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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7061 | 2026-04-30 |
Integrated single-cell transcriptomics and proteomics elucidate the molecular mechanisms and detoxification strategy of rifampicin-induced hepatotoxicity
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.109757
PMID:41362738
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研究论文 | 整合单细胞转录组学和蛋白质组学揭示了利福平诱导肝毒性的分子机制及解毒策略 | 首次结合单细胞RNA测序、批量RNA测序和基于质谱的蛋白质组学与代谢组学,系统揭示利福平诱导肝毒性的区域特异性肝细胞损伤机制,并发现维甲酸具有潜在治疗作用 | 基于小鼠模型,结论向人类转化的适用性需进一步验证 | 阐明利福平诱导肝毒性的细胞和分子机制,并寻找高效低毒的治疗干预措施 | 利福平诱导肝毒性的小鼠模型 | 机器学习 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 质谱蛋白质组学, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据 | 小鼠肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7062 | 2026-04-30 |
Integrated Machine Learning and Multi-Omics Analysis Identifies Mitophagy-Related Core Genes and Mechanisms in Non-Alcoholic Fatty Liver Disease
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S575586
PMID:41907204
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研究论文 | 通过整合机器学习和多组学分析,系统筛选非酒精性脂肪肝病(NAFLD)中线粒体自噬相关核心基因及其调控网络和免疫微环境机制 | 首次结合11种机器学习算法和SHAP模型可解释性分析,从多转录组和单细胞数据中筛选NAFLD线粒体自噬核心基因,并深入解析其与免疫微环境重塑的关联 | 缺乏大规模临床队列验证,体外实验仅使用细胞模型,未在动物体内验证核心基因功能及靶向治疗潜力 | 阐明NAFLD中线粒体自噬相关核心基因的分子调控网络及其在免疫微环境中的功能机制,为疾病诊断和治疗提供新靶点 | 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)患者的转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 非酒精性脂肪肝病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 机器学习, SHAP模型解释, 分子对接, Western Blot, qRT-PCR, JC-1染色 | WGCNA, 11种机器学习算法, SHAP | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个NAFLD转录组数据集(GEO数据库)及单细胞RNA测序数据,具体样本数量未明确 | NA | NA | NA | NA |
| 7063 | 2026-04-30 |
ECM remodeling features in reparative chondrocytes during knee osteoarthritis
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1773139
PMID:42051458
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据整合分析,揭示膝关节骨关节炎中修复性软骨细胞的细胞外基质重塑特征 | 首次从伪时间轨迹框架揭示KOA中修复性软骨细胞(RepC)在ECM重塑中的动态变化,并验证FN1和TGF-β1信号对其诱导作用 | 依赖公开数据集,体外实验仅验证部分信号通路,未在体内模型中验证RepC的功能 | 阐明膝关节骨关节炎中修复性软骨细胞的ECM重塑特征及其动态转变机制 | 人类膝关节软骨细胞(对照和KOA样本) | 单细胞转录组学 | 膝关节骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个公开单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7064 | 2026-04-30 |
The inhibitory effect of hepatic cancer energy metabolism on immune checkpoint therapy: perspectives from single-cell multi-omics analysis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1753670
PMID:42051493
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析研究肝细胞癌免疫检查点抑制剂治疗后代谢重编程,尤其是丙酮酸代谢变化,并构建代谢相关预后模型及评估LDHA靶向治疗潜力 | 首次从单细胞多组学层面揭示免疫检查点抑制剂治疗后肝癌细胞丙酮酸代谢重编程(LDHA上调)及其对免疫治疗耐药的影响,并验证LDHA抑制剂与PD-1抗体联合治疗的抗肿瘤效果 | 研究基于公共数据集和体外/体内实验,样本量和临床验证有限,且未深入探讨代谢重编程导致免疫耐药的具体分子机制 | 探究肝细胞癌免疫检查点抑制剂治疗前后的代谢重编程(尤其是丙酮酸代谢),构建预后模型并评估LDHA靶向治疗潜力 | 肝细胞癌肿瘤组织样本(GEO和Mendeley数据库来源的单细胞RNA-seq数据)及Huh7肝癌细胞系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | Cox回归, Lasso回归 | 基因表达数据, 文本 | GEO和Mendeley数据库中的单细胞RNA-seq样本,数量未明确说明;TCGA队列用于预后模型构建;Huh7细胞系用于体外实验,异种移植模型用于体内实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7065 | 2026-04-30 |
Genome to single-cell characterization of the MAPK family in bighead carp (Hypophthalmichthys nobilis) spleen during Aeromonas hydrophila challenge
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1777786
PMID:42051520
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研究论文 | 对大头鲤MAPK家族进行基因组到单细胞水平的表征,并探索其在嗜水气单胞菌感染下的脾脏免疫反应 | 首次在24个物种中比较基因组分析MAPK家族,并利用单细胞RNA测序揭示大头鲤脾脏中对细菌感染的早期免疫应答中mapk6和mapk11的潜在作用 | 未明确讨论局限性 | 解析大头鲤MAPK家族基因组组成及在细菌感染中的转录响应 | 大头鲤(Hypophthalmichthys nobilis)的脾脏组织及分离的细胞 | 数字病理学 | 鱼类细菌性疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 加权基因共表达网络分析, 细胞间通讯分析, 假时间分析 | NA | 基因序列、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 来自大头鲤脾脏的28,348个细胞 | Illumina(推断) | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | Illumina NovaSeq(推断) | 单细胞RNA测序(具体平台未提及) |
| 7066 | 2026-04-30 |
NR2F2 in cancer-associated fibroblasts drives immune microenvironment remodeling and promotes lung adenocarcinoma progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1776008
PMID:42051516
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研究论文 | 本研究整合单细胞和转录组数据,鉴定出肺癌相关成纤维细胞中驱动免疫微环境重塑并促进肺腺癌进展的NR2F2因子 | 首次通过单细胞RNA测序和体外实验验证NR2F2在癌症相关成纤维细胞中通过协同增强TGF-β信号和EMT过程促进肿瘤恶性进展,并构建了有效的预后模型 | 未具体提及局限性 | 探索肺腺癌中癌症相关成纤维细胞的功能异质性及其驱动肿瘤进展的分子机制 | 肺腺癌患者的肿瘤免疫微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 计算机视觉 | 肺癌 | scRNA-seq, RNA-seq, siRNA敲低, 质粒过表达, CCK-8, EdU标记, Transwell实验 | LASSO-Cox回归 | 单细胞转录组数据, 转录组数据 | 公开数据集包括GEO和TCGA数据,以及独立验证队列GSE72094,未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7067 | 2026-04-30 |
CXCL2 affects macrophage antitumor function and immunotherapy efficacy in esophageal squamous cell carcinoma through calcium signaling
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1695387
PMID:42051510
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research paper | 通过单细胞RNA测序分析发现CXCL2+巨噬细胞与食管鳞状细胞癌免疫治疗反应相关,并通过钙信号影响抗肿瘤功能和免疫治疗效果 | 首次发现巨噬细胞特异性CXCL2作为预测食管鳞状细胞癌免疫治疗疗效的新型生物标志物,并揭示其通过钙信号促进巨噬细胞向免疫激活状态转变的机制 | NA | 鉴定与食管鳞状细胞癌免疫治疗反应相关的关键巨噬细胞亚群 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织及小鼠模型 | machine learning | lung cancer | 单细胞RNA测序, RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | ESCC患者样本数量未明确提及 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7068 | 2026-04-30 |
Exploring immune modulation in osteoarthritis: identifying key biomarkers and the role of PTPRC in regulating immune microenvironment for therapeutic intervention
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1795075
PMID:42051521
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研究论文 | 探索骨关节炎中免疫调节机制,鉴定关键生物标志物及PTPRC在调控免疫微环境中的作用 | 首次通过整合转录组分析、单细胞测序和免疫细胞浸润分析,揭示PTPRC在骨关节炎免疫微环境中的调控作用,为组织工程联合免疫调节治疗提供新靶点 | 研究主要基于数据库分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证和大规模临床样本确认 | 探索骨关节炎免疫相关进展机制并鉴定潜在生物标志物,用于诊断和治疗干预 | 骨关节炎患者关节组织及免疫细胞 | 机器学习 | 骨关节炎 | RNA-seq, 单细胞测序 | XGBoost, 随机森林, 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7069 | 2026-04-30 |
Deciphering the peripheral immune landscape of Alzheimer's disease through integrated multi-omics research and cohort validation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1648591
PMID:42051535
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研究论文 | 通过整合多组学孟德尔随机化和队列验证,解析阿尔茨海默病相关的外周免疫基因失调 | 首次将大规模GWAS、多组织eQTL/mQTL数据、单细胞转录组和临床队列验证相结合,系统鉴定了阿尔茨海默病外周免疫致病基因及其表观遗传调控机制 | NA | 探索阿尔茨海默病相关外周免疫失调的分子驱动因素,以识别致病基因和治疗靶点 | 阿尔茨海默病患者的外周免疫细胞、血液转录组、血浆蛋白质组和脑脊液生物标志物 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | GWAS, eQTL, mQTL, 单细胞RNA测序, 全转录组关联研究 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据、蛋白质组数据、临床测量数据 | GWAS荟萃分析涵盖894710例样本;ADNI队列包含基因表达、脑脊液生物标志物、认知测量、免疫细胞谱和血浆蛋白质组数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7070 | 2026-04-30 |
Dyslipidemia is associated with monocyte lipid metabolic reprogramming in Guillain-Barré syndrome
2026, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2026.1797582
PMID:42051772
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研究论文 | 研究吉兰-巴雷综合征中血脂异常与单核细胞脂质代谢重编程的关系 | 首次揭示GBS中血脂异常与外周血单核细胞亚群脂质代谢重编程的协同作用,并鉴定CEBPB为核心转录因子调控这一过程 | 仅基于已有单细胞RNA测序数据集,未进行进一步实验验证转录因子功能 | 探索GBS中循环血脂异常与单核细胞免疫代谢重塑的内在联系及潜在机制 | 吉兰-巴雷综合征患者和健康对照者的外周血单核细胞 | 机器学习 | 吉兰-巴雷综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 序列数据 | 163例GBS患者和169例健康对照的临床数据,以及公开的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7071 | 2026-04-29 |
Extracellular vesicle-mediated transcellular mitophagy as a modulatory target for moderate hyperoxia-induced alveolar developmental arrest in bronchopulmonary dysplasia
2026-Jun, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 揭示中度高氧诱导支气管肺发育不良中成纤维细胞通过细胞外囊泡介导的线粒体自噬传递导致肺泡发育停滞的机制 | 首次阐明成纤维细胞通过富含外线粒体膜蛋白VDAC1的细胞外囊泡抑制肺泡上皮细胞线粒体自噬,从而在BPD中发挥关键作用 | NA | 探究中度高氧下成纤维细胞如何参与肺泡发育停滞的机制,为支气管肺发育不良寻找治疗靶点 | 中度高氧诱导的支气管肺发育不良小鼠模型中的成纤维细胞和II型肺泡上皮细胞 | 数字病理学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, 细胞外囊泡分析 | NA | 基因表达数据, 图像 | 中度高氧(60%氧气)暴露的BPD小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7072 | 2026-04-29 |
Advancing single-cell omics and cell-based therapeutics with quantum computing
2026-May, Nature reviews. Molecular cell biology
DOI:10.1038/s41580-025-00918-0
PMID:41478876
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综述 | 探讨量子计算在单细胞组学和基于细胞的治疗中的进展与挑战,通过高分辨率检测与先进计算工具整合,构建细胞行为的精准模型 | 首次系统阐述量子计算如何协同人工智能,解决单细胞分析中捕获细胞动态的计算瓶颈,并提出与基于细胞治疗的整合路径 | 作为路线图文章,未提供实验验证或具体算法实现,主要基于理论探讨和案例研究 | 探索量子计算在单细胞空间转录组学和多组学技术中的应用,推动细胞行为模型的变革 | 单细胞和细胞群体行为模型、基于细胞的治疗策略 | 机器学习 | NA | 单细胞测序、空间转录组学、多组学技术 | NA | 单细胞组学数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、单细胞多组学 | NA | NA |
| 7073 | 2026-04-29 |
Cross-platform transcriptomic data integration identifies an overactive neuro-immune signature in human osteoarthritis synovium
2026-Apr, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.08.013
PMID:40889615
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研究论文 | 通过跨平台转录组数据整合,识别出人类骨关节炎滑膜中过度活跃的神经免疫信号特征 | 首次通过跨平台统计整合多个公开数据集,系统性地表征骨关节炎滑膜的转录表型,并聚焦于与疼痛相关的信号通路 | 研究基于公共数据集,样本量有限(153例受试者),且仅关注终末期骨关节炎,未纳入早期或中度病变 | 表征骨关节炎滑膜的转录表型,重点关注与疼痛相关的神经免疫信号 | 人类非骨关节炎和骨关节炎滑膜组织样本 | 机器学习 | 骨关节炎 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 153例受试者(质量控后139例) | Illumina | bulk RNA-seq | Illumina NovaSeq | 来自GEO数据库的多个微阵列和RNA测序数据集 |
| 7074 | 2026-04-29 |
Evaluating the Diagnostic Value and Molecular Mechanism of Energy Metabolism-Related Gene PEA15 in Sepsis
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S556793
PMID:41907205
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研究论文 | 通过机器学习与单细胞RNA测序评估能量代谢相关基因PEA15在脓毒症中的诊断价值及分子机制 | 首次结合机器学习和单细胞RNA测序技术,鉴定能量代谢相关基因PEA15在脓毒症中的诊断潜力,并揭示其与免疫细胞浸润及核心基因网络的关系 | 未明确说明潜在局限性(如样本数量、验证队列不足等) | 探索脓毒症中能量代谢相关基因的诊断价值及分子机制,为早期诊断和治疗提供新靶点 | 脓毒症患者基因表达数据及单细胞RNA测序样本 | 机器学习 | 脓毒症 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | GSE65682和GSE95233数据集(具体样本数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7075 | 2026-04-29 |
Neutrophil-Specific Biomarker S100A2 Mediates Diabetic Foot Ulcer Through IL-17 Signaling Pathway and Potential Therapeutics
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S577432
PMID:41907219
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析糖尿病足溃疡的免疫微环境,发现中性粒细胞特异性生物标志物S100A2及其通过IL-17信号通路的作用机制和潜在治疗药物 | 首次鉴定出S100A2作为与IL-17信号通路关联的中性粒细胞特异性生物标志物,填补了糖尿病足溃疡发病机制中特定基因-免疫细胞相互作用的空白 | 主要基于公开数据库的生物信息学分析,缺乏大规模临床样本验证,药物预测需要进一步的实验验证 | 探索糖尿病足溃疡的免疫微环境特征及其中性粒细胞特异性生物标志物的作用机制,寻找潜在治疗策略 | 糖尿病足溃疡患者与糖尿病足部皮肤样本的免疫细胞和基因表达数据 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 定量实时聚合酶链反应 | 加权基因共表达网络分析, CIBERSORT, Seurat | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据集 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7076 | 2026-04-29 |
Exploring Centrosome Amplification-Associated Biomarkers in Osteoarthritis Through Bioinformatics and Experimental Approaches
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S576712
PMID:41907222
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研究论文 | 通过生物信息学和实验方法探索骨关节炎中与中心体扩增相关的生物标志物 | 首次将中心体扩增相关基因与骨关节炎联系起来,通过整合差异表达分析、WGCNA、孟德尔随机化、ROC曲线及单细胞RNA测序等多种方法,鉴定出PLK2和SUN2两个潜在生物标志物,并构建了高预测准确度的列线图模型 | 未明确说明 | 识别骨关节炎中中心体扩增相关基因作为潜在生物标志物 | 骨关节炎患者的转录组数据和临床标本 | 生物信息学 | 骨关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 7077 | 2026-04-29 |
CPEB1 drives ferroptosis-neuroinflammation crosstalk in temporal lobe epilepsy via the SIRT1-NRF2 acetylation axis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1727784
PMID:41909681
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研究论文 | CPEB1通过SIRT1-NRF2乙酰化轴驱动颞叶癫痫中铁死亡与神经炎症的交互作用 | 首次揭示CPEB1通过调节SIRT1-NRF2乙酰化轴促进铁死亡-神经炎症交互作用在颞叶癫痫中的机制 | 未明确说明,但研究主要基于模型验证,可能需更多临床验证 | 探究CPEB1在颞叶癫痫中铁死亡与神经炎症交互作用中的分子机制 | 人类颞叶癫痫患者和海马组织、小鼠模型(KA/PTZ诱导)及体外谷氨酸诱导的神经元损伤模型 | 神经科学 | 颞叶癫痫 | 单细胞转录组学、批量RNA测序、生物信息学分析、腺相关病毒(AAV)介导的过表达与敲低、药物调控 | NA | 转录组数据 | 人类颞叶癫痫患者组织样本及小鼠模型(数量未具体说明) | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 7078 | 2026-04-29 |
Machine learning meets psoriasis: identifying key lactylation biomarkers as potential targets for diagnosis and therapies
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1791693
PMID:41909697
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研究论文 | 该研究通过机器学习识别银屑病中与乳酰化相关的关键生物标志物,为诊断和治疗提供潜在靶点 | 首次将机器学习算法(随机森林和LASSO回归)与乳酰化基因结合,鉴定出MPHOSPH6、ENO1、MKI67和FABP5作为银屑病诊断和治疗的新型生物标志物,并通过孟德尔随机化分析揭示了其因果关联 | 研究主要基于公开数据库分析和动物模型验证,缺乏大规模临床样本的验证 | 识别银屑病中与乳酰化相关的生物标志物,探索其在诊断和治疗中的潜在价值 | 银屑病患者和健康对照的基因表达数据、小鼠银屑病模型 | 机器学习 | 银屑病 | NA | 随机森林、LASSO回归 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7079 | 2026-04-28 |
Spatial Robustness of Prostate Cancer Biomarkers Evaluated by Spatial Transcriptomics
2026-Jun, The Prostate
DOI:10.1002/pros.70164
PMID:41911496
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研究论文 | 利用空间转录组学评估两种患者前列腺癌组织切片中四种预后生物标志物基因的空间稳健性 | 首次通过空间转录组学评估多个预后生物标志物面板(Oncotype DX、Prolaris、Decipher和ProClass)在高度异质的前列腺癌组织中的空间表达模式,并提出“空间稳健”面板概念 | 仅分析两名患者共37个组织切片,样本量小;低丰度基因可能受当前技术限制影响,难以进行稳健空间分析 | 探究空间转录组学在验证和优化前列腺癌预后生物标志物面板中的潜在用途,评估生物标志物基因的空间变异性 | 两名患有局部高等级前列腺癌患者的37个组织切片 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | 加权基因共表达网络分析 | 空间基因表达数据 | 37个组织切片(来自2名患者) | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium Spatial Platform | Visium空间平台 |
| 7080 | 2026-04-28 |
Diminished and Altered Cellular Senescence Response in Delayed Wound Healing of Aging
2026-May, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70493
PMID:42033084
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研究论文 | 研究揭示了衰老小鼠伤口愈合延迟与细胞衰老反应减弱和功能转变相关 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出年轻小鼠伤口中具有促愈合功能的p16/p21/Ki67衰老成纤维细胞亚群,并发现衰老导致该细胞数量减少且功能从促愈合的细胞外基质重塑转向促炎状态 | 未提供具体局限性信息 | 探索细胞衰老反应在老年个体皮肤伤口延迟愈合中的作用机制 | 年轻和老年小鼠的全层背部皮肤伤口组织,以及年轻人类供体的伤口组织 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 年轻和老年小鼠的伤口组织样本,以及年轻人类供体的伤口组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |