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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
981 2026-05-02
Disulfidptosis-related genes define a prognostic signature and novel therapeutic targets in Ewing's sarcoma through transcriptomic analysis and experimental validation
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过转录组分析和实验验证,鉴定与二硫化物凋亡相关的基因在尤文肉瘤中的预后特征和潜在治疗靶点 首次建立与二硫化物凋亡相关的尤文肉瘤预后特征,并通过单细胞RNA测序分析揭示其代谢异质性和微环境相互作用 未提及具体限制 评估二硫化物凋亡相关基因在尤文肉瘤中的预后意义和潜在治疗靶点 尤文肉瘤组织和细胞系(RD-ES细胞) 数字病理学 尤文肉瘤 转录组分析,单细胞RNA测序 Cox回归,LASSO 基因表达数据 分析四个GEO数据集 Illumina 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq 进行单细胞RNA测序分析
982 2026-05-02
SpatialFinder: a human-in-the-loop vision-language framework for prioritizing high-value regions in spatial transcriptomics
2026, Frontiers in bioinformatics IF:2.8Q2
研究论文 提出SpatialFinder框架,结合生物医学视觉语言模型与人在回路优化流程,从常规H&E组织切片中预测基因表达异质性并排序高价值区域,以提高空间转录组学的成本效益 首次将视觉语言模型与人机交互优化结合用于空间转录组学中的感兴趣区域优先排序,可在无转录组数据的情况下仅凭H&E图像识别高信息区域,并支持临床医生自定义微环境偏好 评估仅在Visium HD组织的四种类型上进行,可能需进一步验证其他平台和组织的普遍适用性;研究中未涉及真实临床场景的长期经济性评估 开发一种经济有效的空间转录组学分析框架,通过优先分析高价值感兴趣区域降低实验成本,同时保持生物学发现能力 四种Visium HD组织类型的H&E组织切片及其空间转录组数据 计算机视觉、自然语言处理、数字病理学 未明确指定疾病类型,涉及通用组织微环境研究 空间转录组学(Space Transcriptomics)、H&E染色、视觉语言模型(VLM) 生物医学视觉语言模型 组织切片图像(H&E染色)、空间转录组表达数据 四种Visium HD组织类型,具体样本数未在摘要中说明 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium HD 10x Visium HD空间转录组学平台
983 2026-05-02
Cisplatin resistance in oral squamous cell carcinoma: mechanisms, reversal strategies, and emerging technologies
2026, Frontiers in physiology IF:3.2Q2
综述 系统审查了口腔鳞状细胞癌中顺铂耐药的多维机制及克服耐药性的策略 整合纳米技术、免疫疗法、代谢靶向、类器官模型、单细胞技术和人工智能等新兴研究范式,提出克服顺铂耐药的个性化联合疗法 综述未涵盖临床前到临床转化的具体挑战和成本效益分析 阐明口腔鳞状细胞癌中顺铂耐药的机制并探索逆转策略 口腔鳞状细胞癌中的耐药细胞及其微环境 机器学习 口腔癌 单细胞测序 NA 多组学数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
984 2026-05-02
Integrating bulk RNA-seq and ScRNA-seq to identify manganese metabolism-related subtypes and immunoregulatory mechanisms in liver hepatocellular carcinoma
2026-Jan, Open life sciences IF:1.7Q3
研究论文 整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,识别肝细胞癌中锰代谢相关亚型及免疫调控机制 首次将锰代谢基因与肝细胞癌亚型分类和预后模型相结合,利用单细胞数据分析免疫细胞通讯 未明确提及外部验证或机制实验验证,可能依赖公共数据库的回顾性分析 研究锰代谢在肝细胞癌中的分子亚型及免疫调控机制,以指导精准诊断和免疫治疗 肝细胞癌肿瘤样本(来自TCGA和GEO数据库) 自然语言处理, 机器学习, 数字病理学 肝癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq LASSO, 多变量Cox回归 基因表达数据 TCGA和GEO数据库中的多个肝细胞癌样本(具体数量未提及) NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
985 2026-05-02
Integrative Machine Learning and Experimental Validation Identify MYBL2 as a Prognostic Biomarker and Therapeutic Target in Hepatocellular Carcinoma
2026, Oncology research IF:2.0Q3
research paper 通过整合机器学习和实验验证,确定MYBL2作为肝细胞癌的预后生物标志物和治疗靶点 系统验证了MYBL2在肝细胞癌中的临床意义,利用多种机器学习及实验技术,并揭示了miR-29a对MYBL2的调控机制 研究主要基于公开数据集和有限体外实验,临床应用验证不足 验证MYBL2在肝细胞癌中的临床意义,阐明其功能及上游调控机制 肝细胞癌样本、细胞系及小鼠模型 machine learning liver cancer RNA-seq, single-cell transcriptomics, iTRAQ proteomics, CRISPR knockout LASSO transcriptomic data, proteomic data, clinical data TCGA和GEO队列样本 Illumina RNA-seq, single-cell RNA-seq Illumina NovaSeq TCGA和GEO平台的RNA-seq数据
986 2026-05-02
Identify MTDH as a Key Gene of Radio-Resistance in Colorectal Cancer Based on Multi-Omics and Experimental Validation
2026, Oncology research IF:2.0Q3
research paper 基于多组学和实验验证,确定MTDH为结直肠癌放疗抵抗的关键基因 结合14种机器学习算法和SHAP可解释性分析,从多组学数据中识别MTDH与放疗抵抗的关联,并通过单细胞RNA测序和临床样本验证其在恶性二倍体单细胞亚群中的上调表达 未提及具体局限性 探究MTDH在结直肠癌放疗抵抗中的精确作用机制 MTDH基因及其在结直肠癌放疗抵抗中的作用 machine learning colorectal cancer RNA-seq, single-cell RNA sequencing NA gene expression data, single-cell transcriptomic data 82名直肠癌患者的组织样本 NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
987 2026-05-02
Navigating the Labyrinth of Hepatocellular Carcinoma: Leveraging AI/ML for Precision Oncology
2026, Oncology research IF:2.0Q3
综述 系统评估人工智能与机器学习在肝细胞癌精准肿瘤学中整合多组学数据、识别生物标志物和优化治疗决策的作用 创新性提出了AI驱动框架在解码肿瘤微环境相互作用和空间异质性中的转化潜力,特别是结合空间转录组学、数字病理学和单细胞技术的综合策略 文中未明确讨论具体局限,但综述性质可能受限于当前AI模型的可解释性、数据标准化及临床验证不足 评估AI/ML作为整合工具在肝细胞癌管理中转化高维多组学数据为临床可操作见解的能力 肝细胞癌的分子靶点、组合治疗策略、多组学数据(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、表观基因组学) 机器学习 肝癌 NA NA 文本、图像(数字病理学)、空间转录组学数据、单细胞数据 NA NA 空间转录组学, 数字病理学, 单细胞RNA-seq NA NA
988 2026-05-02
CDKN1A/p21 Influences the Survival and Expansion of Breast Cancer Stem Cells after Oxidative Damage
2026, Oncology research IF:2.0Q3
研究论文 本研究探讨了CDKN1A/p21在氧化损伤后乳腺癌干细胞存活与扩增中的作用 首次揭示CDKN1A/p21通过直接结合CD44、SPP1和TMSB10启动子调控其表达,影响乳腺癌干细胞存活,为克服治疗耐药和转移提供了新靶点 研究主要基于体外三维模型,缺乏体内验证,且未深入探讨p21调控的具体信号通路机制 探索CDKN1A/p21在乳腺癌干细胞存活和扩增中的功能及其分子机制 乳腺癌干细胞(BCSCs) 机器学习 乳腺癌 空间转录组学,染色质免疫沉淀定量PCR NA 图像,文本 NA 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台用于基因表达谱分析
989 2026-05-02
High-dimensional multiomics reveals perturbations to IL-6/IL-6R axis and RUNX3 in CD4+ T cells during third-trimester pregnancy
2026, Clinical & translational immunology IF:4.6Q2
研究论文 利用多组学技术研究妊娠晚期CD4+ T细胞的表面蛋白质组和转录组变化 首次通过高维多组学方法(包括流式细胞术和单细胞RNA测序结合CITE-seq)系统分析了妊娠晚期外周血和蜕膜中CD4+ T细胞的表面蛋白质组和转录组,揭示了IL-6/IL-6R轴和RUNX3的扰动 研究仅针对足月妊娠(>37周),未涵盖早孕期或中孕期;样本量较小;未对非妊娠对照组进行纵向追踪 理解妊娠期CD4+ T细胞的表面蛋白表达和转录组变化,为胎盘发育和妊娠并发症的免疫调节提供机制见解 足月妊娠(>37周)女性的外周血和蜕膜中的CD4+ T细胞以及非妊娠女性的外周血CD4+ T细胞 机器学习和数字病理学 妊高症、胎儿生长受限、死产 流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CITE-seq NA 蛋白质表达数据、转录组数据 足月妊娠女性与非妊娠女性(具体数量未明确提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序、CITE-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序结合CITE-seq抗体(>130种条形码抗体)
990 2026-05-01
HOX code-based stratification reveals RUNX1T1-HDAC reprogramming as a targetable driver of lineage plasticity across cancers
2026-Jun-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 通过分析80,000多个RNA-seq样本的HOX基因表达,发现HOX代码能够跨癌种区分谱系受限和谱系可塑性状态,并揭示RUNX1T1-HDAC轴作为可治疗靶点 首次建立基于HOX代码的跨癌种谱系可塑性分类框架,发现RUNX1T1作为跨谱系可塑性调节因子,并验证HDAC3抑制可作为治疗策略 未明确提及,但可能包括机制验证主要基于前列腺癌模型,以及临床验证样本范围的潜在限制 探索HOX代码作为跨癌种谱系可塑性生物标志物的可行性,并鉴定潜在治疗靶点 前列腺癌、肺癌和急性髓系白血病的谱系可塑性亚型及相关细胞模型 机器学习 前列腺癌、肺癌、急性髓系白血病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CUT&RUN, 共免疫沉淀, 脂质纳米颗粒 人工智能结构建模 RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 染色质图谱数据 超过80,000个RNA-seq样本,涵盖23种癌症类型的114个亚型 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
991 2026-05-01
AMPK-p38 axis converts human pluripotent stem cells to naive state
2026-May-15, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究发现AMPK-p38轴可单独诱导人类多能干细胞(hPSCs)从始发态向原始态转化,并揭示了中间状态细胞的特征 首次发现AMPK/p38通路单因子即可驱动始发态hPSC向原始态转变,无需多种外源因子;通过scRNA-seq与RNA速率分析揭示了始发态与原始态之间的中间细胞状态 未提及具体局限性,可能需要进一步验证AMPK-p38通路的长期稳定性和安全性 探索将人类多能干细胞从始发态高效转化为原始态的新机制与简化方法 人类多能干细胞(hPSCs)在始发态与原始态之间的转化过程及中间状态细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量,研究基于细胞系实验及单细胞分析 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 使用10x Chromium平台进行单细胞RNA测序,结合RNA速率分析和Totem轨迹映射分析中间状态
992 2026-05-01
Single-Cell Profiling Reveals Divergent Mechanisms of Fibrosis in Localized Scleroderma and Systemic Sclerosis
2026-May, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 通过单细胞测序揭示局限性硬皮病和系统性硬化症纤维化的不同机制 首次通过单细胞RNA测序比较两种纤维化疾病的机制差异,发现局限性硬皮病中三级淋巴结构驱动的局部免疫激活,而系统性硬化症中CREB3L1高表达成纤维细胞的系统性活化 样本量较小(每组仅3例患者),且未进行大规模队列验证 阐明局限性硬皮病和系统性硬化症纤维化差异的分子机制 皮肤活检样本(3例健康对照、3例局限性硬皮病患者、3例系统性硬化症患者)及小鼠模型 数字病理学 纤维化疾病(局限性硬皮病、系统性硬化症) 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 9例皮肤活检样本(3例健康对照、3例局限性硬皮病、3例系统性硬化症) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
993 2026-05-01
Transcriptomics analyses reveal microgravity triggers estrogen synthesis amidst degeneration and aging in human ovarian granulosa cells
2026-May, Life sciences in space research IF:2.9Q2
研究论文 通过转录组学分析揭示微重力诱发人卵巢颗粒细胞退化和衰老过程中的雌激素合成 首次系统表征微重力对人卵巢颗粒细胞的多方面影响,包括细胞骨架、线粒体功能和雌激素合成相关过程的破坏,并鉴定抗衰老化合物如雷帕霉素作为潜在干预措施 由于测序数据稀缺,机制研究和干预开发受到限制,且研究仅在体外进行 探究微重力对人卵巢颗粒细胞的影响及其对生殖内分泌健康的潜在机制 人卵巢颗粒细胞 转录组学 生殖内分泌疾病 转录组学分析、单细胞转录组学解卷积分析 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
994 2026-05-01
Methylene blue restores NAD+/NADH homeostasis to attenuate Achilles tendinopathy via activating AIF/Mitochondrial respiratory chain complex I
2026-May, Journal of orthopaedic translation IF:5.9Q1
research paper 本研究探讨亚甲蓝通过恢复NAD+/NADH稳态缓解跟腱病的机制,并发现其通过激活AIF/线粒体呼吸链复合体I发挥作用 首次揭示亚甲蓝靶向NAD代谢通过AIF驱动的线粒体修复机制促进线粒体复合体I生物合成,为老药新用提供转化医学范例 未提及具体研究局限性 研究NAD代谢失调在跟腱病中的作用,评估亚甲蓝恢复NAD稳态和缓解跟腱病的疗效 人类跟腱组织、大鼠实验性跟腱病模型、大鼠原代跟腱细胞 machine learning geriatric disease 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 人类跟腱组织和大鼠跟腱样本,具体数量未提及 NA single-cell RNA-seq NA NA
995 2026-05-01
Germ layer specification and organotropism in lymphoma invasion
2026-Apr-30, Science bulletin IF:18.8Q1
研究论文 本研究揭示了弥漫大B细胞淋巴瘤外侵犯的胚层依赖性特征,包括基因突变、器官迁移轨迹和免疫检查点表达差异 首次发现淋巴瘤外侵犯模式与胚层发育之间存在关联,并揭示了恶性B细胞遵循类似胚层发育的演化轨迹 未明确提及但可能包括样本量有限、机制验证不足等 探究弥漫大B细胞淋巴瘤外侵犯与胚层发育之间的关系及其分子特征 弥漫大B细胞淋巴瘤患者的外侵犯样本 数字病理学 淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
996 2026-05-01
Multiomics Analysis Reveals Stromal Cell State Changes and INHBA-Associated Remodeling in Calcific Aortic Valve Disease
2026-Apr-30, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 通过多组学分析揭示钙化性主动脉瓣疾病中基质细胞状态变化及INHBA相关的重塑机制 首次整合GWAS、单细胞RNA测序和体外模型,系统解析胎儿、健康成人及CAVD瓣膜中基质细胞亚群状态转变,并鉴定INHBA在VIC成骨重塑中的关键作用 未明确说明具体局限性 阐明CAVD的细胞和分子机制,特别是基质细胞状态变化及INHBA在疾病相关重塑中的作用 主动脉瓣膜间质细胞和瓣膜源性基质细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、GWAS、bulk RNA测序 NA 基因表达数据 胎儿、健康成人和CAVD患者的瓣膜样本,以及体外VIC钙化模型 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序用于scRNA-seq; Illumina NovaSeq用于bulk RNA-seq和GWAS
997 2026-05-01
TNF Pathway-Mediated Tolerogenic T-Cell Trajectory Driven by Allergen Immunotherapy
2026-Apr-30, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 本研究探讨过敏原免疫治疗如何通过TNF通路驱动耐受性T细胞轨迹,恢复免疫平衡 首次通过单细胞转录组学揭示Tr17细胞作为促炎与调节性T细胞程序之间的中间状态,并发现TNF/LTA信号通路在耐受性信号传导中的关键作用 主要基于动物模型和少量人类血液样本,未进行长期临床随访验证 探究AIT治疗第一年内从3型免疫向调节性状态转变的动态过程及效应细胞功能障碍 人类和实验性过敏性气道炎症模型的T细胞群体,包括Treg、Tr17和Th17细胞 机器学习和生物信息学交叉 过敏性气道疾病 单细胞转录组学、流式细胞术、增殖实验 NA 单细胞基因表达数据 人类血液样本和动物模型样本(具体数量未提供) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
998 2026-05-01
Integrating single-cell RNA and bulk RNA sequencing data to identify prognostic genes associated with pyrimidine metabolism in triple-negative breast cancer by machine learning algorithm combinations
2026-Apr-30, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 利用机器学习算法整合单细胞和批量RNA测序数据,识别三阴性乳腺癌中与嘧啶代谢相关的预后基因 首次通过101种机器学习算法组合筛选与嘧啶代谢相关的预后基因,并基于单细胞RNA测序分析揭示上皮细胞与预后基因表达的相关性 所有数据来自公共数据库,缺乏独立外部验证队列;预后基因的功能验证仅限于SEPT3,其他基因的机制未深入探讨 识别三阴性乳腺癌中与嘧啶代谢相关的预后基因 三阴性乳腺癌患者 机器学习 乳腺癌 RNA-seq 加权基因共表达网络分析、单变量Cox回归、101种机器学习算法组合 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 公共数据库中的三阴性乳腺癌样本(具体数量未说明) NA 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq NA NA
999 2026-05-01
Engineering of Immunoactive Hydrogels Complements Tumor-Treating Fields for Glioblastoma Therapy
2026-Apr-29, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 该研究揭示了肿瘤治疗电场(TTF)通过鞘脂代谢相关通路介导的内质网应激诱导胶质母细胞瘤免疫原性细胞死亡,并设计了一种ATP响应性水凝胶佐剂与TTF协同作用,实现抗原和CpG的时空控释,增强抗肿瘤免疫效果 首次在单细胞RNA测序分辨率下阐明TTF诱导免疫原性细胞死亡的分子机制,并开发了ATP响应性水凝胶佐剂与TTF联合疗法(HaTTF),实现了对胶质母细胞瘤的更强效治疗 该研究尚未在人类临床试验中验证HaTTF的安全性和有效性,且水凝胶佐剂的长期生物降解性和免疫激活的潜在副作用需进一步评估 开发一种联合肿瘤治疗电场和免疫佐剂的综合疗法,以改善胶质母细胞瘤的治疗效果 胶质母细胞瘤(GBM)细胞和大鼠GBM模型 机器学习和数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未在摘要中明确提及样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1000 2026-05-01
Spatial-aware detection of copy number alterations from spatial transcriptomics using SpaCNA
2026-Apr-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出SpaCNA框架,整合空间转录组学多模态信息,实现肿瘤拷贝数变异的高精度检测 首次将隐马尔可夫随机场模型与空间连续性及形态学特征结合,实现空间转录组数据中CNAs的稳健检测,并扩展到3D空间连续切片的重建 未提及计算资源需求或对低质量数据的适应性等局限性 开发空间转录组数据中拷贝数变异检测的计算方法 模拟数据及多种真实癌症数据集(乳腺癌、结直肠癌、头颈鳞癌) 计算生物学 乳腺癌, 结直肠癌, 头颈鳞状细胞癌 空间转录组学 隐马尔可夫随机场 空间转录组数据 模拟数据及多种癌症数据集 NA 空间转录组学 NA NA
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