及医源性喉气管狭窄诱导的小鼠模型 | 数字病理学 | 喉气管狭窄 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 基因表达分析 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 人类标本(具体数量未说明);小鼠模型(每组数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1014 | 2026-07-04 |
Artificial Intelligence in single-cell and spatial transcriptomics data analyses
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.011
PMID:41986013
|
综述 | 探讨人工智能在单细胞和空间转录组学数据分析中的应用 | 系统综述了AI方法(如CNN、GNN和VAE)在预处理、降维、细胞分类、整合多组学及推断细胞轨迹中的应用,并聚焦于癌症生物学、免疫学和神经科学领域 | 存在可扩展性、可解释性和数据标准一致性不足的挑战 | 提供AI推动单细胞和空间转录组学数据解析的全面指南 | 单细胞和空间转录组学数据集及AI分析方法 | 机器学习 | 癌症、免疫疾病、神经疾病 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序 | 卷积神经网络、图神经网络、变分自编码器 | 基因表达数据、空间转录数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 1015 | 2026-07-04 |
AI-driven gene-sets, networks, pathways, and interactions analyses of multi-omics data
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.023
PMID:41986006
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研究论文 | 介绍了PAGER 3.0知识生态系统,用于分析多组学数据中的基因集、网络、通路和相互作用 | PAGER 3.0在PAGER知识生态系统中实现了重大进步,提供扩展且精心策划的通路、注释基因列表和基因签名(PAGs)集合、本体感知的知识导航、加权富集分析和结构化基于网络的优先级排序工具 | NA | 介绍PAGER 3.0的概念基础、架构和分析工作流程,并通过白血病单细胞转录组学案例研究证明其实用性 | 多组学数据中的基因集、通路、网络和相互作用 | 生物信息学 | 白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1016 | 2026-07-03 |
Sini decoction inhibits colorectal cancer liver metastasis by suppressing HIF-1α-dependent exosomal integrin signaling
2026-Nov-15, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121951
PMID:42259422
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研究论文 | 该研究探讨了四逆汤通过抑制HIF-1α依赖性外泌体整合素信号来抑制结直肠癌肝转移的作用和机制 | 首次揭示四逆汤通过靶向HIF-1α减少ITGαvβ5富集的外泌体分泌,进而阻断M2巨噬细胞极化,从而抑制结直肠癌肝转移 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步的临床验证来确认其转化潜力 | 阐明四逆汤抑制结直肠癌肝转移的活性成分和机制,重点关注肿瘤来源外泌体和巨噬细胞极化 | 小鼠结直肠癌肝转移模型及其肿瘤微环境 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠结直肠肝转移模型(具体样本量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1017 | 2026-07-03 |
The crosstalk between SPP1+ macrophages and follicular helper T cells promotes the immune disorder of Graves' disease
2026-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110712
PMID:42128213
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研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学揭示Graves病中SPP1+巨噬细胞与滤泡辅助性T细胞的相互作用促进免疫紊乱 | 首次在Graves病中通过单细胞和空间转录组学联合分析,发现SPP1+巨噬细胞与CXCL13+ Tfh细胞通过SPP1-CD44相互作用加重免疫微环境失调,并揭示SPP1+巨噬细胞通过SPP1和VEGF信号通路促进新生血管内皮细胞形成 | NA | 探究Graves病甲状腺组织中免疫细胞和空间基因表达模式的变化,以及SPP1+巨噬细胞在疾病免疫紊乱中的作用 | Graves病患者、缓解期患者和正常对照个体的甲状腺组织 | 数字病理学 | 自身免疫性甲状腺疾病 | 单细胞转录组测序,空间转录组技术 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 对照个体、Graves病患者和缓解期患者的甲状腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1018 | 2026-07-03 |
JAK-STAT3-MYC axis defines pathogenic stem cell-like memory CD4+ T cells in rheumatoid arthritis
2026-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110733
PMID:42309459
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,揭示了类风湿关节炎患者CD4+ Tscm细胞中JAK-STAT3-MYC轴驱动致病性干细胞样记忆T细胞的作用 | 首次在类风湿关节炎Tscm细胞中鉴定出STAT3-MYC转录特征,并揭示其与治疗抵抗及疾病严重程度的相关性 | JAK抑制剂仅部分抑制STAT3活性,未完全阻断信号通路,MYC作为潜在治疗靶点需进一步验证 | 探究类风湿关节炎中CD4+ Tscm细胞的分子特征及其在慢性免疫激活中的致病机制 | 11名类风湿关节炎患者和8名健康对照的CD4+ Tscm细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 | 不适用 | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 11名类风湿关节炎患者和8名健康对照的外周血Tscm细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于Tscm细胞转录组分析,同时结合蛋白质组学分析 |
| 1019 | 2026-07-03 |
Multiomic Single-Cell Sequencing Identifies BCR::ABL1 as an Acquired Resistance Mechanism in FLT3+ AML
2026-Aug, European journal of haematology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/ejh.70207
PMID:42046307
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研究论文 | 利用多组学单细胞测序识别FLT3阳性急性髓系白血病中BCR::ABL1作为获得性耐药机制 | 首次通过多组学单细胞DNA测序在单细胞分辨率下揭示BCR::ABL1获得作为FLT3-ITD AML患者对FLT3抑制剂耐药的克隆演化机制 | 基于单个病例的研究,结果可能需在更大样本中验证 | 阐明FLT3突变型AML中BCR::ABL1获得性耐药机制的克隆演化特征 | FLT3-ITD突变型急性髓系白血病患者 | 基因组学 | 急性髓系白血病 | 多组学单细胞DNA测序 | NA | 单细胞基因组数据 | 1例FLT3-ITD AML患者 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1020 | 2026-07-03 |
Cross-stage single-cell and spatial metabolome analyses reveal periderm specialization and tanshinone biosynthesis in Salvia miltiorrhiza roots
2026-Aug, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.71285
PMID:42169223
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研究论文 | 通过跨阶段单细胞和空间代谢组分析揭示丹参根周皮特化和丹参酮生物合成机制 | 首次结合单细胞RNA测序与空间代谢组学,构建丹参根从表皮到周皮的发育轨迹,鉴定与二萜生物合成相关的转录程序,并预测SmCYP76AK5参与丹参酮合成 | 未提及明确局限性 | 解析多年生根中周皮分化和次生代谢的细胞程序 | 丹参(Salvia miltiorrhiza)根在不同发育阶段的细胞类型组成和转录动态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间代谢组数据 | 不同发育阶段的丹参根样品 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |