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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2026-09-19 |
STADiffuser: high-fidelity simulation and full-view 3D modeling of spatial transcriptomics
2026-08-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76829-1
PMID:42749702
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研究论文 | 提出STADiffuser,一种基于扩散模型的深度生成模型,用于空间转录组数据的高保真模拟和全视图3D建模 | 采用两阶段架构(图注意力自编码器学习spot嵌入+潜在扩散模型结合空间去噪网络),支持多样本和3D坐标,可扩展至百万级spot,实现对超过2000万spot的狨猴小脑图谱全视图3D建模 | 未明确提及 | 解决空间转录组技术成本高、数据稀疏、分辨率有限以及缺乏灵活高保真模拟器的问题 | 空间转录组数据,包括狨猴小脑图谱 | 机器学习, 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 扩散模型, 自编码器, 图注意力机制 | 空间转录组数据, 图像 | 狨猴小脑图谱超过2000万个spot | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 822 | 2026-09-19 |
Hypoxia enhances follicle survival and ameliorates markers of metabolic function in human ovarian cortical tissue culture
2026-Aug-18, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2026.105918
PMID:42753296
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了人卵巢皮质组织体外培养引起的基因表达和组织形态变化,并探讨了缺氧条件对代谢和卵泡存活的影响 | 首次利用单细胞转录组学系统表征人卵巢皮质组织体外培养诱导的细胞类型特异性转录变化,并证明缺氧培养可部分恢复代谢特征、改善卵泡存活 | 样本量较小(单细胞转录组学n=3,缺氧验证n=12),仅评估6天培养,未涉及长期培养或体内移植验证 | 探究人卵巢皮质组织6天体外培养对基因表达和组织形态的影响,并优化培养条件以减少培养诱导的变化 | 接受性别肯定手术或择期剖宫产供者的卵巢皮质组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据、图像 | 研究1中新鲜和培养样本n=3;研究2中来自12名供者的组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 823 | 2026-09-19 |
scE2TM improves single-cell embedding interpretability and reveals cellular perturbation signatures
2026-08-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76825-5
PMID:42744811
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研究论文 | 提出了一种外部知识引导的嵌入式主题模型scETM,用于可解释的单细胞RNA测序分析,提升细胞嵌入的可解释性并揭示细胞扰动特征 | 引入外部知识引导的嵌入式主题模型,通过嵌入聚类正则化鼓励每个主题表示不同的基因群,从而捕获独特的生物信息,并模拟主题扰动 | 未明确提及 | 解决单细胞RNA测序中计算方法的性能与生物学可解释性之间的平衡问题 | 单细胞RNA测序数据,包括干扰素刺激的外周血单核细胞和黑色素瘤数据集 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 嵌入式主题模型 | 文本(基因表达计数数据) | 20个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 824 | 2026-09-19 |
Decoding the sequence determinants of locus-specific DNA methylation across human tissues
2026-08-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76744-5
PMID:42744826
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研究论文 | 该论文提出了Melody深度学习框架,从10-kb基因组序列预测DNA甲基化,并开发了Melody-G整合单细胞RNA-seq基础模型嵌入来推断未见过细胞类型的甲基化状态 | 引入Melody深度学习框架,能够从10-kb基因组序列预测DNA甲基化,整合局部和长程序列信号,在全染色体、低甲基化区域和细胞类型特异性基准上优于现有方法,并开发Melody-G整合单细胞RNA-seq基础模型嵌入推断未见过细胞类型的甲基化状态 | 未明确提及 | 研究DNA甲基化的序列决定因素,预测位点特异性DNA甲基化,并连接基因组序列和细胞状态到DNA甲基化 | 人类组织中的DNA甲基化 | 机器学习 | NA | 深度学习,单细胞RNA-seq | 深度学习框架 | 基因组序列,甲基化数据,转录组数据 | 39个人类组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 825 | 2026-09-19 |
