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当前共找到 7593 篇文献,本页显示第 6261 - 6280 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
6261 2026-02-27
MR-DELTAnet: A Longitudinal MRI-Transformer Model Predicting Pathological Complete Response and Revealing Immune Microenvironment via scRNA-seq in Locally Advanced Rectal Cancer
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究开发了一种基于纵向MRI的Transformer模型MR-DELTAnet,用于预测局部晚期直肠癌患者对新辅助放化疗的病理完全缓解,并通过单细胞RNA测序揭示免疫微环境特征 首次结合纵向MRI数据和Transformer架构,集成Delta-Efficient Latent-Temporal Attention机制,预测病理完全缓解并关联单细胞RNA测序揭示免疫微环境差异 研究为回顾性多中心设计,可能存在选择偏倚;外部验证样本量相对较小(n=181),需前瞻性研究进一步验证 开发非侵入性工具,准确评估局部晚期直肠癌对新辅助放化疗的肿瘤反应,以指导个性化治疗策略 局部晚期直肠癌患者 计算机视觉 直肠癌 单细胞RNA测序 Transformer MRI图像 1026名局部晚期直肠癌患者(训练集633例,内部验证集212例,外部验证集181例),另加26例单细胞RNA测序样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6262 2026-02-27
METTL5 Enables Immune Evasion of Liver Cancer via Chemokine mRNA Translation Regulation
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了METTL5通过调控趋化因子CXCL16的mRNA翻译,介导18S rRNA的mA修饰,从而促进肝内胆管癌的免疫逃逸 首次发现METTL5作为18S rRNA mA甲基转移酶,通过下调CXCL16的翻译来排斥CD8 T细胞,从而驱动肝内胆管癌的免疫逃逸,并证明靶向METTL5联合PD-1阻断可有效消除肿瘤 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序分析,在人类患者中的直接验证和临床转化仍需进一步探索 探究METTL5在调控肝脏免疫微环境以促进癌症进展中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 肝内胆管癌(ICC)小鼠模型、人类ICC样本、免疫细胞(特别是CD8 T细胞和肿瘤相关巨噬细胞) 癌症免疫学 肝内胆管癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞T细胞受体测序(scTCR-seq)、脂质纳米颗粒包裹的siRNA递送、免疫细胞过继转移 基因敲除小鼠模型(cKO) 单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据、体内成像数据 小鼠模型及人类ICC样本(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 NA NA
6263 2026-02-27
Decoding cell state transitions driven by dynamic cell-cell communication in spatial transcriptomics
2026-Feb, Nature computational science IF:12.0Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CCCvelo的方法,用于解码空间转录组学中由动态细胞间通讯驱动的细胞状态转换 提出了CCCvelo方法,通过联合优化动态细胞间通讯信号网络和潜在细胞状态转换时钟,首次在空间转录组学中重建细胞间通讯驱动的细胞状态转换动态 NA 研究多细胞系统中细胞命运决定的调控机制,特别是细胞间通讯如何驱动细胞状态转换 小鼠皮层、胚胎躯干发育和人类前列腺癌数据集 空间转录组学 前列腺癌 空间转录组学 物理信息神经网络 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
6264 2026-02-27
Toward informed batch correction for single-cell transcriptome integration
2026-Feb, Nature computational science IF:12.0Q1
综述 本文回顾了单细胞转录组数据整合中常用的批次效应校正方法,并展望了未来框架的发展方向 提出未来批次校正框架应学习可解释的基因和细胞表示,并实现对技术和生物变异的知情建模 NA 探讨单细胞转录组数据整合中的批次效应校正问题 单细胞转录组数据集 生物信息学 NA 单细胞RNA-seq NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
6265 2026-02-27
Phylogenomic tree of Cercozoa based on single-cell transcriptomes from 100 uncultured cells
2026-Jan-30, BMC biology IF:4.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术,对100个未培养的Cercozoa细胞进行采样,构建了基于系统基因组学的Cercozoa系统发育树 通过单细胞转录组学广泛采样未培养的Cercozoa多样性,将分类单元采样增加了300%以上,并报告了五个新的未知谱系和两个仅从环境序列中已知的谱系 某些先前建立的类群(如Imbricatea类)在系统发育树中未被恢复,表明采样或方法可能存在局限性 研究Cercozoa的系统发育关系和多样性,以增进对其基本生物学的理解 单细胞真核生物Cercozoa(原生生物),包括土壤和海洋沉积物中的捕食性原生生物、海洋浮游生物等 系统发育学 NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据、形态图像数据 100个未培养的Cercozoa细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6266 2026-02-27
Peroxiredoxin 1 mediates bleomycin-induced acute lung injury in mice via macrophage NOD1/NF-κB axis
2026-Jan-30, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究揭示了过氧化物还原酶1(Prdx1)通过激活巨噬细胞中的NOD1/NF-κB信号通路,在博来霉素诱导的急性肺损伤中起关键作用 首次发现Prdx1作为损伤相关分子模式在博来霉素诱导的急性肺损伤中的作用机制,并证实其通过巨噬细胞NOD1/NF-κB轴介导炎症反应 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证;Prdx1中和抗体的临床应用潜力需进一步评估 探究Prdx1在博来霉素诱导的急性肺损伤中的作用机制,寻找潜在治疗靶点 小鼠(包括Prdx1基因敲除小鼠) 病理生理学 急性肺损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
6267 2026-02-27
Granzyme A-producing type 1 innate lymphoid cells promote salivary secretion in the aged submandibular gland
2026-Jan-29, Inflammation and regeneration IF:5.0Q1
研究论文 本文探讨了衰老过程中颌下腺唾液分泌的维持机制,发现GZMA+ ILC1细胞通过GZMA-Pard3轴促进上皮细胞功能 首次揭示了GZMA+ ILC1细胞在衰老颌下腺中通过GZMA-Pard3轴维持唾液分泌的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类相关性需进一步验证;机制细节如GZMA-Pard3轴的具体作用途径仍需深入探究 探究衰老过程中唾液腺分泌功能维持的细胞机制 小鼠颌下腺组织、淋巴细胞簇、上皮细胞 单细胞生物学 老年疾病 单细胞RNA测序、显微切割、共培养系统、体内耗竭实验 NA 单细胞转录组数据、组织学图像 按衰老阶段分层的小鼠群体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6268 2026-02-27
Translating spatial transcriptomic signatures in adenosquamous carcinoma into bulk prognostic biomarkers in lung adenocarcinoma: a bottom-up approach
2026-Jan-23, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学分析肺腺鳞癌,识别出TTF-1/p40阴性肿瘤细胞群,并将其基因特征转化为肺腺癌的预后生物标志物 开发了一种自下而上的生物标志物发现策略,利用空间转录组学从腺鳞癌中识别罕见肿瘤状态,并成功将其转化为适用于肺腺癌的批量预后分层工具 研究主要基于肺腺鳞癌模型,其发现向肺腺癌的转化需进一步验证,且样本量可能有限 将空间转录组学定义的罕见肿瘤状态转化为临床相关的预后生物标志物 肺腺鳞癌和肺腺癌患者样本 数字病理学 肺癌 空间转录组学、免疫组化 RGB-UMAP 空间转录组数据、批量转录组数据、图像数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
6269 2026-02-27
NR4A1 limits CD8⁺ T Cell effector responses and protection in tuberculosis
2026-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过小鼠、猕猴和人类数据验证,发现核受体NR4A1是结核病中CD8⁺ T细胞免疫的关键抑制因子,并提出了NR4A1-NKG7轴作为新的宿主导向治疗靶点 首次将NR4A1鉴定为结核病中CD8⁺ T细胞免疫的负调控因子,并揭示了NR4A1通过抑制NKG7表达来限制CD8⁺ T细胞效应功能的分子机制 研究主要基于动物模型,在人类结核病中的直接验证仍需进一步临床研究 探究结核病感染中CD8⁺ T细胞功能失调的调控机制 CD8⁺ T细胞、NR4A1核受体、结核分枝杆菌感染模型 免疫学 结核病 基因敲除小鼠、过继转移模型、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、空间分析、ChIP-qPCR、药理学抑制 NA 基因表达数据、空间定位数据、蛋白质结合数据 小鼠模型、猕猴数据集、人类数据集 NA 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 NA NA
6270 2026-02-27
Biomarkers Informed by Single-Cell and Spatial Transcriptomics-Biomarkers for Grade 3 Follicular Lymphoma
2026-Jan-09, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据,识别并验证了AID、CXCR4、CD71和Ki67作为滤泡性淋巴瘤3级的客观生物标志物,以改进风险分层 首次利用单细胞和空间转录组学数据识别滤泡性淋巴瘤3级的客观生物标志物,并验证其预后价值,提高了分级的可重复性 研究样本量有限(59例),且需在统一治疗的队列中进行进一步的临床验证 识别客观的生物标志物以改进滤泡性淋巴瘤的预后分层 正常生发中心和滤泡性淋巴瘤样本 数字病理学 滤泡性淋巴瘤 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学 NA 转录组数据,图像数据 59例滤泡性淋巴瘤标本(42例1-2级,17例3级)及扁桃体样本 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
6271 2026-02-27
Vascular Smooth Muscle Cell-Specific BCAT2 Deficiency Attenuates Diabetic Atherosclerotic Calcification via Histone Propionylation
2026, Research (Washington, D.C.)
研究论文 本研究揭示了血管平滑肌细胞特异性BCAT2缺失通过组蛋白丙酰化减轻糖尿病动脉粥样硬化钙化的新机制 首次发现支链氨基酸分解代谢在糖尿病动脉粥样硬化钙化中的作用,并阐明BCAT2-BCKA轴通过组蛋白丙酰化表观遗传调控RUNX2表达,从而促进血管平滑肌细胞成骨分化的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体临床试验中得到验证 阐明BCAT2在糖尿病动脉粥样硬化钙化中的作用及其分子机制 糖尿病足截肢患者的动脉组织、ApoE敲除小鼠模型、血管平滑肌细胞 代谢组学与单细胞转录组学 糖尿病心血管并发症 气流辅助解吸电喷雾电离质谱成像、单细胞RNA测序、空间代谢组学 ApoE敲除小鼠糖尿病动脉粥样硬化钙化模型 质谱成像数据、单细胞转录组数据、组织切片图像 糖尿病足截肢患者的动脉组织、基因工程小鼠模型 NA 单细胞RNA测序、空间代谢组学 NA NA
6272 2026-02-27
Lymph Node Metastasis-Associated Spatiotemporal Mapping of the TFF3-Linked Niche in Breast Cancer: Integrating Radiogenomic Signatures with Immune-Ecosystem Remodeling
2026, Research (Washington, D.C.)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和放射基因组学,揭示了TFF3在乳腺癌淋巴结转移中的核心调控作用及其与免疫微环境重塑和MAPK-EMT轴的关系 首次通过多模态整合(单细胞测序、空间图谱、放射组学)系统解析了TFF3在淋巴结转移性乳腺癌中的双重功能(调控MAPK-EMT轴和免疫检查点),并发现6-巯基嘌呤可作为新型TFF3拮抗剂 研究主要基于回顾性队列(TCGA/佛山队列),需要前瞻性临床验证;动物模型未能完全模拟人类肿瘤微环境的复杂性 阐明乳腺癌淋巴结转移的分子机制并开发潜在治疗策略 原发性乳腺癌伴腋窝淋巴结转移患者样本、体外细胞模型、体内异种移植模型 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 蛋白质组学, 孟德尔共定位分析, 放射组学 机器学习 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 影像数据 TCGA和佛山队列患者样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
6273 2026-02-27
A Deep Learning-Generated Mixed Tumor-Stroma Ratio for Prognostic Stratification and Multi-omics Profiling in Bladder Cancer
2026, Research (Washington, D.C.)
研究论文 本研究开发了一种基于卷积神经网络的混合肿瘤-基质比率(MTSR)计算方法,用于膀胱癌的预后分层和多组学分析 首次提出并验证了深度学习生成的MTSR作为膀胱癌的独立预后指标,并通过多组学分析揭示了其与ITGB8富集的基质-致癌通路的机制联系 研究依赖于回顾性多中心队列,需要前瞻性验证;mpMRI放射组学模型的预测准确性有待进一步提高 通过量化肿瘤-基质架构来改进膀胱癌的风险分层,并探索其分子基础 膀胱癌患者的组织切片和多参数MRI图像 数字病理学 膀胱癌 全切片图像分析,多组学分析(包括bulk RNA测序和单细胞RNA测序),放射组学 卷积神经网络(ResNet50),随机森林 图像(组织切片和MRI图像),转录组数据 多中心队列,具体数量未在摘要中明确说明 NA bulk RNA测序,单细胞RNA测序 NA NA
6274 2026-02-26
Spatial transcriptomics reveals the molecular signatures of prodromal and advanced α-synucleinopathy
2026-Mar-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究应用空间转录组学技术,揭示了α-突触核蛋白病在啮齿动物模型和帕金森病患者中的分子特征,包括能量代谢通路的变化和特定信号标记的识别 首次结合空间转录组学与帕金森病患者微阵列数据,系统揭示了α-突触核蛋白病从前期到晚期阶段的分子动态变化,并识别出与病理进展一致的生物标记 研究基于转基因小鼠模型和有限的帕金森病患者队列,可能无法完全反映人类疾病的复杂性,且空间转录组学技术分辨率有限 探究α-突触核蛋白病在帕金森病中的分子机制和进展标志,为生物标记发现和靶向治疗提供依据 转基因M83小鼠模型的脑组织切片以及四个独立帕金森病患者队列的微阵列数据集 空间转录组学 帕金森病 空间转录组学,微阵列分析 NA 空间转录组数据,微阵列数据 转基因M83小鼠模型脑切片及四个独立帕金森病患者队列数据集 NA 空间转录组学 NA NA
6275 2026-02-26
Neural network-assisted RNA velocity imputation for empowering transcript dynamics-based analyses
2026-Mar-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文提出了一种名为NARVI的深度学习框架,用于通过神经网络辅助RNA速度插补,以解决现有RNA速度估计工具因技术限制或模型假设而无法计算大量基因速度的问题 利用深度学习学习可计算基因的表达模式与速度之间的关系,从而准确估计原本无法计算的基因速度,扩展了基于转录动力学的下游分析范围 未在摘要中明确提及具体限制 解决RNA速度估计工具在单细胞转录组数据分析中因技术限制或模型假设导致的基因速度计算缺失问题,以增强基于转录动力学的下游分析能力 单细胞转录组数据集中的基因速度估计 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度学习框架(神经网络) 单细胞转录组数据 多个单细胞转录组数据集(未指定具体样本数量) NA 单细胞RNA-seq NA NA
6276 2026-02-26
High-throughput proteomics uncovers molecular clusters and biomarkers of severity in bullous pemphigoid
2026-Mar, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV IF:8.4Q1
研究论文 本研究通过高通量蛋白质组学分析,揭示了天疱疮(BP)中局部和全身炎症反应的分子特征,并识别了与疾病严重程度相关的生物标志物 首次使用Olink Target 96炎症面板全面分析BP的皮肤和血清蛋白质组,识别出CCL13等关键炎症蛋白,并基于蛋白质组数据定义了两种分子亚型,揭示了BP的生物学异质性 样本量相对较小(29例皮肤活检和27例匹配血清),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证 全面分析BP的局部和系统性炎症反应,探索其与疾病严重程度、临床特征和治疗结果的关联 天疱疮患者的皮肤活检和血清样本,以及健康对照样本 蛋白质组学 天疱疮 Olink Target 96炎症面板蛋白质组学分析,单细胞RNA测序 主成分分析、无监督聚类、差异表达分析、基因集富集分析、k-means聚类 蛋白质组数据、转录组数据 29例BP皮肤活检、27例匹配血清样本、14例健康对照 Olink 高通量蛋白质组学,单细胞RNA测序 Olink Target 96 Inflammation panel Olink Target 96炎症面板用于蛋白质组分析,公开可用的单细胞RNA测序数据集用于外部验证
6277 2026-02-26
Multi-omics analysis identifies SMPD1 as a key contributor in sphingolipid pathway for Type 2 diabetes pathogenesis
2026-Mar, Genes & genomics IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过多组学分析,确定SMPD1是2型糖尿病发病机制中鞘脂代谢通路的关键贡献因子 整合基因组、转录组和代谢组数据,并结合孟德尔随机化分析与体内实验,首次系统性地证实了SMPD1在2型糖尿病发病中的因果作用和致病机制 研究主要基于小鼠模型和部分人类数据,需要在更广泛的人类队列中进行验证;对SMPD1影响下游信号通路的分子机制探索尚不全面 识别和表征导致2型糖尿病发病的关键鞘脂通路成分 2型糖尿病患者、代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)患者的肝脏组织、瘦型和ob/ob肥胖小鼠模型 多组学分析 2型糖尿病 多组学整合分析、孟德尔随机化分析、全基因组关联研究(GWAS)、体内实验 NA 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 涉及人类GWAS数据、T2D患者血液代谢组数据、MASLD肝脏组织bulk和单细胞RNA-seq数据集,以及瘦型和ob/ob小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
6278 2026-02-26
Molecular analysis of tumor recurrence using established cancer stem cell-line and drug discovery
2026-Mar, International journal of clinical oncology IF:2.4Q3
研究论文 本文通过开发LGR5特异性单克隆抗体和建立具有干细胞特性的结直肠癌细胞系PLR123,研究了癌症干细胞在肿瘤复发中的作用,并发现RNA聚合酶I抑制剂BMH-21能有效抑制复发 开发了LGR5特异性单克隆抗体和高灵敏度免疫荧光方法,建立了维持干细胞特性的结直肠癌细胞系PLR123及体外复发模型,并通过单细胞RNA测序和小分子筛选发现BMH-21作为新型抑制剂 未明确说明样本量或临床验证的局限性,研究主要基于细胞系和模型系统 阐明癌症干细胞在结直肠癌复发中的作用机制,并开发预防肿瘤复发的新疗法 结直肠癌干细胞、LGR5标记物、PLR123细胞系、肿瘤复发模型 癌症生物学 结直肠癌 单细胞RNA测序、免疫荧光、小分子筛选 体外复发模型 基因表达数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
6279 2026-02-26
Correction to "A comparison of integration methods for single-cell RNA sequencing data and ATAC sequencing data"
2026-03, Quantitative biology (Beijing, China)
correction 本文是对先前发表的关于单细胞RNA测序数据与ATAC测序数据整合方法比较文章的更正 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
6280 2026-02-26
Distribution and Levels of Insulin-like Growth Factor 2 Receptor Across Mouse Brain Cell Types
2026-Mar, Receptors (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究通过免疫荧光染色和单细胞RNA测序数据比较,系统评估了成年雄性C57BL/6J小鼠大脑中胰岛素样生长因子2受体在不同脑细胞类型和脑区的分布与表达水平 首次全面揭示了IGF-2R蛋白在多种脑细胞类型中的特异性分布,特别是在兴奋性和抑制性神经元中的高富集,以及其在树突和轴突区室中的定位 研究仅限于成年雄性C57BL/6J小鼠,未涵盖其他年龄、性别或物种,且依赖公开的单细胞RNA测序数据库进行mRNA表达比较 探究IGF-2R在大脑不同细胞类型和亚细胞区室中的分布与表达水平,以增进对其在脑功能和疾病中作用的理解 成年雄性C57BL/6J小鼠的大脑组织,包括海马体和皮质区域 神经科学 神经发育和神经退行性疾病 双重和多重免疫荧光染色,单细胞RNA测序数据分析 NA 图像数据,公开的RNA测序数据 成年雄性C57BL/6J小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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