本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2026-09-19 |
An Integrative Strategy Delineates Modular Metabolic Remodeling and Potential Therapeutic Targets Across Metabolic Diseases
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76250
PMID:42325124
|
研究论文 | 通过整合已发表的单细胞RNA测序数据集,构建了涵盖七种主要代谢疾病的单细胞代谢图谱,开发了评估代谢通路活性的综合分析策略,揭示了模块化代谢重塑并识别了潜在治疗靶点 | 构建了包含562699个细胞的大规模单细胞代谢图谱,开发了评估227条代谢通路活性的先进整合分析策略,识别了89条疾病富集通路并组织为15个协同代谢模块,揭示了跨细胞类型调控回路和63个潜在治疗靶点,并开发了开放获取资源 | 基于已发表数据集的整合分析,可能受原始数据异质性限制,未进行实验验证 | 阐明不同代谢通路与代谢疾病临床相关性之间的联系,揭示模块化代谢重塑的保守原理并发现治疗靶点 | 七种主要代谢疾病的86名患者的562699个细胞 | 机器学习 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 562699个细胞来自86名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 802 | 2026-09-19 |
Dynamic cellular programs of human cardiac allograft rejection revealed by spatial transcriptomics
2026-Sep, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-026-00849-9
PMID:42576067
|
研究论文 | 利用亚细胞分辨率的图像空间转录组学对人类心脏活检样本进行分析,以刻画心脏移植排斥反应期间的转录异质性 | 首次在纵向人类心脏活检中应用亚细胞分辨率的图像空间转录组学,揭示了排斥反应严重程度之间的转录状态重叠、排斥等级内的显著异质性,以及应答者和无应答者之间的不同转录组谱 | 样本量相对有限(62例),且仅基于心脏移植排斥反应,未涉及其他实体器官移植 | 表征人类心脏移植受者在组织学诊断的排斥反应期间及之后的转录异质性,以改善诊断和风险分层 | 62名成人和儿童心脏移植受者的纵向心脏活检样本 | 空间转录组学 | 心脏移植排斥反应 | 图像空间转录组学 | NA | 图像 | 62名心脏移植受者的纵向活检样本 | NA | 空间转录组学 | NA | 基于图像的空间转录组学,亚细胞分辨率 |
| 803 | 2026-09-19 |
The CCL2-CCR2-Ly6c + macrophage axis in PegIFNα-2b therapy for chronic hepatitis B
2026-Sep, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2026.153227
PMID:42594731
|
研究论文 | 本研究通过公共单细胞数据集和AAV-HBV感染的人源化小鼠模型,揭示CCL2-CCR2-Ly6c+巨噬细胞轴在PegIFNα-2b治疗慢性乙型肝炎中介导抗病毒疗效的关键免疫调控作用 | 首次系统阐明CCL2-CCR2-Ly6c+巨噬细胞轴在干扰素治疗慢性乙型肝炎中的免疫调控机制,揭示该轴协调巨噬细胞募集、功能分化和细胞间通讯从而介导PegIFNα-2b抗病毒效果 | 研究主要基于小鼠模型,人类慢性乙肝患者的临床验证尚需进一步开展 | 阐明CCL2-CCR2-巨噬细胞信号轴是否以及如何介导干扰素-α治疗慢性乙型肝炎的抗病毒疗效 | AAV-HBV感染的人源化I型干扰素受体小鼠(huIFNAR小鼠)及公共单细胞数据集(GSE237519) | 数字病理学 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 804 | 2026-09-19 |
Resveratrol Modulates Lung Cancer-Associated Hub Genes Identified by Integrated Bioinformatics, Single-Cell Analysis, Molecular Docking, and Experimental Validation
2026-Sep, Cell biochemistry and biophysics
IF:1.8Q4
DOI:10.1007/s12013-026-02142-9
PMID:42599654
|
研究论文 | 该研究通过整合生物信息学、单细胞分析、分子对接和实验验证,识别了肺癌相关的五个核心基因(CASP3、DDX54、TP53BP1、CDKN2A、ABT1),并初步证明白藜芦醇可能调控这些基因的表达 | 首次整合差异表达分析、WGCNA、单细胞RNA测序、分子对接及体外实验,系统识别肺癌核心基因并预测白藜芦醇的调控作用 | 研究主要基于生物信息学预测和体外细胞实验,缺乏体内动物模型和临床样本验证,白藜芦醇调控核心基因的具体机制尚未完全阐明 | 识别与肺癌进展相关的关键基因,并探索白藜芦醇对这些基因的潜在调控作用 | 肺癌样本、对照样本、BEAS-2B正常肺上皮细胞和A549肺癌细胞 | 生物信息学、单细胞分析、分子对接 | 肺癌 | 差异表达分析、WGCNA、单细胞RNA测序、分子对接、CCK-8、Western blotting、qRT-PCR | WGCNA、蛋白质-蛋白质相互作用网络、分子对接 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、图像、文本 | GSE43458数据集包含80个肺癌样本和30个对照样本;GSE131907单细胞RNA测序数据;BEAS-2B和A549细胞系 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 805 | 2026-09-19 |
Exploring the mechanism underlying negative pressure wound therapy in promoting the healing of diabetic foot ulcers via integrated multi-omics and bioinformatics approaches
2026-Sep, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2026.153228
PMID:42600283
|
研究论文 | 该研究通过整合批量RNA测序、单细胞RNA测序和生物信息学方法,探索负压伤口治疗促进糖尿病足溃疡愈合的分子机制,提出NPWT-GRHL2-MET-细胞转化的信号轴 | 首次提出NPWT-GRHL2-MET-细胞转化的信号轴,建立了糖尿病足溃疡修复中'间充质成纤维细胞-棘上层角质形成细胞'的间充质-上皮转化模型,从宏观组织修复表型深入到微观细胞命运决定层面揭示NPWT的生物学效应 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据分析,分子对接结果仅提供潜在药物 efficacy 的预测,缺乏体内功能实验验证;临床样本验证仅限于GRHL2的免疫荧光表达验证,样本量有限 | 探索负压伤口治疗促进糖尿病足溃疡愈合的具体分子机制 | 糖尿病足溃疡患者样本及公共数据库中的DFU相关RNA-seq和scRNA-seq数据 | 数字病理学, 机器学习 | 糖尿病足溃疡 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, GSVA, AddModuleScore, CytoTRACE, 伪时间轨迹分析, 免疫荧光, 分子对接, 机器学习 | 多种机器学习算法(未具体指定), CytoTRACE | 基因表达数据(RNA-seq), 图像(免疫荧光) | 13例糖尿病足溃疡单细胞样本,以及来自GEO数据库的批量RNA-seq数据 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 806 | 2026-08-23 |
Correction to "Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Heterogeneity in Differentiation Trajectory and Tumor Microenvironment Leading to More Aggressive Phenotypes of Papillary Thyroid Cancer in Children and Young Adult Patients"
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.77252
PMID:42627634
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 807 | 2026-09-19 |
IL-33/IL1RL1 (ST2) signalling drives immune suppression in squamous intraepithelial hyperplasia
2026-Sep-01, Tumour virus research
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.tvr.2026.200350
PMID:42679897
|
研究论文 | 该研究利用HPV16-E7癌蛋白介导的小鼠鳞状上皮增生模型,揭示了IL-33/IL1RL1信号轴通过招募Tregs介导免疫抑制,促进上皮增生向鳞状细胞癌发展的机制 | 首次利用空间转录组学证明IL1RL1+Foxp3+Tregs与表达IL-33的细胞在小鼠模型和人宫颈上皮内瘤变组织中空间邻近,并发现IL-33的胞质定位与其生物活性相关 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限,IL1RL1信号通路作为治疗靶点的有效性和安全性尚需进一步临床前和临床研究验证 | 探究IL-33/IL1RL1信号通路在鳞状上皮增生中调控上皮细胞与免疫细胞相互作用的机制及其在免疫抑制中的功能角色 | HPV16-E7癌蛋白介导的小鼠鳞状上皮增生模型及人宫颈上皮内瘤变组织 | 数字病理学 | 鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 808 | 2026-09-19 |
Muscularis EGR1 Deficiency Impairs M2 Macrophage Polarization and Disrupts Gastric Motility in Diabetic Gastroparesis
2026-Sep, Neurogastroenterology and motility
IF:3.5Q2
DOI:10.1111/nmo.70439
PMID:42745198
|
研究论文 | 本研究揭示了糖尿病胃轻瘫中肌肉层EGR1缺失通过破坏TXN2依赖性巨噬细胞氧化磷酸化并触发CCL5/CCR5/NLRP3介导的ICC损伤,从而促进胃轻瘫,局部恢复EGR1可改善胃动力 | 首次发现EGR1连接巨噬细胞极化与ICC完整性,阐明TXN2-CCL5/CCR5-NLRP3轴在糖尿病胃轻瘫中的作用,并验证局部AAV9-EGR1基因治疗改善胃动力的可行性 | 人胃体转录组数据样本量有限,单细胞数据验证仍属探索性,临床幽门肌肉层活检例数较少,大鼠模型与人类疾病存在种属差异,长期AAV9治疗的安全性和有效性未评估 | 探究EGR1是否连接巨噬细胞极化与糖尿病胃轻瘫中ICC完整性,并评估局部恢复EGR1的治疗潜力 | 糖尿病胃轻瘫患者胃体组织、幽门肌肉层活检组织,以及链脲佐菌素诱导的糖尿病胃轻瘫大鼠模型中的巨噬细胞和原代ICC | 数字病理, 机器学习 | 糖尿病胃轻瘫 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 差异表达分析, 机器学习, 免疫组化, 线粒体呼吸分析, 细胞因子谱分析, AAV9基因治疗 | 探索性机器学习, 差异表达模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像, 文本 | 人类胃体转录组数据集GSE115601,单细胞RNA测序数据集GSE252126,临床幽门肌肉层活检样本,以及链脲佐菌素诱导的DGP大鼠模型 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina测序平台 | NA |
| 809 | 2026-09-19 |
Multiomics analyses revealed the roles of the epithelial-mesenchymal transition and novel early candidate diagnostic biomarkers in neonatal necrotising enterocolitis
2026-Sep, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70793
PMID:42745358
|
研究论文 | 该研究通过整合大量蛋白质组学、空间蛋白质组学、单细胞RNA测序及动物模型,揭示了新生儿坏死性小肠结肠炎中上皮-间质转化(EMT)相关肠道重塑机制,并筛选出ANXA2等候选早期诊断生物标志物 | 首次整合大量蛋白质组学、空间蛋白质组学与单细胞RNA测序多组学方法系统解析NEC肠道分子改变;发现Snail介导的EMT在NEC发病中发挥作用,并在小鼠模型中验证了药理抑制EMT可改善肠道损伤与生存;鉴定出ANXA2、RPL13、RPL23A、RPS28为候选组织生物标志物,且血清ANXA2对NEC诊断具有较高价值(AUC 0.944) | 血清ANXA2的诊断效能仍需前瞻性多中心验证;研究样本量有限;小鼠模型与人类NEC存在种属差异;医学NEC与高度疑似牛奶蛋白过敏的鉴别仅为探索性分析 | 探究NEC相关的肠道分子改变并探索候选早期诊断生物标志物 | NEC患儿的FFPE肠道组织(6例单细胞测序样本)、NEC索引病例、血清样本,以及小鼠NEC模型 | 多组学 | 新生儿坏死性小肠结肠炎 | 大量蛋白质组学, 空间蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 免疫组化, 血清酶联免疫吸附试验 | NA | 蛋白质组数据, 图像, 文本 | 6例肠道样本用于单细胞测序,另包括FFPE肠道组织、血清样本及小鼠NEC模型(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学, 大量蛋白质组学 | NA | NA |
| 810 | 2026-09-19 |
TMEM59L promotes neuroendocrine differentiation and enzalutamide resistance in prostate cancer by regulating MUC1/β-catenin/MYC axis
2026-Sep, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70835
PMID:42746692
|
研究论文 | 该研究揭示了跨膜蛋白TMEM59L通过调控MUC1/β-catenin/MYC信号轴促进前列腺癌神经内分泌分化和恩杂鲁胺耐药的机制 | 首次发现并阐明了TMEM59L/MUC1/β-catenin/MYC信号级联在前列腺癌神经内分泌分化及恩杂鲁胺耐药中的关键调控作用,为克服下一代AR信号抑制剂耐药提供了新的潜在治疗靶点 | 摘要中未明确提及研究局限性,但研究主要基于细胞系和动物模型,缺乏临床试验验证 | 探究TMEM59L在前列腺癌进展、谱系可塑性和治疗耐药中的功能角色及其分子机制 | 恩杂鲁胺耐药性前列腺癌细胞系及相应小鼠异种移植模型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 811 | 2026-09-19 |
Closed-Loop Decoding and Intervention of Pain: A Novel BMI Strategy Integrating θ-Band Detection and Mechano-Electro-Biological Coupled Hydrogels
2026-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76269
PMID:42360145
|
研究论文 | 开发了一种基于新型水凝胶电极的闭环脑机接口,用于神经病理性疼痛的诊断和干预 | 首次将θ波段检测与机械-电-生物耦合水凝胶结合的闭环脑机接口策略用于神经病理性疼痛管理 | 研究仅在大鼠模型中进行,尚未验证临床转化可行性 | 开发闭环脑机接口平台,实现神经病理性疼痛的客观诊断和有效治疗 | 神经病理性疼痛大鼠模型 | 脑机接口 | 神经病理性疼痛 | 电生理记录、空间转录组学 | 闭环脑机接口 | 电生理信号、转录组数据 | 未明确 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 812 | 2026-09-19 |
Integrative multi-omics analysis identifies AIF1 as an immune-associated factor linked to monocyte-centered inflammatory networks in Alzheimer's disease
2026-Sep, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2026.153229
PMID:42571730
|
研究论文 | 该研究通过整合多组学分析(孟德尔随机化、批量转录组学、单细胞RNA测序和外周血验证),系统识别了与阿尔茨海默病相关的血浆蛋白,并确定AIF1为与单核细胞为中心的炎症网络相关的免疫相关因子 | 首次通过整合孟德尔随机化、批量转录组学、单细胞RNA测序和外周血验证的多组学策略,系统性地识别AIF1作为阿尔茨海默病的共享候选基因;揭示了AIF1在单细胞水平上以单核细胞为主的细胞类型特异性表达模式,尽管批量转录组显示整体表达降低 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性,如样本量大小、人群特异性、AIF1的功能机制尚未通过实验验证等 | 系统识别与阿尔茨海默病相关的血浆蛋白及其细胞背景,探究外周免疫参与阿尔茨海默病的分子机制 | 阿尔茨海默病患者与对照样本的血浆蛋白、转录组数据及外周血单核细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化, 批量转录组学, 单细胞RNA测序, qPCR | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 813 | 2026-09-19 |
Berberine Modulates Mitophagy-Related Gene Expression and Suppresses Breast Cancer Cells: A Multi-Omics and Experimental Study
2026-Sep, Cell biochemistry and biophysics
IF:1.8Q4
DOI:10.1007/s12013-026-02156-3
PMID:42645668
|
研究论文 | 本研究整合GEO数据库和单细胞测序数据,结合分子对接和体外实验,探究小檗碱通过调控线粒体自噬相关基因抑制乳腺癌的作用机制 | 首次整合GEO数据库、单细胞测序、分子对接和体外实验,系统揭示小檗碱通过靶向BECN1、BCL2、HIF1A、MYC、PINK1和FOXO3等关键基因调控线粒体自噬和线粒体质量控制从而抑制乳腺癌的新机制 | CASP3仅在mRNA水平进行评估,因MCF-7细胞本身缺乏CASP3;研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内动物实验验证 | 探究小檗碱是否通过调控线粒体自噬相关基因发挥抗乳腺癌作用,并揭示乳腺癌中线粒体自噬的关键基因及潜在治疗靶点 | 乳腺癌细胞(MCF-7)及GEO数据库中的乳腺癌患者样本和单细胞测序数据 | 机器学习, 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, 分子对接, 体外实验 | NA | 基因表达数据, 图像, 文本 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 814 | 2026-09-19 |
The Portuguese man-of-war genome reveals the genetic basis of medusa loss and sea-air interface adaptation
2026-Sep, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwag374
PMID:42751451
|
研究论文 | 本研究通过染色体水平基因组组装和单细胞转录组学,揭示了僧帽水母(Portuguese man-of-war)失去自由游泳水母阶段及适应海气界面的遗传和细胞机制 | 首次获得两种漂浮水母的染色体水平基因组,发现神经和肌肉基因家族的广泛收缩,鉴定出Medusa基因作为水母发育的关键调控因子,并通过单细胞转录组学揭示了气囊充气的一氧化碳产生机制及触手中神经毒性、细胞毒性和溶血性代谢物与毒素的分布,发现了具有毒素结构域的扩张基因家族 | 摘要未明确提及研究的具体局限性 | 探究僧帽水母(漂浮水母)适应海气界面特殊生态位的分子基础,特别是其失去自由游泳水母阶段的遗传机制 | 两种漂浮水母(Physalia sp.及另一种具有远洋水母阶段的漂浮水母) | 基因组学、进化生物学、单细胞转录组学 | NA | 染色体水平基因组组装、单细胞转录组测序、基因敲降 | NA | 基因组序列、单细胞转录组数据 | 两种漂浮水母的个体样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 815 | 2026-09-19 |
Halo: a pretrained model for whole-cell segmentation from nuclei images in spatial transcriptomics
2026-Sep-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag515
PMID:42752546
|
研究论文 | 本文介绍了Halo,一种预训练的全细胞分割模型,通过整合细胞核形态与RNA转录本的空间分布,从仅有细胞核染色的空间转录组数据中重建全细胞边界 | 首次将转录本坐标转换为分子密度图与DAPI图像联合处理,基于Cellpose-SAM分割架构构建预训练模型,可在12种组织类型的多模态Xenium数据上预训练后直接应用于新数据集,无需额外训练或数据集特定拟合 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 解决空间转录组实验中仅有细胞核染色图像时难以可靠推断细胞边界的问题,实现可扩展且可重复的基于图像的空间转录组细胞分割 | 空间转录组数据中的细胞,涵盖12种组织类型 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | Cellpose-SAM | 图像 | 12种组织类型的多模态Xenium数据 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | 10x Xenium多模态空间转录组数据,包含DAPI染色图像和转录本空间坐标信息 |
| 816 | 2026-09-19 |
Arginine Kinase 1 supports energy homeostasis in Drosophila flight muscle development
2026-Sep, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1012304
PMID:42752582
|
研究论文 | 本文研究了Argk1在果蝇飞行肌发育中维持能量稳态的作用,发现其缺失导致ATP水平降低、肌节成熟缺陷和肌肉收缩丧失 | 首次揭示Argk1的一种亚型定位于发育中肌纤维的线粒体,并证明Argk1在非应激条件下对飞行肌发育不可或缺,通过维持局部ATP水平支持肌原纤维生成和肌肉生长 | 未明确Argk1各亚型的具体功能差异,未完全阐明Argk1如何协调线粒体能量供应与肌节成熟的分子机制 | 探究Argk1在果蝇飞行肌发育中的功能及其在能量稳态维持中的作用 | 果蝇(Drosophila)飞行肌及其相关成肌细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 817 | 2026-09-19 |
Integrated pan-cancer analysis reveals a cancer-associated fibroblast oxidative stress response signature predicting immunotherapy response and prognosis
2026-Aug-31, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02424-w
PMID:42671485
|
研究论文 | 该研究通过整合泛癌单细胞RNA测序数据,构建了癌症相关成纤维细胞氧化应激反应特征(FOSR.Sig),用于预测免疫治疗反应和预后 | 首次基于泛癌单细胞RNA测序数据揭示癌症相关成纤维细胞具有最高的氧化应激反应评分,并构建了成纤维细胞来源的氧化应激相关特征(FOSR.Sig)用于预测ICI反应和预后 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 构建基于癌症相关成纤维细胞氧化应激反应的特征,用于预测肿瘤免疫治疗反应和患者预后 | 泛癌肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞、免疫检查点抑制剂治疗患者 | 机器学习 | 泛癌 | 单细胞RNA测序,RNA-seq | LASSO回归,机器学习框架 | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 818 | 2026-09-19 |
A Single-Cell Transcriptional Landscape of Emphysema: Heterogeneous Cellular Dynamics in Centrilobular, Panlobular, and Paraseptal Subtypes
2026-Aug-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27177807
PMID:42737703
|
研究论文 | 该研究对三种肺气肿亚型(小叶中心型、全小叶型和间隔旁型)的肺组织进行单细胞RNA测序,绘制了转录景观图谱,揭示了各亚型特异性的细胞和分子机制 | 首次在单细胞分辨率下系统比较三种肺气肿亚型(CLE、PLE、PSE)的转录景观,揭示了各亚型特异性的细胞组成和转录特征,发现了CLE以气道起源炎症为主、PSE呈现纤维化样重塑表型、PLE为先天免疫激活和基质失调的中间状态 | 每种亚型仅纳入3例患者,样本量较小,可能无法充分代表各亚型的异质性;未包含正常对照样本进行对比分析 | 揭示小叶中心型肺气肿(CLE)、全小叶型肺气肿(PLE)和间隔旁型肺气肿(PSE)三种亚型特异性的细胞和分子致病机制 | 9例肺气肿患者的肺组织(每种亚型3例) | 数字病理学 | 肺气肿 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 9例患者肺组织样本,共84,704个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 819 | 2026-09-19 |
The landscape mapping of single-cell sequencing in the research progression and hotspots of liver cancer based on systematical analysis
2026-Aug-21, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000050022
PMID:42629669
|
研究论文 | 本文通过文献计量学方法分析了2017年至2024年3月间单细胞测序在肝癌研究中的应用进展和热点 | 首次系统性地通过文献计量学方法绘制了单细胞测序在肝癌研究中的知识图谱,揭示了研究趋势和热点 | 仅基于Web of Science Core Collection数据库,可能遗漏其他数据库的相关研究 | 旨在绘制单细胞测序在肝癌领域的研究水平、研究热点和进展趋势 | 2017年至2024年3月间发表的379篇关于肝癌和单细胞测序的文章 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 文本 | 379篇文章 | NA | NA | NA | NA |
| 820 | 2026-09-19 |
Exploring and validating hub genes associated with atopic dermatitis through weighted gene co-expression network analysis and machine learning
2026-Aug-21, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000050369
PMID:42629711
|
研究论文 | 本研究通过整合差异表达分析和加权基因共表达网络分析,结合LASSO和支持向量机递归特征消除两种机器学习方法,筛选并验证了与特应性皮炎相关的6个核心基因,并分析了其与免疫细胞浸润及单细胞表达模式的关系 | 首次综合运用WGCNA与两种机器学习算法(LASSO和SVM-RFE)从多个AD数据集中筛选核心基因,并结合CIBERSORT免疫浸润分析和单细胞RNA测序揭示核心基因在AD中的细胞特异性表达模式,通过独立队列验证了核心基因的表达失调 | 摘要中未明确说明研究的局限性,但基于常规生物信息学研究的特征,可能包括样本量有限、缺乏实验功能验证、单细胞数据来源和样本量未详细说明等 | 识别特应性皮炎的新型生物标志物并探究其致病机制 | 特应性皮炎相关的基因表达数据集及患者样本 | 机器学习 | 特应性皮炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 差异表达分析, 功能富集分析 | LASSO, SVM-RFE | 基因表达数据, 文本 | 7个AD相关数据集(来自GEO数据库)加上一个独立验证队列,具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |