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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7141 | 2026-04-25 |
RNA m6A methylation regulates CDH6 to promote epithelial-to-mesenchymal transition in cholangiocytes of biliary atresia
2026-Apr, Journal of pediatric surgery
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.jpedsurg.2025.162492
PMID:40774478
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research paper | 本研究探讨了RNA m6A甲基化通过调控CDH6促进胆道闭锁胆管细胞上皮-间质转化的机制 | 首次揭示了m6A甲基化通过METTL3/YTHDF2轴调控CDH6表达,进而促进胆道闭锁胆管细胞上皮-间质转化的新机制 | 研究主要基于公开单细胞RNA测序数据集和体外实验,缺乏体内动物模型验证及临床样本的大规模验证 | 探究m6A修饰在胆道闭锁胆管细胞上皮-间质转化中的参与作用及其机制 | 胆道闭锁患者的胆管细胞 | machine learning | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, RNA免疫沉淀 | NA | 单细胞RNA测序数据, RNA-seq数据 | 公开单细胞RNA测序数据集HRA003163 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7142 | 2026-04-25 |
Mapping the zygote-to-adult developmental cell phylogeny in Arabidopsis thaliana reveals a three-cell rule of branching
2026-Apr, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-026-02264-1
PMID:41975122
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研究论文 | 通过开发e-SMALT系统整合单细胞RNA测序,绘制拟南芥从合子到成体的发育细胞系统发育树,揭示三分枝规则 | 首次在高等植物中实现从合子到成体的全发育追踪,发现每个枝条起源于三个创始细胞的三细胞规则,并通过单细胞转录组解析三层胚层起源 | 当前仅分析两个个体,且barcode序列长度与突变率的依赖性可能限制更复杂组织的解析能力 | 阐明多细胞生物从单细胞合子到成体组织的发育细胞谱系及其分支规则 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana)的枝条、花和果实组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、细胞谱系追踪 | 系统发育树重建 | 单细胞转录组数据、突变条形码数据 | 两株3月龄拟南芥个体,数千个细胞来自多个枝条分支 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组建库方法 |
| 7143 | 2026-04-25 |
Cellular stress-induced eccrine gland dysfunction as a potential mechanism in acquired idiopathic generalized anhidrosis
2026-Apr-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.03.022
PMID:41933877
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研究论文 | 通过组织学和单细胞RNA测序分析,探究获得性特发性全身性无汗症(AIGA)的发病机制及糖皮质激素脉冲疗法的治疗作用 | 首次发现未折叠蛋白反应相关的细胞应激导致外泌腺功能障碍是AIGA的潜在发病机制,并阐明糖皮质激素脉冲疗法通过减轻细胞应激而非仅靠免疫抑制发挥作用 | 样本量较小,仅对少数病例进行详细分析;缺乏功能性验证实验 | 阐明获得性特发性全身性无汗症的潜在机制及糖皮质激素脉冲疗法的作用原理 | 获得性特发性全身性无汗症(AIGA)患者的皮肤病变组织 | 数字病理学 | 获得性特发性全身性无汗症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、组织病理图像 | 多例AIGA患者的皮肤样本,具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7144 | 2026-04-25 |
Decoding NK Cell Subset Dysregulation in SARS-CoV-2 Infection: Phenotypic, Functional, and Transcriptomic Insights Into COVID-19 Pathogenesis
2026-Apr, Scandinavian journal of immunology
IF:4.1Q2
DOI:10.1111/sji.70115
PMID:41981866
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综述 | 综述了SARS-CoV-2感染中NK细胞亚群的表型、功能和转录组学失调及其在COVID-19发病机制中的作用 | 整合多组学和表型方法,全面解析NK细胞亚群失调与疾病严重程度的关联,并提出潜在生物标志物和治疗靶点 | 未提供原始实验数据,可能依赖已有研究的局限性,如样本异质性和技术差异 | 阐明SARS-CoV-2感染中NK细胞亚群的失调机制及其在COVID-19免疫病理学中的作用 | 自然杀伤细胞(NK细胞)亚群 | 数字病理学 | 新型冠状病毒肺炎 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 7145 | 2026-04-25 |
Comprehensive bioinformatics analysis and experimental validation reveal the role of circadian rhythm-related genes in the crosstalk between osteoporosis and atherosclerosis
2026-Mar-27, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-026-10216-5
PMID:41896290
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研究论文 | 通过综合分析生物信息学和实验验证,揭示昼夜节律相关基因在骨质疏松与动脉粥样硬化共病中的关键作用 | 首次鉴定出AEBP1作为骨质疏松和动脉粥样硬化共病的关键共享标志基因,并揭示昼夜节律在骨髓基质细胞和血管平滑肌细胞中的调控机制 | 尚需进一步验证AEBP1作为治疗靶点的具体功能机制,且动物模型可能不完全模拟人类疾病复杂性 | 探索骨质疏松和动脉粥样硬化共存的共享标志基因及细胞机制 | 骨质疏松和动脉粥样硬化相关的单细胞RNA测序数据和mRNA表达谱,自然衰老小鼠和腺嘌呤诱导小鼠模型 | 生物信息学 | 骨质疏松, 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序, mRNA表达谱分析 | hdWGCNA, AUCell | 基因表达数据 | 人类骨髓样本(9种细胞系17个亚群)和颈动脉样本(6种细胞系18个亚群),小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7146 | 2026-04-25 |
Scalable nonparametric clustering with unified marker gene selection for single-cell RNA-seq data
2026-Mar-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101329
PMID:41825449
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研究论文 | 提出一种可扩展的非参数聚类方法NCLUSION,用于单细胞RNA-seq数据的统一标记基因选择与聚类分析 | 利用贝叶斯稀疏先验的非参数无限混合模型,同时实现标记基因识别和聚类,并采用变分推理算法支持百万级细胞规模 | 未明确说明局限性,但可能依赖公开数据集验证,需进一步评估在多样化样本中的泛化能力 | 开发一种无需用户预定义参数的聚类方法,以鲁棒统计方式同时识别标记基因并降低假发现率 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 非参数无限混合模型 | 基因表达数据 | 模拟数据及公开scRNA-seq数据集(未提供具体数量) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7147 | 2026-04-25 |
Comparative analysis of nuclei isolation methods for brain single-nucleus RNA sequencing
2026-Mar-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101337
PMID:41875869
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研究论文 | 比较三种不同的细胞核分离方法在脑组织单细胞核RNA测序中的效果 | 首次系统评估不同细胞核分离策略对核完整性和snRNA-seq数据质量的影响,填补了该领域的方法学空白 | 仅针对脑组织进行测试,其他组织类型的适用性尚需验证 | 评估不同细胞核分离方法对snRNA-seq数据质量的影响 | 脑组织中的细胞核 | 数字病理学 | 未指定 | 单细胞核RNA测序 | 未指定 | RNA测序数据 | 未详细说明 | 未指定 | 单细胞核RNA测序 | 未指定 | 未指定 |
| 7148 | 2026-04-25 |
From a Multi-Omics Signature to a Therapeutic Candidate: Computational Prediction and Experimental Validation in Liver Fibrosis
2026-Mar-17, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph19030495
PMID:41901341
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研究论文 | 通过多组学特征开发肝纤维化进展标志物,并验证候选药物Withaferin A的抗纤维化活性 | 提出了一个跨病因稳健的六基因肝纤维化进展标志物,结合单细胞RNA测序和药物重定位方法发现并验证了Withaferin A的抗纤维化作用 | 研究仅基于公开数据集和动物模型验证,缺乏大样本临床队列的进一步评估 | 开发跨病因的肝纤维化进展预测标志物并发现潜在治疗药物 | 肝纤维化患者样本、小鼠模型及肝星状细胞系LX-2 | 计算机视觉 | 肝纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 机器学习 | 随机森林, XGBoost, LASSO, Boruta | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 训练队列368例,外部验证队列4个独立数据集,共涉及数百例样本;动物实验使用CCl4诱导小鼠模型 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 7149 | 2026-04-25 |
Identification of a putative progenitor-like chondrocyte subpopulation in osteoarthritic human cartilage
2026-Mar-14, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-04969-8
PMID:41827033
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示骨关节炎软骨中一种疑似祖细胞样软骨细胞亚群 | 首次在骨关节炎软骨中鉴定出一个表达祖细胞相关基因特征的软骨细胞亚群(PLC),并基于伪时间轨迹分析推测其处于分化层次的上游位置 | 功能性验证和空间定位验证仍需进一步开展,当前结论基于转录组推断 | 解析骨关节炎软骨的单细胞转录组图谱并鉴定具有再生潜能的祖细胞样软骨细胞亚群 | 6名终末期骨关节炎患者的膝关节软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6名终末期骨关节炎患者,约14,000个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞RNA测序(10x Chromium平台) |
| 7150 | 2026-04-25 |
Integrated transcriptomics and single-cell analysis identify ITGAX⁺ macrophages as key immunosuppressive factors in the prostate cancer tumor microenvironment
2026-Mar-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04737-3
PMID:41824168
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研究论文 | 整合转录组学和单细胞分析揭示ITGAX+巨噬细胞是前列腺癌肿瘤微环境中的关键免疫抑制因子 | 首次通过整合TCGA转录组数据和单细胞RNA测序,鉴定出ITGAX+巨噬细胞在前列腺癌中作为关键免疫抑制因子,并揭示其与T细胞的抑制性相互作用 | 基于单一TCGA队列,缺乏独立的外部验证;还需要进一步的功能实验验证ITGAX+巨噬细胞的免疫抑制机制 | 识别前列腺癌肿瘤微环境中新的生物标志物,并阐明其免疫调控机制 | 前列腺癌患者肿瘤样本(499例肿瘤和52例正常前列腺样本) | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据 | 499例肿瘤样本和52例正常前列腺样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7151 | 2026-04-25 |
Single-cell transcriptomics reveals lipid metabolism reprogramming in macrophages in vitro during early stages of Leishmania donovani infection
2026-Mar-13, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-026-07361-w
PMID:41827050
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研究论文 | 利用单细胞转录组测序技术分析杜氏利什曼原虫感染早期巨噬细胞的脂质代谢重编程 | 首次在单细胞水平揭示杜氏利什曼原虫感染早期巨噬细胞中Fabp4/Cd36脂质代谢通路的激活以及衰老相关基因的诱导,并发现M2型巨噬细胞更有利于寄生虫生存 | 论文摘要未提及具体局限性 | 探索杜氏利什曼原虫感染巨噬细胞的发病机制 | 小鼠巨噬细胞 | NA | 内脏利什曼病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠巨噬细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7152 | 2026-04-25 |
Subtype specific immune-metabolic reprogramming in preeclampsia revealed by multiomics and serum biomarkers
2026-03, Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension
IF:4.3Q1
DOI:10.1038/s41440-025-02504-5
PMID:41419624
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学和空间代谢组学分析早发型和晚发型子痫前期的胎盘免疫-代谢重编程,并鉴定出早期妊娠血清标志物 | 首次同时整合胎盘单细胞RNA测序、空间转录组学和空间代谢组学揭示子痫前期两种亚型(早发与晚发)的特异性免疫-代谢重编程机制,并基于前瞻性队列发现三种早期妊娠血清代谢物可实现早发型子痫前期的有效预测 | 未明确说明研究局限性 | 解析早发型与晚发型子痫前期在细胞水平、转录组和代谢组的差异驱动因素,并探索早期妊娠血清标志物 | 人类胎盘组织及母体血清样本 | 机器 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 空间代谢组学, 血清代谢组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据, 代谢物丰度数据 | 199例妊娠前瞻性队列(包括子痫前期患者和匹配对照) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 空间代谢组学, 血清代谢组学 | NA | NA |
| 7153 | 2026-04-25 |
scChat: A Large Language Model-Powered Co-Pilot for Contextualized Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2026-Feb-11, AIChE journal. American Institute of Chemical Engineers
DOI:10.1002/aic.70285
PMID:41959856
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研究论文 | scChat是一种由大型语言模型驱动的协同助手,用于情境化单细胞RNA测序分析,兼顾定量算法与推理能力 | 首次将大型语言模型作为互动推理框架集成到单细胞RNA测序分析中,结合检索增强生成与多智能体架构,支持假设验证、机制解释和实验设计,超越了传统仅做细胞类型注释或富集分析的局限 | 未提及具体限制,但可能受限于大型语言模型的幻觉问题或对特定领域的泛化能力 | 增强单细胞RNA测序分析的可解释性,将数据驱动方法转变为结合研究情境的推理型框架 | 单细胞RNA测序数据及其分析流程 | 自然语言处理 | NA | RNA-seq | 大型语言模型 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7154 | 2026-04-25 |
Unveiling the choroidal immune landscape revealed interferon-gamma and TNF-alpha as novel therapeutic targets in dry AMD
2026-02, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-2951-5
PMID:41077603
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示脉络膜免疫微环境,发现干扰素-γ和肿瘤坏死因子-α可作为干性年龄相关性黄斑变性新治疗靶点 | 首次阐明成纤维细胞通过IFNγ和TNFα信号通路介导脉络膜炎症在干性AMD发病中的关键作用,并验证了靶向这些通路的治疗效果 | 未提及 | 探索脉络膜免疫微环境在干性AMD发病机制中的作用,寻找新治疗靶点 | 人类脉络膜组织 | 机器学习 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类脉络膜样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 7155 | 2026-04-25 |
5-FU Resistance Facilitates Immune Evasion in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Through ADAM10-Mediated PD-L1 Shedding and Tumour Microenvironment Remodelling
2026-01, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70038
PMID:40958168
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研究论文 | 揭示5-氟尿嘧啶耐药性通过ADAM10介导的PD-L1脱落和肿瘤微环境重塑促进食管鳞状细胞癌免疫逃逸的机制 | 首次发现ADAM10在5-FU耐药食管鳞状细胞癌中显著上调,通过促进可溶性PD-L1释放限制CD8+ T细胞浸润,揭示耐药驱动免疫抑制的新机制 | NA | 阐明5-FU耐药性如何重新编程肿瘤微环境并促进免疫逃逸的分子机制 | 5-FU耐药的AKR小鼠食管鳞状细胞癌细胞系及其亲本对照细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 第三代DNA测序, 蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 5-FU耐药AKR小鼠ESCC细胞系及亲本细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7156 | 2026-04-25 |
Decoding adenomyosis pathogenesis using an assembloid model
2026-01, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-2981-1
PMID:40889046
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研究论文 | 利用类组装体模型解码子宫腺肌症的发病机制 | 首次建立能模拟月经周期子宫内膜动态的类组装体模型,并通过单细胞转录组学揭示异位细胞在分泌期向管腔优势、腺体缺陷转录谱转变的分子机制,以及BMP/WNT信号通路失衡在疾病中的作用 | 未提及具体局限性 | 构建生理相关的体外模型以研究子宫腺肌症发病机制并探索潜在治疗靶点 | 子宫内膜类组装体模型及其异位病变细胞 | 数字病理学 | 子宫腺肌症 | 单细胞转录组学 | 类组装体 | 单细胞转录组数据 | 未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7157 | 2026-04-25 |
Single-cell multiomics data analysis of potential receptors and therapeutic drugs for epilepsy patients comorbid with depression
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0347526
PMID:42018591
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研究论文 | 通过单细胞多组学数据分析癫痫合并抑郁症的潜在受体和治疗药物,发现Ziprasidone可能通过靶向NLGN3蛋白发挥治疗作用 | 首次从单细胞水平揭示少突胶质前体细胞在癫痫和抑郁症共病中的关键作用,并发现NLGN3-NRXN信号通路是潜在治疗靶点,Ziprasidone通过与NLGN3蛋白稳定结合激活该通路,为共病治疗提供新策略 | 研究数据来源于公共数据集可能引入偏差;药物效果仅通过分子动力学模拟和细胞热稳定性迁移实验验证,缺乏体内动物模型和临床试验进一步确认 | 探索癫痫和抑郁症共病的分子机制并发现潜在治疗药物 | 癫痫患者和重度抑郁症患者的少突胶质前体细胞 | 机器学习 | 癫痫,抑郁症 | 单细胞RNA测序,分子动力学模拟,细胞热稳定性迁移实验 | NA | 单细胞基因表达数据 | 未在摘要中明确提供样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7158 | 2026-04-25 |
Single-Cell Sequencing and Mendelian Randomization Reveal T Cell Nuclear Factor Genes in Hepatocellular Carcinoma Progression
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/7446280
PMID:42022794
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法揭示T细胞核因子相关基因在肝细胞癌进展中的作用 | 首次将单细胞转录组学与孟德尔随机化相结合,以优先筛选肝细胞癌中NFAT相关因果基因,并构建具有高诊断效能的列线图 | 依赖于公共数据集,可能受样本量和批次效应影响;因果推断基于eQTL数据,需进一步功能验证 | 阐明NFAT相关基因在肝细胞癌进展中的免疫调节机制,并开发早期诊断工具 | 肝细胞癌患者肿瘤组织中的免疫细胞与肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、eQTL分析 | NA | 基因表达数据 | GSE162616数据集(具体样本数未明确),TCGA-LIHC队列 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | GSE162616数据集基于10x Genomics平台进行单细胞RNA测序,但具体配置未在摘要中提供 |
| 7159 | 2026-04-25 |
The Role of Genomics in the Development and Treatment of Multiple Myeloma: Understanding the Challenges and Opportunities
2026, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S595435
PMID:42027619
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综述 | 综述多发性骨髓瘤基因组学的最新进展及其临床意义 | 系统阐述了关键驱动基因突变、拷贝数变异、表观遗传失调及非编码RNA在多发性骨髓瘤发病机制中的作用,并展望了基因组学指导下的靶向和免疫治疗策略以及液体活检用于微小残留病监测 | NA | 提供多发性骨髓瘤基因组学进展的全面概述,并探讨其临床应用前景 | 多发性骨髓瘤及其基因组异常 | 基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 高通量测序, 下一代测序, 单细胞测序, 生物信息学 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7160 | 2026-04-25 |
Integration of Multi-Omics Data Identifies the Role of the Selenium-Related Gene PNPO and Pre-exhausted CD127- CD8+ T Cells in Laryngeal Carcinoma
2026, Cancer informatics
IF:2.4Q3
DOI:10.1177/11769351261438477
PMID:42027653
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研究论文 | 通过整合孟德尔随机化、批量转录组和单细胞分析,揭示了硒相关基因PNPO及预耗竭性CD127- CD8+ T细胞在喉癌中的作用 | 首次通过多组学整合分析(孟德尔随机化、批量转录组和单细胞测序)系统阐明了硒相关基因PNPO与喉癌风险及免疫特征之间的因果关系,并发现了一个具有独特分子和功能特征的预耗竭性CD127- CD8+ T细胞亚群 | 需要进一步的机制验证和潜在治疗探索 | 阐明硒指标、硒相关基因与喉癌免疫特征之间的机制联系 | 喉癌患者的肿瘤样本及免疫细胞,包括恶性上皮细胞和CD8+ T细胞 | 机器学习和生物信息学 | 喉癌 | 孟德尔随机化、批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 使用了TCGA和GEO队列数据,以及单细胞RNA测序数据(具体样本数量未提供) | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |