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当前共找到 9342 篇文献,本页显示第 641 - 660 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
641 2026-09-20
HKDC1 as a Prognostic and Tumor Microenvironment‑Associated Biomarker in Colorectal Cancer: An Integrated Multi‑omics and Spatial Transcriptomic Study
2026-Nov, Digestive diseases and sciences IF:2.5Q2
研究论文 本研究通过整合多组学和空间转录组学方法,系统表征了HKDC1在结直肠癌中的表达、预后价值及肿瘤微环境关联 首次对HKDC1(第五种己糖激酶同工酶)在结直肠癌中进行整合多组学和空间转录组学表征,揭示其作为代谢调节因子与EMT及肿瘤微环境相互作用的关联 功能验证仅限于细胞系水平,缺乏体内动物实验验证;HKDC1调控结直肠癌进展的具体分子机制尚未完全阐明 探索HKDC1作为结直肠癌预后生物标志物和肿瘤微环境相关代谢调节因子的潜力 结直肠癌患者样本、结直肠癌细胞系、TCGA/GEO/GTEx公共数据集 数字病理学 结直肠癌 空间转录组学、单细胞RNA测序、WGCNA、差异表达分析、Western blot、免疫组化 NA 图像、文本 临床队列168例结直肠癌患者样本 NA 空间转录组学、单细胞RNA测序 NA NA
642 2026-09-20
ApolipoproteinE+ Kupffer cells maintain immune homeostasis following liver transplantation by inducing CD8+ T cell exhaustion
2026-Oct-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 该研究通过整合人类单细胞RNA测序与小鼠原位肝移植模型,发现了一个在稳定和耐受移植物中富集的APOE+ Kupffer细胞亚群,该亚群通过CXCL16-CXCR6轴与CD8+ TRM T细胞通讯,诱导其耗竭以维持移植后免疫稳态。 首次鉴定出APOE+ Kupffer细胞亚群在肝移植后免疫稳态中的核心作用,揭示了供体来源APOE通过驱动CD8+ TRM细胞耗竭促进移植物耐受的新机制,并提出了供体APOE作为预后生物标志物和治疗靶点的双重潜力。 摘要中未明确提及研究局限性。 探究肝移植后Kupffer细胞维持免疫稳态的机制,特别是APOE+ Kupffer细胞在诱导CD8+ T细胞耗竭和移植物耐受中的作用。 人类肝移植样本和小鼠原位肝移植模型中的Kupffer细胞和CD8+ TRM T细胞。 单细胞转录组学、免疫学 肝移植、终末期肝病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据、临床数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
643 2026-09-20
Neutrophil-Driven Trogocytosis in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Liver Metastases Restrains Immunosuppressive Macrophage Polarization and Limits Metastatic Progression
2026-Oct, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本研究通过活体钙成像和单细胞RNA测序,揭示了中性粒细胞在胰腺导管腺癌肝转移中通过胞噬作用摄取肿瘤碎片并呈递给肝脏巨噬细胞,从而抑制免疫抑制性巨噬细胞极化并限制转移进展 首次整合活体钙成像与单细胞RNA测序,发现中性粒细胞通过CCL2/CCL5招募至肝转移灶,经胞噬作用摄取肿瘤碎片并呈递给巨噬细胞,通过C3依赖性信号抑制免疫抑制性巨噬细胞极化,揭示了一种此前未认识的中性粒细胞-巨噬细胞交互免疫调节机制 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类患者中验证;中性粒细胞-巨噬细胞交互的具体分子机制有待进一步阐明 探究中性粒细胞在胰腺导管腺癌肝转移中对肝脏巨噬细胞及转移微环境免疫格局的调控作用 胰腺导管腺癌肝转移小鼠模型中的肝脏浸润白细胞,包括中性粒细胞和巨噬细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序, 活体钙成像 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
644 2026-09-20
IL-33 as a component of neutrophil extracellular traps mediates contrast-induced acute kidney injury by promoting ferroptosis in tubular epithelial cells
2026-Oct, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本研究通过前瞻性队列、小鼠模型和单细胞转录组学,揭示了IL-33富集的中性粒细胞胞外诱捕网通过抑制IKKα和损害β-catenin核转位促进肾小管铁死亡,从而介导造影剂诱导的急性肾损伤 首次发现造影剂可直接诱导NETs形成,并阐明NETs通过IL-33抑制IKKα、破坏IKKα-β-catenin相互作用、损害β-catenin核转位,进而去抑制长链酰基辅酶A合成酶4转录并放大铁死亡的新机制 摘要中未明确提及研究局限性 探究造影剂是否直接诱导NETs形成,以及NETs是否通过IL-33驱动肾小管铁死亡,从而阐明CIAKI的免疫介导致病机制 330例接受冠状动脉造影的患者、野生型小鼠、PAD4敲除小鼠、IL-33敲除小鼠、HK-2细胞 机器学习 心血管疾病 单细胞转录组测序 NA 文本 330例接受冠状动脉造影的患者,以及野生型、PAD4敲除和IL-33敲除小鼠的CIAKI肾脏样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
645 2026-09-20
Decoding tumor immune microenvironment heterogeneity by single-cell and spatial multi-omics: From immunotherapy resistance to translational biomarkers
2026-10, Neoplasia (New York, N.Y.)
综述 本文综述了单细胞和空间多组学如何重新定义肿瘤免疫微环境异质性在免疫治疗耐药中的作用,并探讨了新兴的转化生物标志物 提出未来免疫治疗生物标志物应从静态单标志物检测向纵向、空间分辨、可解释的多组学模型演变,以指导精准联合免疫治疗 作为综述文章,未提供原始实验数据,缺乏对现有方法的系统性定量比较和验证 总结单细胞和空间多组学如何重新定义免疫治疗耐药中的肿瘤免疫微环境异质性,探讨转化生物标志物用于患者分层 肿瘤免疫微环境中的免疫细胞和基质细胞状态、空间免疫生态位 数字病理学 肺癌 单细胞组学,空间转录组学,空间蛋白质组学,基于成像的方法 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
646 2026-09-20
Machine learning of sunitinib resistance genes reveals that SP5 regulates angiogenesis and sunitinib resistance in RCC via the VEGFA/AKT axis
2026-10, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 该研究通过整合批量RNA-seq和单细胞转录组数据,利用机器学习算法鉴定舒尼替尼耐药相关基因,发现SP5通过VEGFA/AKT轴调控肾细胞癌血管生成和舒尼替尼耐药,并筛选出苏拉明作为潜在SP5抑制剂 首次确立SP5为舒尼替尼耐药的核心驱动基因,揭示SP5直接结合VEGFA启动子上调其转录、通过自分泌和旁分泌环路激活AKT磷酸化从而促进血管生成和耐药的机制,并通过虚拟筛选发现苏拉明可破坏SP5-VEGFA相互作用并与舒尼替尼协同抑制肿瘤生长 摘要中未明确提及研究的局限性 揭示肾细胞癌中舒尼替尼耐药的分子机制,鉴定耐药相关核心基因并开发潜在治疗策略 肾细胞癌(RCC)患者样本及细胞系,舒尼替尼耐药相关基因和通路 机器学习 肾细胞癌 bulk RNA-seq, 单细胞转录组测序, CUT&RUN, 虚拟筛选, 分子对接 117种机器学习算法组合 转录组数据, 图像, 文本 GSE172165、GSE173572、GSE216494三个bulk RNA-seq数据集及GSE156632单细胞转录组数据集 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
647 2026-09-20
Cell-based crop phenotyping for future climates
2026-Oct, The New phytologist
综述 本文论述了基于细胞的作物表型分析技术在应对未来气候挑战中的重要性,指出当前表型分析方法在预测价值上的局限,并提出将组学技术与表型分析相结合是培育耐逆作物的关键途径 提出基于细胞的表型分析(如荧光染料和电生理方法)作为桥接组学技术与作物育种之间差距的关键手段,强调细胞特异性基因操作在耐逆育种中的应用 当前表型分析方法虽然对已发现性状的功能验证有效,但在胁迫生物学中的预测价值有限,且缺乏合适的表型分析平台来支撑育种项目 探讨如何通过基于细胞的表型分析技术弥合组学技术与作物表型分析之间的差距,以推动未来气候条件下的耐逆作物育种 农作物(受非生物胁迫影响的现代作物) 植物科学 NA 单细胞RNA测序, 空间组学, 荧光染料, 电生理方法 NA NA NA NA 单细胞RNA测序, 空间组学 NA NA
648 2026-09-20
Low Abundance of Cytotoxic Natural Killer Cells in Peritoneal Metastasis from Appendiceal Adenocarcinoma Suggests Tumor Immune Escape
2026-Oct, Annals of surgical oncology IF:3.4Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析腹膜转移性阑尾腺癌中自然杀伤细胞的转录特征,发现其高度耗竭且缺乏细胞毒性表型,提示肿瘤免疫逃逸机制 首次针对阑尾腺癌(尤其是腹膜转移性阑尾腺癌)中NK细胞的角色进行专门研究,填补了该分子独特型胃肠道肿瘤中NK细胞功能研究的空白 样本量有限,仅基于单细胞转录组数据,缺乏蛋白水平验证和功能实验验证,且未涉及局部阑尾腺癌的对比分析 评估NK细胞在阑尾腺癌(特别是腹膜转移灶)中的作用,探索NK细胞功能拯救作为阑尾腺癌治疗策略的可能性 腹膜转移性阑尾腺癌(PMAA)肿瘤浸润的自然杀伤(NK)细胞 数字病理学 阑尾腺癌 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
649 2026-09-20
Detection of FGFR Alterations in Urothelial Carcinoma: Current Diagnostic Methodologies, Technical Considerations and Future Perspectives
2026-Oct, Clinical genitourinary cancer IF:2.3Q2
综述 本文综述了尿路上皮癌中FGFR变异的检测方法、技术考量及未来发展方向 系统整合了组织活检和液体活检的FGFR变异检测策略,并展望了人工智能、单细胞和空间转录组学、多组学整合等新技术在FGFR检测中的应用前景 作为综述文章,未提供原始实验数据,对新兴技术的讨论主要基于理论展望而非实证验证 总结尿路上皮癌中FGFR变异检测的当前诊断方法学、技术考量及未来前景 尿路上皮癌患者及FGFR2/FGFR3基因变异 数字病理学 尿路上皮癌 DNA二代测序, RNA二代测序, 基于PCR的伴随诊断检测, 荧光原位杂交, 免疫组化, 液体活检 NA 文本 NA NA NA NA NA
650 2026-09-20
Conserved hepatic RNA signatures across multiple cohorts reveal novel mechanistic clues for advanced fibrosis in human MASLD
2026-Oct-01, Hepatology communications IF:5.6Q1
研究论文 通过多队列肝脏转录组数据的荟萃分析,识别与MASLD晚期纤维化相关的保守基因特征和细胞互作机制 在约1000例MASLD患者的多队列转录组数据中识别出跨数据集保守的846个差异表达基因和配体-受体互作,克服了既往研究的异质性和样本量限制 基于转录组数据的生物信息学分析,缺乏实验验证;配体-受体互作预测需进一步功能验证 识别MASLD晚期纤维化的保守纤维化机制和可靶向的分子通路 约1000例经纤维化分期表征的MASLD患者肝脏转录组数据 机器学习 代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD) bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA 转录组数据 约1000例MASLD患者 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
651 2026-09-20
THBS1+ macrophages fuel pathogenic inflammation in alcohol-associated liver disease
2026-Oct-01, Hepatology communications IF:5.6Q1
研究论文 该研究通过整合单细胞RNA测序数据,揭示了循环IL15+单核细胞动态分化为肝脏THBS1+单核细胞来源巨噬细胞,二者协同促炎作用加速酒精相关性肝病进展 首次发现并证实循环IL15+单核细胞可动态分化为肝脏THBS1+单核细胞来源巨噬细胞,揭示了这两个亚群在酒精相关性肝病中的协同促炎作用及分化轴 摘要中未明确提及研究局限性 探究酒精相关性肝病中重要的细胞亚群及其在疾病进展中的作用机制 健康个体及酒精相关性肝病患者(包括酒精性肝硬化和重度酒精性肝炎)的外周血和肝组织,以及MetALD样小鼠模型 单细胞组学 酒精相关性肝病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
652 2026-09-19
Dermatopathology in 4D: in situ spatial transcriptomics maps the cellular and molecular architecture of skin
2026-Sep-18, The British journal of dermatology
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
653 2026-09-20
Accurate reconstruction of spatial cell-type maps and characterization of domain-specific functions based on a gene-aware heterogeneous network
2026-Sep-18, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 提出了一种基因感知的异构图注意力网络STGnet,用于空间转录组数据的细胞类型解卷积和功能注释。 利用混合伪斑点生成策略捕获真实的细胞类型空间富集模式,在统一的异质网络中整合空间邻接、转录相似性和基因-斑点关联,并通过注意力权重突出域特异性基因以实现可解释的域注释。 摘要中未明确提及。 准确重建空间细胞类型图谱并表征域特异性功能,以促进空间疾病机制的发现和对病理组织组织的理解。 空间转录组数据(模拟和真实数据集)。 数字病理学 NA 空间转录组学 异构图注意力网络 图像、文本 摘要中未明确提及。 NA 空间转录组学、单细胞RNA测序 NA NA
654 2026-09-20
Mycn facilitates hematopoietic stem and progenitor cell generation from endothelial cells by inhibiting adhesion signaling
2026-Sep-18, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文揭示了Mycn通过抑制黏附信号通路促进造血干细胞和祖细胞从内皮细胞生成的作用机制 首次证明内皮特异性敲除Mycn(而非Myc)会损害小鼠胚胎中HSPC的形成;建立了嵌合分析策略以区分突变胚胎中Mycn的缺失状态;发现Mycn缺陷的HEC异常上调黏附通路,而抑制黏着斑激酶可挽救HSPC产生 研究主要基于小鼠胚胎模型,尚未在人类系统中验证;未完全阐明Mycn调控黏附信号的具体分子机制 探究Mycn和Myc在生血内皮细胞向造血干细胞和祖细胞转变(EHT)过程中的作用及其潜在机制 小鼠胚胎中的生血内皮细胞(HECs)和造血干细胞及祖细胞(HSPCs) 单细胞转录组学、发育生物学 NA 单细胞转录组学、功能实验、嵌合分析 NA 基因表达数据、图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
655 2026-09-20
Super-enhancer-driven SGK1 activates polyamine metabolism to promote autoimmune uveitis
2026-Sep-18, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 该研究整合CUT&Tag和单细胞RNA测序技术,描绘了VKH病患者CD4 T细胞的超级增强子图谱和转录谱,发现SGK1是驱动自身免疫性葡萄膜炎的关键SE相关基因 首次整合CUT&Tag和scRNA-seq技术揭示VKH病患者CD4 T细胞的超级增强子景观,鉴定SGK1为SE驱动的关键基因,并通过分子对接和分子动力学模拟发现herbacetin作为SGK1天然抑制剂 研究主要基于VKH病患者样本和小鼠模型,样本量有限,SGK1抑制剂herbacetin的临床转化仍需进一步验证 揭示自身免疫性葡萄膜炎中超级增强子驱动的调控机制,寻找潜在治疗靶点 VKH病患者CD4 T细胞及葡萄膜炎小鼠模型 单细胞组学 自身免疫性葡萄膜炎 CUT&Tag, 单细胞RNA测序 分子对接, 分子动力学模拟 基因表达数据, 表观遗传数据 NA NA single-cell RNA-seq, CUT&Tag NA NA
656 2026-09-20
Spatial biology of liver transplantation: Mapping injury, immunity, and repair in the allograft
2026-Sep-18, Liver transplantation : official publication of the American Association for the Study of Liver Diseases and the International Liver Transplantation Society IF:4.7Q1
综述 本文综述了空间转录组学和空间蛋白质组学技术在肝移植中的应用,重点探讨移植物损伤、免疫反应和修复的空间生物学机制 系统整合了基于测序、基于成像和显微切割三类空间组学平台在肝移植研究中的应用,提出空间分辨的分子特征可改善供体评估、早期风险分层和精准干预 临床转化需要纵向采样和标准化工作流程,目前仍处于早期阶段,需要与人工智能驱动的分析技术进一步整合 总结空间组学平台在肝移植研究中的技术、分析考量及新兴应用,推动生物学指导的肝移植临床实践 肝移植受体的同种异体移植物,包括缺血再灌注损伤、同种免疫损伤、慢性重塑和肝病复发等病理过程 空间组学 肝移植 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 显微切割 NA 图像, 文本 NA 10x Genomics 空间转录组学, 空间蛋白质组学 10x Visium, 10x Xenium 基于测序的空间转录组学平台、基于成像的空间转录组学平台和显微切割方法
657 2026-09-20
Multiplexed molecular imaging for spatial transcriptomics and proteomics
2026-Sep-18, Current opinion in chemical biology IF:6.9Q1
综述 本文综述了用于生物样本中转录本和蛋白质高通量多重分子成像的最新空间生物学技术,重点关注不断发展的多重成像前沿及其多样的标记策略 系统梳理并总结了面向生物医学研究的多重成像前沿技术,涵盖广泛的标记策略,并指出该领域在单分子分辨率空间组学方面存在丰富的多学科创新机会 作为综述文章,本文未提供原始实验数据,也未对各项技术进行定量比较或基准测试 综述能够实现生物样本中转录本和蛋白质高通量、多重、分子成像的最新空间生物学技术 生物样本中的转录本和蛋白质 空间组学 NA 多重分子成像 NA 图像 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学 NA NA
658 2026-09-20
Integrative single-cell and spatial transcriptomic analyses identify LMX1B as a tumor suppressor orchestrating the GDF15-ATP4B axis in renal cell carcinoma
2026-Sep-18, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 该研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了LMX1B作为肾细胞癌中的抑癌因子,通过调控GDF15-ATP4B轴发挥作用的机制 首次在肾癌发生中研究LMX1B的功能,发现其作为抑癌因子通过直接结合GDF15启动子激活其转录,进而通过ROS介导的线粒体凋亡途径抑制肿瘤进展,建立了LMX1B-GDF15-ATP4B抑癌级联轴 摘要中未明确提及研究局限性 阐明肾细胞癌中空间分辨的细胞程序和细胞间通讯网络,并研究LMX1B在肾癌发生中的作用及机制 肾细胞癌(RCC)患者肿瘤样本及正常对照组织,包括三个独立的RCC队列 数字病理学 肾细胞癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, hdWGCNA, CellChat, RCTD空间解卷积, mistyR共定位分析, qRT-PCR, 蛋白质印迹, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告基因检测 NA 图像, 文本 三个独立的RCC队列 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
659 2026-09-20
Integrated multi-omics and experimental analyses reveal VIPR1 as a potential mediator linking environmental bisphenol A exposure to MASH-HCC progression
2026-Sep-18, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 该研究通过整合转录组学、加权基因共表达网络分析、机器学习、单细胞RNA测序、虚拟敲除、虚拟筛选、分子对接和体外实验,揭示了双酚A暴露通过YY1-VIPR1轴促进MASH-HCC进展的分子机制 首次整合多组学与实验验证揭示VIPR1是连接环境双酚A暴露与MASH-HCC进展的潜在关键介质,并发现YY1作为VIPR1的上游调控因子,同时筛选出Tasisulam作为探索性转录组逆转候选药物 研究主要基于公共数据库的转录组数据和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本队列的进一步确认,Tasisulam的治疗潜力仍需更多药理学和临床前研究验证 探究环境双酚A暴露与MASH-HCC进展之间的分子机制,识别关键候选基因和潜在治疗靶点 MASH-HCC相关的转录组数据、单细胞RNA测序数据以及体外细胞模型 机器学习, 数字病理学 肝癌 转录组分析, 单细胞RNA测序, 机器学习, 分子对接, 虚拟筛选 机器学习模型, SHAP 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像 NA NA 单细胞RNA测序, 批量RNA-seq NA NA
660 2026-09-20
Nitrate transiently rewires transcription in developing xylem of Populus wood to promote cell expansion via CRF4
2026-Sep-18, The Plant cell
研究论文 该研究揭示了硝酸盐在杂交杨树木质部发育过程中通过CRF4短暂调控转录,促进木质部细胞扩张的分子机制 首次在木本植物中通过直接将硝酸盐递送至木质部汁液,结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq,揭示了硝酸盐在发育木质部中引发的快速、细胞类型特异性的转录响应,并鉴定出CRF4作为连接硝酸盐感知与木质部细胞扩张的关键调控因子 研究主要在杂交杨树中进行,硝酸盐信号模块在其他木本植物中的保守性尚不明确;CRF4调控的下游具体靶基因网络及与其他信号通路的交互作用有待进一步阐明 探究硝酸盐在木本组织中的感知机制及其如何转化为发育输出,特别是硝酸盐信号如何调控木质部发育 杂交杨树(Populus tremula × P. tremuloides)发育中的木质部组织 植物生物学 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA 转录组数据 NA 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq 10x Chromium, Illumina测序平台 NA
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