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当前共找到 9441 篇文献，本页显示第 6281 - 6300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6281 | 2026-05-20 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal an arachidonic acid-related cellular atlas in lung adenocarcinoma
2026-May-19, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-026-02251-4
PMID:42151495
|
研究论文 | 利用单细胞和空间转录组学揭示肺腺癌中花生四烯酸相关的细胞图谱 | 整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，首次在肺腺癌中系统探索花生四烯酸代谢相关的关键生物标志物及其在肿瘤微环境中的作用 | 未明确说明局限性 | 探究肺腺癌中花生四烯酸代谢的关键生物标志物及其在肿瘤微环境中的调控机制 | 肺腺癌组织中的肿瘤细胞、T细胞和上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6282 | 2026-05-20 |
Basal cell subsets, as biomarker to predict the therapeutic effect of neoadjuvant therapy for esophageal carcinoma
2026-May-19, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-026-06503-y
PMID:42151650
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research paper | 通过单细胞RNA测序分析食管癌新辅助治疗中基底细胞亚群作为疗效预测的生物标志物 | 首次发现基底细胞亚群Basal3、Basal8与病理完全缓解相关，Basal7与不完全病理反应相关，并识别了ATF3和JUN基因对生存的影响 | 样本量较小（仅22例患者），且包含多数食管鳞癌和1例腺鳞癌，统计结果代表性有限 | 探索食管癌新辅助治疗疗效预测的生物标志物 | 来自22例II-IV期接受新辅助化免疫治疗的食管癌患者的肿瘤及配对邻近组织 | 数字病理学 | 食管癌 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 22例食管癌患者（21例食管鳞癌，1例食管腺鳞癌） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 6283 | 2026-05-20 |
Decoding circulating neutrophil phenotypes in triple-negative breast cancer via optimized single-cell RNA sequencing
2026-May-19, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04345-8
PMID:42154046
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研究论文 | 通过优化的单细胞RNA测序解码三阴性乳腺癌中循环中性粒细胞的表型 | 开发了基于两个中性粒细胞标记基因面板和排除非中性粒细胞标记基因的稳健分析框架，实现了对单细胞数据中中性粒细胞的精准鉴定与功能表征 | 研究样本量较小（仅6名TNBC患者和6名对照），且中性粒细胞分离数量有限（TNBC组84个，对照组128个），可能限制结果的普适性 | 表征三阴性乳腺癌患者循环中性粒细胞的转录组差异，探究肿瘤对免疫细胞的影响机制 | 三阴性乳腺癌患者和非恶性供体的循环中性粒细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12例样本（6例TNBC患者和6例非恶性供体），共分离212个中性粒细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6284 | 2026-05-20 |
Multiscale domain identification for spatial transcriptomics via persistent homology
2026-May-18, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101376
PMID:41916308
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研究论文 | 利用持续同调方法对空间转录组数据进行多尺度域识别 | 首次将拓扑数据分析中的持续同调方法应用于空间转录组的多尺度域识别，解决了传统聚类方法仅能识别单一形态尺度域、忽略多尺度交互的问题 | 未对计算效率进行详细评估，且方法在异构区域与同质域之间的边界识别能力有待进一步验证 | 开发一种基于持续同调的多尺度空间域识别方法，以捕捉跨形态尺度的组织结构 | 空间转录组数据中的空间域 | 数字病理学, 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 持续同调 | 基因表达数据 | 多组织类型与空间转录组技术的数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6285 | 2026-05-20 |
Decoding spatial transcriptomics across multicellular and subcellular resolutions
2026-May-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72872-0
PMID:42151140
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研究论文 | 提出STARS方法，利用Vision Transformer和对比学习，从多细胞和亚细胞分辨率空间转录组数据中重建单细胞水平基因表达 | 首次实现跨多细胞和亚细胞分辨率空间转录组平台的单细胞水平基因表达重建，结合组织学图像和转录组数据 | 未明确指出局限性 | 开发能准确从多细胞和亚细胞分辨率空间转录组数据中分解或聚合信号至单细胞水平的方法 | 小鼠肺组织、结直肠癌组织中的细胞类型，包括免疫细胞和成纤维细胞等 | 计算机视觉, 机器学习, 数字病理学 | 结直肠癌, 流感感染, 细菌继发感染 | 空间转录组学 | Vision Transformer, 对比学习 | 图像, 转录组数据 | 小鼠肺组织（3个平台：Visium、Visium HD、Stereo-seq）及额外公共数据集 | 10x Genomics, BGI | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Visium HD, BGI Stereo-seq | 10x Visium多细胞分辨率平台, 10x Visium HD亚细胞分辨率平台, BGI Stereo-seq亚细胞分辨率平台 |
| 6286 | 2026-05-20 |
Identification of diagnostic and therapeutic roles of programmed cell death-related proteins in dilated cardiomyopathy: a multi-omics and experimental validation study
2026-May-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-52624-2
PMID:42151293
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研究论文 | 通过多组学整合分析与实验验证，识别与程序性细胞死亡相关的扩张型心肌病的诊断和治疗分子特征 | 首次结合批量与单细胞RNA测序数据，利用六种机器学习算法构建基于程序性细胞死亡相关核心基因的预测模型，并鉴定两种具有不同免疫代谢特征的分子亚型 | 多数转录组数据集代表晚期疾病状态，发现可能反映心脏重塑的共同分子特征而非早期疾病特异性机制 | 揭示程序性细胞死亡在扩张型心肌病中的诊断和治疗潜力 | 扩张型心肌病患者和动物模型的心肌组织样本 | 机器学习 | 扩张型心肌病 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、差异基因表达分析、加权基因共表达网络分析、机器学习、分子对接 | 预测模型 | 转录组数据 | 五个独立队列 | NA | 批量RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6287 | 2026-05-20 |
Single-cell analysis reveals IL1B+ macrophages promote lung metastasis in adenoid cystic carcinoma
2026-May-16, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218590
PMID:42144099
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和批量转录组分析，结合多重免疫组化，揭示了IL1B+肿瘤相关巨噬细胞在腺样囊性癌肺转移中的作用机制 | 首次鉴定了IL1B TAMs在肺转移中的双重作用：在原发性病灶中促进血管生成和细胞外基质重塑以协助肿瘤细胞入血，在转移灶中通过IL-1R1/ACKR1/SELP轴吸引肿瘤细胞定植，并诱导CD8 T细胞耗竭 | 小鼠模型与人类患者之间的差异可能影响结论的普适性，机制验证主要基于相关性分析，缺乏直接的因果证据 | 探索腺样囊性癌肺转移的分子机制，特别是IL1B+肿瘤相关巨噬细胞的作用 | 腺样囊性癌患者的原发灶和肺转移灶样本，以及携带转移性ACC细胞的小鼠模型 | 单细胞生物学 | 腺样囊性癌 | 单细胞RNA测序，批量转录组分析，多重免疫组化，血浆细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据，批量转录组数据，组织切片图像，血浆样本数据 | ACC患者原发灶和肺转移灶组织样本（具体数量未在摘要中说明），以及小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 6288 | 2026-05-20 |
The temporal architecture of the seminiferous epithelial cycle revealed by spatial transcriptomics
2026-May-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.04.036
PMID:42143021
|
研究论文 | 利用seqFISH+空间转录组学技术，对小鼠睾丸细胞进行分析，揭示了生精上皮周期的时空架构，并发现支持细胞的内在周期性程序是维持基线节律的关键，而生殖细胞信号则微调周期以协调精子发生 | 首次利用空间转录组学技术在单细胞分辨率下绘制生精上皮周期的时空转录图谱，并发现支持细胞本身具有不依赖生殖细胞的内在周期性转录程序 | 研究主要基于小鼠模型，其发现需在人类或其他物种中验证；且仅对部分基因进行检测，可能遗漏一些重要调控因子 | 探究哺乳动物精子发生过程中生精上皮周期的时空转录调控机制，特别是支持细胞与生殖细胞之间的相互作用 | 成年小鼠睾丸组织（正常及生殖细胞耗竭模型：白消安处理、W/W突变小鼠） | 空间转录组学、发育生物学 | NA | seqFISH+空间转录组学 | NA | 基因表达（转录组）数据、空间位置数据 | 867,062个小鼠睾丸细胞，2,653个基因 | NA | 空间转录组学 | seqFISH+ | 用于高多重空间单细胞基因表达分析的seqFISH+技术 |
| 6289 | 2026-05-20 |
Spatial transcriptomic profiling of developing mouse hearts reveals a spatially patterned signaling environment
2026-May-15, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10259-z
PMID:42141139
|
研究论文 | 利用空间转录组学技术绘制小鼠心脏发育过程中的空间图谱，揭示区域特异性信号环境 | 首次结合两种空间转录组学平台（10x Visium和Curio Slide-seq）系统分析小鼠胚胎期和新生期心脏的空间信号模式，并整合谱系追踪技术鉴定心外膜细胞衍生细胞及其与微环境细胞的信号互作 | 未明确提及局限性 | 解析心脏发育过程中细胞与周围微环境之间的动态信号相互作用 | 小鼠胚胎期和新生期心脏组织 | 计算机视觉， 机器学习 | 心血管疾病 | 空间转录组学， 谱系追踪， 细胞消融 | NA | 空间基因表达数据 | 小鼠心脏组织样本（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics, Curio Bioscience | 空间转录组学 | 10x Visium, Curio Slide-seq | 10x Visium用于胚胎期和新生期心脏空间图谱构建，Curio Slide-seq用于心脏传导细胞鉴定 |
| 6290 | 2026-05-20 |
A tissue-scale strategy for sensing threats in barrier organs
2026-May-14, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101611
PMID:42140193
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研究论文 | 揭示屏障器官通过空间分级表达模式识别受体来感知威胁并调节免疫应答的组织层面策略 | 首次发现肺部不同细胞类型对流感感染检测概率具有细胞类型特异性，上皮细胞最低而基质细胞最高，并揭示这种差异源于核酸感应PRRs的空间梯度表达 | 未提及 | 探究屏障器官如何评估威胁并调整免疫反应以平衡宿主保护与附带损伤 | 小鼠肺部不同细胞类型（包括上皮细胞和基质细胞） | 计算生物学 | 流感感染 | 单分子成像、空间转录组学 | NA | 影像数据、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6291 | 2026-05-20 |
Longitudinal multiomic and spatial transcriptomic profiling of lupus nephritis progression in a murine model
2026-May-14, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag100
PMID:42152612
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研究论文 | 对狼疮肾炎小鼠模型进行纵向多组学和空间转录组学分析，揭示疾病进展的分子机制和空间免疫微环境 | 首次结合时间序列转录组和空间转录组技术，在LN小鼠模型中绘制了疾病从早期到晚期的阶段特异性分子图谱，并识别了与B细胞和髓系细胞富集相关的空间免疫生态位 | 研究基于小鼠模型，需在人类LN样本中进一步验证发现的跨物种保守性及其临床相关性 | 阐明狼疮肾炎进展的分子机制，为早期干预提供潜在靶点 | 狼疮倾向的New Zealand Black/White F1小鼠肾脏样本 | 数字病理学 | 狼疮肾炎 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 10周、20周和30周龄的狼疮倾向小鼠肾脏样品，每时间点至少3个生物学重复 | NA | 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6292 | 2026-05-20 |
CSFeatures improves the identification of cell-type-specific differential features in single-cell and spatial omics data
2026-May-13, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.05.027
PMID:42134646
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研究论文 | CSFeatures是一种计算新方法，用于从单细胞和空间组学数据中识别细胞类型特异性的分子特征 | 提出CSFeatures方法，整合表达水平、分布平滑性和跨细胞群的比例表示，从多模态单细胞和空间组学数据中识别细胞类型特异性特征，并通过多重免疫荧光在蛋白质层面验证其特异性 | 未明确说明局限性，但可能依赖数据质量和参数选择 | 开发一种从单细胞和空间组学数据中识别细胞类型特异性分子特征的新方法 | 模拟数据集和14个真实数据集，涵盖单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学和空间ATAC测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, 空间ATAC测序, 多重免疫荧光 | CSFeatures | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 空间转录组数据 | 1个模拟数据集和14个真实数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, 空间ATAC测序 | NA | NA |
| 6293 | 2026-05-20 |
Benchmarking sketching methods on spatial transcriptomics data
2026-May-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag434
PMID:42109248
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研究论文 | 系统评估了几种草图绘制方法（均匀采样、杠杆分数采样、Geosketch和scSampler）在空间转录组学数据上的表现，并提出了结合空间信息的改进方案 | 首次系统比较了多种草图方法在空间转录组学数据中的应用，发现仅依赖表达信息或空间坐标的方法各有缺陷，并创新性地提出了一种空间感知的杠杆分数计算方法，能够在保持组织均匀覆盖的同时恢复稀有细胞状态 | 评估仅限于少数真实数据集和模拟数据，未涵盖所有可能的空间转录组学平台和样本类型，且提出的空间感知方法仍有改进空间 | 探索草图绘制方法对空间转录组学数据分析的影响，寻找能平衡全局转录组异质性和组织空间结构保留的最佳策略 | 多个空间转录组数据集（小鼠卵巢、MERFISH脑组织、人乳腺癌、肺）及模拟数据 | 机器学习和数字病理学 | 乳腺癌、肺癌 | 空间转录组学、主成分分析、随机奇异值分解 | NA | 空间转录组数据 | 多个真实数据集（小鼠卵巢、MERFISH脑组织、人乳腺癌、肺）和模拟数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6294 | 2026-05-20 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals FLS2-Dependent Hypoxia Signaling and ERF13-Mediated Transcription During flg22-Triggered Immunity
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516380
PMID:41802127
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示拟南芥中FLS2依赖的低氧信号及ERF13介导的转录调控在flg22触发免疫中的作用 | 首次在单细胞分辨率下系统解析flg22诱导的免疫反应，发现低氧信号与免疫信号通过ERF13整合，并揭示细胞类型特异性转录重编程 | 未在体内验证所有发现的调控机制，且研究仅限于拟南芥模式植物 | 阐明flg22触发免疫反应的细胞类型特异性调控机制 | 拟南芥野生型及突变体（fls2、ate1、prt6、zpr2、erf13、sim smr、e2fabc、cpr5）的叶片细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 拟南芥叶片细胞（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6295 | 2026-05-20 |
BGN/MDK Axis in the Melanoma Tumor Microenvironment Strengthens Tumor Malignancy by Modulating Cancer Cells and Cancer-Associated Fibroblasts Crosstalk
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514590
PMID:41833003
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了黑色素瘤肿瘤微环境中BGN/MDK轴通过调节癌细胞与癌症相关成纤维细胞的相互作用来增强肿瘤恶性 | 首次发现m6A修饰因子以平行非层级方式协同上调BGN表达，并阐明BGN/MDK轴通过AEBP1调控CAFs形成及CD8+ T细胞浸润的分子机制 | 未说明具体局限性 | 探究BGN在黑色素瘤肿瘤微环境中的调控网络及其对CAFs形成和肿瘤恶性进展的作用 | 黑色素瘤细胞、癌症相关成纤维细胞（CAFs）、CD8+ T细胞 | 数字病理 | 黑色素瘤 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 体外/体内实验, 功能分析, 分子检测 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6296 | 2026-05-20 |
In Vivo CRISPR Screening Identifies the Glutamate Receptor GRIA2 as Promoting Peritoneal Metastasis of Gastric Cancer via Calcium-Dependent β-Catenin Activation
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521746
PMID:41806318
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研究论文 | 通过体内CRISPR筛选发现AMPA型谷氨酸受体亚基GRIA2通过钙依赖性β-连环蛋白激活促进胃癌腹膜转移 | 首次通过体内全基因组CRISPR/Cas9筛选鉴定GRIA2为胃癌腹膜转移的关键驱动因子，并揭示谷氨酸-GRIA2-GSK-3β-β-连环蛋白信号轴的新机制 | 未提及具体的局限性信息 | 寻找胃癌腹膜转移的新治疗靶点 | 胃癌腹膜转移的分子机制 | 机器学习 | 胃癌 | CRISPR/Cas9筛选, 单细胞RNA测序, 药理学抑制 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 细胞系来源和患者来源的类器官异种移植（PDOX）小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6297 | 2026-05-20 |
Single-Cell and Mendelian Randomization Analyses Identify Key Genes Common to COVID-19 and Multiple Sclerosis
2026-May, Viral immunology
IF:1.5Q4
DOI:10.1177/08828245261426986
PMID:41841545
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，识别COVID-19与多发性硬化症共有的关键基因 | 首次结合单细胞RNA测序、全基因组关联研究和表达数量性状位点数据，系统分析COVID-19和多发性硬化症中B细胞相关的共享分子机制 | 未提及，仅从摘要推断可能包括样本量有限或因果关系的验证需求 | 阐明B细胞在COVID-19和多发性硬化症发病中的分子机制，以制定更有效的治疗策略 | COVID-19患者和多发性硬化症患者的B细胞 | 机器学习和基因组学 | COVID-19与多发性硬化症 | 单细胞RNA测序、全基因组关联研究、表达数量性状位点分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6298 | 2026-05-20 |
A Decline in Follicle Cell Function Is a Major Driver of Drosophila Ovarian Aging
2026-05, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70529
PMID:42062799
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研究论文 | 发现卵泡细胞功能下降是果蝇卵巢老化的主要驱动因素 | 首次通过单细胞RNA测序揭示卵泡细胞在卵巢老化中具有最多的差异表达基因，并证实针对卵泡细胞的遗传操作足以改善生殖老化特征 | 研究仅以果蝇为模型，结果向哺乳动物（如人类）的转化需要进一步验证；具体机制（如Atg8a调控老化的分子通路）未完全阐明 | 探究果蝇卵巢老化的细胞分子机制，特别是体细胞（卵泡细胞）在老化过程中的作用 | 果蝇卵巢中的卵泡细胞和生殖细胞 | 生物信息学 | 生殖系统老化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本量，涉及年轻与年老果蝇卵巢组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于卵巢细胞转录组分析 |
| 6299 | 2026-05-20 |
Germ layer specification and organotropism in lymphoma invasion
2026-04-30, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2026.03.009
PMID:41904054
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研究论文 | 研究弥漫大B细胞淋巴瘤中胚层依赖性外结侵犯的分子特征和发育轨迹 | 首次揭示外结侵犯模式与胚层发育的关联性，通过单细胞RNA测序发现恶性B细胞遵循类似胚层发育的轨迹，并提出依赖性免疫检查点靶向策略 | 未明确说明但可能涉及样本量有限及胚层依赖性机制在临床转化中的验证需求 | 探究淋巴瘤侵犯模式与胚层发育之间的关联，并解析其分子机制和临床意义 | 弥漫大B细胞淋巴瘤患者的外结侵犯样本，分为外胚层、内胚层和中胚层起源亚组 | 机器学习 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | 发育轨迹分析模型 | 基因表达数据、临床生存数据 | 未明确说明具体数量，但涉及多组外结侵犯患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6300 | 2026-05-20 |
A sequence knowledge-guided deep learning method for single-cell multi-omics translation
2026-Apr-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04070-6
PMID:41975483
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研究论文 | 提出一种序列知识引导的深度学习方法scProTrans，实现单细胞多组学翻译，将转录组数据转换为蛋白质组信息 | 融合序列知识与多组学整合，通过层次注意力机制、双向编码器架构和细胞特异性关联组件实现跨组学翻译，并在三组学场景中验证其可扩展性 | 未明确提及，但依赖CITE-seq训练数据，可能对训练数据外的条件泛化能力有限 | 开发一种可解释的深度学习框架，利用序列知识引导多组学整合，实现单细胞分辨率下的跨组学翻译 | 单细胞RNA测序数据与蛋白质组数据的关系，涉及基因-蛋白质关联和细胞异质性 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、CITE-seq | 深度学习模型（层次注意力机制、双向编码器架构） | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | 17个多组学数据集 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3', CITE-seq训练数据 |