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当前共找到 9342 篇文献，本页显示第 701 - 720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2026-09-20 |
Multi-scale spatial testing recovers gene programs missed by existing detection methods
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711372
PMID:41890107
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研究论文 | 本文提出FlashS方法，通过在频域中重新构建基于核的空间检验，实现多尺度空间表达模式检测，并在多个数据集上验证其性能 | 将基于核的空间检验重新构建在频域中，能够检测任意多尺度表达模式，并可扩展至数百万细胞 | 摘要中未明确提及 | 识别空间可变基因，检测现有多尺度空间表达模式 | 空间转录组学数据，包括人类心脏组织和50个基准数据集 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | 基于核的空间检验，频域方法 | 基因表达空间数据 | 人类心脏组织样本（具体数量未提及），50个基准数据集，艾伦脑MERFISH图谱（394万细胞） | 10x Genomics, NanoString, 等（9个平台，具体未列出） | 空间转录组学, MERFISH | NA | NA |
| 702 | 2026-09-20 |
Depletion of Fibrinogen Suppresses Growth of Primary Tumors and Metastasis of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2026-Apr, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.09.024
PMID:41432649
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研究论文 | 该研究通过耗竭纤维蛋白原，探究其对胰腺导管腺癌原发肿瘤生长和转移的影响及相关机制 | 首次在多个PDAC患者来源异种移植模型中，使用正在临床测试的反义寡核苷酸或含siRNA的脂质纳米颗粒技术平台耗竭纤维蛋白原，并结合蛋白质组学和空间转录组学揭示其通过重塑肿瘤微环境促进肿瘤生长和早期转移的新机制 | 研究仅使用了3个PDAC患者来源异种移植模型，样本量较小；未在人体临床试验中验证纤维蛋白原耗竭疗法的安全性和有效性 | 探究纤维蛋白原耗竭对胰腺导管腺癌原发肿瘤生长和转移的影响及其分子机制 | 胰腺导管腺癌患者来源异种移植小鼠模型 | 数字病理学, 机器学习 | 胰腺癌 | 反义寡核苷酸, 小干扰RNA脂质纳米颗粒, 蛋白质组学, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 3个PDAC患者来源异种移植模型 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于分析肿瘤微环境中的基质成分变化 |
| 703 | 2026-09-20 |
Species-specific roles of SP1 in bovine and human embryonic genome activation and early embryonic development
2026-Mar-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2526998123
PMID:41849396
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研究论文 | 该研究通过牛胚胎单细胞RNA测序揭示主要EGA在8细胞期卵裂球间异步启动，并比较牛与人类胚胎中SP1在EGA和早期发育中的物种特异性作用 | 首次揭示牛胚胎主要EGA在8细胞期卵裂球间异步启动；发现EGA过程中蛋白质积累与转录及翻译激活存在差异；阐明SP1在牛和人类胚胎EGA中的保守及物种特异性功能 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 揭示胚胎基因组激活（EGA）的分子特征及调控该过程的转录因子，并探究SP1在牛和人类早期胚胎发育中的作用 | 牛胚胎和人类胚胎 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq、多组学分析 | NA | 文本、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 704 | 2026-09-20 |
Type 2 lymphocytes restrict type 3 lymphocytes during liver fibrosis and colocalize in fibroblast niches
2026-Mar-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea6805
PMID:41811951
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研究论文 | 该研究通过小鼠肝损伤和纤维化模型、三维显微镜和空间转录组学，发现2型淋巴细胞（主要是ILC2）与3型淋巴细胞及成纤维细胞生态位空间共定位，并相互制约调节肝纤维化 | 揭示了2型淋巴细胞和3型淋巴细胞在肝纤维化中的空间关联和相互制约作用，以及它们与成纤维细胞生态位的共定位 | 研究主要基于小鼠模型，人类肝脏疾病的适用性需要进一步验证 | 探究2型淋巴细胞和3型淋巴细胞的空间定位如何影响肝脏修复或病理性纤维化 | 小鼠肝脏中的2型淋巴细胞（包括ILC2）、3型淋巴细胞（包括γδ T细胞）、成纤维细胞和肌成纤维细胞 | 空间转录组学 | 肝纤维化 | 空间转录组学, 三维显微镜 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 705 | 2026-09-20 |
scDEcrypter: Uncertainty-aware differential expression analysis for viral infection in scRNA-seq
2026-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.09.710583
PMID:41959296
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研究论文 | 本文提出了 scDEcrypter，一种带惩罚的双向混合模型，利用部分标签进行病毒感染单细胞RNA测序数据的差异表达分析 | 提出了带惩罚的双向混合模型，利用感染状态和细胞类型等变量的部分标签，并采用数据拆分策略避免double-dipping，实现快速、基于似然的差异表达推断 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 解决病毒感染单细胞RNA测序研究中病毒reads稀疏、感染细胞标签不足以及旁观者反应干扰差异表达分析的问题 | 病毒感染单细胞RNA测序数据中的感染细胞状态及感染相关基因 | 机器学习 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 带惩罚的双向混合模型 | 文本 | 两个不同的病毒感染数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 706 | 2026-09-20 |
Single-cell and spatial profiling highlights TB-induced myofibroblasts as drivers of lung pathology
2026-03-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20251067
PMID:41489684
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析结核感染与阴性个体的肺组织，揭示了TB诱导的肌成纤维细胞在肺病理中的驱动作用 | 首次识别出MMP1+CXCL5+成纤维细胞亚群，表达肌成纤维细胞样基因签名，并与严重疾病和更高细菌载量相关；通过网络分析揭示了该成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞在肉芽肿袖套中的相互作用 | 摘要中未提及研究限制 | 定义人类结核免疫病理的细胞驱动因素，并寻找新型结核治疗的潜在靶点 | 结核感染和结核阴性个体的肺组织 | 数字病理学 | 肺结核 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学, 流式细胞术 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 707 | 2026-09-20 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals cellular and molecular changes in EGFR-positive lung adenocarcinoma before and after Furmonertinib treatment
2026-03, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01706-y
PMID:41307822
|
研究论文 | 通过对EGFR阳性肺腺癌患者Furmonertinib治疗前后肿瘤及配对癌旁组织进行单细胞RNA测序，揭示肿瘤微环境重塑、转录组适应及细胞间通讯网络重编程 | 首次系统整合公开和自有数据集，对EGFR阳性肺腺癌患者在Furmonertinib治疗前后的肿瘤及配对癌旁组织进行单细胞转录组分析，揭示了肿瘤微环境重塑、转录组重编程及细胞间通讯网络变化 | 摘要中未明确说明样本量及具体研究局限性 | 阐明EGFR阳性肺腺癌患者对Furmonertinib响应和适应的细胞及分子机制，特别是肿瘤微环境的变化 | EGFR阳性肺腺癌患者治疗前后的肿瘤组织及配对癌旁组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 708 | 2026-09-20 |
Spatial transcriptomics in the human left atrial appendage and pulmonary vein sleeve
2026 Mar-Apr, Cardiovascular pathology : the official journal of the Society for Cardiovascular Pathology
IF:2.3Q2
DOI:10.1016/j.carpath.2025.107802
PMID:41314481
|
研究论文 | 该研究利用空间转录组学技术分析了人类左心耳和肺静脉袖套组织，以探究心房颤动（AF）相关基因的空间表达模式 | 首次对人类肺静脉和左心耳组织进行空间转录组学研究，克服了获取PV组织的挑战，并揭示了AF相关基因如SHOX2在PV中的潜在重要性 | 样本来源于未使用的移植供体，可能无法完全代表AF患者的病理状态；每个55微米直径空间区域可能包含多种细胞，分辨率有限 | 通过空间转录组学揭示人类肺静脉和左心耳组织的细胞类型分布和空间区域特征，以及AF相关基因的空间表达 | 人类肺静脉（PV）和左心耳（LAA）组织 | 空间转录组学 | 心房颤动 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 来自未使用移植供体的人类PV和LAA组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 709 | 2025-12-02 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor microenvironment characteristics in ovarian malignant Brenner tumor
2026-Mar, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101635
PMID:41322338
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 710 | 2026-09-20 |
The Role of CCR1 as a decisive factor for immune response activation versus suppression phenotypes in gastric cancer
2026-03, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101277
PMID:41621162
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析、单细胞与空间转录组学、体内实验等手段，探究CCR1在胃癌免疫微环境中激活或抑制免疫应答的作用机制 | 首次系统阐明CCR1在胃癌中作为免疫应答激活因子的决定性作用，揭示CCR1通过NF-κB和MAPK通路上调CXCL9/CXCL10促进T细胞浸润的机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究CCR1在胃癌中是促进还是抑制肿瘤进展，并阐明其调控免疫微环境的分子机制 | 胃癌患者组织样本、CCR1敲除小鼠模型 | digital pathology | 胃癌 | 转录组分析、单细胞转录组测序、空间转录组学、Western blotting、qRT-PCR、免疫荧光 | NA | 转录组数据、图像 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 711 | 2026-09-20 |
Experimental study of tumor-associated macrophage-derived SPP1 inhibit CD8+ T cells to promote Colorectal cancer progression
2026-03, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101276
PMID:41633116
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组分析，揭示了肿瘤相关巨噬细胞来源的SPP1通过CD44信号抑制CD8⁺ T细胞向Tc1分化，从而促进结直肠癌进展 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学鉴定出高表达SPP1的肿瘤相关巨噬细胞亚群，并阐明TAM来源的SPP1通过CD44介导的LCK-ZAP70-LAT信号通路抑制CD8⁺ T细胞向Tc1分化 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养实验，缺乏临床患者样本验证，且SPP1-CD44轴的具体下游分子机制仍需进一步探讨 | 探究肿瘤相关巨噬细胞在结直肠癌免疫微环境中的免疫调节作用及其分子机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞和CD8⁺ T细胞，以及MC38细胞系和CL2MDP脂质体处理的巨噬细胞清除小鼠模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 712 | 2026-09-20 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics to dissect mast-cell heterogeneity and arginine-metabolism-associated markers in BRCA
2026-03, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101281
PMID:41655499
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据，揭示了乳腺癌中肥大细胞基于精氨酸代谢的异质性，并识别出与精氨酸代谢相关的标志物 | 首次基于精氨酸代谢活性将乳腺癌中的肥大细胞分为高活性和低活性两个亚群，揭示了HAS细胞在TNBC中的富集及其促肿瘤机制，并构建了五基因预后模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，功能验证仅限于OAT基因，其他模型基因的功能尚未验证，且缺乏前瞻性临床试验数据 | 探究精氨酸代谢是否定义了乳腺癌中转录和功能上不同的肥大细胞亚群，并揭示其在肿瘤微环境中的作用 | 乳腺癌（BRCA）特别是三阴性乳腺癌（TNBC）中的肥大细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | LASSO-Cox, Seurat-Louvain聚类, Monocle2, CellChat, hdWGCNA | 图像, 文本 | 272,592个细胞（GSE161529）；空间转录组数据（GSE243022）；批量RNA-seq数据（TCGA, GSE42568） | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | 10x Chromium, Illumina测序平台 | 10x Chromium单细胞3'端文库构建，Illumina平台测序，空间转录组使用10x Visium |
| 713 | 2026-09-20 |
Tamoxifen promotes metastasis of breast cancer via reshaping lipid-driven fibrotic microenvironments in the lung
2026-03, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101286
PMID:41666535
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研究论文 | 该研究探究了长期他莫昔芬治疗对乳腺癌肺转移微环境形成的影响，发现其通过重塑脂质驱动的肺纤维化微环境促进肿瘤转移 | 首次揭示长期他莫昔芬治疗可通过诱导肺纤维化和脂质代谢重编程重塑转移微环境，进而促进ER阳性乳腺癌肺转移，并提出靶向脂质代谢可能作为限制转移的治疗策略 | 研究主要基于PyMT和4T1小鼠同种移植模型，尚需进一步在人类临床样本中验证；他莫昔芬促进转移的具体分子机制仍需深入探究 | 探究长期他莫昔芬治疗对乳腺癌转移微环境形成的影响及其潜在机制 | ER阳性乳腺癌小鼠模型（PyMT和4T1同种移植模型）及他莫昔芬处理后的肺组织 | 肿瘤生物学、单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、图像 | PyMT和4T1同种移植小鼠模型的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 714 | 2026-09-20 |
SMARCA4 deficiency in glioblastoma: Mitochondrial transfer from MSCs and the clinical dilemma in targeting the tumor microenvironment
2026-03, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101288
PMID:41692001
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研究论文 | 该研究探讨了SMARCA4在胶质母细胞瘤进展中的作用，重点关注肿瘤微环境中间充质基质细胞的线粒体转移 | 首次揭示了SMARCA4缺陷的间充质基质细胞通过微管依赖性线粒体转移促进胶质母细胞瘤生长的机制 | 研究主要基于体外实验和免疫缺陷异种移植模型，需要进一步验证在人体中的适用性 | 探究SMARCA4表达与胶质母细胞瘤进展的相关性及其在肿瘤微环境中的作用 | 胶质母细胞瘤细胞、间充质基质细胞、免疫缺陷小鼠异种移植模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 715 | 2026-09-20 |
From noise to models to numbers: Evaluating negative binomial models and parameter estimations in single-cell RNA-seq
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014014
PMID:41838800
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研究论文 | 本文通过计算效率高的模型选择技术，探讨了单细胞RNA测序数据中负二项分布模型与基因表达动力学参数之间的关系，并评估了参数估计的准确性。 | 揭示了负二项分布广泛适用的参数范围，并指出其拟合良好并不唯一指示转录爆发；同时发现即使校正技术噪声后，爆发参数估计仍存在较大误差，但爆发频率的基因排序相对可靠。 | 研究主要基于模拟数据，实际scRNA-seq数据的验证有限；参数估计误差较大，尤其在小样本情况下；未全面考虑所有可能的噪声来源和模型复杂性。 | 探究负二项分布模型在scRNA-seq数据中广泛适用的原因，评估其与基因表达动力学参数的关系及参数估计的准确性。 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达计数分布，以及模拟生成的基因表达数据，包括哺乳动物基因。 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 负二项分布模型、Beta-Poisson模型、泊松模型 | 计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 716 | 2026-09-20 |
"Recurrent Extinction of Resistance Mutations Leads to Convergent Multidrug Resistance in Sequential Antibiotic Treatment"
2026-Feb-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.08.647880
PMID:42124691
|
研究论文 | 该研究通过模拟临床抗生素药代动力学，探索在单一或序贯抗生素治疗下细菌耐药性的进化轨迹，发现序贯治疗可通过消除耐药突变导致基因型和表型趋同的多重耐药性。 | 揭示了序贯抗生素治疗可通过反复消除耐药突变，使原本分歧的进化路径趋同，形成多重耐药性，挑战了传统认为耐药进化不可预测的观点。 | 摘要中未明确说明研究的局限性。 | 为设计不易产生耐药性的抗生素治疗方案提供进化生物学依据。 | 在单一或序贯抗生素治疗下进化的大肠杆菌或其他细菌群体（具体菌种未明确）。 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 717 | 2026-09-20 |
Peptide-driven identification of TCRs reveals dynamics and phenotypes of CD4 T cells in tuberculosis
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf287
PMID:41241821
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研究论文 | 该研究开发了PDI-TCR方法，通过肽段驱动结合体外扩增、bulk TCR测序和统计分析，从人血液中鉴定抗原特异性TCR，并应用于结核病患者，揭示CD4 T细胞的动态和表型 | 开发了PDI-TCR方法，通过比较对非重叠肽段的反应来区分真正的抗原特异性TCR克隆型与非特异性旁观者激活相关的TCR，克服了TCR多样性及TCR-抗原识别复杂性带来的挑战 | 本研究中PDI-TCR参数是Mtb特异性的，需要根据其他抗原系统进行调整；未提及样本量的具体规模 | 开发一种从人血液中鉴定抗原特异性TCR的方法，并应用于结核病研究以揭示抗原特异性T细胞的动态和表型 | 结核病患者（诊断时及治疗全程）和Mtb致敏的健康个体（IGRA+）的血液样本 | 免疫学 | 结核病 | bulk TCR测序、单细胞RNA测序 | NA | 文本、图像 | NA | NA | bulk TCR测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 718 | 2026-09-20 |
The Sixth Annual Symposium of the Midwest Aging Consortium
2026-02-05, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf280
PMID:41429578
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会议纪要 | 本文介绍了2025年4月在明尼苏达州罗切斯特梅奥诊所举行的中西部老龄化联盟（MAC）第六届年度研究研讨会，会议聚焦老龄化机制、治疗概念及前沿研究方法 | 创纪录规模的跨学科老龄化研究会议，涵盖脂质代谢、线粒体功能障碍、应激反应、细胞衰老和免疫适应等关键老龄化机制，并展示了单细胞与空间转录组学、代谢组学和类器官培养等前沿技术 | 作为会议纪要，未提供具体研究数据或实验结果的详细分析，缺乏原始研究的一手数据支撑 | 展示中西部老龄化联盟在推动老龄化研究方面的持续影响力，促进跨学科合作与老龄化机制研究成果的临床转化 | 老龄化研究领域的科研人员，包括受训人员和早期职业研究者 | 老年医学 | 老年疾病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 代谢组学, 类器官培养 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 代谢组学 | NA | NA |
| 719 | 2026-09-20 |
Neoplastic Immune Mimicry Potentiates Breast Tumor Progression
2026-02-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0985
PMID:41129726
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研究论文 | 该研究发现去分化的乳腺肿瘤上皮细胞亚群表达经典白细胞表面受体蛋白，命名为“免疫拟态”，并证实该程序促进肿瘤恶性进展 | 首次提出并命名“免疫拟态”这一肿瘤细胞去分化程序，发现肿瘤细胞通过表达白细胞表面受体获得增殖优势并促进肿瘤生长 | 未明确说明具体局限性 | 探究乳腺癌进展过程中去分化程序对肿瘤细胞适应性的影响及其临床意义 | 人乳腺肿瘤单细胞RNA测序数据集、乳腺癌组织病理标本、乳腺癌细胞系、小鼠转基因及细胞系来源的乳腺癌症模型 | 数字病理学, 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 组织病理学分析 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 720 | 2026-09-20 |
Airway epithelial heterogeneity and mucus plugging in asthmatic bronchioles
2026-02-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202409-1849OC
PMID:40986379
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研究论文 | 该研究通过组织学、RNA原位杂交、免疫组化、空间转录组学和多重组免疫表型分析，揭示哮喘细支气管上皮异质性及MUC5AC主导的黏液栓形成机制 | 首次发现哮喘细支气管中存在异质性分布的MUC5AC高表达生态位，且这些生态位独立于免疫细胞定位，由T2炎症驱动上皮重塑 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 验证哮喘细支气管存在上皮生物学紊乱并产生MUC5AC主导的黏液栓这一假说 | 重度哮喘患者、致死性哮喘患者及对照组的肺外周组织 | 数字病理学 | 哮喘 | 空间转录组学、RNA原位杂交、免疫组化、多重免疫表型分析 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |