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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7101 | 2026-04-27 |
Adversarial validation of in silico perturbation profiles for intelligence-associated genes in human prefrontal cortex
2026-Apr-21, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 基于Geneformer模型对与智力相关的21个基因在人类前额叶皮层中的计算机扰动进行对抗性验证 | 提出了一个可复现的对抗性验证框架,用于评估基础模型的计算机扰动结果,并揭示了表达水平混杂因素会显著放大原始扰动信号 | 研究在供体层面统计效力不足(n=3,估计效力约27%),推荐至少20个供体;交叉模型一致性受标记化问题限制 | 建立标准化对抗性验证框架,评估基础模型在计算机基因扰动中的可靠性,并检验智力相关基因的细胞类型特异性机制 | 人类背外侧前额叶皮层(DLPFC)单细胞RNA-seq数据中的21个智力相关基因 | 自然语言处理 | 智力相关疾病 | 单细胞RNA测序 | Geneformer, scGPT | 单细胞RNA-seq表达数据 | 3个供体的500个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7102 | 2026-04-27 |
Integrating single-cell and single-nucleus datasets improves bulk RNA-seq deconvolution
2026-Apr-20, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101346
PMID:41895263
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研究论文 | 本研究评估了整合单细胞和单细胞核数据集以改善批量RNA-seq反卷积的策略,并提出了最佳实践方法 | 首次系统比较了多种整合策略(包括基于主成分的潜在偏移、条件和非条件scVI以及跨模态差异表达基因过滤)在提升单细胞核RNA-seq参考数据反卷积准确性的效果,并推荐了优先使用scRNA-seq及跨模态DEG过滤的方法 | 研究仅基于四种组织类型进行基准测试,可能未涵盖所有组织类型;跨模态DEG过滤需要配对的scRNA-snRNA细胞类型信息,实际应用中可能受限于数据可用性 | 评估并改进单细胞核RNA-seq数据作为批量RNA-seq反卷积参考的准确性 | 四种组织类型(具体未列出)的scRNA-seq和snRNA-seq数据;真实的脂肪组织批量样本 | 机器学习 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞核RNA-seq | 条件/非条件scVI(单细胞变分推断) | 基因表达数据 | 四种组织的scRNA-seq和snRNA-seq数据集;真实的脂肪组织批量样本(具体数量未说明) | NA | scRNA-seq, snRNA-seq | NA | NA |
| 7103 | 2026-04-27 |
Brain endothelial tmTNFα overexpression in a mouse model altered cell type-specific signaling changes linked to schizophrenia-relevant behaviors
2026-Apr-20, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106777
PMID:42019828
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研究论文 | 在小鼠模型中,脑内皮细胞tmTNFα过表达引发与精神分裂症相关行为相关的细胞类型特异性信号变化 | 首次在脑内皮细胞中通过tmTNFα过表达模型,揭示其通过TNFR2信号通路引发精神分裂症相关行为的细胞类型特异性分子机制,包括从急性星形胶质细胞和突触紊乱到慢性免疫激活、代谢失调和翻译后调控的时序演变 | 未明确提及研究局限性 | 探究脑内皮细胞中tmTNFα过表达导致精神分裂症相关行为的分子机制 | 小鼠模型(短期和长期tmTNFα表达模型)及TNFR2敲除小鼠 | 机器学习 | 精神分裂症 | RNA-seq, 单细胞转录组学, 蛋白质印迹, sGC活性检测 | NA | 转录组数据, 蛋白质表达数据, 信号通路数据 | 小鼠模型(短期4周和长期28周表达模型) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7104 | 2026-04-27 |
Maternal immune activation causes sex-specific impairment of microglial function during prefrontal cortex development
2026-Apr-19, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2026.106770
PMID:42013920
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研究论文 | 该研究揭示了孕期母体免疫激活通过性别特异性损害小胶质细胞功能,导致前额叶皮层发育异常和雄性后代行为缺陷 | 首次证明MIA通过性别特异性方式损害小胶质细胞反应性,导致雄性后代前额叶皮层突触修剪缺陷和行为异常 | 未明确小胶质细胞功能障碍与神经发育异常之间的分子机制 | 探究母体免疫激活如何通过小胶质细胞介导性别特异性神经发育异常 | 母体免疫激活小鼠模型的后代,特别是前额叶皮层中的小胶质细胞 | 机器学习 | 神经发育障碍 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | MIA诱导的雄性及雌性小鼠后代,具体数量未在摘要中明确 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7105 | 2026-04-27 |
M2 macrophage-derived exosomes deliver NGF-modified mRNA to promote comprehensive corneal repair
2026-Apr-17, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114930
PMID:42002048
|
研究论文 | 利用M2巨噬细胞来源的外泌体递送NGF修饰mRNA用于促进角膜综合修复 | 首次将M2巨噬细胞外泌体与NGF修饰mRNA结合,实现多维度的角膜修复,同时促进组织再生、抑制炎症和新生血管 | 未明确提及研究限制 | 开发一种基于M2巨噬细胞外泌体和NGF修饰mRNA的创新递送平台,用于角膜损伤后的综合修复 | M2巨噬细胞来源的外泌体、NGF修饰mRNA、碱烧伤的角膜组织 | 数字病理学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7106 | 2026-04-27 |
SCTGE infers transformer-based graph embeddings to improve cell-cell interaction identification and cell identity annotations
2026-Apr-11, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | SCTGE是一种基于Transformer的图嵌入新架构,整合自适应多尺度注意力和图神经网络,用于解决单细胞转录组空间嵌入难题并提升细胞间相互作用识别与细胞身份注释性能 | 创新性地融合Transformer自注意力机制与图神经网络,引入上下文感知自适应多头注意力和APPNP增强特征传播,有效应对空间转录组学中的可扩展性和噪声挑战 | 在特定数据集上细胞身份注释性能存在例外情况 | 开发可扩展且可解释的解决方案,用于空间嵌入提取、细胞间通信分析和细胞身份注释 | 单细胞转录组数据中的空间嵌入和细胞间相互作用 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 基于Transformer的图神经网络 | 单细胞转录组数据 | 六个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7107 | 2026-04-27 |
Multidimensional single-cell analysis reveals immune dysfunction and inflammatory response in lymphatic malformations
2026-Apr-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf103
PMID:41273773
|
research paper | 通过单细胞多组学分析揭示了淋巴管畸形中免疫功能障碍和炎症反应的细胞类型特异性机制 | 首次整合单细胞RNA测序、T细胞受体测序和B细胞受体测序对淋巴管畸形患者外周血和胸腔积液进行多维免疫图谱分析,发现促炎性单核细胞和记忆B细胞扩增、细胞毒性T细胞和自然杀伤细胞减少,并鉴定出S100A8作为潜在治疗靶点 | 未提及 | 阐明淋巴管畸形中循环细胞的免疫表型和潜在分子机制 | 淋巴管畸形患者的外周血和胸腔积液样本 | 单细胞组学 | 淋巴管畸形 | scRNA-seq, scTCR-seq, scBCR-seq | NA | 单细胞转录组数据、T细胞受体序列、B细胞受体序列 | 淋巴管畸形患者样本 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell TCR-seq, single-cell BCR-seq | NA | NA |
| 7108 | 2026-04-27 |
Indirubin and Retinoic Acid Show Binding Affinity to Monocyte Biomarker CSF3R in Parkinson's Disease
2026-Apr, Journal of clinical laboratory analysis
IF:2.6Q2
DOI:10.1002/jcla.70197
PMID:41845882
|
研究论文 | 本研究整合多组学数据分析,识别帕金森病单核细胞相关生物标志物CSF3R和IFITM3,并预测潜在靶向药物 | 首次结合单细胞测序与hdWGCNA分析,鉴定帕金森病外周血中单核细胞相关生物标志物,并预测其靶向药物 | NA | 通过多组学数据整合分析,揭示帕金森病中单核细胞的关键分子变化,识别新型生物标志物 | 帕金森病患者外周血单核细胞 | 机器学习 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序、芯片分析 | NA | 单细胞转录组数据、芯片数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7109 | 2026-04-27 |
Multi-Omics Profiling Uncovers Predictive Factors for Tumor-Infiltrating Lymphocyte Therapy in Ovarian Cancer
2026-Apr, Journal of clinical laboratory analysis
IF:2.6Q2
DOI:10.1002/jcla.70196
PMID:41877397
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research paper | 通过多组学分析揭示卵巢癌肿瘤浸润淋巴细胞治疗中的预测因素 | 首次对卵巢癌肿瘤样本进行多组学分析,整合全外显子组测序、bulk RNA测序和单细胞RNA测序数据,系统性地识别与TIL治疗成功相关的细胞组成、代谢活性和细胞间通讯特征 | 样本量较小(仅10例患者),且主要基于回顾性分析,需要更大规模的前瞻性研究进行验证 | 识别预测卵巢癌患者肿瘤浸润淋巴细胞分离和扩增成功与否的关键因素 | 10例卵巢癌患者的肿瘤样本 | machine learning | ovarian cancer | 多组学分析 | NA | 基因组数据 | 10例卵巢癌患者的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 7110 | 2026-04-27 |
A Composite interaction Score: Prioritizing cell-cell interactions from single-cell RNA-seq with application to pre-menopausal epithelial barriers
2026-Mar-22, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.046
PMID:41875947
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研究论文 | 提出Composite Interaction Score (CIS)方法,整合六种细胞-细胞相互作用预测工具,优先排序来自单细胞RNA-seq的相互作用 | 通过排名偏差精度加权工具间一致性,强调排名列表顶部的一致性,优于简单平均值基线,并应用于上皮屏障组织 | 未明确提及局限性 | 开发优先排序细胞-细胞相互作用的共识策略,强调可重复性和生物学相关性 | 肠、皮肤和子宫的上皮屏障组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 来自肠、皮肤和子宫的单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7111 | 2026-04-27 |
Epigenetic Programming of Macrophage Phenotypes by STING-IRF3 Drives Inflammation in Ascending Thoracic Aortic Dissection
2026-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.22.701198
PMID:41648393
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研究论文 | 该研究通过单细胞多组学技术揭示STING-IRF3信号轴介导的巨噬细胞表观遗传重编程驱动升主动脉夹层炎症 | 首次阐明STING-IRF3信号通过协调BRG1依赖的染色质开放和关闭,同时促进促炎基因程序并抑制吞噬基因表达,从而驱动巨噬细胞表观遗传重编程 | NA(摘要未明确提及局限性) | 探究表观遗传重编程是否调控巨噬细胞表型命运并促进升主动脉夹层发病机制 | 人类升主动脉组织(对照、升主动脉瘤患者、急性升主动脉夹层患者)和血管紧张素II输注的小鼠模型 | 单细胞组学 | 升主动脉夹层 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、单细胞染色质可及性数据、空间转录组数据 | 人类:对照、升主动脉瘤患者和急性升主动脉夹段患者;小鼠:Ang II输注模型及巨噬细胞特异性Sting-/-和Irf3-/-小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 | 10x Chromium | 用于单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序的10x Chromium平台 |
| 7112 | 2026-04-27 |
Mitochondrial dysfunction in diabetic cardiomyopathy: a review of pathogenic mechanisms and therapeutic strategies
2026, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2026.1751243
PMID:41908047
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综述 | 本文综述了线粒体功能障碍在糖尿病心肌病发病机制中的核心作用及潜在治疗策略 | 系统阐述了线粒体损伤通过能量代谢紊乱、氧化应激、炎症小体激活及凋亡/铁死亡通路驱动糖尿病心肌病的多维机制,并总结了线粒体靶向治疗的最新进展,包括小分子抗氧化剂、代谢调节剂、基因治疗、干细胞外泌体及生活方式干预 | 未详细讨论各治疗策略的临床试验阶段和具体疗效数据,对新兴技术如单细胞转录组学的应用前景仅作了简要提及 | 阐明线粒体功能障碍在糖尿病心肌病发病机制中的多维作用,并总结线粒体靶向治疗策略的研究进展 | 糖尿病心肌病患者及实验模型中的线粒体功能 | 机器学习 | 心血管疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7113 | 2026-04-27 |
Establishing an atherosclerosis diagnostic model based on WGCNA and machine learning algorithms with key genes in cholesterol metabolism and ferroptosis, and revealing the regulatory role of HMOX1 in cellular ferroptosis
2026, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2026.1715946
PMID:41908043
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研究论文 | 基于WGCNA和机器学习算法建立动脉粥样硬化诊断模型,揭示HMOX1在细胞铁死亡中的调控作用 | 整合胆固醇代谢和铁死亡相关基因,利用三种机器学习算法筛选核心特征基因,构建诊断模型并验证其鉴别能力 | 未提及具体局限性 | 建立动脉粥样硬化诊断模型并识别潜在生物标志物 | 动脉粥样硬化患者及ox-LDL诱导的THP-1细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组测序 | 逻辑回归 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7114 | 2026-04-27 |
Distinct diversity of skin cell populations of rhinophyma and hypertrophic scar illustrated by scRNA-seq
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1703469
PMID:41909715
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示酒渣鼻和肥厚性疤痕皮肤细胞群体的独特多样性 | 首次通过单细胞转录组学比较酒渣鼻与肥厚性疤痕的细胞和分子差异,解释为何酒渣鼻术后能恢复正常而不复发疤痕 | 文中未明确提及研究限制 | 利用单细胞测序技术揭示两种病理状态的细胞和分子差异,以解决临床悖论 | 酒渣鼻和肥厚性疤痕组织中的单细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7115 | 2026-04-27 |
Identification and Experimental Verification Reveal SLC2A3 Associated With Prognosis and Immune Infiltration in Colon Adenocarcinoma
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/8383379
PMID:42029110
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研究论文 | 通过整合转录组分析鉴定与结肠腺癌预后和免疫浸润相关的parthanatos相关基因,并实验验证SLC2A3的作用 | 首次系统表征parthanatos相关基因在结肠腺癌中的分子亚型,构建基于parthanatos的预后评分系统,并实验验证SLC2A3对肿瘤细胞增殖和侵袭的促进作用 | 体外实验发现SLC2A3可能促进结肠腺癌细胞增殖和侵袭,但需要在其他模型中进行验证 | 阐明parthanatos在结肠腺癌中的临床相关性,并提供新的预后评估和治疗靶向框架 | 结肠腺癌患者 | 机器学习 | 结肠腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | TCGA和GEO队列的多个样本 | Illumina | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 7116 | 2026-04-27 |
Reappraisal of profibrotic phenotype and cell-cycle state of renal tubular epithelium after ischemia-reperfusion injury
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0347835
PMID:42030280
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研究论文 | 重新评估肾小管上皮细胞在缺血再灌注损伤后的促纤维化表型和细胞周期状态 | 发现肾小管上皮细胞的促纤维化表型并非仅由G2/M期阻滞细胞获得,正常细胞周期中的静息G0/G1期细胞也可获得此表型 | 基于小鼠模型和体外实验,可能不完全代表人类慢性肾病的复杂病理过程 | 探究肾小管上皮细胞在缺血再灌注损伤后促纤维化表型与细胞周期阻滞的关系,并为慢性肾病治疗提供新思路 | 肾小管上皮细胞 | 机器学习 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序、体外细胞实验 | NA | 基因表达数据 | γGT.Fucci2aR小鼠单侧缺血再灌注损伤模型;人肾-2细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 使用公开的小鼠单细胞RNA测序数据 |
| 7117 | 2026-04-25 |
Identification and multi-layered experimental validation of feature genes related to butyrate metabolism and oxidative stress in sepsis
2026-Dec, Artificial cells, nanomedicine, and biotechnology
DOI:10.1080/21691401.2026.2658990
PMID:42028810
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研究论文 | 该研究鉴定了与败血症中丁酸代谢和氧化应激相关的特征基因,并通过多层面实验验证了其表达和诊断价值 | 首次系统鉴定败血症中丁酸代谢和氧化应激相关的特征基因,并利用单细胞RNA测序揭示单核细胞在其中的关键作用 | 尚未提及具体限制,但可能存在样本量有限和机制研究不够深入的问题 | 阐明败血症中丁酸代谢和氧化应激相关基因的分子特征,寻找潜在治疗靶点 | 败血症相关基因、丁酸代谢和氧化应激相关基因 | 机器学习 | 败血症 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、CIBERSORT免疫浸润分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞数据 | 多个败血症相关数据集及前瞻性收集的临床样本 | Illumina | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | 未提供具体配置详情 |
| 7118 | 2026-04-25 |
Erchen decoction and its active flavonoids hesperidin and quercetin alleviate high-fat diet-induced neuroinflammation by targeting HK2-mediated microglial glycolysis
2026-Jul-15, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121603
PMID:41921767
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研究论文 | 本研究系统表征了二陈汤的活性植物化学物质,并阐明了其通过靶向HK2介导的小胶质细胞糖酵解缓解高脂饮食诱导的神经炎症的神经保护机制 | 首次揭示了二陈汤的活性成分橙皮苷和槲皮素通过直接结合并抑制己糖激酶2(HK2)、阻断HK2/HIF-1α轴、抑制小胶质细胞Warburg效应,从而缓解高脂饮食诱导的神经炎症的机制,将中医传统“化痰”理论与脑代谢稳态恢复相关联 | NA | 研究二陈汤的神经保护机制,特别是其对肥胖相关神经炎症的调控作用 | 二陈汤及其活性成分橙皮苷和槲皮素对高脂饮食小鼠神经炎症和小胶质细胞糖代谢的影响 | 机器学习 | NA | UPLC-MS,单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟,酶活性检测 | NA | 代谢组学数据,单细胞RNA测序数据 | 雄性C57BL/6J小鼠(数量未在摘要中指定) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7119 | 2026-04-25 |
SLC28A1 inhibits clear cell renal cell carcinoma progression by affecting arachidonic acid metabolism: A novel nucleoside transporter-based targeted therapy strategy
2026-Jul-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218481
PMID:41946263
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研究论文 | 本研究探讨SLC28A1通过影响花生四烯酸代谢抑制肾透明细胞癌进展的机制,并提出基于核苷转运体的靶向治疗策略 | 首次发现SLC28A1作为关键核苷转运体通过调控PLA2G12A介导的MAPK信号通路影响花生四烯酸代谢促进铁死亡,并开发了靶向纳米递送系统增强药物疗效 | 未提及研究的具体局限性 | 评估核苷转运体在肾透明细胞癌中的预后作用,阐明关键转运体的抑癌机制,并开发靶向治疗策略 | 肾透明细胞癌(ccRCC) | 机器学习 | 肾癌 | NA | NA | 转录组数据、单细胞测序数据、临床病理数据 | TCGA数据库中的肾透明细胞癌样本(具体数量未提及) | NA | NA | NA | NA |
| 7120 | 2026-04-25 |
Targeting the NSUN5-circPPAP2A axis reverses immunosuppression and sensitizes renal cell carcinoma to anti-PD-1 therapy
2026-Jul-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218466
PMID:41967697
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研究论文 | 揭示NSUN5-circPPAP2A轴在肾透明细胞癌中通过调控HIF-2α信号和免疫抑制微环境导致治疗抵抗,并证明靶向该轴可增强抗PD-1疗效 | 首次发现circRNA的m5C修饰通过NSUN5/circPPAP2A/YBX1轴协同激活HIF-2α信号和诱导免疫抑制,区别于以往仅关注mRNA的研究 | 未在更大规模队列或不同种族人群中验证,且纳米颗粒递送系统的临床转化可行性尚需进一步评估 | 阐明肾透明细胞癌中circRNA的m5C修饰机制及其临床意义,探索克服HIF-2α靶向治疗和免疫治疗双重耐药的新策略 | 肾透明细胞癌患者临床样本、细胞系、小鼠模型 | 机器学习 | 肾癌 | m5C-MeRIP-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RIP, RNA pull-down, ChIP-qPCR | NA | 基因表达数据, 测序数据 | 临床样本(TCGA、ICGC队列及SYSU队列) | Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Illumina NovaSeq | NA |