单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 9441 篇文献,本页显示第 7841 - 7860 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
7841 2026-03-20
Single-cell profiling reveals MIF-mediated immune evasion and CD8 + T cell exhaustion in relapsed multiple myeloma
2026-Mar-08, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序分析揭示了复发多发性骨髓瘤中MIF介导的免疫逃逸和CD8⁺ T细胞耗竭机制 首次在单细胞水平上识别MIF作为浆细胞进化的关键调节因子,并揭示了其在复发MM中介导免疫微环境重塑和CD8⁺ T细胞功能障碍的新机制 样本量相对较小(20例患者),且为回顾性分析,需要更大规模的前瞻性研究验证 探索多发性骨髓瘤进展和复发过程中的免疫微环境动态变化,寻找与疾病复发相关的关键通路和细胞相互作用 多发性骨髓瘤患者的骨髓单细胞 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序,免疫组织化学,流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据,图像数据,流式数据 20例多发性骨髓瘤患者(10例初治,2例缓解,8例复发),共60,234个高质量单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7842 2026-03-20
Standardizing single-cell approaches to osteoarthritis: Toward a comprehensive cellular atlas
2026-Mar, Osteoarthritis and cartilage IF:7.2Q1
评论 本文概述了推进骨关节炎单细胞研究的下一步方向,强调标准化细胞类型注释和整合新旧数据集的重要性 提出在骨关节炎研究中标准化单细胞方法,以构建全面的细胞图谱,解决当前数据异质性和整合挑战 作为评论文章,未涉及具体实验数据或方法验证,主要基于现有研究提出建议 推动骨关节炎单细胞研究的标准化,以构建更完整和一致的细胞图谱 骨关节炎的关节细胞组成 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
7843 2026-03-20
Spatial transcriptomic profiling uncovers the molecular effects of the neurotoxicant polychlorinated biphenyls (PCBs) in the brains of adult mice
2026-Jan-31, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学技术,探讨了多氯联苯(PCBs)暴露对成年小鼠大脑功能和认知的影响 首次结合空间转录组学分析,揭示了PCBs暴露对小鼠多个脑区基因表达的特异性影响,并关联了血脑屏障完整性破坏的机制 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠,未考虑性别差异;暴露时间和剂量可能无法完全模拟人类长期低剂量暴露情况 评估PCBs暴露对大脑功能和认知的分子机制影响 成年雄性C57BL/6J小鼠 空间转录组学 神经退行性疾病 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 成年雄性C57BL/6J小鼠(具体数量未明确) NA 空间转录组学 NA NA
7844 2026-03-20
Single-Cell Transcriptome and Microbiome Profiling Uncover Ileal Immune Impairment in Intrauterine Growth-Retarded Piglets
2026, Current pharmaceutical design IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组和微生物组分析,揭示了宫内生长迟缓(IUGR)仔猪回肠免疫功能受损的机制 首次结合单细胞RNA测序和16S rRNA测序,系统探究IUGR仔猪回肠免疫细胞亚群分布、信号通路及微生物组变化,并识别出新的免疫相关转录因子和关键微生物作为潜在治疗靶点 样本量较小(仅3只IUGR仔猪和3只正常仔猪),且研究局限于7日龄仔猪,未涵盖其他发育阶段 探究IUGR仔猪肠道免疫功能障碍的基因调控模式和微生物组变化 宫内生长迟缓(IUGR)仔猪和正常同窝仔猪的回肠组织及内容物 单细胞组学 宫内生长迟缓 单细胞RNA测序(scRNA-seq),16S rRNA扩增子测序(16S-seq) NA 单细胞转录组数据,微生物组数据 3只IUGR仔猪和3只正常同窝仔猪 NA 单细胞RNA-seq,16S rRNA测序 NA NA
7845 2026-03-20
Liver Sinusoidal Endothelial Cells Promote Metabolic Dysfunction-associated Steatohepatitis Progression via Interleukin-1R1-mediated Chemokine Production Induced by Macrophage-derived Interleukin-1β
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示了巨噬细胞来源的IL-1β通过LSEC上的IL1R1信号通路诱导趋化因子产生,从而驱动MASH炎症和纤维化进展的机制 首次阐明了在MASH中,巨噬细胞与肝窦内皮细胞之间通过IL-1β/IL1R1轴相互作用,并利用空间转录组学技术定位了这种相互作用主要发生在门静脉周围区域 体外研究使用了细胞系而非原代细胞,动物模型为饮食诱导,可能无法完全模拟人类MASH的复杂性 阐明IL-1β在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)病理进展中的作用机制 THP-1巨噬细胞系、TMNK-1肝窦内皮细胞系、内皮细胞特异性Il1r1敲除小鼠、Cxcl10全身敲除小鼠、MASH患者肝组织 数字病理学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 RNA测序、空间转录组学分析 NA 基因表达数据、空间转录组数据 小鼠模型(Il1r1ΔEC和Cxcl10-/-小鼠)、MASH患者肝组织样本 NA 空间转录组学 NA NA
7846 2026-03-20
GPR65 as a Laryngeal Cancer Risk Gene Identified through Single-Cell Transcriptomics, Mendelian Randomization Analysis, and Experimental Validation
2026, Anti-cancer agents in medicinal chemistry IF:2.6Q3
研究论文 本研究通过单细胞转录组学、孟德尔随机化分析和实验验证,识别出GPR65作为喉癌的潜在风险基因,并探讨其在癌症发生中的功能机制 首次结合单细胞转录组学、孟德尔随机化分析和体外实验验证,系统识别并验证GPR65作为喉癌风险基因的功能 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证,且样本来源和数量可能有限 识别喉癌的潜在风险基因并研究其功能机制 喉鳞状细胞癌(LSCC)细胞系(TU686和Hep-2)、正常上皮细胞、肿瘤组织与正常组织 数字病理学 喉癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、全基因组关联研究(GWAS)、表达数量性状位点(eQTL)分析、qRT-PCR、免疫组化、细胞增殖、迁移和侵袭实验 NA 单细胞转录组数据、GWAS数据、TCGA数据、实验数据 未明确指定样本数量,但涉及LSCC细胞系、正常上皮细胞及组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7847 2026-03-20
A clustering method for single-cell RNA sequencing data based on denoising and masking learning
2026, Frontiers in bioinformatics IF:2.8Q2
研究论文 本文提出了一种基于去噪和掩码学习的单细胞RNA测序数据聚类方法scDMAC,旨在解决数据高维、稀疏和噪声问题 结合零膨胀负二项分布去噪自编码器和掩码自编码器,通过概率去噪和特征重建学习基因相关性,提升聚类性能 未在更广泛或更复杂的单细胞多组学数据上验证,且计算效率可能受数据规模影响 开发一种针对单细胞RNA测序数据的高效聚类方法,以应对数据稀疏性和噪声挑战 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 自编码器(包括ZINB去噪自编码器和掩码自编码器) 基因表达数据 多个基准scRNA-seq数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7848 2026-03-19
High-sensitivity in situ detection of Sox21 reveals transcript asymmetry from the zygote stage
2026-May, Developmental biology IF:2.5Q2
研究论文 本研究利用高灵敏度原位检测技术,揭示了小鼠胚胎发育中Sox21基因转录不对称性早在2细胞阶段就已出现 首次在2细胞阶段检测到Sox21 mRNA的异质性表达,并发现其优先从雄性原核表达,这为哺乳动物早期谱系决定的机制提供了新见解 研究主要基于小鼠模型,在人类或其他哺乳动物中的普适性尚需验证,且技术方法可能无法完全排除检测假阳性的可能性 探究哺乳动物早期胚胎发育中谱系决定的时间点和分子机制 小鼠早期胚胎(从受精卵到4细胞阶段) 发育生物学 NA 杂交链式反应(HCR)结合共聚焦成像,单细胞RNA-seq NA 图像数据,转录组数据 未明确说明具体样本数量,但涉及多个发育阶段的小鼠胚胎 NA 单细胞RNA-seq,原位杂交 NA NA
7849 2026-03-19
Identification and experimental confirmation of TBC1D10C as a shared transcriptional link between abdominal aortic aneurysm and major depressive disorder
2026-04-09, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过整合多组学数据,识别并实验验证了TBC1D10C作为腹主动脉瘤和重度抑郁症之间的共享转录调控因子 首次发现TBC1D10C作为AAA和MDD的共同关键枢纽基因,并通过scRNA-seq和小鼠模型验证其在免疫细胞中的表达与淋巴细胞活化的负相关性 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证,缺乏直接的人类临床干预数据 揭示腹主动脉瘤和重度抑郁症之间的共享分子通路,寻找共同治疗靶点 腹主动脉瘤和重度抑郁症患者及小鼠模型的基因表达数据 生物信息学 心血管疾病 RNA-seq, scRNA-seq 机器学习 基因表达数据 七个基因表达数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7850 2026-03-19
Tumor Necrosis Factor Receptor-Associated Factor 1 Inhibits Macrophage Killing of Sporothrix schenckii by Enhancing Expression and Activity of Inducible Nitric Oxide Synthase
2026-Mar-17, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和实验模型,揭示了TRAF1通过稳定NOS2表达抑制巨噬细胞杀伤申克孢子丝菌的机制,并探讨了局部热疗的治疗作用 首次发现TRAF1通过结合NOS2抑制其泛素化降解,从而延迟孢子丝菌病愈合,并阐明热疗通过下调TRAF1和NOS2表达发挥治疗作用 机制研究主要在体外和动物模型中进行,临床转化需进一步验证 探究TRAF1和NOS2在孢子丝菌病免疫逃逸中的作用及热疗的治疗机制 申克孢子丝菌感染的巨噬细胞及孢子丝菌病病变组织 NA 孢子丝菌病 单细胞RNA测序, 免疫共沉淀, 泛素化分析, 定点突变 NA 单细胞RNA测序数据, 实验数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
7851 2026-03-19
DUSP6 ablation restores CAR T-cell fitness impaired by tumor CD58 loss through invigoration of AP-1 signaling
2026-Mar-17, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本研究揭示了肿瘤CD58缺失通过减弱AP-1信号导致CAR-T细胞功能障碍,并发现阻断DUSP6可恢复CAR-T细胞的适应性 重新定位CD58不仅是免疫突触成分,更是CAR-T细胞生物学中的代谢检查点,并确定DUSP6阻断是增强CAR-T细胞效力的新工程靶点 未明确说明 探究肿瘤CD58缺失导致CAR-T细胞功能障碍的机制,并寻找恢复CAR-T细胞适应性的治疗策略 CAR-T细胞 肿瘤免疫治疗 癌症 CRISPR/Cas9筛选、单细胞RNA-seq、转录组分析 NA 转录组数据 未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7852 2026-03-19
Human umbilical cord mesenchymal stromal cells therapy for neuromyelitis optica spectrum disorder: a phase 1/2a trial
2026-Mar-17, Cell death and differentiation IF:13.7Q1
研究论文 本研究评估了人脐带间充质干细胞治疗视神经脊髓炎谱系疾病的安全性和有效性 首次在临床试验中系统评估hUC-MSCs对NMOSD的疗效,并探索了其通过硫氧还蛋白和氧化磷酸化途径增强Treg细胞功能的潜在机制 单臂、开放标签设计,样本量较小(31例),缺乏对照组,随访时间有限(15个月) 评估hUC-MSCs减少NMOSD复发和改善神经功能障碍的安全性与疗效 31名NMOSD患者 NA 视神经脊髓炎谱系疾病 单细胞RNA测序,代谢组学检测 NA 临床数据,MRI影像,单细胞RNA测序数据,代谢组学数据 31例NMOSD患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7853 2026-03-19
Cathepsin B promotes asthma potentially via macrophage-associated autophagy and apoptosis
2026-Mar-17, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究整合遗传学、转录组学和实验方法,揭示了组织蛋白酶B(CTSB)通过巨噬细胞相关的自噬和凋亡途径促进哮喘发病的机制 首次通过孟德尔随机化分析证实循环CTSB水平升高与哮喘风险存在因果关系,并利用单细胞RNA测序技术将CTSB表达定位到巨噬细胞,阐明了其通过调控自噬和凋亡影响哮喘的分子机制 研究主要基于小鼠模型和体外数据,在人类中的直接验证尚不充分;CTSB抑制剂的选择性及其在临床治疗中的安全性和有效性仍需进一步评估 探究组织蛋白酶B(CTSB)是否以及如何参与哮喘的发病机制 哮喘患者(人类数据)和C57BL/6小鼠卵清蛋白诱导的哮喘模型 NA 哮喘 孟德尔随机化分析、全基因组关联研究(GWAS)、RNA测序(RNA-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 遗传数据、转录组数据、实验数据 大规模GWAS数据、哮喘患者RNA-seq数据、scRNA-seq数据集、C57BL/6小鼠模型 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
7854 2026-03-19
Representation learning of single-cell RNA-seq data
2026-Mar-16, RNA (New York, N.Y.)
综述 本文综述了单细胞RNA测序数据的表示学习方法,包括因子模型、自编码器、对比学习和基于Transformer的基础模型,并提供了分类和挑战分析 将多种scRNA-seq表示学习方法统一到表示学习范式下,提供概念分类和基准测试讨论 作为综述,未提出新方法,主要基于现有文献总结 综述单细胞RNA测序数据的表示学习方法及其应用 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 因子模型, 自编码器, 对比学习, Transformer 基因表达数据 超过1亿个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7855 2026-03-19
Reconstitution of the uterine immune milieu after uterus or hematopoietic stem cell transplantation
2026-Mar-11, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和高参数流式细胞术,探讨了子宫移植或造血干细胞移植后人类子宫免疫微环境的重建过程 首次在人类中系统评估子宫移植和造血干细胞移植后子宫免疫系统的重建,利用单核苷酸多态性和HLA表达差异追踪供体与受体细胞起源,揭示了免疫细胞在转录组、表型和空间层面的恢复能力 研究样本量有限,且受他克莫司药物影响,可能限制了组织驻留淋巴细胞特征的体外诱导观察 探究人类组织特异性免疫系统的建立与重建机制,特别是在子宫这一持续再生器官中的免疫持久性和恢复能力 接受子宫移植或造血干细胞移植的女性患者的子宫内膜免疫细胞 单细胞组学 移植免疫 单细胞RNA测序, 高参数流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 未明确具体样本数量,涉及接受子宫移植或造血干细胞移植的女性患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
7856 2026-03-19
Macrophage SLC9A1 Links Endocytic Trafficking to Innate Immune Activation in Myocardial Injury
2026-Mar-10, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了巨噬细胞中的钠氢交换体SLC9A1通过调节巨胞饮作用,连接膜离子转运与心肌损伤后先天免疫激活的新机制 首次发现SLC9A1作为连接膜离子转运与炎症信号传导的桥梁,并证实巨噬细胞巨胞饮作用是心肌梗死后先天免疫激活的关键调节器 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中得到验证;SLC9A1抑制剂EIPA的特异性可能影响其他细胞功能 探究心肌梗死后巨噬细胞感知缺血危险信号的上游机制,特别是巨胞饮作用和SLC9A1在先天免疫激活中的作用 心肌梗死小鼠模型中的巨噬细胞,特别是梗死相关巨噬细胞 心血管疾病研究 心血管疾病 单细胞RNA测序,药理学抑制,基因敲除技术 NA 基因表达数据,功能表型数据 使用单核细胞和单核细胞来源巨噬细胞特异性敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7857 2026-03-19
Systematic analyses uncover endocrine-disrupting chemical-responsive genes linked to endometriosis
2026-03, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
研究论文 本研究通过整合孟德尔随机化、贝叶斯共定位和单细胞RNA测序,识别了与内分泌干扰物反应相关并可能影响子宫内膜异位症风险的基因 首次将孟德尔随机化、贝叶斯共定位与单细胞RNA测序整合,系统性地揭示了内分泌干扰物通过特定基因影响子宫内膜异位症风险的分子通路 研究主要基于遗传学和转录组学数据,需要进一步的实验验证来确认这些基因在EDC暴露下的功能机制 识别内分泌干扰物反应基因,并探究它们如何影响子宫内膜异位症的发病风险 与内分泌干扰物反应相关的基因及其在子宫内膜异位症中的潜在作用 生物信息学 子宫内膜异位症 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 贝叶斯共定位分析, 全基因组关联研究 NA 基因表达数据, 遗传变异数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
7858 2026-03-19
A novel integrative machine learning-based prognostic model reveals lactylation regulation in hepatocellular carcinoma progression
2026-Feb-10, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究构建了一个基于乳酸化相关代谢基因的预后模型,用于预测肝细胞癌的进展和治疗效果 首次开发了一个整合机器学习框架的代谢相关乳酸化指数(MRLI),并验证其在多个独立队列中的预后准确性,揭示了乳酸化在肿瘤微环境重塑中的作用 研究主要基于公共数据集和体外实验,需要进一步在更大规模的临床队列中进行验证 构建肝细胞癌的预后预测模型,并探索乳酸化在肿瘤进展中的调控机制 肝细胞癌(HCC)患者 机器学习 肝细胞癌 RNA-seq, 蛋白质组学, 单细胞分析, 空间转录组学 整合机器学习框架 RNA-seq数据, 蛋白质组学数据, 单细胞数据, 空间转录组学数据 四个独立HCC队列,包括40个HCC样本的验证队列 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
7859 2026-03-19
Screening Co-Diagnostic Genes for Lung Adenocarcinoma and Myocardial Infarction and Analysis of the Molecular Functions and Drug Value of the Genes
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
研究论文 本研究通过生物信息学分析筛选了肺腺癌和心肌梗死的共同诊断基因,并分析了其分子功能和药物价值 首次将肺腺癌和心肌梗死两种疾病联系起来,通过多步骤生物信息学方法筛选出共同诊断基因MMP9,并揭示了其在炎症和免疫调节中的作用 研究主要基于公开数据库的转录组数据,缺乏实验验证,且样本来源可能存在异质性 发现肺腺癌和心肌梗死的共同诊断基因,分析其分子功能和潜在药物价值 肺腺癌和心肌梗死患者的基因表达数据 生物信息学 肺癌,心血管疾病 差异表达分析,WGCNA分析,功能富集分析,PPI网络分析,机器学习方法(LASSO,SVM-RFE),免疫浸润分析,药物预测,分子对接分析,单细胞测序分析 LASSO,SVM-RFE 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
7860 2026-03-19
Network toxicology and machine learning reveal the impact of acetyl tributyl citrate on erectile dysfunction and identify cathepsin S as a critical regulator
2026-01, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
研究论文 本研究利用网络毒理学和机器学习方法,探讨了乙酰柠檬酸三丁酯对勃起功能障碍的影响,并确定了组织蛋白酶S作为关键调控因子 首次结合网络毒理学、单细胞测序和多种机器学习算法,系统性地揭示了ATBC通过调控CTSS表达影响内皮功能并导致ED的分子机制 研究主要基于计算分析和体外实验,缺乏体内动物模型或临床样本的验证,且环境暴露的剂量效应关系未充分探讨 探究环境内分泌干扰物ATBC在勃起功能障碍中的具体作用和分子机制 乙酰柠檬酸三丁酯、勃起功能障碍、阴茎海绵体组织、内皮细胞 机器学习 勃起功能障碍 单细胞测序、分子对接、网络毒理学、富集分析 多种机器学习算法(未具体说明类型) 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部