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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2026-01-26 |
Single-cell dissection of CD8+ T cell-driven immune dysregulation in type 1 diabetes mellitus: Mechanistic links to diabetic foot pathogenesis
2026-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2025.110646
PMID:41308942
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了1型糖尿病患者外周血单个核细胞中CD8+ T细胞驱动的免疫失调机制,并探讨了其与糖尿病足等并发症的潜在联系 | 首次在1型糖尿病患者中发现了一个新的耗竭性CD4+ T细胞亚群(PDCD1+, LAG3+),并揭示了GALECTIN-CD44信号轴在驱动单核细胞/树突状细胞与CD8+ T/NK细胞间促炎性串扰中的核心作用 | 研究样本量相对有限(共77例),且为横断面研究,无法确定观察到的免疫失调是疾病的原因还是结果 | 阐明1型糖尿病进展的细胞网络及其与糖尿病并发症的潜在联系 | 1型糖尿病(T1DM)患者的外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 无监督聚类分析,细胞间通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 46名3期1型糖尿病患者和31名匹配对照者的外周血单个核细胞,共87,542个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 922 | 2026-01-26 |
Single-cell sequencing reveals APOE deletion alleviates adipose wasting in cancer cachexia via macrophage repolarization
2026-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2025.110660
PMID:41453629
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了载脂蛋白E(ApoE)缺失通过巨噬细胞重编程缓解癌症恶病质中脂肪组织消耗的机制 | 首次在癌症恶病质背景下,通过单细胞测序技术揭示了ApoE调控脂肪组织稳态的新机制,特别是发现了Cbr2+巨噬细胞亚群向M2表型转化的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;未深入探讨ApoE调控巨噬细胞极化的具体分子通路 | 探究ApoE在癌症恶病质脂肪组织重塑中的作用机制 | 癌症恶病质患者样本、小鼠模型、脂肪细胞 | 单细胞组学 | 癌症恶病质 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、免疫荧光图像 | 未明确样本数量,包括恶病质患者血浆/皮下脂肪样本、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 923 | 2026-01-26 |
Research progress on immunotherapeutics for triple-negative breast cancer from a single-cell perspective
2026-Feb, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.105111
PMID:41485631
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综述 | 本文从单细胞视角综述了三阴性乳腺癌免疫治疗的研究进展,整合了单细胞多组学技术与药理学的最新发现 | 从单细胞多组学(scRNA-seq、scATAC-seq、空间转录组学)的独特视角,系统整合了肿瘤微环境重塑机制与免疫治疗开发,提出了单细胞指导的免疫治疗创新策略 | 作为综述文章,主要基于现有文献进行总结,未涉及原始实验数据验证 | 总结三阴性乳腺癌免疫治疗的最新进展,探讨肿瘤微环境对免疫治疗耐药性的影响,并展望单细胞技术指导下的精准治疗策略 | 三阴性乳腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)、空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 924 | 2026-01-26 |
A PNPLA3-NACC1-RIPK3 pathway mediates macrophage necroptosis and inflammation in MASLD
2026-Feb-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000890
PMID:41564367
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研究论文 | 本研究揭示PNPLA3 148M变异通过巨噬细胞特异性NF-κB-NACC1-RIPK3轴促进巨噬细胞坏死性凋亡和炎症信号,从而加剧肝细胞脂肪变性和肝星状细胞活化 | 首次阐明PNPLA3 148M变异在巨噬细胞中的特异性作用机制,并发现NACC1作为RIPK3的关键转录调节因子 | 研究主要基于体外诱导多能干细胞衍生的多细胞肝脏培养模型,体内验证和临床转化仍需进一步研究 | 探究PNPLA3 148M变异如何改变巨噬细胞行为及多细胞肝脏病理在脂毒性应激下的作用 | 人诱导多能干细胞衍生的多细胞肝脏培养(包含肝细胞、肝星状细胞和同基因巨噬细胞) | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 925 | 2026-01-26 |
Exploring key genes in NAFLD linked to glutamine metabolism: A comprehensive analysis combining multi-omics, machine learning and SHAP
2026-Feb, Asia Pacific journal of clinical nutrition
IF:1.3Q4
DOI:10.6133/apjcn.202602_35(1).0008
PMID:41565234
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研究论文 | 本研究通过整合多组学、机器学习和SHAP分析,探索与非酒精性脂肪肝病相关的谷氨酰胺代谢关键基因 | 结合孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序和多种机器学习算法,识别与NAFLD风险相关的代谢物和基因,并利用SHAP方法解释模型贡献 | 未明确说明样本来源和具体数量,可能限制结果的普适性 | 探索NAFLD的发病机制,寻找新的诊断和治疗靶点 | 非酒精性脂肪肝病相关的血清代谢物和基因 | 机器学习 | 非酒精性脂肪肝病 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、GO和KEGG富集分析、LASSO回归、机器学习算法(Catboost、NGboost、XGboost)、SHAP分析 | Catboost、NGboost、XGboost | 多组学数据(包括代谢组和转录组) | 涉及1,400种血清代谢物和两个NAFLD数据集,具体样本数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 926 | 2026-01-26 |
Spatial Profiling Reveals Distinct Molecular and Immune Evolution of Mouse Lung Adenocarcinoma Precancers with or Without Carcinogen Exposure
2026-Jan-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512597
PMID:41580978
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研究论文 | 本研究整合全外显子组测序、成像质谱流式细胞术和空间转录组学,探究了两种小鼠肺腺癌前体模型的分子演化和免疫反应 | 首次结合空间技术与遗传分析,系统比较了遗传工程和致癌物诱导的肺腺癌前体模型在分子和免疫演化上的差异 | 研究基于小鼠模型,结果向人类癌症的转化需进一步验证 | 探究肺腺癌前体在有无致癌物暴露下的分子和免疫演化差异 | 小鼠肺腺癌前体模型(129S4 K 遗传工程模型和 129S4 U 致癌物诱导模型) | 数字病理学 | 肺癌 | 全外显子组测序, 成像质谱流式细胞术, 空间转录组学 | NA | 空间单细胞数据, 空间转录组数据, 基因组数据 | 141只小鼠中的156个病灶,包括284个IMC感兴趣区域和51,531个空间转录组点 | NA | 空间转录组学, 成像质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 927 | 2026-01-26 |
Research on the molecular mechanism of celastrol targeting CTNNB1/STAT3 to inhibit uveal melanoma based on network pharmacology and multi-omics analysis
2026-Jan-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37061-5
PMID:41580492
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研究论文 | 本研究结合网络药理学、多组学分析和机器学习,揭示了雷公藤红素通过靶向CTNNB1/STAT3信号通路抑制葡萄膜黑色素瘤的分子机制 | 首次整合网络药理学、转录组学、机器学习、免疫浸润分析、单细胞RNA测序及分子对接/动力学模拟,系统阐明雷公藤红素在葡萄膜黑色素瘤中的多靶点作用机制 | 研究主要基于细胞系实验,缺乏体内动物模型验证;临床样本验证不足;未深入探讨CTNNB1与STAT3之间的交叉调控网络 | 阐明雷公藤红素抑制葡萄膜黑色素瘤的分子作用机制 | 葡萄膜黑色素瘤细胞系(B16-F10、C918)及相关分子靶点 | 多组学整合分析 | 葡萄膜黑色素瘤 | 网络药理学、转录组学、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、qPCR、Western blot | 机器学习算法(未指定具体模型) | 转录组数据、单细胞RNA-seq数据、分子结构数据 | 两种细胞系(B16-F10、C918) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 928 | 2026-01-26 |
Single-cell transcriptomics uncover RNF130-mediated TNF-α pathway activation and worenine synergy with paclitaxel in breast cancer
2026-Jan-24, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-026-02057-5
PMID:41580768
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了RNF130在乳腺癌中通过激活TNF-α通路促进肿瘤进展,并发现中药成分Worenine与紫杉醇具有协同抗肿瘤作用 | 首次系统性地揭示了RNF130在TNBC中的功能机制,发现其通过TNF-α通路调控肿瘤免疫微环境,并首次报道了Worenine对RNF130的靶向抑制作用及其与紫杉醇的协同效应 | 研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型,缺乏大规模临床验证;Worenine的具体作用机制仍需进一步阐明 | 探究RNF130在三阴性乳腺癌中的作用机制及其作为治疗靶点的潜力 | 三阴性乳腺癌细胞、小鼠模型、单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组数据分析、体外细胞实验、体内小鼠模型 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的大规模转录组数据,多个乳腺癌样本及其肝转移样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 929 | 2026-01-26 |
HMGB1 affects the progression of neurofibromatosis type 1-associated malignant peripheral nerve sheath tumors through E2F2
2026-Jan-24, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04165-3
PMID:41580779
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研究论文 | 本研究揭示了HMGB1通过直接转录激活E2F2,驱动神经纤维瘤病1型相关恶性外周神经鞘瘤的细胞周期进程和肿瘤恶性进展 | 首次在单细胞水平上整合分析NF1-MPNST和PNF组织,明确了HMGB1在恶性CNV-high亚群中的特异性上调及其与患者不良预后的关联,并阐明了HMGB1通过直接结合并激活E2F2启动子来驱动G1/S期转换的新机制 | 研究主要基于患者来源的组织和细胞系以及异种移植小鼠模型,尚未在更复杂的体内微环境或遗传工程小鼠模型中进行验证,临床转化潜力有待进一步探索 | 探究HMGB1在神经纤维瘤病1型相关恶性外周神经鞘瘤进展中的功能作用和分子机制 | 患者来源的NF1-MPNST和丛状神经纤维瘤组织、NF1细胞系、异种移植小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 神经纤维瘤病1型相关恶性外周神经鞘瘤 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、CUT&Tag、ChIP-qPCR、qPCR、Western blot | NA | RNA测序数据、蛋白质印迹数据、染色质免疫沉淀数据 | 患者来源的NF1-MPNST和PNF组织(具体数量未明确说明)、NF1细胞系、异种移植小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 930 | 2026-01-26 |
Single-cell sequencing analysis and machine learning model reveal aberrant TIM-3 expression in microglia during Alzheimer's disease progression
2026-Jan-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07621-w
PMID:41580850
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 931 | 2026-01-26 |
Decoding the heterogeneity of human undifferentiated spermatogonia reveals RAS-dependent regulation of stem cell fate
2026-Jan-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116868
PMID:41579373
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和抗体筛选,解码了人类未分化精原细胞的异质性,揭示了RAS信号通路在调控干细胞命运中的作用 | 首次系统鉴定了人类未分化精原细胞的四个标志物(PIWIL4、EGR4、PPP1R36、NANOS3)及其功能特征,并发现RAS信号通路在维持原始未分化精原细胞状态中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和转录组分析,在体内功能验证和临床应用转化方面仍需进一步探索 | 阐明人类未分化精原细胞的异质性及其调控机制 | 人类未分化精原细胞 | 生殖生物学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序、抗体筛选、比较转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 932 | 2026-01-26 |
Activated CD38+ mast cells promote gastric cancer progression by suppressing CD8+ T cell cytotoxic activity through adenosine metabolism
2026-Jan-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116863
PMID:41579372
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了幽门螺杆菌感染下胃癌进展过程中胃黏膜微环境的动态变化,并验证了活化的肥大细胞通过腺苷代谢抑制CD8+ T细胞毒性促进胃癌进展的机制 | 首次在幽门螺杆菌相关胃癌进展的四个典型阶段进行单细胞RNA测序,系统描绘了细胞景观和动态变化,并发现活化的肥大细胞通过CD38和COX2上调腺苷和前列腺素E分泌,进而抑制CD8+ T细胞毒性的新机制 | 样本量相对较小(21个胃黏膜样本),且研究主要基于单细胞转录组数据,缺乏蛋白质水平或功能实验的全面验证 | 探究幽门螺杆菌感染下胃癌进展过程中胃黏膜微环境的动态变化及免疫调控机制 | 幽门螺杆菌感染患者的胃黏膜组织,涵盖胃癌进展的四个典型阶段 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 21个胃黏膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 933 | 2026-01-26 |
Automatic cell type identification methods for single-cell RNA sequencing based on coordinate convolutional neural network
2026-Jan-22, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文提出了一种基于坐标卷积神经网络(CoordConv)的单细胞RNA测序数据自动细胞类型识别新方法BP-Coord,通过引入坐标信息和双三次插值上采样层提升模型性能 | 提出BP-Coord方法,首次将坐标信息作为额外通道融入卷积神经网络,并引入双三次插值上采样层,有效解决了传统CNN在scRNA-seq数据中因平移不变性导致的细胞类型误分类问题 | 未在更多样化的单细胞多组学数据集上进行验证,且未与其他新兴的深度学习架构(如Transformer)进行系统比较 | 开发更高效准确的单细胞RNA测序数据自动细胞类型识别方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络(CNN)、坐标卷积神经网络(CoordConv) | 基因表达矩阵(可视为二维数据) | 五个公共scRNA-seq基准数据集(包括大规模PBMC数据集) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 934 | 2026-01-26 |
Bimekizumab long-term response in psoriasis: Mechanistic insights into efficacy level and durability
2026-Jan-22, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.12.1013
PMID:41580158
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研究论文 | 本文评估了bimekizumab在银屑病患者中长达4年的临床反应持久性,并探讨了其分子机制 | 通过单细胞RNA测序揭示了病变皮肤中表达IL17A和/或IL17F的组织驻留记忆T细胞亚群,并发现其与bimekizumab疗效持久性相关 | 研究基于回顾性临床数据整合和转录组分析,可能受样本选择和测序技术限制 | 评估bimekizumab治疗银屑病的长期疗效持久性并探究其分子机制 | 银屑病患者 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | 503名患者(来自临床试验),另加三个独立单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 935 | 2026-01-26 |
A Nanovesicle-Sericin-Based Hydrogel Scaffold for RGC Survival in Glaucoma via Regulation of Microglial Polarization
2026-Jan-21, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c18589
PMID:41490471
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研究论文 | 本研究开发了一种负载干细胞和纳米囊泡的丝胶基水凝胶支架,旨在通过调节小胶质细胞极化来促进青光眼模型中视网膜神经节细胞的存活 | 开发了一种新型的、集成了源自牙周膜干细胞的纳米囊泡(负载原花青素)的丝胶基光交联水凝胶支架,用于协同调节神经炎症微环境 | NA | 开发一种生物材料支架,以改善青光眼病理条件下视网膜神经节细胞的存活 | 视网膜神经节细胞、小胶质细胞、牙周膜干细胞 | 生物材料与组织工程 | 青光眼 | 单细胞RNA测序、RNA测序、超速离心、脂质体挤出 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 936 | 2026-01-26 |
Integrative transcriptomic profiling reveals subtype-specific therapeutic vulnerabilities and resistance mechanisms in prostate cancer
2026-Jan-21, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15357-5
PMID:41566241
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研究论文 | 本研究通过整合转录组数据和临床分析,揭示了前列腺癌中雄激素受体依赖性的异质性,并识别了与治疗抵抗相关的分子亚型及关键耐药驱动因子MCL1 | 结合CRISPR-Cas9筛选、多队列转录组整合及空间与单细胞测序,系统解析了前列腺癌的AR依赖性和耐药机制,并发现了具有独立预后价值的侵袭性分子亚型(Cluster 3) | 研究主要基于细胞系和回顾性队列数据,缺乏前瞻性临床验证,且样本来源可能受限于特定平台或技术 | 解析前列腺癌中雄激素受体依赖性和耐药机制,以识别亚型特异性治疗靶点 | 前列腺癌细胞系(如VCaP、LNCaP、DU145等)、TCGA-PRAD、Changhai和DKFZ队列的临床样本、原发性和转移性肿瘤组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | CRISPR-Cas9筛选、RNA测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 | 共识聚类、模糊聚类 | 转录组数据、临床数据 | 多个细胞系及TCGA-PRAD、Changhai、DKFZ队列的样本(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 937 | 2026-01-23 |
Single-cell transcriptome analysis reveals mechanisms by which hippocampal deep brain stimulation promotes neurorepair and microglial subpopulation remodeling in ischemic stroke
2026-Jan-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07388-0
PMID:41566372
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 938 | 2026-01-26 |
APM⁺ macrophages associated with plaque vulnerability via MIF-CD74 signaling: a multi-omics study
2026-Jan-21, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00869-9
PMID:41566509
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了与斑块脆弱性相关的APM⁺巨噬细胞及其通过MIF-CD74信号通路的作用机制 | 首次结合代谢组学、单细胞RNA测序和空间转录组学,系统性地解析了APM⁺巨噬细胞在动脉粥样硬化斑块不稳定中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,临床转化需进一步验证 | 探究动脉粥样硬化与缺血性心肌病共享的代谢失调机制及斑块不稳定性的细胞基础 | 动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 代谢组学, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习 | 代谢组数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 涉及ApoE-/-小鼠模型及多个队列的人类样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 939 | 2026-01-26 |
ELK1 promotes the progress of myeloid leukemia by hindering the differentiation of neutrophils
2026-Jan-20, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00742-4
PMID:41559783
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研究论文 | 本研究探讨了ELK1在急性髓系白血病(AML)进展中的作用,发现其通过阻碍中性粒细胞分化促进疾病发展 | 首次揭示ELK1通过损害造血干细胞干性并阻碍中性粒细胞分化来加速KrasG12D诱导的髓系白血病发展,并证明抑制ELK1可促进白血病细胞向成熟中性粒细胞分化 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人类临床试验中验证ELK1抑制剂的治疗效果 | 探索ELK1在AML发病机制中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 | 小鼠模型(条件性Elk1和KrasG12D表达小鼠)、骨髓移植样本、未分化白血病细胞 | 分子生物学与血液肿瘤学 | 急性髓系白血病 | 条件性基因表达、骨髓移植、bulk-cell RNA测序、单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞表型数据 | 多种转基因小鼠品系及体外培养的白血病细胞 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 940 | 2026-01-26 |
Multi-Scale Transcriptomics Redefining the Tumor Immune Microenvironment
2026-Jan-15, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech15010007
PMID:41562697
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综述 | 本文综述了批量、单细胞和空间转录组学方法在肿瘤免疫微环境研究中的原理、应用和局限性,并强调了整合分析的新兴策略 | 提出了多尺度转录组学框架,整合批量、单细胞和空间转录组数据,以更详细和机制性地理解肿瘤免疫微环境 | 综述文章未进行原始数据分析,主要总结现有方法,可能未涵盖最新技术进展 | 重新定义肿瘤免疫微环境,以支持更精确的生物技术和免疫治疗策略的开发 | 肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 肿瘤 | 高通量测序技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |