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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8461 | 2026-02-15 |
Microenvironmental niches dictate divergent fibroblast fates in reversible versus progressive lung fibrosis
2026-Feb, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106142
PMID:41619352
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术,比较了不同间质性肺病中微环境对成纤维细胞命运的调控机制 | 首次在疾病原位比较了不同间质性肺病表型中特异性细胞微环境如何塑造成纤维细胞命运,揭示了可逆修复与进行性纤维化之间的转换机制 | 研究主要基于体外实验验证,体内微环境的复杂性可能未被完全模拟 | 探究间质性肺病中成纤维细胞行为决定疾病结局的机制,特别是可逆修复与进行性纤维化之间的转换 | 人外周肺组织样本,包括对照组、机化性肺炎、结缔组织病相关间质性肺病和特发性肺纤维化患者 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间转录组学,单细胞RNA测序,免疫荧光,体外细胞培养 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,图像数据 | 未明确指定样本数量,但包括对照组、OP、CTD-ILD和IPF患者的外周肺组织 | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | 10x Visium | High-Definition Visium空间转录组学平台 |
| 8462 | 2026-02-15 |
A Field-Friendly, Non-Toxic Fixative for Integrated Morphological and Molecular Research in Non-Model Invertebrates
2026-Feb, Ecology and evolution
IF:2.3Q2
DOI:10.1002/ece3.73006
PMID:41675138
|
研究论文 | 本文评估了一种名为KINFix的无毒酒精基固定剂,用于非模式无脊椎动物的形态学和分子研究,包括电子显微镜、RNA保存和单细胞RNA测序 | 开发了一种新型无毒固定剂KINFix,能同时保存组织形态、蛋白质和核酸,适用于野外研究和单细胞RNA测序应用 | 固定条件可能需要针对不同物种和组织进行优化 | 评估KINFix固定剂在非模式无脊椎动物中用于形态学和分子研究的适用性 | 来自不同螺旋动物门的四种无脊椎动物物种 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、电子显微镜 | NA | 图像、RNA序列数据 | 四种无脊椎动物物种,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8463 | 2026-02-15 |
Integrated single-cell and transcriptomic analysis of CD8+CD101+TIM3+ T cells in hepatocellular carcinoma: implications for tumor microenvironment and prognostic modeling
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1639
PMID:41674942
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和转录组学分析,揭示了肝细胞癌中CD8+CD101+TIM3+ T细胞的功能、分化机制及其在肿瘤微环境中的作用,并构建了一个预后模型 | 首次在肝细胞癌中系统研究了CD8+CD101+TIM3+ T细胞的功能、分化轨迹及其与肿瘤微环境的相互作用,并基于此构建了一个新的预后预测模型 | 研究主要基于公共数据库和单细胞测序数据,缺乏体内实验验证;预后模型在验证队列中的表现略低于训练队列 | 探究肝细胞癌中特定T细胞亚群的功能、分化机制及其对免疫治疗和预后的影响 | 肝细胞癌组织中的CD8+CD101+TIM3+ T细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | Cox回归模型,LASSO回归模型 | 单细胞RNA测序数据,临床数据,转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肝细胞癌样本数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8464 | 2026-02-15 |
Prognostic value of palmitoylation-regulated mechanisms in glioblastoma: integrated multi-omics analysis via least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) regression and single-cell sequencing
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1953
PMID:41674962
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和单细胞测序,系统探讨了棕榈酰化相关基因在胶质母细胞瘤中的预后价值 | 结合LASSO回归和单细胞RNA测序分析,识别出与患者总生存期显著相关的核心基因,并揭示了它们在关键致癌通路中的富集和异质表达模式 | 研究主要基于公共数据库(如TCGA和GTEx)的转录组数据,可能未涵盖所有临床或分子亚型,且功能验证仅限于细胞系实验 | 系统研究棕榈酰化相关基因在胶质母细胞瘤中的预后意义 | 胶质母细胞瘤组织和正常脑组织 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组分析、单细胞RNA测序、LASSO回归、Kaplan-Meier生存分析 | LASSO回归 | RNA-seq数据、单细胞RNA-seq数据 | 基于TCGA和GTEx数据库的胶质母细胞瘤与正常组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8465 | 2026-02-15 |
Single-cell analysis reveals the prognostic role of immune escape in the colorectal cancer microenvironment
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1466
PMID:41674966
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌肿瘤微环境中的免疫逃逸相关细胞亚型,揭示了其在预后和免疫治疗中的潜在作用 | 首次系统性地对结直肠癌肿瘤微环境中的免疫逃逸相关细胞亚型进行新型分类,并利用CellChat和伪时序分析探索其细胞间相互作用和分化途径 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,需要通过多重免疫组化等技术进一步验证,且样本量可能有限 | 探索结直肠癌中免疫逃逸相关亚型的新型分类,阐明其机制,并评估其对免疫治疗和预后的价值 | 结直肠癌肿瘤微环境中的免疫逃逸相关细胞亚型,包括癌症相关成纤维细胞、CD8+ T细胞、巨噬细胞和B细胞等 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组化 | 非负矩阵分解聚类, CellChat, 伪时序分析, SCENIC, Cox比例风险回归, Kaplan-Meier生存分析 | 单细胞RNA测序数据, 免疫组化图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8466 | 2026-02-15 |
Single-patient single-cell RNA sequencing reveals neuroendocrine predominance and immunosuppression in small-cell lung cancer
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1674
PMID:41674970
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析小细胞肺癌患者的肿瘤组织,揭示了神经内分泌细胞占主导和免疫抑制的肿瘤微环境特征 | 首次在单患者水平使用scRNA-seq深入解析SCLC的瘤内异性和免疫微环境,并识别BEX1和MAP1b作为新的治疗靶点 | 研究仅基于单个患者样本,结果需在更大队列中验证;BEX1和MAP1b的临床实用性尚待后续研究确认 | 表征小细胞肺癌的瘤内异性和免疫抑制肿瘤微环境,并探索潜在治疗靶点 | 小细胞肺癌患者的原发肿瘤组织及相邻非癌组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例SCLC患者的原发肿瘤和相邻非癌组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8467 | 2026-02-15 |
Key genes and pathway differences between serrated polyps and conventional adenomas: insights from multi-omics
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-2138
PMID:41674976
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了锯齿状息肉与传统腺瘤在关键细胞类型和基因上的差异 | 首次整合CRC GWAS数据与单细胞测序,识别出锯齿状特异性细胞(SSC)作为CRC遗传风险的关键上皮细胞群,并鉴定出六个稳健的风险基因 | NA | 探究锯齿状息肉和传统腺瘤恶性转化过程中的关键细胞类型和基因 | 结直肠癌(CRC)中的锯齿状息肉和传统腺瘤 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞测序, GWAS, TWAS, 精细定位, 孟德尔随机化 | scPagwas, SMR | 基因组, 转录组, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8468 | 2026-02-15 |
Novel fatty acid metabolism-related molecular subtyping and prognostic signature for breast cancer
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1424
PMID:41674979
|
研究论文 | 本研究开发了一种与脂肪酸代谢相关的基因预后模型,用于乳腺癌的风险分层和预后预测 | 首次整合十种机器学习方法构建脂肪酸代谢相关基因预后模型,并结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析验证模型基因的功能和空间表达模式 | 研究主要基于TCGA数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能 | 识别与脂肪酸代谢相关的有效生物标志物,以改善乳腺癌患者的风险分层和治疗选择 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,基因表达分析 | CoxBoost,随机生存森林 | 基因表达数据 | 1,217名乳腺癌患者(TCGA数据库),26名乳腺癌患者(单细胞RNA测序数据) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 8469 | 2026-02-15 |
GNAL-driven calcium signaling reshapes the spatiotemporal immune landscape in ER+ breast cancer: causal insights and prognostic implications
2026-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1796
PMID:41674994
|
研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和空间转录组学,系统探讨了GNAL在ER+乳腺癌中的生物学功能、分子机制及预后相关性,揭示了其通过钙信号和干细胞样分化调控肿瘤免疫微环境的时空重塑 | 首次系统研究GNAL在ER+乳腺癌中的作用,结合因果推断、单细胞和空间分析,构建了多组学预后模型,并发现GNAL通过MIF-CD74轴招募B细胞 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证GNAL的具体调控机制 | 探究GNAL在ER+乳腺癌内分泌抵抗中的生物学功能、分子机制及预后价值 | ER+乳腺癌患者样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化, 分子对接 | 多组学预后模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | TCGA和GEO队列中的多个患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8470 | 2026-02-15 |
Identification and verification of SPP1 in anoikis as a prognostic biomarker for intestinal metaplasia and gastric cancer
2026-Jan-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-36714-9
PMID:41559138
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研究论文 | 本研究探讨了失巢凋亡相关基因SPP1在肠化生和胃癌中的表达、免疫学作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 首次将SPP1与肠化生/胃癌关联,并整合多组学分析、单细胞RNA测序及体外实验验证其在肿瘤进展和免疫微环境中的作用 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏大规模临床队列验证,免疫治疗相关性需进一步研究 | 探索SPP1在肠化生至胃癌进展中的表达特征、免疫学功能及其作为预后生物标志物的价值 | 胃癌、肠化生组织样本及细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR, Western blot | Cox比例风险回归, ROC曲线分析, WGCNA, ceRNA网络 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质印迹数据 | 32例人体组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8471 | 2026-02-15 |
Single-cell profiling of immunogenic cell death in melanoma reveals prognostic signatures and therapeutic targets
2026-Jan-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04406-5
PMID:41543608
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研究论文 | 本研究通过整合批量转录组数据和单细胞RNA测序数据,开发了一个基于免疫原性细胞死亡的预后模型,并探讨了其在黑色素瘤中的临床相关性 | 首次在黑色素瘤中整合批量与单细胞数据构建基于ICD的预后模型,并识别出MYO10作为关键基因与免疫逃逸相关 | 研究主要依赖于公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性队列验证,且单细胞数据样本来源有限 | 研究免疫原性细胞死亡在黑色素瘤中的作用,开发预后模型并探索治疗靶点 | 黑色素瘤患者样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | 来自TCGA、GEO和GSE215120的多个队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8472 | 2026-01-18 |
Single-cell sequencing-based analysis of CD4 + T-cell and B-cell heterogeneity in patients with lupus nephritis
2026-Jan-15, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02277-3
PMID:41540405
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8473 | 2026-02-15 |
Recent Advances in Single-Cell Analysis of Atherosclerotic Plaque Biology
2026-Jan-15, JMA journal
IF:1.5Q2
DOI:10.31662/jmaj.2025-0397
PMID:41676784
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综述 | 本文综述了单细胞和空间转录组学技术在动脉粥样硬化斑块生物学研究中的最新进展,揭示了斑块内免疫细胞的异质性和空间组织 | 利用单细胞和空间转录组学技术,首次在动脉粥样硬化斑块中识别出多种先前未知的免疫细胞亚群(如TREM2泡沫样巨噬细胞亚群和CD163巨噬细胞亚群,包括血红蛋白刺激的巨噬细胞[M(Hb)]表型),并揭示了斑块内免疫细胞的空间特异性炎症生态位和纤维帽动态 | 本文为综述文章,未直接进行实验研究,因此未涉及具体的技术平台或样本量细节,且依赖于现有研究的局限性 | 总结单细胞和空间转录组学技术在动脉粥样硬化斑块生物学研究中的应用,以推动对动脉粥样硬化发病机制的理解和精准免疫治疗策略的开发 | 动脉粥样硬化斑块,特别是斑块内的免疫细胞(如巨噬细胞和T细胞) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞T细胞受体测序 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8474 | 2026-02-15 |
Unveiling personalised targets of PD-1 blockade hyperprogression in a cervical adenocarcinoma via longitudinal single-cell and spatial monitoring
2026-Jan-13, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01270-4
PMID:41530529
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研究论文 | 本研究通过纵向单细胞和空间转录组学分析,揭示了一例宫颈腺癌患者在PD-1阻断治疗后出现超进展疾病的个性化分子机制 | 首次在单个宫颈腺癌病例中,通过纵向整合单细胞RNA测序、T细胞受体分析和空间转录组学,实时揭示了PD-1阻断后超进展疾病的适应性机制,并提出了LAG3和IGF1R作为潜在治疗靶点 | 研究仅基于单个病例,结果需要更大样本量的队列研究进行验证 | 探究宫颈腺癌患者对PD-1免疫检查点抑制剂产生超进展反应背后的分子和细胞机制 | 一例接受抗PD-1免疫治疗后出现超进展疾病的宫颈腺癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体分析, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 1例宫颈腺癌患者(纵向监测) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8475 | 2026-02-15 |
Genital herpes shedding episodes associate with altered spatial organization and activation of mucosal immune cells
2026-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197491
PMID:41252205
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研究论文 | 本研究探讨了HSV-2感染期间病毒脱落对宫颈阴道黏膜免疫细胞空间组织和活化的影响 | 首次结合空间转录组学、流式细胞术和免疫荧光成像,系统揭示了活动性HSV-2脱落期间阴道黏膜免疫细胞的空间重编程和激活状态变化 | 研究为横断面设计,无法确定观察到的免疫变化与病毒脱落之间的因果关系;样本量虽大但可能未涵盖所有临床亚群 | 探究HSV-2感染对宫颈阴道黏膜免疫的影响机制 | HSV-2血清阳性和阴性参与者的宫颈阴道组织和血液样本 | 空间转录组学 | 生殖器疱疹 | 流式细胞术、免疫荧光成像、可溶性免疫因子分析、空间转录组学 | NA | 组织样本、血液样本、空间转录组数据、成像数据 | 232名参与者(包括HSV-2血清阳性和阴性个体) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8476 | 2026-02-15 |
VISTA uncovers missing gene expression and spatial-induced information for spatial transcriptomic data analysis
2026-Jan-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09479-6
PMID:41507434
|
研究论文 | 本文提出了一种名为VISTA的模型,通过整合单细胞RNA测序和亚细胞空间转录组学数据,预测空间转录组数据中未测量的基因表达 | VISTA结合了变分推断、几何深度学习和不确定性量化,首次实现了在空间转录组数据中准确预测未测量基因表达,并支持多种下游分析 | 未明确提及模型在处理高度异质性组织或大规模数据集时的具体限制 | 克服空间转录组技术基因覆盖有限的缺陷,提升空间转录组数据的解释性和应用价值 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 变分推断, 几何深度学习 | 基因表达数据, 空间数据 | 四个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8477 | 2026-02-15 |
Resolving Single-Cell Gene Expression by Pseudotemporal Integration of Transcriptomic and Proteomic Datasets
2026-Jan, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2025.101475
PMID:41317903
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研究论文 | 本研究提出了一种利用伪时间细胞排序整合单细胞RNA-Seq和单细胞蛋白质组学数据的新方法,以分析缺氧条件下的转录-翻译表达动态 | 通过伪时间轨迹整合单细胞转录组和蛋白质组数据,揭示转录和翻译响应的时间差异,如即时转录组响应和延迟蛋白质组表达 | NA | 整合单细胞转录组和蛋白质组数据,构建全面的转录-翻译图谱,以理解缺氧应激下的细胞表型 | 单细胞样本(在缺氧条件下采集的纵向样本) | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-Seq, 单细胞蛋白质组学(质谱分析) | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 8478 | 2026-02-15 |
Gut Microbiota-Derived Metabolites Regulate CASP3 and Neuroimmune Pathways in Multiple Sclerosis: An Integrative Multiomics Study
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/3572399
PMID:41674923
|
研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、机器学习和单细胞转录组分析,揭示了肠道菌群代谢物通过调节CASP3及神经免疫通路在多发性硬化症中的作用 | 首次将网络药理学、机器学习(SHAP方法)和单细胞转录组分析结合,识别出CASP3作为肠道菌群代谢物的核心靶点,并通过孟德尔随机化验证因果关系 | 研究结果需要进一步的实验验证来确认机制和转化潜力 | 探究肠道菌群代谢物在多发性硬化症发病机制中的作用,识别潜在治疗靶点 | 多发性硬化症相关的差异表达基因、肠道菌群代谢物及其靶点 | 机器学习 | 多发性硬化症 | 网络药理学、机器学习、单细胞转录组分析、孟德尔随机化、分子对接 | 机器学习模型(未指定具体类型,但使用了SHAP方法) | 转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA |
| 8479 | 2026-02-15 |
Causal Association Between Plasma Proteins and Pericarditis: A Mendelian Randomization Study With Therapeutic Target Identification
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/4659271
PMID:41674924
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析探讨了血浆蛋白与心包炎之间的因果关系,并识别了潜在的治疗靶点 | 首次利用大规模血浆蛋白组GWAS数据,结合孟德尔随机化方法系统评估了血浆蛋白与心包炎的因果关联,并整合了单细胞RNA测序分析和分子对接技术来识别潜在治疗靶点和化合物 | 研究人群仅限于欧洲血统个体,可能限制了结果在其他人群中的普适性;孟德尔随机化分析依赖于遗传变异作为工具变量,可能存在残留混杂或水平多效性 | 评估血浆蛋白与心包炎之间的因果关系,并探索潜在的治疗靶点 | 35,559名欧洲血统个体的遗传和血浆蛋白数据,以及心包炎的遗传关联数据 | 生物信息学与遗传流行病学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究(GWAS)、孟德尔随机化(MR)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接 | 逆方差加权中位数法、方差加权法、MR-Egger回归 | 遗传变异数据、血浆蛋白定量数据、单细胞基因表达数据 | 35,559名欧洲血统个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8480 | 2026-02-15 |
Development and validation of an interpretable machine learning model identify the lactylation-related protein SUSD3 as a prognostic and therapeutic biomarker for breast cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1701978
PMID:41676158
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研究论文 | 本研究开发并验证了一个可解释的机器学习模型,用于识别乳酸化相关蛋白SUSD3作为乳腺癌的预后和治疗生物标志物 | 首次结合多种机器学习算法构建了与免疫细胞浸润、趋化因子表达和肿瘤突变负荷相关的乳酸化相关特征,并实验验证了枢纽基因SUSD3的作用 | NA | 探究乳酸化在乳腺癌发生发展中的作用,并开发用于预测恶性进展和免疫逃逸的风险模型 | 乳腺癌 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组学、空间转录组学 | 多种机器学习算法组合 | 基因组数据、转录组数据 | 来自公共数据库(TISCH、TCGA、GEO)的大量数据集 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |