单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 9342 篇文献,本页显示第 8261 - 8280 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
8261 2026-02-24
Multi-gene biomarkers reveal spatial organization and subpopulation-specific damage response in intrahepatic biliary epithelial cells
2026-Feb-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习算法识别小鼠肝内胆管上皮细胞的亚群及其生物标志物,并利用杂交链式反应荧光原位杂交验证其空间定位和损伤响应 开发了NSForest机器学习算法识别BEC亚群的最小多基因特征,首次揭示了BEC亚群在胆管内的空间组织和同质细胞邻域的形成,并发现损伤条件下亚群特异性基因下调及增殖亚群的出现 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证;体外培养系统可能无法完全模拟体内微环境 识别小鼠肝内胆管上皮细胞的亚群和生物标志物,探究其空间组织和损伤响应机制 小鼠肝内胆管上皮细胞 单细胞组学 肝病 scRNA-seq, 杂交链式反应荧光原位杂交 NSForest机器学习算法 单细胞转录组数据, 图像数据 小鼠肝组织样本(包括胆管结扎和假手术对照组) NA 单细胞RNA-seq NA NA
8262 2026-02-24
Tumor-derived Extracellular Vesicles Induce ER Stress to Drive Tolerogenic Dendritic Cell Development in the Tumor Microenvironment
2026-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了肿瘤来源的细胞外囊泡通过触发未折叠蛋白反应,诱导树突状细胞向耐受性状态转变,从而促进肿瘤免疫逃逸的机制 首次阐明了肿瘤EV通过PERK-ATF4和IRE1α-XBP1s信号轴触发UPR,进而激活SREBP2和PPAR-α转录因子,驱动树突状细胞脂质代谢重编程的完整信号通路 研究主要基于黑色素瘤模型,在其他肿瘤类型中的普适性有待验证;体内实验主要使用基因工程小鼠模型,人类临床样本验证不足 探究肿瘤微环境中肿瘤来源细胞外囊泡如何调控树突状细胞功能,并评估靶向相关通路克服免疫治疗耐药性的治疗潜力 树突状细胞、肿瘤来源的细胞外囊泡、CD8+ T细胞、CD4+ FoxP3+ 调节性T细胞 肿瘤免疫学 黑色素瘤 单细胞RNA测序、批量RNA测序、多参数流式细胞术、Western blotting、实时定量PCR、细胞代谢测定 NA RNA测序数据、流式细胞术数据、蛋白质印迹数据、基因表达数据 未明确具体样本数量,使用工程化肿瘤模型和基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
8263 2026-02-24
Proteomics and single-cell transcriptomics identify LRP1 as a diagnostic biomarker for atypical fibroxanthoma and pleomorphic dermal sarcoma
2026-Feb-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过蛋白质组学和单细胞转录组学分析,鉴定出LRP1作为非典型纤维黄瘤和多形性真皮肉瘤的诊断生物标志物 首次结合单细胞RNA测序和批量蛋白质组学数据,在AFX/PDS与其他皮肤梭形细胞肿瘤的鉴别诊断中,发现了LRP1、LTBP2和NAV1在mRNA和蛋白水平均富集,并验证了LRP1具有比现有临床标志物CD10更高的诊断性能 研究队列规模有限,且生物标志物在更广泛人群和不同病理亚型中的验证仍需进一步研究 寻找用于鉴别诊断非典型纤维黄瘤和多形性真皮肉瘤的临床有价值的生物标志物 非典型纤维黄瘤、多形性真皮肉瘤、皮肤平滑肌肉瘤、梭形细胞黑色素瘤、肉瘤样鳞状细胞癌 数字病理学 皮肤肿瘤 单细胞RNA测序, 批量蛋白质组学, 免疫组织化学 NA 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像数据 包含AFX、PDS、cLMS、SCM和sSCC的队列 NA 单细胞RNA-seq, 批量蛋白质组学 NA NA
8264 2026-02-24
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal heterogeneity and key subgroups in ovarian cancer: HOXA1 identified as a potential therapeutic biomarker
2026-Feb-05, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了卵巢癌的异质性,并识别了关键细胞亚群和转录因子HOXA1作为潜在治疗生物标志物 结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,从时空角度阐明卵巢癌异质性,并构建了基于SAA1⁺肿瘤细胞的风险预后模型STRS 研究数据主要来源于GEO和TCGA数据库,可能受限于样本来源和临床信息的完整性,且未进行实验验证 揭示卵巢癌的异质性,识别关键细胞亚群和生物标志物,以优化诊断和治疗策略 卵巢癌患者样本的单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 预后模型 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
8265 2026-02-06
Subject: letter to the editor: platelet single-cell RNA sequencing
2026-Feb-04, Journal of thrombosis and thrombolysis IF:2.3Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
8266 2026-02-22
stGCL: a versatile cross-modality fusion method based on multi-modal graph contrastive learning for spatial transcriptomics
2026-Jan-28, Genome biology IF:10.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
8267 2026-02-24
SLC25A37 as a novel therapeutic target for benign prostatic hyperplasia: integrative analyses of single-cell RNA sequencing and genome-wide association studies
2026-Jan, Open medicine (Warsaw, Poland)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和全基因组关联分析,鉴定出SLC25A37是良性前列腺增生(BPH)的一个新型致病基因,并探索了其作为治疗靶点的潜力 首次将单细胞RNA测序与全基因组关联研究相结合,在BPH的经典单核细胞中鉴定出SLC25A37这一新的致病基因,并探索了靶向该基因的潜在治疗药物 未明确说明样本的具体数量,且体外实验验证可能不足以完全代表体内复杂的病理生理环境 识别良性前列腺增生(BPH)的致病基因并探索潜在的治疗靶点 良性前列腺增生(BPH)患者与健康对照者的前列腺组织 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),全基因组关联研究(GWAS),孟德尔随机化(MR),贝叶斯共定位,分子对接,流式细胞术,qRT-PCR,蛋白质印迹,免疫组织化学,免疫荧光染色 NA 单细胞RNA测序数据,基因组关联数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8268 2026-02-24
Multi-scale systems toxicology defines a KLF5-centered adverse outcome pathway linking DEHP exposure to pancreatic cancer progression and signaling programs relevant to therapy tolerance
2026, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过多尺度系统毒理学框架,揭示了DEHP暴露通过KLF5中心的不良结局通路促进胰腺癌进展的机制 整合了异质集成机器学习、孟德尔随机化、分子对接与动力学、单细胞转录组学等多种方法,首次提出KLF5为中心的DEHP-PDAC关联通路 研究结果主要为假设生成性质,需要进一步实验验证 阐明DEHP暴露与胰腺癌进展之间的分子机制和不良结局通路 胰腺导管腺癌(PDAC)相关基因、KLF5蛋白、PANC-1细胞系 系统毒理学 胰腺癌 单细胞转录组学、分子对接、分子动力学模拟、孟德尔随机化 TabPFN增强集成模型、异质集成机器学习 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据、分子结构数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8269 2026-02-24
Multi-omics comprehensive analysis identified KIF22 and KRAS as highly synthetic lethal pairs for triple-negative breast cancer
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过多组学分析识别出KIF22和KRAS作为三阴性乳腺癌的合成致死基因对 首次通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序等多组学数据,结合机器学习方法,系统性地鉴定出三阴性乳腺癌中具有高合成致死活性的新型细胞亚型,并实验验证了KIF22和KRAS作为合成致死基因对的功能 研究主要基于生物信息学分析和体外体内实验验证,临床转化潜力尚需进一步临床试验评估 探索三阴性乳腺癌的异质性,识别与疾病进展相关的合成致死基因对,为靶向治疗提供新策略 三阴性乳腺癌细胞及其微环境细胞亚群 生物信息学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 随机森林, 机器学习 RNA测序数据 未明确指定具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
8270 2026-02-24
ESRP1 drives epithelial-mesenchymal transition by activating EPAC-RAP1A signaling axis
2026, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本研究揭示了ESRP1通过激活EPAC-RAP1A信号轴驱动上皮-间质转化,从而促进特发性肺纤维化进展 首次在单细胞水平上识别ESRP1作为EMT的关键上游调控因子,并阐明其通过EPAC-RAP1A轴的新机制 研究主要基于小鼠模型和细胞系,人类样本验证不足,且未探讨其他潜在信号通路 探究特发性肺纤维化中上皮-间质转化的分子机制 小鼠肺组织、原代肺泡上皮细胞、MLE-12肺泡上皮细胞系 单细胞转录组学 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序、qPCR、Western blot、免疫荧光、Co-IP NA 单细胞转录组数据、基因表达数据、蛋白质互作数据 未明确样本数量,包括BLM处理的小鼠模型和细胞培养实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8271 2026-02-23
Therapeutic reprogramming of circulating myeloid cells via signal regulatory protein α extracellular vesicles in acute kidney injury
2026-Mar, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本文探讨了通过表达高亲和力信号调节蛋白α变体的细胞外囊泡靶向CD47,以治疗急性肾损伤 开发了表达高亲和力SIRPα变体的细胞外囊泡,用于系统性靶向循环髓系细胞中的CD47,提供了一种新型免疫调节策略 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且长期疗效和安全性未充分评估 研究靶向CD47的细胞外囊泡在急性肾损伤中的治疗潜力 人类急性肾损伤样本和小鼠模型(顺铂和双侧缺血/再灌注) 数字病理学 急性肾损伤 单细胞RNA测序,CD47蛋白染色 NA RNA测序数据,蛋白质染色图像 人类急性肾损伤标本和两种小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8272 2026-02-23
Mechanistic insights from transcript analysis of long-term pig to non-human primate kidney xenografts
2026-Mar, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本文通过转录分析探讨了猪到非人灵长类动物肾脏异种移植物的长期机制,揭示了稳定移植物中转录升高、VEGFA损失与血栓性微血管病相关,以及异种移植物中供体内皮转录损失和受体内皮转录获得的新颖过程 研究发现异种移植物中供体内皮转录损失和受体内皮转录及蛋白的意外获得,这是一种在异种移植物中检测到的新过程,与同种异体移植中的抗体介导排斥反应形成对比 研究基于非人灵长类动物模型,可能不完全适用于人类临床环境,样本数量有限(58个样本),且依赖于转录分析,需要进一步功能验证 研究猪肾脏异种移植物在非人灵长类动物中的长期转录机制,以了解异种移植与同种异体移植的不同机制 eGenesis猪肾脏异种移植物在猕猴中的样本,包括供体、灌注后、协议和终末样本 数字病理学 肾脏疾病 转录分析、空间转录组学、抗体检测 NA 转录数据、空间转录组数据、蛋白质表达数据 58个样本来自猕猴中的猪肾脏异种移植物 NA 空间转录组学 NA NA
8273 2026-02-23
Lactate metabolism-driven tumor heterogeneity and molecular signatures in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Feb-21, World journal of gastroenterology IF:4.3Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,系统表征了肝内胆管癌中乳酸代谢驱动的异质性及其分子和功能意义 首次在单细胞水平系统表征了肝内胆管癌中乳酸代谢的异质性,并利用多种机器学习算法识别出12个与乳酸代谢相关的特征基因,其中CYC1被鉴定为主要驱动基因 研究主要基于转录组数据,功能验证仅限于细胞系实验,缺乏体内模型和临床样本的进一步验证 系统表征肝内胆管癌中乳酸代谢驱动的异质性及其分子和功能意义 肝内胆管癌恶性细胞 机器学习 肝内胆管癌 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 定量PCR, 细胞功能实验 LASSO, 随机森林, 梯度提升机, 自适应最佳子集选择, 决策树 RNA测序数据, 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
8274 2026-02-23
Interpretable inflammation landscape of circulating immune cells
2026-Feb, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术,描绘了感染、免疫介导炎症性疾病和癌症中循环免疫细胞的炎症过程,构建了一个包含超过650万个外周血单个核细胞的单细胞图谱 通过大规模单细胞图谱学习循环免疫细胞的全面炎症模型,并利用无监督和可解释机器学习开发疾病分类框架 研究主要基于外周血单个核细胞,可能未完全涵盖组织特异性炎症反应 全面理解循环免疫细胞的炎症过程,开发炎症性疾病的分类框架 循环免疫细胞,特别是外周血单个核细胞 单细胞转录组学 感染、免疫介导炎症性疾病、癌症 单细胞转录组学 无监督机器学习、可解释机器学习 单细胞RNA-seq数据 1,047名患者(56%女性,43%男性),超过650万个外周血单个核细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8275 2026-02-23
An integrated single-cell lung cancer atlas reveals distinct fibroblast phenotypes between adenocarcinoma and squamous cell carcinomas
2026-Jan-23, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过整合公共可用的单细胞RNA测序数据,构建了一个非小细胞肺癌的综合图谱,揭示了肺腺癌和肺鳞状细胞癌之间肿瘤微环境异质性、细胞组成以及癌症相关成纤维细胞亚型的显著差异 首次通过整合大规模公共单细胞RNA测序数据,系统比较了肺腺癌和肺鳞状细胞癌中肿瘤微环境的异质性,并明确了两种亚型中占主导地位的癌症相关成纤维细胞亚型及其与预后的不同关联 研究依赖于公共数据集,可能存在批次效应;研究结果主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;共培养实验在体外进行,可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 探究非小细胞肺癌中肺腺癌和肺鳞状细胞癌之间肿瘤微环境,特别是癌症相关成纤维细胞亚型的差异及其与预后的关系 非小细胞肺癌患者肿瘤组织中的细胞,特别是癌症相关成纤维细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 整合了公共可用的大规模单细胞RNA测序数据集(具体样本数量未在摘要中明确给出) NA 单细胞RNA-seq NA NA
8276 2026-02-23
Expression Atlas in 2026: enabling FAIR and open expression data through community collaboration and integration
2026-Jan-06, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了Expression Atlas知识库在2026年的更新,包括内容扩展、功能增强和社区协作,以支持FAIR原则下的基因和蛋白质表达数据 新增了批量基线实验的标记基因分析模块,整合了单细胞RNA-seq数据集如Tabula Sapiens和GTEx单核图谱,并计划提供AI就绪数据格式 未明确提及具体的技术或数据局限性,主要关注资源更新和未来方向 通过社区协作和集成,实现FAIR和开放的表达数据,支持基础和转化研究 基因和蛋白质表达数据,涵盖组织、细胞类型、条件和多种物种 生物信息学 NA 单细胞RNA-seq,蛋白质组学 NA 基因表达数据,蛋白质表达数据 超过4500项研究,涉及67个物种,包括数百个单细胞RNA-seq实验 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
8277 2026-02-22
Tumor necrosis factor from leukemic environment stimulates hematopoietic stem/progenitor cells toward megakaryocyte/myeloid lineage bias
2026-Mar, Experimental hematology IF:2.5Q3
研究论文 本研究探讨了急性髓系白血病(AML)骨髓环境中肿瘤坏死因子(TNF)如何驱动残留的正常造血干细胞/祖细胞向巨核细胞/髓系谱系分化,导致其耗竭 揭示了AML骨髓微环境中TNF-α信号上调是导致残留正常造血干细胞/祖细胞谱系偏向和功能耗竭的关键机制,为理解白血病生物学和正常造血提供了新视角 研究主要基于小鼠模型和体外实验,其在人类AML中的直接适用性尚需进一步验证 阐明AML骨髓中残留正常造血系统受损的机制 MLL-AF9诱导的AML小鼠骨髓中的非白血病(nl)造血干细胞/祖细胞(HSPCs)以及正常HSCs/HSPCs 血液学/肿瘤学 急性髓系白血病 单细胞转录组分析 NA 基因表达数据 AML小鼠模型中的造血干细胞/祖细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8278 2026-02-22
Single-cell characterization of the adult male hippocampus suggests a prominent, and cell-type specific, role for Nrgn and Sgk1 in response to a social stressor
2026-Mar, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,对成年雄性小鼠海马体在基线和急性应激条件下的分子特征进行了全面表征,揭示了应激反应中的细胞类型特异性分子机制 首次在成年雄性小鼠海马体中,结合单细胞RNA测序和糖皮质激素受体与盐皮质激素受体基因敲除模型,系统揭示了应激反应的细胞类型特异性分子特征,并识别出Nrgn和Sgk1作为关键调控因子 研究仅聚焦于成年雄性小鼠,未涉及雌性或不同年龄阶段的动物,且应激模型为单一的社会挫败应激,可能无法全面反映其他应激类型的影响 探究应激相关精神障碍的分子机制,特别是海马体在应激反应中的细胞类型特异性调控网络 成年雄性小鼠的海马体组织,包括谷氨酸能神经元、GABA能神经元、少突胶质细胞、星形胶质细胞和内皮细胞等多种细胞类型 单细胞组学 应激相关精神障碍 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但描述为最大且最全面的成年雄性小鼠海马体表征 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8279 2026-02-22
Captopril restores microglial homeostasis and reverses ASD-like phenotype in a model of ASD induced by exposure in utero to anti-caspr2 IgG
2026-Mar, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 本研究探讨了孕期暴露于母体抗Caspr2抗体如何导致子代小鼠出现自闭症谱系障碍样表型,并发现血脑屏障可渗透的ACE抑制剂卡托普利能恢复小胶质细胞稳态并改善相关行为缺陷 首次揭示了孕期母体抗Caspr2抗体暴露通过诱导小胶质细胞持续活化和代谢功能障碍导致ASD样表型的机制,并发现卡托普利可通过恢复小胶质细胞稳态逆转该表型 研究主要基于小鼠模型,其在人类中的直接适用性尚需验证;仅针对与抗Caspr2抗体相关的ASD亚型 探究孕期母体抗体暴露导致神经发育障碍的机制,并寻找潜在治疗策略 暴露于母体抗Caspr2抗体的子代小鼠(雄性) 神经科学 自闭症谱系障碍 单细胞RNA测序 动物模型(小鼠) 基因表达数据、行为数据 未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8280 2026-02-22
Myeloid landscape profiling identifies DLBCL-specific suppressive macrophages colocalized with blood endothelial cells
2026-Feb-24, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞技术揭示了弥漫性大B细胞淋巴瘤中肿瘤相关巨噬细胞与血管内皮细胞共活化的特异性模式及其与免疫抑制微环境和不良预后的关联 首次在单细胞水平系统描绘B细胞淋巴瘤中单核吞噬细胞的异质性,并发现DLBCL特异性ANXA1+FPR1/2+S100A9+巨噬细胞-内皮细胞空间互作轴 研究样本主要来自淋巴结组织,未全面评估其他淋巴器官或转移灶的微环境特征 解析B细胞淋巴瘤肿瘤微环境中单核吞噬细胞与基质细胞的异质性及相互作用机制 弥漫性大B细胞淋巴瘤和滤泡性淋巴瘤患者的淋巴结组织及反应性次级淋巴器官 数字病理学 淋巴瘤 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术,空间成像分析 NA 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,空间成像数据 未明确样本数量(B细胞淋巴瘤淋巴结与反应性淋巴器官对比) NA 单细胞RNA-seq,质谱流式细胞术 NA NA
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