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当前共找到 9342 篇文献，本页显示第 861 - 880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2026-09-19 |
MZB1 expression levels are associated with long-term maintenance of high anti-HBs titers: single-cell RNA-seq with validation by nested case-control and intervention studies
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1913957
PMID:42751130
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序发现MZB1在长期维持高抗-HBs滴度个体的B细胞中显著上调，并通过巢式病例对照和干预研究验证了血清MZB1水平与乙肝疫苗应答强度的关联 | 首次发现MZB1表达与乙肝疫苗接种后长期维持高抗-HBs滴度相关，并揭示血清MZB1可作为预测乙肝疫苗抗体应答的生物标志物，且MZB1在抗-HBs出现之前即被疫苗诱导升高 | 单细胞RNA测序样本量较小（仅20例），验证队列样本量有限（巢式病例对照102例、干预研究79例），且未深入探讨MZB1的上游调控通路及功能机制 | 探究乙肝疫苗接种后长期维持高抗-HBs滴度的潜在机制，并寻找可预测疫苗应答的生物标志物 | 接种乙肝疫苗后维持高抗-HBs滴度超过30年的受试者、已血清转化的受试者、乙肝疫苗低应答或无应答者 | 机器学习 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 单细胞RNA测序20例（10例高抗-HBs滴度维持者+10例血清转化者），巢式病例对照研究102例，干预研究79例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 862 | 2026-09-19 |
HIV-driven tumor ecosystem: from chronic immune dysfunction to cancer evolution
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1901762
PMID:42751305
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综述 | 该综述将HIV相关恶性肿瘤的病毒学、免疫学、肿瘤微环境和临床治疗反应整合为一个系统性的“肿瘤生态系统”框架 | 首次将KSHV、EBV、HPV等单个致癌病毒视角与免疫功能障碍视角整合为统一的系统性肿瘤生态系统框架，涵盖病毒学、免疫学、肿瘤微环境和临床治疗反应 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，主要基于已有文献的综合分析 | 构建HIV相关恶性肿瘤的肿瘤生态系统理论框架，指导精准预防和治疗策略 | HIV感染患者的肿瘤生态系统，包括淋巴瘤和卡波西肉瘤等HIV相关癌症 | 肿瘤免疫学 | HIV相关恶性肿瘤 | 单细胞组学，空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 863 | 2026-09-18 |
In Vivo CRISPR Interference Screen Reveals Long Noncoding RNA Portfolio Crucial for Cutaneous Squamous Cell Carcinoma Tumor Growth
2026-Jan, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.038
PMID:40441291
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研究论文 | 通过对正常和cSCC人类皮肤组织的单细胞测序数据进行假体分析，并结合体外和体内CRISPR干扰筛选，鉴定出影响皮肤鳞状细胞癌生长的关键长链非编码RNA | 首次通过体内CRISPR干扰筛选结合单细胞测序假体分析，系统性揭示了长链非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌生长中的调控作用，并验证了LINC00704和LINC01116作为cSCC生长调控因子和潜在生物标志物 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 揭示长链非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌生长中的调控作用和机制 | 正常和cSCC人类皮肤组织中的角质形成细胞亚群及cSCC细胞系 | 数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞测序, CRISPR干扰筛选 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 864 | 2026-09-18 |
Unraveling the Role of Perivascular Macrophages in Alzheimer's Disease: Insights from the Crosstalk between Immunometabolism and Ferroptosis
2026, Current neuropharmacology
IF:4.8Q1
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序数据和孟德尔随机化分析，揭示了阿尔茨海默病中血管周围巨噬细胞在免疫代谢与铁死亡交叉对话中的作用 | 首次从免疫代谢与铁死亡交叉对话的角度，结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法，系统揭示血管周围巨噬细胞在阿尔茨海默病中的保护性机制，并鉴定出八个关键因果基因 | 研究主要基于公共数据库的生物信息学分析，缺乏实验验证；样本量有限；未进行体内外功能实验证实关键基因的具体机制 | 探究血管周围巨噬细胞在阿尔茨海默病发病机制中的作用，特别是免疫代谢与铁死亡交叉对话相关的分子通路 | 阿尔茨海默病患者和对照受试者的血管周围巨噬细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 | NA | 文本, 基因表达数据 | 来自GEO数据库的阿尔茨海默病患者和对照受试者的血管周围巨噬细胞单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 865 | 2026-09-17 |
Stratifying lung adenocarcinoma: a novel prognostic model based on mitochondrial outer membrane permeabilization activity
2026-Oct, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-026-05058-6
PMID:42745950
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研究论文 | 该研究利用TCGA-LUAD和GSE42127数据集，通过多种分析方法和机器学习算法构建了一个基于线粒体外膜通透化（MOMP）相关基因的肺腺癌预后模型，并评估其生物学意义和临床价值。 | 首次基于MOMP活性相关基因构建肺腺癌预后模型，结合多种机器学习算法和孟德尔随机化分析，并整合单细胞RNA测序数据揭示免疫微环境重塑。 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 识别与肺腺癌MOMP活性相关的预后基因，构建预后模型，并评估其生物学意义和临床价值。 | 肺腺癌（LUAD）患者 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 梯度提升机（GBM） | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞数据 | 训练队列TCGA-LUAD和验证队列GSE42127，具体样本量未明确 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 866 | 2026-09-17 |
Inhibition of Jaw Bone Marrow Mesenchymal Stem Cell Cuproptosis Attenuates Bone Loss in Apical Periodontitis via Suppressing the FoxO Signalling Pathway
2026-Sep-16, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.70266
PMID:42746789
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研究论文 | 本研究探讨了铜死亡在根尖周炎骨丧失中的作用，并发现抑制颌骨骨髓间充质干细胞铜死亡可通过FoxO信号通路减轻骨丧失 | 首次揭示铜死亡是根尖周炎牙槽骨丧失的新型驱动因素，并阐明铜死亡通过FoxO/β-catenin轴损害颌骨骨髓间充质细胞成骨功能的机制，提出TTM靶向铜死亡作为治疗策略 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 研究铜死亡在根尖周炎骨丧失中的参与及其调控机制 | 根尖周炎患者根尖周组织标本、根尖周炎大鼠模型、颌骨骨髓间充质干细胞（JBMMSCs） | 单细胞组学、骨生物学 | 根尖周炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、LC-MS/MS蛋白质组学、micro-CT、H&E染色、免疫组化、qRT-PCR、Western blotting | NA | 图像、文本、单细胞转录组数据 | 来自健康受试者或根尖周炎患者的根尖周标本；3个scRNA-seq数据集（GSE171213、GSE181688、GSE197680）；根尖周炎大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 867 | 2026-09-17 |
Ruscogenin Targets TXNIP to Suppress PANoptosis and Inflammation in Periodontitis
2026-Sep-15, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70402
PMID:42745234
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研究论文 | 本研究探索了PANoptosis在牙周炎中的作用，识别了关键PANoptosis相关基因TXNIP，并验证了Ruscogenin作为靶向TXNIP的小分子抑制剂可抑制PANoptosis和牙周炎症 | 首次揭示TXNIP作为牙周炎中PANoptosis的关键调控因子，并发现Ruscogenin可通过靶向TXNIP抑制PANoptosis和炎症，为牙周炎治疗提供了新的小分子药物候选 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探索PANoptosis在牙周炎中的作用，识别关键PANoptosis相关基因并评估潜在小分子抑制剂 | 牙周炎患者牙龈组织、临床样本、小鼠牙周炎模型及细胞实验 | 机器学习 | 牙周炎 | 单细胞RNA-seq，分子对接，分子动力学模拟，ssGSEA，WGCNA | 多种机器学习方法 | 基因表达数据，图像，文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 868 | 2026-09-17 |
Machine learning and multi-omics clustering to map cellular rewiring and immune evasion in ccRCC
2026-Sep-15, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-01024-8
PMID:42745293
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研究论文 | 该研究结合机器学习与多组学聚类，构建了ccRCC的共识机器学习驱动特征（CMLS），并利用空间转录组和单细胞RNA测序解析了肿瘤微环境中的细胞重编程和免疫逃逸机制 | 开发了一个整合框架，将宏观生存风险与微观肿瘤微环境结构相联系；使用101种机器学习组合生成24基因CMLS；结合空间转录组和14万细胞scRNA-seq图谱解码特征的细胞起源；发现CMLS在预测ICB获益方面优于肿瘤突变负荷 | 样本量相对有限（三个独立队列和17对临床组织），需要更大规模的前瞻性验证；RT-qPCR仅验证了5个核心基因 | 克服ccRCC中肿瘤微环境异质性对免疫检查点阻断疗效的限制，建立连接宏观生存风险与微观TME结构的整合框架，并开发能够预测ICB获益的患者分层工具 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者及其肿瘤微环境 | 机器学习, 数字病理学, 多组学 | 肾细胞癌 | 多组学聚类, 空间转录组, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 机器学习 | SuperPC, 机器学习组合模型 | 图像, 文本, 基因表达数据 | 三个独立队列，140,000个细胞的scRNA-seq图谱，17对ccRCC临床组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 869 | 2026-09-17 |
Single-cell transcriptomics reveals distinct microglial state remodeling associated with the (R)-nicotine/diosmetin combination and galantamine in LPS-challenged BV2 cells
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1901868
PMID:42745774
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组学揭示了(R)-尼古丁/地奥司明联合用药与加兰他敏在LPS刺激的BV2细胞中诱导的不同小胶质细胞状态重塑。 | 首次在单细胞分辨率上比较了(R)-尼古丁、地奥司明、其联合用药(DR)及加兰他敏对LPS刺激BV2小胶质细胞异质性转录状态的影响，并结合RNA velocity与SCENIC调控子推断揭示了不同治疗相关的转录与调控模式差异。 | 研究使用BV2小胶质细胞样细胞系而非原代小胶质细胞或体内模型，可能无法完全反映体内小胶质细胞的复杂性与微环境相互作用。 | 在单细胞分辨率上比较(R)-尼古丁、地奥司明、其联合用药及加兰他敏对LPS刺激的BV2小胶质细胞异质性转录状态的重塑作用。 | LPS刺激的BV2小胶质细胞样细胞 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 每组3个生物学重复，共4组（LPS对照、(R)-尼古丁、地奥司明、DR联合用药、加兰他敏），共12个样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 870 | 2026-09-17 |
Donor-dependent heterogeneity and matrix-remodeling transcriptional programs in COL2A1-variant urine-derived cell cultures with IGF1-associated cell-state shifts
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1920598
PMID:42745831
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研究论文 | 该研究通过软骨诱导尿液来源细胞（chUDCs）比较COL2A1变异患者与健康对照的转录组差异，并探索IGF1对细胞状态的影响 | 首次利用COL2A1变异患者来源的尿液衍生细胞进行软骨诱导，结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq揭示供体依赖性异质性和基质重塑转录程序，并发现IGF1相关细胞状态转变 | 未对IGF1处理的对照供体细胞系进行单细胞测序分析，因此IGF1相关变化仅为探索性结果，不能声称是COL2A1特异性效应；样本量较小（3例患者和3例对照） | 探索COL2A1相关生长障碍中软骨生物学和生长因子响应性的转录程序 | 携带杂合致病性COL2A1变异的个体的尿液来源细胞及健康对照的尿液来源细胞 | 数字病理学, 机器学习 | COL2A1相关骨骼发育不良 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 文本, 图像 | 3例COL2A1变异患者和3例健康对照的尿液来源细胞，其中2例患者来源细胞系进行了单细胞RNA测序 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 871 | 2026-09-17 |
Network-informed deconvolution of bulk immune gene co-expression reveals single-cell programs and spatial organization
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1843602
PMID:42745838
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研究论文 | 该研究开发了一种网络信息引导的解卷积框架，利用批量RNA-seq数据构建免疫相关基因的贝叶斯网络调控结构，并将其投影到单细胞RNA-seq数据上以识别免疫细胞状态，同时结合空间转录组学评估其空间一致性 | 提出了一种网络信息引导的解卷积框架，利用贝叶斯网络从批量RNA-seq数据中提取调控结构，并将网络标志物投影到单细胞数据中以定义免疫细胞状态，而非仅依赖传统的基于表达的聚类分析，同时整合了批量转录组、单细胞转录组和空间转录组三个尺度的数据 | 摘要中未明确说明该研究的局限性 | 开发一种网络信息引导的解卷积框架，以识别免疫细胞亚群并表征其功能，同时将批量免疫基因共表达、单细胞程序和空间组织联系起来 | 外周血单个核细胞（PBMC）和肺腺癌（LUAD）单细胞RNA-seq数据集，以及空间转录组数据集和背景匹配的批量RNA-seq队列 | 机器学习 | 肺癌 | scRNA-seq, 批量RNA-seq, 空间转录组学 | 贝叶斯网络 | 文本（基因表达数据） | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 872 | 2026-09-17 |
PAFAH1B1 governs follicular development by modulating the protein complex of CCNE1-CDK2-CDK1 to induce cell cycle arrest
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1919659
PMID:42745890
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和整合分析发现PAFAH1B1参与细胞周期调控，并证实PAFAH1B1通过结合CCNE1-CDK2-CDK1复合物阻滞G2/M期，从而抑制颗粒细胞增殖和卵泡发育 | 首次在猪基因型-组织表达数据库中发现PAFAH1B1作为细胞周期的新型调控因子，揭示了PAFAH1B1通过物理结合CCNE1-CDK2-CDK1复合物阻滞G2/M期来抑制颗粒细胞增殖和卵泡发育的新机制，并证明了CpG岛去甲基化可促进PAFAH1B1转录 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究卵泡发育过程中颗粒细胞增殖和细胞周期调控的分子机制，鉴定参与细胞周期调控的新基因 | 猪卵巢颗粒细胞和卵泡 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，免疫共沉淀，流式细胞术，EdU染色，HE染色，TUNEL检测，染色质可及性分析，CRISPR/dCas9-TET1表观遗传编辑 | NA | 图像，文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 873 | 2026-09-17 |
Identification of Wnt/β-catenin- and immune-related genes in hepatic ischemia-reperfusion injury using bulk transcriptomics, single-cell RNA sequencing, and a murine model
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1745640
PMID:42745923
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研究论文 | 该研究通过整合肝脏移植相关转录组数据集与单细胞RNA测序数据，结合小鼠肝缺血再灌注损伤模型，筛选并验证了与Wnt/β-catenin信号通路评分和免疫调控相关的关键基因HSP90AA1、HSP90AB1、NFATC1和THBS1 | 首次联合bulk转录组学、单细胞RNA测序和非移植小鼠HIRI模型，基于Wnt/β-catenin信号评分和免疫调控整合分析，识别并验证了HSP90AA1、HSP90AB1、NFATC1和THBS1四个关键生物标志物，并构建了TF-mRNA及lncRNA-miRNA-mRNA调控网络 | 非移植小鼠HIRI模型仅提供初步表达验证，关键基因的时间依赖性意义和 therapeutic 价值仍需在肝移植模型及基因功能干预实验中进一步验证 | 筛选与肝移植后肝缺血再灌注损伤中Wnt/β-catenin信号评分和免疫调控相关的关键基因 | 肝移植相关肝缺血再灌注损伤患者转录组数据及非移植小鼠HIRI模型 | 数字病理学 | 肝移植相关肝缺血再灌注损伤 | bulk转录组测序, 单细胞RNA测序, qPCR, Western blot, 组织学分析, 血清学评估 | WGCNA, Boruta, LASSO, CIBERSORT | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像, 文本 | 三个肝移植相关转录组数据集（GSE151648、GSE12720、GSE189539）及非移植小鼠HIRI模型样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 874 | 2026-09-17 |
Tekt2 regulates hair cell development and function by maintaining normal kinocilium morphology in zebrafish
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1898887
PMID:42745927
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序、原位杂交、基因功能缺失与拯救实验、行为学检测、扫描电镜和FM染料摄取等方法，揭示了Tekt2在斑马鱼感觉毛细胞中通过维持动纤毛正常形态来调控毛细胞发育与功能的作用 | 首次系统阐明Tekt2在斑马鱼感觉毛细胞中富集于毛细胞顶端和动纤毛，并证明其缺失会导致动纤毛形态异常、毛束组织紊乱、顶端极性破坏及机械转导功能受损，明确了tektin家族蛋白在感觉毛细胞形态发生和功能中的关键作用 | 研究主要基于斑马鱼模型，未在哺乳动物或人类毛细胞中验证Tekt2功能的保守性，且对Tekt2调控动纤毛形态的具体分子机制探讨尚不深入 | 探究tektin 2（tekt2）在斑马鱼感觉毛细胞中的表达模式及其在毛细胞形态发生、动纤毛维持和机械转导功能中的作用 | 斑马鱼的感觉毛细胞，包括神经丘、斑和嵴中的毛细胞 | 发育生物学、听力与平衡觉研究 | 听力障碍、前庭功能障碍 | 单细胞RNA测序、整胚原位杂交、基因功能缺失与拯救分析、行为学检测、扫描电子显微镜、FM染料摄取实验 | 斑马鱼基因敲除与转基因拯救模型 | 图像、文本、行为学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 875 | 2026-09-17 |
Complement expression profiles in human glomerular mesangial cells, endothelial cells, podocytes and proximal tubular epithelial cells
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1881549
PMID:42746023
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研究论文 | 该研究综合表征了非疾病人肾组织中肾小球系膜细胞、肾小球内皮细胞、足细胞和近端肾小管上皮细胞中补体成分的表达谱 | 首次系统全面地比较了四种人肾固有细胞中经典途径、凝集素途径和替代途径相关补体成分及其调控因子的表达特征，并结合培养细胞实验与单细胞RNA测序数据进行了验证 | 研究主要基于体外培养细胞和公共数据库及单细胞测序数据，缺乏蛋白质水平的全面验证，且仅关注非疾病肾组织，未涉及疾病状态下的补体表达变化 | 全面表征非疾病人肾组织中四种肾固有细胞的补体成分表达谱 | 人肾小球系膜细胞、肾小球内皮细胞、足细胞和近端肾小管上皮细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RT-PCR、免疫荧光染色、单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | 四种人肾固有细胞（培养细胞）及公共单细胞RNA测序数据集中的非疾病人肾组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序 |
| 876 | 2026-09-17 |
Aqueous humour extracellular vesicle membrane protein profiling reveals pathological features of refractory macular edema
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1880885
PMID:42746022
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研究论文 | 本研究通过分析房水来源的细胞外囊泡膜蛋白，揭示了难治性糖尿病性黄斑水肿和视网膜静脉阻塞相关黄斑水肿的不同病理特征和通路 | 首次利用EV Array芯片对房水细胞外囊泡膜蛋白进行高通量分析，发现了难治性DME和RVO-ME的病因特异性通路的差异，并鉴定出可高精度区分难治性病例的EV蛋白标志物 | 样本量较小（共28例患者），需要更大规模的队列研究验证；仅分析了膜蛋白，未涵盖EV其他组分；随访时间未明确 | 探究房水来源的细胞外囊泡膜蛋白能否表征黄斑水肿对抗VEGF治疗的难治性，并揭示不同病因的特异性通路 | 28例DME或RVO-ME患者（各14例），分为初治亚组和难治亚组 | 数字病理学 | 黄斑水肿 | EV Array芯片蛋白组学分析、生物信息学分析、单细胞RNA-seq数据分析 | NA | 蛋白表达数据、文本 | 28例患者房水样本（14例DME，14例RVO-ME） | NA | bulk RNA-seq | EV Array芯片（435抗体） | EV Array芯片靶向435种抗体进行细胞外囊泡膜蛋白谱分析，并利用公共单细胞RNA-seq数据进行细胞来源映射 |
| 877 | 2026-09-17 |
Spatial immune biomarkers in triple-negative breast cancer: emerging evidence, technology trade-offs, and barriers to clinical translation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1899098
PMID:42746148
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综述 | 本文综述了三阴性乳腺癌中空间免疫生物标志物的研究进展，比较了多种空间成像与转录组技术，并讨论了其临床转化的障碍 | 系统梳理了TNBC中空间免疫生物标志物的新兴证据，并对多重免疫荧光、MIBI-TOF、成像质谱流式、空间转录组学和基于H&E的人工智能等技术进行了多维度比较，指出了临床转化面临的采样、分割和阈值选择等挑战 | 大多数报告的预后或治疗反应关联仍为回顾性或探索性，标志物定义对采样、分割和阈值选择敏感，缺乏前瞻性验证 | 探讨三阴性乳腺癌中空间免疫生物标志物的研究现状、技术权衡及临床转化障碍 | 三阴性乳腺癌患者的肿瘤免疫微环境 | 数字病理学, 空间生物学 | 三阴性乳腺癌 | 多重免疫荧光, 飞行时间多重离子束成像, 成像质谱流式, 空间转录组学, 基于H&E的人工智能 | 人工智能 | 图像, 空间转录组数据 | NA | NA | 多重免疫荧光, 飞行时间多重离子束成像, 成像质谱流式, 空间转录组学 | NA | NA |
| 878 | 2026-09-17 |
Multi-omics and machine learning reveal LYZ and ISG15 as diagnostic and therapeutic targets in autoimmune-mediated chronic kidney disease
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1922463
PMID:42746275
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研究论文 | 该研究整合转录组学、单细胞RNA测序和机器学习方法，识别出LYZ和ISG15作为自身免疫介导的慢性肾脏病的诊断生物标志物和治疗靶点，并通过动物模型验证了槲皮素和全反式维甲酸的治疗效果 | 首次通过多算法整合（LASSO、随机森林、Boruta和MCODE）结合多组学数据系统鉴定LYZ和ISG15作为自身免疫介导CKD的核心诊断标志物，并发现槲皮素和ATRA可靶向逆转其过表达从而减轻肾脏纤维化 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 系统识别参与自身免疫介导的慢性肾脏病进展的关键特异性基因，寻找早期诊断生物标志物和特异性治疗靶点 | 自身免疫介导的慢性肾脏病患者样本及IRI小鼠模型 | 机器学习 | 慢性肾脏病 | 转录组学、单细胞RNA测序 | LASSO、随机森林、Boruta、人工神经网络（ANN） | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 879 | 2026-09-16 |
A multi-modal profiling workflow of transcriptomics and biomineralization demonstrated on a tooth-on-chip model
2026-Dec, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2026.104137
PMID:42733539
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研究论文 | 本文提出了一种适用于纤维蛋白水凝胶牙齿芯片模型的多模态分析工作流程，整合了整体RNA提取、细胞分选、空间转录组学和光谱/超微结构成像五种方法，用于表征牙上皮-间充质相互作用的转录程序和矿化形成 | 首次将五种成熟分析方法适配到纤维蛋白水凝胶牙齿芯片构建体上，建立了多模态分析工作流程，实现了对牙齿芯片共培养系统的转录组分析和生物矿化表征，并发现了纤维蛋白溶解与下游细胞分选之间的平台级不兼容性 | 空间转录组学所需的固定策略虽保留了组织形态但牺牲了RNA质量；拉曼光谱结合透射电镜虽能评估磷酸钙沉积但确认成熟羟基磷灰石仍需进一步验证；纤维蛋白溶解与下游分选存在平台级不兼容性 | 建立一种实用的多模态分析框架，用于基准测试纤维蛋白基牙齿芯片及相关器官芯片共培养系统中的分析读数 | 纤维蛋白水凝胶基牙齿芯片构建体中的牙上皮-间充质共培养系统 | 数字病理学 | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学, 磁激活细胞分选, 拉曼光谱, 透射电子显微镜 | NA | RNA序列数据, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 880 | 2026-09-16 |
From planktonic to biofilm states: single-cell transcriptomics reveals metabolic reprogramming and cellular heterogeneity in Acinetobacter baumannii
2026-Dec, Biofilm
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.bioflm.2026.100393
PMID:42733702
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，追踪鲍曼不动杆菌从浮游状态到生物膜状态的动态形成过程，揭示了生物膜发育过程中的代谢重编程和细胞异质性 | 首次在单细胞分辨率下全面描绘鲍曼不动杆菌生物膜形成的转录景观，识别了从浮游状态到生物膜状态转变的关键分支点（Node 2），并揭示了各亚群特异性的代谢特征 | 研究仅基于转录组层面的分析，所揭示的潜在治疗靶点仍需通过靶向突变和功能实验进一步验证 | 在单细胞分辨率下阐明鲍曼不动杆菌生物膜形成的转录景观，探索潜在的治疗靶点 | 鲍曼不动杆菌（Acinetobacter baumannii）生物膜形成过程中的不同状态亚群 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 文本 | 浮游状态（AB_0h）、12小时混合群体（M_12h）和48小时成熟生物膜（BF_48h）样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |