单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 3630 篇文献,本页显示第 801 - 820 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
801 2026-03-17
MIF-CD74 axis facilitates MDSC infiltration in the tumor microenvironment of pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究探讨了胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境中MIF-CD74轴如何促进髓源性抑制细胞(MDSCs)浸润,揭示了其与癌症相关成纤维细胞(CAFs)的相互作用及其对免疫抑制微环境的影响 首次在PDAC组织中通过单细胞RNA测序和空间转录组学发现MDSCs特征性表达CD74,并揭示MIF-CD74轴在CAFs与MDSCs相互作用中的关键作用,为免疫治疗提供了新靶点 研究主要基于手术标本和鼠模型,临床样本量有限,且未深入探讨MIF-CD74轴在其他癌症类型中的普适性 研究PDAC肿瘤微环境的免疫抑制特性,特别是MDSCs的浸润机制及其与CAFs的相互作用 胰腺导管腺癌(PDAC)组织样本、髓源性抑制细胞(MDSCs)、癌症相关成纤维细胞(CAFs) 数字病理学 胰腺癌 流式细胞术(FCM)、单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞RNA测序数据、空间转录组学数据、流式细胞术数据 PDAC手术标本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
802 2026-03-17
Formononetin, an active component of RAS-RH, ameliorates radiation-induced mitochondrial fission dysfunction in endothelial cells via TCs-ECs crosstalk
2026-May, Microvascular research IF:2.9Q2
研究论文 本研究揭示了中药复方RAS-RH的活性成分芒柄花素通过调控心脏端细胞介导的旁分泌信号,减轻X射线辐射诱导的大鼠心脏微血管内皮细胞损伤的机制 首次阐明了芒柄花素通过AR/miR-151a-5p/Fis1轴介导心脏端细胞与内皮细胞之间的串扰,抑制线粒体过度分裂的核心机制 研究为体外细胞模型,缺乏体内实验验证;机制研究主要聚焦于Fis1通路,可能存在其他调控途径 探究RAS-RH及其活性成分芒柄花素缓解辐射诱导内皮细胞损伤的作用机制 大鼠心脏微血管内皮细胞、心脏端细胞 细胞生物学 辐射损伤 单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、分子动力学模拟、Western blot、免疫荧光、流式细胞术 NA 基因表达数据、蛋白质数据、细胞成像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
803 2026-03-17
BRIP1-mediated RINT1 acetylation and NF-κB activation promote DNA repair and immunosuppressive microenvironment in lung adenocarcinoma
2026-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究揭示了BRIP1通过调控RINT1乙酰化和NF-κB信号通路,促进肺腺癌DNA修复和免疫抑制微环境形成的分子机制 首次发现BRIP1通过两条相互关联的通路协调DNA修复能力和先天免疫抑制,并建立了BRIP1作为DNA修复能力与免疫抑制之间分子联系的新角色 研究主要在细胞和动物模型中进行,临床转化效果需进一步验证;BRIP1调控的具体分子细节仍需深入探索 探究BRIP1在肺腺癌DNA修复和免疫逃逸中的作用机制,为联合免疫治疗提供新靶点 肺腺癌细胞、肿瘤组织、动物模型 肿瘤免疫学 肺腺癌 空间转录组学、单细胞RNA测序、多重免疫组化、功能实验 NA 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据、免疫组化图像 未明确说明具体样本数量,涉及肿瘤组织和多个细胞系 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
804 2026-03-17
BPHL promotes TNBC stemness by resolving R-loops via POLR2A lactylation inhibition and BARD1-mediated ubiquitination
2026-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本文揭示了BPHL通过调控R-loop稳态来维持三阴性乳腺癌干细胞干性的新机制 首次发现BPHL通过抑制POLR2A乳酰化并促进BARD1介导的泛素化来解析R-loops,从而驱动Wnt信号通路和肿瘤干细胞干性 研究主要基于体外和动物模型,临床转化潜力需进一步验证 探究BPHL在调控三阴性乳腺癌干细胞干性中的作用机制 三阴性乳腺癌细胞和肿瘤干细胞 癌症生物学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 26个乳腺癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
805 2026-03-17
PH2ST: Prompt-guided hypergraph learning for spatial transcriptomics prediction in whole slide images
2026-May, Medical image analysis IF:10.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为PH2ST的提示引导超图学习框架,用于从H&E染色组织学图像中预测空间转录组学数据 利用提示引导超图学习框架,结合有限的空间转录组学信号来指导多尺度组织学表示学习,以实现准确且稳健的空间基因表达预测 NA 解决当前空间转录组学技术成本高、覆盖范围有限和技术复杂性的问题,通过预测方法实现可扩展且经济高效的空间基因表达图谱构建 H&E染色组织学图像与空间转录组学数据之间的关系 数字病理学 NA 空间转录组学 超图学习框架 图像 两个公共空间转录组学数据集 NA 空间转录组学 NA NA
806 2026-03-17
Unraveling pancreatic ductal adenocarcinoma at single-cell resolution with spatial insights: From mechanisms to clinical translation
2026-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
综述 本文系统总结了基于单细胞RNA测序(scRNA-seq)的胰腺导管腺癌(PDAC)研究,并讨论了整合单细胞与空间多组学方法在解析PDAC肿瘤微环境中的应用 整合了单细胞测序与空间多组学技术,为理解PDAC的细胞异质性、肿瘤微环境动态交互和临床转化提供了新的框架 作为一篇综述文章,未提出新的实验数据或模型,主要基于现有文献进行总结和展望 系统总结PDAC在单细胞分辨率下的研究进展,并探讨从机制到临床转化的路径 胰腺导管腺癌(PDAC)的肿瘤微环境,包括T细胞、髓系细胞、成纤维细胞和恶性上皮细胞等 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间多组学 NA 单细胞转录组数据,空间多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
807 2026-03-17
Targeting ACSS2 disrupts metabolic-epigenetic crosstalk to restore apoptosis and temozolomide chemosensitivity in pancreatic neuroendocrine tumors
2026-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究揭示了胰腺神经内分泌肿瘤(PNETs)中ACSS2通过代谢-表观遗传信号轴驱动替莫唑胺(TMZ)耐药的新机制,并提出了靶向ACSS2/BCL6/P53轴以恢复化疗敏感性的治疗策略 首次在PNETs中发现ACSS2通过介导乙酸盐代谢促进组蛋白高乙酰化,进而上调BCL6并抑制TP53表达,从而驱动TMZ耐药的非冗余代谢-表观遗传屏障 研究主要基于临床队列分析、细胞模型、患者来源类器官和小鼠模型,仍需在更大规模的前瞻性临床试验中验证靶向ACSS2/BCL6轴的治疗效果 阐明胰腺神经内分泌肿瘤对替莫唑胺化疗耐药的分子机制,并探索克服耐药性的新治疗策略 胰腺神经内分泌肿瘤(PNETs)细胞、患者来源类器官、Rip1-Tag2免疫活性小鼠模型 肿瘤代谢与表观遗传学 胰腺神经内分泌肿瘤 单细胞RNA测序、临床队列分析、药理学抑制、基因敲除、免疫治疗联合 NA 单细胞转录组数据、临床数据、类器官实验数据、小鼠模型数据 未明确指定具体样本数量,但涉及临床队列、患者来源类器官和Rip1-Tag2小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
808 2026-03-17
The underlying mechanism of cardiac injury in exertional heat stroke rats based on the scRNA-seq analysis
2026-04-09, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究基于单细胞RNA测序分析,探讨了劳力性热射病大鼠心脏损伤的潜在机制 首次在劳力性热射病模型中应用单细胞RNA测序技术,系统性地鉴定了不同细胞类型中的差异表达基因,并验证了Hspa8、Hspe1、Id1、Ndufa4和Cd36等关键基因在心脏损伤机制中的作用 研究基于大鼠模型,其结果向人类临床应用的转化需要进一步验证;单细胞测序分析仅聚焦于基因表达层面,未深入探究蛋白质功能或翻译后修饰的影响 探究劳力性热射病中心脏损伤的细胞信号通路和关键基因,为早期识别心脏损伤生物标志物提供理论依据 劳力性热射病大鼠模型的心脏组织 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序,RT-qPCR,免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据,基因表达定量数据,组织切片图像 未明确说明具体样本数量的大鼠心脏组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
809 2026-03-17
Single-cell transcriptomics reveals targeted modulation of inflammatory repertoire by SOCE blockers
2026-Apr, Human immunology IF:3.1Q3
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术,探究了SOCE阻断剂BTP2和CM4620在PHA驱动的T细胞活化模型中,对人类外周血单个核细胞炎症反应的特异性调控作用 首次在单细胞分辨率下揭示了SOCE阻断剂对特定免疫细胞亚群(CD8效应T细胞、NK细胞和CD4调节性T细胞)转录程序的特异性调控,为靶向免疫调节提供了新见解 研究基于体外PHA驱动的T细胞活化模型,可能无法完全反映体内复杂免疫环境;需要未来与常规免疫抑制剂进行头对头比较研究 探究SOCE阻断在特定活化背景下对免疫细胞功能的细胞类型特异性影响 正常人外周血单个核细胞(PBMCs) 单细胞组学 免疫介导性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
810 2026-03-17
Exploring estrogen synthesis and metabolism related markers and immune dynamics in osteoporosis-insights from single-cell RNA sequencing and Mendelian randomization
2026-Apr, Experimental gerontology IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化探索骨质疏松症中雌激素合成与代谢相关标志物及免疫动态 结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,识别出CCND1、SCGB1A1和DDIT4作为骨质疏松症的新型生物标志物 样本量可能有限,且研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证其临床适用性 探索骨质疏松症中雌激素相关标志物以改善诊断和治疗 骨质疏松症患者 数字病理学 骨质疏松症 单细胞RNA测序, qRT-PCR, western blot 机器学习 RNA测序数据, 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
811 2026-03-17
Microglia Display Heterogeneous Initial Responses to Disseminated Tumor Cells
2026-Mar-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过多技术结合揭示了脑转移早期小胶质细胞对播散性肿瘤细胞的异质性反应及其可塑性 首次结合体内命运图谱成像、单细胞RNA测序和光遗传-组学技术(opto-omics)在同一动物模型中动态追踪肿瘤命运与早期小胶质细胞反应 研究主要聚焦早期反应阶段,未深入探讨晚期转移中系统免疫抑制占主导后的机制 探究脑转移早期小胶质细胞在肿瘤微环境中的异质性调控机制 小鼠脑转移模型中的小胶质细胞与播散性肿瘤细胞 单细胞组学与肿瘤免疫 脑转移瘤 单细胞RNA测序、体内命运图谱成像、光遗传-组学技术(opto-omics) NA 单细胞转录组数据、活体成像数据 同一批动物模型的动态追踪数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
812 2026-03-17
Hot Zones for Liver Cancer: Metabolic Zonation, Ferroptosis, and the Origins of HCC
2026-Mar-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过小鼠遗传学与空间转录组学结合,揭示了肝癌(HCC)起源于肝脏特定代谢区域(区域3)的机制,并识别出Gstm2和Gstm3酶在抑制铁死亡和促进肿瘤形成中的关键作用 首次通过空间转录组学追踪肝脏特定区域的癌前肝细胞,发现肝癌主要起源于区域3,揭示了克隆扩张与肿瘤发生潜力之间的脱节,并识别出GSTMs酶在维持氧化还原平衡和抑制铁死亡中的核心作用 研究主要基于小鼠模型,结果在人类肝癌中的直接适用性需进一步验证,且未详细探讨其他潜在影响因素 探究肝癌在肝脏代谢异质性区域中的起源机制,并识别关键调控因子 小鼠肝脏的特定代谢区域(区域1和区域3)及其癌前肝细胞 空间转录组学 肝癌 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
813 2026-03-17
Spatially Resolved Opto-Omics Uncovers Functional Microglial Subtypes in Brain Metastasis
2026-Mar-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本文介绍了一种名为“opto-omics”的前沿方法,用于在脑转移瘤微环境中映射活体、空间定位细胞的转录命运,揭示了功能性的小胶质细胞亚型 开发了opto-omics技术,结合光转换荧光蛋白和单细胞转录组学,实现了对活体、空间迁移小胶质细胞的实时转录分析,并识别出五个与特定生物过程相关的亚群 研究基于小鼠模型,可能无法完全模拟人类脑转移的复杂性;技术应用范围有限,需进一步验证在其他疾病或组织中的适用性 研究脑转移瘤微环境中小胶质细胞的功能亚型及其在肿瘤发展中的作用 小鼠模型中的小胶质细胞和播散性肿瘤细胞 数字病理学 脑转移瘤 opto-omics, 单细胞转录组学, 光转换荧光蛋白技术 NA 转录组数据, 空间定位数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
814 2026-03-17
A Soft Matrix Microenvironment Promotes Laterally Spreading Tumors via Oxidative Phosphorylation-Dependent Cell Adhesion
2026-Mar-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学等技术,揭示了侧向扩散肿瘤在软基质微环境中通过氧化磷酸化依赖性细胞粘附机制促进其横向生长的分子机制 首次将软基质微环境、氧化磷酸化代谢重编程和细胞粘附抑制联系起来,提出了ENTPD1-ADORA2B轴在调控侧向扩散肿瘤生长中的核心作用 研究主要基于临床样本和类器官模型,体内验证和临床转化应用仍需进一步探索 探究侧向扩散肿瘤与常规突出性腺瘤在分子机制和生长模式上的差异 侧向扩散肿瘤、常规突出性腺瘤及相邻正常组织 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间转录组数据, 临床样本数据 临床标本和患者来源的类器官模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
815 2026-03-17
SlGRF1 mediates gibberellin signaling to control cut-budding in tomato
2026-Mar-15, Journal of integrative plant biology IF:9.3Q1
研究论文 本研究探讨了番茄中切割诱导芽再生(cut-budding)的分子基础,重点关注生长调节因子1(SlGRF1)及其与赤霉素(GA)信号传导的关联 结合单细胞RNA测序、时序转录组分析和遗传验证,阐明了芽再生的关键阶段,并鉴定出SlGRF1作为关键调节因子,揭示了GA信号通过抑制SlGRF1表达负调控芽起始的新机制 NA 研究番茄中切割诱导芽再生(cut-budding)的分子机制 番茄(Solanum lycopersicum) 植物分子生物学 NA 单细胞RNA测序,时序转录组分析,CRISPR/Cas9基因敲除,ChIP-seq分析 NA RNA测序数据,基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
816 2026-03-17
DNA Methylation Profiling Reveals a Novel Subtype Harboring IDH Mutation in H3-altered Gliomas
2026-Mar-14, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究通过全基因组DNA甲基化分析,在H3突变胶质瘤中发现了一个新的IDH/H3共突变亚型,并揭示了其与改善生存相关的表观遗传特征 首次在H3突变胶质瘤中鉴定出IDH/H3共突变亚型,该亚型表现出全球DNA高甲基化和神经发育基因程序富集,与显著改善的生存相关 研究样本量相对较小(49例代表性病例),且依赖于临床队列和TCGA数据进行验证,可能无法完全代表所有H3突变胶质瘤的异质性 重新定义H3突变胶质瘤的分子分类,揭示其临床和表观遗传多样性,并识别亚型特异性治疗脆弱性 H3突变胶质瘤(特别是H3K27M和H3G34R/V突变)患者样本 数字病理学 胶质瘤 全基因组DNA甲基化分析、单细胞RNA测序、ChIP-seq、空间转录组学 无监督聚类分析 DNA甲基化数据、RNA测序数据、染色质免疫沉淀数据、空间转录组数据 49例代表性病例(来自375例H3突变胶质瘤临床队列),并使用TCGA数据进行验证 NA 全基因组DNA甲基化分析、单细胞RNA测序、ChIP-seq、空间转录组学 NA NA
817 2026-03-17
Type 2 lymphocytes restrict type 3 lymphocytes during liver fibrosis and colocalize in fibroblast niches
2026-Mar-13, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过小鼠模型、三维显微镜和空间转录组学,揭示了肝脏纤维化中2型淋巴细胞(T2Ls)与3型淋巴细胞(T3Ls)在成纤维细胞微环境中的空间互作机制 首次发现T2Ls(主要是ILC2s)在肝脏纤维化中通过空间定位限制T3Ls(主要是γδ T细胞)的活性,从而调节肝脏修复过程 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类肝脏疾病中得到验证,且空间转录组学技术的分辨率可能限制细胞互作细节的解析 探究肝脏纤维化过程中淋巴细胞与成纤维细胞微环境的空间互作机制及其对病理纤维化的影响 小鼠肝脏纤维化模型中的2型淋巴细胞、3型淋巴细胞和成纤维细胞 空间转录组学 肝脏纤维化 三维显微镜、空间转录组学 NA 图像、空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
818 2026-03-17
SEMA3C/PLXND1 Interaction Regulates Collagen Metabolism in Keloid Fibroblasts via the TGF-β1 Signaling Pathway
2026-Mar-13, The American journal of pathology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和实验验证,揭示了SEMA3C/PLXND1信号轴通过激活TGF-β1通路调控瘢痕疙瘩成纤维细胞胶原代谢的新机制 首次证明SEMA3C/PLXND1相互作用通过TGF-β1信号通路驱动瘢痕疙瘩纤维化,并发现该配体-受体对是瘢痕疙瘩样本中最普遍的相互作用 研究主要基于体外细胞实验和公共数据集分析,缺乏体内动物模型验证 鉴定调控瘢痕疙瘩发病机制的新信号轴 瘢痕疙瘩成纤维细胞 数字病理学 皮肤纤维化疾病 单细胞RNA测序, 转录组测序, qPCR, Western blotting, 免疫荧光 NA 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 8个瘢痕疙瘩样本和8个正常皮肤样本(来自4个公共数据集) NA 单细胞RNA-seq NA NA
819 2026-03-17
Whole-embryo spatial transcriptomics at subcellular resolution from gastrulation to organogenesis
2026-03-12, Science (New York, N.Y.)
研究论文 本研究开发了一种名为weMERFISH的全胚胎成像平台,用于在亚细胞分辨率下对斑马鱼胚胎进行空间转录组分析 首次实现了从原肠胚形成到器官发生阶段的全胚胎空间转录组分析,并创建了包含25,872个基因表达和294,954个染色质区域可及性的在线图谱 仅分析了495个基因的亚细胞表达模式,未覆盖全部基因;研究局限于斑马鱼模型 系统检测胚胎发育过程中的基因表达模式及其调控机制 斑马鱼胚胎 空间转录组学 NA 多重错误鲁棒荧光原位杂交(MERFISH),活体成像 NA 空间基因表达数据,染色质可及性数据,成像数据 斑马鱼胚胎(具体数量未明确说明) NA 空间转录组学,荧光原位杂交 weMERFISH(全胚胎MERFISH平台) 全胚胎成像平台,用于亚细胞分辨率的多重错误鲁棒荧光原位杂交
820 2026-03-17
A multi-scale biocompatibility atlas of porous silicon nanoparticles: From whole embryo to single-cell resolution
2026-Mar-12, Biomaterials IF:12.8Q1
研究论文 本研究利用斑马鱼模型,结合整体表型分析和单细胞RNA测序,建立了从整体胚胎到单细胞分辨率的多尺度生物相容性评估体系,以评估多孔硅纳米颗粒的安全性 首次将斑马鱼整体表型分析与单细胞RNA测序技术整合,构建了一个从生物体到单细胞水平的多尺度生物相容性评估框架,为纳米药物的安全性评价提供了新方法 研究仅在斑马鱼胚胎模型中进行,尚未在哺乳动物或人体中进行验证;且主要关注急性暴露效应,长期生物相容性有待进一步评估 评估多孔硅纳米颗粒的生物相容性和安全性,为其作为下一代药物递送和诊疗一体化平台的临床应用提供依据 多孔硅纳米颗粒在斑马鱼胚胎中的生物效应 生物医学工程 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,表型数据 斑马鱼胚胎 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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