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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7561 | 2026-04-06 |
Plasma PFDN2 suppresses head and neck squamous cell carcinoma progression by restricting CD64 on monocyte-driven inflammatory microenvironments
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1791776
PMID:41884853
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研究论文 | 本研究通过多样本孟德尔随机化分析,发现血浆蛋白PFDN2通过抑制单核细胞上的CD64来限制头颈部鳞状细胞癌的进展 | 首次将血浆蛋白PFDN2与HNSC风险通过单核细胞CD64介导的免疫微环境联系起来,并利用虚拟敲除和分子模拟验证其相互作用 | 研究主要基于遗传关联和计算模拟,需要更多实验验证PFDN2-CD64轴的功能机制 | 探究血浆蛋白对头颈部鳞状细胞癌免疫微环境的因果调控作用 | 头颈部鳞状细胞癌患者样本、血浆蛋白质组、免疫细胞表型 | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、免疫荧光染色 | scTenifoldKnk虚拟敲除模型 | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、组织病理数据 | 大规模血浆蛋白质组和HNSC样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7562 | 2026-04-05 |
MLRR-ATV: A Robust Manifold Nonnegative Low-Rank Representation With Adaptive Total-Variation Regularization for scRNA-seq Data Clustering
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3432740
PMID:39046863
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研究论文 | 本文提出了一种名为MLRR-ATV的新型单细胞RNA测序数据聚类方法,通过自适应全变分正则化和流形学习来减少噪声影响并保留数据结构 | 将自适应全变分正则化引入低秩表示模型,通过梯度学习减少噪声,并同时学习线性和非线性流形结构 | 模型是非凸的,需要采用交替方向乘子法进行优化,可能影响计算效率 | 开发一种鲁棒的单细胞RNA测序数据聚类方法,以改善基因表达数据的分析 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩表示模型 | 基因表达数据 | 八个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7563 | 2026-04-05 |
Deep Imputation Bi-Stochastic Graph Regularized Matrix Factorization for Clustering Single-Cell RNA-Sequencing Data
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3387911
PMID:38607719
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研究论文 | 提出一种基于深度矩阵分解和双随机图正则化的单细胞RNA测序数据聚类新方法 | 结合特征选择、缺失值填补、降维处理和双随机图正则化的深度矩阵分解框架 | 未明确说明方法在超大规模数据集上的计算效率及对特定细胞类型的适用性 | 开发单细胞RNA测序数据的聚类算法以揭示细胞异质性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度矩阵分解 | 基因表达矩阵 | 九个数据集(未指定具体样本量) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7564 | 2026-04-04 |
Single-cell landscape of piglet lung response with Actinobacillus pleuropneumoniae
2026-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2026.2646800
PMID:41843736
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了猪肺在感染胸膜肺炎放线杆菌后的免疫反应和纤维化特征 | 首次在猪肺感染模型中应用单细胞RNA测序技术,系统性地鉴定了18个细胞亚群,并揭示了单核细胞、中性粒细胞和浆细胞样树突状细胞在感染后的富集和基因表达变化,以及胸膜肺炎放线杆菌通过抑制单核细胞分化和触发肺泡巨噬细胞凋亡来减少巨噬细胞数量的机制 | 研究仅针对猪肺模型,未直接验证在人类纤维化肺病中的适用性,且样本量可能有限,未详细说明具体样本数量 | 探究猪肺对胸膜肺炎放线杆菌感染的免疫反应和纤维化机制 | 猪肺组织,包括感染和未感染胸膜肺炎放线杆菌的猪肺样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7565 | 2026-04-04 |
Mechanism study of phthalate exposure promoting endometriosis: Based on the ferroptosis perspective
2026-Apr-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.141670
PMID:41791190
|
研究论文 | 本研究从铁死亡角度,整合多组学数据与计算方法,系统研究了邻苯二甲酸酯暴露促进子宫内膜异位症的机制 | 首次从铁死亡角度系统揭示邻苯二甲酸酯暴露促进子宫内膜异位症的微观机制,并构建了“PAEs - 铁死亡 - EMT - 子宫内膜异位症”轴 | 机制研究主要基于计算分析和体外模型,需要进一步的体内实验验证 | 探究邻苯二甲酸酯暴露促进子宫内膜异位症的分子机制 | 子宫内膜异位症患者样本及相关细胞模型 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, 网络毒理学, 多组学分析, 分子对接 | 多种机器学习方法, scTenifoldKnk算法 | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7566 | 2026-04-04 |
Unveiling the Clinical Potential of Prostate Cancer Three-dimensional Models: A Systematic Review
2026-Apr-01, European urology oncology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.euo.2026.03.007
PMID:41927412
|
系统综述 | 本文系统评估了前列腺癌三维模型的可行性、分子保真度及转化应用 | 首次系统性地评估了患者来源类器官和器官切片组织作为三维模型在前列腺癌研究中的临床潜力,并总结了其在分子保真度、生物标志物发现和药物筛选方面的应用 | 类器官建立成功率差异大,长期扩增能力有限,缺乏微环境成分,且建立过程耗时 | 评估前列腺癌三维模型作为转化工具在精准肿瘤学中的可行性、分子保真度及应用价值 | 人类来源的前列腺癌三维模型,包括患者来源类器官和器官切片组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序,基因组学,转录组学,表观遗传学分析 | 3D 模型,患者来源类器官,器官切片组织 | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7567 | 2026-04-04 |
Complement 5a receptor 2 attenuates diabetic kidney disease by promoting mitochondria-associated endoplasmic reticulum membrane formation mediated by PSS-MFN2 interaction
2026-Mar-31, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-026-00873-w
PMID:41916963
|
研究论文 | 本研究揭示了补体5a受体2(C5aR2)通过促进PSS-MFN2相互作用介导的线粒体相关内质网膜形成,从而改善糖尿病肾病(DKD)的新机制 | 首次阐明了C5aR2在DKD中的非经典代谢调控作用,发现其通过c-FOS/PSS/MFN2信号轴促进MAM形成和磷脂酰丝氨酸生物合成,并证实C5aR2特异性激动剂P59的治疗潜力 | 研究主要基于动物模型和体外机制探索,在人体中的治疗效应和长期安全性仍需进一步临床验证 | 探究C5aR2在糖尿病肾病代谢调控中的非经典功能及其分子机制 | 糖尿病肾病患者组织样本、糖尿病模型小鼠(包括C5aR2缺陷型)、db/db小鼠、近端肾小管细胞 | 单细胞组学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 糖尿病肾病患者组织样本及多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7568 | 2026-04-04 |
Biology and preclinical models of colorectal cancer metastasis
2026-Mar-26, Intestinal research
IF:3.4Q2
DOI:10.5217/ir.2025.00315
PMID:41882926
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综述 | 本文总结了结直肠癌转移的生物学机制及当前用于研究转移性结直肠癌的临床前模型,并讨论了新兴技术如何整合以改进模型系统 | 系统性地比较了现有实验模型在模拟转移级联关键步骤和器官特异性微环境方面的优缺点,并提出了整合单细胞、空间转录组学和纵向追踪技术的新框架 | 现有模型在模拟免疫和基质影响方面存在概念性差距,且纵向采样和转移负荷的定量读出存在实际障碍 | 理解转移性结直肠癌的生物学机制并改进其临床前研究模型 | 转移性结直肠癌的生物学过程及其实验模型系统 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7569 | 2026-04-04 |
Developmental determinants of male bias in medulloblastoma
2026-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.25.714163
PMID:41929097
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研究论文 | 本研究探讨了髓母细胞瘤中男性发病率偏高的发育决定因素 | 通过整合多组学数据、构建性别匹配的小鼠小脑单细胞转录组图谱,并结合基因工程小鼠模型和人小脑类器官,揭示了男性偏倚的遗传和神经发育机制,特别是雄性激素睾酮的主导作用 | 研究主要基于小鼠模型和类器官,其结论在人体中的普适性仍需进一步验证;对性染色体失活丢失的具体机制及其功能影响探讨有限 | 探究髓母细胞瘤(一种儿童小脑肿瘤)中男性发病率显著高于女性的生物学原因 | 儿童髓母细胞瘤患者样本、发育中小鼠的小脑细胞、基因工程小鼠模型、人小脑类器官 | 癌症生物学/发育神经生物学 | 髓母细胞瘤(儿童脑肿瘤) | 多组学分析(基因组学、转录组学、表观基因组学)、单细胞转录组测序、染色质可及性分析、基因工程小鼠模型、类器官培养 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观基因组数据、单细胞RNA-seq数据 | 大型多组学数据集(来自儿童髓母细胞瘤患者),具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7570 | 2026-04-04 |
Heterogeneity and prognostic significance of mast cell subsets in the tumor microenvironment of prostate cancer
2026-Mar-24, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04363-6
PMID:41874654
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和生物信息学分析,揭示了前列腺癌肿瘤微环境中肥大细胞亚群的异质性及其与预后的关联 | 首次在前列腺癌中通过单细胞RNA测序将肥大细胞分为两个功能相反的亚群,并鉴定出亚群特异性标记基因作为预后因子 | 研究样本量相对较小(39个肿瘤样本),且主要依赖生物信息学分析,缺乏实验验证 | 探究前列腺癌肿瘤微环境中肥大细胞亚群的异质性及其对预后的影响 | 前列腺癌肿瘤微环境中的肥大细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 生物信息学分析 | 非负矩阵分解 | RNA测序数据 | 39个前列腺癌肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7571 | 2026-04-04 |
Combined single-cell transcriptome and immune repertoire analysis reveals hepatic and renal immune injury by heat stroke
2026-Mar-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189825
PMID:41869724
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、T细胞受体测序和流式细胞术分析,揭示了热射病(特别是劳力性热射病)中肝脏和肾脏免疫损伤的机制 | 首次结合单细胞转录组和免疫受体分析,识别了热射病中富集的颗粒酶阳性T细胞、CD56dim NK细胞和IL-1B+NLRP3+单核细胞,并揭示了它们通过NLRP3炎症小体通路诱导肝、肾细胞焦亡的相互作用机制 | 样本量较小(仅27名参与者),且仅分析了外周血单个核细胞,未直接研究肝脏和肾脏组织 | 探索热射病(特别是劳力性热射病)的免疫病理学机制 | 热射病患者、热衰竭患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 热射病 | 单细胞转录组学、T细胞受体测序、流式细胞术 | NA | 单细胞RNA-seq数据、免疫受体序列数据、流式细胞数据 | 27名参与者(9名健康对照、9名热衰竭患者、9名劳力性热射病患者) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7572 | 2026-04-04 |
Hypothyroidism impairs skeletal muscle regeneration after injury by altering myogenic and nonmyogenic pathways
2026-Mar-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197761
PMID:41869726
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和细胞周期报告小鼠模型,揭示了甲状腺功能减退通过改变肌源性及非肌源性通路损害骨骼肌损伤后再生过程 | 首次结合单细胞转录组测序与FUCCI细胞周期报告系统,系统阐明甲状腺功能减退对肌源性细胞多样性、细胞周期进程及非肌源性微环境(FAPs与巨噬细胞)的双重调控机制 | 研究基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;未探讨甲状腺激素替代治疗的干预效果 | 探究甲状腺激素信号在骨骼肌损伤修复过程中的具体调控通路 | 小鼠胫骨前肌的骨骼肌干细胞、纤维脂肪祖细胞及巨噬细胞等 | 单细胞组学 | 甲状腺功能减退相关肌病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞周期荧光报告系统(FUCCI)、转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据、细胞周期成像数据 | 小鼠胫骨前肌损伤模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7573 | 2026-04-04 |
Macrophages expressing macrophage receptor with collagen structure attenuate liver fibrosis through a tissue restoration phenotype
2026-Mar-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.193172
PMID:41869728
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,揭示了MARCO+巨噬细胞在肝脏纤维化中通过促进组织修复表型来减轻纤维化的作用机制 | 首次在肝脏纤维化模型中识别出MARCOhi巨噬细胞亚群,并证明其通过增强吞噬作用和抗炎基因表达,直接与肝星状细胞相互作用减少胶原沉积,为肝脏纤维化治疗提供了新的潜在靶点 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证;MARCO+巨噬细胞的具体分子调控机制仍需进一步探索 | 探究巨噬细胞在肝脏纤维化中的作用,特别是MARCO+巨噬细胞对纤维化进程的影响 | 小鼠肝脏纤维化模型中的巨噬细胞和肝星状细胞 | 单细胞组学 | 肝脏纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肝脏纤维化模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7574 | 2026-04-04 |
Confidence-Based Batch Ordering in Continual Learning: A Curriculum Learning Approach for Single-Cell RNA Sequencing Data
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3654772
PMID:41543966
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研究论文 | 本研究提出了一种基于置信度的批量排序策略,用于单细胞RNA测序数据的持续学习,通过按置信度升序排列训练批次来提升分类性能 | 引入置信度估计来优先处理训练样本,首次在持续学习中系统研究批量排序对学习效率和模型性能的影响 | 未探讨自适应置信度指标在动态数据集中的应用,且策略在其他领域的扩展性有待验证 | 优化持续学习算法在数据密集型任务中的工作流程,提高模型在单细胞RNA测序数据上的分类性能和泛化能力 | 单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 持续学习算法 | 基因表达数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7575 | 2026-04-04 |
scDGCL: A Dual-Level and Graph-Constrained Contrastive Learning Method for Single-Cell RNA Sequencing Data Clustering
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3655670
PMID:41557577
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scDGCL的双层图约束对比学习方法,用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 该方法通过同时考虑细胞和簇级别的相似性与差异性,并利用图的关系先验对齐表示,从而优化细胞表示并提升聚类性能 | NA | 提升单细胞RNA测序数据的聚类性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 对比学习 | 基因表达数据 | 12个真实数据集和8个模拟数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7576 | 2026-04-04 |
Bayesian Hyperspherical Graph Mixture-of-Experts Deciphers Cell-Cell Interaction in Spatial Transcriptomics
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3660060
PMID:41628049
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研究论文 | 本文提出了一种名为B-HGME的无监督贝叶斯框架,用于从空间转录组数据中联合推断空间域和细胞-细胞相互作用网络 | 提出了首个结合超球面嵌入和贝叶斯混合专家模型的框架,用于无监督地推断具有方向性和长程性的细胞-细胞相互作用,并提供了原则性的不确定性量化 | 未明确说明模型的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 | 开发一种计算框架,以无监督和可解释的方式从空间转录组数据中准确推断细胞-细胞相互作用和空间域 | 空间转录组数据中的细胞及其相互作用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 贝叶斯超球面图混合专家模型 | 空间转录组数据 | 来自六个主要空间转录组平台的多个数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7577 | 2026-04-04 |
TGF-β regulated Tim-3 sustains macrophage phagocytic function and confers protection in Plasmodium yoelii NSM-infected mice
2026-Feb-27, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-026-07287-3
PMID:41761269
|
研究论文 | 本研究揭示了在疟疾感染中,TGF-β调控的Tim-3通过维持巨噬细胞的吞噬功能发挥保护作用 | 首次揭示了TGF-β-Tim-3轴在疟疾感染中调控巨噬细胞功能的新机制,并证明Tim-3在巨噬细胞上的保护性作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体中得到验证 | 探究Tim-3在疟疾感染期间调控巨噬细胞功能的作用及其上游调控机制 | 约氏疟原虫NSM感染的小鼠模型、脾脏巨噬细胞、体外共培养系统 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、功能测定 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7578 | 2026-04-04 |
Single-cell hdWGCNA and experimental validation identify an innovative T-cell-associated prognostic model and immune microenvironment in lung adenocarcinoma with lymph node metastasis
2026-Feb-25, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15649-4
PMID:41742055
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高维加权基因共表达网络分析,构建了一个基于T细胞相关基因(CD69、GOLGA8A、IL16)的预后模型,用于评估淋巴结转移性肺腺癌患者的预后 | 首次结合单细胞RNA测序和高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)构建T细胞相关预后模型,并整合临床变量提升模型可解释性 | 研究依赖于公共数据库数据,样本量可能有限,且实验验证主要在细胞系中进行,需进一步临床验证 | 建立基于T细胞的预后模型,评估淋巴结转移性肺腺癌患者的预后并优化治疗策略 | 淋巴结转移性肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)、差异表达分析、Cox/LASSO回归、qRT-PCR、免疫组化、多重免疫荧光 | 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7579 | 2026-04-04 |
Decoding muscle-resident Schwann cell dynamics during neuromuscular junction remodeling
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195917
PMID:41433107
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,通过比较稳定神经支配模型与部分或完全去神经支配后的再神经支配模型,揭示了肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的作用 | 发现了多种不同的施万细胞亚型,包括一个在去神经-再神经循环中起关键作用的终末施万细胞亚型,并确定了SPP1信号通路是调节神经肌肉接头动态、促进施万细胞增殖和肌肉再神经支配的关键调控因子 | 未在摘要中明确说明 | 阐明肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的贡献 | 肌肉驻留施万细胞 | 单细胞组学 | 神经肌肉疾病、神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7580 | 2026-04-04 |
Aging-induced decrease in progenitor B cells enhances the osteoclastogenesis of bone marrow macrophages via ROS-activated Fos/CCL3 signaling pathway
2026-Feb-10, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-026-00561-z
PMID:41668199
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研究论文 | 本研究揭示了衰老过程中骨髓微环境中ROS水平升高导致祖B细胞减少,进而通过激活Fos/CCL3信号通路促进破骨细胞生成,从而引发老年性骨质疏松的机制 | 首次通过单细胞RNA测序等多组学整合策略,阐明了骨髓微环境中ROS诱导的祖B细胞减少通过Fos/CCL3-CCR1轴促进破骨细胞生成的新机制 | 研究主要基于SAMP6小鼠模型,人体内的验证尚需进一步研究;体外细胞实验使用了BaF3和RAW 264.7细胞系,可能与体内原代细胞存在差异 | 探究免疫细胞改变在老年性骨质疏松中的机制作用 | SAMP6衰老加速小鼠、SAMR1对照小鼠、BaF3细胞系、RAW 264.7细胞系 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序、转录组测序、流式细胞术、微CT、分子生物学、组织学技术、多色免疫荧光、多重细胞因子分析 | NA | 基因表达数据、图像数据、细胞计数数据 | SAMP6与SAMR1小鼠模型,具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |