本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-12-06 |
The tumor microenvironment in lung cancer: Heterogeneity, therapeutic resistance and emerging treatment strategies (Review)
2026-Jan, International journal of oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.3892/ijo.2025.5824
PMID:41312736
|
综述 | 本文综述了肺癌肿瘤微环境的异质性及其在治疗抵抗中的作用,并探讨了新兴的治疗策略 | 整合多组学数据和空间转录组学,推动肿瘤微环境导向的干预向生物标志物引导的个体化方案发展 | NA | 分析肺癌肿瘤微环境在肿瘤进展和治疗抵抗中的关键作用,并总结新兴治疗策略 | 肺癌的肿瘤微环境,包括免疫细胞、基质成分、细胞外基质和生物活性分子 | 数字病理学 | 肺癌 | 多组学数据整合,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 82 | 2025-12-06 |
Current Knowledge and Future Directions for Cyclospora cayetanensis Research and Its Surrogates
2026-Jan, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70327
PMID:41347294
|
综述 | 本文综述了环孢子虫的研究现状、挑战及未来方向,并评估了替代生物在研究中的应用 | 整合了当前知识,评估了替代生物(如艾美球虫和隐孢子虫)在研究中的局限性,并提出了新兴工具如宏基因组学、单细胞测序和AI生物信息学作为未来突破方向 | 环孢子虫无法在体外/体内培养,基因组特征有限,替代生物不能完全模拟其生物学特性,标准化采样方法缺乏,检测灵敏度仍需提高 | 改善环孢子虫的检测、风险评估和公共卫生政策,以减轻环孢子病的负担 | 环孢子虫及其替代生物(艾美球虫和隐孢子虫) | NA | 环孢子病 | 分子检测、宏基因组学、单细胞测序、AI驱动的生物信息学 | NA | 基因组数据、环境样本数据、食品样本数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2025-12-05 |
The unfolded protein response in progeria arteries originates from non-endothelial cell types
2026-Feb, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503485
PMID:41326174
|
研究论文 | 本研究探讨了早衰症动脉中未折叠蛋白反应的起源,发现其主要源于非内皮细胞类型 | 揭示了在表达早老素的动脉中,UPR激活具有细胞类型特异性,挑战了先前关于血管平滑肌细胞和成纤维细胞中UPR普遍激活的观点 | 研究基于小鼠模型,可能不完全反映人类HGPS的病理生理学,且未详细探讨非内皮细胞中UPR的具体机制 | 研究早衰症中未折叠蛋白反应是否导致内皮细胞功能障碍 | Hutchinson-Gilford早衰综合征小鼠模型,特别是内皮细胞特异性表达早老素的动脉组织 | 数字病理学 | 早衰症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2025-12-05 |
Spatial transcriptomics mapping of immune cell and TGFβ signalling pathway heterogeneity in testicular germ cell tumours
2026-Jan, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70100
PMID:40693358
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,绘制了睾丸生殖细胞肿瘤中免疫细胞和TGFβ信号通路的异质性图谱 | 首次应用空间转录组学分析睾丸生殖细胞肿瘤的组织切片,揭示了肿瘤内部及周围区域的免疫细胞和TGFβ信号通路异质性 | 样本量较小(仅4例患者),且未涉及长期临床结果验证 | 探究睾丸生殖细胞肿瘤的异质性,特别是免疫细胞和TGFβ信号通路在肿瘤发生发展中的作用 | 睾丸生殖细胞肿瘤组织切片,包括非精原细胞瘤和精原细胞瘤样本 | 空间转录组学 | 睾丸生殖细胞肿瘤 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | 4例TGCT患者样本,超过90个感兴趣区域 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | NanoString GeoMx空间全转录组工作流程 |
| 85 | 2025-12-05 |
Altered Inflammatory Signature in a C9ORF72 -ALS iPSC-Derived Motor Neuron and Microglia Coculture Model
2026-Jan, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70084
PMID:40952044
|
研究论文 | 本研究利用携带C9ORF72基因突变的人类诱导多能干细胞(iPSC)来源的运动神经元与小胶质细胞共培养模型,揭示了ALS中炎症反应的改变机制 | 首次在iPSC来源的运动神经元与小胶质细胞共培养模型中,结合单细胞RNA测序技术,系统分析了C9ORF72突变对神经炎症的影响,并发现LPS响应性小胶质细胞亚群的消失 | 研究主要基于体外细胞模型,可能无法完全模拟体内复杂的神经微环境;样本类型和数量有限 | 探究肌萎缩侧索硬化症(ALS)中,C9ORF72基因突变如何通过小胶质细胞介导的神经炎症影响疾病病理 | 人类诱导多能干细胞(iPSC)来源的运动神经元和小胶质细胞,包括携带C9ORF72六核苷酸重复扩增(HRE)的ALS患者iPSC系和C9ORF72敲除(KO)iPSC系 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),细胞共培养,炎症因子表达与分泌分析 | iPSC来源的细胞共培养模型 | 单细胞转录组数据,细胞表型数据 | 多个iPSC细胞系(包括C9ORF72 HRE和KO系),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 86 | 2025-12-05 |
Plasma proteomics identifies potential drug targets for diabetic polyneuropathy: Evidence from prospective cohorts and genetic analysis
2026-Jan, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.70239
PMID:41144938
|
研究论文 | 本研究通过血浆蛋白质组学分析,结合前瞻性队列和遗传数据,识别出与糖尿病多发性神经病相关的潜在药物靶点,特别是TNFRSF14,并探讨其临床和细胞机制 | 首次大规模整合临床、遗传和单细胞测序数据,系统性地筛选并验证TNFRSF14作为糖尿病多发性神经病的新型生物标志物和治疗靶点 | 研究依赖于观察性队列和遗传关联分析,因果推断需进一步实验验证;单细胞测序数据可能样本有限,需扩大验证 | 识别糖尿病多发性神经病的潜在药物靶点,以提升治疗效果 | 糖尿病多发性神经病患者及相关蛋白质和遗传因素 | 蛋白质组学 | 糖尿病多发性神经病 | 血浆蛋白质组学、单细胞测序 | NA | 蛋白质组数据、遗传数据、临床数据 | 大规模临床和遗传数据集(具体样本数未在摘要中说明) | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 87 | 2025-12-05 |
Dissolvable microneedles loaded with denosumab alleviate knee osteoarthritis in rodent and canine models by inhibiting macrophage senescence
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.116970
PMID:41328338
|
研究论文 | 本研究开发了一种负载地诺单抗的可溶性微针阵列,用于局部递送药物以治疗骨关节炎,并在啮齿类和犬类模型中验证了其疗效 | 首次将可溶性微针平台用于地诺单抗的经皮关节内递送,以靶向衰老巨噬细胞,提供了一种微创、局部治疗骨关节炎的新策略,避免了关节内注射的侵入性和全身给药的不良反应 | 研究主要在啮齿类和犬类动物模型中进行,其疗效和安全性仍需在人体临床试验中进一步验证 | 开发一种微创的微针给药平台,用于局部递送地诺单抗以治疗骨关节炎,并评估其疗效和机制 | 骨关节炎(OA) | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫荧光,组织学评估,行为学评估,衰老巨噬细胞-软骨细胞共培养 | NA | 基因表达数据,图像数据,行为数据 | 啮齿类动物(具体物种和数量未明确说明)和比格犬 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-12-05 |
Enhancer-mediated NR2F2 recruitment activates BGN to promote tumor growth and shape tumor microenvironment in papillary thyroid cancer
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.113712
PMID:41328346
|
研究论文 | 本研究揭示了NR2F2-BGN轴在调控甲状腺乳头状癌(PTC)肿瘤生长和肿瘤微环境(特别是巨噬细胞极化)中的关键作用,并评估了靶向该轴的潜在治疗策略 | 首次系统阐明了BGN在PTC中通过内分泌和旁分泌方式促进肿瘤进展的双重作用机制,并发现了NR2F2作为BGN转录的关键上游调控因子,同时验证了NR2F2特异性抑制剂CIA1的治疗潜力 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型,其临床转化效果和长期安全性仍需在更多临床样本和试验中验证 | 探究细胞外基质成分BGN在甲状腺乳头状癌(PTC)发生发展中的内分泌与旁分泌作用及其分子机制 | 甲状腺乳头状癌(PTC)细胞、小鼠模型、肿瘤微环境中的免疫细胞(特别是巨噬细胞) | 肿瘤生物学 | 甲状腺癌 | 多组学整合分析、RNA-seq、单细胞RNA-seq、流式细胞术、CRISPR干扰、荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2025-12-02 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor microenvironment characteristics in ovarian malignant Brenner tumor
2026-Mar, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101635
PMID:41322338
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2025-12-04 |
Unraveling the therapeutic potential of triptolide in glioma: Orchestrating apoptosis and immune landscape remodeling
2026-Jan-01, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2025.150039
PMID:41205732
|
研究论文 | 本研究探讨了雷公藤甲素在胶质瘤中的治疗潜力,通过诱导细胞凋亡和重塑肿瘤免疫微环境发挥双重抗肿瘤作用 | 整合转录组学、免疫浸润分析和单细胞RNA测序,揭示了雷公藤甲素通过调控关键基因(如BCL2L11、CASP3、IL6、TGF-β1)同时促进胶质瘤细胞凋亡和抑制M2巨噬细胞极化的新机制 | 研究主要基于公共数据集GSE147352和体外实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接验证 | 阐明雷公藤甲素在胶质瘤治疗中的作用机制,探索其作为胶质瘤免疫治疗候选药物的潜力 | 胶质瘤细胞及肿瘤免疫微环境,特别是巨噬细胞极化状态 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 转录组分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学、qPCR | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 基于公共数据集GSE147352,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2025-12-04 |
From genes to lifestyle: A multi-dimensional framework for Alzheimer's disease prevention and therapy
2026-Jan, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2025.102947
PMID:41271115
|
综述 | 本文综述了阿尔茨海默病预防和治疗的基因-细胞-网络-生活方式多维框架 | 提出了从单一靶点治疗转向整合基因、细胞、网络和生活方式的多维精准医学范式 | NA | 探讨阿尔茨海默病的多组学整合机制及预防治疗策略 | 阿尔茨海默病相关的基因、细胞类型和调控网络 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 转录组学、表观基因组学、遗传关联研究、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2025-12-02 |
Astrocytes and Alcohol Throughout the Lifespan
2026-Jan-01, Biological psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1016/j.biopsych.2025.04.013
PMID:40311830
|
综述 | 本文综述了星形胶质细胞在酒精使用障碍(AUD)和胎儿酒精谱系障碍(FASD)中的作用,包括其对酒精的反应、异质性、反应性以及细胞外基质重塑的贡献 | 首次系统回顾了星形胶质细胞在酒精暴露效应中的参与,并强调了单细胞RNA测序在揭示星形胶质细胞异质性和酒精敏感性亚群方面的应用 | 现有知识存在空白,特别是对酒精暴露敏感的星形胶质细胞亚群和分子的识别不足,需要进一步研究 | 评估星形胶质细胞在酒精暴露效应中的参与,并探讨其在AUD和FASD发展中的作用 | 星形胶质细胞及其在酒精使用障碍和胎儿酒精谱系障碍中的生物学角色 | 神经科学 | 酒精使用障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2025-12-02 |
5-FU Resistance Facilitates Immune Evasion in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Through ADAM10-Mediated PD-L1 Shedding and Tumour Microenvironment Remodelling
2026-Jan, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70038
PMID:40958168
|
研究论文 | 本研究揭示了5-FU耐药通过上调ADAM10和释放可溶性PD-L1,重塑食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境,促进免疫逃逸 | 发现了ADAM10介导的可溶性PD-L1释放是5-FU耐药导致免疫逃逸的新机制,并提出了靶向ADAM10-PD-L1轴的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,尚未在人体临床试验中验证 | 探究5-FU耐药如何通过ADAM10介导的PD-L1脱落和肿瘤微环境重塑促进免疫逃逸 | 5-FU耐药的AKR小鼠食管鳞状细胞癌细胞系及其亲本细胞系,以及异种移植模型 | 肿瘤免疫学 | 食管鳞状细胞癌 | 第三代DNA测序、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组、蛋白质组、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 94 | 2025-12-02 |
MIF Facilitates Resistance to Androgen Deprivation Therapy by Regulating AMPD2 Expression in Prostate Cancer Cells
2026-Jan, The Prostate
DOI:10.1002/pros.70053
PMID:40968720
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9筛选和单细胞RNA测序,发现MIF通过上调AMPD2表达促进前列腺癌细胞增殖,从而介导对雄激素剥夺疗法的耐药性 | 首次将MIF与ADT耐药性联系起来,并揭示其通过调控AMPD2表达促进前列腺癌细胞增殖的新机制 | 研究主要基于细胞实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接证据 | 探究前列腺癌对雄激素剥夺疗法产生耐药性的分子机制 | 前列腺癌细胞 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 全基因组CRISPR/Cas9敲除筛选, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2025-12-02 |
Elucidating Wenshen Xuanbi Decoction's Anti-Osteoporotic Mechanisms via Integrated Multiomics Analysis
2026-Jan, Biomedical chromatography : BMC
IF:1.8Q3
DOI:10.1002/bmc.70273
PMID:41320184
|
研究论文 | 本研究采用整合多组学方法,系统探讨了温肾宣痹汤(WSXBT)治疗原发性骨质疏松症(POP)的活性成分及作用机制 | 首次结合HPLC-Q-TOF-MS/MS、网络药理学、转录组学、单细胞RNA测序及WGCNA等多组学技术,全面解析WSXBT抗骨质疏松的多靶点机制,并确认CTNNB1和AKT1为核心靶点 | 研究主要基于公共数据库和计算模拟,缺乏体内或体外实验的直接验证,且样本来源和具体实验条件未详细说明 | 阐明温肾宣痹汤抗骨质疏松的活性成分及分子机制 | 温肾宣痹汤的化学成分及其在原发性骨质疏松症中的作用靶点 | 多组学分析 | 骨质疏松症 | HPLC-Q-TOF-MS/MS, 网络药理学, 转录组分析, 单细胞RNA测序, WGCNA, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | 化学质谱数据, 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组分析 | NA | NA |
| 96 | 2025-12-01 |
A synthetic circular RNA targeting miR-340-5p promotes optic nerve regeneration and retinal ganglion cell survival following axotomy
2026-Feb, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115527
PMID:41138896
|
研究论文 | 本研究开发了一种靶向miR-340-5p的合成环状RNA,能够促进视神经切断后的轴突再生和视网膜神经节细胞存活 | 首次通过计算模型筛选出调控多个再生相关基因的miR-340-5p,并设计环状RNA海绵实现多基因转录重编程 | Circ-340-5p对神经元存活的促进作用在六周后未能持续维持 | 探索通过miRNA调控促进中枢神经系统轴突再生的新策略 | 小鼠视网膜神经节细胞和背根神经节神经元 | 神经再生 | 神经损伤 | 单细胞RNA测序,计算建模,环状RNA设计 | 计算模型 | 单细胞RNA测序数据 | 雄性和雌性C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 97 | 2025-12-01 |
Low-density lipoprotein receptor interacts with clusterin to regulate A1/A2 astrocyte polarization and ameliorate hemorrhagic brain injury
2026-Feb, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115539
PMID:41175961
|
研究论文 | 本研究探讨低密度脂蛋白受体与clusterin相互作用调控星形胶质细胞A1/A2极化并改善出血性脑损伤的机制 | 首次揭示LDLR通过相互作用蛋白CLU调控星形胶质细胞极化状态,为出血性脑损伤提供新的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探索LDLR对星形胶质细胞极化的影响及其分子机制 | C57BL/6J小鼠脑出血模型中的星形胶质细胞 | 神经科学 | 脑出血 | 单细胞测序, 质谱分析, 免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | 小鼠脑出血模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2025-12-01 |
De novo truncating variant in the FBRSL1 gene caused neurodevelopmental disorders, epilepsy, congenital heart disease, and facial dysmorphism
2026-Feb, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115549
PMID:41232796
|
研究论文 | 本研究通过全外显子测序和斑马鱼模型验证,发现FBRSL1基因新发截断变异导致神经发育障碍、癫痫、先天性心脏病和面部畸形的综合征 | 首次将FBRSL1确定为多系统发育障碍的致病基因,揭示了其与AUTS2旁系同源基因在神经发育中的关联机制 | 研究样本量有限,仅分析了5名患者,需要更大规模研究验证 | 探究FBRSL1基因在发育障碍中的致病作用 | 携带FBRSL1变异的患者和斑马鱼模型 | 遗传学 | 神经发育障碍 | 全外显子测序, 单细胞RNA测序, 斑马鱼基因敲低 | 斑马鱼模型, 类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 5名患者和斑马鱼模型 | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子测序 | NA | NA |
| 99 | 2025-12-01 |
EED226 treatment targets key immune genes to suppress LPS response in Chinese tongue sole splenocytes
2026-Jan, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2025.110927
PMID:41076212
|
研究论文 | 本研究探讨EED226通过表观遗传机制调控中国半滑舌鳎脾细胞对LPS免疫反应的机制 | 首次在硬骨鱼中揭示EED蛋白及其抑制剂EED226的免疫调节功能,发现跨物种保守的EED靶点 | 研究仅限于中国半滑舌鳎脾细胞,未在其他组织或物种中验证 | 探究表观遗传机制在硬骨鱼LPS免疫反应中的调控作用 | 中国半滑舌鳎脾细胞 | 表观遗传学 | 细菌感染 | 转录组分析,单细胞RNA测序,定量RT-PCR | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 100 | 2025-11-30 |
A common progenitor gives rise to fibroblastic reticular cells and vascular smooth muscle cells in murine lymph nodes
2026-Feb-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20242300
PMID:41295950
|
研究论文 | 本研究通过时间分辨单细胞转录组学揭示了小鼠淋巴结中成纤维网状细胞和血管平滑肌细胞共同来源于表达CCL19的胚胎祖细胞 | 首次发现淋巴结中成纤维网状细胞和血管平滑肌细胞具有共同的胚胎祖细胞,并揭示了淋巴毒素β受体依赖和非依赖的发育路径 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类组织中验证 | 探究淋巴结微环境中基质细胞的发育起源和分化路径 | 小鼠淋巴结中的成纤维网状细胞和血管平滑肌细胞 | 单细胞生物学 | NA | 时间分辨单细胞转录组学,细胞命运图谱,高分辨率共聚焦显微镜 | NA | 单细胞转录组数据,显微图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |