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当前共找到 9342 篇文献，本页显示第 9021 - 9040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9021 | 2026-01-15 |
Machine learning and multi-omics integration identifies immunological predictors and mechanistic insights in autoimmune encephalitis
2026-Jan-14, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02180-8
PMID:41533076
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研究论文 | 本研究利用免疫指标和机器学习算法开发了自身免疫性脑炎的预后预测模型，并通过多组学方法探讨了核磷蛋白1在疾病发病机制中的潜在作用 | 首次整合了临床免疫指标、多种机器学习算法、SHAP可解释性分析、单细胞RNA测序、空间转录组学和表型全基因组关联研究，构建了可解释的预后预测模型并提出了新的潜在治疗靶点 | PAIA治疗的证据仅来自单个患者，NPM1作为治疗靶点的安全性仍需进一步验证，PheWAS仅为初步安全性评估 | 开发自身免疫性脑炎的预后预测模型并探索疾病发病机制 | 抗体阳性自身免疫性脑炎患者及实验性自身免疫性脑脊髓炎模型 | 机器学习 | 自身免疫性脑炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 表型全基因组关联研究 | RF, XGBoost, LGBM | 临床免疫指标数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 | 未明确患者数量，包含独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9022 | 2026-01-15 |
D-Mannose-Modified M2 Macrophage Membrane-Derived Decoy Nanovesicles for Synergistic Immunotherapy of Asthma
2026-Jan-13, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c04996
PMID:41441854
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研究论文 | 本研究开发了一种基于M2巨噬细胞膜的纳米诱饵，用于协同免疫治疗哮喘 | 利用M2巨噬细胞膜衍生的纳米诱饵高效捕获多种2型细胞因子，并通过D-甘露糖修饰增强细胞因子清除，实现协同免疫抑制 | 研究基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 开发一种针对哮喘的纳米技术免疫疗法 | 哮喘（特别是嗜酸性粒细胞性哮喘） | NA | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9023 | 2026-01-15 |
Single-cell integration and multi-modal profiling reveals phenotypes and spatial organization of neutrophils in colorectal cancer
2026-Jan-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.12.003
PMID:41529665
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研究论文 | 本研究通过单细胞整合与多模态分析，揭示了结直肠癌中中性粒细胞的表型、空间组织及其在肿瘤微环境中的免疫调节作用 | 构建了包含427万单细胞的大规模图谱，结合空间转录组学和蛋白质谱数据，首次识别出具有抗原呈递特性的中性粒细胞亚群，并揭示了KRAS依赖的中性粒细胞促肿瘤极化及IL-1信号介导的中性粒细胞-成纤维细胞相互作用 | NA | 探究结直肠癌肿瘤微环境中免疫细胞的组成、表型及空间相互作用，以理解其对治疗反应的影响 | 结直肠癌患者样本中的单细胞，包括中性粒细胞等免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质谱分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质数据 | 1,670例患者样本（含4.27百万单细胞），补充了266例患者的单细胞谱，以及3.7百万细胞的空间转录组和0.7百万细胞的蛋白质谱 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 9024 | 2026-01-15 |
Identification of Crohn's disease subtypes in single-cell RNA sequencing signatures of treatment-naive samples across the pediatric gastrointestinal tract
2026-Jan-09, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaf225
PMID:41369126
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在未接受治疗的儿童克罗恩病患者中，识别了跨胃肠道多个区域的疾病亚型 | 开发了聚类稳定性评估工作流程以确保结果的稳健性，并首次在未治疗儿科队列中应用张量分解技术来识别疾病亚型 | 研究样本仅限于未接受治疗的儿童患者，且炎症对细胞比例的影响因供体和组织异质性而较弱 | 研究克罗恩病的发病机制，识别疾病亚型以推动个性化医疗 | 未接受治疗的儿童克罗恩病患者的回肠、结肠和直肠活检样本 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | 张量分解 | 单细胞转录组数据 | 一个未治疗儿科克罗恩病队列的多个胃肠道区域活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9025 | 2026-01-15 |
A co-evolutionary perspective on humans and Mycobacterium tuberculosis in the era of systems biology
2026-Jan-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.108175
PMID:41499279
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综述 | 本文从系统生物学的角度探讨了人类与结核分枝杆菌的共进化关系，强调了宿主-病原体相互作用的复杂性 | 提出单一免疫机制研究阻碍进展，倡导采用系统生物学方法（如单细胞和空间转录组学）来全面理解结核病的多路径发病机制 | 未具体说明如何在实际研究中整合这些新兴方法以克服现有分析的缺陷 | 理解人类与结核分枝杆菌在共进化背景下的宿主-病原体相互作用，以推动结核病防控 | 人类与结核分枝杆菌（Mtb）的共进化关系及免疫学过程 | 系统生物学 | 结核病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9026 | 2026-01-15 |
Cigarette smoke-mediated YTHDC2 suppression drives macrophage senescence and a tumor-promoting microenvironment in lung cancer
2026-Jan, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.70068
PMID:41292214
|
研究论文 | 本研究揭示了香烟烟雾通过抑制m6A阅读器YTHDC2诱导巨噬细胞衰老，从而在肺癌中形成促肿瘤微环境的机制 | 首次发现YTHDC2在香烟烟雾诱导的巨噬细胞衰老及促肿瘤微环境形成中的关键调控作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探究香烟烟雾如何通过调控YTHDC2影响巨噬细胞功能及肺癌微环境 | 肺癌组织、巨噬细胞、香烟烟雾暴露模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 吸烟者与非吸烟者的肺癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9027 | 2026-01-15 |
Single-cell transcriptome analysis reveals macrophage-specific apolipoprotein C1 as a key regulator of polarization and progression in triple-negative breast cancer
2026-Jan, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.70066
PMID:41294154
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了载脂蛋白C1（APOC1）在调控三阴性乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞极化和促进肿瘤进展中的关键作用 | 首次在单细胞水平上系统解析了三阴性乳腺癌中巨噬细胞的异质性，并鉴定出APOC1作为调控巨噬细胞向促肿瘤M2表型极化的关键分子，其通过激活糖酵解通路发挥作用 | 研究主要基于体外细胞实验和单细胞测序数据分析，缺乏体内动物模型的直接验证；APOC1调控糖酵解的具体下游分子机制尚未完全阐明 | 探究三阴性乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其促进肿瘤进展的分子机制 | 三阴性乳腺癌组织中的巨噬细胞（特别是脂质相关巨噬细胞LA-TAMs） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9028 | 2026-01-15 |
Co-targeting MRPS7-23 synergistically enhances cisplatin efficacy to suppress nasopharyngeal carcinoma growth and metastasis
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.115523
PMID:41522354
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，揭示了MRPS7和MRPS23通过稳定β-catenin驱动鼻咽癌顺铂耐药的新机制，并发现靶向其上游调控因子USP10可协同增强顺铂疗效 | 首次鉴定出线粒体核糖体蛋白MRPS7和MRPS23是鼻咽癌顺铂耐药的关键驱动因子，并阐明了其通过抑制β-catenin泛素化促进癌症干细胞特性和上皮-间质转化的分子机制，同时发现了USP10作为上游调控因子的新作用 | 研究主要基于细胞和动物模型，临床转化效果仍需进一步验证；耐药机制可能涉及其他未被发现的通路 | 阐明鼻咽癌顺铂耐药的分子机制，并寻找逆转耐药的治疗策略 | 鼻咽癌细胞系、动物模型以及相关的分子通路 | 癌症生物学 | 鼻咽癌 | 整合多组学分析、单细胞RNA测序、质谱分析、功能研究 | NA | 基因组学数据、转录组学数据、蛋白质组学数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9029 | 2026-01-15 |
Dual Phosphorylation of STAT1 at Y701/S727 by TNFα Drives AIM2-Mediated PANoptosis of Renal Tubular Epithelial Cells and Fibrotic Progression in Renal Allografts
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.123441
PMID:41522348
|
研究论文 | 本研究揭示了TNF-α通过双重磷酸化STAT1激活AIM2，驱动肾小管上皮细胞发生PANoptosis，进而促进肾移植间质纤维化的分子机制 | 首次阐明了TNF-α/STAT1/AIM2轴在触发PANoptosis及其下游EMT-纤维化级联反应中的作用，为慢性移植肾功能障碍提供了新的治疗靶点 | NA | 探究慢性移植肾功能障碍中肾移植间质纤维化的分子机制 | 肾移植组织、肾小管上皮细胞 | 数字病理 | 慢性移植肾功能障碍 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9030 | 2026-01-15 |
Acute anti-Aβ antibody exposure induces microglial changes and significantly alters chemokine signaling
2026 Jan-Mar, Alzheimer's & dementia (New York, N. Y.)
DOI:10.1002/trc2.70201
PMID:41522370
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析，探讨了抗淀粉样蛋白β抗体（3D6）急性暴露对大脑免疫反应的影响，特别是小胶质细胞的变化和趋化因子信号通路的改变 | 首次在急性时间点（3天）通过单细胞测序揭示抗Aβ抗体如何快速改变小胶质细胞亚型和趋化因子信号，特别是CCL通路靶向稳态小胶质细胞而非疾病相关亚型的新发现 | 研究仅基于短期（3天）观察，未评估长期效应；颅内注射模型可能无法完全模拟临床免疫治疗的实际给药方式 | 阐明抗淀粉样蛋白β抗体治疗阿尔茨海默病时大脑的即时免疫反应机制 | 小鼠大脑皮层组织中的小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量，但涉及3D6抗体注射组和IgG对照组的小鼠大脑皮层 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9031 | 2026-01-14 |
Evaluating the practical aspects and performance of commercial single-cell RNA sequencing technologies
2026-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf215
PMID:41503158
|
研究论文 | 本文对商业单细胞RNA测序技术进行了全面评估，比较了多种平台的性能指标和实际应用因素 | 首次在单细胞TCR恢复可用检测中比较了T细胞特异性性能，并综合评估了细胞回收率、灵敏度对稀有细胞亚型解析能力的影响 | 研究主要基于PBMC样本，可能不适用于其他组织类型；未涵盖所有商业平台 | 评估商业单细胞RNA测序技术的实际应用性能和选择标准 | 来自不同供者的标准化PBMC样本 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个供者的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, TCR分析 | NA | 评估了七种全转录组mRNA检测试剂盒和两种包含TCR分析的试剂盒 |
| 9032 | 2026-01-14 |
Opportunities for RNA sequencing in physiology: from big data to understanding homeostasis and heterogeneity
2026-Feb-01, Function (Oxford, England)
DOI:10.1152/function.019.2025
PMID:41401424
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综述 | 本文探讨了RNA测序在生理学中的应用潜力，强调其从大数据到理解稳态和异质性的作用 | 强调非编码RNA（如lncRNA）在生理学中的重要性，并讨论单细胞和空间转录组学的最新进展 | 未提及具体实验或数据验证，主要基于现有文献综述 | 评估RNA测序技术在生理学研究中的机遇和挑战 | RNA分子，包括编码和非编码RNA，以及其在细胞、组织和器官生理学中的应用 | 自然语言处理 | NA | RNA测序，单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 超过一百万RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9033 | 2026-01-14 |
Detection of pleiotropic genetic factors and critical brain cell types linking insomnia with psychiatric disorders
2026-Jan-13, Sleep
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/sleep/zsaf317
PMID:41065713
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研究论文 | 本研究通过分析失眠症与12种精神疾病的遗传关联，揭示了它们之间共享的遗传结构和神经生物学机制 | 首次系统地识别了失眠症与多种精神疾病共享的70个基因组位点，并确定了GABA能突触信号通路和特定皮质神经元亚型在共病机制中的核心作用 | 研究主要基于欧洲血统人群的GWAS数据，可能限制了结果在其他人群中的普适性；功能验证和因果推断需要进一步实验研究 | 探究失眠症与精神疾病之间的遗传重叠、生物学通路和脑细胞类型关联 | 失眠症和12种精神疾病（包括ADHD、厌食症、焦虑症、自闭症谱系障碍、双相情感障碍、重度抑郁症和精神分裂症）的基因组数据 | 遗传学与神经科学 | 精神疾病与睡眠障碍 | 全基因组关联研究（GWAS）、单细胞RNA测序 | bivariate MiXeR、conjFDR、ASSET、MAGMA、SEISMIC | 基因组关联数据、单细胞转录组数据 | 失眠症样本量314,149；精神疾病样本量12,783至449,855不等 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9034 | 2026-01-14 |
GraphSTAR: Proximal Operator-Based Graph Neural Network Enhanced by Dynamic Graph Aggregation for Spatial Transcriptomics
2026-Jan-12, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3644379
PMID:41525646
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研究论文 | 本文提出了一种名为GraphSTAR的新方法，用于整合空间转录组学中的空间坐标和基因表达数据，以改进空间域识别和细胞类型注释任务 | GraphSTAR通过将空间和基因表达数据编码为无向图，并利用动态图聚合结合近端算子，有效建模局部邻域关系和长程功能关联，克服了现有方法在探索长程关系方面的不足 | NA | 解决空间转录组学中原始空间坐标与高维基因表达谱在原生特征空间中的整合挑战，以更好地解析基因的空间表达模式 | 空间转录组学数据，包括空间坐标和基因表达谱 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 图神经网络（GNN） | 空间坐标和基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9035 | 2026-01-14 |
Mapping somatosensory afferent circuitry to bone identifies neurotrophic signals required for fracture healing
2026-Jan-08, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adr9608
PMID:41505527
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了骨骼感觉神经元的神经解剖学环路及其在骨折愈合中的关键作用 | 首次系统性地绘制了骨骼感觉传入神经元的单细胞转录组图谱，并识别出FGF9作为骨折修复的主要调控因子 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证尚需进一步研究 | 探究骨骼感觉神经元的神经解剖学环路及其在骨折愈合中的调控机制 | 小鼠骨骼的背根神经节神经元 | 单细胞转录组学 | 骨折 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及骨折前后的小鼠背根神经节神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9036 | 2026-01-14 |
Drug and single-cell gene expression integration identifies sensitive and resistant glioblastoma cell populations
2026-Jan-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67783-5
PMID:41501023
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研究论文 | 本研究开发了scFOCAL平台，通过整合单细胞基因表达数据与药物数据库，识别胶质母细胞瘤中对靶向疗法敏感和耐药的细胞亚群，并预测协同治疗组合 | 开发了scFOCAL（单细胞组学连接与分析框架），首次将单细胞RNA测序数据与LINCS L1000药物数据库的转录反应特征进行整合，量化细胞对药物的敏感性和耐药性景观，并预测药物组合协同作用 | 研究主要基于转录组数据，未全面评估表观遗传、蛋白质组等其他层面的异质性；临床前验证虽涵盖体外、离体和体内模型，但尚未进行临床试验 | 开发一个预测平台，以解决胶质母细胞瘤肿瘤内异质性和可塑性对治疗开发的阻碍，识别对不同治疗敏感或耐药的细胞状态，并发现新的协同治疗组合 | 新诊断和复发性胶质母细胞瘤肿瘤样本中的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9037 | 2026-01-14 |
Mapping isoforms and regulatory mechanisms from spatial transcriptomics data with SPLISOSM
2026-Jan-05, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02965-6
PMID:41491254
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SPLISOSM的方法，用于从空间转录组学数据中检测异构体分辨率模式，并应用于小鼠大脑和人类胶质母细胞瘤的分析 | SPLISOSM方法首次使用非参数核的多变量测试来处理点水平和异构体水平的依赖性，从而在稀疏数据上实现高统计功效，揭示了空间转录多样性的新调控关系 | 方法可能依赖于数据质量和覆盖度，且分析主要聚焦于大脑组织，在其他组织中的适用性未验证 | 研究旨在理解转录多样性（包括剪接和替代3'端使用）的空间协调机制及其在正常和肿瘤条件下的作用 | 小鼠大脑和人类胶质母细胞瘤组织 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | SPLISOSM（空间异构体统计建模） | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 9038 | 2026-01-14 |
Integrative Single-Cell and Machine Learning Analysis Identifies a Nucleotide Metabolism-Related Signature Predicting Prognosis and Immunotherapy Response in LUAD
2026-Jan-02, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18010160
PMID:41514669
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和机器学习算法，构建了一个核苷酸代谢相关特征（NMRS），用于预测肺腺癌（LUAD）的预后和免疫治疗反应 | 首次在单细胞水平上系统描绘了肺腺癌中核苷酸代谢的异质性，并构建了一个跨队列稳健的预后和免疫治疗反应预测特征（NMRS），同时通过实验验证了关键基因ENO1的功能 | 研究主要基于公开的回顾性数据集，需要前瞻性临床队列进一步验证NMRS的预测效能；体外实验仅初步验证了ENO1的功能，缺乏体内模型和机制深入探索 | 探究肺腺癌中核苷酸代谢的细胞异质性及其对肿瘤进展、免疫微环境和治疗反应的影响，并开发相关的预后和预测标志物 | 肺腺癌（LUAD）患者肿瘤组织中的细胞，特别是恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），机器学习算法组合 | 多种机器学习算法组合（共101种组合），inferCNV，Monocle2，CellChat | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据 | 来自独立LUAD患者的公开scRNA-seq数据集，TCGA-LUAD队列和多个GEO队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9039 | 2026-01-14 |
CausalGenDiff: Generative causal diffusion bridges scRNA-seq and spatial transcriptomics
2026-Jan, Journal of biomedical informatics
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbi.2025.104966
PMID:41354118
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研究论文 | 提出了一种名为CausalGenDiff的生成因果扩散模型，用于有效整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据 | 首次将扩散和自回归过程相结合以利用基因间的因果依赖关系，并将原本用于图像生成的因果注意力变换器扩展应用于高维基因表达数据，无需依赖预定义关系即可捕捉基因调控机制 | 未明确说明模型的计算复杂度或对计算资源的需求，也未讨论模型在更广泛组织类型或疾病状态下的泛化能力 | 提高单细胞RNA测序和空间转录组学数据整合的性能，以更好地理解空间背景下的基因表达 | 基因表达数据 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 扩散模型，自回归模型，因果注意力变换器，VAE | 基因表达数据 | 10个组织数据集 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 9040 | 2026-01-14 |
Optimization of Brain Tissue Preservation for Nucleic Acid Stability
2026 Jan-Feb, The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society
DOI:10.1369/00221554251400421
PMID:41489252
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研究论文 | 本文通过优化脑组织保存方案，旨在提高空间转录组学研究中核酸稳定性与细胞结构完整性 | 首次系统比较了不同保存条件对羊脑组织RNA质量和细胞结构的影响，为空间转录组学样本制备提供实证指导 | 研究基于羊脑模型，尚未在人类样本中验证；冷冻方案仍需改进以达到FFPE组织的细胞结构水平 | 优化脑组织保存方法以提升空间转录组学研究的样本质量 | 羊脑组织（n=16）的FFPE和冷冻样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学、RNA完整性分析、组织形态学分析 | NA | RNA质量数据、组织切片图像 | 16个羊脑样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |