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当前共找到 7432 篇文献，本页显示第 7061 - 7080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7061 | 2026-01-17 |
Adaptive multi-view information bottleneck for multi-omics data clustering
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf717
PMID:41527852
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研究论文 | 本文提出了一种基于信息瓶颈原理的自适应多视图聚类框架（scAMVIB），用于解决多组学数据聚类任务 | 利用信息瓶颈原理学习多视图组学表示，同时捕获组学间关联和组学特定模式，并通过自适应权重分配优化聚类性能 | NA | 解决多组学数据聚类中互补信息有效整合与权重分配的挑战 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 自适应多视图信息瓶颈框架 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学 | NA | NA |
| 7062 | 2026-01-17 |
CSRefiner: a lightweight framework for fine-tuning cell segmentation models with small datasets
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf718
PMID:41527855
|
研究论文 | 本文提出了一个名为CSRefiner的轻量级框架，用于在小数据集上微调细胞分割模型，以提升全组织单细胞空间表达分析的精度 | CSRefiner是一个轻量级且高效的微调框架，支持微调空间组学领域广泛使用的分割模型，并能在标注数据非常有限的情况下实现高精度，同时兼容多种主流模型 | 未在摘要中明确说明 | 解决现有微调方法通常需要大量重新训练或局限于特定模型架构的问题，为实际应用中的全组织单细胞空间表达分析提供一种实用解决方案 | 细胞分割模型 | 数字病理学 | NA | 空间组学技术 | 深度学习分割模型 | 图像（核或膜染色图像） | 小数据集（具体数量未在摘要中说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7063 | 2026-01-17 |
Integrating single-cell and bulk transcriptomes identifies B cell features associated with neoadjuvant chemoradiotherapy sensitivity in rectal cancer
2026-Jan-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-31068-0
PMID:41484196
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，识别了与直肠癌新辅助放化疗敏感性相关的B细胞亚群及其特征基因 | 应用Scissor算法整合单细胞RNA-seq和批量转录组数据，首次在直肠癌中鉴定出与nCRT反应相关的特定B细胞亚群，并基于此开发了机器学习预测模型 | 研究样本量有限，验证队列仅64例样本，且未进行实验验证B细胞亚群的功能机制 | 探究B细胞在直肠癌新辅助放化疗反应中的作用，并开发预测模型 | 直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 直肠癌 | 单细胞RNA-seq，批量转录组测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 未明确总样本数，验证队列包含64例样本 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 7064 | 2026-01-17 |
Chronic Alcohol Consumption Enhances the Differentiation Capacity of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells into Osteoclast Precursors
2026-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.06.010
PMID:40683559
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研究论文 | 本研究探讨了长期酒精摄入如何增强造血干细胞和祖细胞向破骨细胞前体分化的能力，揭示了酒精导致骨密度降低和骨骼脆性的机制 | 首次在恒河猴模型中结合谱系流式细胞术和单细胞RNA测序，系统分析了长期酒精摄入对造血干细胞和祖细胞向破骨细胞分化能力的影响，并识别了相关的转录组和表观遗传变化 | 研究基于动物模型，结果可能不完全适用于人类；样本量未明确说明，可能影响统计效力；未探讨长期酒精摄入对其他骨细胞类型的影响 | 探究长期酒精摄入如何通过影响造血干细胞和祖细胞的分化能力，导致骨密度降低和骨骼疾病 | 恒河猴模型中的造血干细胞和祖细胞及其分化的单核细胞/巨噬细胞和破骨细胞前体 | 单细胞组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序，谱系流式细胞术，集落形成单位分析，抗酒石酸酸性磷酸酶染色 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据，功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7065 | 2026-01-17 |
Decoding innate lymphoid cell heterogeneity and plasticity in colorectal cancer
2026-Jan, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70593
PMID:41527493
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了结直肠癌中固有淋巴样细胞的异质性、可塑性及其在肿瘤微环境中的功能 | 揭示了肠道固有淋巴样细胞的两个不同起源，并发现骨髓来源的ILC2s在三级淋巴结构中富集，支持B细胞成熟，与更好的临床预后和免疫治疗反应相关 | NA | 阐明结直肠癌中固有淋巴样细胞的起源、异质性和功能，及其对疾病进展和治疗效果的影响 | 固有淋巴样细胞（ILCs）在结直肠癌中的角色 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 体外共培养, 批量RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据, 免疫荧光图像, 批量RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 来自多个组织（骨髓、血液和肠道）的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7066 | 2026-01-17 |
Network models for bridging denoising and identifying spatial domains of spatially resolved transcriptomics
2026-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013867
PMID:41529048
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研究论文 | 本文提出了一种名为stACN的集成网络模型，用于联合去噪空间转录组数据并识别空间域 | 首次通过图噪声模型学习干净的双细胞网络，并利用联合张量分解提取兼容的细胞特征，实现了去噪与空间域识别的统一框架 | 未明确说明模型对特定噪声类型或组织复杂度的适应性限制 | 解决空间转录组数据中技术噪声干扰与空间域识别分离处理导致的性能限制问题 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 图神经网络、张量分解 | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7067 | 2026-01-16 |
Unveiling CDKN1A and RELA: Machine learning-driven aging biomarkers for precision diagnosis and therapy in knee osteoarthritis
2026-Mar, Journal of orthopaedics
IF:1.5Q3
DOI:10.1016/j.jor.2025.11.045
PMID:41536554
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研究论文 | 本研究通过整合转录组数据和机器学习方法，鉴定出CDKN1A和RELA作为膝骨关节炎中下调的生物标志物，并进行了实验验证 | 首次结合多数据集、多种机器学习算法（LASSO、SVM-RFE、随机森林）和单细胞RNA测序分析，系统性地识别膝骨关节炎中与衰老相关的核心生物标志物，并探索其与免疫细胞浸润、代谢通路及潜在治疗化合物（姜黄素）的关联 | 研究主要基于公共数据集和生物信息学分析，实验验证仅在动物模型中进行，缺乏大规模临床样本验证；机器学习模型的泛化能力有待进一步在不同队列中验证 | 系统识别膝骨关节炎中与衰老相关的生物标志物，以用于精准诊断和治疗 | 膝骨关节炎（KOA）相关的基因表达数据、衰老相关基因、小鼠KOA模型 | 机器学习 | 骨关节炎 | 基因表达分析、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、分子对接、qRT-PCR、Western blotting | LASSO回归、SVM-RFE、随机森林 | 基因表达数据（微阵列、RNA-seq）、单细胞RNA测序数据 | 两个公共基因表达数据集（GSE12021、GSE169077）和一个单细胞RNA测序数据集（GSE176308），以及小鼠KOA模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7068 | 2026-01-16 |
Tumor-initiating stem cells fine-tune the plasticity of neutrophils to sculpt a protective niche
2026-Jan-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.11.001
PMID:41349542
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了肿瘤起始干细胞如何通过调节中性粒细胞的塑性，塑造保护性微环境以影响癌症免疫治疗疗效 | 首次发现SOX2肿瘤起始干细胞通过Fads1-AA-PGE信号通路调节中性粒细胞的塑性，从而影响免疫治疗响应 | 研究主要聚焦于鳞状细胞癌，其他癌症类型中的类似机制尚未验证 | 探究肿瘤相关中性粒细胞异质性及其在癌症免疫治疗中的作用机制 | 肿瘤相关中性粒细胞和SOX2肿瘤起始干细胞 | 数字病理学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 遗传操作 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7069 | 2026-01-16 |
Tumor-infiltrating bacteria disrupt cancer epithelial cell interactions and induce cell-cycle arrest
2026-Jan-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.09.010
PMID:41106380
|
研究论文 | 本文揭示了肿瘤浸润细菌通过破坏上皮细胞接触诱导细胞周期停滞，从而促进化疗耐药性的机制 | 首次通过空间成像和单细胞空间转录组学证明胞外细菌在肿瘤微生态位中的定位及其诱导癌细胞静止和免疫逃逸表型的作用 | 研究主要基于结直肠癌和口腔癌模型，在其他癌症类型中的普适性有待验证，且患者队列规模有限 | 探究肿瘤浸润细菌如何调节癌症进展和治疗耐药性 | 结直肠癌和口腔癌中的肿瘤浸润细菌（如具核梭杆菌）及癌细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间成像、单细胞空间转录组学、活细胞成像、空间分析、小鼠模型、转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 52名结直肠癌患者队列及独立直肠癌队列 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 7070 | 2026-01-16 |
A standardized approach for the isolation of vascular smooth muscle cells from carotid atherosclerotic plaques
2026-Jan-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-24161-x
PMID:41519833
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研究论文 | 本文优化了一种从人类颈动脉粥样硬化斑块中分离高活性血管平滑肌细胞的酶消化方案，并通过单细胞转录组分析验证了其有效性 | 开发了一种简化的酶消化方案，能够高效分离高活性的血管平滑肌细胞，适用于单细胞研究，并通过单细胞RNA测序验证了细胞身份和表型转换 | 样本量较小，仅涉及四个颈动脉斑块（两个稳定和两个不稳定），且来自特定患者群体，可能限制结果的普遍性 | 优化从人类颈动脉粥样硬化斑块中分离血管平滑肌细胞的方案，以支持下游细胞培养分析和单细胞研究 | 人类颈动脉粥样硬化斑块中的血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | Harmony集成分析、伪时间轨迹推断 | 单细胞转录组数据 | 四个颈动脉斑块（两个稳定、两个不稳定），来自男性和女性患者，共23,661个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10X Genomics Chromium | 10X Genomics Chromium平台用于单细胞RNA测序 |
| 7071 | 2026-01-16 |
Loss of E3 ligase Ube4A Disrupts Colon Homeostasis and Accelerates Experimental Colitis via Altered Lipid Handling
2026-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.02.697430
PMID:41502940
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研究论文 | 本研究揭示了E3泛素连接酶Ube4A在维持结肠稳态中的关键作用，其缺失会通过改变脂质处理过程加剧实验性结肠炎 | 首次阐明了Ube4A在胃肠道中的生理功能，并发现其缺失会导致结肠上皮应激和脂质代谢重编程，从而增加对炎症损伤的敏感性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本分析依赖于公开的单细胞RNA测序数据集，需要进一步在人类组织中进行验证 | 明确Ube4A在结肠中的功能，并确定其缺失如何影响实验性结肠炎的易感性 | 人类结肠组织（健康个体和IBD患者）、全局Ube4A敲除小鼠 | 单细胞组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、组织图像、流式细胞数据 | 未明确具体样本数量，使用了公开的人类单细胞RNA测序数据集和Ube4A敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7072 | 2026-01-16 |
scSurv: a deep generative model for single-cell survival analysis
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf671
PMID:41429574
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scSurv的深度生成模型，用于单细胞生存分析，旨在量化单个细胞对临床结果的异质性影响 | 首次将Cox比例风险模型与单细胞转录组深度生成模型结合，在单细胞分辨率下揭示细胞异质性如何影响癌症患者生存 | 未明确说明模型在更大规模或更复杂疾病类型中的泛化能力限制 | 开发一种方法以在单细胞水平上分析细胞异质性对患者生存的影响 | 单细胞转录组数据，涉及癌症（如黑色素瘤、肾细胞癌）和传染病 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞转录组测序 | 深度生成模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7073 | 2026-01-16 |
Single-Cell Analysis Combined with Mendelian Randomization Identifies Genes Associated with Prostate Cancer Cells
2026-Jan, The world journal of men's health
DOI:10.5534/wjmh.240298
PMID:40583027
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序数据与孟德尔随机化分析，识别了与前列腺癌细胞相关的基因，特别是TMEM59在疾病进展中的潜在作用 | 首次结合单细胞测序与孟德尔随机化分析来识别前列腺癌预后相关基因，并验证了TMEM59作为保护性因子的功能 | 样本量较小（仅6例前列腺癌病例），且依赖于公共数据库数据，可能限制结果的普遍性 | 研究前列腺癌包膜侵犯相关的预后基因 | 前列腺癌细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序, 孟德尔随机化分析, 免疫组织化学, 细胞功能实验 | hdWGCNA, Seurat, Cox回归 | 单细胞RNA-seq数据, SNP数据, 临床数据 | 6例前列腺癌病例的单细胞数据，以及TCGA和GEO的临床与基因表达数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7074 | 2026-01-15 |
Single-cell and spatial profiling highlights TB-induced myofibroblasts as drivers of lung pathology
2026-03-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20251067
PMID:41489684
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了结核病诱导的肌成纤维细胞作为肺病理驱动因素的关键作用 | 首次在结核病研究中结合单细胞RNA测序和空间转录组学，识别出MMP1+CXCL5+成纤维细胞亚群作为疾病严重程度和细菌负荷的关联因素，并揭示了其与SPP1+巨噬细胞的相互作用网络 | 研究样本量有限，且部分发现依赖于非人灵长类动物模型，需进一步在更大规模人类队列中验证 | 探究结核病肺免疫病理的细胞驱动因素 | 结核病感染者和未感染者的肺组织 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 来自结核病感染者和未感染者的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7075 | 2026-01-15 |
Machine learning and multi-omics integration identifies immunological predictors and mechanistic insights in autoimmune encephalitis
2026-Jan-14, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02180-8
PMID:41533076
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研究论文 | 本研究利用免疫指标和机器学习算法开发了自身免疫性脑炎的预后预测模型，并通过多组学方法探讨了核磷蛋白1在疾病发病机制中的潜在作用 | 首次整合了临床免疫指标、多种机器学习算法、SHAP可解释性分析、单细胞RNA测序、空间转录组学和表型全基因组关联研究，构建了可解释的预后预测模型并提出了新的潜在治疗靶点 | PAIA治疗的证据仅来自单个患者，NPM1作为治疗靶点的安全性仍需进一步验证，PheWAS仅为初步安全性评估 | 开发自身免疫性脑炎的预后预测模型并探索疾病发病机制 | 抗体阳性自身免疫性脑炎患者及实验性自身免疫性脑脊髓炎模型 | 机器学习 | 自身免疫性脑炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 表型全基因组关联研究 | RF, XGBoost, LGBM | 临床免疫指标数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 | 未明确患者数量，包含独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7076 | 2026-01-15 |
D-Mannose-Modified M2 Macrophage Membrane-Derived Decoy Nanovesicles for Synergistic Immunotherapy of Asthma
2026-Jan-13, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c04996
PMID:41441854
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研究论文 | 本研究开发了一种基于M2巨噬细胞膜的纳米诱饵，用于协同免疫治疗哮喘 | 利用M2巨噬细胞膜衍生的纳米诱饵高效捕获多种2型细胞因子，并通过D-甘露糖修饰增强细胞因子清除，实现协同免疫抑制 | 研究基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 开发一种针对哮喘的纳米技术免疫疗法 | 哮喘（特别是嗜酸性粒细胞性哮喘） | NA | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7077 | 2026-01-15 |
Single-cell integration and multi-modal profiling reveals phenotypes and spatial organization of neutrophils in colorectal cancer
2026-Jan-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.12.003
PMID:41529665
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研究论文 | 本研究通过单细胞整合与多模态分析，揭示了结直肠癌中中性粒细胞的表型、空间组织及其在肿瘤微环境中的免疫调节作用 | 构建了包含427万单细胞的大规模图谱，结合空间转录组学和蛋白质谱数据，首次识别出具有抗原呈递特性的中性粒细胞亚群，并揭示了KRAS依赖的中性粒细胞促肿瘤极化及IL-1信号介导的中性粒细胞-成纤维细胞相互作用 | NA | 探究结直肠癌肿瘤微环境中免疫细胞的组成、表型及空间相互作用，以理解其对治疗反应的影响 | 结直肠癌患者样本中的单细胞，包括中性粒细胞等免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质谱分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质数据 | 1,670例患者样本（含4.27百万单细胞），补充了266例患者的单细胞谱，以及3.7百万细胞的空间转录组和0.7百万细胞的蛋白质谱 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 7078 | 2026-01-15 |
Identification of Crohn's disease subtypes in single-cell RNA sequencing signatures of treatment-naive samples across the pediatric gastrointestinal tract
2026-Jan-09, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaf225
PMID:41369126
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在未接受治疗的儿童克罗恩病患者中，识别了跨胃肠道多个区域的疾病亚型 | 开发了聚类稳定性评估工作流程以确保结果的稳健性，并首次在未治疗儿科队列中应用张量分解技术来识别疾病亚型 | 研究样本仅限于未接受治疗的儿童患者，且炎症对细胞比例的影响因供体和组织异质性而较弱 | 研究克罗恩病的发病机制，识别疾病亚型以推动个性化医疗 | 未接受治疗的儿童克罗恩病患者的回肠、结肠和直肠活检样本 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | 张量分解 | 单细胞转录组数据 | 一个未治疗儿科克罗恩病队列的多个胃肠道区域活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7079 | 2026-01-15 |
A co-evolutionary perspective on humans and Mycobacterium tuberculosis in the era of systems biology
2026-Jan-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.108175
PMID:41499279
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综述 | 本文从系统生物学的角度探讨了人类与结核分枝杆菌的共进化关系，强调了宿主-病原体相互作用的复杂性 | 提出单一免疫机制研究阻碍进展，倡导采用系统生物学方法（如单细胞和空间转录组学）来全面理解结核病的多路径发病机制 | 未具体说明如何在实际研究中整合这些新兴方法以克服现有分析的缺陷 | 理解人类与结核分枝杆菌在共进化背景下的宿主-病原体相互作用，以推动结核病防控 | 人类与结核分枝杆菌（Mtb）的共进化关系及免疫学过程 | 系统生物学 | 结核病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7080 | 2026-01-15 |
Cigarette smoke-mediated YTHDC2 suppression drives macrophage senescence and a tumor-promoting microenvironment in lung cancer
2026-Jan, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.70068
PMID:41292214
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研究论文 | 本研究揭示了香烟烟雾通过抑制m6A阅读器YTHDC2诱导巨噬细胞衰老，从而在肺癌中形成促肿瘤微环境的机制 | 首次发现YTHDC2在香烟烟雾诱导的巨噬细胞衰老及促肿瘤微环境形成中的关键调控作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探究香烟烟雾如何通过调控YTHDC2影响巨噬细胞功能及肺癌微环境 | 肺癌组织、巨噬细胞、香烟烟雾暴露模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 吸烟者与非吸烟者的肺癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |