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当前共找到 9441 篇文献，本页显示第 6401 - 6420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6401 | 2026-05-17 |
Single-cell analysis of signalling and transcriptional responses to type I interferons
2026-May, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-026-00750-3
PMID:41896367
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研究论文 | 通过质谱流式技术和RNA测序分析I型干扰素在免疫细胞中的信号传导与转录反应 | 首次在多种原代免疫细胞中比较不同I型干扰素亚型的信号和转录反应，并发现细胞类型特异性的STAT磷酸化变化和基因表达模式 | 未发现不同I型干扰素亚型诱导的定性差异，且研究仅限于体外刺激系统 | 探究不同I型干扰素是否诱导不同的细胞反应 | 人外周血单个核细胞（PBMCs） | 细胞生物学, 免疫学 | 抗病毒免疫, 自身炎症, 肿瘤免疫 | 质谱流式细胞术, RNA测序（bulk和单细胞RNA-seq） | NA | 蛋白质磷酸化数据, 基因表达数据 | 人外周血单个核细胞 | NA | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6402 | 2026-05-17 |
Chikungunya virus persists in joint-associated macrophages and promotes chronic disease in mice
2026-May, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02303-9
PMID:41922840
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、空间转录组学和流式细胞术，探究甲病毒感染小鼠关节相关组织中巨噬细胞持续携带基孔肯雅病毒RNA并促进慢性疾病的机制 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示慢性期关节相关组织中巨噬细胞持续携带病毒RNA并参与炎症维持，且CD4 T细胞通过MHC II表达调控巨噬细胞炎症反应 | 研究仅基于小鼠模型，未验证人类样本；未明确巨噬细胞中病毒持续复制的具体分子机制 | 阐明甲病毒（如基孔肯雅病毒）在慢性期通过巨噬细胞持续复制引发关节炎症的机制 | 甲病毒感染小鼠的关节相关组织 | 机器学习 | 甲病毒相关慢性关节疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、空间表达数据 | 甲病毒感染小鼠（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 6403 | 2026-05-17 |
Spatial transcriptomics maps host-gut microbiome biogeography at high resolution
2026-May, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02286-7
PMID:41792309
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研究论文 | 该研究开发了一种高分辨率空间转录组学方法，用于绘制宿主-肠道微生物组生物地理学图谱 | 通过酶促原位多聚腺苷酸化结合空间RNA测序，提高了细菌RNA回收率，实现了对低丰度和空间受限微生物类群的转录组分析，首次在亚微米分辨率下研究肠道微生物组的空间组织 | 文章中未明确提及局限性 | 开发一种在肠道中以高分辨率广泛空间采样微生物组-宿主相互作用的方法 | 小鼠肠道微生物组及宿主组织 | 数字病理学 | 肠道肿瘤 | 空间RNA测序、酶促原位多聚腺苷酸化 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠肠道肿瘤模型样品 | Illumina | 空间转录组学 | 空间RNA测序平台 | 采用商业空间RNA测序平台进行高分辨率（1 µm）分析 |
| 6404 | 2026-05-17 |
RELB Overexpression Induced by DNA Hypomethylation Contributes to Perioperative Immunotherapy Resistance in Resectable Esophageal Squamous Cell Carcinoma by Modulating the mregDC-Treg Axis
2026-May, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71863
PMID:42130013
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研究论文 | DNA低甲基化诱导的RELB过表达通过调节mregDC-Treg轴导致可切除食管鳞癌围手术期免疫治疗耐药 | 首次发现RELB通过mregDC-Treg轴介导食管鳞癌围手术期免疫治疗耐药，并揭示DNA低甲基化是其过表达的调控机制 | NA | 识别可切除食管鳞癌围手术期免疫治疗疗效的预测生物标志物，并阐明非应答者治疗耐药的机制 | 可切除食管鳞癌患者组织样本及Eca109和KYSE450细胞系 | 数字病理学 | 食管癌 | 亚硫酸盐测序、甲基化特异性PCR、单细胞RNA测序、批量RNA测序、三重免疫荧光染色 | NA | 组织样本、单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 59例接受围手术期免疫治疗的食管鳞癌患者组织样本，以及组织微阵列样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6405 | 2026-05-17 |
osr1 as a Novel Marker for ICC-Like Cells Development in Zebrafish
2026-May, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.70162
PMID:42132003
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现osr1作为ICC样细胞的新型标志基因，并在斑马鱼中验证其对肠道发育的关键作用 | 首次发现osr1是ICC样细胞的新型标志基因，并揭示其通过调控yap1影响肠道发育的机制 | 未提及具体局限性 | 探究osr1在肠道发育和疾病中的功能 | 人类和斑马鱼的肠道组织及ICC样细胞 | 数字病理学 | 肠道疾病 | 单细胞转录组测序、转基因技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类IBD患者活检组织和斑马鱼样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6406 | 2026-05-17 |
scHilda: Hierarchical Integration of LLM with KG database for single cell type annotation
2026-May, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014291
PMID:42113882
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研究论文 | 提出scHilda框架，将大型语言模型与知识图谱分层集成，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型注释 | 提出层次化仲裁注释策略，先识别主要细胞谱系再动态检索子图领域信息以精确解析细胞亚型，有效约束LLM决策空间、降低幻觉风险并减轻知识库缺陷导致的误导 | 未提及具体限制，但依赖外部知识库质量且仅验证于基准数据集 | 开发一种集成外部知识图谱与大型语言模型的鲁棒框架，提升单细胞注释的准确性、可解释性和泛化能力 | 单细胞RNA测序中的细胞类型注释任务 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 大型语言模型（LLM） | 基因表达数据 | 多个基准数据集，具体样本量未说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6407 | 2026-05-17 |
Stromal NNMT overexpression as an independent prognostic biomarker in lung adenocarcinoma and breast carcinoma
2026-Apr-09, Carcinogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/carcin/bgag020
PMID:41913584
|
研究论文 | 研究了烟酰胺N-甲基转移酶在泛癌基质中的表达谱及其预后意义，并在肺腺癌和乳腺癌中进行了验证 | 首次揭示基质NNMT过表达作为肺腺癌和乳腺癌的独立预后生物标志物，并利用单细胞RNA测序和多个数据库进行多层面验证 | 数据主要来自公共数据库，独立临床队列样本量可能有限，未深入探讨NNMT的分子机制 | 探究基质NNMT在多种癌症中的表达模式及其对肺腺癌和乳腺癌患者的预后价值 | 肺腺癌和乳腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌， 乳腺癌 | RNA-seq， 单细胞RNA测序， 定量免疫组织化学 | Cox回归模型 | 基因表达数据， 蛋白质表达数据， 组织样本图像 | 多个公共数据库和独立临床队列 | NA | 单细胞RNA测序， 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6408 | 2026-05-17 |
Generation of biologically responsive colon-like intestinal tissue patches from human induced pluripotent stem cells using a rapid co-differentiation platform
2026-Apr-09, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-05006-4
PMID:41957847
|
研究论文 | 利用人诱导多能干细胞快速共分化平台，生成具有生物学响应性的结肠样肠道组织补片 | 开发了一种新型早期人诱导多能干细胞共分化平台，能在8天内生成多种肠道细胞谱系（上皮、间质和内皮），该方法无血清、动物产品使用大幅减少，且能形成结肠样肠道组织补片 | 仍处于早期阶段 | 开发一种可移植的肠道黏膜组织移植物，用于促进肠道损伤愈合 | 人诱导多能干细胞 | 数字病理学 | 肠道疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 多个hiPSC细胞系，并在独立中心重复 | NA | 单细胞RNA-seq, 大量RNA-seq | NA | NA |
| 6409 | 2026-05-17 |
A zero-inflated hierarchical generalized transformation model to address non-normality in spatially-informed cell-type deconvolution
2026-Apr-09, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujag055
PMID:41994891
|
研究论文 | 提出一种零膨胀分层广义变换模型，用于解决空间转录组学中细胞类型解卷积的非正态性问题，并在口腔鳞状细胞癌数据上验证其优越性能 | 首次将零膨胀分层广义变换模型应用于条件自回归解卷积框架，解决口腔鳞状细胞癌空间转录组数据的高度零膨胀问题，提高细胞类型解卷积的准确性并量化不确定性 | 未提及具体局限性 | 改进空间转录组学中细胞类型解卷积方法，处理数据非正态性和高度零膨胀问题 | 口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境中的细胞类型解卷积 | 机器学习 | 口腔癌 | 空间转录组学 | 零膨胀分层广义变换模型、条件自回归模型 | 空间转录组数据 | 口腔鳞状细胞癌样本（具体数量未提及） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6410 | 2026-05-17 |
Benchmarking tools for deciphering cellular crosstalk in spatially-resolved transcriptomics
2026-Apr-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04063-5
PMID:41952215
|
研究论文 | 该论文对九种计算细胞间相互作用推断方法在空间转录组学数据上进行了系统评估 | 首次针对空间转录组学应用场景对细胞间相互作用推断工具进行全面基准测试，涵盖多个平台和真实数据集 | 工具性能在不同空间分辨率、组织背景和平台间存在显著差异；应用于真实空间转录组学数据时面临关键挑战 | 评估空间转录组学中用于解析细胞间通讯的计算工具的性能和适用性 | 九种计算细胞间相互作用推断方法 | 空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组数据 | 九组来自三项独立研究的真实空间转录组学数据集 | 10x Genomics, BGI | 空间转录组学 | 10x Visium, MGI Stereo-seq, 10x Xenium | Visium平台、Stereo-seq平台、Xenium平台 |
| 6411 | 2026-04-04 |
Global scientific growth and thematic development of spatial transcriptomics in oncology research
2026-Apr-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04937-x
PMID:41931230
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6412 | 2026-05-17 |
A Tissue Virus Microenvironment with Activated Stress Responses Underlies Durable SIV Persistence
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716177
PMID:41959291
|
研究论文 | 通过对比早期与晚期抗逆转录病毒治疗后的SIV感染恒河猴，结合免疫PET/CT引导采样和空间转录组学，定义了组织病毒微环境（VME）在病毒持久性和反弹中的作用 | 首次利用免疫PET/CT引导的空间转录组学揭示病毒微环境（VME）的结构和功能特征，并发现其与肿瘤微环境的相似性，为HIV治愈策略提供新视角 | 未提及具体局限性 | 探究SIV在抗逆转录病毒治疗下的病毒持久性机制及其对病毒反弹的影响 | 早期与晚期启动抗逆转录病毒治疗的SIV感染恒河猴组织样本 | 数字病理学 | 艾滋病 | 空间转录组学、免疫PET/CT | NA | 影像数据, 空间转录组数据 | SIV感染的恒河猴（早期治疗组与晚期治疗组） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6413 | 2026-05-17 |
RNF128 aggravates metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease progression via stabilization of SCD1
2026-Mar-30, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001757
PMID:41911552
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研究论文 | 本研究揭示了RNF128通过稳定SCD1加重代谢功能障碍相关脂肪性肝病进展的机制 | 首次发现E3泛素连接酶RNF128通过催化SCD1的K63连接泛素化并阻断其自噬溶酶体降解，促进脂质积累，并验证了靶向RNF128的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类MASLD的异质性和复杂性可能限制其直接临床转化 | 阐明RNF128在MASLD进展中的功能及其分子机制，并评估其治疗靶点潜力 | 人类MASLD肝脏组织、饮食诱导的MASLD小鼠模型、肝细胞特异性RNF128敲除和过表达模型 | 分子生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 泛素组学分析 | NA | RNA序列数据, 蛋白质组学数据, 泛素组学数据 | 未明确说明具体样本量，涉及人类肝脏样本和小鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6414 | 2026-05-17 |
KIF11 prevents retinal endothelial ferroptosis in familial exudative vitreoretinopathy by inhibiting phosphorylation-driven PRDX1 phase separation
2026-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71009-7
PMID:41872221
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研究论文 | 通过bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析，发现KIF11是家族性渗出性玻璃体视网膜病变中视网膜内皮细胞的关键下游效应因子，并通过抑制磷酸化驱动的PRDX1相分离来阻止铁死亡 | 首次揭示β-catenin/KIF11/PRDX1轴依赖的铁死亡机制在家族性渗出性玻璃体视网膜病变中的作用，并强调铁死亡靶向和抗氧化策略作为潜在疗法 | 未提及 | 探究家族性渗出性玻璃体视网膜病变的发病机制，特别是下游致病机制 | 视网膜内皮细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 家族性渗出性玻璃体视网膜病变 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠组织样本（具体数量未提及） | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 使用bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析视网膜内皮细胞 |
| 6415 | 2026-05-17 |
Ganglioside-Mediated Neural-Acinar Crosstalk Facilitates Pancreatic Carcinogenesis via Metaplastic Niche Remodeling
2026-Mar-16, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2026.02.033
PMID:41850539
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研究论文 | 本研究揭示了神经-腺泡细胞间通过神经节苷脂介导的相互作用在胰腺癌发生中的作用机制 | 首次阐明神经节苷脂GM3在腺泡-导管化生与神经重塑双向串扰中的关键作用，发现β-1,4-半乳糖基转移酶5在胰腺癌早期病变中的过表达及其作为治疗靶点的潜力 | 未提供具体局限性信息 | 系统研究胰腺导管腺癌发生过程中腺泡-导管化生与神经重塑之间的相互作用机制 | 小鼠ADM模型、胰腺上皮内瘤变病变、PDAC病变、小鼠及人类细胞系和组织标本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 质谱脂质组学分析、单细胞RNA测序、基因过表达/敲低、免疫组化、免疫印迹 | NA | 转录组数据、脂质组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6416 | 2026-05-17 |
Integrated multi-omics analysis reveals that MARCKS reprograms the immunosuppressive microenvironment to drive hepatocellular carcinoma progression
2026-Mar-11, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01372-7
PMID:41813922
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科研论文 | 通过多组学综合分析揭示MARCKS在肝细胞癌中重编程免疫抑制微环境以驱动肿瘤进展的机制 | 首次整合批量转录组学、单细胞RNA测序和空间转录组学，系统阐明MARCKS在肝细胞癌免疫微环境中的调控作用及其通过JAK/STAT3信号通路促进M2型巨噬细胞极化的新机制 | 主要依靠临床样本和细胞系实验，缺乏大规模前瞻性队列验证，MARCKS作为治疗靶点的体内药效学验证尚不充分 | 阐明MARCKS在肝细胞癌免疫抑制微环境中的作用机制及其作为治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌患者肿瘤组织样本和肝癌细胞系 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多免疫荧光 | NA | 转录组数据， 单细胞转录组数据， 空间转录组数据， 免疫荧光图像 | 多组肝细胞癌临床样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6417 | 2026-05-17 |
Progenitor CD8+ T cells and hyper-Treg crosstalk: a driver of immune checkpoint inhibitor resistance in esophageal squamous cell carcinoma
2026-01-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02256-0
PMID:41524793
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究食管鳞状细胞癌中免疫检查点抑制剂耐药机制，揭示祖细胞CD8+ T细胞与超强Treg之间的相互作用 | 首次发现抗原递呈恶性上皮细胞与T细胞之间的交互作用在食管鳞癌免疫检查点抑制剂耐药中的关键作用，以及超强Treg通过CLEC2C-KLRB1轴调节CD8 T细胞活化的新机制 | 基于公开数据库的scRNA-seq数据，样本量有限（24例），且缺乏功能性验证实验 | 阐明食管鳞状细胞癌中肿瘤抗原呈递和肿瘤微环境内细胞间相互作用如何驱动免疫检查点抑制剂耐药 | 接受化疗和免疫检查点抑制剂治疗的食管鳞状细胞癌患者 | 机器学习 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 24例食管鳞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6418 | 2026-05-17 |
Patient-derived liver organoids recapitulate liver epithelial heterogeneity and enable precision modeling of alcohol-related liver disease
2026-01, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.07.014
PMID:40754225
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研究论文 | 本研究开发了一种从酒精性肝病患者肝脏穿刺活检样本中衍生的类器官模型，该模型能够重现肝上皮异质性，并用于酒精性肝病的精准建模 | 首次从酒精性肝病患者的穿刺活检样本中生成类器官，并证明其能捕捉肝上皮细胞的异质性和疾病阶段特异性特征，从而为个性化疾病建模和药物测试提供新的平台 | 未提及具体局限性 | 开发一种能够捕捉肝上皮异质性和患者特异性特征的人类模型，以推进酒精性肝病的精准建模和个性化治疗 | 酒精性肝病患者的穿刺活检样本及其衍生的类器官 | 数字病理学 | 酒精性肝病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光 | 类器官模型 | 图像、文本 | 早期阶段患者28例，晚期阶段患者34例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6419 | 2026-05-17 |
Integrative bioinformatic analysis prioritizes TIMP1 and FN1 as angiogenesis-related candidate genes in diabetic foot ulcers
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0348808
PMID:42127081
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析，优先识别TIMP1和FN1作为糖尿病足溃疡中血管生成相关的候选基因 | 首次将批量转录组数据、机器学习基因优先级排序和单细胞RNA测序相结合，系统表征糖尿病足溃疡中血管生成损伤相关的分子特征 | FN1 mRNA表达下降趋势未达到统计学显著性，且结论基于生物信息学探索性分析，需进一步实验验证 | 探索糖尿病足溃疡中与血管生成损伤和修复受损相关的分子特征 | 糖尿病足溃疡的转录组数据及单细胞表达模式 | 机器学习, 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 机器学习 | LASSO逻辑回归模型 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 使用GSE199939和GSE134431数据集（含发现队列和复制队列） | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6420 | 2026-05-17 |
UBE2S emerges as a key driver in an NK cell-based prognostic model for clear cell renal cell carcinoma
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0344925
PMID:42133651
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序与多队列转录组验证，构建基于NK细胞和UBE2S的肾透明细胞癌预后模型 | 首次通过单细胞RNA测序揭示NK细胞亚群在ccRCC肿瘤微环境中的关键作用，并发现UBE2S作为驱动基因参与肿瘤进展；基于CoxBoost算法构建的12基因预后模型在多独立数据集中验证了高预测准确性 | 未提供明显的局限性信息 | 探索肾透明细胞癌的免疫微环境异质性，建立稳健的预后分子标志物和治疗靶点 | 肾透明细胞癌患者肿瘤及癌旁组织 | 机器学习, 数字病理学 | 肾细胞癌, 肾透明细胞癌 | 单细胞RNA测序, 转录组测序, CoxBoost, 体外敲低实验 | CoxBoost, 加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据, 转录组数据 | 多队列转录组验证，具体样本数未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |