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当前共找到 9342 篇文献,本页显示第 8421 - 8440 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
8421 2026-02-17
Single-Cell RNA-Seq Profiling of Transposable Element Expression in Human Peripheral Blood Cells During Viral Infections
2026-Jan-28, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序数据,分析了人类外周血单个核细胞在流感病毒、HIV和SARS-CoV-2感染期间非长末端重复转座元件的表达特征 首次在单细胞分辨率下系统揭示了不同病毒感染中非长末端重复转座元件的细胞特异性表达模式,并发现其可用于区分疾病严重程度、预测进展和评估疗效 研究样本量相对有限(98名患者),且需要进一步研究转座元件参与抗病毒防御的具体机制以确认其作为生物标志物或治疗靶点的潜力 探究病毒感染期间人类外周血细胞中转座元件的表达特征及其在抗病毒免疫中的作用 人类外周血单个核细胞(PBMCs),特别是前体细胞毒性T淋巴细胞(T CD8+ Naive细胞) 单细胞转录组学 病毒感染(流感、HIV、COVID-19) 单细胞RNA测序 生物信息学分析(共表达网络分析) 单细胞RNA测序数据 98名患者(涵盖流感病毒、HIV和SARS-CoV-2感染队列) NA 单细胞RNA-seq NA NA
8422 2026-02-17
IL-17 Cytokines Induce IκBζ in Dermal Fibroblasts to Promote Pro-Inflammatory Gene Expression in Psoriasis
2026-Jan-28, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究揭示了IL-17细胞因子通过诱导真皮成纤维细胞中的IκBζ表达,促进银屑病中促炎基因的表达 首次系统性地在真皮成纤维细胞中表征了IκBζ的调控机制,并利用空间转录组学技术验证其在银屑病皮损中的表达模式 研究主要基于体外细胞模型,体内功能验证尚需进一步深入 探究IκBζ在真皮成纤维细胞中的调控作用及其在银屑病发病机制中的贡献 人类真皮成纤维细胞及银屑病患者的皮肤活检组织 数字病理学 银屑病 空间转录组学, qPCR, Western blotting, siRNA敲低 NA 转录组数据, 蛋白质数据 NA NA 空间转录组学 CosMx™ NA
8423 2026-02-17
The Landscape of Ferroptosis-Related Gene Signatures as Molecular Stratification in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Jan-23, Diagnostics (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究通过转录组和蛋白质组数据分析,揭示了三阴性乳腺癌中铁死亡相关基因的分子分层特征 首次在三阴性乳腺癌中系统描绘了铁死亡相关基因的分子分层景观,并构建了铁死亡指数作为预后标志 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证其生物学机制和临床转化价值 探索铁死亡相关基因在三阴性乳腺癌中的分子分层和预后价值 三阴性乳腺癌患者的转录组和蛋白质组数据 生物信息学 乳腺癌 转录组测序,蛋白质组分析,单细胞RNA测序 LASSO回归模型,Cox回归模型 基因表达数据,蛋白质表达数据 来自METABRIC、TCGA、GEO和CPTAC数据库的多中心样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8424 2026-02-17
scIRT: Imputation and Dimensionality Reduction for Single-Cell RNA-Seq Data by Combining NMF with SMOTE
2026-Jan-23, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本文提出了一种名为scIRT的迭代插补流程,结合SMOTE和NMF技术,用于单细胞RNA测序数据的插补和降维 通过结合合成少数类过采样技术(SMOTE)和非负矩阵分解(NMF),同时实现数据插补和降维,提高了单细胞RNA测序数据的处理性能 NA 开发一种预处理工具,以改善单细胞RNA测序数据的质量,便于下游分析如细胞类型聚类和可视化 单细胞RNA测序数据 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NMF, SMOTE 基因表达矩阵 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8425 2026-02-17
Dynamic single-cell transcriptomics reveals lsamp-guided neural network formation in male S. japonicum driving female reproduction
2026-Jan-22, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了日本血吸虫雄性个体中lsamp基因引导的神经网络形成如何驱动雌性生殖成熟 首次构建了日本血吸虫高分辨率单细胞转录组图谱,发现雄性特异性N4.3神经元亚型及其关键基因lsamp在神经网络形成和雌雄互作中的作用 研究主要基于转录组数据,功能验证可能有限,且样本仅涵盖四个发育阶段 探究血吸虫雌雄配对过程中细胞动态和神经调控机制 日本血吸虫(Schistosoma japonicum)雄性和雌性个体 单细胞转录组学 血吸虫病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 104,671个细胞,来自雄性和雌性日本血吸虫的四个发育阶段 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8426 2026-02-17
Evaluating deconvolution methods using real bulk RNA-expression data for robust prognostic insights across cancer types
2026-Jan-21, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本研究提出了一种基于真实批量RNA表达数据的新框架,用于评估五种去卷积方法,并识别出ReCIDE和BayesPrism作为稳健方法,同时发现基质癌症相关成纤维细胞(mCAF)作为跨多种癌症的预后标志物 引入了一个新颖的真实数据框架,利用18个真实批量RNA表达队列来评估去卷积方法,并基于三种创新基准场景(与scRNA-seq的一致性、跨队列可重复性、预后相关性可重复性)进行验证 传统伪批量基准在真实世界设置中可能不可靠,因为绝对细胞比例未知 评估去卷积方法在真实批量RNA表达数据中的性能,以提供精准肿瘤学的可操作工具并指导转化研究中的方法选择 18个真实批量RNA表达队列(5,891个样本)涵盖九种癌症类型,以及TCGA和GEO队列 自然语言处理 肺癌 批量RNA测序,单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA表达数据 5,891个样本 NA 批量RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
8427 2026-02-17
CCL14, identified by multi-omics approach, serves as a novel indicator of disease severity and progression in lymphangioleiomyomatosis
2026-Jan-20, Orphanet journal of rare diseases IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过多组学方法鉴定出CCL14是淋巴管平滑肌瘤病(LAM)疾病严重程度和进展的新型生物标志物 首次通过整合血浆蛋白质组学和单细胞RNA测序,系统揭示了CCL14在LAM中的表达模式、细胞来源及其在疾病微环境中的调控网络,并验证了其作为预测疾病进展的临床潜力 样本量相对有限(尤其是单细胞测序部分),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性队列验证CCL14的临床预测价值 探索CCL14在淋巴管平滑肌瘤病(LAM)中的生物学功能及其作为疾病生物标志物的临床价值 淋巴管平滑肌瘤病(LAM)患者和健康对照者的血浆样本及肺组织样本 生物信息学与多组学整合分析 淋巴管平滑肌瘤病 蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), ELISA 生物信息学通路富集分析, CellPhoneDB细胞互作分析 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 临床表型数据 单细胞测序:6名LAM患者和5名健康供体的肺组织;ELISA验证:53名LAM患者和25名对照的血浆样本 NA 单细胞RNA-seq, 血浆蛋白质组学 NA NA
8428 2026-02-17
Quantifying uncertainty in RNA velocity
2026-Jan-06, Biometrics IF:1.4Q2
研究论文 本文提出了一种贝叶斯分层模型来估计RNA速度,通过结合马尔可夫链蒙特卡洛和共识方法进行全贝叶斯推断,实现了校准良好的不确定性量化 首次在RNA速度估计中引入时间依赖性转录速率和非平凡初始条件,并讨论了模型参数的可识别性,包括潜在时间的较大值,这是以往未涉及的 模型可能仍受限于单细胞RNA测序数据的固有噪声和稀疏性,且计算复杂度较高 量化单细胞RNA测序数据中RNA速度的不确定性,以提取更可靠的动态信息 小鼠胚胎干细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 贝叶斯分层模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8429 2026-02-17
Single-cell RNA Sequencing Analysis Reveals the Regulatory Functions of Copines Family Genes in Testicular Cancer Progression
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
研究论文 本研究基于单细胞转录组数据,揭示了Copines家族基因在睾丸癌不同细胞亚群中的表达模式及其通过调控PI3K-Akt信号通路和细胞周期驱动癌症进展的潜在分子机制 首次在单细胞水平上系统分析Copines家族基因在睾丸癌中的表达和调控功能,并识别出关键信号通路如PI3K-Akt,为精准治疗提供了新靶点 研究基于单细胞转录组数据,未进行实验验证,且样本量未明确说明,可能限制结论的普适性 探究Copines家族基因在睾丸癌细胞亚群中的表达模式及其调控癌症进展的机制 睾丸癌的单细胞转录组数据,包括NK/T细胞、肿瘤细胞、B细胞和巨噬细胞等亚群 数字病理学 睾丸癌 单细胞RNA测序 聚类分析、差异表达分析、功能富集分析、伪时间分析 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8430 2026-02-17
Prognostic Value and Immune Characterization of Genes Associated with Childhood Acute Leukemia applying Single-Cell RNA Sequencing
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
研究论文 本研究整合单细胞和批量转录组数据,识别儿童急性淋巴细胞白血病中的关键B细胞亚群和分子标志物,并构建预后风险模型 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别cALL中与增殖相关的B细胞C2亚群,并基于四个标记基因构建具有高预测精度的预后模型 研究样本量较小(仅2名cALL患者和3名健康对照),且仅针对B细胞起源的cALL,未涵盖其他亚型 探究儿童急性淋巴细胞白血病的免疫特征,并开发预后预测模型 儿童急性淋巴细胞白血病患者及健康儿童的骨髓样本 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序,批量RNA测序 Cox回归,LASSO回归 RNA测序数据 2名cALL患者和3名健康儿童的骨髓样本(单细胞数据),511名cALL样本(批量数据) NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
8431 2026-02-16
Integrative functional genomics and fine-mapping identify regulatory mechanisms of multivariate obesity GWAS and its cardiometabolic implications
2026-Apr, Metabolism: clinical and experimental
研究论文 本研究通过整合多变量肥胖GWAS与功能基因组学数据,揭示了肥胖的跨组织神经-脂肪调控轴及其心脏代谢影响 采用基因组结构方程模型构建多变量肥胖表型,结合多组学数据(染色质可及性、增强子-启动子互作、eQTL、TWAS、PWAS)进行精细定位和共定位分析,首次系统识别了肥胖相关的神经-脂肪调控机制 研究主要基于欧洲人群数据,可能限制其跨人群普适性;功能验证实验不足,机制结论仍需进一步实验证实 解析肥胖的共享遗传结构和关键调控机制,特别是非编码变异的作用,及其对心脏代谢特征的影响 五种肥胖相关性状(体重指数、腰围、内脏脂肪、肝脏脂肪、体脂百分比)的GWAS数据,脂肪组织多组学数据,以及心脏代谢特征 基因组学 肥胖症 GWAS, 基因组结构方程建模, 染色质可及性分析, 增强子-启动子互作分析, eQTL分析, TWAS, PWAS, 精细定位, 共定位分析, 单细胞分析 基因组结构方程模型, MAGMA, scPagwas 基因组数据, 表观基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8432 2026-02-16
SARS-CoV-2 E protein reduces PPARA activity in colonic and pulmonary epithelial cells, driving diarrhea and pneumonia in COVID-19
2026-Mar-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过临床数据和单细胞RNA测序,揭示了SARS-CoV-2 E蛋白通过抑制PPARA活性,导致结肠和肺上皮细胞中膜转运蛋白表达下调,从而引发COVID-19相关腹泻和肺炎的机制 首次发现SARS-CoV-2 E蛋白通过抑制PPARA活性,在结肠和肺上皮细胞中共同驱动腹泻和肺炎,并提出了PPARA激动剂作为潜在治疗策略 单细胞RNA测序仅基于一名死亡COVID-19腹泻患者的结肠组织样本,样本量较小,且体外细胞模型可能无法完全模拟体内复杂环境 阐明SARS-CoV-2诱导腹泻和肺炎的分子机制,并探索潜在治疗靶点 COVID-19患者(临床数据)及结肠和肺上皮细胞(体外模型) 单细胞组学 COVID-19 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因调控网络分析、体外细胞培养实验 NA 临床数据、单细胞RNA测序数据、体外实验数据 3023名患者的临床数据,以及一名死亡COVID-19腹泻患者的结肠组织进行scRNA-seq NA 单细胞RNA-seq NA NA
8433 2026-02-16
Autophagy-driven CCL7+ monocyte terminal differentiation program fuels CD8+ T cell-mediated cardiac injury in Sepsis
2026-Mar-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了自噬驱动的CCL7+单核细胞终末分化程序通过CCL7介导的免疫激活促进CD8+ T细胞介导的心脏损伤,为脓毒症心肌病提供了新的免疫代谢机制 首次鉴定出具有高自噬通量和CCL7表达的C6单核细胞亚群,并阐明了其通过CCL7-CCR1/CCR2-PI3K-AKT信号轴促进CD8+ T细胞活化和心肌损伤的新机制 研究主要基于生物信息学分析和动物模型,临床验证有限,且未深入探讨其他免疫细胞亚群的具体作用 揭示自噬依赖性单核细胞重编程在脓毒症心肌病中的作用及其通过CCL7介导的免疫激活机制 脓毒症患者样本、LPS诱导的脓毒症小鼠模型、体外共培养系统 单细胞转录组学 脓毒症心肌病 单细胞RNA测序、批量转录组分析、WGCNA、伪时间轨迹推断、CellChat通讯分析、流式细胞术、ELISA、Western blot NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 来自公共数据库GSE65682、GSE152363、GSE167363的脓毒症患者数据,以及LPS诱导的脓毒症小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq NA NA
8434 2026-02-16
Multi-omics profiling of intercellular immunometabolic heterogeneity highlights in lung cancer: Crosstalk mechanisms and resistance in the tumor-immune interface
2026-Mar, Critical reviews in oncology/hematology
综述 本文综述了肺癌肿瘤微环境中恶性细胞与免疫细胞之间的代谢串扰机制,及其如何驱动免疫逃逸、异质性和免疫治疗耐药,并整合多组学数据定义了相关的免疫代谢表型和治疗策略 独特地整合了2009-2025年的最新文献,利用多组学数据(单细胞转录组学、蛋白质组学、代谢组学、空间分析)来定义肺癌中的免疫代谢表型(如LM-high、CD73^high、KEAP1/NRF2突变)和相关通路,并强调了靶向这些通路的治疗策略 本文为综述性文章,未进行原始数据研究,其结论基于对现有文献的综合分析 阐明肺癌肿瘤微环境中肿瘤细胞与免疫细胞之间的免疫代谢串扰机制,及其对免疫治疗耐药的影响,并探索基于多组学分析的精准治疗策略 肺癌的肿瘤微环境,特别是其中的恶性细胞和免疫细胞(如细胞毒性T细胞、树突状细胞、调节性和抑制性免疫亚群) 数字病理学 肺癌 单细胞转录组学,蛋白质组学,代谢组学,空间分析 NA 多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
8435 2026-02-16
Interpretable Aging Signatures in Human Retinal Cell Types Revealed by Single-Cell RNA Sequencing and Sparse Logistic Regression
2026-Mar, Ophthalmology science IF:3.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和稀疏逻辑回归,揭示了中国人群视网膜细胞类型中可解释的衰老特征 首次在中国人群中利用机器学习模型推导出细胞类型特异性的视网膜衰老特征,揭示了保守的分子标志和独特的细胞脆弱性 样本量相对较小(18个视网膜,12名捐赠者),且为横断面研究,无法追踪个体衰老动态 表征人类视网膜衰老过程中的细胞类型特异性转录变化,并开发用于细胞年龄判别的机器学习模型 人类视网膜细胞 数字病理学 老年疾病 单细胞RNA测序 L1正则化逻辑回归加递归特征消除 单细胞转录组数据 18个未冷冻视网膜,来自12名中国捐赠者(9名年轻,34-55岁;9名老年,68-92岁),共223,612个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' v3.1
8436 2026-02-16
Gut-Heart Axis in Myocardial Repair: Mechanisms, Cross-Organ Networks, and Therapeutic Opportunities
2026-Feb-13, Circulation research IF:16.5Q1
综述 本文综述了肠道微生物群通过多器官网络(如肠-脑-心轴)调节心肌损伤、修复和再生的机制,并探讨了其作为疾病驱动因素和治疗靶点的潜力 整合了肠道微生物群在心肌修复和再生中的新兴作用,强调了跨器官网络(如肠-脑-心轴)和免疫代谢信号,并提出了结合多组学与机制模型用于精准心血管医学的新策略 NA 探讨肠道微生物群在心肌损伤、修复和再生中的作用机制,以及其作为治疗靶点的潜力 肠道微生物群及其代谢物,以及它们与心肌健康相关的跨器官网络 NA 心血管疾病 宏基因组学、代谢组学、单细胞转录组学 NA NA NA NA NA NA NA
8437 2026-02-16
Multiomics Analyses Reveal an Essential Role of Tryptophan in Treatment of csDMARDs in Rheumatoid Arthritis
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过多组学方法揭示了色氨酸在类风湿关节炎患者对传统合成改善病情抗风湿药治疗反应中的关键调节作用 首次通过整合代谢组学、微生物组学、转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学等多组学数据,并结合体外/体内实验及临床试验,系统阐明了色氨酸在csDMARDs治疗反应中的调控机制 样本量相对有限,且主要关注色氨酸通路,其他潜在代谢通路可能未被充分探索 阐明类风湿关节炎患者对传统合成改善病情抗风湿药治疗反应差异的分子机制 类风湿关节炎患者(采集血浆、粪便和外周血单个核细胞)、MH7A细胞系、小鼠模型 多组学整合分析 类风湿关节炎 代谢组学、微生物组学、转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学 NA 多组学数据(代谢物、微生物、基因表达、蛋白质、磷酸化) 类风湿关节炎患者的血浆、粪便和PBMC样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 代谢组学, 微生物组学, 蛋白质组学 NA NA
8438 2026-02-16
Characterizing Stage-Specific Cellular Dynamics and Microenvironmental Remodeling in Lung Adenocarcinoma by Single-Cell RNA Sequencing
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序,系统描绘了肺腺癌不同进展阶段的细胞组成和转录状态,揭示了肿瘤微环境从早期免疫激活到晚期免疫抑制的动态重塑过程 整合早期患者样本与公共晚期数据集,系统揭示了肺腺癌进展中阶段特异性的肿瘤微环境重塑;鉴定出具有转移和缺氧特征的C5肿瘤细胞亚群、免疫抑制性LGMN⁺巨噬细胞、STAT1驱动的耗竭CD8⁺ T细胞、FKBP11⁺浆B细胞及POSTN⁺ CAFs等关键细胞亚群,提出了缺氧驱动的功能趋同模型 未明确说明样本的具体数量及来源的详细信息;研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质或功能层面的验证;整合的公共数据集可能存在批次效应 阐明肺腺癌进展过程中阶段特异性的细胞动态和肿瘤微环境重塑机制 肺腺癌患者肿瘤组织(涵盖早期和晚期阶段) 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8439 2026-02-16
Inferring Gene Regulatory Networks From Single-Cell RNA Sequencing Data by Dual-Role Graph Contrastive Learning
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文提出了一种名为RegGAIN的新型深度学习模型,用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络 提出了一种基于双重角色图对比学习的自监督方法,通过单独的编码器同时学习每个基因的调控者和靶标双重角色表示,以捕获调控方向性和不同的调控模式 NA 从单细胞转录组数据中准确重建细胞类型特异性的基因调控网络 基因调控网络 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度学习,对比学习 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8440 2026-02-16
Type I Interferon Pathway Activation Disrupts Monocyte Maturation and Enhances Immune Evasion in Multiple Myeloma
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了多发性骨髓瘤中I型干扰素通路激活破坏单核细胞成熟并促进免疫逃逸的机制 首次在多发性骨髓瘤中系统描绘了I型干扰素通路如何破坏单核细胞分化轨迹,并证明其直接促进肿瘤细胞增殖 研究主要基于转录组分析,功能验证实验可进一步扩展;样本量相对有限,需更大队列验证 探究多发性骨髓瘤中单核细胞功能障碍与免疫逃逸之间的机制联系 健康供者和多发性骨髓瘤患者的外周血和骨髓单核细胞 单细胞组学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 健康供者和多发性骨髓瘤患者的外周血与骨髓样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
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