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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2026-05-05 |
Spatial transcriptomics identifies fibroblast-T cell crosstalk as a driver of Th2 polarization in allergic rhinitis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1788288
PMID:42079570
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研究论文 | 利用空间转录组学绘制过敏性鼻炎患者鼻黏膜图谱,发现成纤维细胞与T细胞的串扰驱动Th2极化 | 首次通过10x Genomics Xenium原位空间转录组学结合配体-受体模型,系统性揭示成纤维细胞- T细胞串扰在过敏性鼻炎Th2极化中的核心驱动作用 | 样本量有限(10例患者与10例对照),且主要依赖于空间转录组数据,需要进一步的功能验证研究 | 阐明过敏性鼻炎发病机制中空间基质-免疫细胞相互作用 | 10例过敏性鼻炎患者和10例非过敏性对照的鼻黏膜组织 | 空间转录组学 | 过敏性鼻炎 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 20例鼻黏膜样本(10例AR,10例对照) | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium In Situ | 10x Genomics Xenium原位空间转录组学平台 |
| 762 | 2026-05-05 |
B cell-mediated immune surveillance defines the favorable prognosis of occult breast cancer: a multi-omics study
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1813674
PMID:42079576
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研究论文 | 通过多组学方法研究隐秘性乳腺癌的免疫微环境,揭示B细胞介导的免疫监视与良好预后的关联 | 首次利用多组学整合分析(蛋白质组学、转录组学、单细胞RNA测序)阐明隐秘性乳腺癌中B细胞作为免疫中枢细胞清除原发肿瘤的机制 | 结果基于探索性分析,需在更大队列中进行功能验证 | 揭示隐秘性乳腺癌原发肿瘤清除的免疫机制 | 隐秘性乳腺癌与非隐秘性乳腺癌的淋巴结和肿瘤组织样本 | 基因组学与免疫学 | 乳腺癌 | 定量蛋白质组学、批量转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | SEER数据库12162例患者用于生存分析 | Illumina | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | Illumina测序平台 | 单细胞RNA测序使用10x Genomics平台 |
| 763 | 2026-05-05 |
Single-cell RNA sequencing of leukocytes at the maternal-fetal interface in physiological and pathological Nodal-deficient pregnancies
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1611813
PMID:42079595
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析生理和病理Nodal缺陷妊娠中母胎界面白细胞的特征 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统表征了Nodal缺陷妊娠中母胎界面白细胞的转录组特征,揭示了髓系细胞在胎盘发育中的新功能 | NA | 阐明白细胞在胎盘发育中的作用,理解生理妊娠和生殖失败的机制 | 小鼠母胎界面白细胞(包括巨噬细胞和中性粒细胞等) | NA | 生殖疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 764 | 2026-05-05 |
Single-cell RNA sequencing unravels T cell exhaustion underlying the chronicity of chromoblastomycosis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1784450
PMID:42079606
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示CD4+ T细胞耗竭是着色芽生菌病慢性化的关键机制 | 首次从单细胞水平揭示CD4+ T细胞耗竭是着色芽生菌病慢性化的核心免疫机制,并阐明单核/巨噬细胞通过持续抗原呈递和配体-受体相互作用驱动该过程 | 样本量有限(仅1例患者病变皮肤),需要更大规模队列及更多慢性感染模型验证 | 探究着色芽生菌病慢性化的免疫病理机制 | 着色芽生菌病患者的病变皮肤组织及Fonsecaea pedrosoi感染小鼠模型 | 数字病理学 | 真菌感染性疾病 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者病变皮肤样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 765 | 2026-05-05 |
