单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 9342 篇文献，本页显示第 921 - 940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2026-09-16 |
Predicting Targeted and Immunotherapeutic Response Outcomes in Melanoma With Single-Cell Raman Spectroscopy and Artificial Intelligence
2026-Sep, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO-25-00591
PMID:42715507
|
研究论文 | 该研究结合单细胞拉曼光谱与机器学习，快速分析黑色素瘤细胞并预测靶向治疗和免疫治疗耐药性 | 提出无损单细胞拉曼光谱与机器学习结合的方法，实现快速细胞表型分析和治疗反应预测，构建两阶段评估流程推断临床耐药性 | 摘要未明确提及研究局限性 | 识别黑色素瘤免疫治疗反应的可靠预测因子，通过单细胞拉曼光谱与机器学习预测治疗耐药性 | 小鼠和人类黑色素瘤细胞系，以及9例已知耐药谱的黑色素瘤患者样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞拉曼光谱 | 随机森林 | 光谱数据 | 小鼠和人类黑色素瘤细胞系，以及9例黑色素瘤患者样本，评估了33种患者-药物组合 | NA | NA | NA | NA |
| 922 | 2026-09-16 |
Japanese encephalitis virus reprograms host pyrimidine metabolism to facilitate viral replication
2026-Sep, Infectious medicine
DOI:10.1016/j.imj.2026.100274
PMID:42733724
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和功能验证，揭示了日本脑炎病毒感染如何重编程宿主脑内嘧啶代谢以促进病毒复制 | 首次在单细胞分辨率下描绘了正常和JEV感染小鼠脑内嘧啶代谢的细胞类型特异性图谱，并发现JEV复制依赖于神经元中的从头嘧啶生物合成、外源性谷氨酰胺摄取和GOT介导的天冬氨酸合成 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类或其他动物模型中验证；单细胞RNA测序数据的代谢基因表达分析可能受技术噪音影响；未在体内验证代谢抑制剂对JEV感染的治疗效果 | 表征中枢神经系统嘧啶代谢的细胞类型特异性组织方式，并揭示JEV感染期间的嘧啶代谢重编程 | 正常和JEV感染的小鼠脑组织，以及Neuro-2a细胞和原代小鼠脑源混合神经元/胶质细胞培养物 | 单细胞转录组学、病毒学、代谢组学 | 日本脑炎 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR、免疫印迹、噬斑实验 | NA | 单细胞RNA测序数据、图像、文本 | 正常和JEV感染的小鼠脑组织（具体数量未提及），以及Neuro-2a细胞和原代混合培养物 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 923 | 2026-09-16 |
Plant Spatio-Temporal Integration Network (PSTN): a framework for dynamic single-cell and spatial transcriptomics in fungal-plant interactions
2026-Aug-31, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag637
PMID:42633556
|
研究论文 | 该研究开发了植物时空整合网络（PSTN），用于在真菌与植物互作的动态过程中联合学习阶段特异性的单细胞到空间映射，并在水稻稻瘟病菌感染数据上验证了其优于现有方法的性能 | PSTN通过表达重构和双向最大相似度时序正则化，联合学习阶段特异性的细胞到空间映射，首次实现了跨阶段的时序耦合单细胞与空间转录组整合，而非独立分析各阶段 | 基因置换对照实验表明方法性能依赖正确的跨模态基因对应关系；独立基准验证仅限于小鼠皮层数据的静态重构组件，在植物-病原体动态系统中的泛化能力仍需进一步验证 | 解决现有单细胞RNA测序与空间转录组整合方法独立分析各阶段、忽略时序连续性的问题，实现动态宿主-病原体系统中的时序耦合单细胞与空间整合 | 水稻（受稻瘟病菌Magnaporthe oryzae感染的宿主）的单细胞RNA测序与空间转录组数据，以及小鼠皮层数据作为独立基准验证 | 机器学习 | 植物病害 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | PSTN（Plant Spatio-Temporal Integration Network） | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 水稻scRNA-seq和ST匹配数据，覆盖0、12和24小时三个时间点；4000个高变基因用于评估 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 924 | 2026-09-16 |
Benzene metabolite-targeted gene ATF7IP2 drives glutamate metabolic reprogramming to promote acute myeloid leukemia initiation
2026-Aug-22, Toxicology letters
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.toxlet.2026.113185
PMID:42632605
|
研究论文 | 本研究整合孟德尔随机化、转录组学和单细胞测序数据，发现苯代谢物靶向基因ATF7IP2通过重编程谷氨酸代谢驱动造血干细胞向白血病前体干细胞转化，从而促进急性髓系白血病发生，并验证了靶向该轴的抑制剂TCMCB07的治疗效果 | 首次通过整合双样本孟德尔随机化、转录组学和单细胞测序鉴定出ATF7IP2为苯相关急性髓系白血病的关键驱动基因，揭示其作为转录代谢枢纽通过重编程谷氨酸代谢驱动HSC向pre-LSC恶性分化，并开发靶向该轴的肽模拟抑制剂TCMCB07 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 识别苯相关急性髓系白血病的关键驱动因子并阐明其致病机制 | 苯暴露相关的急性髓系白血病患者样本、细胞模型、小鼠模型 | 机器学习、数字病理学 | 急性髓系白血病 | 孟德尔随机化、转录组学、单细胞RNA测序、代谢组学 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 925 | 2026-09-16 |
IL-1A promotes inflammation while safeguarding epithelial basal cell identity and barrier function
2026-Aug-20, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.08.003
PMID:42624292
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序结合空间表征和功能分析，揭示了人类食管上皮祖细胞的异质性，并阐明了IL-1A在嗜酸性食管炎中协调上皮炎症与再生反应的分子机制 | 利用NGFR和P73定义了跨越乳头区和乳头间区的人类基底祖细胞层，揭示了乳头区基底祖细胞中YAP信号的空间异质性，发现了IL-1A介导的上皮顶端到基底信号轴，并证明IL-1A信号结局由周围炎症环境决定 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 表征人类食管上皮祖细胞异质性，鉴定调控嗜酸性食管炎中上皮再生的分子机制 | 人类食管上皮祖细胞、原代人食管类器官、嗜酸性食管炎患者样本 | 单细胞组学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序、空间表征、类器官培养、气液界面培养 | NA | 单细胞转录组数据、空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 926 | 2026-09-16 |
Spatially distinct macrophage subsets drive myofibroblast heterogeneity and maladaptive fibrosis in lupus nephritis
2026-Aug-13, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2026.07.014
PMID:42595656
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了狼疮肾炎中巨噬细胞与成纤维细胞之间的空间异质性相互作用网络，并在小鼠模型中验证了其功能后果 | 首次在狼疮肾炎中识别出两种空间分布不同的肌成纤维细胞亚群（Myofib1位于肾小管间质，Myofib2位于肾小球），并揭示了它们分别与不同巨噬细胞亚群的相互作用模式，阐明了Spp1/整合素、Sema4/PlexinB和NAMPT/INSR等关键配体-受体信号通路介导的纤维炎症回路 | 空间转录组学仅纳入6例患者活检样本，样本量较小；机制验证主要基于小鼠模型，与人类疾病的完全转化性仍需进一步验证 | 探究人类狼疮肾炎中巨噬细胞与成纤维细胞相互作用的图谱，并在小鼠模型中验证这些发现，以寻找预防慢性肾脏损伤的治疗靶点 | 156例人类狼疮肾炎活检样本、30例健康对照以及6例狼疮肾炎患者的空间转录组学活检样本，并辅以小鼠模型体外共培养研究 | 数字病理学 | 狼疮肾炎 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、体外共培养实验 | NA | 图像、文本 | 156例人类狼疮肾炎活检样本、30例健康对照、6例空间转录组学活检样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞捕获平台用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 927 | 2026-09-16 |
A microphysiological system HHT-on-a-chip platform recapitulates patient vascular lesions
2026-Aug-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76448-w
PMID:42722664
|
研究论文 | 该研究开发了一种基于全人源细胞的微生理系统芯片平台，通过诱导性shRNA调控原代内皮细胞中的Alk1表达，再现遗传性出血性毛细血管扩张症患者的血管病变 | 首次构建了HHT-on-a-chip微生理系统，利用诱导性shRNA在原代内皮细胞中调控内源性Alk1，仅需亚群Alk1缺陷内皮细胞即可触发血管畸形，并通过单细胞转录组学揭示了微血管修剪和退化以及PDGFB缺失参与病变机制 | 未明确提及 | 构建能忠实再现HHT患者血管病变的芯片模型，以更好地理解HHT疾病生物学并筛选潜在新药 | 遗传性出血性毛细血管扩张症（HHT）患者血管病变，原代内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | 微生理系统芯片模型 | 图像 | 未明确提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 928 | 2026-09-16 |
Immune Circuit Rewiring by HDAC Inhibition Enables Response to Dual Checkpoint Blockade in Metastatic Breast Cancer
2026-Aug-11, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-26-1086
PMID:42578817
|
研究论文 | 结合实验、临床数据与理论模型，研究HDAC抑制剂entinostat联合抗PD-1和抗CTLA-4治疗转移性乳腺癌的肿瘤微环境重塑机制 | 通过知识引导的单细胞RNA测序亚聚类和细胞回路分析，识别了39种细胞状态及其显著相互作用，并结合空间蛋白质组学和流式细胞术验证，揭示B细胞在治疗响应中的必要性以及ICAM1和IFNγ通路的关键作用 | 研究主要基于小鼠乳腺至肺转移模型，人体样本验证规模有限，数学模型的预测能力需进一步实验验证 | 阐明HDAC抑制剂联合双重免疫检查点阻断治疗转移性乳腺癌的响应机制，为开发免疫治疗组合策略提供框架 | 转移性乳腺癌患者活检和血液样本，以及小鼠乳腺至肺转移模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学, 流式细胞术 | 数学建模 | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学, 流式细胞术 | NA | NA |
| 929 | 2026-09-16 |
Th17 effector cytokines induce shared and distinct microglial and endothelial cell responses in a mouse model for post-streptococcal encephalitis
2026-Aug-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76232-w
PMID:42717209
|
研究论文 | 本研究利用小鼠遗传学、单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了A组链球菌感染如何通过Th17效应细胞因子诱导小胶质细胞和脑内皮细胞的共享及特异性反应，从而导致血脑屏障功能障碍和神经炎症 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学联合分析，揭示了GAS感染后小胶质细胞IL-17A-IL17RA信号通路在血脑屏障功能障碍和神经炎症中的潜在介导作用，并发现GAS响应性小胶质细胞定位于浸润性CD4 T细胞附近 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中验证；GM-CSF缺失仅部分减少小胶质细胞趋化因子表达且未恢复血脑屏障完整性；IL-17A中和仅部分挽救血脑屏障转录变化而非功能障碍 | 探究外周A组链球菌感染与脑功能障碍之间的机制联系，特别是Th17效应细胞因子如何介导小胶质细胞和脑内皮细胞的反应 | 小鼠模型中的小胶质细胞、脑内皮细胞（BECs）、CD4 T细胞以及受影响的链球菌感染患者血清 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 神经免疫学 | 链球菌感染后脑炎, 神经精神障碍, 神经炎症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 小鼠遗传学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 930 | 2026-09-16 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals immune remodeling in bone marrow during aged sepsis
2026-Aug, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01966-2
PMID:41225282
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析年轻和老年脓毒症小鼠骨髓免疫细胞的变化，揭示老年脓毒症免疫功能障碍的机制 | 首次在老年脓毒症中构建骨髓免疫细胞的单细胞图谱，发现HSC扩增及Lgals9-Cd44介导的细胞间通讯受损是免疫衰竭的关键机制，并验证激活该轴可部分恢复髓系细胞迁移 | 样本量较小（每组2-3只小鼠），Lgals9-Cd44轴的治疗潜力仅在临床前模型中初步验证，临床可行性和安全性尚待证实 | 探究衰老导致脓毒症免疫功能障碍的骨髓细胞机制 | 年轻和老年雄性小鼠的骨髓免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10个骨髓样本（Y-Sham n=2, Y-CLP n=3, A-Sham n=2, A-CLP n=3） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 931 | 2026-09-16 |
Integrative transcriptomics and scpagwas analysis predicts immune-related markers of preeclampsia
2026-08, Journal of reproductive immunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jri.2026.104935
PMID:42442143
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序和bulk转录组数据，结合scPagwas分析，鉴定子痫前期胎盘中与免疫相关的关键基因和巨噬细胞调控机制 | 首次将scPagwas算法应用于子痫前期研究，整合单细胞和bulk转录组数据，发现巨噬细胞与子痫前期遗传关联最强，并鉴定出ARL4C、SLC16A10和DAB2三个核心基因作为巨噬细胞极化的关键调控因子 | 单细胞RNA测序样本量较小（n=4），需要在更大规模队列中验证核心基因和候选药物的临床价值 | 利用整合转录组学和scPagwas分析鉴定子痫前期胎盘中与免疫相关的标志物 | 子痫前期患者胎盘组织 | 机器学习 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | LASSO、随机森林 | 基因表达数据 | 单细胞RNA测序4例（GSE173193），bulk转录组157例（GSE75010） | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 932 | 2026-09-16 |
The Impact of Ageing on Skeletal Muscle: Roles of Mitochondrial Dysregulation, Systemic Communication, and Exercise
2026-08, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70212
PMID:42503896
|
综述 | 本文综述了衰老过程中线粒体功能失调、局部及全身细胞环境变化对骨骼肌再生能力下降和肌少症的影响，并探讨了运动干预及新兴技术在该领域的应用前景 | 整合了从细胞自主性代谢失调到局部及全身细胞环境老化的多层次机制，强调了运动对肌肉组织健康的重要作用，并指出人类肌肉图谱和空间转录组学等新兴技术将有助于发现新的生物标志物和治疗靶点 | 作为综述性文章，未提供原始实验数据，对具体分子机制和信号通路的阐述可能不够深入，且未对现有研究的异质性和争议进行系统性的荟萃分析 | 总结肌少症和衰老过程中肌肉修复效率低下的相关机制，从细胞自主性代谢失调到局部及全身细胞环境的老化变化，并探讨运动干预和新兴技术在防治肌少症中的潜力 | 衰老骨骼肌、肌少症、肌肉干细胞、细胞微环境 | NA | 肌少症 | 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 933 | 2026-09-16 |
Multiomics Profiling Identifies Blood-Based Diagnostic Markers for Sepsis
2026-08, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70213
PMID:42530023
|
研究论文 | 该研究通过整合大规模转录组分析与机器学习算法，识别出脓毒症的三基因诊断标志物（TLR5、HMGB2和C19orf59），并通过单细胞RNA测序、小鼠模型和临床血清验证其诊断与严重程度分层价值 | 发现了跨临床严重程度分层均保持稳定诊断效能的三基因标志物组合（TLR5、HMGB2和C19orf59），并通过单细胞RNA测序将其定位至髓系免疫细胞区室，同时利用严格时间匹配的假手术对照CLP小鼠模型和溶剂对照体外模型消除了手术或环境应激的混杂效应 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 识别和验证脓毒症的血液诊断标志物，用于早期诊断和风险分层 | 脓毒症患者、CLP小鼠模型、LPS刺激的体外细胞模型 | 机器学习 | 脓毒症 | 转录组分析、单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 934 | 2026-09-16 |
Spatial dynamics of viral replication drive biphasic lymphoid activation and systemic alphavirus immune responses
2026-08, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1014509
PMID:42585262
|
研究论文 | 该研究揭示了委内瑞拉马脑炎病毒（VEEV）在淋巴结中的空间复制动态如何驱动双相淋巴激活和全身性α病毒免疫应答 | 结合靶向细胞清除和Visium HD空间转录组学病毒基因定量，首次揭示了VEEV感染引发的时空双相固有免疫应答：初期由淋巴结被膜下窦中树突状细胞和单核/巨噬细胞亚型的病毒复制驱动，后期（16小时感染后）则由非病毒复制的旁观者细胞（包括浆细胞样树突状细胞）主导细胞因子诱导 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类或其他宿主中验证；VEEV突变体的淋巴趋向性可能无法完全代表野生型病毒；空间转录组学的分辨率可能限制了对单个细胞水平病毒复制动态的精确追踪 | 阐明淋巴组织中病毒-细胞相互作用和特定宿主信号通路如何启动全身性I型干扰素和促炎细胞因子应答，以及这些应答与病毒淋巴组织趋向性的关联 | 具有明确淋巴结趋向性的委内瑞拉马脑炎病毒（VEEV）突变体及感染的小鼠模型 | 空间转录组学、免疫学、病毒学 | α病毒感染、委内瑞拉马脑炎 | 空间转录组学、靶向细胞清除、病毒基因定量 | NA | 图像、文本（空间转录组数据） | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium HD | Visium HD空间转录组学用于病毒基因定量 |
| 935 | 2026-09-16 |
Single-cell immune atlas of mouse testes unveils metabolic reprogramming of FOLR2 + macrophages in orchestrating testicular immunity during aging
2026-Aug, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-026-02109-x
PMID:41618065
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了年轻和年老小鼠睾丸免疫细胞图谱，揭示了FOLR2+巨噬细胞在衰老过程中代谢重编程并调控睾丸免疫的机制 | 首次构建了小鼠睾丸衰老的全面免疫细胞图谱，发现了FOLR2+常驻巨噬细胞向促炎状态的表型转变，并揭示了线粒体代谢功能障碍（特别是IDH2抑制）是FOLR2+巨噬细胞激活的关键驱动因素，以及CCL8-CCR2/CCR5轴在招募单核细胞和CD8+ T细胞中的作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类睾丸衰老中验证相关发现；样本量相对有限（6622个免疫细胞） | 阐明睾丸衰老过程中免疫细胞的动态变化和功能，特别是FOLR2+巨噬细胞在维持睾丸免疫稳态中的作用 | 年轻和年老小鼠睾丸中的CD45+免疫细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | 6622个免疫细胞（包括巨噬细胞、单核细胞和T细胞），来自年轻和年老小鼠睾丸 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 936 | 2026-09-16 |
Time-dependent effects of rapid-acting antidepressants in iPSC-derived neurons from treatment-resistant depression and healthy volunteers
2026-Jul-24, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-026-03768-0
PMID:42498781
|
研究论文 | 该研究利用来自难治性抑郁症患者和健康志愿者的iPSC衍生的皮层神经元，评估了多种快速起效抗抑郁药在6小时和24小时处理后的转录组效应 | 首次在iPSC衍生神经元模型中并行评估多种候选快速起效抗抑郁药，并结合单细胞RNA测序揭示了(2R,6R)-HNK的细胞类型特异性效应，且与氯胺酮治疗健康志愿者的脑脊液蛋白质组学结果进行了验证 | 摘要中未明确提及样本量有限、iPSC模型无法完全模拟体内复杂环境、仅评估了6小时和24小时两个时间点、以及脑脊液蛋白质组学验证仅针对氯胺酮 | 探究快速起效抗抑郁药在人类皮层神经元中的分子机制及其治疗效果的转化相关性 | 来自难治性抑郁症患者和健康志愿者的iPSC衍生成熟皮层样神经元 | 数字病理学 | 难治性抑郁症 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 蛋白质印迹, 免疫细胞化学, 脑脊液蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像 | 来自难治性抑郁症患者和健康志愿者的iPSC衍生神经元，具体数量未在摘要中说明 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 937 | 2026-09-16 |
GEM-GPT Enables Personalized Cell Type-Resolved Therapeutic Design for Systems Pharmacology
2026-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.17.739269
PMID:42539229
|
研究论文 | 本文提出了GEM-GPT，一个基于转录组的分子生成框架，通过耦合单细胞RNA测序基础模型与分子GPT模型，设计能够逆转细胞类型特异性疾病状态的个性化治疗化合物 | 首次将单细胞RNA测序基础模型与分子GPT模型进行生物学启发的深度融合，实现细胞类型特异性化学-基因相互作用的建模，能够为不同细胞类型生成不同分子，并稳健泛化到未见过的细胞类型 | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 开发面向系统药理学的生成式AI工具，实现个性化、细胞类型分辨的治疗分子设计，以克服传统一药一靶点范式的局限性 | 慢性及全身性疾病（以阿片类药物使用障碍为案例研究），涉及不同细胞类型的疾病状态 | 机器学习 | 阿片类药物使用障碍 | 单细胞RNA测序 | GPT、基础模型 | 文本、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 938 | 2026-09-16 |
Neonatal hyperoxia promotes macrophage senescence and lung injury via a p38MAPK-dependent secretome
2026-Jul-17, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1093/ajrcmb/aanag141
PMID:42473130
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学揭示了新生儿高氧通过糖酵解重编程诱导肺泡巨噬细胞衰老，并通过p38MAPK依赖性分泌组导致肺损伤的机制 | 首次阐明高氧通过增加糖酵解诱导肺泡巨噬细胞衰老，并证明衰老肺泡巨噬细胞的分泌组通过p38MAPK依赖性机制驱动肺损伤，提出抑制巨噬细胞糖酵解和p38MAPK通路作为预防肺损伤的新治疗策略 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究高氧诱导肺泡巨噬细胞衰老的机制，以及衰老/高氧对肺泡巨噬细胞功能的影响和其分泌组在肺损伤中的作用 | 高氧暴露的新生小鼠及肺泡巨噬细胞 | 机器学习 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 939 | 2026-09-16 |
Concurrent genetic and non-genetic resistance mechanisms to KRAS inhibition in colorectal cancer
2026-Jul-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.04.009
PMID:42167227
|
研究论文 | 该研究通过靶向外显子组测序和空间转录组学，分析了接受KRAS和EGFR抑制剂联合治疗的结直肠癌患者活检样本，揭示了KRAS抑制耐药中遗传性和非遗传性机制并存的现象 | 结合靶向外显子组测序与空间转录组学，在患者匹配的结直肠癌活检样本中同时解析遗传性和非遗传性耐药机制，发现间充质、YAP和胎儿样转录特征在耐药肿瘤中占主导，而炎症程序在治疗早期即被诱导，并通过单细胞空间分析揭示了肿瘤内异质性及不同区域的多样化适应状态，最终鉴定TBK1为消除炎症适应期并增强KRAS抑制响应的靶点 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探索结直肠癌中KRAS抑制剂耐药的机制 | 接受KRAS和EGFR抑制剂联合治疗的结直肠癌患者的配对活检样本、人类和小鼠类器官模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 靶向外显子组测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 靶向外显子组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 940 | 2026-09-16 |
Intervening in p53-Induced Death Domain Protein 1 to Decrease Regulatory T Cell Recruitment Boosts the Effectiveness of Radiofrequency Ablation Combined With Anti-Programmed Cell Death Protein-1 Therapy in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jul-03, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101844
PMID:42398821
|
研究论文 | 该研究揭示了p53诱导死亡结构域蛋白1（PIDD1）在射频消融不完全后通过促进调节性T细胞招募驱动肝细胞癌复发中的关键作用，并证明沉默PIDD1可增强射频消融联合抗PD-1治疗的疗效 | 首次鉴定PIDD1为连接射频消融后残留肿瘤细胞与免疫抑制微环境的肿瘤内在分子纽带，阐明PIDD1通过caspase-2/MDM2轴增强p53表达、促进TGF-β1分泌、驱动T细胞向调节性T细胞分化的机制，并提出射频消融联合抗PD-1治疗前沉默PIDD1的新策略 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 阐明射频消融不完全消融后残留肿瘤细胞与免疫抑制微环境之间的肿瘤内在分子联系，以改善肝细胞癌射频消融后的治疗结局 | 肝细胞癌患者（接受射频消融或肝切除治疗）及完全/不完全射频消融小鼠模型 | 数字病理学 | 肝癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA-seq | NA | NA |