单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 9441 篇文献,本页显示第 6241 - 6260 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
6241 2026-05-21
Single-cell profiling of ANKRD26 thrombocytopenia reveals progenitor expansion and polyploid apoptosis via JUNB-p21
2026-Apr-23, Blood IF:21.0Q1
研究论文 通过单细胞转录组学和体外功能分析,揭示ANKRD26相关性血小板减少症中祖细胞扩增和通过JUNB-p21通路诱导多倍体巨核细胞凋亡的机制 首次在多个患者中整合单细胞转录组和体外功能分析,发现ANKRD26通过JUNB介导的CDKN1A转录激活独立于经典p53-PIDDosome轴诱导多倍体巨核细胞凋亡,并定位ANKRD26到中心体参与有丝分裂调控 样本量有限(仅4名患者),未提及可能的批次效应或技术复制的详细评估 阐明ANKRD26基因5'UTR变异导致的血小板减少症的细胞和分子机制 4名THC2患者的骨髓CD34+造血干细胞和祖细胞以及原代巨核细胞 数字病理学 血小板减少症 单细胞转录组学,共聚焦成像 NA 序列数据 4名患者,包含47,281个THC2 HSPC细胞与51,907个对照细胞,以及7,309个THC2 pMK细胞与5,077个对照细胞 10x Genomics,Illumina 单细胞RNA测序 10x Chromium,Illumina NovaSeq 10x Chromium 单细胞3'测序,Illumina NovaSeq测序平台
6242 2026-05-21
Reference-free discovery with barcoded single-cell sequencing
2026-Apr-22, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 介绍sc-SPLASH方法用于无参考的条形码单细胞测序数据发现 首次提出统计优先、无参考的发现方法,独立BKC子模块优化条形码数据预处理,速度比UMI-tools快约50倍 文章中未提及具体局限性 开发一种无参考的统计优先方法,用于发现条形码单细胞测序和空间转录组学中的转录组变异 海绵(Spongilla,缺少参考序列)和海鞘(Ciona)的免疫样细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学 NA 序列数据 海绵和海鞘的免疫样细胞样本 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
6243 2026-05-21
The transcription factor E4F1 is crucial for spermatogonial differentiation and meiosis progression in mice
2026-Apr-14, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 揭示了转录因子E4F1在小鼠精原细胞分化和减数分裂进程中的关键作用 首次发现E4F1通过调控精原细胞分化和减数分裂相关基因表达,影响小鼠精子发生过程 需要进一步验证以完全阐明E4F1依赖的转录调控机制 探究E4F1在精原细胞分化和减数分裂进程中的功能及分子机制 小鼠精原细胞和精母细胞 分子生物学 NA Cre-loxP基因敲除、单细胞转录组分析、CUT&Tag分析 NA 基因表达数据 E4f1条件性敲除小鼠和HIS-Tag敲入小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6244 2026-05-21
High-throughput strategy for targeting MDM2 in uveal melanoma to reverse radiation therapy resistance
2026-Apr-11, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 结合机器学习和高通量筛选平台发现靶向MDM2的小分子抑制剂,以克服葡萄膜黑色素瘤的放射治疗耐药性 首次将机器学习模型与高通量筛选平台整合,识别靶向MDM2的新型小分子抑制剂SAR405838,并验证其通过p53激活增强放射敏感性 未提及临床验证和体内实验的长期效果评估 开发克服葡萄膜黑色素瘤放射治疗耐药性的新治疗策略 葡萄膜黑色素瘤细胞及其放射治疗耐药机制 机器学习 葡萄膜黑色素瘤 转录组测序, 单细胞RNA测序 机器学习模型 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
6245 2026-05-21
MDA5-MAVS and interferon-lambda signaling in the intestinal epithelium limit murine astrovirus infection
2026-Apr, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示MDA5-MAVS和干扰素-λ信号在肠道上皮细胞中限制小鼠星状病毒感染的作用机制 首次在体内通过单细胞RNA测序明确小鼠星状病毒感染的细胞嗜性,并证明肠上皮细胞是干扰素-λ的主要来源,MDA5-MAVS通路调控干扰素-λ诱导,且IFN-λ信号主要在分泌细胞(包括杯状细胞)中发挥抗病毒作用 未发现特定肠上皮细胞类型对MAVS在控制病毒感染中的需求差异,提示可能需要多种肠上皮细胞的协同作用 阐明小鼠星状病毒感染时干扰素-λ诱导的病毒感知通路及其在病毒控制和细胞嗜性调节中的具体作用 小鼠星状病毒感染的小鼠肠道上皮细胞(包括杯状细胞和多种肠上皮细胞类型) 机器学习和单细胞组学 肠道病毒感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未提供具体样本量信息 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6246 2026-05-21
Application and Challenges of Chimeric Antigen Receptor T Cell Therapy in Systemic Rheumatic Diseases and Autoimmune Disorders
2026-Apr, MedComm IF:10.7Q1
综述 综述嵌合抗原受体T细胞疗法在系统性风湿病和自身免疫性疾病中的应用与挑战 系统总结了CAR-T在自身免疫性疾病中的作用机制,分析了核心临床挑战,并突出了新兴策略(如通用型/体内生成CAR-T细胞、多靶点/逻辑门设计、器官归巢工程以及与耐受增强剂的合理组合),强调多组学整合用于患者分层和复发预测 面临制造复杂、组织穿透有限、抗原逃逸、免疫后遗症以及缺乏预测性生物标志物等未满足需求 系统阐述CAR-T在自身免疫性疾病中的机制、挑战和精准导向创新策略,推动功能免疫重置 系统性风湿病和自身免疫性疾病患者 自然语言处理 自身免疫性疾病 CAR-T细胞疗法 NA NA NA NA NA NA NA
6247 2026-05-21
Metabolic Alterations in Macrophage Subtypes Propel Immune and Stromal Remodeling in Neurofibroma's Malignant Progression
2026-Apr, MedComm IF:10.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,揭示巨噬细胞亚型代谢变化驱动神经纤维瘤恶变过程中的免疫和基质重塑 首次鉴定出SPP1KYNU巨噬细胞亚群在MPNST恶变中协调基质重塑和免疫抑制的核心作用,并发现色氨酸代谢作为潜在治疗靶点 未提及样本量较小等具体局限性 阐明神经纤维瘤恶性转化为MPNST的潜在机制,寻找新的治疗靶点和诊断标志物 人类良性丛状神经纤维瘤和恶性外周神经鞘瘤样本中的肿瘤微环境细胞 数字病理学 神经纤维瘤病1型、恶性外周神经鞘瘤 单细胞RNA测序 NA 文本(基因表达数据) 9个丛状神经纤维瘤和5个恶性外周神经鞘瘤样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
6248 2026-05-21
High-Purity Functional Corneal Endothelial Cells From Human Induced Pluripotent Stem Cells via a Novel Wash-Out Method
2026-Apr, MedComm IF:10.7Q1
研究论文 通过新颖的冲洗方法从人诱导多能干细胞中生成高纯度功能性角膜内皮细胞 首次开发了一种高效、非细胞毒性的冲洗方法,用于去除未分化的诱导多能干细胞并获得高纯度的角膜内皮样细胞 内容未提及该方法在长期移植后的稳定性以及其他动物模型或临床试验的验证 建立从诱导多能干细胞高效生成高纯度功能性角膜内皮样细胞的稳健方法,以克服角膜内皮移植治疗中供体短缺的问题 角膜内皮细胞和诱导多能干细胞 机器学习 角膜内皮功能不全 诱导多能干细胞分化、冲洗方法、单细胞测序、体内移植 NA 单细胞测序数据 诱导多能干细胞衍生的角膜内皮样细胞和人类原代角膜内皮细胞,以及角膜内皮功能障碍家兔模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6249 2026-05-19
Dysregulated landscape of RNA-binding proteins in unexplained recurrent spontaneous abortion revealed by bulk and single-cell transcriptome
2026-Apr-01, Scientific reports IF:3.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
6250 2026-05-21
Spike-in probe-enhanced single-cell RNA-seq reveals post-infusion transcriptomic remodeling of "prime-and-kill" synNotch-CAR-T cells
2026-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种带有外源探针的增强型单细胞RNA测序工作流程,用于追踪和分析“prime-and-kill” synNotch-CAR-T细胞输注后的转录组重塑 首次采用定制外源探针增强单细胞RNA测序技术检测synNotch-CAR转录本,结合机器学习辅助分类器实现工程化细胞的高特异性和高灵敏度检测 外源探针检测敏感性在不同细胞类型间存在差异(E-SYNC细胞78.2% vs B-SYNC细胞60.0%),可能影响低丰度细胞的全面捕获 开发能够同时检测工程化细胞并进行转录组分析的单细胞RNA测序工作流程,以解析synNotch-CAR-T细胞输注后的动态行为 针对胶质母细胞瘤的synNotch-CAR-T细胞(E-SYNC和B-SYNC系统) 机器学习、数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、外源探针设计、机器学习辅助分类器 NA 单细胞转录组数据 胶质母细胞瘤异种移植模型中的脾脏、肺和脑组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6251 2026-05-21
NetTracer3D Enables User-Friendly Analysis of Diverse Microscopic and Medical 3D Datasets
2026-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 NetTracer3D 是一个用于分析多样化显微与医学3D数据集的用户友好型工具 NetTracer3D 提供了三种广泛适用的网络分析模式(连接网络、分支邻接与分支点网络、邻近网络),并支持标准化数据格式和交互式探索,简化了3D图像分析流程 文章未明确提及局限性 开发一个集成工具,简化三维图像分析,促进不同数据集之间的整合、共享和分析 人类和小鼠肾脏、小鼠支气管、人类脑血管造影、淋巴结以及3D光片癌症图像 计算机视觉 癌症 CODEX, 无标记拉曼光谱, 光片显微镜 网络分析模型(连接网络、分支邻接与分支点网络、邻近网络) 图像 多种样本,包括人类和小鼠肾脏、小鼠支气管、人类脑血管造影、淋巴结及3D光片癌症图像 NA 空间转录组学, CODEX NA NA
6252 2026-05-21
Cross-Species Multi-Omics Profiling Identifies Conserved Activated Valvular Interstitial Cell Population Driving Myxomatous Mitral Valve Degeneration
2026-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 跨物种多组学分析揭示了在粘液样二尖瓣退行性变中保守的活化瓣膜间质细胞群 首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,跨物种(小鼠和人类)鉴定出一个保守的活化瓣膜间质细胞群,该细胞群富集促纤维化细胞外基质重塑程序,并优先定位于机械脆弱区域 研究生效细胞群的因果关系验证尚不充分,且人类样本数量有限 解析粘液样二尖瓣退行性变中瓣膜间质细胞的分子异质性及其在疾病发病机制中的状态特异性贡献 纤维蛋白-1缺陷小鼠模型和人类二尖瓣组织标本(包括正常、散发性二尖瓣脱垂和马凡综合征相关二尖瓣脱垂) 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间表达数据 包含小鼠和人类样本,具体样本数未在摘要中说明 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学
6253 2026-05-21
Vascular invasion-associated gene expression is detectable in pre-surgical biopsies of stage I lung adenocarcinoma
2026-Mar-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 检测I期肺腺癌术前活检标本中与血管侵犯相关的基因表达,以预测复发和手术获益 发现血管侵犯相关的基因特征在肿瘤侵袭灶之外也可检测到,并在术前活检中具有区分VI的潜力,支持术前风险分层 文中未明确提及具体局限性 识别能预测I期肺腺癌血管侵犯的生物标志物,以改善术前风险分层 I期肺腺癌肿瘤样本,包括切除肿瘤和术前活检标本 机器学习 肺癌 RNA-seq, 空间转录组学 NA 基因表达数据 162个切除肿瘤样本,及其子集用于空间转录组学;独立验证队列和多区域采样数据;术前活检队列 Illumina bulk RNA-seq, 空间转录组学 Illumina NovaSeq, 空间转录组平台未详述 bulk RNA测序使用Illumina平台,空间转录组学用于部分子集
6254 2026-05-21
ZMAP: A single-cell meta-atlas of zebrafish embryonic development reveals a consensus hierarchy of cell identities
2026-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 整合8个斑马鱼胚胎单细胞RNA测序数据集,构建统一参考图谱ZMAP,揭示细胞身份的分层共识 通过整合多个独立数据集,建立斑马鱼胚胎发育的共识层次注释本体和标记基因发现流水线,并提供交互式网络工具 未提及具体局限性,但跨研究整合可能受限于数据批次效应和原始注释差异 构建斑马鱼胚胎发育的单细胞整合参考图谱,实现跨研究一致性注释和细胞身份共识推断 斑马鱼胚胎发育中的单个细胞 计算生物学, 单细胞基因组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 798,790个细胞,覆盖15个发育时间窗口 NA 单细胞RNA测序 NA 整合8个已发表的斑马鱼全胚胎scRNA-seq数据集
6255 2026-05-21
Intranasal HSV-1 Infection Drives Region-Specific Interferon-Dominant Microglial Remodeling
2026-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 利用多组学框架研究鼻内HSV-1感染如何驱动小胶质细胞区域特异性干扰素主导的重塑 首次整合单核RNA测序、染色质可及性分析和空间转录组学,在生理相关的鼻内HSV-1感染模型中解析小胶质细胞反应的转录和表观遗传机制 未提及明确限制 阐明急性HSV-1感染体内小胶质细胞反应的转录和表观遗传机制 鼻内HSV-1感染小鼠模型中的小胶质细胞和巨噬细胞 数字病理学 神经退行性疾病 单核RNA测序、染色质可及性分析、空间转录组学 NA 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞多组学、空间转录组学 NA NA
6256 2026-05-21
Spatial transcriptomics identifies dysregulated programs across neural and non-neural tissues in spinal muscular atrophy
2026-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 利用空间转录组学技术识别脊髓性肌萎缩症中神经和非神经组织的失调程序 首次在症状前SMA小鼠模型中使用空间转录组学分析整个腰椎区域的多组织转录变化,揭示了SMN缺乏在运动神经元丢失前即引起广泛组织重编程 NA 阐明SMN缺乏在神经和周围组织中的早期转录后果 症状前SMA小鼠和对照小鼠的腰椎横截面 数字病理学 脊髓性肌萎缩症 空间转录组学 NA 基因表达数据 SMA小鼠和对照小鼠(数量未明确说明) NA 空间转录组学 NA NA
6257 2026-05-21
Multiscale confidence quantification for virtual spatial transcriptomics with UTOPIA
2026-Mar-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出了UTOPIA框架,用于虚拟空间转录组学的多尺度置信度量化,从组织学图像预测基因表达或细胞类型 提出了模型无关的UTOPIA框架,能对虚拟空间转录组预测进行统计校准的置信度评分,并控制基因和细胞类型检测的假发现率 NA 解决虚拟空间转录组学预测的统计可靠性问题,确保预测的可信度并防止虚假生物学结论 虚拟空间转录组学预测的空间分辨率和生物粒度 计算机视觉, 机器学习 NA 空间转录组学 NA 图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
6258 2026-05-21
BDCD: a comprehensive Brain Disease Cell-cell communication Database
2026-Jan-15, Database : the journal of biological databases and curation
研究论文 BDCD是首个专注于脑疾病细胞间通讯网络的综合数据库,整合了来自单细胞RNA-seq和空间转录组学的大量数据 首次构建了覆盖多种脑疾病的特异性细胞间通讯资源,整合了配体-受体相互作用与遗传关联、通路和药物调节剂等多维度数据,支持跨疾病比较和动态假说生成 现有资源在脑部特异性、区域覆盖和功能注释方面仍存在局限,且数据库可能尚未涵盖所有已知脑疾病或最新研究数据 为脑疾病病理机制和治疗发现提供综合性的细胞间通讯资源 脑疾病中涉及的单细胞和空间转录组数据,覆盖阿尔茨海默病、帕金森病、精神分裂症、双相情感障碍和多发性硬化症 生物信息学 阿尔茨海默病, 帕金森病, 精神分裂症, 双相情感障碍, 多发性硬化症 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 8519425个单细胞和140744个空间转录组点,来自38个手动整理的数据集,涵盖14个脑区和13种经典细胞类型 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
6259 2026-01-20
Single-cell transcriptomic analysis reveals metabolic reprogramming and tumor microenvironment remodeling in aldosterone-producing adenoma
2026-01, Genomics IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了醛固酮瘤(APA)中的代谢重编程和肿瘤微环境重塑 首次构建了APA的单细胞图谱,揭示了CAPS zona glomerulosa样细胞的代谢重编程特征、分化轨迹紊乱以及肿瘤微环境中免疫浸润和基质重塑的关键机制 样本量较小(仅3例APA患者和3例对照),且为单中心研究,需要更大规模队列验证 阐明醛固酮瘤的细胞异质性、肿瘤发生机制及潜在治疗靶点 肾上腺组织(来自APA患者和对照个体) 数字病理学 肾上腺肿瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 3例APA患者和3例对照的肾上腺组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6260 2026-05-21
Single-cell RNA sequencing reveals a cellular atlas of the sheep testis
2026-01, Genomics IF:3.4Q2
研究论文 利用单细胞RNA测序构建绵羊睾丸细胞图谱,揭示精子发生过程中的细胞异质性和分化轨迹 首次在绵羊中通过单细胞转录组分析鉴定出六种体细胞亚型和五种生殖细胞亚型,并发现Leydig细胞和管周肌样细胞可能起源于共同祖细胞谱系 仅分析了6月龄性成熟湖羊的睾丸组织,缺乏不同发育阶段或病理状态的比较 解析绵羊睾丸中不同细胞类型的转录组特征及精子发生的分化轨迹 3只6月龄性成熟湖羊的睾丸细胞 机器学习和生物信息学 NA scRNA-seq(单细胞RNA测序) NA 单细胞转录组数据 3只绵羊,共15,826个睾丸细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Genomics Chromium™ 单细胞3'转录组测序
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