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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2026-07-04 |
Multi-Omics Analysis Reveals Sex-Specific Signatures for BCG Vaccine Efficacy
2026-02, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70144
PMID:41677158
|
研究论文 | 利用多组学数据分析BCG疫苗效力的性别特异性特征 | 首次通过大规模多组学分析系统揭示性别差异对BCG疫苗效力的决定因素 | 仅基于单一队列的321名健康个体数据,可能无法推广到其他人群或疫苗 | 理解BCG疫苗效力的性别特异性差异,以优化疫苗效果 | 321名接种BCG疫苗的健康个体 | 机器学习 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫细胞频率、单细胞RNA测序、血浆蛋白、代谢物、DNA甲基化数据 | 321名健康个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 842 | 2026-07-04 |
GeoMx and RNAscope: A Comparative Assessment of Their Utility for Spatial mRNA Expression Profiling in Formalin-Fixed Breast Cancer Tissue
2026-02, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.70020
PMID:41795633
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研究论文 | 比较GeoMx数字空间分析仪与RNAscope在福尔马林固定乳腺癌组织中进行空间mRNA表达分析的效用 | 首次系统比较GeoMx高多重空间转录组学技术与RNAscope原位杂交方法在福尔马林固定乳腺肿瘤组织中的定量表达一致性 | PD-L1表达仅在单个核心中较高,无法进行相关性分析;样本局限于乳腺癌组织,且仅评估三个基因的RNAscope探针 | 评估GeoMx与RNAscope两种空间表达谱分析技术的定量一致性及各自优势 | 两个组织微阵列中的乳腺癌症样本,包括三阴性乳腺癌(n=48)和不同ER/HER2状态样本(n=45) | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,原位杂交 | NA | 图像 | 93个乳腺癌症样本(两个组织微阵列) | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx Cancer Transcriptomics Atlas (CTA) 覆盖约1,800个基因 |
| 843 | 2026-07-04 |
S100A8/A9 Promotes Fibrosis in Iatrogenic Laryngotracheal Stenosis
2026-01, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.70008
PMID:40776636
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光技术发现S100A8/A9在医源性喉气管狭窄中高表达,并在小鼠模型中证实其促进纤维化作用 | 首次通过体内实验明确S100A8/A9促进医源性喉气管狭窄纤维化的机制,并揭示其下游调控蛋白MYD88的参与 | 仅在小鼠模型验证,未在人样本中进行干预实验;样本量较小且未阐明S100A8/A9与其他免疫介质的相互作用 | 阐明S100A8/A9在医源性喉气管狭窄发病机制中的作用 | 人类喉气管狭窄组织标本及医源性喉气管狭窄诱导的小鼠模型 | 数字病理学 | 喉气管狭窄 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 基因表达分析 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 人类标本(具体数量未说明);小鼠模型(每组数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 844 | 2026-07-04 |
Artificial Intelligence in single-cell and spatial transcriptomics data analyses
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.011
PMID:41986013
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综述 | 探讨人工智能在单细胞和空间转录组学数据分析中的应用 | 系统综述了AI方法(如CNN、GNN和VAE)在预处理、降维、细胞分类、整合多组学及推断细胞轨迹中的应用,并聚焦于癌症生物学、免疫学和神经科学领域 | 存在可扩展性、可解释性和数据标准一致性不足的挑战 | 提供AI推动单细胞和空间转录组学数据解析的全面指南 | 单细胞和空间转录组学数据集及AI分析方法 | 机器学习 | 癌症、免疫疾病、神经疾病 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序 | 卷积神经网络、图神经网络、变分自编码器 | 基因表达数据、空间转录数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 845 | 2026-07-04 |
AI-driven gene-sets, networks, pathways, and interactions analyses of multi-omics data
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.023
PMID:41986006
|
研究论文 | 介绍了PAGER 3.0知识生态系统,用于分析多组学数据中的基因集、网络、通路和相互作用 | PAGER 3.0在PAGER知识生态系统中实现了重大进步,提供扩展且精心策划的通路、注释基因列表和基因签名(PAGs)集合、本体感知的知识导航、加权富集分析和结构化基于网络的优先级排序工具 | NA | 介绍PAGER 3.0的概念基础、架构和分析工作流程,并通过白血病单细胞转录组学案例研究证明其实用性 | 多组学数据中的基因集、通路、网络和相互作用 | 生物信息学 | 白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 846 | 2026-07-03 |
Sini decoction inhibits colorectal cancer liver metastasis by suppressing HIF-1α-dependent exosomal integrin signaling
2026-Nov-15, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121951
PMID:42259422
|
研究论文 | 该研究探讨了四逆汤通过抑制HIF-1α依赖性外泌体整合素信号来抑制结直肠癌肝转移的作用和机制 | 首次揭示四逆汤通过靶向HIF-1α减少ITGαvβ5富集的外泌体分泌,进而阻断M2巨噬细胞极化,从而抑制结直肠癌肝转移 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步的临床验证来确认其转化潜力 | 阐明四逆汤抑制结直肠癌肝转移的活性成分和机制,重点关注肿瘤来源外泌体和巨噬细胞极化 | 小鼠结直肠癌肝转移模型及其肿瘤微环境 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠结直肠肝转移模型(具体样本量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 847 | 2026-07-03 |
The crosstalk between SPP1+ macrophages and follicular helper T cells promotes the immune disorder of Graves' disease
2026-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110712
PMID:42128213
|
研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学揭示Graves病中SPP1+巨噬细胞与滤泡辅助性T细胞的相互作用促进免疫紊乱 | 首次在Graves病中通过单细胞和空间转录组学联合分析,发现SPP1+巨噬细胞与CXCL13+ Tfh细胞通过SPP1-CD44相互作用加重免疫微环境失调,并揭示SPP1+巨噬细胞通过SPP1和VEGF信号通路促进新生血管内皮细胞形成 | NA | 探究Graves病甲状腺组织中免疫细胞和空间基因表达模式的变化,以及SPP1+巨噬细胞在疾病免疫紊乱中的作用 | Graves病患者、缓解期患者和正常对照个体的甲状腺组织 | 数字病理学 | 自身免疫性甲状腺疾病 | 单细胞转录组测序,空间转录组技术 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | 对照个体、Graves病患者和缓解期患者的甲状腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 848 | 2026-07-03 |
JAK-STAT3-MYC axis defines pathogenic stem cell-like memory CD4+ T cells in rheumatoid arthritis
2026-Aug, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110733
PMID:42309459
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,揭示了类风湿关节炎患者CD4+ Tscm细胞中JAK-STAT3-MYC轴驱动致病性干细胞样记忆T细胞的作用 | 首次在类风湿关节炎Tscm细胞中鉴定出STAT3-MYC转录特征,并揭示其与治疗抵抗及疾病严重程度的相关性 | JAK抑制剂仅部分抑制STAT3活性,未完全阻断信号通路,MYC作为潜在治疗靶点需进一步验证 | 探究类风湿关节炎中CD4+ Tscm细胞的分子特征及其在慢性免疫激活中的致病机制 | 11名类风湿关节炎患者和8名健康对照的CD4+ Tscm细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 | 不适用 | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 11名类风湿关节炎患者和8名健康对照的外周血Tscm细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于Tscm细胞转录组分析,同时结合蛋白质组学分析 |
| 849 | 2026-07-03 |
Multiomic Single-Cell Sequencing Identifies BCR::ABL1 as an Acquired Resistance Mechanism in FLT3+ AML
2026-Aug, European journal of haematology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/ejh.70207
PMID:42046307
|
研究论文 | 利用多组学单细胞测序识别FLT3阳性急性髓系白血病中BCR::ABL1作为获得性耐药机制 | 首次通过多组学单细胞DNA测序在单细胞分辨率下揭示BCR::ABL1获得作为FLT3-ITD AML患者对FLT3抑制剂耐药的克隆演化机制 | 基于单个病例的研究,结果可能需在更大样本中验证 | 阐明FLT3突变型AML中BCR::ABL1获得性耐药机制的克隆演化特征 | FLT3-ITD突变型急性髓系白血病患者 | 基因组学 | 急性髓系白血病 | 多组学单细胞DNA测序 | NA | 单细胞基因组数据 | 1例FLT3-ITD AML患者 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 850 | 2026-07-03 |
Cross-stage single-cell and spatial metabolome analyses reveal periderm specialization and tanshinone biosynthesis in Salvia miltiorrhiza roots
2026-Aug, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.71285
PMID:42169223
|
研究论文 | 通过跨阶段单细胞和空间代谢组分析揭示丹参根周皮特化和丹参酮生物合成机制 | 首次结合单细胞RNA测序与空间代谢组学,构建丹参根从表皮到周皮的发育轨迹,鉴定与二萜生物合成相关的转录程序,并预测SmCYP76AK5参与丹参酮合成 | 未提及明确局限性 | 解析多年生根中周皮分化和次生代谢的细胞程序 | 丹参(Salvia miltiorrhiza)根在不同发育阶段的细胞类型组成和转录动态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间代谢组数据 | 不同发育阶段的丹参根样品 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 851 | 2026-07-03 |
Chromatin and genomic instability in the cochlea contributing to age-related hearing loss: Insights from in vitro and in vivo models
2026-Aug, Hearing research
IF:2.5Q1
DOI:10.1016/j.heares.2026.109691
PMID:42263393
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研究论文 | 通过体外和体内模型研究染色质和基因组不稳定性在年龄相关性听力损失中的贡献 | 结合多种体内外模型和单细胞RNA测序技术,首次揭示外毛细胞在衰老过程中染色质和基因组不稳定性的具体变化,并验证了ATRX基因的差异表达 | 具体限制未在标题和摘要中提及 | 探讨染色质和基因组不稳定性在年龄相关性听力损失中的作用机制 | 年龄相关性听力损失的小鼠模型(HEI-OC1细胞及Corti器、血管纹、螺旋神经节细胞)和转基因小鼠(tdTomato标记外毛细胞) | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 852 | 2026-07-03 |
Targeting YAP1-Mediated Tubular Cell Senescence to Attenuate Maladaptive Repair and Fibrotic Transition After Acute Kidney Injury
2026-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503969RR
PMID:42381472
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研究论文 | 探讨YAP1介导的肾小管细胞衰老在急性肾损伤后修复及纤维化转变中的机制 | 首次揭示YAP1持续过表达通过驱动肾小管细胞衰老促进急性肾损伤向慢性肾病转变,并提出衰老细胞清除药物或维替泊芬可双重保护再生能力并抑制纤维化 | 未明确YAP1调控衰老的具体信号通路细节,且体内外模型可能不能完全模拟人类疾病的全部特征 | 阐明急性肾损伤后肾小管细胞衰老及上皮-间质转化在不良修复和纤维化中的分子机制,探索治疗靶点 | 小鼠肾组织(IRI及叶酸模型)、人肾小管上皮HK-2细胞 | 机器学习和数字病理学 | 肾脏疾病(急性肾损伤及慢性肾病) | 单细胞RNA测序(ScRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 人肾组织活检样本(GSE212273)及小鼠模型(未明确数量) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 853 | 2026-07-03 |
Tumor-Infiltrating Platelets Recruit Neutrophils to Promote Tumor Growth through the 5-HIAA-GPR35-ERK1/2 Axis in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jul-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0498
PMID:41962042
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研究论文 | 该论文发现肿瘤浸润血小板通过5-HIAA-GPR35-ERK1/2轴招募中性粒细胞促进肝细胞癌生长 | 首次揭示肿瘤浸润血小板与肿瘤相关中性粒细胞在肝细胞癌中的空间共定位,并阐明其通过5-HIAA-GPR35-ERK1/2信号轴促进肿瘤生长的机制 | NA | 探究肝细胞癌中肿瘤浸润血小板与肿瘤相关中性粒细胞的关系及其促进肿瘤生长的分子机制 | 肝细胞癌患者样本、Hepa1-6小鼠模型、血小板和中性粒细胞 | NA | 肝细胞癌 | 多重免疫组化、Transwell迁移实验、代谢组学分析、单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 患者来源的肝细胞癌样本,Hepa1-6小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 854 | 2026-07-03 |
NMB+CXCL13+CD4+ T Cell-Derived Neuromedin B Promotes Neuropeptide S Receptor 1-Positive Malignant Cell Senescence and Malignancy
2026-Jul-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1081
PMID:42029557
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序整合分析,发现NMB+CXCL13+CD4+ T细胞通过NMB-NPSR1轴促进结直肠癌恶性细胞的衰老与转移 | 首次鉴定出促转移的NMB+CXCL13+CD4+ T细胞亚群,并揭示了其通过NMB-NPSR1轴调控肿瘤细胞“衰老-恶性转化”的新机制 | 作为原理验证研究,仍需进一步验证SHA68与抗PD-1联合治疗在临床中的效果 | 探究CXCL13+CD4+ T细胞亚群在结直肠癌肝转移中的功能异质性及其机制 | 结直肠癌临床样本及泛癌数据集中的CD4+ T细胞和恶性细胞 | 自然语言处理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 结直肠癌临床样本及泛癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 855 | 2026-07-03 |
CD28+ CD8+ Tem cells with a STAT1-dependent glucocorticoid receptor deficit contribute to steroid-refractory acute GVHD
2026-Jul-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025032587
PMID:41980031
|
研究论文 | 该研究通过整合多组学方法,发现CD28+ CD8+ Tem细胞中STAT1依赖性糖皮质激素受体缺陷是导致类固醇难治性急性移植物抗宿主病的关键机制 | 首次通过多中心队列验证CD28+ CD8+ Tem细胞绝对计数作为类固醇耐药预测生物标志物,并揭示STAT1-糖皮质激素受体调控轴在类固醇抵抗中的核心作用 | 未详细说明研究样本的种族多样性及潜在混杂因素控制,回顾性研究设计可能引入选择偏倚 | 阐明类固醇难治性急性移植物抗宿主病的免疫机制并寻找预测性生物标志物 | 异基因造血细胞移植后无aGVHD、类固醇敏感aGVHD和类固醇难治性aGVHD患者的外周血样本 | 数字病理学 | 移植物抗宿主病 | NGS, RNA-seq, 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | 图像, 文本 | 多中心队列包含无aGVHD、类固醇敏感aGVHD和类固醇难治性aGVHD患者的外周血样本,具体数量未在摘要中说明 | Illumina, 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | Illumina NovaSeq, 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 856 | 2026-07-03 |
Cryptorchidism: Novel genetic insights into CCDC149 mutations
2026-07, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70072
PMID:40459248
|
研究论文 | 本研究通过全外显子测序发现CCDC149基因突变与隐睾症相关,并利用CRISPR/Cas9技术构建的基因敲除小鼠模型验证了其在睾丸下降和精子形态中的关键作用 | 首次揭示CCDC149基因突变在双侧隐睾症中的致病机制,发现该基因通过与抗苗勒氏管激素及肌肉发育因子的相互作用调控睾丸下降过程 | 仅基于单一个案的全外显子测序结果,缺乏大规模人群验证;动物模型无法完全模拟人类隐睾症的复杂表型 | 探究CCDC149基因突变在双侧隐睾症发生中的作用及分子机制 | 一名8岁双侧隐睾症患儿及其外周血样本、Ccdc149基因敲除小鼠 | 机器学习 | 隐睾症 | 全外显子测序,CRISPR/Cas9,单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因测序数据,单细胞转录组数据 | 1例患儿,Ccdc149基因敲除小鼠(数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 857 | 2026-07-03 |
Matrix stiffness drives squamous cell carcinoma progression via a Piezo1-mediated mechanotransduction feedback loop
2026-07, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.041
PMID:41151627
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研究论文 | 本研究揭示了基质硬度通过Piezo1介导的机械传导反馈环路驱动鳞状细胞癌进展的机制 | 首次阐明Piezo1-RCC2-YAP自增强信号轴将机械信号转化为促肿瘤信号,并驱动成纤维细胞介导的细胞外基质重塑 | 未提及 | 探究基质硬度如何通过Piezo1介导的机械传导驱动鳞状细胞癌进展及其临床意义 | 人皮肤、口腔和肺部鳞状细胞癌样本及SCC细胞系 | 数字病理学 | 鳞状细胞癌 | 原子力显微镜, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本, 测序数据 | 53例皮肤鳞状细胞癌队列样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 空间转录组学使用10x Visium,单细胞RNA测序使用10x Chromium |
| 858 | 2026-07-03 |
Dietary carboxymethylcellulose metabolite promotes heart allograft rejection through induction of proinflammatory macrophages via lysophosphatidic acid
2026-Jul, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2026.02.030
PMID:41780895
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研究论文 | 研究发现膳食羧甲基纤维素通过诱导促炎巨噬细胞促进心脏移植排斥反应,其机制涉及肠道菌群代谢物溶血磷脂酸 | 首次揭示食品添加剂羧甲基纤维素通过肠道菌群代谢物溶血磷脂酸激活巨噬细胞糖酵解途径,促进心脏移植排斥反应,并发现LPA受体6作为潜在治疗靶点 | 研究仅在动物模型和患者样本中验证,未进行大规模临床试验;未完全阐明肠道菌群变化的具体菌种及代谢通路 | 探究常见食品乳化剂羧甲基纤维素对移植免疫的影响及其分子机制 | 小鼠心脏移植模型及移植排斥患者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 质谱分析, 单细胞RNA测序 | NA | 质谱数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠模型(具体数量未提及)及移植排斥患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于分析移植排斥患者样本 |
| 859 | 2026-07-03 |
Selective impact on regulatory T cells with sustained functional phenotypes by the interleukin-2 mutein VIS171 in a nonhuman primate model
2026-Jul, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2026.03.007
PMID:41850490
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研究论文 | 在非人灵长类模型中,白介素-2突变体VIS171通过选择性扩增调节性T细胞并保持其功能性表型的影响 | 首次在非人灵长类模型中评估了经工程改造延长半衰期并增强对高表达三聚体IL-2受体的Treg细胞选择性结合和扩增能力的VIS171的效果,并通过单细胞RNA测序揭示了不同的Treg亚群及其转录组特征 | 未提及 | 评估VIS171在非人灵长类中免疫细胞群体的效应,重点研究其选择性扩增Treg细胞的能力及扩增过程中的表型变化 | 非人灵长类(猕猴)的免疫细胞群体 | 机器学习 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 860 | 2026-07-03 |
Seamless vessel-microenvironment bioprinting reveals contact-dependent vascular communications
2026-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.02.003
PMID:41856805
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研究论文 | 开发了一种无界面血管-微环境生物打印系统,用于研究接触依赖性血管通讯 | 首次利用纳米改性胶原构建共质生物墨水-支撑浴系统,实现无界面、仿生细胞外基质连续性的血管-间质建模 | 未提及具体限制 | 研究血管与微环境之间的接触依赖性通讯机制 | 血管-间质相互作用(再生模型和病理肿瘤模型) | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 生物打印模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序用于细胞间通讯分析 |