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当前共找到 9441 篇文献,本页显示第 7181 - 7200 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
7181 2026-04-24
Insights from pooled CRISPRi single-cell screens in K562 cells reveal gene functions, regulatory networks, and highlight opportunities and limitations
2026-Mar-13, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本研究利用改良的CRISPRi单细胞筛选技术在K562细胞中敲低六个转录因子,重建基因调控网络并评估技术潜力与局限性 优化CROP-seq方案实现sgRNA高效捕获,无需单独富集步骤,并揭示如LMO2-GATA2等新调控相互作用 仅约40-50%靶基因实现有效敲低,扰动效率存在实验间差异,需进一步优化标准化 评估联合CRISPRi和单细胞RNA测序的筛选技术在基因功能解析和调控网络重建中的潜力与局限性 K562细胞系中的六个转录因子(LMO2、TCF3、LDB1、MYB、GATA2、RUNX1) 功能性基因组学 NA CRISPRi、单细胞RNA测序、CROP-seq NA 单细胞RNA测序数据 K562细胞系,具体样本数未提及 NA 单细胞RNA测序 CROP-seq 改良CRISPR droplet sequencing (CROP-seq) 方案,从cDNA文库直接捕获sgRNA
7182 2026-04-24
The MDM2-p53 Axis in Osteosarcoma: Current Understanding of Regulatory Mechanisms and Targeted Therapeutic Strategies
2026-Mar-13, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
综述 系统阐述骨肉瘤中MDM2-p53通路的分子机制及靶向治疗策略 综述了新兴MDM2抑制剂(如APG-115)进入II期临床试验的突破进展,并引入单细胞测序和AI辅助药物设计加速开发 多数药物尚未在骨肉瘤专用队列中验证,早期抑制剂存在疗效有限与剂量限制性毒性 阐明MDM2-p53通路调控机制并总结靶向治疗策略 骨肉瘤患者及MDM2-p53通路相关分子机制 机器学习 骨肉瘤 NA NA NA NA NA NA NA NA
7183 2026-04-24
Iron and Copper Homeostasis in Cardiometabolic Disease: Therapeutic Potential of Chelators
2026-Mar-09, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
综述 本文综述了铁和铜稳态失衡在心代谢疾病中的作用,重点阐述了铁死亡和铜死亡两种细胞死亡形式,并探讨了金属螯合剂在治疗中的潜力 整合了单细胞转录组学、脂质组学和金属组学与机器学习衍生的基因特征,揭示了铁-铜轴的统一分子机制及其作为治疗靶点的可行性 翻译受限于生物标志物变异性、系统性安全性问题以及缺乏大型前瞻性临床试验 探讨铁和铜稳态在心代谢疾病中的机制,并评估金属螯合剂的治疗潜力 冠状动脉疾病、心肌梗死、心力衰竭、动脉粥样硬化和糖尿病并发症等心代谢疾病 机器学习 心血管疾病 单细胞转录组学、脂质组学、金属组学 机器学习衍生的基因签名 文本 不适用 NA NA NA NA
7184 2026-04-24
AI-based phenotyping of hepatic fiber morphology to inform molecular alterations in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2026-Mar-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 通过AI量化肝纤维形态表型,揭示代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)的分子改变 首次利用人工智能算法FibroNest定量分析MASLD肝活检中的纤维形态表型,并结合多组学分析(转录组、空间单细胞转录组)揭示纤维形态与分子改变的关联 样本量较小(94例肝活检),且仅12例合并肝细胞癌,可能限制发现的普遍性 全面表征MASLD中肝纤维形态表型及其相关的分子改变,探索纤维形态对疾病进展和潜在机制的指示作用 94例MASLD患者的肝活检样本(其中12例合并肝细胞癌) 计算机视觉、机器学习、数字病理 代谢功能障碍相关脂肪性肝病、肝细胞癌 转录组测序、空间单细胞转录组 FibroNest算法 图像、转录组数据、空间基因表达数据 94例MASLD患者肝活检样本,其中12例合并肝细胞癌 PharmaNest, CosMx 数字病理、空间转录组学 FibroNest, CosMx FibroNest用于肝纤维形态量化,CosMx用于空间单细胞转录组分析
7185 2026-04-24
Spatial multi-omics unveils the monoclonal origin, neuroendocrine plasticity, and microenvironment niches in combined small cell lung cancer
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过空间多组学揭示了联合性小细胞肺癌的单克隆起源、神经内分泌可塑性和微环境生态位 首次对联合性小细胞肺癌进行空间全外显子测序、空间转录组学和单核RNA测序的多组学分析,发现其单克隆起源和神经内分泌可塑性,并开发了基于突变的诊断检测方法 未明确说明,但从研究设计推断可能受限于样本量(19例)和单一肿瘤类型 探究联合性小细胞肺癌的分子特征、谱系可塑性和肿瘤微环境 联合性小细胞肺癌患者肿瘤组织 数字病理学 肺癌 空间全外显子测序、空间转录组学、单核RNA测序 NA 基因表达、突变、拷贝数变异数据 19 例未经治疗的联合性小细胞肺癌肿瘤 Illumina, 10x Genomics 空间转录组学, 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq, 10x Visium, 10x Chromium 10x Visium 用于空间转录组学, 10x Chromium 用于单核RNA测序
7186 2026-04-24
Pre-B-cell leukemia transcription factor 1 contributes to liver fibrosis by enabling IL-7 signaling in HSC
2026-Feb-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究揭示了Pre-B细胞白血病转录因子1(PBX1)在肝星状细胞(HSC)激活中的作用,并通过IL-7信号通路促进肝纤维化 首次发现PBX1通过Notch3介导的转录上调在HSC激活中起关键作用,并揭示IL-7受体(IL7R)与TGF-β受体相互作用促进纤维化的新机制 未明确提及研究局限性,但可能包括动物模型与人类疾病的差异、样本量限制或未深入探讨其他信号通路的交互作用 探究PBX1在肝星状细胞激活及肝纤维化中的分子机制 肝星状细胞(HSC)、小鼠肝纤维化模型、肝硬化患者样本 数字病理学 肝纤维化 单细胞RNA测序、报告基因检测、染色质免疫沉淀、整合转录组分析 NA 单细胞RNA测序数据、转录组数据 小鼠模型及肝硬化患者样本(具体数量未提供) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
7187 2026-04-24
Mesenchymal Stem Cell-Derived Extracellular Vesicles Modulate the Course of Peritoneal Inflammation Through Metabolic and Epigenetic Regulation
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 揭示乳酸积累通过组蛋白H3K18乳酰化促进腹膜纤维化的代谢-表观遗传机制,并证明间充质干细胞来源细胞外囊泡可通过调控该通路改善腹膜损伤 首次发现乳酸诱导的组蛋白乳酰化在腹膜纤维化中的关键作用,并揭示间充质干细胞来源细胞外囊泡通过代谢-表观遗传调控抑制巨噬细胞招募的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化仍需进一步验证;未探讨其他可能参与纤维化的代谢通路或细胞类型 阐明腹膜纤维化的代谢-表观遗传机制并评估间充质干细胞来源细胞外囊泡的治疗潜力 人骨髓间充质干细胞来源细胞外囊泡、小鼠腹膜纤维化模型、腹膜间皮细胞 机器学习 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠腹膜纤维化模型(使用氯己定葡萄糖酸盐或腹膜透析液诱导) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'测序
7188 2026-04-24
Optimized Retinal Cell Dissociation for Downstream Analysis of Cone Photoreceptors
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 开发了一种优化的视网膜细胞解离方案,用于下游锥体感光细胞的分子分析 提出了一种改进的视网膜细胞解离方法,使用木瓜蛋白酶消化、机械解离和过滤,提高了锥体感光细胞的活性和质量 未提及具体限制,但可能包括解离效率对不同视网膜细胞类型的差异及对脆弱细胞的潜在影响 开发一种可靠高效的视网膜细胞解离方法,以改善锥体感光细胞的下游分子分析 视网膜细胞,特别是锥体感光细胞 数字病理学 视网膜退行性疾病 单细胞测序、转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
7189 2026-04-24
FUNCellA: A Tool for Single-Sample Enrichment Analysis and Relative Pathway Activity Estimation in Single-Cell RNA Sequencing Data
2026, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
研究论文 提出FUNCellA工具,用于单细胞RNA测序数据的单样本富集分析和相对通路活性评估 整合7种单样本富集算法与新颖的相对激活阈值方法,利用无监督工具(k-means和高斯混合模型)进行单通路活性向量聚类,实现细胞亚群功能分类 未提及具体局限性 开发一种针对单细胞RNA测序数据的相对通路活性评分框架,解决数据稀疏性和噪声问题,并支持单通路活性向量聚类以发现亚群 单细胞RNA测序数据(包括真实和模拟数据)以及批量RNA测序和微阵列转录组数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、批量RNA测序(bulk RNA-Seq)、微阵列 k-means、高斯混合模型 基因表达数据 单细胞RNA测序数据集(真实和模拟)、批量RNA测序和微阵列转录组数据 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
7190 2026-04-24
Osteopontin-expressing valvular interstitial cell subpopulation as a driver of extracellular matrix remodeling in aortic valve disease
2026, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2
研究论文 通过生物信息学再分析公开的单细胞RNA测序数据,鉴定出骨桥蛋白表达阳性的瓣膜间质细胞亚群,该亚群通过细胞外基质重塑驱动主动脉瓣疾病进展 首次在主动脉瓣疾病中鉴定出Spp1+瓣膜间质细胞亚群,并揭示其通过细胞外基质重构参与早期瓣膜硬化的分子机制 研究基于公开数据集的小鼠模型再分析,缺乏人类样本验证和功能实验 探究主动脉瓣疾病中致病性瓣膜间质细胞亚群及其细胞间通讯网络 Apoe-/-和Ldlr-/-小鼠主动脉瓣组织的单细胞转录组数据 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
7191 2026-04-24
From genes to clinical application: a circulating four-gene signature for early diagnosis model of refractory Mycoplasma pneumoniae pneumonia
2026, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1
研究论文 基于外周血单个核细胞中四个基因标志物建立难治性肺炎支原体肺炎早期诊断模型 首次结合单细胞RNA测序与RT-qPCR筛选出四个特异性上调基因(IGHM, NEAT1, IL32, ACTG1)并构建三分类逻辑回归模型,实现难治性肺炎支原体肺炎的早期鉴别诊断 研究样本量相对有限,外部验证队列仅54例,且模型基于单一中心数据,可能影响泛化性 识别难治性肺炎支原体肺炎的早期诊断生物标志物并构建诊断模型 儿童外周血单个核细胞 机器学习 肺炎支原体肺炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RT-qPCR 多项逻辑回归模型 基因表达数据 349名儿童(117名健康对照,123名普通MPP,109名RMPP),其中8名用于scRNA-seq发现队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7192 2026-04-24
Integrated profiling of RUNX3 in intratumoral NK cells activity through bulk and single-cell transcriptomic analysis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整体和单细胞转录组分析,探究RUNX3在肿瘤内NK细胞活性中的综合作用 首次揭示RUNX3在肿瘤微环境中对NK细胞功能的调控作用,并利用单细胞RNA测序分析其表达与分化的关系 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内模型验证,且样本量有限 阐明RUNX3在NK细胞介导的抗肿瘤免疫中的生物学作用 RUNX3基因、NK细胞、肿瘤微环境 机器学习 肺癌, 肝癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 使用TCGA数据库的泛癌样本,具体数量未明确 NA 单细胞RNA测序, 整体RNA测序 NA NA
7193 2026-04-24
Single cell transcriptomics reveals dendritic cell subsets in bovine afferent lymph and immune cell-resolved responses to BCG vaccination
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序技术揭示牛传入淋巴树突状细胞亚群及其对BCG疫苗接种的免疫细胞响应 首次在牛模型中通过单细胞转录组学系统解析传入淋巴树突状细胞(ALDC)的亚群(cDC1和cDC2)及其对BCG疫苗接种的差异化响应,揭示了亚群特异性基因功能 样本量较小(3头牛),且仅关注皮肤引流淋巴结的ALDCs,未涉及其他组织或长期免疫应答 探究BCG疫苗接种后牛树突状细胞亚群的转录组变化及其在抗结核免疫中的作用 牛传入淋巴树突状细胞(ALDCs)及其他免疫细胞(单核细胞、T细胞、B细胞、NK细胞) 单细胞转录组学 肺结核 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 3头牛,共20,761个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
7194 2026-04-24
Integrating bulk, single-cell, and spatial transcriptomics to identify a novel pyroptosis-related gene signature for predicting prognosis and tumor immune landscape in triple-negative breast cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合批量、单细胞和空间转录组学数据,构建一种新的焦亡相关基因特征,用于预测三阴性乳腺癌的预后和肿瘤免疫景观 首次结合多组学数据(批量RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学)全面识别三阴性乳腺癌中的焦亡相关基因,并构建预后特征,揭示了这些基因在肿瘤免疫微环境中的细胞和空间异质性 未提及 开发一种可靠的焦亡相关基因预后特征,用于预测三阴性乳腺癌的预后和免疫景观 三阴性乳腺癌患者 机器学习 乳腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化 LASSO算法 转录组数据, 基因表达数据, 空间转录组数据, 图像数据 48个临床三阴性乳腺癌样本 Illumina 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 Illumina NovaSeq TCGA和GEO数据库中的转录组数据,单细胞RNA测序和空间转录组学平台未明确指定
7195 2026-04-24
Acylation modification mediated post-translational modifications learning signature reveals ZDHHC18 promotes progression of lung adenocarcinoma by attenuating immunocyte activation
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该研究构建了酰化修饰(AM)学习签名AM.score,并发现ZDHHC18通过减弱免疫细胞激活促进肺腺癌进展 首次整合12种酰化修饰类型,利用多组学共识聚类和机器学习建立跨癌种免疫治疗预测评分系统,并验证ZDHHC18作为关键分子靶点的作用 具体机制尚未完全阐明,且需更多独立队列验证AM.score的临床适用性 探索酰化修饰相关的新型治疗途径,为肺腺癌精准治疗提供预测生物标志物 肺腺癌患者及免疫治疗队列,包括1720名患者和8个验证队列 机器学习 肺腺癌 多组学共识聚类、机器学习、单细胞RNA测序、空间转录组学 AM.score学习签名(基于机器学习算法) 转录组数据、多组学数据、免疫治疗响应数据 1720名肺腺癌患者(主队列)及8个独立队列 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
7196 2026-04-24
Interferon regulatory factors: the next prospective targets for tissue ischemia-reperfusion injury?
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 系统阐述干扰素调节因子(IRFs)在多系统和器官组织缺血再灌注损伤中的调控机制与研究进展,并提出了“动态调控网络”和“器官-IRF轴”两个创新理论框架 首次提出“动态调控网络”和“器官-IRF轴”两个理论框架,揭示了IRFs功能异质性的分子基础,并前瞻性地提出整合单细胞测序、类器官模型和人工智能预测的未来研究方向 IRFs的潜在调控机制仍需进一步研究和阐明,且存在转化瓶颈的挑战 系统阐述IRFs及其相关通路在组织缺血再灌注损伤中的调控机制和研究进展,从病理生理学和分子生物学角度提供理论基础 干扰素调节因子(IRFs)家族及其在心血管系统、中枢神经系统、肾脏、肝脏和肠道等器官中的生物学功能 自然语言处理 心血管疾病 NA NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
7197 2026-04-24
Integrative analysis of transcriptomics, single-cell RNA sequencing, and GraphBAN identifies de novo lipogenesis-associated genes and their potential roles in diabetic retinopathy
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合转录组学、单细胞RNA测序和GraphBAN模型,识别了与新生脂肪生成相关的基因及其在糖尿病视网膜病变中的潜在作用 首次结合GraphBAN模型预测基因与化合物相互作用,并在单细胞水平上解析了DC2和经典单核细胞在DR相关通路中的转录活性 该研究为探索性研究,初步发现需进一步验证,且样本量可能有限 识别与新生脂肪生成和糖尿病视网膜病变相关的特征基因,并探索其在疾病发病机制中的作用 糖尿病视网膜病变患者和对照组的血液样本及公开数据库中的转录组和单细胞数据 计算机视觉 糖尿病视网膜病变 RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接 GraphBAN 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 糖尿病视网膜病变患者与对照组血液样本(具体数量未说明) NA 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA NA
7198 2026-04-23
Spatiotemporally programming the immune-osteogenic cascade with a dual-immunomodulatory scaffold for functional bone regeneration
2026-Sep, Bioactive materials IF:18.0Q1
研究论文 本文提出了一种双免疫调节骨支架(DIBS),通过顺序调节巨噬细胞和间充质干细胞的免疫功能,以修复临界尺寸骨缺损 创新点在于开发了一种双免疫调节支架,不仅调控巨噬细胞表型转换,还激活归巢间充质干细胞的免疫调节功能,通过CCL2/CCR2信号轴促进血管生成和成骨分化 NA 研究目的是通过免疫-成骨级联调控,实现功能性骨再生 研究对象为临界尺寸骨缺损的修复过程,涉及巨噬细胞和间充质干细胞 数字病理学 骨科疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
7199 2026-04-23
Ion channel/Stat6-driven nano-immune programming of tissue-resident macrophages by amide-functionalized nanocellulose
2026-Aug, Bioactive materials IF:18.0Q1
研究论文 本研究通过多组学分析,探讨了酰胺功能化纳米纤维素对组织驻留巨噬细胞的免疫重编程机制 揭示了酰胺功能化纳米纤维素通过激活电压门控离子通道和Stat6信号通路,促进M2巨噬细胞极化,而不引发适应性免疫反应 研究仅基于14天亚急性窗口和28天脾细胞分析,长期效应和具体分子机制需进一步验证 阐明纳米纤维素表面化学介导的免疫重编程机制 原始纤维素纳米晶体和酰胺功能化纤维素纳米晶体 纳米生物材料 NA scRNA-Seq, bulk RNA-Seq, 药理学抑制, 组织学分析 NA 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 组织学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
7200 2026-04-23
ELK1/NOL3/GRP78 axis regulates proliferation and stemness in TP53-mutant colon cancer by enhancing adaptive endoplasmic reticulum stress
2026-Jun, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
研究论文 本文研究了ELK1/NOL3/GRP78轴在TP53突变结肠癌中通过增强适应性内质网应激来调控增殖和干细胞特性的机制 揭示了TP53突变肿瘤干细胞中内质网应激与线粒体代谢途径的同步激活,并首次将ELK1/NOL3/GRP78轴鉴定为驱动适应性内质网应激和干细胞特性的上游调控因子 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证有限,且未探讨该轴在其他癌症类型中的普适性 探究TP53突变结肠癌中适应性内质网应激的上游调控机制及其对肿瘤进展的影响 TP53突变与野生型结肠癌细胞系(SW480、HT-29、HCT116)及TCGA-COAD和GEO队列的临床数据 癌症生物学 结肠癌 单细胞RNA测序、DESeq2、LASSO回归、CCK-8、集落形成、微球形成、异种移植、双荧光素酶报告基因、免疫共沉淀、Western blot NA 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据、临床数据 TCGA-COAD和GEO队列的结肠癌样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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