Identification of a migrasome-related lncRNA signature and its prognostic and immunological role in bladder cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1763443
PMID:42079608
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研究论文 | 建立了一个与迁移体相关的长链非编码RNA签名,用于预测膀胱癌患者的预后和免疫特征 | 首次识别并构建了基于迁移体相关lncRNA的预后签名,并整合单细胞RNA测序分析揭示其在膀胱癌微环境中的细胞异质性和细胞间通讯模式 | 未提及具体局限性 | 识别与膀胱癌预后相关的迁移体相关lncRNA,并评估其与免疫微环境和药物敏感性的关系 | 膀胱癌患者 | 机器学习 | 膀胱癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Cox回归, LASSO回归 | 转录组数据, 临床数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA的膀胱癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 766 | 2026-05-05 |
Innate immune profiling reveals a specific reduction of CD57+CD62L+CD161+ NK cells in CMV-positive males with hypertension
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1749702
PMID:42079601
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研究论文 | 利用质谱流式和单细胞RNA测序揭示高血压男性患者中CMV阳性状态下CD57+CD62L+CD161+ NK细胞特异性减少及其亚群重塑机制 | 首次发现高血压导致CD57+CD62L+CD161+ NK细胞整体减少及致病性亚群重塑,即KLRC2high适应性亚群特异性丧失,而FCER1Ghigh细胞毒性亚群相对保留并成为优势群体 | 样本量较小(仅男性),机制验证依赖IL-15信号通路关联分析,缺乏直接因果实验 | 探究高血压中先天免疫细胞(特别是NK细胞)的失调机制及致病作用 | 高血压和血压正常男性的外周血单个核细胞(PBMC)中的NK细胞 | 机器学习和生物信息学 | 高血压 | 质谱流式(CyTOF)、全谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 质谱流式数据、流式细胞术数据、单细胞转录组数据 | 初始队列10例高血压和10例血压正常男性;验证队列10例高血压和6例血压正常男性 | Fluidigm | 质谱流式, 单细胞RNA测序 | CyTOF, 10x Chromium | CyTOF用于先天免疫谱分析;10x Chromium用于单细胞RNA测序 |
| 767 | 2026-05-05 |
Single-cell landscape of melanoma reveals ETV5-driven C3 ID4+ tumor subpopulation with extracellular vesicle-associated immunosuppressive and pro-metastatic potential
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1795778
PMID:42079653
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组分析,在黑色素瘤中鉴定出ETV5驱动的C3 ID4+肿瘤亚群,该亚群具有细胞外囊泡相关的免疫抑制和促转移潜力 | 首次通过单细胞转录组整合分析揭示ETV5作为关键转录调控因子驱动C3 ID4+肿瘤亚群,并阐明其通过TGF-β相关细胞间通讯和细胞外囊泡信号促进黑色素瘤进展和免疫逃逸的机制 | 缺乏大规模临床样本验证及功能实验的体内模型支持,且ETV5下游具体调控网络和细胞外囊泡的详细机制尚未完全解析 | 探究黑色素瘤中未分化的肿瘤亚群及其在恶性进展和免疫逃逸中的作用 | 10例I/III期黑色素瘤标本的肿瘤微环境和肿瘤异质性 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | CytoTRACE, CellChat, SCENIC, CRISPR/Cas9 | 单细胞转录组数据 | 10例I/III期黑色素瘤标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 768 | 2026-05-05 |
scRNA sequencing revealed HIV-associated inflammation-mediated lung epithelial dysregulation and fibroblast remodeling
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1789140
PMID:42079650
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示HIV感染导致肺部上皮失调和成纤维细胞重塑的机制 | 首次在单细胞水平上系统描绘HIV感染对肺上皮、免疫和基质细胞群的转录重组影响,发现肺泡上皮细胞向间质表型转变及成纤维细胞促炎应激反应增强 | 未探讨这些通路在HIV相关肺部病理中的治疗相关性,且样本量可能有限 | 表征HIV感染在肺部的细胞和分子景观,评估上皮重塑和HIV驱动的肺细胞组成及转录程序变化 | 来自HIV感染者和未感染个体的肺组织,包括吸烟者和非吸烟者 | 单细胞转录组学 | HIV相关肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | UMAP聚类 | 单细胞转录组数据 | 总共54,230个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 769 | 2026-05-05 |
Tumor reactivity assessment using clonal expression reveals tumor reactive CD8+ T cell heterogeneity across solid tumors
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1815974
PMID:42079667
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研究论文 | 利用克隆表达评估肿瘤反应性,揭示实体瘤中肿瘤反应性CD8+ T细胞的异质性 | 提出一种无需数据集预处理的克隆型水平CD8+ TRT分类器TRACE,克服了单数据集、供体或适应症训练的局限性,并可在新测试数据集上直接应用 | 未在论文中明确提及局限性 | 构建并验证一种基于单细胞RNA测序的肿瘤反应性T细胞预测算法,以评估不同实体瘤中TRT的频率 | 肿瘤浸润淋巴细胞和血液T细胞克隆型 | 机器学习 | 肺癌,结直肠癌,胰腺癌,黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自多个肿瘤图谱的数百名患者样本(涵盖肺癌、结直肠癌和胰腺癌) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 770 | 2026-05-05 |
Application of multi-omics in systemic autoimmune rheumatic diseases: a bibliometric and visualization analysis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1759610
PMID:42079670
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综述 | 利用文献计量学和可视化分析,系统回顾2005至2025年间多组学技术在系统性自身免疫性风湿病中的应用现状、发展趋势及主题演变 | 首次通过文献计量学方法,系统描绘了多组学在SARD研究中从体液分子表征向单细胞免疫细胞层面高分辨率分析的转化路径及国际合作模式 | 仅依赖Web of Science核心合集数据库,可能存在文献覆盖不全;操作化定义仅纳入至少两个组学层面的研究,可能排除了单一组学但有重要贡献的工作 | 系统综述多组学技术在系统性自身免疫性风湿病研究中的应用现状与发展趋势,指导未来研究方向 | 2005至2025年间Web of Science核心合集中关于多组学在SARD应用的英文文献 | 自然语言处理 | 风湿性自身免疫疾病 | NA | NA | 文本 | 2576篇文献(2072篇研究论文和504篇综述) | NA | NA | NA | NA |
| 771 | 2026-05-05 |
Integrated analysis identifies a palmitoylation-associated prognostic model (ACSM5/SKA3) for lung adenocarcinoma across multiple cohorts
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.21160
PMID:42079738
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研究论文 | 通过整合分析确定了肺腺癌中一个棕榈酰化相关预后模型(ACSM5/SKA3),并在多个队列中验证其预后价值 | 首次构建了基于棕榈酰化相关基因的ACSM5/SKA3双基因预后模型,该模型能够分层患者预后并反映代谢、增殖和免疫微环境状态,为肺腺癌风险分层和治疗设计提供棕榈酰化相关基础 | 模型区分性能中等(TCGA中1年、3年、5年AUC分别为0.717、0.733、0.697),可能需进一步优化 | 探究棕榈酰化相关基因在肺腺癌中的预后价值及其与肿瘤微环境的关系 | 肺腺癌患者 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR | LASSO-Cox回归模型 | 转录组数据(RNA-seq), 单细胞RNA测序数据(scRNA-seq) | TCGA-LUAD队列及三个GEO外部验证队列,包含单细胞RNA测序数据集和配对的LUAD及相邻组织 | NA | NA | NA | NA |
| 772 | 2026-05-05 |
An optimization framework for hierarchical clustering
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag107
PMID:42079811
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研究论文 | 提出一种基于平均链接的层次聚类优化框架,通过集成多视图相似性度量提升聚类质量 | 首次将局部与全局视角结合,通过多视图数据生成与集成学习优化层次聚类,克服贪心算法的结构性次优问题 | 未明确提及计算复杂度及大规模数据集上的扩展性 | 改进层次聚类的结构最优性 | 合成数据集、经典基准数据集及单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 平均链接层次聚类、集成学习 | 数值数据 | 多种合成及经典数据集,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 773 | 2026-05-04 |
Molecular PET imaging of tumor-associated macrophages in precision oncology
2026-Jul-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218526
PMID:42019605
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综述 | 系统评述了用于肿瘤相关巨噬细胞定量成像的正电子发射断层扫描策略的演变,重点介绍了高亲和力分子探针的范式转变及其临床潜力 | 强调从间接代谢成像向高亲和力分子探针的范式转变,特别突出了纳米抗体和肽类示踪剂在肿瘤穿透性和快速清除方面优于全长抗体的优势 | 跨物种标志物不一致等转化障碍限制了临床应用 | 评估分子PET成像在肿瘤相关巨噬细胞量化中的进展及其在精准肿瘤学中的潜在应用 | 肿瘤相关巨噬细胞 | 计算机视觉 | 肿瘤 | PET | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 774 | 2026-05-04 |
GLT8D2-mediated PD-L1 N-glycosylation promotes tumor immune evasion in ovarian cancer peritoneal metastasis
2026-Jul-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218478
PMID:41936856
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研究论文 | 本研究探讨糖基转移酶GLT8D2通过PD-L1 N-糖基化促进卵巢癌腹膜转移和肿瘤免疫逃逸的作用机制 | 首次发现GLT8D2通过催化PD-L1在Asn192位点的N-糖基化修饰来增强PD-L1稳定性,从而促进卵巢癌腹膜转移和免疫逃逸,并揭示了HIF-1α作为其直接转录激活因子 | 尚需进一步验证GLT8D2在其他癌症类型中的功能和临床转化潜力 | 阐明GLT8D2在卵巢癌腹膜转移中调控免疫逃逸的分子机制 | 卵巢癌腹膜转移组织和肿瘤细胞 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 临床样本和单细胞数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 775 | 2026-05-04 |
Decoupling lactylation-associated metabolic remodelling in Asthma: Integrated multi-omics and machine learning identify RCC2 as a potential therapeutic target
2026-Jul, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2026.109371
PMID:42000636
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研究论文 | 通过整合多组学和机器学习,解析哮喘中乳酸化相关的代谢重塑,并识别RCC2作为潜在治疗靶点 | 首次结合批量转录组和单细胞RNA测序,构建可解释的乳酸代谢生物标志物诊断框架,并发现RCC2连接糖酵解与表观遗传重塑的调控作用 | 未提及具体局限性,但可能需要体内和临床队列进一步验证 | 绘制哮喘中乳酸/组蛋白乳酸化相关的代谢状态,并开发乳酸代谢生物标志物诊断框架 | 哮喘患者的气道细胞和16HBE细胞 | 机器学习 | 哮喘 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 高斯混合模型引导的逻辑回归分类器 | 转录组数据 | 批量转录组训练集GSE63142和验证集GSE43696,单细胞RNA测序数据集GSE193816 | NA | NA | NA | NA |
| 776 | 2026-05-04 |
Curcumin modulates the function of SPP1+ macrophages via NF-κB signaling to alleviate endometriosis
2026-Jul-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116644
PMID:42001649
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和多组学分析,揭示SPP1+巨噬细胞通过NF-κB信号通路促进子宫内膜异位症发病,并阐明姜黄素通过靶向该通路缓解疾病的分子机制 | 首次鉴定SPP1+巨噬细胞为子宫内膜异位症的关键致病巨噬细胞亚群,并阐明姜黄素靶向NF-κB信号通路抑制炎症重编程的新机制 | NA | 探索子宫内膜异位症的细胞异质性及其核心致病机制,并评估姜黄素的治疗潜力 | 子宫内膜异位症病灶组织中的细胞,特别是SPP1+巨噬细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序,多组学分析,细胞间通讯分析,动物实验 | NA | 单细胞转录组数据,多组学数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 777 | 2026-05-04 |
DECTIN-2 regulates macrophage M1 polarization via the SYK/ROS/JNK axis to influence the progress of apical periodontitis
2026-Jul-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116694
PMID:42019388
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研究论文 | 本研究揭示DECTIN-2通过SYK/ROS/JNK信号轴调控巨噬细胞M1极化,从而影响根尖周炎的进展 | 首次阐明DECTIN-2在根尖周炎中通过SYK/ROS/JNK轴调控巨噬细胞M1极化的分子机制 | 未提及具体局限性 | 探究DECTIN-2在巨噬细胞极化和根尖周炎中的功能及潜在机制 | 人类根尖周炎病变组织、Dectin-2敲除小鼠模型及体外培养的巨噬细胞 | 机器学习 | 根尖周炎 | 单细胞测序、转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据、转录组测序数据 | 人类根尖周炎病变组织样本及Dectin-2敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、转录组测序 | NA | NA |
| 778 | 2026-05-04 |
From cells to niches: Rewiring cardiovascular disease through spatial immunity
2026-Jul-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116731
PMID:42044575
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综述 | 提出从细胞中心转向微环境中心的心血管疾病空间免疫学新框架 | 提出从细胞中心模型转向微环境中心模型,将组织视为结构化免疫生态系统,并整合空间转录组学等多模态技术 | 目前从空间相关性推断因果关系的能力有限 | 整合空间免疫学进展,推动心血管疾病免疫机制的概念转变 | 心血管疾病中的免疫细胞、基质细胞及其空间微环境 | 计算生物学、免疫学 | 心血管疾病 | 空间转录组学、多重成像、单细胞多组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、成像数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序、单细胞多组学 | NA | NA |
| 779 | 2026-05-04 |
Targeted inhibition of microglial C5aR1 by PMX205 mitigates post-ischemic stroke neuroinflammation and promotes functional recovery
2026-Jun-01, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和功能实验,发现PMX205靶向抑制小胶质细胞C5aR1可减轻缺血性脑卒中后神经炎症并促进功能恢复 | 首次利用单细胞RNA测序识别缺血性脑卒中后小胶质细胞中C5aR1的关键调控作用,并通过PMX205靶向抑制验证其治疗潜力 | NA | 识别缺血性脑卒中小胶质细胞中的关键调节因子,并将其转化为临床治疗靶点 | 小胶质细胞C5aR1在缺血性脑卒中的表达及功能 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,定量免疫印迹,分子对接,ELISA,TTC染色,TUNEL/Nissl染色 | NA | 基因表达数据,图像 | 公共单细胞RNA测序数据集,两种小鼠模型(永久性局灶性缺血和短暂缺血再灌注损伤) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 780 | 2026-05-04 |
Exploring the toxicological impact of perfluorooctanoic acid and perfluorooctane sulfonate on glioblastoma through network toxicology, machine learning, and multi-dimensional bioinformatics analysis
2026-Jun-01, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 结合网络毒理学、机器学习和多维生物信息学分析,探究全氟辛酸(PFOA)和全氟辛烷磺酸(PFOS)对胶质母细胞瘤(GBM)的毒性影响及其分子机制 | 首次联合网络毒理学、机器学习、免疫浸润分析、单细胞RNA测序、分子对接、孟德尔随机化和分子动力学模拟等多维度方法,系统揭示PFOA/PFOS暴露与GBM之间的潜在毒性靶点和机制,并提出了新的不良结局通路框架 | 研究主要基于计算分析和公共数据库,缺乏体外或体内实验验证,且MR分析中ODC1与GBM风险的关联需要进一步在更大样本中确认 | 探索PFOA和PFOS对胶质母细胞瘤的潜在毒性靶点和分子机制 | PFOA和PFOS两种化学物质、GBM相关基因表达数据、免疫细胞浸润数据、单细胞RNA测序数据 | 计算生物学、机器学习和生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 网络毒理学、机器学习、免疫浸润分析、单细胞RNA测序、分子对接、孟德尔随机化、分子动力学模拟 | 机器学习模型(具体类型未明确) | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、分子对接数据、分子动力学模拟数据 | 3个外部独立数据集用于验证,具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |