单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1772 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-02-02 |
Multi-omics characterization of cachexia-related genes reveals prognostic signatures and immune landscape in breast cancer
2026-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04025-6
PMID:40880013
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了恶病质相关基因在乳腺癌中的预后和免疫学意义，并构建了一个基于11个基因的预后模型 | 首次构建了一个基于恶病质相关基因的乳腺癌预后风险评分模型（CRSBC），并通过单细胞RNA-seq分析揭示了HCCS基因在乳腺癌细胞和巨噬细胞招募中的关键作用 | 研究主要基于TCGA等公共数据库数据，缺乏外部实验验证，且样本来源和临床特征可能存在异质性 | 探究恶病质相关基因在乳腺癌中的预后价值和免疫微环境中的作用 | 乳腺癌患者及其相关的恶病质相关基因 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 差异表达分析，加权基因共表达网络分析（WGCNA），LASSO-Cox回归，单细胞RNA-seq分析 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据，单细胞RNA-seq数据 | 基于TCGA-BRCA队列数据，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 622 | 2026-02-02 |
Immunomodulatory Mechanism of Baiyaojian Decoction on Periodontitis: Network Pharmacology, Single-Cell RNA Sequencing and Molecular Docking
2026-Feb, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71034
PMID:41605874
|
研究论文 | 本研究通过网络药理学、单细胞RNA测序和分子对接，探讨了白药煎剂治疗牙周炎的免疫调节机制 | 首次整合网络药理学、单细胞RNA测序和分子对接技术，系统揭示白药煎剂治疗牙周炎的多成分、多靶点免疫调节机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证，缺乏体内动物模型或临床试验的进一步验证 | 探究白药煎剂治疗牙周炎的分子机制和免疫调节作用 | 牙周炎患者组织样本（来自GEO数据库的RNA-seq数据）及白药煎剂的活性成分 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、分子对接、qRT-PCR、流式细胞术、ELISA | 网络药理学分析、细胞间通讯网络分析（CellChat）、细胞分化轨迹分析（monocle3） | 基因表达数据、分子结构数据 | 包含GSE16134（批量RNA-seq）、GSE152042和GSE171213（单细胞RNA-seq）等多个公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 623 | 2026-02-02 |
A Glucose-Responsive Intelligent Antibacterial and Oxygen-Producing Hydrogel Promotes the Healing of Diabetic Wounds by Regulating Cellular Heterogeneity
2026-Jan-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517028
PMID:41619261
|
研究论文 | 本研究开发了一种葡萄糖响应型智能抗菌产氧水凝胶CF-CPGaMPN，用于促进糖尿病感染伤口的愈合 | 通过结合PVP@CaO纳米颗粒、过氧化氢酶和GaMPN纳米颗粒，实现了葡萄糖触发的按需药物释放，并利用单细胞RNA测序分析了伤口周围的多细胞生态系统 | NA | 开发一种智能水凝胶以促进糖尿病感染伤口的愈合 | 糖尿病感染伤口及其周围的多细胞生态系统 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 624 | 2026-02-02 |
COL14A1 drives ischemic cardiac injury in PCOS: an artificial intelligence-identified biomarker
2026-Jan-31, QJM : monthly journal of the Association of Physicians
DOI:10.1093/qjmed/hcag033
PMID:41619759
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与人工智能方法，鉴定出COL14A1是多囊卵巢综合征与缺血性心肌病共享的关键生物标志物，并揭示了其在免疫-纤维化轴中的作用机制 | 首次通过整合多组学数据与105种机器学习模型组合，系统鉴定出连接PCOS与缺血性心脏损伤的共享生物标志物COL14A1，并利用单细胞及空间转录组学解析其细胞特异性与组织定位 | 研究结论主要基于生物信息学分析与体外数据，缺乏体内实验验证；候选药物罗非昔布的疗效尚未经过临床验证 | 鉴定PCOS与缺血性心肌病之间的共享诊断生物标志物并阐明其生物学基础 | 多囊卵巢综合征患者与缺血性心肌病患者的转录组数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组测序，单细胞RNA测序，空间转录组学，分子对接 | Elastic Net | 基因表达数据 | 来自多个GEO队列的PCOS与ICM转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 625 | 2026-02-02 |
A spectral dimension reduction technique that improves pattern detection in multivariate spatial data
2026-Jan-31, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag052
PMID:41619788
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于多变量空间转录组学数据模式识别的统计方法，通过构建低维特征空间投影来最大化空间依赖性度量Moran's I | 提出了一种无需参数调优的算法，能有效减少非空间变异并优于主成分分析预处理，同时提供校准的空间基因表达测试 | NA | 提高多变量空间数据中模式检测的准确性 | 多变量空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 统计降维算法 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 626 | 2026-02-02 |
A spatiotemporal atlas of cerebrovascular development in zebrafish
2026-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68995-z
PMID:41620404
|
研究论文 | 本研究结合原位测序、单细胞转录组学和3D血管重建技术，绘制了斑马鱼大脑内皮发育的时空图谱 | 整合多尺度数据（分子、细胞和结构）揭示脑血管发育动态，识别出6种内皮亚型并验证了三个未表征基因在血管模式和血脑屏障完整性中的作用 | 研究聚焦于斑马鱼模型，结果向哺乳动物的直接转化需进一步验证 | 探究脊椎动物大脑脑血管发育的分子和细胞动力学 | 斑马鱼大脑内皮细胞（3-11天受精后） | 数字病理学 | NA | 原位测序, 单细胞转录组学, 3D血管重建, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间数据, 3D图像 | 斑马鱼大脑内皮细胞（3-11 dpf），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 627 | 2026-02-02 |
Neoadjuvant modified FOLFIRINOX plus nivolumab in borderline-resectable pancreatic ductal adenocarcinoma: a pilot phase 1 trial
2026-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68976-2
PMID:41620440
|
研究论文 | 这是一项评估新辅助改良FOLFIRINOX联合纳武利尤单抗治疗临界可切除胰腺导管腺癌的1b/2期临床试验 | 首次在临界可切除PDAC患者中评估化疗联合免疫检查点抑制剂的新辅助治疗方案，并采用空间转录组学等先进技术进行转化研究 | 单臂研究设计，样本量较小（28例患者），缺乏随机对照组 | 评估改良FOLFIRINOX联合纳武利尤单抗新辅助治疗的安全性和病理缓解率 | 临界可切除胰腺导管腺癌患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 基因表达分析、免疫组织化学、空间转录组学 | NA | 临床数据、基因表达数据、空间转录组数据 | 28例患者（22例接受手术） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 628 | 2026-02-02 |
Molecular signatures of resilience to Alzheimer's disease in neocortical layer 4 neurons
2026-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68920-4
PMID:41620473
|
研究论文 | 本研究利用单核和空间转录组学技术，识别了阿尔茨海默病中具有韧性的神经元群体，并发现KCNIP4作为关键韧性因子 | 首次在阿尔茨海默病中识别出初级视觉皮层第4层神经元中的韧性群体，并揭示KCNIP4作为关键韧性因子，通过补偿机制对抗神经元过度兴奋 | 研究主要基于男性App小鼠模型，可能未全面反映人类阿尔茨海默病的复杂性 | 探究阿尔茨海默病中神经元韧性的分子基础 | 阿尔茨海默病早期受影响（前额叶皮层、楔前叶）和晚期受影响（初级视觉皮层）的新皮层区域神经元 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 629 | 2026-02-02 |
Oxidative stress-associated genes TPPP3 and VEGFA in COPD revealed by bulk and single-cell sequencing analysis
2026-Jan-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37375-4
PMID:41620539
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和实验方法，识别并验证了慢性阻塞性肺疾病（COPD）中与氧化应激相关的关键基因和通路 | 结合了批量测序和单细胞RNA测序分析，识别出COPD中与氧化应激相关的12个枢纽基因，并特别强调了TPPP3和VEGFA在上皮细胞中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库和体外细胞模型，需要在更多临床样本和体内模型中进一步验证 | 识别和验证COPD中与氧化应激相关的关键基因和通路，探索新的治疗策略和潜在生物标志物 | 慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者数据、人支气管上皮细胞（BEAS-2B） | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、机器学习算法 | LASSO回归、随机森林 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的公共COPD数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 630 | 2026-02-02 |
ACACA modulates R-loop homeostasis to enhance lipid metabolism and microenvironmental interactions in ccRCC
2026-Jan-31, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01319-y
PMID:41620551
|
研究论文 | 本研究通过整合公开的ccRCC转录组和临床数据集，量化R-loop相关活性并构建预后模型，发现ACACA作为R-loop相关代谢驱动因子，连接基因组应激与脂质重编程及肿瘤微环境重塑 | 首次揭示ACACA在ccRCC中作为R-loop相关代谢驱动因子，连接基因组应激、脂质代谢重编程和肿瘤微环境相互作用 | 研究主要基于公开数据集和体外实验，缺乏大规模临床样本验证和体内机制的深入探索 | 探究R-loop在ccRCC肿瘤微环境中的作用，并识别关键代谢驱动因子 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤微环境、R-loop结构和ACACA基因 | 生物信息学与癌症研究 | 肾细胞癌 | 单样本基因集富集分析（ssGSEA）、线性机器学习算法、单细胞转录组学、空间转录组学、体外实验和异种移植实验 | 线性机器学习算法 | 转录组数据、临床数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 基于公开的ccRCC转录组和临床数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 631 | 2026-02-02 |
Spatial transcriptomic profiling uncovers the molecular effects of the neurotoxicant polychlorinated biphenyls (PCBs) in the brains of adult mice
2026-Jan-31, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-026-03466-x
PMID:41620578
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术，探讨了多氯联苯（PCBs）暴露对成年小鼠大脑功能和认知的影响 | 首次结合空间转录组学分析，揭示了PCBs暴露在小鼠多个大脑区域（如海马体、新皮层）的分子特征及其与血脑屏障完整性的关联 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠，未考虑性别差异；暴露时间为七周，长期效应未评估；样本量未明确说明 | 评估PCBs暴露对大脑功能和认知的分子机制影响 | 成年雄性C57BL/6J小鼠 | 空间转录组学 | 神经毒性相关认知障碍 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 632 | 2026-02-02 |
Revealing FPR1 as a potential pathogenic biomarker for aortic dissection based on Mendelian randomization, single-cell transcriptome and clinical data analysis
2026-Jan-31, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00732-4
PMID:41620799
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 633 | 2026-02-02 |
Runx1 transcription factor modulates opioid analgesia and withdrawal in humans and rodents
2026-Jan-30, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.11.018
PMID:41619726
|
研究论文 | 本研究揭示了Runx1转录因子通过调控小胶质细胞转录组，影响人类和啮齿类动物的阿片类镇痛效果和戒断反应 | 首次将Runx1确定为阿片类镇痛反应和戒断的遗传决定因素，并通过单细胞RNA测序和染色质免疫沉淀测序揭示了其在小胶质细胞中的独特调控机制 | 研究主要基于动物模型，人类关联分析可能需要更大样本验证，且未详细探讨Runx1在其他细胞类型中的作用 | 探究Runx1转录因子在阿片类镇痛和戒断反应个体差异中的作用机制 | 小鼠模型和人类个体 | 神经科学 | 疼痛管理 | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 634 | 2026-02-02 |
A pan-cancer single-cell transcriptomic atlas of human bone metastases
2026-Jan-30, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102583
PMID:41619722
|
研究论文 | 本研究构建了一个涵盖13种不同来源的62例骨转移样本的单细胞转录组图谱，揭示了骨转移的分子机制和免疫治疗新靶点 | 首次创建了人类骨转移的单细胞转录组全景图谱，整合了大规模原发性和转移性泛癌数据集，并验证了抗PD-1/TIGIT联合免疫疗法在骨转移小鼠模型中的有效性 | 样本量相对有限（62例骨转移样本），且主要基于单细胞RNA测序数据，可能未涵盖所有分子机制 | 探究人类骨转移的分子机制，并寻找免疫治疗优化策略 | 骨转移样本、配对的原发肿瘤和正常骨髓样本 | 数字病理学 | 骨转移 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | 单细胞转录组数据 | 62例骨转移样本，涵盖13种不同癌症来源 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 635 | 2026-02-02 |
Stem cell specification and niche formation in developing incisor require actomyosin forces
2026-Jan-29, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf074
PMID:41296682
|
研究论文 | 本研究探讨了小鼠切牙发育过程中干细胞规范和生态位形成的精确时间，揭示了肌动球蛋白网络在维持干细胞未分化状态中的作用 | 首次发现表达Sox2的干细胞样群体在功能生态位形成之前就已存在，并揭示了肌动球蛋白网络产生的收缩张力在限制干细胞位置和维持其干性中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类或其他物种中的普适性尚不明确，且对肌动球蛋白网络的具体调控机制仍需进一步探索 | 探究小鼠切牙发育过程中干细胞规范和生态位形成的时间关系及其调控机制 | 小鼠胚胎切牙的牙上皮组织 | 发育生物学 | NA | 遗传谱系追踪，单细胞RNA测序 | NA | 遗传谱系数据，单细胞RNA测序数据 | 不同发育阶段的小鼠胚胎切牙样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 636 | 2026-02-02 |
Resolving clonal evolution and selection of extrachromosomal DNA at single-cell resolution
2026-Jan-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03933-2
PMID:41606654
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为ecSingle的计算方法，利用单细胞RNA测序数据解析肿瘤中染色体外DNA的异质性和克隆进化 | 开发了一种基于单细胞RNA测序数据解析染色体外DNA异质性的新计算方法，并首次在单细胞水平上揭示了ecDNA的克隆选择和转录状态关联 | 方法依赖于标准单细胞RNA测序数据，可能受限于测序深度和覆盖范围，且需要基因组测序验证 | 研究肿瘤中染色体外DNA的克隆进化和选择机制 | 肿瘤样本中的染色体外DNA | 计算生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，单分子长读长测序，基因组测序 | 计算方法（ecSingle） | 单细胞RNA测序数据，基因组测序数据 | 未明确指定具体样本数量，涉及肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq，单分子长读长测序 | NA | NA |
| 637 | 2026-02-02 |
Injured epithelial cell states impact kidney allograft survival after T-cell-mediated rejection
2026-Jan-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68397-1
PMID:41605921
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术，揭示了T细胞介导的排斥反应（TCMR）诱导的肾脏上皮细胞损伤状态及其对移植生存的影响 | 首次在跨物种（小鼠和人类）水平上，结合单核RNA测序、空间转录组学和免疫荧光技术，系统性地识别了TCMR中上皮细胞损伤状态作为移植结果的决定因素，并发现这些状态在TCMR缓解后仍持续存在 | 研究主要基于实验模型和有限的人类样本数据，可能无法完全反映所有临床情境的复杂性，且空间转录组学的分辨率限制可能影响细胞互作的精确解析 | 探究T细胞介导的排斥反应（TCMR）在肾脏移植中的分子机制及其对移植生存的临床影响 | 小鼠肾脏移植模型和人类肾脏移植活检样本，特别是近端小管和厚升支的上皮细胞 | 数字病理学 | 肾脏移植排斥 | 单核RNA测序（snRNA-seq）、空间转录组学、免疫荧光、单细胞反卷积分析 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、图像数据 | 小鼠模型和人类TCMR及稳定移植样本，具体数量未在摘要中明确 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 638 | 2026-02-02 |
Generation of thymus-reconstituting T cell progenitors from human pluripotent stem cells
2026-Jan-26, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101272
PMID:41512861
|
研究论文 | 本文描述了从人类多能干细胞生成能够直接并长期重建胸腺的T细胞祖细胞的方法 | 首次在体外从人类多能干细胞工程化出具有胸腺重建能力的T细胞祖细胞，为研究T细胞发育机制和CAR-T细胞疗法提供了新模型 | 未明确提及实验的局限性，可能包括体内功能验证的深度或长期安全性评估 | 旨在生成大量能够重建受体免疫系统的T细胞祖细胞，以推进癌症免疫治疗 | 人类多能干细胞（hPSC）及其衍生的T细胞祖细胞 | 再生医学 | 癌症 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 639 | 2026-02-02 |
Integrative single‑cell multi‑omics network analysis to elucidate epigenetic regulation in neurodevelopmental disorders
2026-Jan-22, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100395
PMID:41580083
|
研究论文 | 本研究提出了一种整合单细胞多组学网络分析框架，用于阐明神经发育障碍中的表观遗传调控机制 | 整合scRNA-seq、scATAC-seq和单细胞DNA甲基化数据，通过相关分析、流形对齐和网络推断构建细胞类型特异性表观遗传调控网络，揭示多模态失调 | 未明确提及具体样本量限制或技术重复性验证细节 | 阐明神经发育障碍中表观遗传和转录失调的分子机制 | 发育中的人和小鼠脑组织以及患者来源的神经祖细胞模型 | 单细胞多组学 | 神经发育障碍 | scRNA-seq, scATAC-seq, 单细胞DNA甲基化测序 | 典型相关分析、流形对齐、潜变量模型、网络推断 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 640 | 2026-02-02 |
Integrative functional genomics and fine-mapping identify regulatory mechanisms of multivariate obesity GWAS and its cardiometabolic implications
2026-Jan-20, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2026.156509
PMID:41570977
|
研究论文 | 本研究通过整合多变量肥胖GWAS数据与功能基因组学方法，揭示了肥胖与心脏代谢性状的共享遗传机制和关键调控基因 | 采用基因组结构方程模型构建多变量肥胖表型，并结合多组学数据进行精细定位与共定位分析，识别了先前未报告的遗传信号和跨组织神经-脂肪调控轴 | 研究主要基于欧洲人群数据，可能限制了在其他人群中的普适性，且功能验证实验不足 | 解析肥胖的复杂遗传结构及其与心脏代谢疾病的共享机制 | 五种肥胖相关性状（体重指数、腰围、内脏脂肪、肝脏脂肪和体脂百分比）的遗传数据 | 基因组学 | 肥胖症 | GWAS、基因组结构方程建模、表达数量性状位点分析、转录组范围关联研究、蛋白质组范围关联研究、单细胞RNA测序 | 基因组结构方程模型、MAGMA、scPagwas | 基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |