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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6741 | 2026-02-03 |
BMP6 as a therapeutic target for preeclampsia: enhancing trophoblast invasion and vascular mimicry
2026-Jan-23, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-06040-w
PMID:41577865
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研究论文 | 本研究探讨了BMP6通过ID1介导的SERPINE2和PlGF上调促进滋养层细胞侵袭和血管拟态,并发现早期补充BMP6可缓解大鼠子痫前期模型的相关表型 | 揭示了BMP6通过ID1-SERPINE2/PlGF轴调控滋养层细胞侵袭的新机制,并首次在体内模型中证明早期补充BMP6对子痫前期具有治疗潜力 | 研究主要基于体外细胞模型和啮齿动物模型,在人类妊娠早期的直接证据尚不充分 | 阐明BMP6在滋养层细胞侵袭和血管拟态中的调控机制,评估其作为子痫前期治疗靶点的潜力 | 人原代滋养层细胞、HTR8/SVneo细胞系、子痫前期患者胎盘组织、Ad Flt1诱导的子痫前期大鼠模型 | 生殖医学与发育生物学 | 子痫前期 | RNA-seq, scRNA-seq, 腺病毒载体技术 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、生理表型数据 | 未明确样本数量,包含人类胎盘组织和大鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 6742 | 2026-02-03 |
Decoding metabolic reprogramming heterogeneity across bladder cancer stages using single-cell and spatial multi-omics approaches
2026-Jan-21, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2026.109261
PMID:41621229
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研究论文 | 本研究利用单细胞和空间多组学方法解码膀胱癌不同阶段的代谢重编程异质性 | 首次结合单细胞测序、空间转录组和批量RNA测序数据,系统分析膀胱癌不同阶段代谢重编程异质性,并识别出核黄素代谢通路中的关键预后生物标志物 | 研究主要基于现有测序数据,实验验证部分相对有限,且样本量可能不足以覆盖所有膀胱癌亚型 | 分析膀胱癌不同阶段的代谢重编程及其对患者生存的影响 | 膀胱癌患者的上皮细胞及其亚群 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序, 空间转录组测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化, 共定位分析 | NA | 单细胞测序数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6743 | 2026-02-03 |
scXDR: drug response prediction across single-cell datasets via heterogeneous network transfer learning
2026-Jan-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09418-5
PMID:41507436
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研究论文 | 本研究提出了一种名为scXDR的异质网络迁移学习模型,用于跨单细胞数据集的药物反应预测 | 通过异质网络整合药物、基因和细胞间的特征与关联,进行消息传递、特征与结构对齐、结构重建和药物-细胞评分预测,避免了传统方法依赖批量RNA测序与单细胞RNA测序数据整合的局限性 | 未明确提及模型在处理大规模数据集时的计算效率或对罕见细胞类型的预测能力 | 提高单细胞水平药物反应预测的准确性,为药物开发和精准治疗提供指导 | 药物、基因、细胞(包括个体细胞和细胞群) | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 异质网络迁移学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6744 | 2026-02-03 |
Type I interferon drives dysfunction of a distinct CD8+ HLA-DRB1+ T cell subset in systemic lupus erythematosus
2026-Jan-03, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.01.02.26343348
PMID:41607660
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研究论文 | 本研究全面表征了系统性红斑狼疮中一个独特的CD8+ HLA-DRB1+ T细胞亚群,揭示了I型干扰素如何驱动其功能失调状态 | 首次全面表征了SLE中一个独特的CD8+ HLA-DRB1+ T细胞亚群,揭示了I型干扰素通过促进耗竭和损害脱颗粒来驱动其功能失调的机制 | 研究主要基于外周血样本,对肾脏浸润细胞的验证依赖于现有数据集分析 | 旨在全面表征系统性红斑狼疮中CD8+ HLA-DRB1+ T细胞的功能和分子特征 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的外周血CD8+ T细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据、流式细胞数据 | SLE患者和健康对照者的外周血CD8+ T细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6745 | 2026-02-02 |
A single cell transcriptomics-based analysis provides mechanistic insights into the chronic low-concentration effects on hematopoietic disruption in zebrafish(Danio rerio) by Antinomy
2026-Mar-01, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2025.111892
PMID:41519218
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了低浓度锑暴露对斑马鱼造血功能的慢性影响及其机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统解析低浓度锑暴露下斑马鱼造血细胞群体的变化,并阐明IL-17通路介导的炎症反应在锑毒性中的作用 | 研究仅基于斑马鱼模型,结果外推至哺乳动物或人类需谨慎;未探讨长期暴露后的恢复潜力 | 探究低浓度锑暴露对造血功能的慢性毒性效应及分子机制 | 斑马鱼(Danio rerio) | 单细胞组学 | 造血功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼暴露于0、5、50、500和5000 μg/L锑浓度28天 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6746 | 2026-02-02 |
Single-cell sequencing: accurate disease detection
2026-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04007-8
PMID:40819160
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在疾病检测中的应用,特别是在神经系统疾病早期诊断中的潜力 | 突破了传统测序的局限,能在单细胞水平分析基因组和转录组,清晰展示细胞间异质性 | 面临数据处理复杂和检测成本高的挑战 | 探讨单细胞测序技术如何实现疾病的早期和准确检测 | 神经系统疾病中的神经细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6747 | 2026-02-02 |
Multi-omics characterization of cachexia-related genes reveals prognostic signatures and immune landscape in breast cancer
2026-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04025-6
PMID:40880013
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了恶病质相关基因在乳腺癌中的预后和免疫学意义,并构建了一个基于11个基因的预后模型 | 首次构建了一个基于恶病质相关基因的乳腺癌预后风险评分模型(CRSBC),并通过单细胞RNA-seq分析揭示了HCCS基因在乳腺癌细胞和巨噬细胞招募中的关键作用 | 研究主要基于TCGA等公共数据库数据,缺乏外部实验验证,且样本来源和临床特征可能存在异质性 | 探究恶病质相关基因在乳腺癌中的预后价值和免疫微环境中的作用 | 乳腺癌患者及其相关的恶病质相关基因 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 差异表达分析,加权基因共表达网络分析(WGCNA),LASSO-Cox回归,单细胞RNA-seq分析 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据,单细胞RNA-seq数据 | 基于TCGA-BRCA队列数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6748 | 2026-02-02 |
COL14A1 drives ischemic cardiac injury in PCOS: an artificial intelligence-identified biomarker
2026-Jan-31, QJM : monthly journal of the Association of Physicians
DOI:10.1093/qjmed/hcag033
PMID:41619759
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与人工智能方法,鉴定出COL14A1是多囊卵巢综合征与缺血性心肌病共享的关键生物标志物,并揭示了其在免疫-纤维化轴中的作用机制 | 首次通过整合多组学数据与105种机器学习模型组合,系统鉴定出连接PCOS与缺血性心脏损伤的共享生物标志物COL14A1,并利用单细胞及空间转录组学解析其细胞特异性与组织定位 | 研究结论主要基于生物信息学分析与体外数据,缺乏体内实验验证;候选药物罗非昔布的疗效尚未经过临床验证 | 鉴定PCOS与缺血性心肌病之间的共享诊断生物标志物并阐明其生物学基础 | 多囊卵巢综合征患者与缺血性心肌病患者的转录组数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组测序,单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接 | Elastic Net | 基因表达数据 | 来自多个GEO队列的PCOS与ICM转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 6749 | 2026-02-02 |
Stem cell specification and niche formation in developing incisor require actomyosin forces
2026-Jan-29, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf074
PMID:41296682
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠切牙发育过程中干细胞规范和生态位形成的精确时间,揭示了肌动球蛋白网络在维持干细胞未分化状态中的作用 | 首次发现表达Sox2的干细胞样群体在功能生态位形成之前就已存在,并揭示了肌动球蛋白网络产生的收缩张力在限制干细胞位置和维持其干性中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类或其他物种中的普适性尚不明确,且对肌动球蛋白网络的具体调控机制仍需进一步探索 | 探究小鼠切牙发育过程中干细胞规范和生态位形成的时间关系及其调控机制 | 小鼠胚胎切牙的牙上皮组织 | 发育生物学 | NA | 遗传谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | 遗传谱系数据,单细胞RNA测序数据 | 不同发育阶段的小鼠胚胎切牙样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6750 | 2026-02-02 |
Generation of thymus-reconstituting T cell progenitors from human pluripotent stem cells
2026-Jan-26, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101272
PMID:41512861
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研究论文 | 本文描述了从人类多能干细胞生成能够直接并长期重建胸腺的T细胞祖细胞的方法 | 首次在体外从人类多能干细胞工程化出具有胸腺重建能力的T细胞祖细胞,为研究T细胞发育机制和CAR-T细胞疗法提供了新模型 | 未明确提及实验的局限性,可能包括体内功能验证的深度或长期安全性评估 | 旨在生成大量能够重建受体免疫系统的T细胞祖细胞,以推进癌症免疫治疗 | 人类多能干细胞(hPSC)及其衍生的T细胞祖细胞 | 再生医学 | 癌症 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6751 | 2026-02-02 |
Advancing spatial cellular communication inference with ligand diffusion and transport model
2026-Jan-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09413-w
PMID:41501529
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研究论文 | 本研究提出了一种名为SCILD的基于优化框架,用于从空间转录组学数据中以单细胞分辨率推断空间细胞通讯 | SCILD整合了配体扩散、竞争性配体-受体结合和浓度衰减,构建了一个统一的优化模型,并利用神经网络建模和计算机扰动预测下游靶基因 | NA | 开发一种工具以从空间转录组学数据中推断单细胞水平的空间细胞通讯 | 细胞通讯中的配体-受体相互作用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 优化框架与神经网络 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6752 | 2026-02-02 |
Biological and prognostic relevance of A-to-I RNA editing across consensus molecular subtypes of colon cancer
2026-Jan-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34043-x
PMID:41491064
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研究论文 | 本研究探讨了A-to-I RNA编辑在结肠癌共识分子亚型(CMS)中的生物学和预后相关性 | 首次在结肠癌CMS亚型中系统分析RNA编辑事件,揭示了亚型特异性编辑特征、ceRNA网络及其与肿瘤微环境和化疗耐药性的关联 | 研究基于100例患者的bulk RNA-seq数据,样本量相对有限;单细胞分析仅来自独立队列的II期患者,可能未覆盖所有疾病阶段 | 阐明RNA编辑在结肠癌发生发展中的调控作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 100例不同疾病阶段的结肠癌患者,以及独立队列的II期结肠癌患者单细胞数据 | 生物信息学 | 结肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 多变量Cox比例风险模型, ceRNA网络分析 | 转录组数据 | 100例结肠癌患者(bulk RNA-seq)和独立队列的II期结肠癌患者(单细胞RNA-seq) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6753 | 2026-02-02 |
CellCraft: an extensible visual programming application for gene regulatory network inference
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf684
PMID:41452748
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研究论文 | 本文介绍了一个名为CellCraft的基于Web的应用程序,旨在简化从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络的工作流程 | CellCraft提供了直观的图形用户界面和可视化编程接口,简化了复杂多步骤分析的设计与执行,并采用模块化插件架构确保可扩展性 | NA | 开发一个用户友好且可扩展的应用程序,用于单细胞RNA测序数据集的整合基因调控网络分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络推断工具(包括TENET等) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6754 | 2026-02-02 |
Unravelling the progression of the zebrafish primary body axis with reconstructed spatiotemporal transcriptomics
2026-Jan-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03917-8
PMID:41484648
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研究论文 | 本研究提出了一个名为Palette的流程,用于从bulk RNA-seq数据推断详细的空间基因表达模式,并构建了斑马鱼时空表达谱(zSTEP)资源 | 开发了Palette流程,通过平滑、插值和调整基因表达,利用现有空间转录组数据作为唯一参考,从bulk RNA-seq数据重建高分辨率时空表达谱 | 方法依赖于现有空间转录组数据作为参考,且当前空间转录组技术本身存在测序深度低和基因检测有限的问题 | 研究斑马鱼胚胎发育过程中基因表达的时空动态,特别是前后轴发育的调控机制 | 斑马鱼胚胎 | 空间转录组学 | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | 机器学习 | RNA-seq数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 三个发育阶段的53个连续切片bulk RNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6755 | 2026-02-02 |
Tumor-associated macrophage-specific SERPING1 contributes to M1-phenotype transition and suppress colorectal cancer tumorigenesis via NF-κB pathway
2026-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150144
PMID:41513188
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研究论文 | 本研究探讨了丝氨酸蛋白酶抑制剂SERPING1通过抑制NF-κB通路,促进肿瘤相关巨噬细胞向M1表型极化,从而抑制结直肠癌发生发展的机制 | 首次揭示了SERPING1在肿瘤相关巨噬细胞中的特异性表达及其通过调控NF-κB通路影响巨噬细胞表型转换的新机制 | 研究主要基于细胞实验和小鼠模型,临床样本验证和具体信号通路细节有待进一步深入 | 阐明巨噬细胞在结直肠癌发生发展中的作用机制,特别是SERPING1对肿瘤相关巨噬细胞表型调控的功能 | 结直肠癌组织、肿瘤相关巨噬细胞、HCT116细胞系、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞功能实验数据 | 基于公共单细胞RNA-seq数据集和细胞系实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6756 | 2026-02-02 |
Multi-omics integration defines an ECM-associated intratumoral heterogeneity signature enabling prognosis assessment and therapeutic stratification in hepatocellular carcinoma
2026-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150143
PMID:41513193
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研究论文 | 本研究开发了一个基于多组学的肿瘤内异质性评分系统,用于改善肝细胞癌患者的风险分层和指导精准治疗 | 通过整合体细胞突变数据和单细胞RNA测序数据,建立了一个转录组为基础的肿瘤内异质性特征,并揭示了细胞外基质重塑与高异质性肿瘤的关联 | 样本量相对有限,单细胞RNA测序仅涉及20个样本,且主要依赖公共数据库和回顾性数据,需要进一步的前瞻性验证 | 量化肝细胞癌的肿瘤内异质性,以改善患者预后评估和治疗分层 | 肝细胞癌患者,包括来自TCGA数据库的361例患者和单细胞RNA测序的20个样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,体细胞突变分析,转录组分析 | 稳健排序聚合 | 基因组数据,转录组数据 | 361例TCGA患者和20个单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6757 | 2026-02-02 |
Exploring the relationship between metabolism and immune microenvironment in breast cancer bone metastasis based on metabolic pathways
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0341270
PMID:41610108
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研究论文 | 本研究基于代谢通路探索乳腺癌骨转移中代谢与免疫微环境的关系 | 从代谢-免疫相互作用角度揭示乳腺癌骨转移的预后代谢通路和关键靶基因,并构建了代谢相关风险模型作为预后预测工具 | 研究主要依赖于公共数据库的回顾性数据,缺乏实验验证,且样本量有限 | 阐明乳腺癌骨转移中代谢通路与免疫微环境之间的动态相互作用及其对预后的影响 | 乳腺癌骨转移患者的RNA-seq数据和临床信息 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 风险模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的乳腺癌骨转移患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6758 | 2026-02-02 |
THBS3 Functions as a Novel Biomarker for Prognosis and Immunotherapeutic Response in Colorectal Cancer: An Integrative Analysis and Validation of the Thrombospondin Gene Family
2026, Cancer informatics
IF:2.4Q3
DOI:10.1177/11769351251412614
PMID:41613418
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和实验验证,揭示了THBS3在结直肠癌中作为预后生物标志物和免疫治疗反应新靶点的作用 | 首次系统性地将THBS基因家族与结直肠癌的预后和免疫微环境联系起来,并确定THBS3为关键致癌基因,通过激活PI3K-AKT和EMT通路促进癌症进展 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证,且临床样本的具体来源和数量未详细说明 | 探究THBS基因家族在结直肠癌中的具体作用,并评估THBS3作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 | 结直肠癌患者的多组学数据、细胞系以及THBS基因家族,特别是THBS3 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学数据分析、单细胞RNA测序、GO/KEGG/GSEA富集分析、分子对接、体外实验 | NA | mRNA表达数据、临床病理特征数据、生存数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6759 | 2026-01-30 |
Systemic activation and tissue infiltration of CD8 + CX3CR1 + T cells in non-small cell lung cancer treated with neoadjuvant immune checkpoint blockade
2026-Feb, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03160-9
PMID:41275012
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了CD8+CX3CR1+T细胞在非小细胞肺癌新辅助免疫检查点阻断治疗中的系统性激活和组织浸润特征 | 首次系统性地鉴定并表征了与NA-ICB治疗反应相关的CD8+CX3CR1+T细胞亚群,揭示了其在血液中的增殖动态、组织迁移路径以及向耗竭和细胞毒性NK样CD8+T细胞分化的轨迹 | 样本量相对有限(共40例患者),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性队列验证其作为生物标志物的预测价值 | 探究新辅助免疫检查点阻断治疗非小细胞肺癌时,哪些T细胞亚群发生扩增和功能重激活,及其组织起源、迁移模式和表型转换 | 26例接受NA-ICB治疗和14例未经治疗的NSCLC患者的肿瘤组织、配对正常肺组织及外周血样本 | 单细胞组学与免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, TCR repertoire分析, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 流式细胞数据 | 40例NSCLC患者(26例治疗组,14例未治疗组)的肿瘤、正常肺组织和外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6760 | 2026-01-30 |
Single-cell transcriptional mapping of Mustn1 exhibits consistent mural cell localization across musculoskeletal tissues
2026-Feb, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf193
PMID:41522665
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法,系统性地绘制了Mustn1基因在肌肉骨骼组织中的表达图谱,并揭示了其在平滑肌肌动蛋白表达细胞中的一致定位 | 首次利用开源单细胞RNA测序数据集,采用自上而下的转录组学方法,在多种肌肉骨骼组织中系统性地绘制了Mustn1基因的表达图谱,并发现其与Acta2在血管周细胞中的共定位 | 研究依赖于已有的开源数据集,可能受限于数据质量和覆盖范围;未进行实验验证Mustn1蛋白的功能 | 探究Mustn1基因在肌肉骨骼组织中的表达模式和细胞定位 | 肌肉骨骼组织(骨、滑膜、肌肉、肌腱)中的细胞,特别是血管周细胞和Sox9谱系细胞 | 单细胞转录组学 | 肌肉骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |