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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7361 | 2026-04-17 |
From Immunobiology to Clinical Application: Tumor-Infiltrating Lymphocytes in Melanoma
2026-Mar-03, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm16030147
PMID:41893014
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综述 | 本文是一篇关于肿瘤浸润淋巴细胞在黑色素瘤中的生物学作用、预后预测价值以及基于TIL的过继细胞疗法应用的叙述性综述 | 系统性地整合了TIL生物学、预后标志物作用及TIL-ACT疗法在晚期黑色素瘤中的应用现状与未来方向,特别是在免疫检查点抑制剂失败后的治疗策略 | 作为一篇叙述性综述,其结论基于现有文献的综合分析,而非原始数据研究,可能存在发表偏倚 | 综述肿瘤浸润淋巴细胞在黑色素瘤免疫生物学中的作用及其向临床应用(特别是过继细胞疗法)的转化 | 黑色素瘤患者、肿瘤浸润淋巴细胞、基于TIL的过继细胞疗法 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、显微镜检查 | NA | 文本(文献数据) | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7362 | 2026-04-17 |
Single-cell and spatial transcriptome-based metabolism-immunity interaction network and therapeutic target discovery of matrine in cervical cancer
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04801-9
PMID:41283998
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研究论文 | 本研究通过整合TCGA数据库分析、单细胞测序和空间转录组技术,揭示了宫颈癌中代谢与免疫相互作用的分子机制,并探索了苦参碱的潜在治疗靶点 | 首次结合单细胞测序和空间转录组技术,系统性地构建了宫颈癌的代谢-免疫相互作用网络,并探索了天然产物苦参碱的多靶点抗肿瘤机制 | 苦参碱的具体作用机制尚未完全明确,体外实验和分子对接结果仅为初步验证,需要进一步的体内实验和临床研究证实 | 阐明宫颈癌的分子机制,评估苦参碱干预的潜力,为宫颈癌治疗提供新的研究方向和治疗靶点 | 宫颈癌组织、TCGA数据库中的宫颈癌数据、苦参碱 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序、空间转录组、生物信息学分析、分子对接、体外实验 | CIBERSORT算法、ESTIMATE算法 | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组 | NA | NA |
| 7363 | 2026-04-17 |
Integrative bioinformatics-machine learning-experimental validation identifies shared immunomodulatory targets in psoriasis and psoriatic arthritis and deciphers allicin's therapeutic mechanism
2026-Mar, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04777-6
PMID:41408482
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学、机器学习与实验验证,识别了银屑病和银屑病关节炎共有的免疫调节靶点,并揭示了蒜素(allicin)的治疗机制 | 整合了多组学数据、机器学习算法(随机森林和LASSO)、单细胞RNA测序分析以及反向药物筛选,首次系统性地识别了CXCL10、ISG15和IFI27作为银屑病和银屑病关节炎的共有免疫治疗靶点,并通过分子对接、动力学模拟和实验验证了蒜素通过抑制NF-κB信号通路调控这些靶点的治疗潜力 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据,实验验证部分可能受样本量和体外实验模型的限制,蒜素在体内的药效和安全性仍需进一步临床研究证实 | 识别银屑病和银屑病关节炎共有的免疫调节靶点,预测潜在治疗药物,并验证其作用机制 | 银屑病和银屑病关节炎患者的转录组数据、免疫相关基因、候选药物蒜素及其活性成分蒜素 | 生物信息学, 机器学习 | 银屑病, 银屑病关节炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接, 分子动力学模拟 | 随机森林, LASSO | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7364 | 2026-04-17 |
Multimodal bioinformatic analyses of genome-scale expression beyond gene-centric differential expression
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag152
PMID:41978384
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综述 | 本文综述了基因组规模基因表达分析的概念和方法学进展,超越传统的病例对照比较和基因中心差异表达分析 | 强调使用转录组和多模态组学数据阐明基因表达多样机制,包括基因共表达和调控网络推断、上下文特异性网络模型及机器学习方法 | 作为综述文章,未进行原始研究,主要总结现有进展,未提出具体实验验证 | 提高对先进网络分析的认识并鼓励其应用,以探索基因表达调控的多因素性质 | 基因组规模基因表达数据,包括转录组和多模态组学数据 | 生物信息学 | NA | 转录组学、多模态组学、单细胞转录组学、空间转录组学 | 机器学习方法、网络模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 7365 | 2026-04-17 |
Analysis of microsatellite instability intensity in single-cell resolution with scMnT reveals tumor heterogeneity in colorectal cancer
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag156
PMID:41978385
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研究论文 | 本研究开发了一种名为scMnT的生物信息学方法,用于在单细胞分辨率下识别微卫星不稳定(MSI)细胞并量化MSI强度,揭示了结直肠癌中MSI强度的异质性及其与免疫治疗反应的相关性 | 首次在单细胞水平上量化MSI强度,突破了传统二元分类的局限,揭示了MSI在肿瘤内的异质性连续谱 | 方法依赖于scRNA-seq数据的可用性,尚未在更大规模或更多癌种中进行验证 | 开发单细胞水平的MSI强度量化方法,探究MSI异质性在结直肠癌中的临床意义 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 生物信息学分析方法(scMnT) | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7366 | 2026-04-17 |
GDSim: accurate simulation for single-cell transcriptomes based on the guided diffusion model
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag163
PMID:41978379
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研究论文 | 本文提出了一种基于引导扩散模型的新型深度生成网络GDSim,用于准确模拟单细胞转录组数据 | 首次利用标签引导的扩散模型来捕获scRNA-seq数据中复杂的基因表达依赖关系,生成的模拟数据能紧密反映原始数据的真实分布 | 未在摘要中明确说明 | 解决单细胞RNA测序数据不足的问题,为下游分析提供高质量的模拟数据 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 深度生成网络,扩散模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7367 | 2026-04-17 |
Engineering and evaluation of precision-glycosylated clickable albumin nanoplatform for targeting the tumor microenvironment
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.123973
PMID:41355949
|
研究论文 | 本文开发了一种精确糖基化的可点击白蛋白纳米平台(CAN-DGIT),用于靶向肿瘤微环境,并结合空间转录组学评估纳米颗粒与TME的相互作用 | 通过精确控制糖基化程度和类型,实现了白蛋白纳米颗粒的可编程生物分布和细胞类型靶向,并创新性地整合PET成像与空间转录组学进行机制映射 | 研究仅在小鼠模型中进行,未涉及人类临床试验;糖基化类型和靶向机制的普适性需进一步验证 | 开发一种精确糖基化的纳米药物递送平台,以选择性靶向肿瘤微环境并评估其相互作用 | 白蛋白纳米颗粒、糖基化配体(甘露糖、半乳糖、葡萄糖)、4T1肿瘤小鼠模型 | 纳米医学 | 肿瘤 | 点击化学、MALDI-TOF质谱、UV-vis光谱、PET成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 健康小鼠和4T1肿瘤小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7368 | 2026-04-17 |
Identification and validation of SUMOylation-related key genes for osteoarthritis through integration of single-cell, bulk RNA sequencing and animal model experiments
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1779874
PMID:41987786
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和动物模型实验,识别并验证了与骨关节炎相关的SUMOylation关键基因 | 首次结合单细胞测序、批量测序和动物模型,系统识别了骨关节炎中SUMOylation相关的关键基因和细胞类型 | 样本量相对较小,动物模型仅使用大鼠,且未深入探讨关键基因的具体作用机制 | 检测和验证骨关节炎中SUMOylation相关基因的关键作用 | 骨关节炎患者样本和大鼠模型 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,差异表达分析,PPI网络,机器学习,ROC曲线,免疫浸润分析,药物预测 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 三个公共数据集(GSE51588, GSE55235, GSE152805)和大鼠模型(三个OA和三个假手术样本) | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 7369 | 2026-04-17 |
Hypoxic microenvironment in cancer: role in metabolic reprogramming
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1771365
PMID:41988136
|
综述 | 本文综述了肿瘤缺氧微环境如何通过代谢重编程驱动肿瘤进展和治疗抵抗 | 系统整合了单细胞多组学、空间转录组学等新兴技术证据,并讨论了靶向缺氧信号、血管生成通路和代谢酶等创新治疗策略 | NA | 阐明缺氧诱导的代谢重编程机制及其在肿瘤进展和治疗抵抗中的作用,并探讨利用缺氧相关代谢依赖性的精准肿瘤学策略 | 实体瘤及其缺氧微环境中的恶性细胞和基质细胞(包括癌症相关成纤维细胞、内皮细胞、肿瘤相关巨噬细胞和髓源性抑制细胞) | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞多组学,空间转录组学,代谢成像 | NA | NA | NA | NA | 单细胞多组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 7370 | 2026-04-17 |
From forest floor to doctor's office: the immunological journey of Borrelia burgdorferi through vertebrate hosts
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1811554
PMID:41988178
|
综述 | 本文综述了伯氏疏螺旋体在脊椎动物宿主中的免疫生物学进展,重点关注其通过免疫调节建立持续性感染的机制 | 采用阶段结构化框架整合了2020年后活体成像、单细胞转录组学、空间分析和系统免疫学等新技术带来的新见解 | NA | 理解伯氏疏螺旋体如何通过免疫调节在脊椎动物宿主中建立持续性感染,并为诊断、疫苗和治疗提供信息 | 伯氏疏螺旋体及其在脊椎动物宿主中的感染过程 | 自然语言处理 | 莱姆病 | 活体成像、单细胞转录组学、空间分析、系统免疫学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7371 | 2026-04-17 |
The mechanism of PKM2/HIF-1α axis polarizing TAMs by upregulating glucose-serine metabolism to promote melanoma progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1740155
PMID:41988200
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7372 | 2026-04-15 |
Bisphenol analogs affected hepatic development and disrupted lipid homeostasis in zebrafish larvae
2026-May-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2026.127929
PMID:41812818
|
研究论文 | 本研究通过暴露斑马鱼胚胎于BPA及其替代物BPAF和BPG,揭示了这些双酚类似物对肝脏发育和脂质稳态的干扰机制 | 首次系统比较了BPA、BPAF和BPG对斑马鱼幼虫肝脏发育和脂质代谢的影响,并利用10x单细胞RNA-Seq技术揭示了肝细胞中脂质积累和代谢通路的具体变化 | 研究仅基于斑马鱼模型,结果向人类外推需谨慎;暴露浓度设置可能未完全覆盖环境相关水平 | 探究双酚类似物对早期生命发育阶段肝脏发育和脂质稳态的影响机制 | 斑马鱼胚胎和幼虫 | 毒理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA-Seq, 脂质组学分析, 油红O染色 | NA | 基因表达数据, 脂质组数据, 图像数据 | 斑马鱼胚胎暴露于不同浓度双酚类似物(0.5, 50, 500 μg/L BPA/BPAF; 0.5, 50, 250 μg/L BPG) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞RNA-Seq分析系统 |
| 7373 | 2026-04-15 |
Novel insights into the mechanism of formaldehyde-induced lung cancer: a network toxicology and molecular docking approach
2026-May, Toxicology mechanisms and methods
IF:2.8Q2
DOI:10.1080/15376516.2026.2621747
PMID:41641566
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研究论文 | 本研究通过网络毒理学和分子对接技术,探讨了甲醛对肺癌的复杂影响,揭示了其分子机制 | 结合网络毒理学、分子对接和单细胞RNA测序数据分析,系统识别甲醛影响肺癌的关键靶点和通路,揭示了传统毒理学方法难以发现的复杂关系 | 研究主要基于数据库和计算模拟,缺乏实验验证,且样本来源和单细胞数据的具体细节未明确说明 | 探索甲醛诱导肺癌的分子机制,识别关键靶点和通路 | 甲醛与肺癌相关的靶点基因和蛋白质 | 生物信息学 | 肺癌 | 网络毒理学、分子对接、单细胞RNA测序数据分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7374 | 2026-04-15 |
Lumican-mediated fibroblast differentiation in skin fibrosis
2026-May, Matrix biology : journal of the International Society for Matrix Biology
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.matbio.2026.03.006
PMID:41912056
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,探讨了皮肤纤维化中Lumican介导的成纤维细胞分化机制 | 结合单细胞RNA测序与空间转录组学,系统比较了胎儿皮肤、成人皮肤和瘢痕疙瘩中成纤维细胞的基因表达谱和分化轨迹,并首次验证了Lumican作为成纤维细胞分化的关键调控因子 | 研究主要基于体外模型和动物模型,临床转化仍需进一步验证 | 探究从无瘢痕愈合到病理性纤维化的分子机制,并识别关键调控基因 | 胎儿皮肤、成人皮肤和瘢痕疙瘩组织中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 胎儿皮肤、成人皮肤和瘢痕疙瘩组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7375 | 2026-04-15 |
Molecular Markers Distinguishing Early-Stage Mycosis Fungoides From Atopic Dermatitis Skin Lesions
2026-Apr, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70240
PMID:41888970
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据,比较早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎皮肤病变的转录组特征,揭示了两者在免疫和基质细胞中的分子差异 | 首次在单细胞水平上系统比较早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎的转录组特征,识别了恶性T细胞、角质形成细胞、成纤维细胞和髓系细胞中的特异性分子标记 | 研究样本量可能有限,且仅聚焦于早期阶段,未涵盖疾病进展或治疗响应 | 区分早期蕈样肉芽肿与特应性皮炎皮肤病变,以改善诊断和治疗 | 早期蕈样肉芽肿和特应性皮炎患者的皮肤病变样本 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7376 | 2026-04-15 |
Ubiquitin-specific protease 20(USP20) mitigates doxorubicin-induced cardiotoxicity by deubiquitinating and stabilizing HuR
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151642
PMID:41921794
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研究论文 | 本研究揭示了泛素特异性蛋白酶20(USP20)通过去泛素化并稳定HuR蛋白,从而抑制铁死亡并减轻阿霉素诱导的心肌病 | 首次阐明了USP20在阿霉素诱导心肌病中的保护作用机制,并发现其通过去泛素化HuR来稳定GPX4 mRNA以抑制铁死亡 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床样本中得到验证 | 探究USP20在阿霉素诱导心肌病中的作用机制 | 心肌细胞、小鼠心脏组织 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、LC-MS/MS、免疫共沉淀 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7377 | 2026-04-15 |
CEP170 as a novel molecular link between centrosomal function and cerebral cortical development
2026-Mar-26, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-026-01236-z
PMID:41888776
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研究论文 | 本研究揭示了CEP170作为中心体功能与大脑皮层发育之间的关键分子连接,通过调控神经祖细胞增殖和神经元迁移影响皮层结构 | 首次将CEP170蛋白与大脑皮层发育直接关联,并阐明其通过中心体-微管相互作用调控神经发育的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类大脑发育中的直接证据仍需进一步验证 | 探究CEP170在皮层发育中的功能及其分子机制 | 小鼠胚胎皮层、人类发育中皮层、CEP170基因敲除细胞 | 神经发育生物学 | 神经发育障碍 | Western blotting, qPCR, scRNA-seq, 空间转录组学, 子宫内电穿孔, CRISPR/Cas9基因编辑, 流式细胞术, 微管再生实验, 免疫荧光显微镜, 共免疫沉淀 | 基因敲低/敲除模型 | 蛋白质表达数据, 转录组数据, 图像数据 | 未明确具体样本数量,涉及小鼠胚胎皮层组织、人类皮层样本及基因编辑细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7378 | 2026-04-15 |
MeNADP-ME3 Confers Salt and Drought Tolerance in Arabidopsis and Drives Functional Diversification of the NADP-ME Family in Cassava
2026-Mar-20, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48030331
PMID:41899482
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研究论文 | 本研究通过鉴定木薯中的MeNADP-ME基因家族,揭示了其在C3-C4中间型植物中的进化轨迹和功能,特别是MeNADP-ME3在增强抗氧化酶活性和减少氧化损伤方面的作用,为开发抗逆木薯品种提供了遗传资源 | 首次在C3-C4中间型植物木薯中系统研究NADP-ME基因家族,结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq分析基因表达模式,并验证MeNADP-ME3在盐和干旱胁迫下的功能,揭示了其在光合碳代谢和光呼吸调控中的潜在作用 | 研究主要基于基因表达和功能验证,缺乏对MeNADP-ME3具体分子机制的深入探讨,且样本规模有限,未来需扩大实验验证范围 | 探究木薯中NADP-ME基因家族的进化、表达模式及其在环境适应和胁迫响应中的功能,以开发抗逆木薯品种 | 木薯(Manihot esculenta Crantz)中的MeNADP-ME基因家族,特别是MeNADP-ME3基因 | 植物分子生物学 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, 共聚焦成像, 蛋白质-蛋白质相互作用预测 | NA | 基因序列数据, 表达谱数据, 图像数据 | 未明确指定样本数量,但涉及木薯不同组织和细胞亚群的分析 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7379 | 2026-04-15 |
Establishing Area-Specific Brain Organoids Through Transcription Factor-Mediated Patterning
2026-Mar-19, Biology
DOI:10.3390/biology15060488
PMID:41892247
|
研究论文 | 本研究通过转录因子介导的模式化方法,建立了一个具有特定区域特性的大脑类器官平台 | 通过重新分析体内人类皮层转录组数据集,识别出调控区域特异性的候选转录因子,并利用其可诱导过表达,在人类大脑类器官生成过程中实现了对前部和后部皮层特性的可控模拟 | 当前的人类大脑类器官模型仍不完全重现皮层区域多样性,且研究依赖于特定转录因子的过表达,可能无法完全模拟体内复杂的调控网络 | 研究人类大脑皮层区域特异性分化的机制,并建立一个可扩展、可重复的平台来研究人类皮层区域化及神经发育和神经系统疾病的区域特异性机制 | 人类大脑类器官 | 发育生物学与神经科学 | 神经发育障碍与神经系统疾病 | 单细胞RNA测序、钙成像 | NA | 转录组数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7380 | 2026-04-15 |
The Structure, Classification, Functional Diversity and Regulatory Mechanism of Plant C2H2 Transcription Factors
2026-Mar-14, Biology
DOI:10.3390/biology15060471
PMID:41892231
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综述 | 本文全面综述了植物C2H2型锌指转录因子的结构、分类、功能多样性及其调控机制 | 整合了从低等植物到被子植物的进化动态分析,并详细阐述了C2H2转录因子在花器官形态发生、花粉育性维持、开花时间调控以及生物与非生物胁迫响应中的分子网络 | 当前研究存在功能冗余、假基因化现象以及细胞类型特异性调控等方面的知识空白 | 深入理解植物C2H2转录因子家族的调控网络及相关功能,为作物抗逆育种和品质改良提供参考 | 植物C2H2型锌指转录因子家族 | 生物信息学 | NA | 生物信息学分析 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞测序,多组学整合 | NA | NA |