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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2026-05-06 |
Guidelines for evaluating endothelial function in vascular tissue
2026-May-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00656.2025
PMID:41801061
|
指南 | 本文提供了评估血管组织中内皮功能的指南,整合了传统功能测定与现代分子方法 | 将传统功能测定(如导线和压力肌电图)与现代分子方法(如批量及单细胞转录组学、蛋白质组学和先进成像)相结合,形成统一的评估指南 | 未明确提及具体局限性 | 建立评估内皮功能的最佳实践,提高研究的严谨性、可重复性和理解力 | 内皮细胞及其在血管组织中的功能 | NA | 心血管疾病 | 批量转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学、先进成像 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、成像数据 | NA | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 642 | 2026-05-06 |
Integrative transcriptomic profiling reveals molecular signatures of disease progression from gastroesophageal reflux disease to Barrett's esophagus: A foundation for single-cell resolution studies
2026-May, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100412
PMID:41839318
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research paper | 通过整合性转录组分析揭示了从胃食管反流病到巴雷特食管进展的分子特征,为单细胞分辨率研究奠定基础 | 首次系统性地在胃食管反流病和巴雷特食管之间进行大规模转录组比较,识别出1247个差异表达基因及相关信号通路,并揭示了疾病进展的分子标志物 | 缺少单细胞分辨率数据支撑,研究队列样本量较小(N=40),部分临床分子关联分析存在重叠分布 | 阐明胃食管反流病向巴雷特食管转变过程中的分子机制,建立单细胞转录组研究的框架基础 | 胃食管反流病和巴雷特食管患者的食管组织样本 | 数字病理学 | 食管癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 40名患者(20名胃食管反流病,20名巴雷特食管) | Illumina | 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | 高通量RNA测序平台,使用HISAT2比对和StringTie定量分析 |
| 643 | 2026-05-06 |
Activated microglia contribute to paraquat neurotoxicity through neuroinflammation and regulation of phenotypic polarization of astrocytes
2026-May, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120120
PMID:41966020
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研究论文 | 本研究探讨了活化的小胶质细胞通过神经炎症和星形胶质细胞表型极化调控参与百草枯神经毒性的机制 | 首次利用单细胞RNA测序揭示PI3K/AKT通路在百草枯诱导的星形胶质细胞表型转化中的调控作用,并阐明小胶质细胞-星形胶质细胞互作在神经免疫毒性中的关键角色 | 未明确提及研究局限性 | 探究百草枯暴露下小胶质细胞调控星形胶质细胞表型极化及神经炎症的分子机制 | 小胶质细胞、星形胶质细胞、多巴胺能神经元 | 机器学习 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 644 | 2026-05-06 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals novel lncRNA macromolecules associated with PARP11, LMF1, and RRM2 regulatory axes in non-small cell lung cancer
2026-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151932
PMID:41997320
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示非小细胞肺癌中与PARP11、LMF1和RRM2调控轴相关的新型lncRNA大分子 | 识别了三种新型lncRNA大分子(AC005842.1、AC009041.2、AC007240.1)并建立了与关键癌症通路的联系,开发了开源的lncScape Shiny应用,引入lncRNA动力学评分和转录因子-lncRNA动力学评分两种新策略 | 未详细说明样本量和验证数据集范围 | 揭示非小细胞肺癌中lncRNA大分子的调控作用及其与肿瘤微环境异质性的关系 | 非小细胞肺癌细胞系和单细胞RNA测序数据中的肿瘤及免疫细胞群体 | 单细胞转录组学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序,定量实时PCR | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 645 | 2026-05-06 |
Identification of tissue plasminogen activator (PLAT) as a potential target linking osteoarthritis and psoriasis: Integrated bioinformatics analysis and molecular dynamics simulation
2026-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152038
PMID:41997321
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析和分子动力学模拟,识别组织型纤溶酶原激活剂(PLAT)作为骨关节炎和银屑病的潜在共同分子靶点 | 首次通过多组学整合策略(WGCNA、机器学习和单细胞RNA-seq)发现PLAT作为骨关节炎和银屑病共病的共享分子靶点,并利用分子对接和分子动力学模拟预测核黄素为候选PLAT结合化合物 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏大规模临床样本验证;核黄素的体内治疗效果和长期安全性尚未评估 | 识别骨关节炎和银屑病之间的共享分子靶点并探索潜在干预化合物 | 骨关节炎和银屑病的基因表达数据、关节软骨细胞及TNF-α刺激的C28/I2细胞 | 生物信息学 | 骨关节炎, 银屑病 | WGCNA, 机器学习(LASSO、随机森林、人工神经网络), 免疫浸润分析, 单细胞RNA-seq, 分子对接, 分子动力学模拟, MM/PBSA结合自由能计算, RT-qPCR, CCK-8实验, ACLT+MMx小鼠OA模型 | LASSO, 随机森林, 人工神经网络 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 分子结构数据 | NA(基于公开数据集分析,未提供具体样本数量) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 646 | 2026-05-06 |
Advanced single-cell transcriptomics deciphers cellular complexity and MIF-orchestrated signaling networks in diabetes-induced myocardial disease
2026-May, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100420
PMID:41997558
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研究论文 | 通过整合批量与单细胞转录组学方法,系统解析糖尿病所致心肌病变中的细胞异质性和MIF介导的信号网络 | 首次在糖尿病心肌病中结合批量与单细胞转录组分析,揭示了21种成纤维细胞亚型并阐明MIF信号作为关键的细胞间协调枢纽 | 研究基于疾病模型,可能不完全反映人类病变的复杂性;未提供功能验证或干预实验来确认MIF信号的因果作用 | 阐明糖尿病所致心肌功能障碍的转录组架构和细胞间信号框架 | 糖尿病疾病模型的心脏标本 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | WGCNA, CellChat, Seurat | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 未在标题和摘要中明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 647 | 2026-05-06 |
Common potential drug targets for ischemic stroke and coronary heart disease: CYR61, IL2RB, and ST3GAL2 are identified as key regulatory proteins
2026-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152034
PMID:41999825
|
研究论文 | 通过整合基因组学方法,鉴定出CYR61、IL2RB和ST3GAL2是缺血性卒中与冠心病共有的关键调控蛋白及潜在药物靶点 | 首次整合双向孟德尔随机化、共定位分析、单细胞转录组学和分子动力学模拟,系统揭示缺血性卒中与冠心病的共享遗传架构并优先筛选出候选蛋白 | 分子动力学模拟仅生成结构假说,缺乏直接的功能验证;候选蛋白的临床相关性主要基于表达水平,尚需进一步的药理学验证 | 阐明缺血性卒中与冠心病之间的双向遗传关系,并优先筛选共享候选蛋白作为潜在治疗靶点或生物标志物 | 冠心病和缺血性卒中患者 | 机器学习 | 心血管疾病 | GWAS分析、孟德尔随机化、共定位分析、单细胞转录组学、分子动力学模拟 | NA | 基因组数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 648 | 2026-05-06 |
Single-cell and spatial transcriptomic profiling reveal CST6 + epithelial-SPP1+ macrophage crosstalk driving lung adenocarcinoma metastasis
2026-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152105
PMID:42002169
|
研究论文 | 结合单细胞转录组和空间转录组分析揭示CST6+上皮细胞与SPP1+巨噬细胞互作驱动肺腺癌转移的机制 | 首次在肺腺癌中系统鉴定CST6+上皮细胞与SPP1+巨噬细胞的互作通过CST6-SPP1信号轴触发TGF-beta和MMP9等促转移因子分泌,并整合单细胞、空间转录组和功能实验提供多维度验证 | 未提及具体局限性 | 探究肺腺癌转移过程中肿瘤微环境驱动的细胞互作机制 | 肺腺癌原发灶及多部位转移灶(淋巴结、胸膜、脑) | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、多重免疫组化 | NA | 基因表达数据、空间转录数据、组织图像 | 原发肺腺癌及多部位转移样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序、10x Visium空间转录组学 |
| 649 | 2026-05-06 |
Elevated Cutaneous Interleukin-21 Links Eczematous Eruption to Interleukin-17A Inhibitor Treatment in Psoriasis
2026-May, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70026
PMID:40879286
|
研究论文 | 研究发现皮肤中白细胞介素-21水平的升高与银屑病患者接受白细胞介素-17A抑制剂治疗后出现湿疹样皮疹相关 | 首次揭示了IL-21在抗IL-17A治疗相关EE发病机制中的关键调控作用,阐明了其通过JAK-STAT信号通路激活Th2/Th22反应的机制 | 未提及具体局限性 | 阐明银屑病患者接受抗IL-17A治疗后出现湿疹样皮疹的发病机制并鉴定致病分子 | 银屑病患者治疗前后的皮肤样本(包括出现和未出现湿疹样皮疹的样本) | 机器学习 | 银屑病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 组织病理分析, 蛋白质检测, ELISA, LEGENDplex, 体外实验 | NA | 转录组测序数据 | 银屑病患者皮肤样本(治疗前后,包括有和无EE的样本) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 650 | 2026-05-06 |
The dual molecular identity of vestibular kinocilia bridges structural and functional traits of primary and motile cilia
2026-Apr-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.108071
PMID:42029006
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研究论文 | 揭示了前庭动纤毛兼具初级纤毛和运动纤毛的结构与功能特征 | 首次通过单细胞RNA测序发现前庭毛细胞中动纤毛同时表达初级和运动纤毛相关基因,并证实其具有自发运动能力 | 未明确动纤毛自发运动在机械传导中的具体功能机制 | 阐明前庭动纤毛的分子组成、结构特征和功能特性 | 成年小鼠前庭和耳蜗毛细胞 | 机器学习和数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 成年小鼠前庭和耳蜗毛细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 651 | 2026-05-06 |
Decoding Organ-Specific Vulnerability to Triptolide Toxicity: A Systems Toxicology Approach Targeting Glucose Metabolism
2026-Apr-24, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
研究论文 | 利用系统毒理学方法解析雷公藤甲素多器官毒性的分子机制,重点关注葡萄糖代谢紊乱 | 首次通过整合网络药理学、孟德尔随机化、分子对接、分子动力学模拟和单细胞RNA测序分析,系统揭示雷公藤甲素通过靶向糖酵解和磷酸戊糖途径关键酶导致器官特异性毒性的双重机制 | 该研究主要基于计算分析,缺乏体内外实验验证;孟德尔随机化分析受限于现有GWAS数据质量;分子对接结果需进一步晶体学验证 | 阐明雷公藤甲素导致多器官毒性的分子机制,为设计更安全的雷公藤甲素类似物提供理论基础 | 雷公藤甲素对肝脏、肾脏、心脏和生殖系统的毒性作用及其靶点 | 系统毒理学 | 药物毒性 | 网络药理学, 孟德尔随机化, 分子对接, 分子动力学模拟, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 652 | 2026-05-06 |
Mechanisms Underlying the Therapeutic Effects of GeXiaZhuYu Decoction Treating Colorectal Cancer based on Network Pharmacology, Molecular Docking, and Molecular Dynamics Simulations
2026-Apr-23, Current computer-aided drug design
IF:1.5Q3
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研究论文 | 本研究通过网络药理学、分子对接和分子动力学模拟,揭示了膈下逐瘀汤治疗结直肠癌的潜在分子机制 | 首次结合网络药理学、分子对接、分子动力学模拟和MM-GBSA结合自由能分析的多层次计算策略,从系统层面解析膈下逐瘀汤的活性成分与结直肠癌相关靶点的相互作用,并利用单细胞RNA-seq数据验证关键靶点的细胞类型特异性表达 | 研究结果基于计算分析,不直接暗示药理效应或因果机制,需要进一步实验验证 | 从系统层面表征膈下逐瘀汤治疗结直肠癌的潜在药理机制 | 膈下逐瘀汤的活性成分(槲皮素、木犀草素、山奈酚)与结直肠癌相关靶点(HSP90AA1、AKT1、TP53) | 机器学习 | 结直肠癌 | 网络药理学、分子对接、分子动力学模拟、MM-GBSA分析、单细胞RNA-seq | NA | 文本、基因表达数据 | 单细胞RNA-seq数据集GSE144735 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 653 | 2026-05-06 |
Single-Cell Ligand-Receptor Profiling Identifies Targetable Signaling Axes and Therapeutic Candidates in Lupus Nephritis
2026-Apr-22, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 通过单细胞配体-受体分析鉴定狼疮性肾炎中可靶向的信号轴及治疗候选药物 | 首次基于高关联配体-受体对进行狼疮性肾炎亚型分类,并结合分子对接和动力学模拟筛选老药新用候选物 | 仅基于公共单细胞数据,缺乏前瞻性队列验证;体内实验尚未开展 | 阐明配体-受体信号在狼疮性肾炎免疫微环境中的作用并发现治疗靶点 | 狼疮性肾炎患者肾脏组织的单细胞转录组数据 | 计算生物学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 整合多个公开单细胞RNA-seq数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序 |
| 654 | 2026-05-06 |
Divergent Macrophage-Regulated T cell States Determine Response to Bacillus Calmette-Guérin vaccine in High-Risk Bladder Cancer
2026-Apr-21, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI200442
PMID:42081487
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 655 | 2026-05-06 |
Single-cell TCR mapping reveals spatially coordinated T cell states in head and neck cancer
2026-Apr-10, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aec3133
PMID:41961948
|
研究论文 | 提出一种空间TCR图谱分析策略,以单细胞分辨率解析头颈鳞癌中T细胞克隆、转录状态和空间位置的关系 | 首次实现单细胞层面同时解析T细胞克隆身份、转录状态和空间位置,揭示肿瘤微环境中T细胞状态的空间协调性 | 标题和摘要未提及明显局限性 | 开发空间TCR图谱方法,解析头颈癌肿瘤微环境中T细胞的空间组织与功能状态 | 人原发性头颈部鳞状细胞癌组织样本 | 数字病理学 | 头颈癌 | 空间TCR图谱分析 | NA | 空间转录组与TCR测序数据 | 多例头颈鳞癌患者样本(具体数量未提及) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 656 | 2026-05-06 |
CD55-expressing myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) drive cancer immunoevasion
2026-Apr-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012980
PMID:41963079
|
研究论文 | 发现表达CD55的髓系来源抑制细胞(MDSCs)驱动肿瘤免疫逃逸 | 首次鉴定CD55作为MDSCs的保守表面标志物,并揭示其通过代谢重编程(促进糖原磷酸化酶PYGL磷酸化驱动糖酵解)维持免疫抑制表型的新机制 | 主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证规模有限;托马替丁等小分子抑制剂的体内应用效果需进一步评估 | 阐明MDSCs表面分子CD55在肿瘤免疫逃逸中的作用机制及治疗潜力 | MDSCs及其表达的CD55分子 | 数字病理学 | 多种癌症类型(八种癌症) | 单细胞RNA测序、RNA测序、DNA pulldown、染色质免疫共沉淀、荧光素酶报告基因、免疫共沉淀、免疫印迹、免疫沉淀-质谱、分子对接、表面等离子共振成像 | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 八种癌症类型的公共单细胞RNA测序数据集、人类患者样本及小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 657 | 2026-05-06 |
QuantumXCT: Learning Interaction-Induced State Transformation in Cell-Cell Communication via Quantum Entanglement and Generative Modeling
2026-Apr-09, ArXiv
PMID:41958473
|
research paper | 提出一个混合量子-经典生成框架QuantumXCT,从单细胞转录组中推断细胞间通讯,通过量子纠缠学习相互作用诱导的状态变换 | 将细胞间通讯推断从静态配体-受体数据库查询转变为学习数据驱动的状态变换,利用量子电路的可解释性揭示生物通信网络,无需先验生物学假设 | 未明确说明,但可能受限于量子电路的规模及对合成数据的验证而非大规模真实数据 | 开发一种无先验知识依赖的细胞间通讯推断方法,通过量子机器学习建模信号导致的细胞状态变化 | 卵巢癌-成纤维细胞共培养模型中的单细胞转录组数据及合成数据中的已知交互 | machine learning, quantum machine learning, computational biology | ovarian cancer | single-cell RNA-seq, quantum computing | hybrid quantum-classical generative model, parameterized quantum circuits | gene expression data, synthetic data | 未知具体样本数量,涉及卵巢癌-成纤维细胞共培养的scRNA-seq数据 | Illumina(假设用于scRNA-seq测序,从上下文推断) | single-cell RNA-seq | NA(未在标题或摘要中指定具体平台产品) | NA |
| 658 | 2026-05-06 |
Generation of a prop1 knock-in zebrafish enables single-cell transcriptomics of early pituitary development
2026-Apr-07, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqag043
PMID:42035243
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研究论文 | 通过生成prop1敲入斑马鱼,利用单细胞转录组学研究早期垂体发育 | 首次创建了prop1基因敲入GAL4报告基因斑马鱼品系,实现了对早期垂体发育的单细胞分辨率和活体成像研究,并提供了首个斑马鱼早期垂体发育的单细胞图谱 | 未明确提及 | 研究脊椎动物腺垂体原基发育的早期分子机制及内分泌细胞谱系分化 | 斑马鱼和小鼠的早期垂体组织 | 单细胞转录组学 | 垂体发育相关疾病(如侏儒症、性成熟障碍) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、活体成像 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼和小鼠垂体组织样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 659 | 2026-05-06 |
Cardiac Fibrosis: Mechanobiology, Epigenetics, and the Path to Precision Therapy
2026-Apr, Cellular and molecular bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s12195-026-00896-z
PMID:42080143
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综述 | 全面综述心脏纤维化的机械生物学、表观遗传学机制及精准治疗路径 | 整合单细胞和空间转录组学、生物力学及表观遗传学数据,系统阐述纤维化细胞异质性与分子环路;提出CRISPR基因编辑、FAP靶向CAR-T、纳米RNA递送及患者心脏类器官等新兴可逆疗法;构建结合基因组学、生物标志物、AI和环境风险评估的精准抗纤维化策略 | 作为综述,未提供原创实验数据;新兴疗法的临床转化尚处于早期阶段,缺乏大规模验证 | 阐明心脏纤维化的机械生物学与表观遗传学机制,并规划从基础研究到临床精准治疗的转化路线图 | 心脏纤维化中的成纤维细胞、心肌细胞-细胞外基质串扰、机械传导信号及表观遗传调控网络 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学,空间转录组学,基因编辑,CAR-T免疫疗法,纳米医学,类器官技术 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium空间转录组学平台 |
| 660 | 2026-05-06 |
A Chromosome-level Assembly and Functional Genomic Resources for the Model Annelid Capitella teleta
2026-03-02, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evag041
PMID:41732109
|
研究论文 | 结合长和短读长测序及Hi-C染色质构象捕获技术,构建了环节动物Capitella teleta实验室品系的染色体级别核和线粒体基因组,并提供了功能性基因组资源 | 首次组装了环节动物C. teleta的染色体级别基因组,并揭示了核与线粒体基因组的重排现象,为进化发育生物学和比较基因组学提供了高质量参考资源 | 未具体说明局限性,但可能包括样品来源单一(实验室品系)或基因组注释的潜在不完整性 | 为模式环节动物Capitella teleta创建现代化基因组资源,提升其作为进化发育生物学和生态毒理学模型的实用性 | 环节动物Capitella teleta(多毛纲)的实验室品系 | 基因组学 | NA | 长读长测序、短读长测序、Hi-C染色质构象捕获、RNA-seq、ATAC-seq、EM-seq | NA | 基因组序列、RNA-seq数据、ATAC-seq数据、EM-seq数据 | C. teleta实验室品系的一个样本 | NA | 长读长测序、短读长测序、Hi-C、RNA-seq、ATAC-seq、EM-seq | NA | NA |