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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6901 | 2026-01-24 |
Exploration of Novel Biomarkers Through a Precision Medicine Approach Using Multi-Omics and Brain Organoids in Patients With Atypical Depression and Psychotic Symptoms
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508383
PMID:41173797
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研究论文 | 本研究通过结合临床数据、白细胞单细胞RNA测序、血浆蛋白质组学和脑类器官模型,探索了伴有精神病性症状的非典型抑郁症患者的新型生物标志物 | 首次将白细胞单细胞RNA测序、血浆蛋白质组学和患者来源的脑类器官模型整合到一个精准医学框架中,以揭示该精神疾病亚型的免疫和神经学改变 | 白细胞计数在年龄调整后差异不显著,且研究样本可能有限,需要进一步验证 | 探索伴有精神病性症状的非典型抑郁症的病理生理学机制和新型生物标志物 | 伴有精神病性症状的非典型抑郁症患者 | 精准医学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序、血浆蛋白质组学、脑类器官模型 | 脑类器官模型 | 临床数据、scRNA-seq数据、蛋白质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6902 | 2026-01-24 |
Single-cell transcriptome reveals that immune cells inhibit the repairment of IGFBP3 + stromal cells in thin endometrium
2026-Jan, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2025.153152
PMID:41496196
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学结合组织病理学和多重免疫荧光验证,揭示了薄型子宫内膜(TE)中基质细胞修复受损和促纤维化重塑的协调失调机制 | 首次在单细胞分辨率上系统描绘了TE中基质细胞与免疫细胞的相互作用网络,识别出IGFBP3+基质细胞的修复抑制是TE的核心病理特征,并发现了GZMA-PARD3和APOE-TREM2轴抑制以及LAMA3通路过度激活等新的驱动机制 | 研究样本量相对有限,且主要基于转录组数据,功能验证和机制研究有待进一步深入 | 探究薄型子宫内膜(TE)的病理机制,寻找恢复子宫内膜修复和微环境稳态的治疗靶点 | 薄型子宫内膜(TE)患者的子宫内膜组织 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),多重免疫荧光(TSA),空间转录组验证 | CellChat分析 | 单细胞转录组数据,组织图像数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及薄型子宫内膜患者组织 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 6903 | 2026-01-24 |
Prediction of myeloid malignant cells in Fanconi anemia using machine learning
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0340578
PMID:41557613
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研究论文 | 本研究开发了一种深度神经网络模型,用于预测范可尼贫血患者骨髓样本中是否存在AML样恶性细胞 | 首次将公开的AML患者单细胞RNA-seq数据训练的深度神经网络模型应用于范可尼贫血患者,以单细胞分辨率预测恶性细胞,并揭示了预测细胞中与恶性转化相关的转录特征和免疫逃逸线索 | 模型训练数据来源于公开的AML数据集,可能无法完全代表范可尼贫血患者中出现的所有恶性细胞亚型;需要进一步在更大的范可尼贫血患者队列中进行验证 | 开发一种早期识别范可尼贫血患者骨髓中髓系恶性细胞的机器学习方法,以改善患者监测和临床干预 | 范可尼贫血患者的骨髓样本 | 机器学习 | 范可尼贫血 | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6904 | 2026-01-24 |
Simulated Aeromedical Evacuation Causes Hippocampal Neuronal Damage in Rats With Acute Lung Injury
2026-Jan-01, Military medicine
IF:1.2Q2
DOI:10.1093/milmed/usaf377
PMID:40719041
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研究论文 | 本研究探讨了模拟航空医疗后送对急性肺损伤大鼠海马神经元的影响 | 与以往主要关注肺组织二次损伤的研究不同,本研究首次利用单细胞RNA测序技术分析了模拟航空医疗后送环境下急性肺损伤大鼠海马神经元的损伤机制,并揭示了NRG1/ErbB4信号通路在其中的潜在重要作用 | 研究仅使用大鼠模型,未涉及人类样本,且模拟环境可能无法完全复现实际航空医疗后送的所有复杂因素 | 研究低气压缺氧环境对急性肺损伤大鼠脑组织的影响 | 脂多糖诱导的急性肺损伤Sprague-Dawley大鼠 | NA | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未明确指定样本数量,但使用Sprague-Dawley大鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6905 | 2026-01-23 |
Multi-platform analysis of the tumor immune microenvironment associated with breast cancer subtypes
2026-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2610535
PMID:41530924
|
研究论文 | 本研究通过多平台分析揭示了乳腺癌不同分子亚型之间肿瘤免疫微环境的显著差异 | 首次结合多重免疫组化、单细胞RNA测序和两种反卷积算法,系统比较了PAM50各亚型的免疫景观,并观察到NK细胞和CD8 T细胞在特定亚型中的富集 | 未明确说明样本来源的具体队列特征(如治疗史、分期等),且未进行功能性验证实验 | 探索乳腺癌不同分子亚型与肿瘤免疫微环境特征之间的关联 | 乳腺癌肿瘤组织及其免疫微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多重免疫组化, 单细胞RNA测序, 反卷积算法 | NA | 图像, 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6906 | 2026-01-23 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis Reveals Shared and Cancer-Type-Specific Cellular Interactions and Chemokine Signaling Associated With Tertiary Lymphoid Structures in Colorectal and Gastric Cancers
2026-Feb, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70058
PMID:41252687
|
研究论文 | 本研究整合单细胞和空间转录组学数据,揭示了结直肠癌和胃癌中三级淋巴结构(TLS)的细胞相互作用和趋化因子信号传导机制 | 首次在单细胞和空间分辨率下,系统比较了结直肠癌和胃癌中TLS的细胞互作网络和趋化因子信号,发现了癌症类型特异性的免疫招募回路 | 研究样本量有限,且仅聚焦于结直肠癌和胃癌,未涵盖其他胃肠道恶性肿瘤 | 阐明胃肠道恶性肿瘤中三级淋巴结构的调控机制及其与免疫治疗响应的关联 | 结直肠癌和胃癌组织样本中的三级淋巴结构及相关免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌,胃癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 6907 | 2026-01-23 |
Single-cell profiling of bone metastasis ecosystems reveals pivotal role of INSR+AEC in clear cell renal cell carcinoma
2026-Feb, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102650
PMID:41406889
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序与空间转录组学,揭示了肾透明细胞癌骨转移生态系统中INSR+动脉内皮细胞的关键作用及其与肿瘤细胞的相互作用 | 首次在人类骨转移微环境中定义了INSR+动脉内皮细胞亚群,并发现其通过COL4A1-SDC4信号轴与转移性肿瘤细胞相互作用,提出了新的预后标志物IAERS | 研究主要基于体外实验和计算分析,缺乏体内功能验证,且样本来源可能有限 | 阐明肾透明细胞癌骨转移微环境的细胞和空间结构,寻找可干预的治疗靶点 | 肾透明细胞癌骨转移患者的肿瘤组织和相关细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | 多计算管道整合分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及匹配的单细胞和空间样本以及大规模批量队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6908 | 2026-01-23 |
Exploration of precise classification and therapeutic targets of breast cancer based on genes related to neuro-cancer crosstalk
2026-Feb, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102647
PMID:41406890
|
研究论文 | 本研究基于神经-癌症交互相关基因,探索乳腺癌的精确分类和治疗靶点 | 利用神经-癌症交互相关基因构建预后特征模型,并揭示了由MIF和MDK信号通路主导的神经-免疫-肿瘤交互网络 | 研究主要基于TCGA/GEO数据库的转录组和单细胞数据,需进一步实验验证临床适用性 | 探索乳腺癌中神经-癌症交互的调控机制,并开发预后模型和潜在治疗靶点 | 乳腺癌患者样本及相关基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | Cox回归, LASSO-Cox回归 | 转录组数据, 单细胞数据 | TCGA/GEO数据库中的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6909 | 2026-01-23 |
Integrated spatial and single-cell transcriptomics reveals RPL8 as a prognostic biomarker and therapeutic target in hepatocellular carcinoma
2026-Feb, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102663
PMID:41496405
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研究论文 | 本研究通过整合多组学、单细胞转录组和空间转录组数据,揭示了RPL8作为肝细胞癌的诊断生物标志物和治疗靶点 | 首次将空间转录组学与单细胞转录组学结合,系统阐明RPL8在肝细胞癌中的临床价值和微环境作用机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏大规模临床队列验证 | 探究RPL8在肝细胞癌中的临床意义、分子机制及治疗潜力 | 肝细胞癌患者样本、癌细胞系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 空间表达数据 | TCGA、CPTAC数据库样本及GSE146115单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学 | NA | NA |
| 6910 | 2026-01-23 |
Single-cell analysis of heterogeneity in reverted hiPSC-derived human hepatic stellate cells
2026-Feb, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101669
PMID:41551413
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研究论文 | 本研究利用人诱导多能干细胞衍生的多细胞肝脏模型,探究了活化的肝星状细胞在损伤消退后是否能够恢复到静息状态,并通过单细胞RNA测序揭示了其异质性 | 首次在人类诱导多能干细胞衍生的多细胞肝脏模型中,通过单细胞RNA测序揭示了活化肝星状细胞在损伤消退后恢复过程中的异质性,并明确了巨噬细胞来源的IL-10通过调控维生素A代谢促进这一恢复过程的关键机制 | 研究样本量较小(n=4),且模型为体外培养系统,可能无法完全模拟体内复杂的肝脏微环境 | 探究人类活化的肝星状细胞在损伤消退后是否能够恢复到静息状态,并表征其恢复过程的特征 | 人诱导多能干细胞衍生的肝星状细胞、肝细胞和巨噬细胞组成的多细胞肝脏模型 | 单细胞组学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序,基因表达谱分析,功能实验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 4个独立实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6911 | 2026-01-23 |
Inhibition of FOS-Like Antigen 1 Reduces Chemoresistance to Temozolomide Through Stemness Reprogramming via IL-6/STAT3Tyr705 Pathway
2026-Feb, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70593
PMID:41556041
|
研究论文 | 本研究通过抑制FOSL1,揭示了其通过IL-6/STAT3通路调控胶质母细胞瘤干细胞特性,从而降低对替莫唑胺化疗耐药性的新机制 | 首次将FOSL1鉴定为胶质母细胞瘤化疗耐药的新治疗靶点,并阐明其通过IL-6-pSTAT3信号轴调控干细胞特性的具体机制 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚未在临床患者中进行验证 | 探索克服胶质母细胞瘤化疗耐药的新治疗策略 | 胶质母细胞瘤细胞系、小鼠模型 | 分子生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq、转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 未明确指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6912 | 2026-01-23 |
ClusterGVis: An Advanced Visualization and Clustering Tool for Gene Expression Analysis
2026-Jan-22, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag005
PMID:41569346
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研究论文 | 本文介绍了ClusterGVis,一款用于简化基因表达数据分析和可视化的高级生物信息学软件 | 开发了集成了模糊c均值和k均值聚类算法以及热图可视化功能的用户友好界面,有效揭示复杂基因表达谱中的模式和关系 | NA | 简化基因表达数据的分析和可视化,以识别潜在生物标志物并增强对基因功能和调控机制的理解 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 模糊c均值聚类, k均值聚类 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6913 | 2026-01-23 |
scSemiPLC: a semi-supervised learning framework for annotating single-cell RNA-Seq data by generating pseudo-labels through clustering
2026-Jan-20, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00223-25
PMID:41358754
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研究论文 | 本文提出了一种名为scSemiPLC的半监督学习框架,用于通过聚类生成伪标签来注释单细胞RNA-Seq数据 | scSemiPLC利用现有标签信息指导未标记数据的聚类,通过一致性正则化约束扰动数据的预测与伪标签相似,解决了固定高阈值伪标签范式导致的未标记数据利用率低的问题 | NA | 开发一个高效便捷的自动化细胞注释方法,以应对传统手动标记基因匹配方法的繁琐和耗时问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 半监督学习框架 | RNA-Seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6914 | 2026-01-23 |
Inhibition of PFKFB3 in macrophages ameliorates intestinal inflammation by modulating gut microbiota in DSS-induced colitis
2026-Jan-20, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00632-25
PMID:41378888
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研究论文 | 本研究探讨了糖酵解关键酶PFKFB3在巨噬细胞中的作用,发现抑制PFKFB3可通过调节肠道菌群减轻DSS诱导的结肠炎 | 首次揭示了巨噬细胞中PFKFB3缺陷通过调节肠道菌群(特别是增强Akkermansia菌属)改善结肠炎的机制,并证明该菌群可水平传播产生治疗效应 | 研究主要基于小鼠模型,人体验证尚不充分;抗生素处理实验表明菌群介导效应,但具体菌种功能机制需进一步解析 | 阐明PFKFB3在溃疡性结肠炎中的作用机制,探索通过靶向巨噬细胞代谢调节肠道菌群的治疗策略 | 溃疡性结肠炎患者组织样本、DSS诱导的结肠炎小鼠模型、巨噬细胞特异性PFKFB3缺陷小鼠 | 免疫代谢与微生物组学 | 溃疡性结肠炎 | 免疫组化染色、单细胞RNA测序、流式分析、高通量转录组数据分析、Spearman相关性分析 | 小鼠基因缺陷模型(LysM-Cre介导的巨噬细胞PFKFB3敲除) | 转录组数据、单细胞测序数据、临床病理数据 | 人类UC队列组织样本、结肠炎小鼠模型、基因工程小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6915 | 2026-01-23 |
Piezo1 dictates K+ homeostasis through coordinated regulation of the ubiquitin ligase Kelch-like 3 in RBCs and the kidney
2026-Jan-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2513222123
PMID:41533447
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研究论文 | 本文揭示了机械传感器Piezo1通过协调红细胞和肾脏中泛素连接酶Kelch-like 3 (KLHL3)的活性,调控细胞外钾离子稳态的机制 | 首次发现Piezo1-KLHL3相互作用作为红细胞与肾脏之间的关键组织间信号机制,调控钾离子稳态,并提出了该通路作为治疗钾离子紊乱的潜在靶点 | 研究主要基于小鼠模型和人类遗传数据,需要进一步实验验证该通路在人类疾病中的具体作用机制 | 探究组织间信号在钾离子稳态中的作用,特别是Piezo1-KLHL3通路的功能 | 红细胞、肾脏、人类遗传数据(UK Biobank参与者) | 分子生物学 | 钾离子紊乱 | CRISPR基因编辑、单细胞转录组学、遗传关联分析 | NA | 遗传数据、转录组数据、生理参数 | 200,367名UK Biobank参与者、KLHL3敲入小鼠模型 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 6916 | 2026-01-23 |
Pyrroloquinoline quinone ameliorates inflammatory responses by modulating macrophage polarization in murine models of SLE and lupus-associated diffuse alveolar hemorrhage
2026-Jan-20, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116219
PMID:41564475
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研究论文 | 本研究评估了吡咯喹啉醌(PQQ)在系统性红斑狼疮(SLE)及其相关弥漫性肺泡出血(DAH)中的治疗效果,并探讨了其通过调节巨噬细胞极化发挥抗炎作用的机制 | 首次在SLE和SLE相关DAH模型中评估PQQ的治疗效果,并利用单细胞RNA测序和批量RNA测序技术揭示其通过调节巨噬细胞极化及ERK/MAPK信号通路发挥免疫调节作用的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,尚未在人体中进行验证,且具体分子机制细节有待进一步深入探究 | 评估PQQ对SLE及其并发症DAH的治疗效果,并探究其对巨噬细胞极化的调节作用 | 使用Pristane诱导的DAH小鼠、狼疮易感MRL/lpr小鼠以及RAW264.7巨噬细胞系 | NA | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq),流式细胞术 | NA | RNA测序数据,流式细胞术数据 | 涉及两种小鼠模型(Pristane诱导DAH小鼠和MRL/lpr小鼠)及RAW264.7细胞系,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 6917 | 2026-01-23 |
Interpretable trajectory inference with single-cell linear adaptive negative-binomial expression (scLANE) testing
2026-Jan-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1494
PMID:41533563
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研究论文 | 本文提出了一种名为scLANE的可解释轨迹推断方法,用于单细胞RNA-seq数据中的基因表达动态分析 | scLANE方法基于可解释的广义线性模型,通过经验选择的基样条处理非线性,并扩展至估计方程和混合模型,以支持复杂实验设计下的可靠轨迹测试 | NA | 开发一种可解释的轨迹推断方法,以识别与单细胞RNA-seq数据中轨迹进展显著相关的基因表达变化 | 单细胞RNA-seq数据中的基因表达动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | 广义线性模型(GLM) | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6918 | 2026-01-23 |
Unstressed cells are alike, but stressed cells differ: Environmental and single-cell heterogeneity in yeast stress responses
2026-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.12.642837
PMID:41542409
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研究论文 | 本研究通过高通量单细胞RNA测序技术,分析了酵母细胞在多种压力条件下的转录组异质性,揭示了压力响应中平均信号与单细胞水平差异之间的关键区别 | 首次在单细胞水平上系统比较了酵母压力响应中激活与抑制程序的预测能力,发现压力抑制程序(以核糖体相关基因为主)具有跨数据集的稳定预测性,而压力激活程序则高度条件特异性;同时揭示了压力细胞中经典压力程序与转座元件转录之间的互斥性细胞亚群行为 | 研究仅针对酵母模型系统,结果在更复杂生物体中的普适性有待验证;单细胞测序技术本身存在技术噪音和捕获效率限制 | 探究细胞压力响应的异质性本质,比较平均群体水平与单细胞水平在压力响应特征识别上的差异 | 酿酒酵母细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约13,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6919 | 2026-01-23 |
Advancing adoptive T cell therapy in ovarian cancer: barriers, innovations, and emerging platforms
2026-Jan-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013285
PMID:41513408
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综述 | 本文全面分析了卵巢癌中过继性T细胞疗法的现状、障碍、创新策略及新兴技术平台 | 系统整合了从传统TIL、TCR-T、CAR-T到新兴的双特异性T细胞衔接器分泌型T细胞、双靶向平台及合成抗原受体等多种疗法,并强调了空间转录组学、单细胞分析和机器学习等工具在优化疗法设计中的作用 | NA | 克服卵巢癌中过继性T细胞疗法的免疫障碍,加速开发更有效、持久和个性化的T细胞策略 | 卵巢癌及其他实体瘤 | NA | 卵巢癌 | 空间转录组学,单细胞分析,机器学习 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学,单细胞分析 | NA | NA |
| 6920 | 2026-01-23 |
Fishing with Two Lines: A Hybrid Approach to Spatial Transcriptomic Discovery
2026-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.07.698201
PMID:41542551
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研究论文 | 本文开发了一种结合高灵敏度和广覆盖的空间转录组学双重化学方法 | 提出了一种创新的双重化学方法,将10X Genomics Xenium V1定制面板的高灵敏度与Prime 5K面板的广覆盖结合在同一组织切片上 | NA | 解决空间转录组学中基因检测数量与每个基因灵敏度之间的权衡问题 | 人类肺组织微阵列 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10X Genomics Xenium V1, Prime 5K | 10X Genomics Xenium V1定制面板(最多480个基因)与Prime 5K面板(5001个基因) |