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当前共找到 9342 篇文献,本页显示第 721 - 740 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
721 2026-09-20
Mendelian Randomization and ScTranscriptomics Reveal a Lipid Low Malignant Cells Driving Immunosuppression and Matrix Remodeling in Oral squamous cell carcinoma
2026-Feb, International dental journal IF:3.2Q1
研究论文 结合孟德尔随机化与单细胞转录组学,揭示口腔鳞状细胞癌中脂质低代谢恶性细胞驱动免疫抑制和基质重塑 首次采用孟德尔随机化与单细胞RNA测序双验证策略,鉴定出与甘油磷脂代谢低相关的恶性细胞亚群Lipid_Low,并揭示其在免疫抑制和基质重塑中的作用 未提及具体样本量及实验验证的局限性,需要进一步实验验证Lipid_Low亚群的功能机制 探究脂质代谢与口腔鳞状细胞癌预后之间的关系,寻找高风险细胞状态和潜在治疗靶点 口腔鳞状细胞癌患者 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 孟德尔随机化,单细胞RNA测序 NA 图像,文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
722 2026-09-20
Integrated analysis identifies conserved transcription factors TCF12, E2F1, and TEAD4 with diagnostic and therapeutic value in osteoarthritis subchondral bone
2026-02, Genes & genomics IF:1.6Q3
研究论文 该研究通过整合分析人类骨关节炎患者和大鼠模型的RNA-seq数据,识别出在骨关节炎软骨下骨中具有诊断和治疗价值的保守转录因子TCF12、E2F1和TEAD4 首次通过跨物种整合分析识别出TCF12、E2F1和TEAD4三个保守转录因子作为骨关节炎软骨下骨的关键调控因子,并揭示其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 摘要中未明确提及研究局限性 识别驱动骨关节炎进展的软骨下骨关键分子靶点和转录因子,重点关注其诊断和治疗潜力 人类骨关节炎患者的软骨下骨样本和大鼠骨关节炎模型 机器学习 骨关节炎 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫荧光, qPCR NA 文本, 图像 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
723 2026-09-20
Tumor microenvironment-driven drug resistance in urologic cancers: mechanisms and therapeutic targets
2026-02, Genes & genomics IF:1.6Q3
综述 该综述总结了泌尿系统癌症中肿瘤微环境驱动的耐药机制,并探讨了相应的治疗靶点和策略 系统整合了肿瘤微环境各组分在泌尿系统癌症耐药中的作用,并提出了包括单细胞和空间转录组学、类器官共培养系统在内的新型研究方法和治疗策略 作为综述文章,未提供原始实验数据,且未对各个耐药机制的具体贡献进行定量分析 总结泌尿系统癌症中肿瘤微环境驱动耐药的机制,并探讨克服耐药的潜在治疗靶点和策略 肾细胞癌、膀胱癌、前列腺癌 数字病理学 前列腺癌 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
724 2026-09-20
LOXL2⁺ cancer-associated fibroblasts shape WNT signaling to drive chemoresistance and poor outcomes in colorectal cancer: Insights from multi-omics and epidemiological analyses
2026-02, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 该研究通过整合批量、单细胞和空间转录组数据及流行病学分析,揭示了LOXL2⁺癌症相关成纤维细胞通过激活WNT信号驱动结直肠癌化疗耐药和不良预后 首次识别出以LOXL2高表达为特征的肌成纤维细胞样CAF亚群,并阐明其通过激活WNT信号通路促进肿瘤干细胞特性和化疗耐药;结合多组学和流行病学分析验证了LOXL2作为预后生物标志物的临床价值 摘要中未明确提及研究局限性 阐明结直肠癌中癌症相关成纤维细胞的流行病学和分子异质性,及其对化疗耐药和患者预后的影响 结直肠癌患者样本、癌症相关成纤维细胞、肿瘤细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞转录组测序、空间转录组测序、批量转录组测序、免疫荧光、功能实验 多变量Cox回归模型 转录组数据、图像 多个结直肠癌队列的批量、单细胞和空间转录组数据集,以及患者来源组织和独立队列 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 NA NA
725 2026-09-20
Tumor-initiating stem cells fine-tune the plasticity of neutrophils to sculpt a protective niche
2026-Jan-12, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序、空间转录组学和基因操作,揭示了肿瘤起始干细胞通过Fads1-花生四烯酸-PGE信号通路调控肿瘤相关中性粒细胞的异质性和可塑性,从而塑造保护性微环境并促进免疫治疗耐药和肿瘤复发 首次发现位于肿瘤-基质界面的SOX2肿瘤起始干细胞通过上调Fads1产生花生四烯酸,增强中性粒细胞中的PGE信号,破坏干扰素反应,从而精细调控中性粒细胞可塑性并塑造保护性微环境 NA 探究肿瘤相关中性粒细胞不同细胞状态的出现、演化、分布及其对癌症免疫治疗疗效的影响机制 鳞状细胞癌中的肿瘤相关中性粒细胞和SOX2肿瘤起始干细胞 数字病理学, 机器学习 鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 基因操作 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
726 2026-09-20
Tumor-infiltrating bacteria disrupt cancer epithelial cell interactions and induce cell-cycle arrest
2026-Jan-12, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 本文揭示了肿瘤浸润细菌通过破坏上皮细胞相互作用诱导细胞周期停滞并导致化疗耐药的机制 首次结合空间成像和单细胞空间转录组学证明胞外肿瘤内细菌(如梭杆菌)在结直肠癌和口腔癌的肿瘤微环境中局部定位,并阐明其通过破坏上皮接触诱导G0-G1期停滞和转录静默,进而导致5-氟尿嘧啶耐药 研究主要基于相关性观察和体外实验,体内因果机制仍需进一步验证;患者队列样本量有限 探究肿瘤浸润细菌对癌症上皮细胞行为的影响及其在化疗耐药中的作用 结直肠癌和口腔癌肿瘤微环境中的胞外细菌及肿瘤上皮细胞 数字病理学, 空间转录组学 结直肠癌, 口腔癌 单细胞空间转录组学, 空间成像, 活细胞成像 NA 图像, 文本 52例结直肠癌患者队列及一个独立的直肠癌队列 NA 单细胞空间转录组学 NA NA
727 2026-09-20
The gain-of-function TREM2-T96K mutation increases risk for Alzheimer's disease by impairing microglial function
2026-01-07, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 本文研究了TREM2-T96K突变通过损害小胶质细胞功能增加阿尔茨海默病风险,并揭示了其性别依赖性效应 首次在全基因组测序数据中证明T96K增加阿尔茨海默病风险,并发现其通过影响小胶质细胞功能以性别依赖的方式发挥作用,类似于功能丧失突变R47H 研究主要基于小鼠模型和体外细胞培养,人类样本验证有限,且具体分子机制尚未完全阐明 探究TREM2-T96K突变在阿尔茨海默病中的作用及其对小胶质细胞功能的影响 家族性和病例对照样本、雌性5xFAD小鼠、人类小胶质细胞培养物 机器学习, 数字病理学 阿尔茨海默病 全基因组测序, 单细胞RNA测序 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序, 全基因组测序 NA NA
728 2026-09-20
Digital twins for in vivo metabolic flux estimations in patients with brain cancer
2026-Jan-06, Cell metabolism IF:27.7Q1
研究论文 本文开发了两种基于机器学习的框架,用于在脑癌患者体内进行代谢通量估计,包括数字孪生框架(DTF)和单细胞代谢通量分析框架(C-scMFA),并揭示了胶质瘤细胞的代谢异质性及治疗反应预测 首次将第一性原理化学计量和同位素模拟与卷积神经网络结合构建数字孪生框架,用于患者批量样本的通量估计;同时开发了结合单细胞RNA测序与13C同位素示踪的单细胞代谢通量分析框架,实现单细胞水平的通量定量 摘要中未明确提及研究限制 克服组织采样困难、肿瘤微环境异质性和非稳态条件等挑战,实现人类脑癌患者的体内代谢通量估计,并预测代谢抑制剂治疗反应 脑癌患者(胶质瘤)的批量样本和单细胞样本,以及脑癌小鼠模型 机器学习 脑癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、13C同位素示踪 卷积神经网络(CNN) 图像、文本(组学数据) NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
729 2026-09-20
scSuperAnnotator: a platform for benchmarking comparison and visualizing automated cellular annotation methods for scRNA-seq data
2026-Jan-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 开发了首个在线平台scSuperAnnotator,整合多种基于标记基因和基于参考的细胞类型注释方法,用于单细胞RNA-seq数据的自动化细胞注释、基准比较和可视化 首个整合多种基于标记基因和基于参考的细胞类型识别方法的在线平台,提供用户友好的界面,使研究人员无需编程即可完成一站式注释和分析,并提供现有注释方法的全面系统比较 摘要中未明确提及该平台的局限性 构建一个整合多种自动化细胞注释方法的在线平台,用于单细胞RNA-seq数据的细胞类型自动识别、基准比较和可视化,解决现有方法缺乏综合比较平台的问题 单细胞RNA-seq数据及其细胞类型注释方法 机器学习 NA 单细胞RNA-seq NA 文本 NA NA 单细胞RNA-seq NA 在线平台scSuperAnnotator,支持基于标记基因和基于参考的自动化细胞类型注释方法
730 2026-09-20
Characterize Oral-to-Blood Microbial DNA Translocation in Individuals with Cocaine Use Disorder
2026-Jan-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过对比可卡因使用障碍患者与健康对照的唾液和血浆微生物DNA,结合单细胞RNA测序,揭示了口腔至血液的微生物易位现象及其免疫激活作用 首次证明可卡因使用障碍个体存在口腔微生物失调和选择性的口腔至血液微生物易位,且易位而非可卡因本身促进免疫紊乱 样本量较小,仅10例CUD患者和24例对照,且为横断面研究,无法确定因果关系 确定口腔是否是当前可卡因使用障碍个体循环微生物DNA易位的来源 可卡因使用障碍患者(通过吸烟或吸入)和人口学匹配的非药物对照的唾液和血液样本 微生物组学 可卡因使用障碍 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序 NA 序列数据, 文本 10例CUD患者和24例对照的配对唾液和血液样本 Illumina, 10x Genomics 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序 Illumina MiSeq, 10x Chromium 16S rRNA V4区测序, 10x Chromium单细胞3'转录组
731 2026-09-20
Integration of in situ hybridization and scRNA-seq data provides a 2D topographical map of the developing retina across species
2026-Jan-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 结合多重原位杂交与单细胞转录组数据,构建跨物种发育视网膜的二维拓扑图谱 将多重原位杂交数据与scRNA-seq数据整合,创建发育视网膜细胞的定量二维图谱,并发现HAA原基中富集的新候选基因 摘要未明确说明 研究发育组织的空间分子组织逻辑,特别是视网膜沿背腹和鼻颞轴的区域特化 发育中的鸡、小鼠和人类视网膜 空间转录组学 NA 多重原位杂交,单细胞RNA测序 NA 图像,文本 NA NA single-cell RNA-seq, multiplexed in situ hybridization NA NA
732 2026-09-20
Radial-glia-to-astrocyte trans-differentiation and astrocyte transcriptional convergence are coordinated by CEH-43/DLX in C. elegans
2026-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该文章通过谱系限制性单细胞RNA测序,揭示了秀丽隐杆线虫CEPsh星形胶质细胞形成的两阶段程序,并发现转录因子CEH-43/DLX协调放射状胶质细胞向星形胶质细胞的转分化和转录汇聚 首次通过谱系限制性单细胞RNA测序揭示CEPsh星形胶质细胞形成的两阶段程序;发现CEH-43是协调放射状胶质细胞向星形胶质细胞转分化和转录汇聚的关键转录因子;证明CEH-43同源物DLX1/2在小鼠星形胶质细胞中表达,揭示进化保守性 研究主要基于秀丽隐杆线虫模型,虽然发现了与小鼠的保守性,但尚未在哺乳动物体内直接验证CEH-43/DLX在放射状胶质细胞向星形胶质细胞转化中的功能;单细胞RNA测序的细胞数量可能有限 揭示驱动放射状胶质细胞向星形胶质细胞汇聚转化的分子程序 秀丽隐杆线虫CEPsh星形胶质细胞及其祖细胞,以及小鼠星形胶质细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
733 2026-09-20
Single-cell profiling reveals lineage-specific fibroblast stromal subtypes drive ECM remodeling and immune modulation in the hepatocellular carcinoma tumor microenvironment
2026-Jan-03, Medical oncology (Northwood, London, England)
研究论文 通过对六个公共肝细胞癌单细胞RNA测序数据集进行整合分析,结合空间转录组和组织水平分析,鉴定出肝细胞癌肿瘤微环境中具有谱系特异性的成纤维细胞基质亚型,并验证COL1A1和COL3A1在细胞外基质重塑中的功能 首次系统性地在肝细胞癌中鉴定出八个ECM高表达基质细胞亚型和五个功能性成纤维细胞亚群,揭示了肌成纤维细胞和炎症性CAFs作为主要信号发送者,并通过siRNA敲低实验验证了COL1A1和COL3A1在促进肝细胞癌细胞增殖、迁移和集落形成中的作用 主要基于公共数据集的整合分析和体外细胞实验验证,缺乏体内动物模型实验和临床样本的直接验证 解析肝细胞癌肿瘤微环境中成纤维细胞的转录多样性及其在免疫调节和细胞外基质重塑中的作用 肝细胞癌肿瘤微环境中的基质细胞,特别是成纤维细胞亚群 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, siRNA敲低, RT-qPCR, Western blot NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像 六个公共肝细胞癌单细胞RNA测序数据集,以及HepG2和HepB3细胞系 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
734 2026-09-20
Loss of E3 ligase Ube4A Disrupts Colon Homeostasis and Accelerates Experimental Colitis via Altered Lipid Handling
2026-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该研究揭示了E3泛素连接酶Ube4A在结肠稳态中的重要作用,及其缺失通过改变脂质代谢加剧实验性结肠炎的机制 首次发现Ube4A是结肠稳态的调控因子,此前其在胃肠道中的生理功能未知;揭示了Ube4A缺失通过脂质转运和储存失调及上皮应激预致结肠对炎症的敏感性增加 研究主要基于小鼠模型和公共单细胞RNA测序数据,缺乏Ube4A调控结肠脂质代谢的具体分子机制解析,且未验证靶向Ube4A的治疗潜力 定义Ube4A在结肠中的功能,并确定其缺失如何影响实验性结肠炎的易感性 人结肠组织(健康个体和IBD患者)及Ube4A全局敲除小鼠 机器学习 炎症性肠病 单细胞RNA测序,转录组分析,免疫荧光,流式细胞术 NA 图像,文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
735 2026-09-20
Disruption of Pre-Bötzinger Complex neuropeptidergic tonality controls fear and metabolic response
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文揭示了脑干呼吸节律发生器preBötC作为应激响应枢纽,通过PACAP-PAC1R信号通路协调应激、呼吸与代谢适应 首次鉴定preBötC为连接应激反应与外周代谢调控的关键脑干枢纽,发现PAC1R阳性投射神经元通过PACAP信号调控棕色脂肪和肝脏代谢,揭示了神经肽能脑干-外周环路整合应激、呼吸与代谢的新机制 未明确说明preBötC神经元向棕色脂肪和肝脏投射的具体神经通路细节,PAC1R敲低后代谢重编程的分子机制尚需进一步验证,研究主要基于动物模型,临床转化价值有待评估 探究连接应激反应与外周代谢调控的中枢神经环路机制,特别是preBötC在应激诱导代谢适应中的作用 preBötC神经元、PAC1R阳性投射神经元、棕色脂肪组织、肝脏 神经科学 代谢疾病 病毒示踪、全脑c-Fos映射、空间转录组学、基因敲低 NA 图像、文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
736 2026-09-20
Tumor-infiltrating natural killer cell profiling for therapeutic stratification in patients with resectable non-small cell lung cancer
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序分析吸烟者与非吸烟者肺组织中的自然杀伤细胞亚群,发现两种NK细胞亚群与吸烟及COPD严重程度相关,并可指导可切除非小细胞肺癌患者的治疗分层 首次鉴定出两种与吸烟和COPD严重程度密切相关的肿瘤浸润NK细胞亚群(NKSR和NKAIR),并揭示其作为可切除NSCLC治疗分层生物标志物的潜力,即NKSR高预示手术获益,NKAIR高预示新辅助化免疫治疗获益 研究样本量相对有限,需要在更大队列中进一步验证;NK细胞亚群的具体分子机制尚未完全阐明;回顾性分析可能存在选择偏倚 识别与吸烟相关的免疫细胞决定因素,以指导可切除非小细胞肺癌患者的治疗策略选择 非吸烟者和吸烟者的肺组织、侵袭性肺腺癌组织、切除的NSCLC患者及接受新辅助化免疫治疗后手术的NSCLC患者 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA 图像,文本 61例肺组织(单细胞RNA测序),19例侵袭性肺腺癌(单细胞RNA测序),102例切除的NSCLC(批量RNA测序),24例接受新辅助化免疫治疗的NSCLC患者(批量RNA测序) NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
737 2026-09-20
Single cell RNA-sequencing reveals an association between testosterone treatment and reduced hormone signaling in the human mammary gland
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序比较了接受睾酮替代治疗的跨性别男性与顺性别女性的乳腺组织,发现睾酮治疗与乳腺激素信号通路下调相关 首次在人口统计学匹配的队列中,利用单细胞RNA测序技术揭示睾酮替代治疗对跨性别男性乳腺组织中激素受体阳性管腔上皮细胞雌激素信号通路基因表达的显著抑制作用,并实验验证了孕激素受体a/b表达的降低 样本量相对有限,未涉及长期随访数据,且研究对象仅为跨性别男性和顺性别女性,未包括其他人群 探究睾酮替代治疗对乳腺组织生物学的影响及其长期安全性 接受睾酮替代治疗的跨性别男性和人口统计学匹配的顺性别女性的乳腺组织 单细胞组学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
738 2026-09-20
SPP1+ macrophages polarized by lactate confer the progression of hypoxic adaptive tumor cells in brain
2026-Jan-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组图谱全面解析泛脑肿瘤微环境,揭示了缺氧适应性肿瘤细胞与SPP1+巨噬细胞之间的互作机制及其在脑肿瘤进展中的作用 首次构建泛脑肿瘤的单细胞RNA测序和空间转录组图谱,揭示了HIF-1信号介导的缺氧适应性赋予脑内肿瘤生长优势;发现了缺氧适应性肿瘤细胞通过LGALS1招募巨噬细胞并通过乳酸介导的组蛋白乳酸化诱导其向SPP1+亚群分化;阐明了SPP1直接激活肿瘤细胞MAPK信号促进肿瘤生长并抑制CD8+ T细胞杀伤活性;提出了靶向LDHA的司替戊醇与抗PD-1联合治疗脑肿瘤的新策略 摘要中未明确提及研究的具体局限性 全面研究泛脑肿瘤微环境,阐明脑恶性肿瘤(中枢神经系统原发和颅外转移)进展的潜在机制 泛脑肿瘤微环境,包括脑内转移瘤和间充质亚型胶质母细胞瘤,以及其中的肿瘤细胞和巨噬细胞 数字病理学 脑肿瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组, CRISPR/Cas9基因编辑, 流式细胞术, 免疫组织化学, 免疫荧光, 定量逆转录聚合酶链反应, 蛋白质印迹, 共免疫沉淀, DNA下拉实验, 染色质免疫沉淀 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
739 2026-09-20
The single-cell landscape of the human vein after arteriovenous fistula creation and implications for maturation failure
2026-Jan, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本研究通过组织学和多细胞转录组分析,揭示了人类动静脉内瘘(AVF)建立后静脉壁的细胞和分子变化,并阐明了AVF成熟失败的潜在机制 首次构建了AVF建立前后人类静脉的单细胞转录组图谱,揭示了AVF成熟失败的细胞和分子特征,并发现巨噬细胞来源的骨桥蛋白是驱动血管细胞活化的关键旁分泌信号 样本量相对有限(组织学23例,单细胞测序20例),且未进行功能验证实验来证实所发现的治疗靶点的有效性 探究AVF建立后静脉重塑的生物学机制以及AVF成熟失败的细胞和分子基础 接受血液透析的AVF患者,包括术前静脉、早期切除标本、成熟AVF和失败AVF 单细胞转录组学,数字病理学 心血管疾病,慢性肾脏病 单细胞RNA测序,组织学 NA 图像,文本 组织学分析23例患者,单细胞RNA测序分析20例患者的70,281个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
740 2026-09-20
Loss of Ribosomal Protein L22 (RPL22) Expression Identifies a Transcriptional Subset of MLH1-Deficient Endometrial Cancers With Lower Numbers of Tumor-Associated Lymphocytes
2026-Jan, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc IF:7.1Q1
研究论文 本研究开发了一种免疫组化检测方法,用于识别核糖体蛋白L22(RPL22)表达缺失的子宫内膜癌,并通过数字空间转录组学发现RPL22缺失的MLH1缺陷型子宫内膜癌具有免疫低表达特征 首次提供证据表明RPL22缺失是MLH1缺陷型子宫内膜癌中一个独特亚群的易于测量的指标,该亚群可被表征为免疫低表达型,且RPL22表达和肿瘤相关T淋巴细胞水平与肿瘤突变负荷或PD-L1表达无关 摘要中未明确提及研究局限性 探究RPL22突变在微卫星不稳定高型子宫内膜癌中的意义,特别是RPL22表达缺失与MLH1缺陷型子宫内膜癌免疫微环境的关系 子宫内膜癌(EC)患者样本及RPL22敲低的EC细胞系 数字病理学 子宫内膜癌 免疫组化(IHC)、数字空间转录组学 NA 图像、文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
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