单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 9342 篇文献,本页显示第 8161 - 8180 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
8161 2026-02-28
Human ISG15 deficiency unveils impaired healing of ulcerations via type I interferon-mediated fibrosis
2026-May-04, Journal of human immunity
研究论文 本研究通过结合分子生物学方法和空间转录组学,揭示了ISG15缺陷导致I型干扰素介导的纤维化及溃疡愈合受损的机制 首次在ISG15缺陷患者样本中结合空间转录组学分析,阐明了慢性I型干扰素暴露如何通过影响上皮-间质转化、巨噬细胞极化和成纤维细胞功能导致多器官纤维化 研究主要基于体外模型和患者活检样本,缺乏体内动物模型的验证,且样本量有限 阐明ISG15缺陷导致免疫介导纤维化的分子机制 ISG15缺陷患者皮肤活检样本、ISG15敲除的上皮细胞和成纤维细胞 数字病理学 皮肤纤维化病变 空间转录组学、分子生物学方法、体外模型 NA 空间转录组数据、组织图像、细胞实验数据 患者皮肤活检样本(具体数量未明确说明) NA 空间转录组学 NA NA
8162 2026-02-28
C3a-C3ar1 axis mediates macrophage M1 polarization to drive silicosis inflammation and fibrosis
2026-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
研究论文 本研究揭示了C3a-C3ar1轴通过调控巨噬细胞M1极化驱动矽肺炎症和纤维化的机制 首次通过时间序列转录组分析系统研究了矽肺不同阶段所有补体成分的表达模式,并确定了C3a-C3ar1轴是唯一贯穿矽肺发展的补体通路,同时结合时间序列单细胞测序定位了C3ar1在M1巨噬细胞中的表达 未明确提及 阐明补体系统在矽肺进展中的作用和机制 矽肺患者外周血和支气管肺泡灌洗液细胞,以及矽肺模型 生物医学研究 矽肺 时间序列转录组分析,时间序列单细胞测序 NA 转录组数据,单细胞数据,临床样本数据 未明确提及具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8163 2026-02-28
Thrombospondin-1-mediated macrophage efferocytosis dysfunction exacerbates intestinal pathology in Hirschsprung's disease
2026-Apr-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了血栓反应蛋白-1(THBS1)在巨噬细胞胞葬功能障碍中的作用,及其在先天性巨结肠症肠道病理中的关键调控机制 首次发现THBS1通过CD36/Rac1信号轴调控巨噬细胞胞葬功能,并证实其在先天性巨结肠症中作为新型治疗靶点和生物标志物的潜力 样本量相对较小(scRNA-seq仅3对样本),且体内验证主要依赖于DSS诱导的结肠炎模型,可能不完全反映人类疾病复杂性 阐明先天性巨结肠症中肠道稳态破坏、持续炎症和纤维化的细胞与分子机制 先天性巨结肠症患者结肠活检组织、骨髓来源巨噬细胞、DSS诱导的结肠炎小鼠模型 单细胞组学 先天性巨结肠症 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、qRT-PCR、FRET生物传感器 NA 单细胞转录组数据、组织病理图像、流式细胞数据 3对配对结肠活检(scRNA-seq)+5例额外样本(验证实验) NA 单细胞RNA-seq NA NA
8164 2026-02-28
NGR-modified cancer-associated fibroblast-derived exosomes deliver resveratrol to inhibit CXCR2/NF-κB signaling in myeloid-derived suppressor cells and reverse immune suppression in liver cancer
2026-Apr-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究开发了一种NGR肽修饰的癌症相关成纤维细胞来源的外泌体,用于递送白藜芦醇,靶向肿瘤微环境中的髓源性抑制细胞,通过抑制CXCR2/NF-κB信号通路逆转免疫抑制并抑制肝癌进展 创新性地提出了一种靶向肿瘤相关MDSCs而非直接杀伤肿瘤细胞的免疫治疗策略,并首次鉴定和验证了CXCR2作为白藜芦醇在MDSCs中的功能靶点 NA 开发靶向MDSCs的精准药物递送系统,以逆转肝癌免疫抑制微环境并克服免疫治疗耐药性 髓源性抑制细胞、癌症相关成纤维细胞、肝癌细胞、CD8+ T细胞 肿瘤免疫学 肝癌 网络药理学、分子对接、单细胞RNA测序、Western印迹、免疫荧光 NA 单细胞转录组数据、体外实验数据、体内小鼠模型数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
8165 2026-02-28
Necroptosis mediated by FKBP5 in alveolar fibroblasts drives Pseudomonas aeruginosa-induced acute lung injury
2026-Apr-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肺泡成纤维细胞中FKBP5介导的坏死性凋亡在铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤中的核心作用机制 首次在单细胞水平上发现肺泡成纤维细胞中FKBP5通过促进坏死性凋亡激活NF-κB信号通路,驱动中性粒细胞募集和活化,从而加剧肺损伤 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证尚需进一步开展 探究铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤中肺泡成纤维细胞的具体作用机制 肺泡成纤维细胞 单细胞组学 急性肺损伤 单细胞RNA测序 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8166 2026-02-28
Bulk Microarray and Single-Cell Transcriptomic Analyses Reveal Bacterial Lipopolysaccharide-Related Biomarkers in Sepsis
2026-Apr, Drug development research IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合批量微阵列和单细胞转录组数据,识别了与脓毒症相关的细菌脂多糖相关生物标志物,并构建了诊断和预后模型 首次结合批量微阵列和单细胞RNA-seq数据识别脓毒症中LPS相关基因,并应用多种机器学习算法筛选出七个关键生物标志物,提供了新的诊断和预后见解 研究依赖于公共数据库数据,可能受样本异质性和批次效应影响,且需要进一步实验验证生物标志物的功能机制 识别脓毒症中与细菌脂多糖相关的生物标志物及其潜在机制,以改善诊断和预后评估 脓毒症患者相关的基因表达数据,包括批量微阵列和单细胞RNA-seq数据 生物信息学 脓毒症 批量微阵列分析,单细胞RNA-seq,qRT-PCR验证 LASSO回归,支持向量机-递归特征消除,极端梯度提升 基因表达数据 来自Gene Expression Omnibus的多个数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,批量微阵列 NA NA
8167 2026-02-28
Hair follicle stem cell fate supports distinct clinical endotypes in hidradenitis suppurativa
2026-Mar, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV IF:8.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了毛囊干细胞在化脓性汗腺炎早期发病机制中的分化轨迹,并基于临床表型定义了三种疾病内型 首次通过单细胞RNA测序识别了毛囊干细胞在HS中的两种分化轨迹,并整合临床数据定义了三种疾病内型,为分层治疗提供了新见解 样本量相对有限(49例HS患者),且仅分析了病灶周围皮肤,未涵盖疾病所有阶段或全身性因素 探究毛囊干细胞命运在化脓性汗腺炎早期发病机制中的作用 HS患者和健康捐赠者的毛囊细胞群 单细胞组学 化脓性汗腺炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 49例HS患者的病灶周围皮肤样本及健康捐赠者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8168 2026-02-28
Inflammatory niches as spatial drivers of disease mechanisms and targets for personalized treatment
2026-Mar, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV IF:8.4Q1
综述 本文探讨了空间组织的炎症微环境作为疾病机制的空间驱动因素及其在个性化治疗中的靶点作用 整合单细胞测序与空间分析技术,揭示疾病特异性机制如银屑病表皮上层IL-36驱动的正反馈放大、化脓性汗腺炎的复杂炎症结构以及扁平苔藓中T细胞与基底角质形成细胞的相互作用 NA 研究炎症微环境在疾病机制中的作用,并探索其作为个性化治疗靶点的潜力 炎症微环境中的免疫细胞和非免疫细胞 数字病理学 银屑病、化脓性汗腺炎、扁平苔藓 单细胞测序、空间分析 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
8169 2026-02-28
Solute carrier inhibitors in kidney disease therapy: mechanisms and clinical implications
2026-Mar, Diabetes research and clinical practice IF:6.1Q1
综述 本文系统综述了靶向五种溶质载体(SLC)的抑制剂在肾脏疾病治疗中的药理机制、生理病理作用及临床应用前景 聚焦于单细胞测序技术确认的、在肾小管上皮细胞中高表达的五种SLC作为已验证的治疗靶点,系统性地综述了其选择性抑制剂的开发与应用 NA 探讨溶质载体(SLC)抑制剂在肾脏疾病治疗中的作用机制与临床应用价值 五种已验证的SLC治疗靶点(SLC5A2, SLC7A11, SLC12A3, SLC22A12, SLC47A1)及其抑制剂 NA 慢性肾病、糖尿病肾病、急性肾损伤 单细胞测序 NA NA NA NA NA NA NA
8170 2026-02-28
The exposomal imprint on rosacea: More than skin deep
2026-Mar, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV IF:8.4Q1
综述 本文综述了暴露组(包括遗传、环境、生活方式等因素)在玫瑰痤疮发病机制中的作用,并探讨了其与多种共病的关系及未来管理策略 整合了暴露组框架来理解玫瑰痤疮,强调了从反应性治疗向基于暴露组信息的主动干预的范式转变,并提出了包含个性化护肤、微生物组靶向策略等的整体精准医学框架 本文为综述文章,主要总结现有研究,未提出新的原始数据或实验验证 探讨暴露组(遗传、环境、生活方式等因素的集合)对玫瑰痤疮发病机制的影响,并倡导基于暴露组信息的整体性、精准化管理策略 玫瑰痤疮(一种慢性炎症性皮肤病)及其与遗传、免疫、微生物组、环境因素和多种共病(如自身免疫、代谢、胃肠道疾病)的关联 NA 玫瑰痤疮 单细胞转录组学,孟德尔随机化研究 NA NA NA NA NA NA NA
8171 2026-02-28
Carotid plaque macrophage burden and inflammatory lipid-associated macrophage markers predict secondary major adverse cardiovascular events after endarterectomy
2026-Feb-27, European heart journal IF:37.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析颈动脉斑块中的巨噬细胞亚群,并识别出与二次主要不良心血管事件风险相关的标志物 首次在人类动脉粥样硬化中详细表征巨噬细胞亚群的功能差异和起源,并直接关联斑块细胞组成与临床预后 样本量相对有限,且主要基于西方人群,可能限制结果的普适性 表征动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞亚群,并识别预测二次主要不良心血管事件风险的细胞类型和标志基因 颈动脉内膜切除术患者的血液和斑块样本 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq,去卷积分析 NA RNA测序数据 单细胞RNA测序:46名患者;bulk RNA-seq队列:656名患者;验证队列:82名患者 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
8172 2026-02-28
Single-cell RNA-sequencing of myasthenia gravis reveals transcriptional heterogeneity and dysfunction of immune cell populations
2026-Feb-27, International immunology IF:4.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序探索重症肌无力患者胸腺和外周血中免疫细胞亚群的组成和功能 首次在单细胞水平上揭示重症肌无力患者免疫细胞的转录异质性和功能障碍,并识别了15个细胞亚群 样本量较小(仅2名患者和2名对照),且未考虑疾病亚型或治疗状态的影响 探索重症肌无力患者免疫细胞亚群的组成、功能和发育轨迹 重症肌无力患者的胸腺和外周血样本,以及健康对照的外周血样本 单细胞组学 重症肌无力 单细胞RNA测序 UMAP, Monocle3, Velcyto 单细胞转录组数据 来自2名MG患者胸腺的23846个细胞、外周血的9701个细胞,以及2名健康对照外周血的6930个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8173 2026-02-28
DNER as a novel protein contributes to HSCR pathogenesis: multi-omics combined Mendelian randomization analysis
2026-Feb-25, Pediatric research IF:3.1Q1
研究论文 本研究通过整合蛋白质组范围的孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、生物信息学及实验验证,首次发现DNER作为新型蛋白在先天性巨结肠症(HSCR)发病机制中的关键作用,并揭示了其通过Notch信号通路调控肠道神经嵴细胞发育的分子机制 首次通过多组学结合孟德尔随机化分析鉴定出DNER作为HSCR的新型致病蛋白,并建立了DNER-Notch信号轴在肠道神经发育中的作用 未详细阐明DNER/Notch信号通路在HSCR中的具体分子机制,未来研究需聚焦于此 探索HSCR的潜在新靶点和分子机制 先天性巨结肠症(HSCR)及其相关蛋白(如RET、AGRN、DNER)和肠道神经嵴细胞 生物信息学与多组学分析 先天性巨结肠症 蛋白质组范围的孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、生物信息学分析、Western blotting、细胞和组织实验 NA 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、实验数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
8174 2026-02-28
Ultrasound-Responsive Serotonylation and Hallmark Pathway Gene Signatures Reveal Tumor Microenvironment Vulnerabilities and Prognostic Subtypes in Colorectal Cancer
2026-Feb-25, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
研究论文 本研究通过多组学整合揭示了与超声治疗反应相关的血清素化及标志通路基因特征,用于预测结直肠癌的预后亚型及肿瘤微环境脆弱性 首次结合血清素化相关基因与标志通路基因,通过多组学数据(bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组)和机器学习模型,识别出与超声治疗反应相关的预后基因特征,并构建了高精度的预后分类器 研究主要基于公共数据集(如TCGA-COAD、GSE132465、GSE280313),缺乏独立的前瞻性临床队列验证,且超声治疗的具体机制仍需进一步实验验证 探索影响超声治疗反应性的分子因素,并开发生物标志物指导的结直肠癌超声治疗方案 结直肠癌(CRC)患者及肿瘤微环境(TME) 数字病理学 结直肠癌 bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学 非负矩阵分解聚类、随机生存森林(RSF)、SuperPC等101种机器学习模型 RNA-seq数据、单细胞数据、空间转录组数据 基于TCGA-COAD等公共数据集,具体样本数量未明确说明 NA bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
8175 2026-02-28
A p63-dependent molecular switch directs epithelial fate to form a specialized seal at the tooth-gingiva interface
2026-Feb-24, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究揭示了p63依赖的分子开关如何调控上皮细胞命运,以在牙齿-牙龈界面形成特化的密封结构,并阐明了其与病理性修复的区别 首次定义了p63-RUNX1-ODAM轴在交界上皮(JE)特化中的关键作用,并发现其与驱动角化的p63-KLF4-loricrin通路截然不同,为理解炎症易发界面的组织密封机制提供了新见解 研究主要基于小鼠模型和临床数据,在人类组织中的直接验证尚需进一步开展 探究牙齿-牙龈界面交界上皮(JE)再生与维持的分子机制,以理解牙周炎的发病基础并寻找治疗靶点 小鼠牙龈组织、临床手术样本、交界上皮细胞及其祖细胞 分子生物学与发育生物学 牙周炎 单细胞转录组测序、谱系追踪、基因敲除、临床数据分析 NA 转录组数据、谱系追踪数据、临床数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8176 2026-02-28
Human Lung Allografts Experience Persistent Fibrogenic Shift Following Acute Cellular Rejection
2026-Feb-23, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
研究论文 本研究利用单细胞基因组学技术,揭示了肺移植后急性细胞排斥反应(ACR)中持续的TGF-β和mTOR通路激活,为ACR与慢性肺移植物功能障碍(CLAD)的关联提供了分子机制见解 首次在单细胞水平上系统表征了ACR后肺移植物中持续的纤维化转变,并识别了潜在的mTOR抑制和TGF-β阻断作为治疗靶点 样本量较小(8例患者),且研究主要基于观察性数据,需要进一步功能验证和更大规模队列研究 探究肺移植中急性细胞排斥反应的细胞与分子机制,并寻找预防慢性肺移植物功能障碍的潜在治疗靶点 肺移植患者的肺组织样本,包括ACR、已缓解ACR及无ACR的监测活检样本 数字病理学 肺移植相关疾病 单细胞RNA测序,基因芯片分析,免疫荧光,单细胞ATAC测序 NA 单细胞转录组数据,基因表达数据,表观遗传数据,图像数据 8例儿科和成人患者 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
8177 2026-02-28
Normal abundance of immune cells in left ventricular myocardium from patients with heart failure and preserved ejection fraction
2026-Feb-10, European journal of heart failure IF:16.9Q1
研究论文 本研究通过高分辨率空间转录组学和定量免疫荧光技术,分析了心力衰竭伴射血分数保留(HFpEF)患者左心室心肌中的免疫细胞丰度,发现其与对照组无显著差异 首次在人类HFpEF心肌中应用空间转录组学技术,直接评估免疫细胞浸润情况,挑战了心肌免疫细胞浸润是HFpEF主要驱动因素的传统观点 样本量较小(仅28例),且患者群体为接受冠状动脉旁路移植术的特定人群,可能限制结果的普遍适用性 探究HFpEF患者心肌中免疫细胞是否富集,以验证心肌炎症在HFpEF发病机制中的作用 28名接受择期冠状动脉旁路移植术且左心室射血分数保留(≥50%)的成年患者,分为对照组、临床前HFpEF(B期)和明显HFpEF(C期) 空间转录组学 心血管疾病 高分辨率空间转录组学,定量免疫荧光 NA 空间转录组数据,免疫荧光图像 28例左心室心外膜活检样本 NA 空间转录组学 NA NA
8178 2026-02-28
Single-cell transcriptomics reveal intrinsic and systemic T cell aging in COVID-19 and HIV
2026-Feb-08, Aging
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,开发了T细胞转录组时钟(TICTOC),用于在单细胞水平分析T细胞衰老,并应用于COVID-19和HIV感染的研究 开发了首个能够在六种人类T细胞亚群中预测年龄和细胞类型的单细胞转录组时钟(TICTOC),从而区分细胞类型组成变化(系统效应)与单个细胞内的内在变化 研究主要关注T细胞,未涵盖其他免疫细胞类型;样本量和人群多样性可能有限 探究COVID-19和HIV感染如何影响T细胞的系统性和内在性衰老过程 人类T细胞,包括六种T细胞亚群(如CD8+细胞毒性T细胞、初始CD8+ T细胞等) 单细胞组学 COVID-19, HIV感染 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 转录组时钟模型 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,但涉及COVID-19患者和接受抗逆转录病毒治疗的HIV感染者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8179 2026-02-28
Single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization and colocalization reveal cell-specific mechanisms in systemic lupus erythematosus
2026-Feb-04, Rheumatology (Oxford, England)
研究论文 本研究通过整合单细胞表达数量性状位点数据与孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析,识别了系统性红斑狼疮中免疫细胞特异性的因果eGenes 首次结合单细胞eQTL数据、孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析,系统性揭示SLE中免疫细胞特异性的因果基因机制 研究主要基于遗传数据,未进行实验验证;样本来源和细胞类型覆盖可能有限 识别系统性红斑狼疮中免疫细胞特异性的因果eGenes,以揭示疾病机制和发现治疗靶点 14种人类免疫细胞类型的单细胞表达数据及SLE遗传关联数据 生物信息学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA-seq, GWAS, 孟德尔随机化, 贝叶斯共定位分析 统计模型(孟德尔随机化、贝叶斯共定位) 单细胞转录组数据、遗传关联数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
8180 2026-02-28
A cell-specific computational framework reveals a pan-cancer hypoxia signature predicting overall survival and ICI response
2026-Feb, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本研究开发了一个细胞特异性计算框架,揭示了预测总体生存率和免疫检查点抑制剂(ICI)应答的泛癌缺氧特征 首次在单细胞水平探索泛癌缺氧特征,并评估其在ICI疗效和临床结局中的应用,开发了新的计算框架和预测模型 研究基于计算框架和回顾性数据,需要进一步实验验证 从缺氧角度为生存预后、ICI应答预测和临床治疗靶点开发提供新思路 19种癌症类型的362名患者和893,464个细胞,以及33种癌症类型和29种正常组织的18,901个样本 计算生物学 泛癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 六种机器学习算法 转录组数据 362名患者(893,464个细胞)的38个scRNA-seq数据集,以及18,901个样本的批量转录组数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部