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当前共找到 9342 篇文献，本页显示第 9101 - 9120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9101 | 2026-01-10 |
IDH-mutant gliomas arise from glial progenitor cells harboring the initial driver mutation
2026-Jan-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adt0559
PMID:41505555
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研究论文 | 本研究通过深度测序和空间转录组学分析，确定了IDH突变胶质瘤起源于携带初始驱动突变的胶质祖细胞 | 首次结合细胞类型特异性突变分析、克隆进化方向、患者大脑空间转录组学和癌症小鼠模型，明确了IDH突变胶质瘤的起源细胞 | 样本量相对有限（70名患者），且仅针对IDH突变胶质瘤，可能不适用于其他类型脑肿瘤 | 探究IDH突变胶质瘤的起源细胞，以理解肿瘤进化并开发新治疗方法 | IDH突变胶质瘤患者（70名）的肿瘤组织、瘤周皮质、脑室下区和血液样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 深度测序, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 70名患者的142个组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9102 | 2026-01-10 |
Single-cell RNA sequencing reveals the therapeutic mechanism of Calvatia lilacina in promoting wound healing of anal fistula
2026-Jan-07, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-025-01293-w
PMID:41495793
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了紫色秃马勃孢子促进肛瘘伤口愈合的治疗机制 | 首次从单细胞水平解析了紫色秃马勃孢子通过调节巨噬细胞与成纤维细胞相互作用促进肛瘘伤口愈合的分子机制 | 样本量较小（仅20例患者），且为单中心研究，需要更大规模的多中心验证 | 探究紫色秃马勃孢子促进肛瘘伤口愈合的疗效和机制 | 肛瘘术后患者的肉芽组织样本及小鼠皮肤成纤维细胞 | 数字病理学 | 肛瘘 | 单细胞RNA测序, ELISA, 免疫组化, Western blot, 免疫荧光, 流式细胞术, 细胞共培养 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 细胞图像数据 | 20例肛瘘手术患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9103 | 2026-01-10 |
Replication stress-inducing ELF3 upregulation promotes BRCA1-deficient breast tumorigenesis in luminal progenitors
2026-Jan-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89573
PMID:41498327
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研究论文 | 本研究揭示了复制应激在BRCA1缺陷型乳腺肿瘤发生中的作用，并阐明了ELF3在促进管腔祖细胞转化中的关键机制 | 首次通过单细胞测序和RNA-seq技术，揭示了复制应激作为BRCA1缺陷型乳腺肿瘤发生的驱动因素，并发现ELF3在这一过程中的核心调控作用 | 研究主要基于人类突变乳腺癌样本和BRCA1缺陷的正常乳腺细胞，可能未完全涵盖所有肿瘤亚型或体内微环境的影响 | 探究BRCA1缺陷型乳腺癌在管腔祖细胞中易转化的原因 | 人类BRCA1突变乳腺癌样本和BRCA1缺陷的正常乳腺细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9104 | 2026-01-10 |
Integrating single cell- and spatial- resolved transcriptomics unravels the inter-tumor heterogeneity and immunosuppressive landscape in HBV- and Clonorchis sinensis-associated hepatocellular carcinoma
2026-Jan-05, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02381-z
PMID:41491521
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学，揭示了HBV和华支睾吸虫相关肝细胞癌的肿瘤间异质性和免疫抑制微环境 | 首次同时利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，比较了HBV、华支睾吸虫及双重感染背景下肝细胞癌的肿瘤微环境异质性 | 研究样本量相对有限，且部分分析依赖于公开数据集，可能影响结果的普适性 | 探究不同感染背景（HBV和华支睾吸虫）下肝细胞癌的肿瘤间异质性及免疫微环境特征 | 肝细胞癌患者肿瘤及癌旁组织样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 免疫组化, 体外实验 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 269例原发性肝细胞癌患者，包括肿瘤和癌旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9105 | 2026-01-07 |
Correction: An integrative analysis of transcriptome, methylome and single-cell RNA sequencing data identifies UBE2H as a marker of oxaliplatin resistance in colorectal cancer
2026-Jan-05, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04098-x
PMID:41491807
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9106 | 2026-01-10 |
Benchmarking algorithms for RNA velocity inference
2026-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.03.697314
PMID:41509202
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研究论文 | 本研究对29种RNA速度推断算法进行了系统性基准测试，评估了它们在模拟和真实单细胞RNA测序数据上的性能 | 首次对29种RNA速度算法进行大规模系统性基准测试，提出了包含准确性、可扩展性、稳定性和可用性四个维度的统一评估框架，并扩展到空间和多组学层面 | 评估主要基于现有数据集，缺乏真正多模态和空间显式的速度模型，对基于spot技术的支持有限 | 评估和比较不同RNA速度推断算法的性能，为方法选择提供指导 | RNA速度推断算法 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 114个模拟数据集和62个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 9107 | 2026-01-10 |
Spatial transcriptomics reveals expression gradients in developing wheat inflorescences at cellular resolution
2026-Jan-02, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf282
PMID:41388990
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研究论文 | 本研究通过优化空间转录组技术，在细胞分辨率水平揭示了小麦花序发育过程中沿顶端-基部轴的基因表达梯度模式 | 首次将MERFISH空间转录组技术优化应用于小麦花序组织，实现了200个基因在4个发育阶段、5万个细胞中的精确定位，揭示了花序发育的时空组织模式 | 仅分析了200个基因的表达模式，未覆盖全转录组；技术优化主要针对小麦花序组织，在其他植物组织的适用性有待验证 | 解析小麦花序发育过程中基因表达的时空模式 | 小麦（Triticum aestivum）花序组织 | 空间转录组学 | NA | Multiplexed Error Robust Fluorescence In Situ Hybridization (MERFISH) | NA | 空间转录组数据、图像数据 | 4个发育阶段的小麦花序组织，约50,000个细胞 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | 优化的MERFISH技术用于小麦花序组织 |
| 9108 | 2026-01-10 |
scVDM: A Diffusion Model Integrated With Conditional VAE for Generative Single-Cell Tasks
2026-Jan, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3585960
PMID:40608883
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研究论文 | 本文提出了一种名为scVDM的生成模型，结合条件变分自编码器和扩散模型，用于处理单细胞RNA-seq数据中的生成任务 | scVDM首次将条件变分自编码器与基于Transformer的条件去噪扩散模型集成，以学习单细胞数据中的复杂非线性关联，并应用于条件数据生成、批次效应校正和药物扰动预测等多种生成任务 | 未明确提及具体局限性，但可能涉及模型对高维数据的计算复杂度或泛化能力 | 开发一种生成模型，以解决单细胞RNA-seq数据中的噪声问题，并实现多种生成任务 | 单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 扩散模型, 条件变分自编码器, Transformer | 转录组数据 | 基于五个真实世界数据集进行评估，具体样本数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9109 | 2026-01-10 |
MOH: A Novel Multilayer Multi-Omics Heterogeneous Graph for Single-Cell Clustering
2026-Jan, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3589464
PMID:41385419
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研究论文 | 本文提出了一种基于多层多组学异质图的新型单细胞聚类算法MOH，用于整合scRNA-seq、scATAC-seq和空间转录组学数据 | MOH通过构建多层异质图整合三种单细胞组学数据，同时捕获层内和层间关系，克服了传统方法仅整合两种组学数据且忽略细胞间相互作用的限制 | 未明确提及具体局限性，但传统方法在引入新组学数据时需要重新设计图结构，限制了可扩展性 | 开发一种能够整合多种单细胞组学数据的聚类算法，以更准确地识别细胞群体 | 单细胞多组学数据，包括scRNA-seq、scATAC-seq和空间转录组学 | 机器学习 | 癌症 | scRNA-seq, scATAC-seq, 空间转录组学 | 多层异质图模型 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9110 | 2026-01-10 |
Interferon-stimulated gene GALNT2 restricts respiratory virus infections
2026-Jan, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-02200-7
PMID:41387548
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研究论文 | 本研究通过转录组分析和单细胞RNA测序，发现干扰素刺激基因GALNT2通过O-连接糖基化限制多种冠状病毒和甲型流感病毒的复制，揭示了其抗病毒机制和遗传变异与COVID-19住院风险的相关性 | 首次将GALNT2鉴定为抗呼吸道病毒感染的干扰素刺激基因，并阐明其通过O-糖基化调控病毒糖蛋白加工和病毒-细胞融合的机制 | 研究主要基于体外和动物模型，人类遗传数据分析的样本规模和临床验证需进一步扩展 | 探索干扰素刺激基因在抗呼吸道病毒感染中的作用机制 | SARS-CoV-2、多种冠状病毒、甲型流感病毒以及COVID-19患者的样本 | 自然语言处理 | NA | 转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 野生型和IFNAR小鼠的肺组织、COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液和外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9111 | 2026-01-10 |
MMSpa is a deep learning-based tool that enhances the identification of spatial domains in spatial transcriptomics studies
2026-Jan, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003580
PMID:41490241
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研究论文 | 本文提出了一种名为MMSpa的深度学习工具，旨在提升空间转录组学研究中空间域的识别精度 | MMSpa采用掩码图注意力自编码器框架，结合边移除策略构建增强空间图，以解决跨域干扰并刻画更清晰的域边界，通过掩码基因表达重构学习稳定的潜在表征 | NA | 提升空间转录组学中空间域的识别准确性 | 空间转录组学数据中的空间域 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 掩码图注意力自编码器 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9112 | 2026-01-10 |
ZNF282 Promotes Colorectal Cancer Progression Possibly via E2F1 Activation
2026-Jan, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70224
PMID:41125417
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析与实验验证，发现ZNF282基因通过可能激活E2F1促进结直肠癌进展 | 首次将ZNF282鉴定为结直肠癌进展的关键基因，并通过单细胞RNA测序与空间转录组学结合TCGA数据，揭示了其通过调控E2F1影响细胞周期的分子机制 | ZNF282调控E2F1的具体分子机制（如直接结合证据）仍需进一步实验验证 | 探究结直肠癌进展的新分子机制与潜在治疗靶点 | 结直肠癌细胞系、临床结直肠癌样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，CRISPR/Cas9基因敲除，TCGA数据分析 | NA | 基因表达数据，单细胞数据，空间转录组数据 | TCGA数据库及临床CRC数据集（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9113 | 2026-01-10 |
The exploration of immunological landscape and drug targets in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2026-Jan, The World Allergy Organization journal
DOI:10.1016/j.waojou.2025.101140
PMID:41496791
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法，探索了慢性鼻-鼻窦炎伴鼻息肉的免疫学特征和潜在药物靶点 | 首次将孟德尔随机化与单细胞RNA测序相结合，系统性地揭示了CRSwNP的细胞特异性基因表达模式和免疫微环境重塑机制 | 研究样本量未明确说明，且主要基于已有GWAS和eQTL数据，需要进一步实验验证 | 阐明慢性鼻-鼻窦炎伴鼻息肉的免疫学发病机制并识别潜在治疗靶点 | 慢性鼻-鼻窦炎伴鼻息肉患者的组织样本 | 生物信息学 | 慢性鼻-鼻窦炎 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 全基因组关联研究, 表达数量性状位点分析 | NA | 基因表达数据, 遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9114 | 2026-01-10 |
Unraveling the Causal Linkages of RBP7 and SCGB3A1 on Pelvic Organ Prolapse: Multifaceted Insights From Genome-Wide Mendelian Randomization, Single-Cell RNA Analysis, and Network Pharmacology
2026, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/bmri/9785848
PMID:41497737
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序、孟德尔随机化和网络药理学方法，揭示了RBP7和SCGB3A1基因在盆腔器官脱垂中的因果作用及潜在治疗药物 | 首次将单细胞RNA测序、全基因组孟德尔随机化和网络药理学多维度方法相结合，系统性地识别了盆腔器官脱垂的因果风险基因和保护基因，并探索了潜在的治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析和公开数据，缺乏实验验证；未来需要功能实验验证SCGB3A1在成纤维细胞中的作用，并进行临床前药物试验 | 探索盆腔器官脱垂的潜在发病机制并寻找有效的治疗靶点 | 盆腔器官脱垂患者的阴道黏膜组织 | 生物信息学 | 盆腔器官脱垂 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化, 网络药理学, 分子对接 | NA | 单细胞RNA测序数据, GWAS汇总统计数据, eQTL数据 | 来自盆腔器官脱垂患者和非患者的阴道黏膜组织单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9115 | 2026-01-10 |
Multi-modal choroid plexus pathology in aging and Alzheimer's disease
2026-Jan-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.30.697051
PMID:41509283
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研究论文 | 本研究通过多模态方法构建了脉络丛图谱，揭示了其在衰老和阿尔茨海默病中的病理变化 | 整合单核转录组学、AI辅助定量组织病理学、空间转录组学和功能研究，首次系统表征了脉络丛在生命周期中的病理发展及其对阿尔茨海默病的贡献 | 研究主要基于死后样本和5xFAD小鼠模型，可能无法完全反映活体人类疾病进程 | 探究脉络丛在衰老和阿尔茨海默病中的病理机制及其作为血脑屏障和脑脊液产生者的作用 | 人类死后样本（年龄16至105岁）和5xFAD转基因小鼠模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核转录组学, AI辅助定量组织病理学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 组织病理图像, 空间转录组数据 | 超过500个死后样本（年龄16至105岁）和5xFAD小鼠 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9116 | 2026-01-10 |
Progenitor Diversity and Architecture of the Human Ganglionic Eminences Shaping the Basal Ganglia
2026-Jan-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.31.697063
PMID:41509357
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和染色质可及性分析，揭示了人类基底节发育中神经前体细胞的多样性和结构特征 | 首次在灵长类中结合单细胞多组学、活体成像和空间转录组学，系统解析了基底节神经前体细胞的异质性和谱系轨迹，并发现PCDH19在DEN结构形成中的关键调控作用 | 研究主要基于体外器官模型和有限发育阶段样本，体内验证和更广泛发育时期的分析仍需进一步探索 | 解析灵长类基底节发育过程中神经前体细胞的分子异质性、谱系关系和结构形成机制 | 人类胚胎期神经节隆起（MGE、LGE）的神经前体细胞及其衍生的神经元和胶质细胞 | 发育神经生物学 | NA | 单细胞核转录组测序、染色质可及性分析、活体成像、空间转录组学、电子显微镜、类器官培养 | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据、空间转录组数据、成像数据 | 人类胚胎期三个神经节隆起区域的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 9117 | 2026-01-09 |
Dual itaconate delivery systems modulate macrophage Acod1-Hif-1α-glycolysis axis for immunotherapy of bioprosthetic heart valve calcification
2026-Apr, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.11.040
PMID:41492369
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学及多种实验模型，揭示了生物人工心脏瓣膜钙化的免疫学机制，并开发了基于衣康酸递送的靶向免疫调节策略以抑制钙化 | 首次构建了BHV钙化的时空细胞图谱，鉴定出低Acod1表达的新型促钙化巨噬细胞亚群，并揭示了Acod1-Hif-1α-糖酵解轴在钙化中的作用机制；创新性地设计了两种基于生物材料的衣康酸递送系统用于局部免疫调节治疗 | NA | 阐明生物人工心脏瓣膜钙化的免疫学机制并开发靶向免疫调节治疗策略 | 生物人工心脏瓣膜、巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9118 | 2026-01-09 |
Bioinspired scaffold recapitulating chondrogenic ontogeny and microenvironment for functional cartilage regeneration
2026-Apr, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.11.041
PMID:41502980
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研究论文 | 本文开发了一种仿生三层支架，通过模拟软骨发育过程和微环境，有效修复局灶性关节软骨缺损并促进功能性软骨再生 | 创新性地设计了一种三层仿生支架（CE-SKP/CPH/P2G3），该支架能模拟软骨发育过程（从软骨到钙化软骨）并重建局部缺氧微环境，成功修复了软骨缺损并恢复了正常的生理结构 | NA | 开发一种能够模拟软骨发育过程和微环境的支架，以实现功能性关节软骨再生和治疗骨关节炎 | 局灶性关节软骨缺损、骨关节炎 | 组织工程、再生医学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9119 | 2026-01-09 |
Evaluating imputation methods for accurate estimation of cell population fractions in single-cell RNA sequencing
2026-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf204
PMID:41503159
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研究论文 | 本研究系统评估了八种单细胞RNA测序数据插补算法在准确估计细胞群体比例方面的性能 | 首次系统评估多种插补算法在改善细胞群体大小估计方面的能力，并定义了改善估计的条件 | 仅评估了八种算法，可能未涵盖所有现有方法；依赖于模拟和参考数据集，可能无法完全代表真实生物样本的复杂性 | 评估单细胞RNA测序数据插补方法在准确估计细胞群体比例方面的有效性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体比例估计 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | MAGIC, SAVER, scVI, DCA, scBiG, kNN-smoothing, scImpute, ALRA | 单细胞RNA测序数据 | 两个模拟数据集和一个深度测序参考数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9120 | 2026-01-09 |
Altered Thymopoiesis in Thymoma Is Associated with Defects in Negative Selection Machinery and Decreased Treg Abundance
2026-Jan-08, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0190
PMID:41143696
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研究论文 | 本研究通过表型、单细胞RNA测序和空间分析，探讨了胸腺瘤中胸腺生成异常与自身免疫的关系 | 首次结合单细胞RNA测序和空间分析，揭示了胸腺瘤中胸腺上皮细胞的转录组缺陷和皮质-髓质分区丧失，关联了胸腺生成异常与自身免疫 | 研究样本可能有限，且未详细探讨胸腺瘤亚型间的差异 | 研究胸腺瘤中胸腺生成的异常机制及其与自身免疫的关联 | 胸腺瘤中的T细胞和肿瘤性胸腺上皮细胞 | 数字病理学 | 胸腺瘤 | 单细胞RNA测序, 空间分析, 多重免疫组化染色 | NA | RNA测序数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |