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当前共找到 9441 篇文献，本页显示第 6261 - 6280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6261 | 2026-05-21 |
TOGAR: Token-gated generative refinement for high-fidelity spatial transcriptomics and robust spatial domain clustering
2026-01, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111179
PMID:41422986
|
研究论文 | 提出TOGAR模型，一种基于令牌门控生成式细化的空间转录组学方法，统一去噪、空间增强和聚类，实现高保真空间转录组分析和稳健的空间域聚类 | 创新性地提出令牌门控（token gating）与门控线性注意力（gated linear attention）结合的扩散骨干网络（UGate-based diffusion backbone），并整合图卷积网络损失与零膨胀负二项分布损失以处理稀疏计数数据噪声，同时利用扩散轨迹上的相似性引导平均生成稳定的点级估计 | 标题和摘要未提及方法局限性信息 | 解决空间转录组学数据稀疏性和噪声对长程依赖建模的限制，提高空间域划分的准确性 | 空间转录组学数据中的组织切片的空间域聚类及生物结构识别 | 计算机视觉, 机器学习 | 癌症 | 空间转录组学 | 图卷积网络, 扩散模型, 门控线性注意力 | 基因表达数据 | 12个切片（来自三个空间转录组学平台） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6262 | 2026-05-21 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics reveals glycolysis heterogeneity and NEK6-mediated progression in colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1802329
PMID:42131349
|
研究论文 | 整合单细胞和空间转录组学揭示了结直肠癌中糖酵解异质性和NEK6介导的进展 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和孟德尔随机化分析，解析了结直肠癌中糖酵解异质性的空间组织及驱动恶性高糖酵解状态的分子机制，并识别出NEK6作为潜在治疗靶点 | 未提及 | 揭示结直肠癌中糖酵解异质性的空间分布及其分子驱动机制 | 结直肠癌细胞及肿瘤微环境中的巨噬细胞和B细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据，GWAS数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 6263 | 2026-05-21 |
Shared autonomous HERV loci transcription identifies a unique circulating CD14+-xCR1+ mononuclear cell phenotype in a patient group with post-acute sequelae of COVID-19
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0349350
PMID:42154742
|
研究论文 | 本研究分析12名COVID-19后遗症患者外周血单核细胞中共享自主HERV基因座的转录特征，发现CD14+单核细胞中特定HERV基因座与xCR1表达相关 | 首次在CD14+单核细胞中识别出与xCR1基因内含子相关的自主HERV基因座，并发现其在COVID-19感染者支气管灌洗细胞中特异性表达 | 样本量较小（12名患者），且未在健康对照或更大规模队列中验证发现的HERV基因座特异性 | 探讨COVID-19后遗症患者中自主HERV基因座的转录模式及其与免疫功能障碍的关系 | 12名COVID-19后遗症患者的外周血单核细胞 | 机器学习 | COVID-19后遗症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12名COVID-19后遗症患者的外周血单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于窗口的HERV比对方法分析单细胞RNA测序数据 |
| 6264 | 2026-05-21 |
KIM-1 as an Early Diagnostic Biomarker of Cisplatin-Induced Acute Kidney Injury
2026 Jan-Dec, Iranian journal of pharmaceutical research : IJPR
IF:1.8Q3
DOI:10.5812/ijpr-164432
PMID:42157797
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研究论文 | 本研究整合生物信息分析、体外实验以及系统综述与荟萃分析，全面评估KIM-1作为顺铂诱导急性肾损伤早期诊断生物标志物的潜力 | 该研究创新性地结合了单细胞RNA测序、大量RNA测序、体外实验和荟萃分析，多模态验证了KIM-1在顺铂诱导急性肾损伤早期诊断中的特异性和准确性 | 荟萃分析纳入的研究数量可能有限，且临床诊断标准基于血清肌酐，可能影响KIM-1的早期检测性能评估 | 综合评估KIM-1在顺铂诱导急性肾损伤中的表达、功能及早期诊断性能 | 顺铂诱导的急性肾损伤小鼠模型及人肾近端小管细胞（HK-2细胞） | 生物信息学与医学诊断 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序、大量RNA测序、实时定量PCR、酶联免疫吸附试验、CCK-8细胞活力检测 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、临床试验数据 | 荟萃分析涉及多个研究，具体样本量未在摘要中明确列出 | NA | 单细胞RNA测序、大量RNA测序 | NA | NA |
| 6265 | 2026-05-21 |
The Role of Methylacrylylated Hyaluronic Acid Hydrogels in Promoting Skin Wound Healing
2026 Jan-Dec, Iranian journal of pharmaceutical research : IJPR
IF:1.8Q3
DOI:10.5812/ijpr-169881
PMID:42157798
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研究论文 | 探究甲基丙烯酰化透明质酸水凝胶在促进皮肤伤口愈合中的作用及局部微环境特征 | 首次结合单细胞测序和CellChat软件分析HAMA水凝胶治疗下伤口局部成纤维细胞和巨噬细胞的亚群变化及细胞间通讯状态 | 仅在小鼠模型中进行，未在人体中验证，且样本量较小（每组6只），可能无法完全代表临床实际情况 | 探索甲基丙烯酰化透明质酸水凝胶在皮肤伤口愈合中的作用并分析伤口局部微环境特征 | 小鼠（C57BL/6）和RAW264.7小鼠巨噬细胞系 | 机器学习 | 皮肤伤口愈合 | 单细胞测序、RT-qPCR、免疫组织荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 12只小鼠，分为对照组（n=6）和HAMA组（n=6） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用Seurat软件包进行细胞聚类分析，CellChat软件包分析细胞通讯 |
| 6266 | 2026-05-21 |
Activation of GABBR1 by New Ligand Valerate Transcriptionally Regulates ATF4-NRF2-CXCL13 Axis Mediating CD8+ T Cell Anti-Tumor Immunity
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.127859
PMID:42157924
|
研究论文 | 本研究鉴定戊酸作为GABBR1的新型配体，通过转录调节ATF4-NRF2-CXCL13轴介导CD8+ T细胞抗肿瘤免疫 | 首次发现戊酸作为GABA受体的偏向性配体，特异性结合GABBR1亚基并上调其表达，揭示其在非小细胞肺癌中介导CD8 T细胞抗肿瘤免疫的新机制 | 未提及明显局限性 | 探讨戊酸在非小细胞肺癌中通过GABBR1调节CD8+ T细胞抗肿瘤免疫的作用机制 | 非小细胞肺癌细胞和CD8+ T细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 公共数据集及患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6267 | 2026-05-21 |
The SPP1-CD44 Signaling Axis Orchestrates Macrophage Metabolism to Promote Early Inflammation in Acute Kidney Injury
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.130922
PMID:42157927
|
研究论文 | 结合单细胞RNA测序、代谢组学和基因编辑方法，揭示SPP1-CD44信号轴通过PI3K/AKT-PKM2模块调控巨噬细胞代谢重编程，促进急性肾损伤早期炎症的机制 | 首次从单细胞和代谢水平阐明受损肾小管上皮细胞分泌的SPP1通过CD44受体调控巨噬细胞免疫代谢和炎症极化的完整机制，并验证了靶向该轴的潜在治疗价值 | 未明确说明局限性 | 探究急性肾损伤早期受损肾小管上皮细胞如何调控巨噬细胞代谢和表型，并揭示其分子机制 | 缺血再灌注诱导的急性肾损伤小鼠模型及巨噬细胞 | 机器学习和数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 代谢组学, 基因编辑 | NA | 单细胞RNA测序数据, 代谢组学数据 | 小鼠模型（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6268 | 2026-05-21 |
Bone Marrow-Derived Macrophage NLRP3 Mediates Renal Fibrosis by triggering TGF-β/Smad3-mediated Macrophage-Myofibroblast Transition
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.131452
PMID:42157945
|
研究论文 | 发现骨髓来源巨噬细胞中的NLRP3通过触发TGF-β/Smad3介导的巨噬细胞-肌成纤维细胞转化促进肾纤维化 | 首次揭示NLRP3在肾纤维化中的促纤维化新角色，并阐明其通过直接结合TGF-β受体激活信号通路的新机制 | 局限可能包括仅在小鼠模型中验证，缺乏人类样本的直接证据，以及未深入探讨NLRP3在其他细胞类型中的潜在作用 | 研究NLRP3在肾纤维化发病机制中的新功能及其作用机制 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞以及UUO和IRI诱导的肾纤维化小鼠模型 | 机器学习 | 慢性肾病 | 大规模单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及不同基因型小鼠（如NLRP3敲除和巨噬细胞特异性NLRP3敲除小鼠）及UUO和IRI模型，样本数量未具体说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 6269 | 2026-05-21 |
Decoding the Sphingolipid Landscape of Clear Cell Renal Cell Carcinoma: A Single-Cell-Guided Prognostic Model Built With 101 Machine Learning
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/3249360
PMID:42158467
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，结合101种机器学习方法，构建了一个基于鞘脂代谢的透明细胞肾细胞癌预后模型 | 首次利用单细胞测序数据解析鞘脂代谢在ccRCC微环境中的细胞类型特异性特征，并通过101种机器学习组合筛选出最优预后模型 | 未提及具体局限性 | 探索鞘脂代谢在透明细胞肾细胞癌微环境中的异质性作用，并构建预后模型以指导风险分层和治疗优先级 | 透明细胞肾细胞癌患者肿瘤微环境中的免疫细胞和基质细胞亚群 | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 非负矩阵分解, 机器学习 | Lasso+SuperPC | 基因表达数据 | 多队列整合数据，包括GEO单细胞RNA-seq数据及Xena、ArrayExpress、ICGC的批量转录组和临床数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6270 | 2026-05-21 |
Delineating novel diagnostic biomarkers and therapeutic targets for oral submucosal fibrosis: an integrative multi-omics and machine learning approach
2026, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2026.1803111
PMID:42158597
|
研究论文 | 通过整合多组学和机器学习方法，鉴定口腔黏膜下纤维化的新型诊断生物标志物和治疗靶点 | 结合转录组、表观基因组和单细胞RNA-seq数据，并应用机器学习模型来识别潜在生物标志物 | 未明确说明局限性，但样本量较小且主要依赖公共数据库数据 | 发现口腔黏膜下纤维化的新型诊断生物标志物和治疗靶点 | 口腔黏膜下纤维化患者 | 机器学习 | 口腔黏膜下纤维化 | RNA-seq, 微阵列, 表观基因组测序, 单细胞RNA-seq | 随机森林模型 | 基因表达数据, 甲基化数据, 单细胞转录组数据 | 多个公共数据集，具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 6271 | 2026-05-21 |
Characteristics of peripheral blood neutrophil subsets in patients with primary Sjogren's syndrome based on single-cell RNA sequencing
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1820004
PMID:42158857
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序构建原发性干燥综合征患者外周血中性粒细胞亚群图谱，并探索其作用机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统描绘原发性干燥综合征患者外周血中性粒细胞的亚群谱系及细胞间相互作用，发现中性粒细胞2亚群具有独特特征，并鉴定LY6E和CLEC12A为潜在生物标志物和治疗靶点 | 未明确说明研究的局限性 | 探究中性粒细胞亚群在原发性干燥综合征发生发展中的角色与机制 | 原发性干燥综合征患者的外周血中性粒细胞 | 机器学学习 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 纳入2022年12月至2025年1月间新诊断的原发性干燥综合征患者及健康对照者外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6272 | 2026-05-21 |
Identification of characteristic hub genes in the immune-active phase of chronic hepatitis B
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1769749
PMID:42158856
|
研究论文 | 通过整合生物信息学和机器学习方法，鉴定慢性乙型肝炎免疫活跃期外周经典单核细胞中的特征性枢纽基因SLC24A4，并探索其作为免疫调节潜在药物靶点的作用 | 首次利用单细胞RNA测序数据验证SLC24A4在慢性乙型肝炎免疫活跃期外周经典单核细胞中高表达，并通过计算机敲除分析揭示其可能作为单核细胞活化的负调控因子，提出其高表达是限制过度炎症的补偿机制 | 研究主要基于公共数据库和计算机模拟分析，SLC24A4的功能验证局限于计算机敲除和临床样本蛋白表达，缺乏体内功能实验证据 | 识别慢性乙型肝炎免疫活跃期的关键分子靶点，为调控宿主免疫反应提供新策略 | 慢性乙型肝炎患者外周经典单核细胞 | 生物信息学, 机器学习 | 慢性乙型肝炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹法 | 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法, 计算机敲除分析 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | GSE230397数据集（样本量未明确）、GSE182159和GSE283471单细胞数据集（样本量未明确）、临床样本蛋白质印迹验证（样本量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6273 | 2026-05-21 |
Integrative transcriptomic analysis revealed the roles and prognostic value of ion channels in hypertrophic cardiomyopathy
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1810143
PMID:42158954
|
研究论文 | 通过整合转录组分析揭示离子通道在肥厚型心肌病中的作用及预后价值 | 首次结合多个转录组数据集、单细胞RNA测序和空间转录组分析，系统识别出四个关键离子通道（KCNC4、KCNN3、ANO1、CACNA2D3）与HCM发展相关，并发现它们与心肌肥厚、纤维化和巨噬细胞比例变化等病理特征的联系 | 未提及具体局限性，但基于公开数据集的分析可能受样本异质性和数据质量影响 | 阐明离子通道在肥厚型心肌病发展中的角色及其诊断和预后价值 | 肥厚型心肌病患者与对照人群的心脏组织样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | 基于三个转录组数据集，具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6274 | 2026-05-20 |
Identifying mitochondria-related signatures for tuberculosis diagnosis through machine learning on single-cell transcriptomics data and experimental verification
2026-Jul, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108489
PMID:41967724
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研究论文 | 通过单细胞转录组数据和机器学习识别线粒体相关基因特征用于结核病诊断，并经过实验验证 | 首次将单细胞RNA测序数据与机器学习算法相结合，识别出三个线粒体相关基因（STAT2、CASP1和COX7B）作为结核病诊断标志物，构建了基于血液的诊断模型 | 模型在独立临床队列中进行了初步验证，但样本量有限，需更大规模研究进一步确认 | 探索线粒体相关基因特征作为结核病诊断的生物标志物 | 活动性结核病、潜伏性结核感染和健康对照的血液样本及单细胞转录组数据 | 机器学习 | 结核病 | 单细胞RNA测序、微阵列、定量PCR、LASSO、SVM-RFE | 支持向量机（SVM） | 基因表达数据 | 训练集125例，验证集30例，两个测试集分别15例和26例，独立临床队列52例 | Illumina | 单细胞RNA测序、微阵列 | Illumina NovaSeq, Illumina HumanHT-12 | GSE19491微阵列数据，SRP247583单细胞RNA测序数据，GSE54992和GSE34608微阵列数据 |
| 6275 | 2026-05-20 |
Atopic dermatitis: Multi-omics insights into microbiota-driven modulation of the gut-skin axis
2026-Jul, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2026.108504
PMID:42019770
|
综述 | 本文综述了多组学技术揭示的微生物群驱动肠-皮肤轴调控特应性皮炎的作用机制 | 整合了宏基因组学、代谢组学和单细胞转录组学等多组学数据，识别出以拟杆菌和普雷沃菌为主的特应性皮炎内型特征，为精准分层和靶向治疗提供了新框架 | 该综述主要基于现有文献总结，缺乏原始实验数据验证，且未详细讨论不同研究间方法学差异对结论一致性的影响 | 总结宿主遗传学、微生物群网络和多组学生物标志物在特应性皮炎内型中的作用，为精准诊断和靶向干预提供依据 | 特应性皮炎患者及其肠道微生物群、代谢产物和免疫反应特征 | 机器学习 | 特应性皮炎 | 宏基因组学, 代谢组学, 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6276 | 2026-05-20 |
Extracellular vimentin promotes neutrophil-dominant granulomatous inflammation in progressive pulmonary sarcoidosis
2026-Jun-10, Clinical science (London, England : 1979)
DOI:10.1042/CS20250651
PMID:42084847
|
研究论文 | 本研究通过计算机分析和动物实验，发现细胞外波形蛋白在进展性肺结节病中促进中性粒细胞主导的肉芽肿性炎症 | 首次揭示细胞外波形蛋白可作为触发因子，驱动中性粒细胞介导的炎症通路，导致肺结节病进展和纤维化 | 未明确提及具体局限性 | 探索进展性肺结节病中中性粒细胞及其效应分子的作用机制 | 进展性肺结节病患者肺组织样本和波形蛋白诱导的小鼠模型 | 数字病理学 | 肺结节病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 进展性纤维化结节病患者与自愈性疾病患者的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6277 | 2026-05-20 |
Cuproptosis-Related Gene FDX1 Induces Malignant Progression and Immune Suppression in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Jun, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11242-9
PMID:40911146
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研究论文 | 本文研究了铜死亡相关基因FDX1在三阴性乳腺癌中诱导恶性进展及免疫抑制的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示铜死亡关键基因FDX1在三阴性乳腺癌上皮细胞中高表达，并通过体外实验和共培养模型证明其促进肿瘤细胞增殖、迁移并抑制CD8 T细胞免疫应答 | 研究仅基于公共单细胞RNA测序数据集和体外实验，缺乏临床样本验证及体内免疫微环境动态调控机制的深入探讨 | 探究铜死亡相关基因FDX1在三阴性乳腺癌恶性进展及免疫抑制中的作用 | 三阴性乳腺癌细胞及小鼠肿瘤模型 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、qPCR、细胞功能实验、共培养体系、免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据 | 公共单细胞RNA测序数据集及体外细胞系（未明确样本数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 公共scRNA-seq数据集（具体平台未说明） |
| 6278 | 2026-05-01 |
Retraction notice to "Gene expression profile of human placental villous pericytes in the first trimester -an analysis by single-cell RNA sequencing" [Reprod. Biol. 24 (2024) 100919]
2026-06, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2026.101214
PMID:42055852
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6279 | 2026-05-20 |
Spatial transcriptomic profiling of decalcified murine musculoskeletal samples via Xenium Prime 5K
2026-Jun, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziag070
PMID:42124856
|
研究论文 | 针对小鼠肌肉骨骼组织，开发了利用Xenium Prime 5K平台进行空间转录组分析的高质量样本处理流程，包括灌注、固定、脱钙、石蜡包埋和共嵌入策略，实现了多组织同时切片和高转录本检测 | 首次系统建立了适用于小鼠完整肌肉骨骼组织（包括矿化组织）的空间转录组样本处理流程，通过优化固定、脱钙和共嵌入步骤，在保持组织解剖结构的同时实现了高比例优质转录本检测 | 不同组织类型间检测到的转录本数量差异显著，矿化组织转录本数较低；且流程涉及多步骤处理，可能仍存在RNA降解风险 | 建立高质量空间转录组分析的标准流程，以解决小鼠肌肉骨骼组织因脱钙等处理导致的RNA完整性难题 | 成年小鼠的完整膝关节、胫骨和腰椎样本 | 空间转录组学 | 肌肉骨骼疾病 | 基于成像的空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 成年小鼠膝关节、胫骨和腰椎样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium Prime 5K | Xenium Prime 5K平台 |
| 6280 | 2026-05-20 |
Myeloid Mas drives pyruvate kinase M2-mediated Spi1 lactylation to fuel inflammatory senescence in MASLD
2026-May-19, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02704-6
PMID:42151117
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研究论文 | 揭示了髓系Mas通过驱动丙酮酸激酶M2介导的Spi1乳酰化促进MASLD炎症性衰老的机制 | 首次发现G蛋白偶联受体Mas作为MASLD的代谢检查点，并通过Mas-PKM2-Spi1乳酰化轴调控糖酵解重编程和单核前体细胞分化 | 未提及具体局限性 | 阐明免疫代谢与MASLD疾病进展之间的精确机制 | MASLD患者及饮食诱导小鼠模型的肝髓系细胞 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者肝组织样本及饮食诱导小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |