单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 9342 篇文献,本页显示第 8441 - 8460 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
8441 2026-02-16
Three-Year Follow-Up of Neoadjuvant Tislelizumab with Chemotherapy in Locally Advanced Gastric and Gastroesophageal Junction Adenocarcinoma: Revealing Cancer-Associated Fibroblast Heterogeneity Corresponding to PD-1 Blockade Efficacy
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究报道了局部晚期胃癌患者接受新辅助替雷利珠单抗联合SOX化疗的3年随访数据,并通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了癌症相关成纤维细胞异质性对PD-1阻断疗效的影响 首次在局部晚期胃癌新辅助免疫化疗的长期随访中,结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统鉴定了三种癌症相关成纤维细胞表型,并发现炎症性CAFs与免疫治疗疗效负相关 单臂II期试验设计,样本量有限(49例患者),且单细胞测序仅来自7例患者的肿瘤样本,需要更大规模随机对照试验验证 评估局部晚期胃癌患者接受新辅助替雷利珠单抗联合SOX化疗的长期疗效,并探索肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞异质性对PD-1阻断治疗反应的影响 局部晚期胃腺癌和胃食管结合部腺癌患者 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 Cox回归模型, Kaplan-Meier分析 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据, 临床随访数据 49例患者(其中7例患者肿瘤样本进行单细胞RNA测序,包含22,248个细胞) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
8442 2026-02-16
Targeting Itga8 Mitigates Neurogenic Bladder Fibrosis Driven by Trem2⁺ Macrophage-Derived Fn1 via FAK/RhoA/ROCK Signaling
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了神经源性膀胱纤维化的细胞图谱,发现Itga8⁺成纤维细胞在纤维化中的关键作用,并阐明其通过FAK/RhoA/ROCK信号通路被Trem2⁺巨噬细胞来源的Fn1激活的机制 首次在神经源性膀胱纤维化中鉴定出Itga8⁺成纤维细胞亚群,并揭示其与Trem2⁺巨噬细胞通过Fn1-Itga8轴形成促纤维化炎症循环的新机制 研究主要基于动物模型,临床转化效果需进一步验证;Itga8靶向治疗的具体给药方式和长期安全性尚未评估 探究神经源性膀胱纤维化的分子机制并寻找潜在治疗靶点 神经源性膀胱纤维化模型中的成纤维细胞和巨噬细胞 单细胞组学 神经源性膀胱疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8443 2026-02-16
Clostridium perfringens alpha toxin drives pathological NETosis via immature neutrophil mobilization and functional reprogramming
2026-Feb, Acta pharmaceutica Sinica. B
研究论文 本文揭示了产气荚膜梭菌α毒素通过动员和功能重编程未成熟中性粒细胞,诱导病理性NET形成,驱动免疫病理的机制 将α毒素重新定义为一种强大的免疫调节毒素,而非仅作为经典细胞溶解素,并识别出CPA-中性粒细胞-NETs轴作为免疫病理的核心驱动因素 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类临床相关性需进一步验证 探究产气荚膜梭菌α毒素如何调节中性粒细胞功能并促进病理性炎症 小鼠模型、小鼠和人类中性粒细胞 免疫学 气性坏疽 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据、组织病理学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8444 2026-02-16
Integrated Multi-Omics and Spatial Transcriptomics Identify FBLL1 as a Malignant Transformation Driver in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jan-27, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究通过整合多组学与空间转录组学数据,识别出FBLL1作为肝细胞癌恶性转化的关键驱动因子 首次将FBLL1鉴定为肝细胞癌中与恶性状态转换相关的新调控因子,揭示了其通过协同上调c-Myc和EGFR配体来激活EGFR-MAPK信号通路的机制 研究主要基于TCGA和ICGC队列数据,样本来源可能有限;体内外功能验证虽充分,但临床转化潜力需进一步探索 探究肝细胞癌中核糖体生物合成失调的具体分子驱动因子及其在肿瘤发生发展中的作用 肝细胞癌患者样本、HCC细胞系及小鼠异种移植模型 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、转录组分析、Western blotting NA 多组学数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组学数据 TCGA和ICGC队列的肝细胞癌患者样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
8445 2026-02-16
Loss of biomechanical features reveals smooth muscle disruption and disease progression in prostate cancer
2026-Jan-20, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,揭示了生物力学特征丧失与平滑肌破坏在前列腺癌进展中的作用,并开发了一个预后指数MRPX用于风险分层和治疗指导 首次系统性地将生物力学特征与前列腺癌进展联系起来,通过整合大量转录组和单细胞数据定义了生物力学亚型,并开发了具有临床实用性的预后指数MRPX 研究主要基于回顾性队列数据,需要进一步的前瞻性验证;体外实验模型可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 阐明生物力学特征在前列腺癌进展中的作用及其潜在机制 前列腺癌患者和细胞系 生物信息学 前列腺癌 转录组测序,单细胞RNA测序,RT-qPCR,机器学习,共培养模型 机器学习模型(具体类型未明确指定) 转录组数据,单细胞RNA测序数据 1693名前列腺癌患者(来自10个公共队列)和19个前列腺癌样本的单细胞数据 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
8446 2026-02-16
Current Overview of Multi-omics Analyses in Microscopic Polyangiitis and Granulomatosis with Polyangiitis
2026-Jan-15, Internal medicine (Tokyo, Japan)
综述 本文综述了多组学分析在显微镜下多血管炎和肉芽肿性多血管炎中的最新进展 整合了基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等多组学数据,以全面理解AAV的复杂病理生理学,并强调了单细胞RNA测序和空间转录组学等新技术在揭示基因表达谱和细胞相互作用中的应用 作为一篇综述,未涉及原始研究数据,可能未涵盖所有最新研究,且依赖于现有文献的总结 旨在通过多组学分析开发基于AAV分子和遗传特征的个性化诊断和治疗策略 抗中性粒细胞胞浆抗体相关血管炎(AAV),特别是显微镜下多血管炎和肉芽肿性多血管炎 自然语言处理 自身免疫性疾病 多组学分析,包括基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学 NA 文本 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
8447 2026-02-16
Multi-omics characterization of RNA modification enzymes identifies NAT10 as a functionally validated prognostic biomarker in hepatocellular carcinoma
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学分析,揭示了RNA修饰酶在多种癌症中的失调模式,并建立了诊断和预后模型 首次全面描绘了RNA修饰酶在泛癌中的拷贝数变异相关失调景观,并利用机器学习识别出12个可靠的肿瘤诊断标志物,同时通过单细胞转录组分析揭示了其在肿瘤微环境中的异质性表达 研究主要基于关联分析,功能验证仅针对NAT10进行,其他RNA修饰酶的具体生物学机制仍需进一步实验探索 系统表征RNA修饰酶在癌症中的全局调控模式及其临床相关性 多种癌症类型中的RNA修饰酶 生物信息学 肝细胞癌 多组学分析、单细胞RNA测序、机器学习、LASSO回归、EdU实验、qRT-PCR、免疫组化 LASSO回归模型 基因表达数据、拷贝数变异数据、临床数据、单细胞转录组数据 多个独立队列的癌症样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8448 2026-02-16
Prognostic gene screening and experimental validation in renal clear cell carcinoma based on spatial transcriptomics and single-cell sequencing
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,筛选出七个预后基因并构建风险模型,用于肾透明细胞癌的风险分层和生存预测,并鉴定ATP1A1为潜在治疗靶点 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据识别肾透明细胞癌的预后基因,并构建了包含七个基因的风险模型和列线图,提高了生存预测的准确性 研究依赖于公共数据库(TCGA和ICGC)的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证,且功能分析主要基于生物信息学方法,实验验证有限 识别肾透明细胞癌的可靠预后生物标志物和治疗靶点,以改善患者分层和个性化治疗 肾透明细胞癌(ccRCC)患者 数字病理学 肾癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学(ST) 风险模型,列线图(nomogram) 基因表达数据,空间转录组数据 TCGA和ICGC数据集中的肾透明细胞癌患者样本 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
8449 2026-02-16
Transcriptome and single-cell RNA sequencing analysis with 101 machine learning combinations and experimental verification reveals the mechanism of action of mannose metabolism in bladder cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过转录组和单细胞RNA测序分析结合101种机器学习组合及实验验证,揭示了甘露糖代谢在膀胱癌中的作用机制 首次系统整合101种机器学习算法组合来识别膀胱癌中与甘露糖代谢相关的预后基因,并通过单细胞分析确认巨噬细胞为关键细胞类型 研究主要基于公共数据库数据,需要更多独立队列验证;单细胞分析样本量可能有限 探究甘露糖代谢对膀胱癌预后的影响机制 膀胱癌患者样本及相关基因 生物信息学 膀胱癌 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blotting, 免疫组化 机器学习算法组合, 回归分析 基因表达数据, 单细胞数据 未明确具体样本数量,使用公共数据库数据集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
8450 2026-02-16
PSMA4 as a Druggable Target in Hidradenitis Suppurativa: Evidence From Mendelian Randomization and Single-Cell Transcriptomics
2026, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过药物基因组范围的孟德尔随机化分析,结合单细胞转录组学,识别了化脓性汗腺炎(HS)的潜在治疗靶点PSMA4和MAST3 首次整合孟德尔随机化、共定位分析和单细胞RNA测序,揭示PSMA4在CD4 T细胞中的富集及其通过TNF通路促进炎症的作用,为HS提供了新的治疗靶点 研究主要基于遗传和转录组数据,缺乏实验验证靶点功能的具体机制,且样本来源和疾病异质性可能影响结果普适性 识别化脓性汗腺炎的新型治疗靶点 化脓性汗腺炎患者 自然语言处理 皮肤炎症性疾病 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、共定位分析、细胞间通讯分析 NA 遗传数据、转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8451 2026-02-15
Metabolic-immune interactions in gastric cancer T cells: A single-cell atlas for prognostic biomarker identification
2026-Jun, Quantitative biology (Beijing, China)
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量测序数据,系统表征了胃癌肿瘤微环境中的代谢异质性,并识别出与T细胞分化相关的预后生物标志物 首次在单细胞水平系统描绘胃癌代谢-免疫相互作用图谱,并构建了一个基于6个T细胞分化特征的新型风险评分模型,该模型在预测预后方面优于传统临床病理因素 研究主要基于公共数据集进行回顾性分析,需要在更大规模的前瞻性队列中进行验证 揭示胃癌肿瘤微环境中代谢与免疫的相互作用,并开发用于预后分层和免疫治疗靶点识别的生物标志物 胃癌组织、恶性上皮细胞、T细胞 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、微阵列、免疫组织化学 机器学习模型 单细胞转录组数据、批量转录组数据、微阵列数据、临床生存数据 23例胃癌组织的35,633个细胞(单细胞数据),以及来自UCSC Xena的批量RNA-seq数据和两个独立微阵列队列(GSE26899, GSE62254) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
8452 2026-02-15
Mechanistic insights into nitric oxide signaling in shaping root architecture under challenging environments
2026-Mar, Plant science : an international journal of experimental plant biology IF:4.2Q1
综述 本文综述了一氧化氮(NO)在逆境条件下调控植物根系构型(RSA)的多重作用机制 整合了NO与ROS及植物激素信号网络的互作,并强调了单细胞转录组学、氧化还原敏感生物传感器和高分辨率活细胞成像等新兴技术在解析NO-ROS互作中的潜力 NO介导的RSA调控的生化与分子机制仍复杂且部分未知,存在关键知识缺口 理解作物如何适应环境胁迫,特别是通过根系构型可塑性来增强胁迫抗性 植物根系,特别是根系构型(RSA)及其在胁迫下的发育 植物生物学 NA 单细胞转录组学、氧化还原敏感生物传感器、高分辨率活细胞成像 NA NA NA NA NA NA NA
8453 2026-02-15
Probing cellular landscapes in plants via single-cell transcriptomics
2026-Mar, Plant science : an international journal of experimental plant biology IF:4.2Q1
综述 本文全面综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在植物研究中的应用,包括其在解析细胞异质性、发育轨迹、应激响应以及整合空间转录组学和多组学方法方面的进展 整合了跨植物物种和组织类型的见解,提供了关于植物发育和适应的交叉视角,并批判性地评估了关键技术挑战及潜在解决方案 植物系统中scRNA-seq与功能基因组学及空间技术的整合仍然有限,在理解基因调控、应激响应和细胞命运决定方面存在关键空白 综述单细胞转录组学如何推进植物组织发育和应激响应的高分辨率解析,从而促进基因发现和性状改良 多种植物组织 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学,多组学方法(如整合染色质可及性或蛋白质表达数据),CRISPR/Cas9介导的基因组编辑 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录omics NA NA
8454 2026-02-15
Integrating CAR-T therapy with PD-1/PD-L1 blockade: Mechanisms, synergy, and optimized strategies in NSCLC
2026-Feb-20, iScience IF:4.6Q1
综述 本文综述了CAR-T疗法与PD-1/PD-L1阻断在非小细胞肺癌(NSCLC)中的整合机制、协同效应及优化策略 提出了将CAR-T疗法与PD-1/PD-L1阻断相结合以克服NSCLC免疫治疗耐药性的新策略,并讨论了多靶点CAR构建、针对肿瘤微环境的工程策略以及计算建模和机器学习在优化个性化应用中的作用 本文为综述性文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行总结和讨论,因此缺乏对新策略临床效果的实证评估 探讨如何整合CAR-T疗法与PD-1/PD-L1阻断以克服NSCLC免疫治疗中的耐药性并改善治疗效果 非小细胞肺癌(NSCLC)及其肿瘤微环境(TME) 自然语言处理 肺癌 单细胞RNA-seq NA 文本 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8455 2026-02-15
TGFβ signaling promotes cell cycle progression and resistance to the CDK4/6 inhibitor palbociclib through SOX4 transcriptional modulation in breast cancer cells
2026-Feb-04, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了TGFβ信号通过SOX4转录调控促进乳腺癌细胞周期进程和CDK4/6抑制剂帕博西尼耐药的新机制 首次发现TGFβ通过诱导SMAD3与SOX4的相互作用,激活细胞周期和DNA损伤应答通路,从而促进乳腺癌细胞对CDK4/6抑制剂的耐药性 研究主要基于细胞系模型和3D培养系统,体内验证和临床相关性需要进一步研究 解析TGFβ信号在乳腺癌进展中的时空调控机制及其对靶向治疗耐药的影响 人乳腺上皮细胞系(MCF-10A及其HRAS转化型)和原发性乳腺癌肿瘤样本 癌症生物学 乳腺癌 染色质可及性分析、转录组分析、单细胞RNA测序 3D细胞培养模型 基因组、转录组、单细胞转录组数据 等基因细胞系模型(MCF-10A及其HRAS转化型)和原发性乳腺癌肿瘤样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8456 2026-02-15
Multimodal foundation transformer models for multiscale genomics
2026-Feb, Nature methods IF:36.1Q1
综述 本文探讨了基于Transformer的模型在整合和分析多尺度基因组学数据(包括基因组序列、单细胞转录组学和空间数据)中的最新进展和应用 提出了将Transformer模型分为三个层级的分类框架,并展望了利用交叉注意力机制整合异质模态的模块化‘超级Transformer’架构设计 讨论了模型在标记化、可解释性和可扩展性方面面临的挑战 为在多尺度、多模态基因组学中利用Transformer模型提供资源和技术路线图 多尺度生物数据,包括基因组序列、单细胞转录组学和空间数据 机器学习 NA NA Transformer, 大型语言模型 基因组序列, 单细胞转录组数据, 空间数据 NA NA NA NA NA
8457 2026-02-15
SpaceBar enables single-cell-resolution clone tracing with imaging-based spatial transcriptomics
2026-Feb, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 SpaceBar是一种方法,能够在标准成像空间转录组学流程中同时实现克隆追踪和空间基因表达分析 开发了SpaceBar方法,通过96个合成条形码序列组合标记细胞,解决了成像空间转录组学与随机条形码克隆追踪方法不兼容的问题 NA 实现在复杂组织环境中同时检测克隆和空间驱动因素 细胞 空间转录组学 NA 成像空间转录组学 NA 空间基因表达数据 NA NA 成像空间转录组学 NA NA
8458 2026-02-15
Bridging the dimensional gap from planar spatial transcriptomics to 3D cell atlases
2026-Feb, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文提出了一种名为SpatialZ的计算框架,用于从平面空间转录组学数据生成虚拟切片,从而构建密集的三维细胞图谱 开发了SpatialZ框架,能够独立于特定空间技术的基因覆盖限制,在单细胞分辨率下生成虚拟切片,填补了实验测量切片之间的间隙,实现了从稀疏二维切片到密集三维细胞图谱的转换 未明确提及具体的技术限制或数据依赖性,可能依赖于输入数据的质量和覆盖范围 解决从平面空间转录组学数据构建全面三维细胞图谱的挑战,以更好地理解连续器官组织和空间分子景观 小鼠大脑半球(基于BRAIN Initiative Cell Census Network数据)和人类乳腺癌组织(基于成像质谱流式数据) 空间转录组学 乳腺癌 空间转录组学,成像质谱流式 计算框架(SpatialZ) 空间转录组学数据,成像质谱流式数据 超过3800万个细胞(来自小鼠大脑半球三维图谱) NA 空间转录组学,成像质谱流式 NA NA
8459 2026-02-15
Single-cell omics in investigating the effect of CAFs with KRAS overexpression on the malignant progression of anaplastic thyroid cancer
2026-Feb-01, Journal of the Chinese Medical Association : JCMA IF:1.9Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了KRAS过表达的癌症相关成纤维细胞在促进未分化甲状腺癌恶性进展中的作用机制 首次在单细胞水平上解析了未分化甲状腺癌中成纤维细胞亚群KRAS的表达特征,并明确了Fib_KRAS+这一特异性亚群在ATC中的存在及其功能 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;样本量未明确说明;KRAS抑制剂BI-2865的具体作用机制需进一步探究 揭示KRAS过表达的癌症相关成纤维细胞对未分化甲状腺癌恶性生物学行为的影响 未分化甲状腺癌细胞、癌症相关成纤维细胞、癌旁组织成纤维细胞 单细胞组学 甲状腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8460 2026-01-10
Revealing high-resolution spatial metagenes from spatial transcriptomics
2026-Feb, Nature cell biology IF:17.3Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
回到顶部