单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 9441 篇文献,本页显示第 6201 - 6220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
6201 2026-05-23
IgA autoantibodies promote inflammation, Th17 polarization and fibrotic responses in hidradenitis suppurativa
2026-Mar-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文研究了IgA自身抗体在化脓性汗腺炎中促进炎症、Th17极化和纤维化反应的作用 首次系统揭示了IgA自身抗体通过巨噬细胞、中性粒细胞胞外陷阱和T细胞多重机制驱动HS慢性炎症和纤维化的致病网络 主要基于体外实验和临床样本关联分析,缺乏体内动物模型验证因果机制 阐明IgA自身抗体在化脓性汗腺炎发病机制中的致病作用 化脓性汗腺炎患者的皮肤病变组织、血清及免疫细胞 数字病理学 化脓性汗腺炎 单细胞RNA测序, qPCR, 免疫荧光, 蛋白质印迹 NA 基因表达数据, 图像 HS患者皮肤病变样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
6202 2026-05-23
Cellular landscape and diagnostic value of TROP2 in cerebrospinal fluid of lung adenocarcinoma leptomeningeal metastases
2026-Mar-24, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序描绘肺腺癌软脑膜转移患者脑脊液的细胞图谱并评估TROP2的诊断价值 首次系统描绘肺腺癌软脑膜转移脑脊液的单细胞转录组图谱,发现促肿瘤LGMN-SELENOP巨噬细胞和增殖性循环肿瘤细胞,并揭示NECTIN2_TIGIT和CD47_SIRPA免疫抑制轴,以及TROP2作为诊断生物标志物的潜力 样本量有限(仅6例患者),且结果需在更大队列中验证 研究肺腺癌软脑膜转移脑脊液的细胞特征并寻找诊断生物标志物 6例肺腺癌软脑膜转移患者脑脊液样本 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 6例肺腺癌软脑膜转移患者的脑脊液样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
6203 2026-05-23
RelA Signaling in Scgb1a1+ Progenitors Mediates Lower Airway Epithelial Atypia in RSV-Induced Post-Viral Lung Disease
2026-Mar-21, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究探讨RSV感染后慢性肺部疾病中Scgb1a1+祖细胞的RelA信号通路如何诱导下气道上皮异型 首次揭示RSV后病毒性肺病中Scgb1a1+祖细胞通过RelA信号调控上皮-间质微环境,驱动非典型肺泡2型细胞(aAT2)形成及ANGPTL4信号失调 主要基于小鼠模型,需进一步验证在人类RSV感染相关慢性肺病中的适用性 解析RSV感染后慢性气道疾病中先天免疫信号在呼吸道上皮祖细胞中的作用机制 Scgb1a1+祖细胞、非典型肺泡2型细胞(aAT2)、PDGFRβ间质细胞 机器学习 呼吸道合胞病毒感染后肺病 单细胞RNA测序、谱系追踪、条件性基因敲除 NA 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 RSV后病毒性肺病小鼠模型,含RelA条件敲除组和对照组 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
6204 2026-05-23
Modulating Bacteroides to boost anti-PD-1 immunotherapy in HCC
2026-Feb-17, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 通过调节肠道菌群中的拟杆菌属,增强抗PD-1免疫疗法在肝细胞癌中的疗效 发现了B.th通过KLF2/TLR9信号通路重编程树突状细胞增强抗PD-1免疫疗法疗效的新机制,并提出了基于菌群调节的免疫治疗优化策略 尚未完全阐明参与该过程的其他菌种和分子机制,临床转化需进一步验证 探究肠道微生物组对肝细胞癌抗PD-1免疫治疗应答的调控机制及潜在临床应用 肝细胞癌患者及小鼠模型中的肠道菌群、树突状细胞、CD8+ T细胞 机器学习 肝细胞癌 16S rRNA基因测序、单细胞RNA测序、粪便微生物移植 NA 测序数据 NA NA 16S rRNA基因测序、单细胞RNA测序 NA NA
6205 2026-05-23
Redirecting cytomegalovirus immunity against pancreas cancer for immunotherapy
2026-Feb-04, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 通过系统性递送巨细胞病毒T细胞表位,重新引导预先存在的抗病毒免疫力以对抗胰腺癌 提出一种利用预先存在的巨细胞病毒记忆T细胞治疗免疫难治性实体瘤(胰腺癌)的新策略,通过静脉注射T细胞肽表位实现 NA(摘要未提及限制) 研究利用巨细胞病毒特异性T细胞重定向攻击胰腺癌的免疫疗法效果 小鼠模型及胰腺癌细胞 免疫疗法 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 NA(摘要未提及具体样本量) NA 单细胞RNA测序 NA NA
6206 2026-01-18
Neighborhood nonnegative matrix factorization identifies patterns and spatially-variable genes in large-scale spatial transcriptomics data
2026-Jan-16, Genome biology IF:10.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
6207 2026-05-21
Investigating the role of inflammatory bowel disease-associated gene expression in oral cancer using single-cell RNA sequencing
2026-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
研究论文 利用单细胞RNA测序探究炎症性肠病相关基因在口腔癌中的表达及其潜在治疗靶点 首次在单细胞水平揭示口腔癌中炎症性肠病相关基因的表达异质性,并发现NFKBIA表达与趋化因子介导信号通路显著关联 研究样本量有限,未涉及功能性验证实验,缺乏健康对照组织比较 阐明炎症性肠病相关基因在口腔癌中的细胞和分子通路机制 口腔癌组织样本 数字病理学 口腔癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 口腔癌组织样本(具体数量未说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
6208 2026-05-21
Single-cell and bulk transcriptome analysis reveals the impact of inflammatory microglia on prognosis and immunotherapy response in primary glioblastoma
2026-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
研究论文 通过单细胞和批量转录组分析揭示炎症性小胶质细胞在原发性胶质母细胞瘤中对预后和免疫治疗反应的影响 首次基于炎症性小胶质细胞相关基因对GBM患者进行分层,并揭示两种不同亚型在预后和免疫治疗反应上的显著差异 NA 阐明炎症性小胶质细胞在胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的亚型特异性影响,并探索其预后和免疫治疗反应的预测价值 原发性胶质母细胞瘤患者及其肿瘤微环境中的炎症性小胶质细胞 机器学习 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 Cox回归模型 转录组数据 三个独立数据集的GBM患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6209 2026-05-21
Single-cell transcriptomic analysis reveals cellular heterogeneity and prognostic subtypes in colorectal cancer
2026-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析结直肠癌的细胞异质性并识别预后亚型 整合单细胞RNA-seq与批量RNA-seq数据,在单细胞水平揭示结直肠癌肿瘤微环境的细胞组成,并基于标记基因对患者进行基因分型,识别出具有预后意义的分子亚型 需要进一步的功能验证以充分理解这些发现的临床意义 探索结直肠癌的细胞组成,整合单细胞与批量转录组数据以识别预后标志物并表征肿瘤异质性 结直肠癌肿瘤样本的细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA 基因表达数据 17例结直肠癌样本用于单细胞RNA-seq,566例结直肠癌样本用于批量RNA-seq NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
6210 2026-05-21
CCR5 expression defines the functional heterogeneity of tumor-infiltrating CD8+ T cells and predicts enhanced antitumor immunity and favorable prognosis in non-small cell lung cancer
2026-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过综合转录组、单细胞RNA测序及功能实验,揭示了CCR5+CD8+ T细胞在非小细胞肺癌中的抗肿瘤作用及其作为预后标志物的潜力 首次在非小细胞肺癌中系统验证CCR5+CD8+ T细胞的功能异质性及其独立预后价值,并采用多方法联合验证(转录组、单细胞、染色、功能实验) 未提供明显局限性,可能包括样本量有限或机制深度不足(基于摘要推断) 评估CCR5+CD8+ T细胞在非小细胞肺癌中的抗肿瘤功能和预后价值 非小细胞肺癌患者肿瘤浸润CD8+ T细胞 机器学习 肺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光染色, 体外细胞共培养杀伤实验 NA 转录组数据, 单细胞转录组数据, 组织图像 TCGA和GEO队列(多个队列),15例NSCLC患者样本(单细胞RNA测序) NA NA NA NA
6211 2026-05-21
Macrophage-Fibroblast Crosstalk Shapes Wound Repair Signaling In Vitro
2026-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 利用体外2D和3D伤口愈合模型结合活细胞钙成像和单细胞RNA测序,研究巨噬细胞与成纤维细胞之间的接触依赖性和旁分泌互作机制 揭示了接触依赖性钙信号和连接蛋白信号与转录重塑的整合如何协调巨噬细胞-成纤维细胞行为,特别是发现连接蛋白Cx43介导的细胞-细胞接触增强巨噬细胞IL10生成并抑制TNFα分泌 研究仅基于体外模型,尚未在体内伤口愈合环境中验证相关信号通路 阐明巨噬细胞与成纤维细胞之间接触依赖性信号如何与旁分泌通路整合以调控伤口愈合过程中的相互行为 骨髓来源巨噬细胞和成纤维细胞 数字病理学 伤口愈合 单细胞RNA测序、活细胞钙成像 NA 基因表达数据、钙成像数据 使用骨髓来源巨噬细胞和成纤维细胞进行体外实验,未提供具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6212 2026-05-21
Contrastive graph regularized non-negative matrix factorization for domain identification of spatial transcriptomics
2026-May-20, Journal of the Royal Society, Interface
研究论文 提出对比图正则化非负矩阵分解模型用于空间转录组学的域识别,实现可解释的降维和空间结构保留 首次将对比学习与图正则化非负矩阵分解相结合,通过构建正负样本对同时利用基因表达相似性和空间邻近性,增强特征表示和空间结构保留,提升模型的可解释性 未提及局限性,但可能依赖于高质量空间转录组数据,且对比学习框架的计算复杂度较高 开发一种可解释的降维方法,用于空间转录组学中的空间域自动识别和生物学相关区域发现 空间转录组学数据中的空间域和生物功能区域 机器学习 NA 空间转录组学 非负矩阵分解 基因表达数据 三个公开空间转录组数据集 NA 空间转录组学 NA NA
6213 2026-05-21
Decoding the breast cancer microenvironment by spatial multi-omics: from architecture to clinical translation
2026-May-20, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
综述 通过空间多组学技术解码乳腺癌微环境,从结构到临床转化的全面综述 综合讨论空间转录组学、空间蛋白质组学和新兴代谢组学在乳腺癌微环境中的应用,强调从静态分子清单向高分辨率空间图谱的转变,并构建基于肿瘤-免疫界面距离的预后模型 多模态数据整合、批次效应、高成本以及临床实施中缺乏标准化方案 评估空间多组学技术在乳腺癌研究中的进展、挑战及临床转化潜力 乳腺癌肿瘤微环境,包括肿瘤细胞异质性、基质细胞亚型、免疫细胞拓扑结构和三级淋巴结构 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 代谢组学 NA 图像, 文本 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学 NA NA
6214 2026-05-21
Senescent-like neutrophils shape angiogenic immunosuppressive niches in colorectal cancer liver metastasis
2026-May-19, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序和空间增强分辨率组学测序揭示结直肠癌肝转移中肿瘤相关中性粒细胞的转录组图谱,并发现衰老样中性粒细胞通过促进血管生成和招募免疫抑制巨噬细胞形成免疫抑制微环境 首次在单细胞和空间水平系统描绘结直肠癌肝转移中肿瘤相关中性粒细胞的转录图谱,并鉴定出以糖酵解特征和衰老表型为特征的终末分化促肿瘤中性粒细胞亚群(TAN1),揭示BHLHE40在葡萄糖剥夺驱动的TAN1生成中的关键作用 未提及明显局限性 阐明结直肠癌肝转移中肿瘤相关中性粒细胞的异质性和功能 结直肠癌肝转移肿瘤组织中的中性粒细胞 数字病理学 结直肠癌肝转移 单细胞RNA测序,空间增强分辨率组学测序 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 结直肠癌肝转移患者样本(具体数量未提及) 10x Genomics,华大基因 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium,华大基因Stereo-seq 10x Chromium单细胞RNA测序,华大基因Stereo-seq空间转录组学
6215 2026-05-21
Stem cell activity is linked to a transient acquisition of pluripotency during callus proliferation
2026-May-19, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析,揭示愈伤组织形成过程中多能性获得是短暂的,并由WOX5-TAA1模块的干细胞活性调控 首次发现愈伤组织多能性获得是短暂的,并识别出WOX5-TAA1模块在干细胞活性中的关键作用,以及愈伤组织发育的连续程序 未说明 研究植物体细胞重编程过程中多能性获得的动态机制 拟南芥的愈伤组织细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组分析 NA 单细胞转录组数据 多能性和非多能性愈伤组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞测序平台
6216 2026-05-21
E2F-mediated activation of mTORC1 through the ubiquitin-proteasome system promotes lung adenocarcinoma progression
2026-May-19, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 通过整合TCGA/GEO数据集和单细胞RNA-seq数据,发现E2F8通过泛素-蛋白酶体系统激活mTORC1通路,促进肺腺癌进展 首次揭示E2F8通过转录激活E3连接酶WWP1,介导TSC1的K48连接多聚泛素化降解,从而维持mTORC1信号通路的分子机制,并鉴定出E2F8-WWP1-TSC1-mTORC1轴作为肺腺癌的可靶向调控回路 尚未明确E2F8在肺腺癌中上调的上游调控机制,以及该轴在其他肺癌亚型或临床样本中的验证 探究肺腺癌中mTORC1异常激活的分子机制及其与E2F转录因子的关联 TCGA/GEO数据集中的肺腺癌样本、PC-9和H1975细胞系及异种移植瘤模型 分子生物学 肺癌 单细胞RNA测序、RNA-seq、免疫印迹、免疫组化 NA 转录组数据、单细胞转录组数据 TCGA/GEO公共数据库肺腺癌样本及实验室单细胞RNA-seq样本(具体数量未明确提及) Illumina 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq 用于单细胞RNA测序的Illumina平台(具体配置未详述)
6217 2026-05-21
Inferring stochastic dynamics by biophysical Neural ODE using single-cell transcriptomics
2026-May-19, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出一种名为DynNet的深度学习方法,整合神经ODE与生物物理模型,从单细胞转录组数据推断随机动力学 将神经ODE与生物物理模型和基因表达动力学先验知识相结合,实现可解释的细胞命运随机动力学推断 主要依赖合成数据和有限实验数据验证,未见大规模临床应用或跨物种泛化性评估 开发从静态单细胞转录组数据推断细胞命运随机动力学的计算方法 合成数据及肝细胞分化、上皮间质转化(EMT)实验数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 神经ODE 基因表达数据 未明确提及具体样本量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6218 2026-05-21
Depicting the dynamic transcriptional and epigenetic landscape of testis development in pubertal Simmental cattle
2026-May-18, Journal of animal science and biotechnology IF:6.3Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序和单核ATAC测序揭示了青春期西门塔尔牛睾丸发育中的动态转录和表观遗传图谱 首次整合scRNA-seq和sNucATAC-seq技术系统解析青春期前后西门塔尔牛睾丸发育中生殖细胞命运转变的调控网络,并鉴定出跨物种保守的转录因子E2F1、BCLAF1和YY1 未明确提及样本量局限性或技术验证不足等限制 阐明牛睾丸发育中生殖细胞命运转变的调控机制 西门塔尔牛睾丸组织(出生后、青春期前和青春期三个阶段) 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核ATAC测序(sNucATAC-seq) NA 基因表达数据、染色质开放性数据 西门塔尔牛睾丸组织样本覆盖三个发育阶段(出生后、青春期前、青春期) NA 单细胞RNA测序、单核ATAC测序 NA NA
6219 2026-05-21
Single-cell profiling and machine learning identify cuproptosis-related fibroblast subpopulations and fibrogenesis modulator AEBP1 in endometriosis
2026-05-18, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序和机器学习,鉴定子宫内膜异位症中与铜死亡相关的成纤维细胞亚群和纤维化调节因子AEBP1 首次将铜死亡与子宫内膜异位症的成纤维细胞介导的纤维化进程关联,并利用机器学习和网络分析优先筛选出关键枢纽基因AEBP1 铜死亡相关分子机制与纤维化进展的因果关联仍需进一步验证,且目前仅限于体外和动物模型 阐明铜死亡在子宫内膜异位症成纤维细胞介导的纤维化进程中的作用 正常、在位和异位子宫内膜组织、子宫内膜基质细胞、子宫内膜异位症小鼠模型 单细胞分析、机器学习 子宫内膜异位症 单细胞RNA测序 机器学习模型 单细胞转录组数据 正常、在位和异位子宫内膜组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6220 2026-05-21
PSD3 links autophagic flux to MHC-I-associated immune modulation in esophageal squamous cell carcinoma
2026-05-18, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 PSD3连接食管鳞状细胞癌中的自噬通量与MHC-I相关免疫调控 首次发现PSD3在食管鳞状细胞癌中上调且与不良预后相关,并揭示其通过自噬通量调控MHC-I分子表达及免疫细胞浸润的机制 需要进一步研究明确通路层级和抗原呈递功能的关系 探究PSD3在食管鳞状细胞癌中连接自噬过程与免疫调控的分子机制 食管鳞状细胞癌组织、小鼠及人ESCC模型细胞(如KYSE150) 机器学习 食管鳞状细胞癌 共免疫沉淀、蛋白质印迹、串联荧光LC3报告基因、免疫组化、单细胞RNA测序 NA 图像 食管鳞状细胞癌组织样本及小鼠/人细胞系样本 NA 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序试剂盒
回到顶部