Single-cell landscape of immunological responses in CTLA4 haploinsufficiency patient after abatacept therapy
2026-Aug-05, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/94fa8r
PMID:42752352
|
研究论文 | 该研究通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序,分析了CTLA4单倍剂量不足患者在接受阿巴西普治疗前后的外周血单个核细胞免疫应答图谱 | 首次利用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序联合分析CTLA4单倍剂量不足患者在接受阿巴西普治疗前后的免疫细胞图谱,揭示了阿巴西普治疗可调节T细胞和B细胞亚群比例、减轻适应性及先天性免疫激活,并导致多种免疫细胞线粒体基因表达下调,提示代谢重编程效应 | 研究仅基于一例患者,样本量极小,结论的普遍性有限 | 探究阿巴西普治疗CTLA4单倍剂量不足的免疫应答机制 | CTLA4单倍剂量不足患者的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 免疫失调综合征 | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 质谱流式数据 | 1例患者治疗前后的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 826 | 2026-09-19 |
ITPRIPL1: A tumor immune-associated biomarker with prognostic and therapeutic implications in gastrointestinal cancer
2026-07-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-64178-4
PMID:42728269
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研究论文 | 通过对胃癌、结肠癌、直肠癌和食管癌的多组学整合分析,揭示ITPRIPL1作为胃肠道肿瘤免疫相关生物标志物的预后与治疗意义 | 首次系统评估ITPRIPL1在多种胃肠道恶性肿瘤中的肿瘤类型特异性,发现其预后意义仅局限于胃腺癌,并揭示其与免疫微环境(特别是CD8⁺/CD4⁺ T细胞丰度及ZAP70表达)的动态关联 | 研究以探索性分析为主,外部免疫治疗队列和药敏数据的验证尚需前瞻性研究证实,机制层面的功能实验较为有限 | 阐明ITPRIPL1在胃肠道恶性肿瘤中的肿瘤类型特异性、临床相关性及其作为预后和治疗靶点的潜力 | 胃腺癌、结肠腺癌、直肠腺癌和食管癌患者样本及细胞系 | 数字病理学 | 胃肠道肿瘤 | bulk转录组学, 免疫通路分析, 生存建模, 单细胞RNA测序, 免疫荧光验证, 治疗相关性分析 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 827 | 2026-09-19 |
Spatial characterization of interface dermatitis in cutaneous lupus reveals novel chemokine axis-mediated recruitment of leukocytes that drive disease
2026-07-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-60937-5
PMID:42744872
|
研究论文 | 通过空间转录组学和靶向蛋白质组学揭示皮肤型红斑狼疮界面皮炎的免疫发病机制,并发现新的趋化因子轴介导白细胞募集 | 首次在界面皮炎中鉴定出AIM2-Casp8-IL-18-CXCL6-CXCR1轴介导CD14+CD16+单核细胞募集,以及CCL8-CCR2和IFNG/IFNL1-CXCL9/CXCL11-CXCR3趋化因子轴,并发现羟氯喹和瑞帕辛可分别阻断不同单核细胞亚群的迁移 | 样本量较小(仅7例CLE患者和3例健康对照用于蛋白质组学,6例CLE和6例健康供体用于趋化实验),需要在更大队列中验证这些发现 | 研究皮肤型红斑狼疮中界面皮炎的免疫发病机制并寻找治疗靶点 | 皮肤型红斑狼疮患者(包括亚急性皮肤型红斑狼疮和盘状红斑狼疮)及健康对照者的皮肤组织和外周血单个核细胞 | 空间转录组学, 蛋白质组学, 免疫学 | 皮肤型红斑狼疮 | 空间转录组学, 靶向蛋白质组学, 光谱流式细胞术, 趋化实验 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 流式细胞数据 | 空间转录组学和蛋白质组学:4例SCLE、4例DLE和3例健康边缘对照的存档组织;靶向蛋白质组学:7例CLE(4例SCLE、3例DLE)和3例健康对照的新鲜水疱活检组织及血清;趋化实验:6例CLE和6例健康献血者的外周血单个核细胞 | NA | 空间转录组学, 靶向蛋白质组学, 光谱流式细胞术 | NA | NA |
| 828 | 2026-09-19 |
Single-Cell Transcriptome Profiles of Foxl1-Lineage Cells Along the Intestinal Crypt-Villus Axis
2026-Jul-16, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101849
PMID:42463014
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序结合原位杂交、免疫荧光和报告小鼠模型,构建了沿肠道隐窝-绒毛轴的Foxl1谱系细胞图谱,揭示了四种空间上不同的亚上皮细胞群及其信号特征。 | 首次在单细胞分辨率上系统描绘了沿肠道隐窝-绒毛轴的Foxl1谱系细胞异质性,鉴定出四种空间上不同的亚群(隐窝、绒毛基部、绒毛中部、绒毛顶端),并揭示了它们各自的信号程序、功能特化及其配对关系。 | 摘要中未明确提及研究局限性,可能包括样本量有限、仅基于小鼠模型、未进行功能验证实验等。 | 解析肠道隐窝-绒毛轴上Foxl1谱系细胞的异质性及其在维持肠道上皮稳态中的信号调控作用。 | 小鼠肠道隐窝-绒毛轴上的Foxl1谱系细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 免疫荧光 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 829 | 2026-09-19 |
Machine learning-based prognostic model and single-cell transcriptomic integration for identifying brain metastasis-associated malignant subpopulations and potential therapeutic targets in lung adenocarcinoma
2026-Jul-13, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04370-8
PMID:42443906
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研究论文 | 该研究整合单细胞转录组数据与机器学习方法,构建了肺腺癌脑转移相关的预后模型,并鉴定出SEC61G和CFL1作为潜在的恶性亚群标志物及治疗靶点 | 首次结合单细胞转录组学(inferCNV和hdWGCNA)与101种机器学习组合方法构建了肺腺癌脑转移信息指导的12基因预后模型,并系统揭示了脑转移肿瘤微环境中MIF-CD74/CXCR4和MIF-CD74/CD44信号轴的关键调控作用 | 脑转移单细胞样本量有限,预后模型仍需更大规模的前瞻性队列验证,SEC61G和CFL1的具体分子机制尚未完全阐明 | 表征肺腺癌脑转移的肿瘤微环境,识别脑转移相关的恶性细胞亚群,构建预后模型并发现潜在治疗靶点 | 肺腺癌脑转移患者的单细胞转录组样本、肺腺癌生存队列数据、人脑转移组织、小鼠脑转移模型及PC9-BrM细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, qRT-PCR | 机器学习组合模型, CNN | 图像, 文本 | 脑转移单细胞转录组样本及多个肺腺癌生存队列,具体样本量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 830 | 2026-09-19 |
IL-31 blockade elevates thymus and activation-regulated chemokine by lifting LAMP3+CD1c+ mature dendritic cells from calcitonin gene-related peptide-calcitonin receptor-like neuroimmune suppression in atopic dermatitis
2026-07, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.02.044
PMID:41831623
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研究论文 | 本研究通过血清蛋白质组学、小鼠模型、单细胞RNA测序及功能实验,揭示了IL-31受体阻断后TARC升高的神经免疫机制,即IL-31依赖的CGRP-CALCRL神经免疫刹车被解除,导致LAMP3+CD1c+成熟树突状细胞活化并释放TARC | 首次揭示了IL-31通过CGRP-CALCRL神经免疫轴抑制树突状细胞成熟和TARC产生的机制,阐明了nemolizumab治疗中TARC升高的原因,提出了神经免疫刹车的新概念 | 部分机制验证主要依赖小鼠MC903模型,人体数据以相关性分析为主,样本量有限,需要更大规模的临床研究验证 | 阐明IL-31受体A阻断后血清TARC升高的系统性变化及其神经免疫机制 | 特应性皮炎患者、MC903诱导的小鼠AD模型、人树突状细胞及人背根神经节 | 数字病理学, 机器学习 | 特应性皮炎 | 血清蛋白质组学(Olink), 单细胞RNA测序, 原位验证, 配体-受体推断分析 | NA | 图像, 文本 | 特应性皮炎患者样本(具体数量未提及)、MC903小鼠模型、人树突状细胞及人背根神经节样本 | Olink | 单细胞RNA测序, 血清蛋白质组学 | Olink | NA |
| 831 | 2026-09-19 |
Heterogeneity and clinical relevance of group 2 innate lymphoid cells subsets in nasal polyps
2026-07, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.03.021
PMID:41956382
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术揭示了鼻息肉中2型固有淋巴样细胞(ILC2)的异质性及其与临床严重程度的关系 | 首次在鼻息肉中鉴定出四种具有不同激活状态的ILC2亚群(迁移型、过渡型、炎症型和耗竭样型),并揭示了这些亚群与临床严重程度的特异性关联 | 样本量较小(仅6例鼻息肉组织和4例外周血样本),需要更大规模的队列研究验证 | 探究鼻息肉中2型细胞因子的细胞来源、ILC2亚群的异质性以及ILC2亚群与临床严重程度的关系 | 鼻息肉组织和外周血样本中的ILC2细胞和CD4+ T细胞 | 单细胞组学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例鼻息肉组织样本和4例外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 832 | 2026-09-19 |
Establishing a single-cell RNA sequencing workflow using EUS-guided fine-needle aspiration for pancreatic ductal adenocarcinoma
2026 Jul-Aug, Endoscopic ultrasound
IF:4.4Q1
DOI:10.1097/eus.0000000000000214
PMID:42751418
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研究论文 | 本研究评估了使用超声内镜引导细针穿刺(EUS-FNA)获取的胰腺导管腺癌(PDAC)样本进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)的可行性,并与手术切除样本的质量指标和细胞组成进行了比较 | 首次系统评估EUS-FNA来源PDAC样本用于scRNA-seq的可行性,并比较其与手术切除样本在质量指标和细胞组成上的差异 | 样本量有限,需要在更大规模、最好是配对的前瞻性队列中进一步验证 | 评估EUS-FNA来源PDAC样本进行scRNA-seq分析的可行性,并比较其与手术切除样本的质量指标和细胞组成 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者的EUS-FNA样本和手术切除样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics平台 |
| 833 | 2026-09-19 |
Hypoxic CA9-high mesenchymal-like glioma stem cells promote ANXA1-FPR1-dependent macrophage polarization in recurrent glioblastoma
2026-Jun-29, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03905-0
PMID:42374432
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研究论文 | 该研究整合公共转录组队列、单细胞RNA测序、定量蛋白质组学、配对临床标本及体内外功能实验,揭示缺氧诱导的CA9高表达间充质样胶质瘤干细胞通过ANXA1-FPR1轴促进复发性胶质母细胞瘤中免疫抑制性巨噬细胞极化 | 首次在单细胞分辨率下将CA9定位于复发性胶质母细胞瘤中缺氧相关MES样胶质瘤干细胞亚群,并揭示CA9-ANXA1-FPR1神经免疫串扰轴连接缺氧干性肿瘤状态与髓系重塑 | ANXA1被定位为贡献性旁分泌介质而非CA9驱动免疫抑制的唯一效应因子,其完整下游机制及治疗靶向价值仍需进一步验证 | 阐明CA9在复发性胶质母细胞瘤中的细胞状态特异性分布及其在胶质瘤干细胞-巨噬细胞串扰中的作用 | 复发性胶质母细胞瘤患者临床标本、胶质母细胞瘤细胞系及患者来源胶质瘤干细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、定量蛋白质组学、qRT-PCR、Western blotting、ELISA、启动子报告基因实验 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据、图像 | 公共转录组队列及配对临床标本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 834 | 2026-09-19 |
Single-cell profiling of gastric cancer ascites reveals an epithelial-immune dual phenotype signature predictive for anti-PD-1 immunotherapy responses
2026-06-29, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-05017-1
PMID:42374437
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组和TCR/BCR免疫组库分析胃癌恶性腹水与外周血的免疫景观,发现具有上皮-免疫双重表型的EIDPC细胞群,并构建IRS-EIDPC特征用于预测抗PD-1免疫治疗反应 | 首次鉴定出具有上皮-免疫双重表型的EIDPC细胞群,并基于其10个核心基因构建了能够准确预测抗PD-1治疗反应和预后的IRS-EIDPC特征(AUC达0.929) | 样本量较小(仅10例患者),需要更大规模的独立队列进一步验证EIDPC的生物学功能和IRS-EIDPC特征的临床适用性 | 揭示胃癌恶性腹水的免疫景观,鉴定预测抗PD-1免疫治疗反应的生物标志物 | 10例晚期胃癌患者的配对恶性腹水样本和外周血单个核细胞(PBMC)样本,以及独立胃癌临床队列 | 数字病理学, 机器学习 | 胃癌 | 单细胞转录组测序, TCR/BCR免疫组库分析, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 文本 | 10例晚期胃癌患者的配对恶性腹水和外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 835 | 2026-09-19 |
Inferring genetic associations of programmed cell death genes with retinitis pigmentosa through multimodal Mendelian randomization
2026-Jun-27, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-026-01547-9
PMID:42365225
|
研究论文 | 该研究通过整合多模态数据(GWAS、eQTL/pQTL、转录组数据),利用孟德尔随机化等方法推断程序性细胞死亡相关基因与视网膜色素变性的遗传关联 | 首次通过整合多模态框架(GWAS、eQTL/pQTL、bulk和单细胞RNA-seq)系统性地推断程序性细胞死亡相关基因与视网膜色素变性的遗传因果关系,并结合多种验证方法(SMR、贝叶斯共定位、MVMR、PheWAS)确保结果稳健性 | 研究主要基于公开数据库的汇总统计数据,缺乏实验验证;样本主要来自欧洲人群,可能存在人群特异性限制;未进行功能实验验证所识别的核心基因在RP发病中的具体机制 | 通过整合多模态框架识别程序性细胞死亡相关基因在视网膜色素变性发病中的遗传作用,并寻找新的治疗靶点 | 程序性细胞死亡相关基因、视网膜色素变性、视网膜转录组 | 机器学习, 数字病理学 | 视网膜色素变性 | GWAS, eQTL, pQTL, 孟德尔随机化, SMR, 贝叶斯共定位, MVMR, PheWAS, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | CIBERSORT | 文本, 图像 | 三个GWAS汇总统计数据集(ebi-a-GCST90018912、ebi-a-GCST90013904、ebi-a-GCST90013954),bulk转录组数据集GSE62020,单细胞转录组数据集GSE183206 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, GWAS, eQTL, pQTL | NA | NA |
| 836 | 2026-09-19 |
Identification of a long-term surviving human mesenchymal stromal cell subpopulation and implications for recessive dystrophic epidermolysis bullosa treatment
2026-Jun-27, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-05101-6
PMID:42365332
|
研究论文 | 该研究通过体外预处理人骨髓间充质干细胞并注射到免疫缺陷小鼠体内,利用单细胞RNA测序和空间转录组学鉴定了一个能长期存活的间充质干细胞亚群,并探讨其对隐性营养不良型大疱性表皮松解症治疗的启示 | 首次鉴定出注射后能存活长达54至61周的人骨髓间充质干细胞亚群,并发现该亚群独立于体外预处理条件而预先存在于注射群体中 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体中验证;样本来源限于健康供体,未涉及RDEB患者细胞;体外预处理策略未能显著改善干细胞存活率 | 优化人骨髓间充质干细胞的体外培养条件,以提高其在局部注射后的存活率,从而改善隐性营养不良型大疱性表皮松解症的治疗效果 | 健康人类供体来源的骨髓间充质干细胞及免疫缺陷小鼠模型 | 数字病理学, 机器学习 | 隐性营养不良型大疱性表皮松解症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 慢病毒转导, 体内生物发光成像 | NA | 图像, 文本 | 来自健康人类供体的骨髓间充质干细胞,注射到免疫缺陷小鼠中,具体样本数未在摘要中明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 837 | 2026-09-19 |
A single-cell transcriptomic atlas of the pigtail macaque placenta in late gestation
2026-Jun-26, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-13095-x
PMID:42363068
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研究论文 | 该研究构建了妊娠晚期猪尾猕猴胎盘的多个母胎界面组织的单细胞转录组图谱 | 首次在妊娠晚期对猪尾猕猴胎盘的三个母胎界面组织(绒毛膜绒毛、绒毛膜羊膜和母体蜕膜)进行深度单细胞RNA测序,并系统比较其与人类胎盘的细胞组成相似性 | 仅涉及单一时间点(妊娠晚期),未涵盖妊娠早期和中期,且样本量有限 | 构建非人灵长类(猪尾猕猴)胎盘的妊娠晚期单细胞转录组图谱,以理解母胎界面细胞群体的组成,并为研究人类妊娠并发症提供参考 | 猪尾猕猴(Macaca nemestrina)妊娠晚期的胎盘组织,包括绒毛膜绒毛(胎盘盘)、绒毛膜羊膜和母体蜕膜 | 单细胞转录组学 | 妊娠并发症 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | Seurat | 单细胞转录组数据 | 三种母胎界面组织(绒毛膜绒毛、绒毛膜羊膜、母体蜕膜),具体细胞数未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 未在摘要中提供详细配置信息 |
| 838 | 2026-09-19 |
Myeloid Cdc42 deficiency-mediated macrophage pyroptosis exacerbates diabetic cardiomyopathy in type 1 diabetes mellitus
2026-Jun-26, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-026-03268-z
PMID:42363173
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研究论文 | 本研究探讨了髓系Cdc42缺失通过促进巨噬细胞焦亡和炎症反应加重1型糖尿病诱导的糖尿病心肌病 | 首次揭示髓系Cdc42缺失通过激活ERK1/2-NF-κB-IL-1β信号通路介导巨噬细胞焦亡,从而加重1型糖尿病心肌病 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证Cdc42作为治疗靶点的有效性 | 探究髓系Cdc42在1型糖尿病诱导的糖尿病心肌病中的作用及其潜在机制 | 髓系特异性Cdc42敲除小鼠和Cdc42Flox/Flox对照小鼠的糖尿病心肌病模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像,文本 | 使用公开的GSE数据集中的STZ诱导1型糖尿病小鼠单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 839 | 2026-09-19 |
Mapping the evolutionary landscape of intestinal organoids: from self-organization biology to precision medicine
2026-Jun-24, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-05094-2
PMID:42343431
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研究论文 | 该文通过文献计量分析,系统描绘了1986至2025年间肠道类器官研究的全球演化图景 | 首次对肠道类器官研究进行大规模文献计量分析,揭示从自组织生物学到精准医学的范式转变,并识别出器官芯片、力学生物学和单细胞测序等新兴热点 | 仅基于Web of Science核心合集数据,可能存在文献收录偏差,且文献计量分析无法深入评估具体研究的技术细节 | 全面映射肠道类器官研究领域的演化轨迹,识别研究热点和未来方向 | 1986至2025年间Web of Science核心合集中肠道类器官相关文献 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 文献计量分析 | NA | 文本 | Web of Science核心合集中1986至2025年肠道类器官相关文献(具体数量未提及) | NA | NA | NA | 使用VOSviewer和bibliometrix工具进行文献计量分析 |
| 840 | 2026-09-19 |
Single-cell and multi-omics integration delineates the landscape of gene-wise intratumor heterogeneity and identifies prognostic biomarkers for immunotherapy in non-small cell lung cancer
2026-Jun-20, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04454-4
PMID:42322411
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研究论文 | 该研究通过单细胞和多组学整合刻画了非小细胞肺癌中基因水平瘤内异质性图谱,并构建了LITHrisk评分用于预测免疫治疗预后和响应 | 首次系统性地刻画了非小细胞肺癌中基因水平瘤内异质性图谱,发现PD-L1、LAG3、TIM-3等免疫检查点基因为低异质性基因,并构建了基于低异质性基因的LITHrisk评分用于免疫治疗预后预测 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 刻画非小细胞肺癌基因水平瘤内异质性图谱并识别免疫治疗预后生物标志物 | 非小细胞肺癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 多区域转录组测序, 机器学习 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |