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当前共找到 3630 篇文献，本页显示第 901 - 920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2026-03-16 |
The presence of CD11c+ B cells with potent effector memory phenotype in lung adenocarcinoma correlates with overall patient survival
2026-Feb-13, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0635
PMID:41686183
|
研究论文 | 本研究通过分析肿瘤浸润B淋巴细胞（TIL-Bs）在肺腺癌（LUAD）中的分布和功能，发现CD11c+ B细胞的存在与患者总体生存率相关，并探讨了其作为抗癌治疗靶点或预后生物标志物的潜力 | 首次在肺腺癌中识别出CD11c+ B细胞作为效应记忆表型的强效亚群，并证明其与患者生存率的相关性独立于CD8+ T细胞浸润，揭示了B细胞在肿瘤免疫中的独特作用机制 | 研究主要基于转录组数据和单细胞测序，缺乏体内功能验证实验，且样本来源局限于治疗初治患者，可能未涵盖治疗后的动态变化 | 探究肿瘤浸润B淋巴细胞在多种癌症中的预后价值，特别关注肺腺癌中CD11c+ B细胞的表型、功能及其与患者生存的关系 | 肺腺癌（LUAD）患者的肿瘤组织、正常组织及血液样本，以及来自癌症基因组图谱（TCGA）和基因组织表达（GTEx）的转录组数据 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、转录组数据分析 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 | 8,720个治疗初治患者样本（来自TCGA和GTEx数据库），包括15种不同肿瘤类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 902 | 2026-03-16 |
Integrative transcriptomic and machine learning framework reveals candidate genes and potential mechanisms of aflatoxin B1 exposure in breast cancer
2026-Feb-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39844-2
PMID:41688730
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学和机器学习框架，揭示了黄曲霉毒素B1暴露在乳腺癌中的候选基因和潜在机制 | 采用多组学评估（包括转录组分析、共表达网络建模、免疫景观分析、转录因子调控映射、空间和单细胞转录组学）结合机器学习管道，识别了AFB1暴露与乳腺癌相关的关键基因和生物标志物 | 未明确提及样本大小或实验验证细节，可能依赖于计算分析，需要进一步实验验证机制 | 研究黄曲霉毒素B1如何影响乳腺癌肿瘤生物学，揭示其致癌潜力的分子途径 | 乳腺癌相关基因和生物标志物，特别是AFB1暴露下的转录组变化 | 机器学习 | 乳腺癌 | 转录组分析、共表达网络建模（WGCNA）、免疫景观分析、转录因子调控映射、空间转录组学、单细胞转录组学 | glmBoost, StepGLM, SHAP | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 903 | 2026-03-16 |
A novel nanotherapeutic strategy: rescuing nucleus pulposus cells from fatty acid metabolic disorder and pyroptosis through ACOT13 by Chinese herbal formula nanoparticles
2026-Feb-08, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04104-y
PMID:41656235
|
研究论文 | 本研究探讨了脂肪酸代谢在椎间盘退变中的作用，并开发了一种基于中药配方的自组装纳米颗粒，通过靶向ACOT13来改善代谢紊乱和抑制细胞焦亡，从而缓解椎间盘退变 | 从脂肪酸代谢角度揭示了椎间盘退变的新机制，并首次开发了基于中药配方的自组装纳米颗粒作为靶向治疗策略 | NA | 探究椎间盘退变的病理机制并开发一种新的纳米治疗策略 | 椎间盘髓核细胞 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | 单细胞测序，多组学分析，分子动力学模拟 | NA | 测序数据，模拟数据 | 临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 904 | 2026-03-16 |
Spatial Analysis of Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms Defines a Paradoxical Keratin 17-positive, Low-grade Epithelial Population Harboring Malignant Features
2026-Feb-02, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101749
PMID:41638478
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤（IPMN）中一个表达恶性转录特征的KRT17阳性低级别上皮细胞亚群 | 首次在组织学低级别IPMN中识别出表达KRT17等恶性标志物的上皮细胞亚群，该亚群具有向高级别不典型增生进展的过渡状态特征 | 研究样本数量有限，且主要基于转录组学分析，需要进一步的功能验证和临床随访研究 | 探究IPMN进展过程中的转录变化，识别高风险亚群以提高临床决策准确性 | 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤（IPMN）患者样本，包括低级别不典型增生、高级别不典型增生和IPMN来源的癌组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 包含IPMN疾病全谱的患者样本，具体数量未明确说明，但提及了大型患者队列 | Nanostring | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | Nanostring GeoMx | Nanostring GeoMx空间转录组平台 |
| 905 | 2026-03-16 |
ShinySC: An R/Shiny-based desktop application for seamless analysis of scRNA-Seq data
2026-Feb, Biomedical journal
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.bj.2025.100885
PMID:40609640
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为ShinySC的基于R/Shiny的桌面应用程序，旨在通过直观的图形界面简化单细胞RNA测序数据的全面分析 | 开发了一个统一的、用户友好的、可扩展的平台，支持多种数据格式，集成了多种自动细胞类型注释方法（包括基于参考、基于标记和基于GPT的方法），并允许并排比较和手动标签细化 | 分析性能受标准桌面系统硬件限制（例如，在64GB RAM的系统中，对包含多达200,000个细胞的数据集表现稳健），分析时长取决于具体任务和注释方法 | 为没有编程专业知识的临床医生和研究人员提供一个易于访问的单细胞RNA测序数据分析平台 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 演示分析使用了PBMC和干扰素刺激数据集，基准测试表明可处理多达200,000个细胞的数据集 | 10x Genomics, BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, BD Rhapsody | 支持10x Genomics、BD Rhapsody等多种单细胞测序平台的数据格式 |
| 906 | 2026-03-16 |
Elucidating the mechanistic association of xylene inducing non-small cell lung cancer through network toxicology and molecular docking analysis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0341548
PMID:41824427
|
研究论文 | 本研究结合网络毒理学和分子对接分析，探讨二甲苯暴露与非小细胞肺癌（NSCLC）发生之间的潜在分子机制 | 首次整合网络毒理学、分子对接与单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，系统揭示二甲苯异构体通过影响核心靶点基因（IL1A、H3C13、ITGAM、CCR5、COMT）及相关信号通路（如PI3K-Akt）促进NSCLC发展的分子机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外分子对接模拟，缺乏体内实验或临床样本验证，且二甲苯暴露剂量与基因表达变化的定量关系尚未明确 | 阐明环境二甲苯暴露与非小细胞肺癌（NSCLC）发生之间的分子关联机制 | 二甲苯异构体（邻二甲苯、间二甲苯、对二甲苯）及其潜在作用靶点基因与信号通路 | 计算毒理学 | 肺癌 | 网络毒理学分析、分子对接模拟、单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析 | 分子对接模型、蛋白-配体相互作用模型 | 基因表达数据、蛋白质结构数据、化合物-靶点相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 907 | 2026-03-16 |
From genes to diagnosis: The impact of UNC5B and DOK5 in intracranial aneurysm detection and pathogenesis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0340496
PMID:41824480
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习、免疫浸润分析和单基因测序，探讨UNC5B和DOK5基因在颅内动脉瘤检测和发病机制中的作用 | 首次结合机器学习算法（LASSO、随机森林、SVM-RFE）识别UNC5B和DOK5作为颅内动脉瘤的潜在诊断生物标志物，并通过免疫细胞浸润和单细胞测序分析揭示其与M1巨噬细胞和成纤维细胞的关联 | 研究基于微阵列数据，样本来源和数量未明确说明，可能影响结果的普遍性；外部验证数据集的具体细节未详细描述 | 识别颅内动脉瘤的诊断和治疗相关基因，并阐明其发病机制 | 颅内动脉瘤患者和健康对照的基因表达数据 | 机器学习 | 颅内动脉瘤 | 单基因测序、微阵列分析 | LASSO、随机森林、SVM-RFE | 基因表达数据 | NA | NA | 单基因测序 | NA | NA |
| 908 | 2026-03-15 |
Tanreqing injection regulates Sema7a/Plxnc1 signaling pathway mediated neutrophil extracellular trap formation to alleviate lipopolysaccharide-induced acute lung injury
2026-May-23, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121397
PMID:41713818
|
研究论文 | 本研究探讨了痰热清注射液通过调节Sema7a/Plxnc1信号通路介导的中性粒细胞胞外诱捕网形成，以减轻脂多糖诱导的急性肺损伤 | 首次揭示了痰热清注射液通过抑制Sema7a/Plxnc1信号通路来减少中性粒细胞胞外诱捕网形成，从而缓解急性肺损伤的分子机制 | 研究主要基于大鼠模型和体外实验，其结论在人体中的适用性尚需进一步临床验证 | 评估痰热清注射液对急性肺损伤的治疗效果并阐明其分子机制 | 脂多糖诱导的急性肺损伤大鼠模型 | 药理学与分子生物学 | 急性肺损伤 | 超高效液相色谱-四极杆-电喷雾质谱、代谢组学、RNA测序、单细胞测序、分子对接 | NA | 代谢组学数据、转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞测序、RNA测序 | NA | NA |
| 909 | 2026-03-15 |
The co-action mechanism of agreement prescription "homotherapy for heteropathy" against esophageal, head and neck cancer, and lung cancer: network pharmacology, bioinformatics analysis, and experimental validation
2026-May-23, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121430
PMID:41759559
|
研究论文 | 本研究通过网络药理学、生物信息学分析和实验验证，探讨了协定处方“异病同治”治疗食管癌、头颈癌和肺癌的共同靶点与分子机制 | 首次整合网络药理学、生物信息学（包括单细胞转录组学）和体内外实验，系统揭示了“异病同治”协定处方在多种癌症中的共同作用靶点（如CCR7、VEGFA）和PI3K-AKT通路机制 | 研究主要基于数据库分析和实验模型，未涉及临床患者数据，且具体处方成分未明确列出，可能影响结果的普适性 | 探索中医“异病同治”协定处方治疗食管癌、头颈癌和肺癌的共同分子靶点与作用机制 | 协定处方的活性成分、癌症相关基因、PI3K-AKT信号通路、以及食管癌、头颈癌和肺癌的细胞与动物模型 | 生物信息学 | 肺癌 | 网络药理学、生物信息学分析、分子对接、单细胞转录组学、体内外实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、转录组数据 | 未明确样本数量，但使用了TCGA/UALCAN数据库的泛癌数据及实验模型 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 910 | 2026-03-15 |
From Single-Cell Clusters to Causality: ITCH Engagement for CKD Uncovered by Integrative Analysis of MR and MAGMA
2026-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502366R
PMID:41817007
|
研究论文 | 本研究通过整合人类肾脏单细胞RNA测序数据与遗传关联及因果推断框架，识别并验证了ITCH作为慢性肾脏病（CKD）的潜在易感基因 | 采用供体感知的伪批量策略缓解单细胞数据中的假重复问题，并整合转录组差异表达、孟德尔随机化（MR）和MAGMA基因水平关联分析等多层证据，首次将ITCH确立为CKD的高置信度候选基因 | 研究主要基于已有数据集和计算模拟，实验验证仅在动物模型中进行，尚未在人体中进行功能验证；药物预测部分为假设生成性质，需后续实验测试 | 识别慢性肾脏病（CKD）的潜在分子靶点 | 人类肾脏组织、实验性肾损伤模型 | 生物信息学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、孟德尔随机化（MR）、MAGMA基因关联分析、免疫组织化学、分子对接、分子动力学模拟 | NA | 单细胞转录组数据、GWAS汇总统计数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 911 | 2026-03-15 |
[Spatial omics in pulmonary fibrosis: advancing mechanistic insights and therapeutic strategies]
2026-Mar-25, Zhejiang da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Zhejiang University. Medical sciences
DOI:10.3724/zdxbyxb-2025-0785
PMID:41631436
|
综述 | 本文综述了空间组学技术在肺纤维化研究中的应用进展，强调其在揭示疾病机制和指导治疗策略方面的潜力 | 整合空间代谢组学、转录组学和蛋白质组学技术，为肺纤维化提供前所未有的组织架构背景下的高通量可视化分析 | NA | 推进肺纤维化的机制理解和治疗策略开发 | 肺纤维化，特别是特发性肺纤维化（IPF） | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间代谢组学，空间转录组学，空间蛋白质组学 | NA | 空间组学数据 | NA | NA | 空间代谢组学，空间转录组学，空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 912 | 2026-03-15 |
Identification of a putative progenitor-like chondrocyte subpopulation in osteoarthritic human cartilage
2026-Mar-14, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-04969-8
PMID:41827033
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在骨关节炎患者的软骨组织中鉴定出一个具有祖细胞样特征的软骨细胞亚群 | 在骨关节炎软骨中首次鉴定出三个新的软骨细胞亚群，包括一个具有祖细胞样特征的亚群，并描绘了其转录组特征和分化轨迹 | 研究样本量较小，且缺乏功能验证和空间定位验证 | 解析骨关节炎软骨细胞的异质性，并鉴定具有再生潜能的祖细胞样软骨细胞 | 骨关节炎患者的膝关节软骨细胞 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类，伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 6名终末期骨关节炎患者的约14,000个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞RNA测序 |
| 913 | 2026-03-15 |
Integrated transcriptomics and single-cell analysis identify ITGAX⁺ macrophages as key immunosuppressive factors in the prostate cancer tumor microenvironment
2026-Mar-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04737-3
PMID:41824168
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学和单细胞分析，识别出ITGAX⁺巨噬细胞作为前列腺癌肿瘤微环境中的关键免疫抑制因子 | 首次将ITGAX确定为前列腺癌预后基因，并通过单细胞RNA测序揭示其在巨噬细胞亚群中的富集及其与免疫抑制微环境的关联 | 研究主要基于TCGA等公共数据集，缺乏实验验证；样本量相对有限，且未涉及不同种族或亚型的比较分析 | 识别前列腺癌肿瘤微环境中新的生物标志物，以更好地理解疾病进展并为未来诊断或治疗策略提供信息 | 前列腺癌患者的肿瘤和正常前列腺组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 转录组学分析、单细胞RNA测序 | ESTIMATE算法、免疫去卷积算法、Cox回归、PPI网络分析、GSEA功能预测 | 转录组数据、临床数据、生存数据、单细胞RNA测序数据 | 551个样本（499个肿瘤样本和52个正常前列腺样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 914 | 2026-03-15 |
Loop of N2-polarized neutrophils and exhausted CD8 + T cells induces immunotherapy resistance in NSCLC
2026-Mar-13, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05457-y
PMID:41824204
|
研究论文 | 本研究通过整合大规模单细胞RNA测序数据，揭示了非小细胞肺癌中N2极化中性粒细胞与耗竭CD8⁺ T细胞之间形成正反馈环路导致免疫治疗耐药的机制，并基于此构建了深度学习预测模型 | 首次发现并表征了N2中性粒细胞与耗竭CD8⁺ T细胞之间通过ICAM1-整合素和CCL5-CCR1轴形成的自我维持免疫抑制环路，并基于该环路构建了可预测免疫治疗响应的深度学习模型 | 研究主要基于计算分析，需要进一步的实验验证来确认分子机制；模型在更多癌症类型中的普适性仍需验证 | 探究非小细胞肺癌中免疫抑制微环境的形成机制，并开发预测免疫治疗响应的临床模型 | 非小细胞肺癌肿瘤免疫微环境中的N2极化中性粒细胞和耗竭CD8⁺ T细胞 | 计算生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，通路富集分析，细胞间通讯分析，深度学习建模 | 深度神经网络 | 单细胞RNA测序数据，bulk RNA测序数据 | 大规模单细胞RNA测序数据集和多个bulk RNA测序队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 915 | 2026-03-15 |
Unraveling the role of cuproptosis in pulmonary fibrosis pathogenesis and prognosis: an integrative single-cell transcriptomics and microarray analysis
2026-Mar-13, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-026-05510-4
PMID:41824199
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和微阵列分析，揭示了铜死亡在肺纤维化发病机制和预后中的作用，并构建了一个基于4个铜死亡相关基因的预后风险模型 | 首次将铜死亡这一新型细胞死亡途径与肺纤维化联系起来，并通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据构建了一个稳健的预后风险评分模型 | 研究主要基于小鼠模型和回顾性患者数据，需要在更大规模的前瞻性临床队列中进行验证 | 阐明铜死亡在肺纤维化中的生物学功能并建立预后预测模型 | 博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型、TGF-β1刺激的成纤维细胞、以及特发性肺纤维化患者样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, qRT-PCR, 免疫组织化学 | LASSO回归, Cox回归 | 基因表达数据 | GSE70866队列患者数据、小鼠模型、人类IPF样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 916 | 2026-03-15 |
Single-cell RNA sequencing unravels chondrocyte heterogeneity and immune cell interactions in knee osteoarthritis pathogenesis
2026-Mar-13, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-026-08030-0
PMID:41824220
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研究论文 | 本研究通过整合公共GEO数据库中的单细胞RNA测序数据，系统分析了膝骨关节炎中软骨细胞的异质性及其与免疫细胞的相互作用 | 首次在膝骨关节炎中识别出八个软骨细胞亚群，并揭示了MIF信号在促进炎症微环境形成中的关键作用，以及C1Q+巨噬细胞通过补体级联反应增强淋巴细胞介导的细胞毒性 | 研究基于公共数据库的二次观察性分析，样本量相对有限（20例患者和6例健康供体），且未进行实验验证 | 全面表征膝骨关节炎中疾病特异性软骨细胞亚群及其分子特征，并解码浸润免疫细胞的组成多样性 | 膝骨关节炎患者和健康供体的软骨细胞及免疫细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | t-SNE聚类、伪时间分析、CellChat | 单细胞RNA测序数据 | 20例膝骨关节炎患者和6例健康供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 917 | 2026-03-15 |
Neuronal and glial networks interact with traumatic brain injury to modulate cognition in ABCD study
2026-Mar-13, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00681-8
PMID:41826372
|
研究论文 | 本研究整合了基因与轻度创伤性脑损伤（mTBI）交互作用的全基因组关联研究（GWAS）和单细胞RNA测序基因调控网络，以揭示调控mTBI后神经认知结果（特别是学习和记忆表现）的细胞类型特异性关键调节因子和分子机制 | 首次结合全基因组关联研究与单细胞RNA测序基因调控网络，在青少年脑认知发展（ABCD）队列中，从细胞类型特异性角度解析mTBI影响神经认知的复杂调控网络，并识别出海马体和皮层区域神经元与胶质细胞中的关键网络调节因子 | 研究基于观察性队列，可能受混杂因素影响；单细胞RNA测序数据可能未完全覆盖所有相关细胞类型或脑区；结果需要在独立队列中进一步验证 | 阐明轻度创伤性脑损伤（mTBI）影响青少年神经认知表现的生物学机制，特别是学习和记忆功能 | 青少年脑认知发展（ABCD）研究队列中的儿童和青少年，重点关注mTBI患者 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 全基因组关联研究（GWAS），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 基于通路的多基因风险评分模型 | 基因组数据，单细胞转录组数据，神经认知评估数据 | ABCD研究队列参与者（具体样本量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 918 | 2026-03-15 |
Multicellular origins of murine ovarian inflammaging
2026-Mar-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09826-1
PMID:41826404
|
研究论文 | 本研究整合单细胞和空间转录组学，揭示了小鼠卵巢衰老过程中免疫细胞亚群的增加及其在促炎信号传导中的关键作用 | 首次整合单细胞和空间转录组学技术，系统定义了衰老小鼠卵巢中免疫细胞亚群（如巨噬细胞和T细胞）的组成变化及其双向信号传导机制，为卵巢炎症衰老提供了新的分子机制见解 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类卵巢中验证；空间转录组学的分辨率可能限制了对特定细胞类型相互作用的精确解析 | 探究卵巢衰老过程中免疫细胞的功能及其对炎症衰老表型的贡献 | 衰老小鼠的卵巢组织 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 919 | 2026-03-15 |
Insights from pooled CRISPRi single-cell screens in K562 cells reveal gene functions, regulatory networks, and highlight opportunities and limitations
2026-Mar-13, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12667-1
PMID:41826830
|
研究论文 | 本研究通过改进的CRISPRi单细胞筛选方法，在K562细胞中敲低六个转录因子，揭示了基因功能、调控网络，并评估了该技术的潜力与局限性 | 采用改进的CROP-seq协议，无需单独的富集步骤即可直接从cDNA文库捕获sgRNA，显著提高了每个细胞的sgRNA分配准确性，并成功重建了转录调控网络，发现了新的调控相互作用 | CRISPRi介导的扰动效率存在变异性，仅约40-50%的靶基因能实现有效敲低，技术的可靠性、可扩展性和可重复性仍需进一步优化和标准化基准测试 | 评估和改进基于CRISPRi的汇集式单细胞筛选方法，以解析基因功能和重建基因调控网络 | K562细胞系中的六个转录因子：LMO2、TCF3、LDB1、MYB、GATA2和RUNX1 | 单细胞功能基因组学 | 血液系统疾病（白血病相关细胞模型） | CRISPR干扰（CRISPRi）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR液滴测序（CROP-seq） | 基因调控网络（GRN）重建 | 单细胞转录组数据、sgRNA序列数据 | 未明确指定具体细胞数量，但使用了K562细胞系和公开的Perturb-seq CRISPRi数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 改进的CRISPR液滴测序（CROP-seq）协议 |
| 920 | 2026-03-15 |
Myeloid-derived immunosuppression of chimeric antigen receptor T cells in the neuronal microenvironment of glioblastoma
2026-Mar-13, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04783-2
PMID:41827001
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研究论文 | 本研究利用人脑切片模型，通过单细胞测序和空间转录组学技术，揭示了胶质母细胞瘤中CAR-T细胞快速功能障碍的微环境机制和转录调控因子 | 首次在保留复杂胶质母细胞瘤微环境的人脑切片模型中，结合PIC-seq、空间转录组学和基因调控网络分析，系统描绘了CAR-T细胞与肿瘤生态系统间的相互作用 | 研究基于体外脑切片模型，可能无法完全模拟体内免疫微环境的动态变化；样本量相对有限 | 探究胶质母细胞瘤中CAR-T细胞疗法失效的微环境机制和调控通路 | NKG2D CAR-T细胞与胶质母细胞瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | PIC-seq, 空间转录组学, 基因调控网络重建 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |