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当前共找到 9342 篇文献,本页显示第 661 - 680 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
661 2026-09-20
Revealing therapeutic single-cell transcriptomic signatures using a simple classifier
2026-Sep-18, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 本文提出了Cell-Sign算法,能够根据药物处理在单细胞水平对细胞进行分类,识别药物和暴露时间,并利用Perturb-seq数据与LINCS药物特征比对发现药物靶点 Cell-Sign是一种简单的分类器,可以在单细胞水平上根据药物处理对细胞进行分类,识别出常规降维方法中隐藏的单个细胞,并揭示细胞所暴露的药物及暴露持续时间 摘要中未明确提及研究的局限性 开发一种检测算法,用于在单细胞水平上根据药物处理对细胞进行分类,并识别药物靶点 单细胞RNA测序数据中的细胞,涉及药物处理后的细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 分类器 文本(单细胞转录组数据) NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
662 2026-09-20
Genetic variants and the risk of renal impairment in decompensated cirrhosis: a multi-ancestry genome-wide association study
2026-Sep-18, The lancet. Gastroenterology & hepatology
研究论文 通过多祖先全基因组关联研究,识别出失代偿期肝硬化患者肾功能损害的遗传易感位点SUSD1,并结合单细胞和空间转录组学揭示浆细胞样树突状细胞-干扰素轴作为潜在机制 首次在失代偿期肝硬化中开展多祖先GWAS识别肾功能损害的遗传位点,发现SUSD1位点且效应具有失代偿期肝硬化特异性,并整合单细胞和空间转录组学将遗传关联映射到浆细胞样树突状细胞-干扰素轴 未明确提及 识别与失代偿期肝硬化肾功能损害相关的遗传位点并探索其机制 失代偿期肝硬化患者、代偿期肝硬化患者及无肝硬化病史的一般人群 基因组学、数字病理学 肝硬化、肾功能损害、肾衰竭 GWAS、单细胞转录组学、空间转录组学 NA 基因型、血清肌酐水平、转录组数据、图像 发现队列3220例失代偿期肝硬化患者,复制队列1728例欧洲失代偿期肝硬化患者,3139例代偿期肝硬化患者,402683例UK Biobank无肝硬化人群,单细胞和空间转录组样本 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium, Illumina NovaSeq
663 2026-09-20
ConvexGating infers gating strategies from clusters in single cell cytometry data
2026-Sep-18, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文开发了ConvexGating人工智能工具,从单细胞细胞术数据的聚类中自动学习可解释的门控策略,用于无偏、数据驱动的细胞分选 自动学习可解释的门控策略,以无偏、数据驱动的方式生成低污染的分选策略,适用于已知和未知细胞群体;能够有效迁移至CyTOF和CITE-seq数据,并改进细胞分选的标记面板设计 未明确说明 解决基于聚类的细胞群体定义方法无法直接应用于细胞分选的问题,通过自动学习门控策略实现 unbiased 的数据驱动分选 单细胞细胞术数据中的细胞群体,包括浆细胞样树突状细胞、CD8+亚型、脂肪祖细胞群体 机器学习 NA 流式细胞术, 单细胞测序, CyTOF, CITE-seq NA 单细胞细胞术数据, 图像 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 NA NA
664 2026-09-20
Single-cell transcriptomics reveals critical role of CD74 in bone marrow-derived mesenchymal stem cells
2026-Sep-18, Stem cells translational medicine IF:5.4Q1
研究论文 通过单细胞转录组学分析不同供体骨髓间充质干细胞,发现CD74在成骨分化中的关键作用 首次揭示CD74作为骨髓间充质干细胞成骨分化潜能的预测标志物,并发现CD74高表达细胞可能是负责骨髓移植后组织再生的亚群 未明确说明样本量大小,且未提及是否进行体内实验验证CD74功能 探究不同供体骨髓间充质干细胞的分子特征和成骨分化潜能差异,寻找预测移植结果的标志物 不同供体来源的骨髓间充质干细胞 单细胞转录组学 骨骼疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 5个不同供体样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
665 2026-09-20
Single-cell transcriptomics combined with Mendelian randomization reveals the pivotal role of WDR83OS in clear cell renal cell carcinoma: An observational and bioinformatic study
2026-Sep-18, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组学、孟德尔随机化和分子对接等方法,揭示了WDR83OS在透明细胞肾细胞癌中的关键作用,并构建了诊断模型 首次将单细胞转录组学与孟德尔随机化相结合,发现WDR83OS与透明细胞肾细胞癌的因果关联,并通过分子对接筛选出潜在治疗药物羟布宗 摘要中未明确提及研究局限性 全面探究透明细胞肾细胞癌的分子机制,识别关键细胞亚群和基因,开发有效的诊断模型,并筛选潜在靶向治疗药物 透明细胞肾细胞癌 机器学习 肾癌 单细胞转录组测序、孟德尔随机化、分子对接 机器学习算法(包括LASSO回归、单变量逻辑回归等) 单细胞转录组数据、基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
666 2026-09-20
Spatial atlas of the human brain vasculature reveals specialized cell ensembles
2026-Sep-17, Cell IF:45.5Q1
研究论文 构建了涵盖314,535个转录组的人类脑血管细胞图谱,并通过空间转录组学在颞叶皮层和海马中映射了1,529,740个细胞,揭示了血管细胞集合及其在神经血管耦合、血脑屏障运输和免疫监视中的功能 首次构建了涵盖动静脉轴的人类脑血管综合细胞图谱,定义了共识细胞状态,并通过空间转录组学发现了血管细胞集合(vascular cell ensembles)这一刻板的微社区结构,揭示了其与动静脉架构对齐以协调节段特异性功能 NA 解析人类脑血管的空间组织和功能逻辑,解码神经系统疾病的易感性和治疗反应 人类颞叶皮层和海马的脑血管系统 空间转录组学 神经系统疾病、小血管病、卒中 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 转录组数据、空间转录组数据 314,535个转录组(单细胞水平)和1,529,740个细胞(空间转录组水平),来源于人类颞叶皮层和海马 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
667 2026-09-20
Advances in single-cell and spatial multi-omics for deciphering the mechanisms of pan-organ metastasis in breast cancer
2026-Sep-15, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
综述 本文综述了单细胞和空间多组学技术在解析乳腺癌泛器官转移机制方面的最新进展,从泛器官转移程序和器官特异性微环境重塑两个互补视角进行系统总结 从泛器官转移程序与器官特异性微环境两个互补视角系统整合单细胞和空间多组学证据,全面阐述乳腺癌骨、肺、肝、脑转移的异质性机制,并强调CTC/CTM分析、空间 mapping和纵向整合在理解播散、休眠、定植和治疗耐药中的价值 大多数方法仍处于发现或早期验证阶段,需要检测简化、前瞻性验证和跨中心标准化 综合单细胞测序、多组学整合和空间分析技术的最新证据,阐明乳腺癌泛器官转移的机制,为生物标志物开发和机制导向的治疗策略提供基础 乳腺癌转移(骨、肺、肝、脑转移) 数字病理学 乳腺癌 单细胞测序, 多组学整合, 空间分析 NA 文本, 图像 NA NA 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
668 2026-09-20
Norway spruce spatiotemporal programs of conifer reproductive development
2026-Sep-14, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本文构建了挪威云杉发育中生殖与营养梢在三个时间点共88个组织切片的时间分辨空间转录组图谱,并鉴定出与营养-生殖转换及侧生器官发育相关的基因与通路 首次提供挪威云杉生殖发育的时间分辨空间转录组图谱,识别了营养-生殖转换的空间结构域,并通过实验验证了MADS-box基因DAL55的功能,同时揭示了裸子植物与被子植物YABBY基因的进化关系 摘要未提及研究局限性 解析针叶树生殖发育的时空基因表达程序,鉴定参与营养-生殖转换和生殖器官发育的关键基因、通路及其进化关系 野生型挪威云杉(Picea abies)发育中的生殖梢与营养梢,以及acrocona突变体的过渡梢 空间转录组学, 植物发育生物学, 进化生物学 NA 空间转录组学(ST) NA 空间转录组数据 88个组织切片,来自3个时间点的野生型挪威云杉生殖梢、营养梢以及acrocona突变体过渡梢 NA 空间转录组学 NA NA
669 2026-09-20
Unveiling the molecular and immune heterogeneity across distinct disease activity states of systemic lupus erythematosus through integrative bulk and single-cell transcriptomics
2026-Sep-12, Lupus science & medicine IF:3.7Q1
研究论文 该研究通过整合bulk和单细胞转录组数据,揭示了系统性红斑狼疮不同疾病活动状态下的分子和免疫异质性,并构建了一个五基因严重程度评分(SLEsev)用于疾病分层 构建了基于五个枢纽基因(KLRK1、IL2RB、RAG1、SH2D1B和NCR1)的SLEsev评分,可在独立验证队列中一致区分高活动性/重度SLE与低活动性/轻度SLE;揭示了重度SLE具有更复杂的细胞间通讯网络(311 vs 283个推断互作)及更强的整体互作强度 摘要中未明确说明研究局限性 探究SLEDAI定义的SLE不同疾病状态下的分子和细胞机制,并识别与炎症活动增强相关的潜在预后生物标志物和治疗靶点 系统性红斑狼疮(SLE)患者 机器学习 系统性红斑狼疮 bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq CIBERSORTx,CellChat 转录组数据(bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq) NA NA bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
670 2026-09-20
Apoptosis inhibition reprograms alveolar myofibroblasts toward ductal myofibroblasts
2026-Sep-07, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 该研究通过构建可诱导的BCL2过表达小鼠等位基因抑制肺泡肌成纤维细胞凋亡,结合谱系追踪和单细胞RNA测序,揭示肺泡肌成纤维细胞在凋亡被抑制后持续存在并成熟为导管肌成纤维细胞 首次构建可诱导的BCL2过表达小鼠等位基因用于特异性抑制肺泡肌成纤维细胞凋亡,证明凋亡是肺泡肌成纤维细胞清除的主要机制,并意外发现其具有向导管肌成纤维细胞转分化的命运可塑性 研究基于小鼠模型,结论是否适用于人类肺部发育和疾病尚需进一步验证;未完全阐明BCL2 rescued细胞与正常导管肌成纤维细胞在分子水平的所有差异 探究肺泡肌成纤维细胞是否通过凋亡被清除,以及抑制凋亡后这些细胞的命运转归和病理生理行为 小鼠肺组织中的肺泡肌成纤维细胞、导管肌成纤维细胞和气道平滑肌细胞,以及屋尘螨诱导的哮喘模型 单细胞组学 哮喘 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 条件性基因敲入 NA 基因表达数据, 图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
671 2026-09-20
CXCL16 as a potential therapeutic target to limit the activity of asthmatic CD4 memory T cells
2026-09, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本文通过单细胞转录组学分析人类和小鼠哮喘肺CD4 T细胞中CXCR6的表达,并在疾病模型中评估阻断CXCL16-CXCR6通路的效果,发现CXCL16阻断可减少CD4 Trm细胞的积累和持续性,提示其作为哮喘治疗靶点的潜力 首次揭示CXCL16-CXCR6相互作用在哮喘肺CD4 Trm细胞积累和持久性中的关键作用,并证明阻断CXCL16可产生持续的保护效应和耐受性效果 摘要中未明确提及研究局限性 探索CXCL16-CXCR6相互作用在肺部炎症性疾病相关CD4 Trm细胞活性和积累中的作用 人类和小鼠哮喘肺CD4 T细胞 单细胞转录组学 哮喘 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
672 2026-09-20
Inhibition of PERK signaling suppresses tumor progression and blocks GP73-GRP78-dependent stromal activation in hepatocellular carcinoma
2026-09, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本文研究了选择性抑制内质网应激传感器PERK(使用AMG-PERK)在化学诱导的肝细胞癌模型中抑制肿瘤进展并阻断GP73-GRP78依赖的基质活化的作用及机制 首次证明在肝癌发生早期阶段使用AMG-PERK选择性抑制PERK信号可同时抑制肿瘤进展和阻断GP73-GRP78依赖的基质活化,揭示了PERK信号驱动肝癌恶性进展和微环境重塑的新机制 研究主要基于化学诱导的HCC模型和体外实验,缺乏临床试验数据验证PERK抑制剂的治疗效果和安全性 探究PERK信号在肝细胞癌进展和肿瘤微环境重塑中的作用,并评估PERK抑制作为肝癌治疗策略的潜力 肝细胞癌(HCC)细胞、患者来源类器官、肝星状细胞、化学诱导HCC模型 digital pathology 肝癌 单细胞RNA测序, 转录组分析 NA 文本, 图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
673 2026-09-20
B-Cell Remodeling and Regulatory Phenotypes During Acute COVID-19 Are Unaffected by Polyclonal Anti-SARS-CoV-2 Antibody XAV-19
2026-Sep, European journal of immunology IF:4.5Q2
研究论文 该研究通过对POLYCOR试验的免疫学子研究,利用光谱流式细胞术、体外功能实验和单细胞RNA测序,纵向分析了住院COVID-19患者B细胞区室的重塑及XAV-19抗体治疗的影响 首次系统揭示急性COVID-19期间调节性B细胞的动态变化,并证明糖基化人源化多克隆抗体XAV-19不影响B细胞稳态、表型、功能和基因表达 样本量有限,仅针对住院COVID-19患者,未探讨长期随访及不同疾病严重程度的影响 探究急性SARS-CoV-2感染期间B细胞尤其是调节性B细胞的动态变化,以及多克隆抗体XAV-19对B细胞免疫平衡的影响 住院COVID-19患者的B细胞 免疫学 COVID-19 光谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, 体外功能实验 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
674 2026-09-20
Heterogeneous SPP1-expressing esophageal cancer cells license immunotherapy resistance by organizing an immunosuppressive niche
2026-09, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 该研究整合单细胞、空间和bulk转录组数据,发现表达SPP1的食管鳞癌细胞亚群通过塑造免疫抑制微环境驱动免疫治疗耐药 首次发现SPP1表达的恶性上皮亚群在免疫治疗无应答者中显著富集,揭示其通过mTORC1-STAT3通路上调PD-L1、通过SPP1-CD44信号诱导CD8+ T细胞耗竭、通过α5β1整合素-FAK-AKT-mTOR通路极化巨噬细胞,并提名微管和激酶抑制剂靶向SPP1+细胞 摘要中未明确提及研究局限性 识别异质性肿瘤中驱动免疫治疗耐药的关键因素,并探索克服食管鳞癌免疫治疗耐药的策略 食管鳞状细胞癌(ESCC)患者队列及肿瘤微环境中的恶性上皮细胞、CD8+ T细胞和巨噬细胞 数字病理学 食管癌 单细胞转录组测序, 空间转录组测序, bulk转录组测序, RNA测序 NA 转录组数据, 图像 多个ESCC队列(摘要未提供具体样本量) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
675 2026-09-20
Deep learning of pretreatment ascites cytopathology for platinum-resistance risk stratification in advanced epithelial ovarian cancer
2026-09, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 该研究提出了一个多尺度深度学习框架OVCAP,通过分析治疗前腹水细胞学全切片图像来评估晚期上皮性卵巢癌的铂类耐药风险 首次系统性地利用治疗前腹水细胞学全切片图像,结合多尺度深度学习框架进行铂类耐药风险分层,并通过注意力引导的细胞病理学回顾和单细胞RNA测序分析揭示了耐药相关的高危形态学模式和生物学特征 摘要中未明确提及研究的具体局限性 开发一种基于治疗前腹水细胞学的深度学习方法来预测晚期上皮性卵巢癌患者的铂类耐药风险,以便在治疗前进行早期风险分层 438例FIGO IIIB-IV期上皮性卵巢癌患者的治疗前腹水细胞学全切片图像 数字病理学 卵巢癌 全切片图像分析, 单细胞RNA测序 多尺度深度学习框架 图像, 文本 438例FIGO IIIB-IV期上皮性卵巢癌患者,包含一个内部验证队列和两个独立外部验证队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
676 2026-09-20
Regional signaling controls stem cell-mediated regeneration in an invertebrate chordate
2026-Sep, PLoS biology IF:7.8Q1
研究论文 本文通过比较海鞘Ciona robusta可再生的底部体片段与不可再生的上部片段,揭示了区域特异性信号如何调控干细胞介导的再生 利用海鞘独特的区域性再生差异模型,结合流式细胞术、单细胞RNA测序、移植和命运图谱技术,发现再生能力并非取决于干细胞数量,而是依赖于区域特异性信号微环境 研究对象为无脊椎动物海鞘,其再生机制与哺乳动物的差异尚需进一步验证,且未明确具体的信号通路分子机制 探究局部信号如何调控损伤后静息干细胞的激活及组织再生 海鞘(Ciona robusta)的底部可再生体片段和上部不可再生体片段 单细胞组学 NA 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 移植实验, 命运图谱 NA 单细胞转录组数据, 图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
677 2026-09-20
DeepPathway: predicting pathway expression from histopathology images
2026-Aug-31, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出DeepPathway,一种基于对比学习的方法,从H&E组织病理图像预测通路表达水平 首次将预测目标从基因水平提升到通路水平,利用对比学习从H&E图像预测通路表达,并计算通路中各组成基因表达的汇总值作为输入 摘要中未明确提及研究局限性 从廉价易得的H&E图像推断空间通路表达,以克服空间转录组技术成本高和数据获取困难的问题 多种癌症数据集、TCGA的H&E图像、脑肿瘤样本(哌莫硝唑缺氧染色作为金标准) 数字病理学 肺癌,前列腺癌,脑肿瘤 空间转录组学,H&E染色 对比学习 图像,文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
678 2026-09-20
st2traj: deconvolution-informed trajectory inference for multi-timepoint spatial transcriptomics
2026-Aug-31, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了st2traj,一种基于去卷积信息的轨迹推断框架,利用spot-state组成进行多时间点空间转录组轨迹推断 使用去卷积得到的spot-state组成而非归一化的spot级别表达进行多时间点空间轨迹推断,获得更平滑的轨迹场和更强的空间一致性 摘要中未明确说明 解决多时间点空间转录组中spot内细胞状态混合及切片间缺乏直接空间对应关系所导致的轨迹推断和生物学解释困难 人类心脏多时间点空间转录组数据、鸡心脏数据集(D7、D10和D14) 空间转录组学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据、表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
679 2026-09-20
Spatial Transcriptomics of Micropapillary, Plasmacytoid, and Sarcomatoid Urothelial Carcinoma Reveals Distinct Molecular Landscapes
2026-Aug-25, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
研究论文 利用空间转录组学技术对微乳头状、浆细胞样和肉瘤样尿路上皮癌进行分子分类和空间转录组分析,揭示其不同的分子景观 首次使用Bruker GeoMx数字空间分析仪对微乳头状、浆细胞样和肉瘤样尿路上皮癌进行空间转录组分析,揭示了这些亚型的共识分子分类和空间异质性 样本量较小(17个组织芯片核心,38个感兴趣区域),可能限制结果的普遍性 确定微乳头状、浆细胞样和肉瘤样膀胱尿路上皮癌的共识分子分类,并表征其空间转录组特征 17个福尔马林固定石蜡包埋的组织芯片核心,包括5个微乳头状、6个浆细胞样和6个肉瘤样尿路上皮癌样本 数字病理学 膀胱癌 空间转录组学 NA 图像, 文本 17个组织芯片核心(5个微乳头状,6个浆细胞样,6个肉瘤样),38个感兴趣区域 Bruker 空间转录组学 GeoMx Digital Spatial Profiler Bruker GeoMx数字空间分析仪,检测18,676个mRNA
680 2026-09-20
Tumor-derived KLK5 activates TMEM158+ cancer-associated fibroblasts to induce CD8+ T cell exhaustion and confer immunotherapy resistance in lung cancer
2026-Aug-25, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 该研究通过单细胞和空间转录组学揭示了肺鳞癌中肿瘤来源的KLK5激活TMEM158⁺癌症相关成纤维细胞,进而诱导CD8⁺T细胞耗竭并导致免疫检查点阻断耐药 首次鉴定出TMEM158⁺癌症相关成纤维细胞亚群在肺鳞癌免疫检查点阻断非响应者中富集,并阐明了KLK5-TMEM158-SDCBP-MEK/ERK-ELK1-TNC/SPP1信号轴驱动免疫抑制微环境的机制 摘要中未明确提及研究的局限性 定义肺鳞癌中免疫检查点阻断耐药的微环境机制 接受新辅助抗PD-1治疗联合化疗的肺鳞癌患者手术标本 数字病理学 肺癌 单细胞转录组学, 空间转录组学, 批量RNA-seq, 多重免疫荧光 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
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