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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
981 2026-07-05
Prussian blue analogue-mineralized ginseng-derived vesicles promote PPARγ nuclear translocation to suppress tumor vasculogenic mimicry and reverse the immunosuppressive microenvironment
2026-Mar-18, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 开发了一种仿生纳米平台GDVs@CuPBA-iRGD,通过铜基普鲁士蓝类似物在人参源囊泡上原位矿化,并偶联肿瘤穿透肽iRGD,用于抑制肿瘤血管生成拟态并逆转免疫抑制微环境 首次将人参源囊泡与铜基普鲁士蓝类似物结合,通过PPARγ核转位机制抑制血管生成拟态,并利用单细胞RNA测序揭示其激活抗肿瘤免疫的后续效应 研究主要基于肝细胞癌模型,对其他肿瘤类型的适用性有待验证;纳米平台的长期毒性和临床转化潜力需进一步评估 开发一种抑制肿瘤血管生成拟态并逆转免疫抑制微环境的创新治疗策略 肝细胞癌(HCC)细胞和小鼠模型 机器学习 肝癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠肝细胞癌模型样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'试剂盒
982 2026-07-05
M[Formula: see text]DGAT: Multi-view multi-scale dynamic graph attention network(GAT) based prediction of Parkinson's disease(PD) progression using whole-blood RNA sequencing data
2026-Mar-02, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 提出了多视图多尺度动态图注意力网络(M³DGAT),利用全血RNA测序数据预测帕金森病进展 首次融合多视图(时间、空间)与多尺度信息,并采用计数草图双线性融合策略整合时空视图,在动态图表示中编码疾病进展动态信息 论文未提及具体局限性 预测神经退行性疾病(如帕金森病)的进展轨迹,包括疾病阶段和认知评分 帕金森病患者全血RNA测序数据 机器学习 帕金森病 RNA测序 动态图注意力网络(DGAT) 基因表达数据 来自PPMI和PDBP队列的人体血液样本 NA NA NA NA
983 2026-07-05
Inhibition of 5αR2 promotes postoperative wound repair in BPH patients after TURP by alleviating fibrosis and inflammation
2026-03-01, Asian journal of andrology IF:3.0Q1
研究论文 探究5αR2抑制剂对良性前列腺增生患者经尿道前列腺切除术后伤口愈合的影响,发现其通过减轻纤维化和炎症促进恢复 首次通过随机临床试验结合动物模型和类器官实验,系统揭示5αR2抑制剂通过抑制纤维化和炎症加速BPH术后伤口修复的分子机制 未提及长期随访数据及潜在副作用评估,样本量较小(87例患者和12只比格犬) 评估5αR2抑制剂对BPH患者TURP术后伤口愈合、炎症控制和纤维化减少的效果 良性前列腺增生患者、比格犬、膀胱类器官 数字病理学 前列腺疾病 单细胞RNA测序,酶联免疫吸附试验,组织学分析 NA 基因表达数据,组织图像,蛋白质数据 87例BPH患者(治疗组47例,对照组42例),12只比格犬 NA 单细胞RNA测序 NA NA
984 2026-07-05
TCRγ constant usage tunes human γδ T cell antigen sensitivity, thymic programming, and peripheral function
2026-02-13, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 揭示人类γδ T细胞中TCRγ恒定区使用调节抗原敏感性、胸腺编程和外周功能 首次发现人类γδ T细胞受体中γ恒定区可独立于可变区抗原识别调节激活强度,且Cγ1和Cγ2的使用对应不同表型和功能 基于单细胞RNA测序数据,未涉及功能验证实验,样本量可能有限 探究γδ T细胞受体中γ恒定区使用对T细胞功能的影响 人类γδ T细胞 免疫学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 人类胸腺和外周组织样本,具体数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
985 2026-07-05
RCC1 Domain-Containing Protein 1 Promotes Colon Cancer Malignant Progression by Activating Autophagy-Dependent WNT5A Secretion in Cancer-Associated Fibroblasts
2026-Feb, Journal of the Royal Society of New Zealand IF:2.1Q2
研究论文 RCC1结构域包含蛋白1通过激活癌症相关成纤维细胞中自噬依赖的WNT5A分泌促进结肠癌恶性进展 揭示了RCCD1通过AMPK/mTOR/ULK1信号通路激活癌症相关成纤维细胞自噬,进而驱动WNT5A分泌,促进肿瘤细胞恶性转化的新机制 未提及具体局限性 探索自噬在结肠癌肿瘤-基质相互作用中的作用机制 结肠癌细胞及癌症相关成纤维细胞 机器学习 结肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 TCGA-COAD和GSE161277数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
986 2026-07-05
Integrated multi-omics and machine learning identify an interaction between SLC39A11 and phosphoinositide metabolism in deep vein thrombosis
2026-01-22, BMC medical informatics and decision making IF:3.3Q2
研究论文 通过整合多组学和机器学习方法,识别深静脉血栓中SLC39A11与磷脂酰肌醇代谢之间的相互作用 首次通过多组学(代谢组学和转录组学)与机器学习结合,鉴定SLC39A11和磷脂酰肌醇在深静脉血栓中的关键作用,并利用单细胞RNA测序将SLC39A11定位到M1样巨噬细胞 样本量较小(代谢组学62例,转录组学17例,验证集18例,单细胞RNA测序6例),可能影响结果的泛化性;未提及因果关系验证 探索深静脉血栓的多组学特征及其调控机制 深静脉血栓患者和健康对照者的外周血样本 机器学习 深静脉血栓 非靶向代谢组学, 转录组学, 单细胞RNA测序, 电感耦合等离子体质谱 双向正交偏最小二乘法, 机器学习算法 代谢组学数据, 转录组学数据, 单细胞RNA测序数据 代谢组学62例, 转录组学17例, 验证集18例, 单细胞RNA测序6例 未提供 非靶向代谢组学, 转录组学, 单细胞RNA测序 未提供 未提供
987 2026-07-04
Circadian rhythm disruption aggravates periodontitis via orchestrating TREM2+ macrophage-mediated bone resorption
2026-Sep-15, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示昼夜节律紊乱通过TREM2+巨噬细胞介导的骨吸收加剧牙周炎的机制 首次发现TREM2+巨噬细胞亚群在昼夜节律紊乱条件下选择性扩增,并建立BMAL1-TREM2调控轴,揭示昼夜节律紊乱通过破坏该时间门控机制导致持续性TREM2过表达和骨吸收 研究主要基于小鼠模型,未在人体组织中验证该机制;CUT&Tag测序仅限于体外实验,体内直接证据不足 阐明昼夜节律紊乱如何感知并转化为局部炎症性骨丢失的分子机制 CRD加重牙周炎小鼠模型中的牙龈组织及巨噬细胞亚群 数字病理学 牙周炎 单细胞RNA测序、CUT&Tag测序 NA 单细胞转录组数据 CRD加重牙周炎小鼠模型中的牙龈组织样本(数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
988 2026-07-04
METTL3 depletion mitigates hypoxic pulmonary arterial smooth muscle cell over-proliferation via YTHDF2-dependent regulation of FOXO1 mRNA N6-methyladenosine modification: a potential mechanism of hypoxic pulmonary hypertension
2026-Sep-15, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 本文探究了METTL3介导的m6A修饰在低氧性肺动脉高压中肺动脉平滑肌细胞过度增殖的作用及其分子机制 首次发现METTL3-YTHDF2-FOXO1轴通过调控FOXO1 mRNA的m6A甲基化修饰驱动低氧性肺动脉平滑肌细胞增殖,为肺动脉高压治疗提供新靶点 NA 阐明METTL3介导的m6A修饰在低氧性肺动脉高压中肺动脉平滑肌细胞过度增殖中的作用 人肺动脉高压组织、平滑肌特异性Mettl3敲除小鼠、低氧性肺动脉高压模型、人肺动脉平滑肌细胞 机器学习 肺动脉高压 单细胞RNA测序, MeRIP-qPCR, RIP-qPCR, 荧光素酶报告实验 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
989 2026-07-04
Myeloid Piezo1 Drives Cardiac Repair Through Orai1-Rac1-Dependent Efferocytosis
2026-Jul-06, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 研究揭示了髓系Piezo1通过Orai1-Rac1依赖的胞葬作用驱动心肌修复的机制 首次发现Piezo1-Orai1-Rac1信号轴调控巨噬细胞胞葬作用和溶酶体成熟,改善心肌梗死后的心脏功能 未在人类样本中验证该信号轴,且未探讨其他细胞类型(如成纤维细胞)的潜在作用 阐明髓系Piezo1在心肌梗死后心脏修复中的功能及分子机制 髓系Piezo1特异性敲除小鼠及骨髓来源的巨噬细胞 NA 心血管疾病 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、实时PCR、膜片钳、Western blot 小鼠基因敲除模型(Piezo1ΔLysM) 基因表达数据、钙成像数据、蛋白质数据 未明确样本量,涉及小鼠(n未具体说明)及体外细胞实验 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序用于分析巨噬细胞胞葬相关基因表达
990 2026-07-04
Hypoxia Induces Adaptive Lymphangiogenesis via Cd74 and Vegfr3 to Modulate Pulmonary Hypertension
2026-Jul-06, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 研究发现缺氧通过Cd74和Vegfr3信号轴诱导适应性淋巴管生成,调节肺动脉高压,并揭示CD74-VEGFR3信号轴在淋巴内皮细胞中的新作用 首次发现淋巴管生成在肺动脉高压中起保护作用,并揭示CD74-VEGFR3信号轴在淋巴内皮细胞中的新功能 研究主要基于小鼠和大鼠模型,人类数据来自公开单细胞RNA测序数据集,可能需要更多验证 探究肺淋巴管在肺动脉高压病理和血管重塑中的作用 肺动脉高压患者和肺高压模型小鼠、大鼠的淋巴内皮细胞 计算机视觉 肺心血管疾病 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 基因编辑 NA 图像, 文本 小鼠和大鼠模型,以及人特发性肺动脉高压肺组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
991 2026-07-04
Evolving strategies for lineage tracing: Genetic markers, synthetic barcodes, and natural variants
2026-Jul-02, Cell stem cell IF:19.8Q1
综述 综述了谱系追踪从遗传标记、合成条形码到自然变异的方法演变及其与多组学和空间分析的整合 系统梳理了谱系追踪的三大方法支柱及其与多组学和空间分析整合的最新进展,并提供了实验设计的系统指南 未涉及具体技术细节或定量比较不同方法的性能,可能缺乏实际应用中的验证数据 综述谱系追踪策略的演变及其在细胞命运决定机制研究中的应用 谱系追踪方法及其在细胞命运分析中的实验设计 机器学习和计算生物学 不适用 单细胞测序、基因组编辑、合成条形码、自然变异分析 不适用 多组学数据、空间转录组学数据 不适用 不适用 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 不适用 不适用
992 2026-07-04
scMapNet: Marker-based cell type annotation of scRNA-seq data via vision transfer learning with tabular-to-image transformations
2026-07, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 提出scMapNet方法,通过视觉迁移学习与表格到图像转换,实现基于标记基因的scRNA-seq数据细胞类型注释 采用掩码自编码器(MAE)和视觉变换器(ViT)结合树图变换,充分利用细胞标记知识和未标记数据信息进行自监督学习 未提及具体限制,可能涉及对大型未标记数据的预训练依赖或标记基因选择的敏感性 开发一种能有效学习细胞标记知识和未标记数据信息的深度学习细胞类型注释方法 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 掩码自编码器(MAE)和视觉变换器(ViT) 表格数据(单细胞基因表达矩阵) 多种数据集,具体数量未提及 NA 单细胞RNA-seq NA NA
993 2026-07-04
The constitutive 20S proteasome is required for the maintenance and differentiation of spermatogonia in mice
2026-07, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 研究表明组成型20S蛋白酶体对小鼠精原细胞的维持和分化至关重要 首次揭示组成型PSMA7蛋白酶体在精原细胞维持和分化中的关键作用,并发现PSMA8的过表达可补偿PSMA7缺失的功能 未明确说明 探究组成型20S蛋白酶体在精子发生过程中的功能 小鼠精原细胞 机器学习 不适用 条件性基因敲除 不适用 单细胞RNA测序数据 小鼠生殖细胞样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Genomics单细胞RNA测序平台
994 2026-07-04
Divergence between neural and retinal lineage specification during human brain development by signal transduction
2026-07, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 通过基因工程人胚胎干细胞衍生的脑类器官,研究S6K1缺失对人脑早期发育的影响,揭示其调控神经与视网膜谱系分化的信号机制 首次在人类脑类器官模型中证明S6K1信号缺失会驱动视网膜细胞而非皮层神经元形成,并区分了非细胞自主和细胞自主功能的作用 实验仅限于体外脑类器官模型,缺乏体内人体或动物模型验证;未探讨S6K1下游具体分子机制 探究S6K1在人类大脑发育中调控神经与视网膜谱系分化的作用 S6K1基因敲除的人胚胎干细胞(hESCs)及其衍生的背侧前脑类器官 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、ATAC-seq、基因工程、脑类器官培养 NA 单细胞RNA测序数据、染色质可及性数据 早期(5周)和晚期(14周)阶段的背侧前脑类器官;共培养的S6K1敲除和野生型hESCs衍生的脑类器官 NA 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq NA NA
995 2026-07-04
SlGRF1 mediates gibberellin signaling to control cut-budding in tomato
2026-Jul, Journal of integrative plant biology IF:9.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示SlGRF1在番茄切割再生过程中介导赤霉素信号调控芽再生的分子机制 首次阐明SlGRF1作为关键调控因子,通过激活NAM1等茎尖分生组织调节基因表达,介导赤霉素信号对番茄切割再生的负调控作用 研究仅聚焦于番茄这一物种,未在其他植物中验证该机制的保守性;且未深入探讨SlGRF1与NAM1等下游靶基因的相互作用细节 探究番茄切割后芽再生(cut-budding)的分子调控机制,重点关注生长调控因子1(SlGRF1)及其与赤霉素信号的关系 番茄(Solanum lycopersicum) NA NA 单细胞RNA测序、时间序列转录组分析、CRISPR/Cas9基因编辑、ChIP-seq NA 单细胞转录组数据、转录组测序数据、ChIP-seq数据 涉及grf1-cr突变体、野生型对照组及激素处理组,具体样本数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
996 2026-07-04
Dissecting and steering cell dynamics using spatially-informed RNA velocity with veloAgent
2026-Jul, Molecular systems biology IF:8.5Q1
研究论文 提出了veloAgent框架,通过空间信息和生成式模型改进RNA速度推断,实现大规模空间转录组数据中细胞动态分析 首次将空间信息整合到RNA速度分析中,通过基于智能体的模拟实现亚线性内存扩展,并具备原位扰动模块以预测细胞命运调控干预效果 未提及具体局限性 开发可扩展且通用的空间转录组细胞动力学分析框架,支持细胞命运的模拟操控 单细胞转录组和空间转录组数据中的细胞状态转变动态 机器学习 NA RNA速度分析, 空间转录组学, 深度生成模型 深度生成模型, 智能体模型 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
997 2026-07-04
Prostaglandin I2 receptor activation promotes alveolar regeneration via the JUN/p53 pathway
2026-07-01, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1
研究论文 研究前列腺素I2受体(IP)激活通过JUN/p53通路促进肺泡再生的机制 首次揭示IP受体通过PKA介导的MAP3K5抑制调控JNK/JUN轴,进而激活p53依赖性AT2向AT1细胞转分化的分子机制 研究主要基于小鼠模型和体外类器官培养,人类IPF患者样本的验证仅限于原代AT2细胞,还需进一步体内验证 探究IP受体在调控AT2向AT1细胞转分化中的角色及分子机制 肺泡上皮细胞(AT2和AT1细胞)、小鼠肺损伤模型、患者特发性肺纤维化(IPF)组织 分子生物学 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序、ATAC-seq NA 基因表达数据、染色质可及性数据 小鼠模型(博来霉素和LPS诱导)、患者IPF原代AT2细胞 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium Single Cell 3'用于scRNA-seq,10x Chromium Single Cell ATAC用于ATAC-seq
998 2026-07-04
Scoring gene importance by interpreting single-cell foundation models
2026-May-27, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 介绍SIGnature框架,通过单细胞RNA测序基础模型的归因分数评估基因功能重要性 首次利用单细胞基础模型的归因分数来评估基因重要性,减少技术噪声,强调调控基因,并支持跨数据集比较 未明确提及局限性 开发一个用于评分基因重要性的框架,并应用于大规模单细胞RNA测序图谱的基因集搜索和跨疾病分析 单细胞RNA测序数据中的基因 机器学习 COVID-19, 脓毒症, 川崎病 单细胞RNA测序 基础模型 单细胞RNA测序数据 400项研究的数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
999 2026-07-04
Triggering Receptor Expressed on Myeloid Cells 2+ Macrophages Promote Pancreatic Regeneration Through Cholesterol-Metabolism Reprogramming and Hedgehog Signaling Activation Following Acute Pancreatitis
2026-May-27, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示了TREM2+巨噬细胞在急性胰腺炎后通过胆固醇代谢重编程和Hedgehog信号通路激活促进胰腺再生的机制 首次发现TREM2+巨噬细胞在胰腺再生中的保护作用,并阐明其通过胆固醇代谢重编程和Hedgehog信号通路调控胰腺修复的分子机制 主要基于小鼠模型研究,临床样本验证相对有限,且TREM2/DHH轴的靶向治疗策略需进一步在人类胰腺疾病中验证 探究TREM2+巨噬细胞在急性胰腺炎后胰腺再生中的功能及其分子机制 TREM2+巨噬细胞在急性胰腺炎小鼠模型及患者胰腺组织中的分布、功能及调控机制 数字病理学 胰腺炎 单细胞测序, 免疫组化, 谱系追踪, 转录组学分析, 药理学干预 NA 图像, 转录组数据 小鼠模型(LysMCreTrem2fl/fl小鼠)及急性胰腺炎患者临床队列 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
1000 2026-05-20
ASCL2-mediated macrophage-myofibroblast transition generates immunosuppressive CAF_7 in NSCLC bone metastases
2026-May-18, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
研究论文 该研究通过整合单细胞RNA测序、伪时间分析、调节子分析以及体内外实验,揭示ASCL2驱动的巨噬细胞-肌成纤维细胞转化(MMT)生成免疫抑制性CAF_7,促进非小细胞肺癌骨转移的免疫逃逸 首次在非小细胞肺癌骨转移中鉴定出由ASCL2驱动的巨噬细胞-肌成纤维细胞转化(MMT)生成免疫抑制性CAF_7亚群,并阐明其通过直接反式激活Il6ra促进免疫逃逸的机制,同时发现靶向ASCL2可与PD-1阻断疗法协同增强抗肿瘤效果 主要基于小鼠模型和体外实验,骨转移样本数量可能有限;CAF_7在人类患者中的临床相关性及治疗靶点的转化潜力需进一步验证 探究非小细胞肺癌骨转移中肿瘤相关巨噬细胞是否通过MMT生成免疫抑制性CAF亚群及其驱动机制,并评估靶向干预与免疫治疗的协同效应 非小细胞肺癌骨转移样本、小鼠骨转移模型、骨髓来源巨噬细胞、T细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序、伪时间分析、调节子分析、免疫荧光、流式细胞术、体外诱导分化、T细胞共培养、基因敲低/恢复、巨噬细胞耗竭/重建、体内示踪 NA 单细胞转录组数据、图像数据 人原发性肺肿瘤和骨转移样本、小鼠骨转移模型(具体样本量未在摘要中明确) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
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