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当前共找到 5215 篇文献，本页显示第 881 - 900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2026-05-03 |
Neuronal and glial networks interact with traumatic brain injury to modulate cognition in ABCD study
2026-Mar-13, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00681-8
PMID:41826372
|
研究论文 | 本研究整合基因与轻度创伤性脑损伤相互作用的全基因组关联分析和单细胞RNA测序基因调控网络，揭示了神经元和胶质细胞网络中调节神经认知结果的关键调控因子和分子机制 | 首次在青少年大脑认知发展队列中结合基因与mTBI相互作用的GWAS和单细胞RNA测序调控网络，解析了脑区和细胞类型特异性的mTBI病理调控网络 | 未说明具体局限性 | 阐明轻度创伤性脑损伤影响神经认知的细胞类型特异性分子机制和关键调控因子 | 青少年轻度创伤性脑损伤患者 | 机器学习 | 轻度创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 882 | 2026-05-03 |
Multicellular origins of murine ovarian inflammaging
2026-Mar-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09826-1
PMID:41826404
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学，揭示小鼠卵巢衰老中多细胞起源的炎症老化机制 | 首次结合单细胞和空间转录组学技术，鉴定了与年龄相关的巨噬细胞和T细胞亚群作为卵巢炎症老化的关键促炎信号来源，并预测了这些细胞与颗粒细胞之间的双向信号传导 | 未具体说明局限性 | 阐明卵巢炎症老化的多细胞机制，特别是免疫细胞在衰老过程中的功能及其对卵泡发育的影响 | 老年小鼠卵巢 | 自然语言处理 | 生殖衰老疾病 | 单细胞转录组测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 老年小鼠卵巢样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒、10x Visium空间转录组试剂盒 |
| 883 | 2026-05-03 |
Reconstructing 3D transcriptional organization from spatial transcriptomics reveals consistent oncogenic translocations and developmental dynamics
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag177
PMID:42059481
|
研究论文 | 介绍Cytocraft，一个从二维空间转录组数据重建三维转录组织结构的计算框架，并验证其在肺癌和蝾螈脑发育中的生物学应用 | 首次实现从二维空间转录组数据推断共享的、细胞类型特异的三维转录中心构型，并揭示癌症中MALAT1的定向易位和发育中转录中心重组的保守动态 | 基于仿真验证，可能受限于空间转录组数据的分辨率和噪声，真实三维构型推断的准确性尚需更多实验验证 | 开发一种能从二维空间数据重建三维转录组织结构的计算方法，以探索转录在发育和疾病中的空间组织规律 | 人类非小细胞肺癌样本和发育中的蝾螈脑 | 计算机视觉 | 肺癌 | 空间转录组学 | 计算框架 | 亚细胞空间转录组图谱 | 8例肺癌患者样本和蝾螈脑发育阶段样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 884 | 2026-05-03 |
Integrating and mapping single-cell transcriptomics across the entire gene expression space
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag204
PMID:42059480
|
研究论文 | 提出scGES深度学习框架，通过利用所有基因信息在完整基因表达空间整合单细胞转录组数据，校正批次效应 | 首次利用高度和低度可变基因的全基因表达空间进行批次效应校正，超越仅依赖高度可变基因的现有方法 | 未明确提及局限性 | 开发有效校正批次效应并整合单细胞转录组数据集的方法 | 单细胞转录组数据集及查询数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 深度学习框架 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 885 | 2026-05-03 |
CaHoT-GRN: context-aware high-order topology learning for robust single-cell gene regulatory network inference
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag202
PMID:42059479
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研究论文 | 提出CaHoT-GRN框架，利用上下文感知的高阶拓扑学习实现稳健的单细胞基因调控网络推断 | 创新性地整合预训练生物大语言模型提取序列语义嵌入，并通过异质信息网络和相似性共注意力模块建模高阶基因相互作用与拓扑一致性 | 未在文中明确说明局限性，可能包括依赖预训练模型质量及计算复杂度较高 | 开发一种利用序列上下文信息和蛋白质相互作用知识的高阶拓扑学习框架，提升单细胞基因调控网络推断的准确性和鲁棒性 | 单细胞转录组数据集及相关的基因和蛋白质序列 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 预训练生物大语言模型、异质信息网络、相似性共注意力模块 | 序列数据、单细胞转录组数据 | 四种类型网络对应的单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 886 | 2026-05-03 |
A systems immunology approach reveals divergent immune profiles of RSV and SARS-CoV-2 infections in infants
2026-Feb-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aea7097
PMID:41739901
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研究论文 | 通过系统免疫学方法揭示婴儿RSV和SARS-CoV-2感染的不同免疫特征 | 首次在婴儿中系统比较RSV和SARS-CoV-2感染的免疫反应差异，结合单细胞转录组学和表观基因组学分析 | 样本量较小（RSV 19例，SARS-CoV-2 30例，对照17例），年龄中位数2.3个月，结果可能不适用于更大范围或不同年龄段的婴儿 | 揭示RSV和SARS-CoV-2感染在婴儿中导致不同临床表现的免疫机制 | 婴儿（中位年龄2.3个月），包括RSV感染者、SARS-CoV-2感染者和健康对照 | 机器学学习 | 呼吸道感染 | 单细胞转录组学,表观基因组学,细胞因子分析 | NA | 血液样本 | RSV感染19例，SARS-CoV-2感染30例，健康对照17例（共66例婴儿） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于单细胞转录组学分析 |
| 887 | 2026-05-03 |
DeCAF defines clinical fibroblast subtypes and multidimensional tumor-stroma crosstalk shaping prognosis and immunotherapy response
2026-Feb-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102611
PMID:41707654
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序定义具有临床意义的癌症相关成纤维细胞（CAF）亚型，并揭示其与肿瘤亚型的相互作用及对免疫治疗反应的影响 | 首次定义具有临床预后和治疗反应预测价值的CAF亚型（抑制型和促进型），开发出单样本分类器DeCAF，可直接应用于临床决策 | 未提及具体研究限制 | 通过单细胞RNA测序定义具有临床意义的CAF亚型，并揭示其与肿瘤微环境的相互作用及对免疫治疗反应的影响 | 患者肿瘤样本中的癌症相关成纤维细胞（CAF）亚型 | 机器学习 | 多种肿瘤类型 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | DeCAF分类器 | 单细胞转录组数据 | 多个肿瘤类型患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 888 | 2026-05-03 |
Single-cell atlas of hepatic cellular plasticity and immune niche reprogramming in liver cirrhosis
2026-Feb-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07858-z
PMID:41709311
|
研究论文 | 利用单细胞测序数据绘制肝硬化的肝细胞可塑性和免疫微环境重编程图谱 | 整合多种生物信息学工具（Seurat、Monocle、CellChat等）进行综合分析，揭示了肝硬化中免疫细胞亚型变化、转录因子活性以及细胞间通讯网络的重编程，特别是发现了TNF-α/ETS2、IL-1α/β/THRA和MIF三条关键调控轴 | 仅基于公开的单细胞测序数据集，缺乏实验验证和临床样本验证 | 解析肝硬化中免疫细胞亚型的动态变化及其在疾病发生发展中的作用机制 | 肝硬化患者的肝脏免疫细胞（巨噬细胞、CD4+ T细胞、NK细胞等） | 机器学习和生物信息学 | 肝硬化（肝脏疾病） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 35017个细胞，来自多个肝硬化患者样本 | 多个公开数据集来源 | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 889 | 2026-05-03 |
Identification of Lupus Immune Complex-Driven Pathogenic Pro-inflammatory Monocytes and Macrophages in Systemic Lupus Erythematosus
2026-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.21.700902
PMID:41648138
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示狼疮免疫复合物驱动的促炎性单核细胞和巨噬细胞在系统性红斑狼疮发病机制中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合蛋白组学分析，系统阐明狼疮免疫复合物（如U1-snRNP、dsDNA、Ro60）刺激下促炎性单核/巨噬细胞的转录组和蛋白表达变化，并发现这些细胞在狼疮患者皮肤、肾脏和外周血中扩增，且与I型干扰素信号独立作用 | 未明确说明局限性，但可能包括样本量有限、仅基于体外刺激实验和公共数据集分析，缺乏直接体内验证机制 | 探究狼疮免疫复合物刺激驱动的单核吞噬细胞（单核细胞和巨噬细胞）的异质性和功能，阐明其在系统性红斑狼疮发病中的作用 | 系统性红斑狼疮患者的单核细胞、巨噬细胞，以及狼疮免疫复合物（U1-snRNP、dsDNA、Ro60）刺激的人单核细胞 | 单细胞转录组学，免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序，蛋白组学分析 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白表达数据 | 涉及狼疮患者皮肤、肾脏和外周血样本，以及体外培养的人单核细胞，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 890 | 2026-05-03 |
Insights into Cardiomyocyte Regeneration from Screening and Transcriptomics Approaches
2026-Jan-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27020601
PMID:41596256
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综述 | 本文综述了从筛选和转录组学方法中获得的关于心肌细胞再生的见解 | 创新之处在于整合了高通量筛选与单核RNA测序及空间转录组学等多组学方法，揭示了心肌细胞异质性及其对再生的影响，并比较了不同筛选模型的优缺点 | 局限性在于仍需进一步研究以识别可转化且安全的靶点，以在临床环境中诱导功能性心肌细胞扩增 | 研究目的为通过比较高通量筛选策略和总结多组学方法，为心脏再生研究提供综合框架，指导未来治疗开发 | 研究对象为心肌细胞（包括成年心肌细胞、啮齿类心肌细胞、人诱导多能干细胞来源的心肌细胞和心脏类器官）以及斑马鱼胚胎等模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 高通量筛选, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 891 | 2026-05-03 |
Exploring Vitamin D Signaling-Associated Biomarkers and Their Diagnostic Value in Diabetic Retinopathy: A Combined Transcriptomic and Single-Cell Analysis With Experimental Validation
2026, Journal of diabetes research
IF:3.6Q2
DOI:10.1155/jdr/7240252
PMID:42059276
|
研究论文 | 通过转录组和单细胞分析结合实验验证，探索糖尿病视网膜病变中维生素D信号相关的生物标志物及其诊断价值 | 首次系统识别出DR中VD信号相关的下游候选基因SLC36A1和RAB23，并通过单细胞分析揭示其细胞异质性和免疫细胞互作网络 | 生物标志物表达验证仅基于临床样本的RT-qPCR，尚缺乏更大样本量和功能研究的支持 | 识别糖尿病视网膜病变中与维生素D信号相关的生物标志物，并评估其诊断价值 | 糖尿病视网膜病变患者样本及公开数据库中的基因表达数据 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 支持向量机递归特征消除（SVM-RFE） | 基因表达数据 | 包含公开数据集及临床样本，临床样本中DR组与对照组各若干例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 892 | 2026-05-03 |
The Role of Chemokine-Related Genes in Diffuse Large B-Cell Lymphoma Prognosis and Tumor Microenvironment Characteristics
2026, Analytical cellular pathology (Amsterdam)
DOI:10.1155/ancp/6659091
PMID:42060374
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研究论文 | 该研究探讨了趋化因子相关基因在弥漫大B细胞淋巴瘤预后及肿瘤微环境特征中的作用 | 首次基于趋化因子相关基因构建预后风险模型，并揭示其与肿瘤免疫微环境的关联 | NA | 研究趋化因子相关基因与弥漫大B细胞淋巴瘤预后及免疫微环境的潜在关联 | 弥漫大B细胞淋巴瘤患者 | 机器学习 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | Lasso-Cox回归分析 | Lasso-Cox | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 893 | 2026-05-03 |
Single-cell RNA sequencing of healthy and diseased rat temporomandibular joint condyle cartilage
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0348175
PMID:42060618
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析健康与骨关节炎大鼠颞下颌关节髁状突软骨的细胞组成和变化 | 首次在单细胞水平解析颞下颌关节软骨的细胞异质性，揭示纤维软骨细胞样群体来源的三种细胞命运及共享祖细胞来源的两种软骨细胞命运，发现多效蛋白在增殖区软骨细胞祖细胞中特异性表达 | 未明确提及具体局限性，但可推测大鼠模型与人类TMJOA的差异可能限制临床转化 | 阐明颞下颌关节骨关节炎的细胞病理变化机制，为疾病治疗提供潜在靶点 | 成年大鼠的健康与骨关节炎诱导的髁状突软骨 | 单细胞转录组学 | 颞下颌关节骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 成年大鼠髁状突软骨样本（健康组与OA诱导组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 894 | 2026-05-02 |
Integrating bulk and single-cell transcriptomic data to construct a risk model for histidine metabolism-related epithelial cell features in lung adenocarcinoma, predicting prognosis and immune landscape
2026-Dec-31, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2026.2662721
PMID:42003422
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研究论文 | 整合批量与单细胞转录组数据构建基于组氨酸代谢相关上皮细胞特征的肺腺癌风险模型，用于预测预后和免疫微环境 | 首次通过整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，聚焦于组氨酸代谢相关的上皮细胞亚群，构建了具有预后意义的风险模型，并鉴定了七个关键基因 | 未在独立外部队列中验证模型的通用性，且未进行功能性实验验证基因的生物学机制 | 构建基于组氨酸代谢相关上皮细胞特征的肺腺癌预后风险模型，并评估其与免疫微环境的关系 | 肺腺癌患者 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | Cox回归模型, LASSO回归模型 | 转录组数据 | 多组公共数据集中的批量RNA-seq和单细胞RNA-seq样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | UCSC Xena, Code Ocean | NA |
| 895 | 2026-05-02 |
Nigrostriatal dopaminergic vulnerability in Parkinson's disease: Neuroprotective strategies
2026-Aug-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-00380
PMID:40808403
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综述 | 综述帕金森病中黑质纹状体多巴胺能神经元选择性易损性的机制及神经保护策略 | 整合单核RNA测序和空间转录组学揭示的多巴胺能亚型特异性转录应激特征，并提出基于亚型选择性的精准靶向治疗策略 | 未详细讨论不同神经保护策略的临床试验结果或转化障碍 | 理解黑质纹状体多巴胺能神经元选择性易损性的分子和细胞机制，并评估新兴神经保护策略 | 帕金森病中黑质纹状体多巴胺能神经元及其亚型（如AGTR1+/SOX6+和RIT2+群体） | 数字病理学 | 帕金森病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 896 | 2026-05-02 |
Aquaporin 4 knockdown alleviates traumatic brain edema and reduces neuronal axonal growth cone collapse via the RhoA/ROCK pathway
2026-06-01, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2026.107390
PMID:41967652
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研究论文 | 通过调控AQP4表达，探讨其对创伤性脑损伤后脑水肿及神经修复的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示AQP4敲低通过减少星形胶质细胞分泌Sema3A，经RhoA/ROCK通路减轻神经元轴突生长锥塌陷，从而发挥神经保护作用 | NA | 阐明AQP4过表达引起的水肿对神经元修复的影响机制，并评估其作为临床治疗靶点的潜力 | 创伤性脑损伤小鼠模型 | 机器学习和数字病理学 | 创伤性脑损伤 | scRNA-seq, DTI-MRI | NA | 单细胞转录组数据, 磁共振成像数据 | 创伤性脑损伤小鼠，样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 897 | 2026-05-02 |
Tet2 deficiency alters CD4+ T cell function and promotes T cell lymphoma with a TFH cell immunophenotype
2026-Jun-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250194
PMID:42047684
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研究论文 | Tet2缺失改变CD4+ T细胞功能并促进具有TFH细胞免疫表型的T细胞淋巴瘤发生 | 首次揭示了Tet2缺失通过表观遗传改变导致TFH样淋巴瘤转化的机制，并发现ICOS(L)-PI3K信号通路在其中的关键作用 | NA | 探究Tet2突变如何通过表观遗传失调启动恶性T细胞转化 | Tet2基因敲除的CD4+ T细胞及小鼠T细胞淋巴瘤模型 | 机器学习 | T细胞淋巴瘤 | scRNA-seq, 转录组学, 表观遗传学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | Tet2缺失小鼠及人类CD4+ T细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 898 | 2026-05-02 |
Screening of metabolic-related biomarkers linking intervertebral disc degeneration and type 2 diabetes based on comprehensive bioinformatics analysis and machine learning
2026-Jun, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2026.102593
PMID:42064579
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研究论文 | 基于生物信息学分析和机器学习筛选椎间盘退变与2型糖尿病相关的代谢生物标志物 | 首次综合运用多种机器学习算法（Boruta、随机森林、支持向量机、XGBoost）和单细胞测序技术鉴定IVDD与T2D的共同生物标志物AMBP，并验证其与BCAA代谢及免疫细胞浸润的相关性 | 缺少对AMBP在两种疾病中直接因果机制的深入实验验证，且因数据库限制可能有数据偏差 | 识别椎间盘退变（IVDD）和2型糖尿病（T2D）的共同生物标志物并评估其诊断价值 | 椎间盘退变组织和2型糖尿病患者样本 | 机器学习, 生物信息学 | 椎间盘退变, 2型糖尿病 | 差异表达分析, 机器学习（Boruta、RF、SVM、XGBoost）, CYBERSORT免疫浸润分析, 单细胞测序, 临床样本验证 | Boruta, 随机森林, 支持向量机, XGBoost | 基因表达数据（GEO数据库）, 单细胞RNA测序数据 | 两个GEO数据集（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 899 | 2026-05-02 |
Impact of enteric neuronal loss on intestinal cell composition
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115491
PMID:42063560
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究肠神经元缺失对野生型和突变型斑马鱼肠道细胞组成的影响，并验证于人类HSCR组织 | 首次系统揭示肠神经系统缺失对肠道细胞组成的影响，包括免疫细胞增加、上皮细胞代谢紊乱及ECM产生细胞纤维化标志物富集，并验证了临床相关性 | 未提及具体局限 | 探究肠神经元缺失对肠道稳态维持的影响及其潜在机制 | 野生型和突变型（HSCR模型）斑马鱼以及人类HSCR组织 | 数字病理学 | 先天性巨结肠 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量，包括野生型和突变型斑马鱼及人类HSCR组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 900 | 2026-05-02 |
Wnt3-mediated fibrosis and carcinogenesis of lung squamous cell carcinoma in idiopathic pulmonary fibrosis
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115667
PMID:42063567
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示特发性肺纤维化相关肺鳞癌中Wnt3介导的纤维化与癌变机制 | 首次利用单细胞RNA测序和数字空间分析，阐明IPF相关LUSC起源于AT2细胞转分化的化生基底细胞，并揭示Wnt3在此过程中的关键作用 | 样本量较小（仅7例UIP患者），且机制验证主要依赖细胞系模型，需进一步在体内模型中确认 | 探索IPF增加LUSC风险的分子机制，特别是Wnt信号在纤维化与癌变关联中的作用 | 伴有寻常型间质性肺炎的肺鳞癌标本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、数字空间分析、多组学分析 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 7例UIP患者的LUSC标本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |