单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 9441 篇文献,本页显示第 6321 - 6340 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
6321 2026-05-19
Recombinant humanized type III collagen attenuates recurrent spontaneous abortion by regulating stromal cell decidualization and reinforcing protective immune microenvironment at the maternal-fetal interface
2026-May-17, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示重组人源化III型胶原蛋白通过调节基质细胞蜕膜化和增强母胎界面保护性免疫微环境来减轻复发性自然流产 首次在单细胞分辨率下阐明rhCOLIII治疗复发性自然流产的机制,发现其通过激活氧化应激反应通路调控基质细胞功能,并通过APOE-TREM2和BSG-PPIA信号增强抗炎巨噬细胞活性及CD16+ NK细胞丰度 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类中的直接适用性尚需进一步验证;单细胞分析仅限于妊娠第8天,未能全面覆盖时间动态变化 探究rhCOLIII在复发性自然流产中的治疗潜力及其分子机制 人子宫内膜/蜕膜组织样本、小鼠RSA模型(CBA/J ♀ × DBA/2 ♂)的子宫组织 数字病理学 复发性自然流产 免疫组织化学、免疫印迹、单细胞RNA测序、多重免疫组织化学、流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据、免疫组化图像 包含健康供体/正常妊娠者和RSA患者的人类样本,以及24只小鼠(RSA组和rhCOLIII治疗组各12只,具体样本数未明确逐项列出) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
6322 2026-05-19
CCL5 at the tumor-bone interface: A lymphocyte-derived gatekeeper against mandibular invasion in oral squamous cell carcinoma
2026-May-17, Oral oncology IF:4.0Q2
研究论文 探究CCL5在口腔鳞状细胞癌下颌骨侵犯中的作用及其预后价值 首次揭示肿瘤免疫微环境中CCL5和FoxP3表达缺失与骨侵犯的关联,并证实CCL5可作为独立预后标志物 未提及 分析CCL5与口腔鳞状细胞癌骨侵犯的预后相关性及其免疫机制 口腔鳞状细胞癌患者肿瘤组织及免疫微环境 数字病理学 口腔癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫组化 NA 基因表达数据, 病理图像 TCGA队列327例、回顾性队列206例 Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq TCGA HNSCC队列RNA-seq数据;单细胞RNA测序数据来源
6323 2026-05-19
Nuclear factor IX promotes endometriosis progression through transcriptional activation of tetraspanin-2
2026-May-16, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
研究论文 本研究通过整合公共单细胞RNA测序数据和自身RNA测序数据,发现并验证了核因子IX通过转录激活四跨膜蛋白2促进子宫内膜异位症进展的机制 首次揭示核因子IX在子宫内膜异位症间质细胞中高表达,并通过转录调控四跨膜蛋白2促进细胞增殖和侵袭,为子宫内膜异位症治疗提供新靶点 本研究未提及潜在局限性 探究核因子IX在子宫内膜异位症进展中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力 子宫内膜异位症间质细胞、正常子宫内膜间质细胞、子宫内膜异位症小鼠模型 机器学习 妇科疾病 单细胞RNA测序,RNA测序,荧光素酶报告基因实验,染色质免疫沉淀实验 NA 基因表达数据 整合公共数据库与自身样本,具体数量未说明;小鼠模型实验 NA 单细胞RNA测序,RNA测序 NA NA
6324 2026-05-19
Role of HMGB1 in tumors and its targeted therapy
2026-May-16, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
综述 总结了HMGB1在肿瘤中的角色、靶向治疗及其作为生物标志物的应用价值 提出了利用单细胞RNA测序、空间转录组学、实时活细胞成像等前沿技术全面研究HMGB1时空动态及其分子调控机制 肿瘤异质性、HMGB1双面功能及靶向技术局限性仍构成挑战 阐明HMGB1在肿瘤进展中的角色及靶向治疗潜力 肿瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞、肿瘤相关中性粒细胞、肿瘤相关成纤维细胞、T细胞 机器学习和数字病理学 肿瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学、实时活细胞成像 NA NA NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
6325 2026-05-19
A CSF disease-associated macrophage signature defines progressive multiple sclerosis
2026-May-13, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究结合流式细胞术和单细胞转录组学,揭示了进行性多发性硬化症患者脑脊液中CD14+单核细胞增多,这些细胞呈现边界相关巨噬细胞样特征并与疾病进展相关 首次在脑脊液中定义与进行性多发性硬化症相关的疾病相关巨噬细胞特征,并发现这些细胞与神经退行性病变中发现的疾病相关小胶质细胞/巨噬细胞共享部分特性 研究为回顾性与前瞻性结合设计,样本量相对有限,且未探讨脑脊液细胞变化的因果关系 探究进行性多发性硬化症患者脑脊液中的细胞变化及其作为生物标志物的潜力 多发性硬化症患者(包括复发-缓解型和进行性型)及非炎症性对照的脑脊液细胞 数字病理学 多发性硬化症 流式细胞术、单细胞转录组学、ELISA NA 单细胞转录组数据、流式细胞数据、ELISA数据 回顾性流式细胞术:299例(169例RRMS,56例PMS,74例对照);前瞻性单细胞转录组学:35人(11例对照,12例RRMS,12例PMS);额外阿尔茨海默病对照数据来自公开数据集 NA 单细胞RNA-seq、流式细胞术 NA NA
6326 2026-05-19
A Spatial Atlas of Muscle-Invasive Bladder Cancer Reveals Lineage-Specific Vulnerabilities and Immune Architecture
2026-May-13, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 通过整合空间转录组学、批量RNA和全外显子测序数据,构建了肌层浸润性膀胱癌的空间图谱,揭示了肿瘤内部的管腔-基底轴、谱系特异性脆弱性和免疫结构 首次通过空间转录组学揭示MIBC肿瘤内连续有序的管腔-基底轴及其与染色体不稳定性、转录可塑性和治疗敏感性的关联 未提及,可能包括样本量限制和空间转录组技术的分辨率局限性 构建肌层浸润性膀胱癌的空间图谱,以理解其谱系状态、免疫结构和治疗脆弱性 22个肌层浸润性膀胱癌肿瘤样本 计算病理学 膀胱癌 空间转录组学、批量RNA测序、全外显子测序 NA 空间基因表达数据、RNA测序数据、全外显子测序数据 22个肿瘤样本(空间转录组学),超过3000个肿瘤样本(泛队列分析) NA 空间转录组学 NA NA
6327 2026-05-19
Maternal immune activation perturbs the brain epitranscriptome
2026-May-12, Brain, behavior, and immunity
研究论文 本研究揭示了母体免疫激活如何扰动大脑表观转录组,并鉴定出脱甲基酶FTO可作为改善MIA后代行为表型的治疗靶点 首次通过空间转录组学和直接RNA测序技术,系统地描述了发育中小鼠大脑中表观转录组调控因子的细胞类型和脑区特异性分布,并阐明了MIA如何改变大脑表观转录组图谱 未明确提及研究限制 阐明母体免疫激活导致的RNA代谢紊乱的精确机制,并寻找潜在治疗靶点 母体免疫激活小鼠模型及其后代 机器学习, 数字病理学 神经发育障碍 空间转录组学, 直接RNA测序 NA 空间转录组数据, 直接RNA测序数据 使用MIA小鼠模型及其后代,具体样本量未说明 NA 空间转录组学, 直接RNA测序 NA NA
6328 2026-05-19
Single-cell transcriptomics identifies NF-κB/STAT3-associated neutrophil inflammatory reprogramming in rheumatoid arthritis synovium
2026-05, Genomics IF:3.4Q2
研究论文 通过单细胞转录组学分析类风湿性关节炎滑膜中的中性粒细胞异质性及其炎症重编程机制 首次在单细胞水平揭示RA滑膜中性粒细胞的NF-κB/STAT3轴驱动的炎症重编程,并鉴定C1和C3炎症表型以及M3/M4功能模块 验证仅基于bulk RNA-seq队列(n=19),缺乏功能实验的直接验证 阐明类风湿性关节炎滑膜中中性粒细胞的异质性和炎症重编程机制 8名RA患者滑膜组织的66,539个细胞,包括中性粒细胞和其他基质细胞 数字病理学 类风湿性关节炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 8名RA患者(66,539个细胞)和19名独立队列的bulk RNA-seq样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6329 2026-05-08
Abi3S212F Alzheimer's disease variant alters plaque structure and disrupts microglia
2026-05, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究通过构建Abi3S212F小鼠模型,发现该阿尔茨海默病风险变体会改变淀粉样斑块结构并导致小胶质细胞功能障碍 首次在体内揭示ABI3S209F/Abi3S212F变体通过破坏细胞骨架动力学导致小胶质细胞功能障碍和死亡,并证明这种损伤发生在斑块形成之前 未提及具体局限性 阐明ABI3S209F(Abi3S212F)阿尔茨海默病风险变体对小胶质细胞功能和淀粉样病理的影响机制 Abi3S212F基因敲入小鼠与两种人源化β-淀粉样蛋白(Aβ)模型杂交的后代 数字病理学 阿尔茨海默病 空间转录组学, 单细胞分析, 共聚焦成像 NA 图像, 转录组数据 不同年龄段的小鼠样本(具体数量未说明) 10x Genomics 空间转录组学, 单细胞RNA测序 10x Visium, 10x Chromium 空间转录组学使用10x Visium平台,单细胞分析使用10x Chromium平台
6330 2026-05-19
Single-cell transcriptomic analysis reveals APOE genotype-dependent sex differences in Alzheimer's disease
2026-05, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 单细胞转录组分析揭示APOE基因型依赖性性别差异在阿尔茨海默病中的作用 首次在单细胞水平全面研究性别与APOE基因型之间的相互作用 未提供具体局限性信息 探索阿尔茨海默病中性别和APOE相关差异的单细胞转录组学变化 阿尔茨海默病患者的脑细胞类型(54种高分辨率细胞类型) 机器学习 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
6331 2026-05-19
Integrin β3 Promotes Retinal Neovascularization via Endoplasmic Reticulum Stress-Mediated Endothelial Cell Senescence
2026-May-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究探索整合素β3通过内质网应激介导的内皮细胞衰老促进视网膜新生血管形成的机制 首次揭示整合素β3通过PERK/eIF2α/ATF4通路激活内质网应激,驱动内皮细胞衰老,进而促进视网膜新生血管形成 主要基于体外细胞实验和动物模型,缺乏临床样本验证 阐明整合素β3驱动视网膜新生血管形成的分子机制 视网膜血管内皮细胞,特别是氧诱导视网膜病变模型中的内皮细胞亚群 机器学习 视网膜疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 氧诱导视网膜病变小鼠模型及人视网膜微血管内皮细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
6332 2026-05-19
Turep: Detecting cross-cancer tumor-reactive T cells in single-cell and spatial transcriptomics data
2026-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 介绍了一种名为Turep的深度学习方法,用于通过单细胞和空间转录组数据稳健地跨癌种预测肿瘤反应性T细胞 通过整合七种人类恶性肿瘤的配对单细胞RNA和T细胞受体测序数据,识别出泛癌肿瘤反应性基因特征,并利用生成式数据增强解决数据不平衡问题 未明确提及局限性 开发一种能够在跨癌种场景下稳健预测肿瘤反应性T细胞的工具 肿瘤浸润淋巴细胞中的肿瘤反应性T细胞与非反应性旁观者T细胞 机器学习 泛癌(七种人类恶性肿瘤) 单细胞RNA测序,T细胞受体测序,空间转录组学 深度学习模型 单细胞基因表达数据,T细胞受体序列数据,空间转录组数据 七种人类恶性肿瘤的配对单细胞RNA和T细胞受体测序数据,具体样本量未明确 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
6333 2026-05-19
Transcriptomic profile reveals cellular composition contribute to hyaline-vascular variant in unicentric Castleman disease-associated paraneoplastic pemphigus
2026-Apr-20, The British journal of dermatology
研究论文 整合转录组学分析揭示单中心Castleman病相关副肿瘤性天疱疮中透明血管变异型的细胞组成特征 首次通过单细胞RNA测序揭示内皮细胞在血管透明化和基质失调中的核心作用,并阐明内皮-免疫细胞互作机制 未提及 通过整合转录组和细胞分析,阐明单中心Castleman病相关副肿瘤性天疱疮的细胞和分子发病机制 33例UCD-PNP患者的淋巴结样本(包含5例进行单细胞测序) 计算机视觉 NA RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据, 单细胞转录组数据 33例UCD-PNP患者淋巴结样本(5例进行单细胞测序,共58,811个细胞) Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq Illumina NovaSeq 6000测序平台
6334 2026-05-19
Transcriptomic Plasticity Is a Hallmark of Metastatic Pancreatic Cancer
2026-Apr-02, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 对一名胰腺导管腺癌患者的原发肿瘤和多种转移灶进行单细胞转录组分析,揭示转移性胰腺癌的转录组可塑性 通过无监督原型分析和新开发的PICASSO系统发育推断方法,揭示胰腺癌细胞在转移过程中适应局部环境主要依赖环境效应而非克隆基因型 研究仅基于一名患者的样本,结论的普适性需要更多样本人群验证 研究肿瘤细胞在转移过程中适应不同器官微环境的分子机制 一名胰腺导管腺癌患者的原发肿瘤和肝、网膜、腹膜、胃壁、淋巴结、膈肌等转移灶样本 单细胞转录组学 胰腺癌 单细胞RNA测序、全外显子测序 PICASSO(基于拷贝数变异的克隆系统发育推断方法) 单细胞转录组数据、全外显子测序数据 1名患者的多个原发和转移组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6335 2026-05-19
Neoadjuvant Therapy-Induced Remodeling in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma: Multimodal Spatial Analysis and Prognosis
2026-Apr, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 利用整合空间病理组学和转录组学分析新辅助治疗对胰腺导管腺癌肿瘤微环境的重塑作用及其预后意义 首次通过多模态空间分析手段系统揭示新辅助治疗不仅减少肿瘤负荷,更通过成纤维细胞重编程、基质纤维化和免疫空间重组实现肿瘤微环境协同重塑 样本量相对较小(13例未治疗+23例治疗后),独立验证仅使用单细胞空间数据集,缺乏多中心大样本验证 探究新辅助治疗对胰腺导管腺癌肿瘤微环境的结构重塑作用及其对预后评估的价值 胰腺导管腺癌患者(13例未接受新辅助治疗和23例接受新辅助治疗后) 数字病理学 胰腺癌 空间病理组学、空间转录组学、单细胞空间分析 NA 空间转录组数据、病理图像数据 36例胰腺导管腺癌患者(13例未治疗,23例治疗后) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间基因表达分析平台
6336 2026-05-19
In-Tumor CRISPR-Cas9 Knockout Screening and Novel Therapy Development for Malignant Transformation of Ovarian Teratoma
2026-Apr, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 通过体内CRISPR-Cas9敲除筛选和空间转录组学,发现SOD1是卵巢成熟畸胎瘤恶性转化的治疗靶点,并验证了LCS-1的抑瘤效果 首次对卵巢成熟畸胎瘤恶性转化进行全基因组CRISPR-Cas9敲除筛选,结合空间转录组学数据与药理验证,揭示SOD1作为关键脆弱靶点 仅基于单一细胞系NOSCC1和有限临床样本,且SOD1抑制剂的临床转化仍需进一步验证 识别卵巢成熟畸胎瘤恶性转化的治疗脆弱性,探索新靶向疗法 卵巢成熟畸胎瘤恶性转化患者肿瘤及衍生的NOSCC1细胞系 基因组学 卵巢癌 CRISPR-Cas9敲除筛选、空间转录组学、siRNA敲低、小分子抑制 NA 基因组筛选数据、空间转录组数据 3例独立患者肿瘤样本用于空间转录组学;1个患者来源异种移植模型用于体内验证 NA 空间转录组学 NA NA
6337 2026-05-19
A Glucose-Responsive Intelligent Antibacterial and Oxygen-Producing Hydrogel Promotes the Healing of Diabetic Wounds by Regulating Cellular Heterogeneity
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 开发了一种葡萄糖响应性智能抗菌产氧水凝胶,通过调控细胞异质性促进糖尿病伤口愈合 首次开发结合CaO2纳米颗粒、过氧化氢酶和镓多酚纳米颗粒的葡萄糖响应性水凝胶,并利用单细胞RNA测序分析其调控的细胞异质性 未提及 开发一种新型水凝胶以实现糖尿病感染伤口的葡萄糖触发按需药物释放,并通过分析细胞异质性探讨其促愈合机制 CF-CPGaMPN水凝胶及其对糖尿病感染伤口的治疗效果 生物材料 糖尿病伤口 单细胞RNA测序 无 基因表达数据 未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
6338 2026-05-19
Single-Cell and Mendelian Randomization Analyses Identify Macrophage Polarization and Efferocytosis Biomarkers in Osteoarthritis and Reveal Their Regulatory Mechanisms
2026-Apr, Iranian journal of biotechnology IF:1.6Q4
研究论文 整合转录组学和单细胞RNA测序数据与孟德尔随机化分析,鉴定骨关节炎中巨噬细胞极化和胞葬作用相关生物标志物FMO4和GPR65,并揭示其调控机制 首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析结合,从巨噬细胞极化和胞葬作用角度系统鉴定骨关节炎的关键生物标志物,并通过人工神经网络模型提升诊断准确性 主要基于公共数据库的二次分析,缺乏独立的临床样本验证和功能实验验证 鉴定骨关节炎中与巨噬细胞极化和胞葬作用相关的关键生物标志物及其调控机制 骨关节炎患者滑膜组织的转录组和单细胞转录组数据 机器学习 骨关节炎 RNA-seq, 单细胞RNA测序 LASSO, SVM-RFE, 人工神经网络 转录组数据, 单细胞转录组数据 三个骨关节炎相关转录组数据集 (GSE89408, GSE55457, GSE152805) 和一个GWAS数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6339 2026-05-19
Genetic Evidence Supports a Potential Role of WTAP-related m6A Regulation in Vascular Dementia: Insights from Mendelian Randomization and Multi-omics Analyses
2026-Mar-24, Journal of molecular neuroscience : MN IF:2.8Q2
研究论文 通过孟德尔随机化和多组学分析,探讨WTAP相关m6A调控与血管性痴呆的潜在因果关系 首次系统评估m6A调控基因WTAP在血管性痴呆中的因果作用,结合孟德尔随机化、单细胞RNA测序、微生物组中介分析和全表型关联研究,提出m6A调控可能通过肠道微生物影响脑血管生物学 研究基于遗传预测和关联分析,仍需功能性实验验证WTAP在VAD中的具体机制 利用人类遗传学和多组学数据揭示WTAP相关m6A修饰在血管性痴呆发病中的潜在因果作用 血管性痴呆患者脑组织样本及遗传变异数据 机器学习 血管性痴呆 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 全表型关联研究, 加权基因共表达网络分析 NA 基因表达数据, 遗传变异数据, 单细胞转录组数据 GSE122063包含血管性痴呆与对照脑组织样本(具体数量未提供);GSE282111为单细胞测序数据(具体细胞数量未提供);FinnGen GWAS数据(具体样本量未提供) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
6340 2026-05-19
Heterogeneity of lymphoid cells in PBMCs in the acute phase of SFTS: Single-cell transcriptome profiling
2026-Mar-19, Journal of biomedical research IF:2.2Q3
研究论文 通过单细胞转录组测序分析急性期发热伴血小板减少综合征患者外周血单个核细胞中淋巴细胞的异质性,并探究糖皮质激素治疗对淋巴细胞的影响 首次在单细胞水平揭示急性期SFTS患者淋巴细胞的异质性及糖皮质激素治疗的免疫调控作用,为优化临床用药提供新见解 样本量较小(3名健康志愿者和13名患者),且仅关注急性期,缺乏纵向动态监测 探究急性期SFTS中淋巴细胞功能异常的机制以及糖皮质激素治疗对淋巴细胞的影响 急性期SFTS患者和健康志愿者的外周血单个核细胞 单细胞转录组学 发热伴血小板减少综合征 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 3名健康志愿者和13名急性期SFTS患者,共120886个淋巴细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒进行单细胞捕获及mRNA 3'端转录本测序
回到顶部