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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6181 | 2026-05-25 |
Single-bacterial cell insights into mechanisms of ceftriaxone resistance in Neisseria subflava
2026-Mar-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68621-y
PMID:41896210
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研究论文 | 通过单细菌细胞视角揭示头孢曲松耐药在奈瑟氏球菌亚种中的机制 | 首次结合实验进化和单细胞转录组学来解析奈瑟氏球菌亚种在抗生素压力下从共生菌向病原菌转变的多因素策略 | 尚未在更多临床菌株或体内模型中验证该适应性过程 | 研究抗生素压力如何驱动奈瑟氏球菌亚种适应并增强致病性 | 奈瑟氏球菌亚种(Neisseria subflava) | 机器学习和数字病理学 | 慢性呼吸系统疾病 | 全基因组测序、单细胞转录组学 | NA | 基因数据 | 实验进化过程中多个时间点的细菌培养样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6182 | 2026-05-25 |
Germ line LCP1 mutations cause immunodeficiency with neutropenia, monocytopenia, lymphopenia, and defective cytokinesis
2026-Feb-10, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025016507
PMID:41056520
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研究论文 | 本研究报告了LCP1基因种系突变导致的一种新型免疫缺陷疾病,其特征包括中性粒细胞减少、单核细胞减少、淋巴细胞减少及细胞分裂缺陷 | 首次发现LCP1基因的激活型突变是导致常染色体显性遗传性造血系统疾病的病因,并通过患者来源的诱导多能干细胞验证了遗传起源 | 主要基于四个独立家系的数据,样本量有限,且对突变导致的功能获得效应的分子机制阐述尚不完全 | 阐明LCP1基因突变在先天性中性粒细胞减少症及免疫缺陷中的致病作用 | 来自四个独立家系的LCP1基因突变患者及其骨髓来源的造血干细胞和祖细胞 | 数字病理学 | 先天性中性粒细胞减少症 | 单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 四个家系中多名患者,具体数量未说明;其中A247_E254del突变患者的骨髓来源造血干细胞和祖细胞进行了单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6183 | 2026-05-25 |
Claudin 18.2 as a Biomarker for Imaging and Radiopharmaceutical Therapy in Gastric and Pancreatic Tumors
2026-01-02, Journal of nuclear medicine : official publication, Society of Nuclear Medicine
IF:9.1Q1
DOI:10.2967/jnumed.125.270568
PMID:41266253
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研究论文 | 探究Claudin 18.2作为胃癌和胰腺癌中分子成像与靶向放射性药物治疗的生物标志物的潜力 | 首次在胃癌和胰腺癌模型中系统评估CLDN18.2用于PET成像和放射性核素治疗的可行性,展示了[Zr]Zr-DFO-zolbetuximab的高肿瘤摄取和[Lu]Lu-DOTA-zolbetuximab的抗肿瘤效果 | 研究基于小鼠异种移植模型,尚未在人体中进行验证;样本量较小(31例PDAC患者) | 评估CLDN18.2作为胃癌和胰腺癌分子成像和靶向放射性药物治疗的生物标志物的潜力 | 胃癌(GSU细胞系)和胰腺导管腺癌(HUPT-4和PATU8988S细胞系)的小鼠皮下异种移植模型 | 数字病理学 | 胃癌, 胰腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, PET成像, 放射性药物治疗 | NA | 测序数据, 影像数据 | 31名胰腺癌患者, 裸鼠异种移植模型(GSU、HUPT-4、PATU8988S细胞系) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6184 | 2026-05-25 |
Ubiquitous and Brain Cell-Type-Specific Promoters and Enhancers in Lentiviral Vectors
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4807-0_7
PMID:41273642
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综述 | 讨论了在慢病毒载体中构建和运用组成型及脑细胞类型特异性启动子和增强子以实现精准高效基因递送的方法 | 利用单细胞转录组学和ATAC测序新技术发现新型增强子区域,为开发更精准的靶向慢病毒载体铺平道路 | 未明确说明 | 开发用于慢病毒载体的脑细胞类型特异性启动子和增强子,提高转基因在脑细胞中的表达特异性和效率 | 脑细胞类型包括兴奋性和抑制性神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学, ATAC测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 6185 | 2026-05-23 |
SIRT1-NCOR2 Corepressor Modulates Trophoblast-Macrophage Interactions in Preeclampsia
2026-Jun, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
|
研究论文 | 研究SIRT1-NCOR2共抑制复合物在子痫前期中调节滋养层-巨噬细胞相互作用的机制 | 首次揭示SIRT1通过招募NCOR2调控RARRES2表达,影响滋养层与巨噬细胞相互作用,并验证孕酮补充可逆转子痫前期样症状 | 未标注具体局限性,但可能涉及小鼠模型的物种差异及临床样本量限制 | 探究子痫前期中低SIRT1水平如何上调RARRES2表达,影响巨噬细胞极化和疾病发病机制 | 系统性Sirt1杂合敲除小鼠、滋养层特异性Sirt1敲除(cKO)小鼠、子痫前期患者血浆 | 数字病理学 | 妊娠期高血压疾病(子痫前期) | 单细胞测序、共培养实验、荧光素酶报告基因、染色质免疫沉淀、质谱分析、免疫沉淀 | NA | 测序数据、细胞实验数据、动物模型数据、临床样本数据 | 包含小鼠模型(具体数量未提及)及子痫前期患者血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6186 | 2026-05-23 |
Autocrine SFRP2 (secreted frizzled related protein 2) enhances lung myofibroblast fibrogenic activity by suppressing PINK1-mediated mitophagy initiation
2026-Jun, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2026.2642341
PMID:41789512
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现SFRP2在IPF肺肌成纤维细胞中高表达,并揭示其通过抑制PINK1介导的线粒体自噬启动来增强肺肌成纤维细胞的纤维化活性 | 首次定义了一个新型的自分泌SFRP2-线粒体自噬调控轴,该轴持续激活肌成纤维细胞,并作为肺纤维化的潜在治疗靶点 | 目前文章未明确提及局限性,但可能包括模型仅限于小鼠、未在人体样本中验证治疗干预等 | 探究特发性肺纤维化中肌成纤维细胞持续激活的调控机制 | IPF患者肺组织、小鼠肺纤维化模型、原代小鼠肺成纤维细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、腺相关病毒载体、中和抗体、自噬诱导剂 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及IPF患者肺组织样本和小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'(推测) |
| 6187 | 2026-05-23 |
Epigenetic and Transcriptional Regulatory Networks Underlying Psoriasis Pathogenesis
2026-Jun, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.03.003
PMID:41856313
|
综述 | 本文综述了表观遗传调控在银屑病发病机制中的作用,包括DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA,并探讨了环境因素、诊断工具和治疗策略 | 整合了表观遗传学与遗传风险、环境触发因素及精准治疗策略的联系,并强调了单细胞表观基因组学和空间转录组学等新型诊断工具的应用潜力 | 临床前模型的预测价值有限,且表观遗传谱存在个体差异,限制了研究结果的转化 | 阐明表观遗传调控在银屑病病理生理中的核心作用,并探索其作为精准医学框架的桥梁价值 | 银屑病相关的表观遗传机制(DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA)及环境因素(紫外线、空气污染) | 自然语言处理 | 银屑病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞表观基因组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 6188 | 2026-05-23 |
Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell Transcriptomics Identifies Prognostic Biomarkers in Breast Cancer Metastasis
2026-Jun, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11228-7
PMID:40828203
|
研究论文 | 通过整合批量与单细胞转录组数据,识别乳腺癌转移相关的预后生物标志物 | 首次结合批量微阵列与单细胞RNA测序数据,发现PRC1和POLR3H作为乳腺癌转移的新型预后标志物 | 未提供具体局限信息 | 识别乳腺癌转移的预后相关基因标志物 | 乳腺癌转移相关的差异表达基因及其在恶性上皮和EMT细胞中的表达 | 机器学习 | 乳腺癌 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 三个公共微阵列数据集(GSE14776、GSE103357、GSE32489)及一个单细胞RNA测序数据集(GSE180286) | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6189 | 2026-05-21 |
Corrigendum to: Integrating single-cell and spatial transcriptomics reveals endoplasmic reticulum stress-related CAF subpopulations associated with chordoma progression
2026-May-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf159
PMID:40719554
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6190 | 2026-05-23 |
DUSP5 suppresses esophageal squamous cell carcinoma by counteracting macrophage-derived AREG-ERK1/2 signaling and disrupting an oncogenic ERK1/2-ELK1-DUSP5 feedback circuitry
2026-Apr-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08641-0
PMID:41956999
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学结合体内外模型,揭示了DUSP5通过抑制肿瘤浸润巨噬细胞来源的AREG-ERK1/2信号通路及破坏致癌性ERK1/2-ELK1-DUSP5正反馈回路来抑制食管鳞癌进展的分子机制 | 首次阐明DUSP5在食管鳞癌中充当肿瘤抑制因子,并发现其受ERK1/2下游转录因子ELK1负调控,形成致癌性反馈回路;同时揭示了APOC⁺巨噬细胞通过AREG-EGFR轴促进肿瘤生长的免疫微环境机制 | 未明确提及具体研究限制 | 探究DUSP5在食管鳞癌中的功能及肿瘤免疫微环境中的调控机制 | 食管鳞癌细胞系、小鼠异种移植模型及致癌物诱导的DUSP5敲除小鼠 | 数字病理学 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序、Western blot、细胞增殖/凋亡/迁移检测、小鼠肿瘤模型 | 单细胞转录组分析、基因表达谱 | 单细胞转录组数据、临床组织样本数据 | 未明确提及样本量,涉及多个细胞系及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6191 | 2026-05-23 |
Functional analysis of the human miRNome in non-small cell lung cancer unveils a novel miR-92b-3p/NOTCH3 axis that drives tumor progression
2026-Apr-08, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08709-x
PMID:41951596
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研究论文 | 通过功能性miRNA筛选发现miR-92b-3p/NOTCH3轴驱动非小细胞肺癌进展 | 首次对肺腺癌中人类miRNome进行系统性功能筛选,并发现驱动肿瘤进展的新miR-92b-3p/NOTCH3轴 | NA | 系统鉴定与肺腺癌进展相关的功能性miRNA及其机制 | 肺腺癌细胞系及患者样本 | 机器学习, 数字病理学 | 肺癌 | 慢病毒miRNA筛选, RNA-seq, 空间转录组学 | 风险评分模型 | 转录组数据, 空间转录组数据, 临床数据 | TCGA-LUAD队列及内部空间转录组样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6192 | 2026-05-23 |
SIRT1 mediates KU70 to maintain genomic stability in spermatogonial stem cells via the NHEJ repair pathway
2026-Apr-07, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08710-4
PMID:41946691
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研究论文 | 该论文揭示了SIRT1通过KU70介导的非同源末端连接修复途径维持精原干细胞基因组稳定性的机制 | 首次在精原干细胞中阐明SIRT1通过去乙酰化KU70调控NHEJ修复通路,并发现SIRT1-KU70轴是保护雄性生育力的潜在靶点 | 主要基于体外实验和小鼠模型,人体样本验证有限,且未深入探讨SIRT1其他下游靶点 | 探究SIRT1在精原干细胞DNA损伤应答中的作用机制及其对雄性生育力的影响 | 非阻塞性无精子症患者的精原干细胞及小鼠精原干细胞模型 | 机器学习 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类睾丸单细胞RNA测序数据集(非阻塞性无精子症患者与对照),以及梗阻性无精子症患者睾丸切片 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'RNA-seq |
| 6193 | 2026-05-23 |
Integrated spatial transcriptomics and pan-cancer XGBoost modeling uncover spatial drivers of immune exclusion and predict immunotherapy response
2026-Apr-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04374-3
PMID:41925746
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研究论文 | 本研究建立了一个综合计算框架,整合27种癌症类型的多组学数据,利用空间转录组学解码免疫相关非编码RNA调控网络,发现SNHG6-BIRC5轴是肺腺癌“免疫冷”表型的关键驱动因子,并开发了泛癌XGBoost模型用于预测免疫治疗反应 | 首次将空间转录组学与多组学分析结合,系统鉴定免疫排斥的空间驱动因素,并开发了优于PD-L1的泛癌XGBoost预测模型 | 文中未明确提及研究局限性 | 利用空间转录组学和机器学习方法,揭示免疫排斥的空间驱动因素,并开发预测免疫治疗反应的泛癌模型 | 27种癌症类型的肿瘤样本,重点为肺腺癌样本 | 机器学习 | 肺癌 | NGS, 空间转录组学, CRISPR-Cas9筛选 | XGBoost | 图像 | 27种癌症类型的数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6194 | 2026-05-23 |
Hepatic radiofrequency ablation induces widespread cellular activation throughout the liver
2026-Apr-02, European radiology experimental
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s41747-026-00687-1
PMID:41926011
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研究论文 | 研究了肝脏射频消融术后远处肝组织的细胞、转录和翻译激活情况 | 首次通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,全面揭示了射频消融术后肝脏远处区域在转录和翻译水平上的广泛细胞激活现象 | 研究仅使用小鼠模型,且样本量较小(两只治疗小鼠和一只对照),可能无法完全代表人类肝脏的生物学反应 | 探究射频消融对整个肝脏的细胞、转录和翻译激活程度 | 健康肝脏的小鼠模型 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 射频消融, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析(SomaLogic) | NA | 单细胞基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 两只8-10周龄雄性C57/Bl6小鼠进行射频消融,一只进行假手术对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6195 | 2026-05-23 |
Single-cell transcriptomics reveal alveolar macrophage-specific responses in single-hit ozone exposure model in mice
2026-04-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00235.2025
PMID:41481288
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析臭氧暴露小鼠肺泡巨噬细胞的浓度依赖性反应 | 首次在单细胞分辨率下揭示肺泡巨噬细胞对不同浓度臭氧暴露的转录组变化和功能调节 | 信息不足,未提及 | 探究肺泡巨噬细胞在臭氧暴露下的浓度依赖性反应机制 | 成年雄性C57BL/6J小鼠的肺泡巨噬细胞 | NA | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年雄性C57BL/6J小鼠,具体数量未提供 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6196 | 2026-05-23 |
Generative cerebral vasculature visualization using spatial transcriptomic data
2026-Mar-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-46455-4
PMID:41917199
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研究论文 | 利用空间转录组数据和生成式AI模型Tera-MIND预测并可视化脑部血管结构 | 首次利用空间转录组数据和生成式AI模型(Tera-MIND)从基因共表达模式预测脑部血管空间组织,无需额外组织处理 | NA | 预测脑部血管的空间组织,探索生成式AI在生物结构模拟中的应用潜力 | 小鼠大脑中的血管网络结构 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | 扩散模型(Diffusion model) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6197 | 2026-05-23 |
Risk assessment of secondary primary malignancies: results from two large prospective European cohorts
2026-Mar-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01380-7
PMID:41888349
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研究论文 | 利用两个大型欧洲前瞻性队列数据进行孟德尔随机化分析,评估原发肿瘤与继发性恶性肿瘤之间的因果关系 | 首次系统验证原发肿瘤与继发性恶性肿瘤的因果关系,并使用单细胞测序分析揭示PLK1癌症干细胞可能是驱动因素 | 研究仅基于欧洲人群,可能限制结果的普遍性;此外,因果关系的机制尚未完全阐明 | 评估原发肿瘤与继发性恶性肿瘤之间的因果关联,为癌症幸存者的随访策略优化提供证据 | 来自UK Biobank(31种癌症类型)和FinnGen(28种癌症类型)的欧洲人群数据 | 机器学习 | 胃癌,食管癌,直肠癌 | NGS,单细胞测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据,临床数据 | 两个队列包含31种和28种癌症类型,具体样本量未详细说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6198 | 2026-05-23 |
HarveST uses a heterogeneous graph learning framework to reveal spatial transcriptomics patterns
2026-Mar-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09841-2
PMID:41896336
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研究论文 | 提出了一个基于异构图的框架HarveST,用于整合空间、转录组和基因-基因相互作用数据,以识别空间域和标记基因 | 首次将异构图学习框架应用于空间转录组学,结合自监督学习和部分监督细化双重训练策略,并引入随机游走重启算法识别空间域特异性的空间可变基因 | 暂未在标题和摘要中提及具体限制 | 开发一种能够精确识别空间域和标记基因的计算方法,以解决空间转录组学中的主要挑战 | 人类皮层组织、小鼠嗅球及肿瘤微环境中的空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 异构图学习框架 | 空间转录组数据 | 涵盖人类皮层组织、小鼠嗅球和肿瘤微环境样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6199 | 2026-05-23 |
AI-driven body composition atlas reveals its association with NSCLC immunotherapy outcome and molecular background: a multicenter study
2026-Mar-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01382-5
PMID:41896593
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研究论文 | 本研究通过整合八个独立队列,利用深度学习算法从CT图像中自动提取92项身体成分参数,揭示了其与非小细胞肺癌免疫治疗结局及分子背景的关联 | 首次全面分析多维身体成分与NSCLC免疫治疗结局的关联,并揭示性别差异和不同脂肪分布区域对免疫微环境的影响 | 未明确指出具体局限性 | 探究多维身体成分与NSCLC免疫治疗预后及分子机制的关联 | 非小细胞肺癌患者 | 计算机视觉 | 肺癌 | 深度学习、RNA-seq、单细胞RNA-seq | 深度学习算法 | CT影像 | 2,132例非小细胞肺癌患者(8个独立队列) | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 6200 | 2026-05-23 |
CD8+ T cells sustain vaccination-induced immunity against dissemination of contained tuberculosis in immunosuppressed hosts
2026-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70911-4
PMID:41876499
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研究论文 | 在免疫抑制宿主中,CD8+ T细胞维持疫苗接种诱导的免疫反应,阻止结核分枝杆菌从局限的淋巴感染中扩散 | 首次揭示在CD4 T细胞缺失的情况下,CD8 T细胞能介导BCG疫苗接种诱导的保护作用,阻止结核分枝杆菌的扩散,并利用多参数成像、空间转录组和网络分析阐明了免疫抑制下非CD4免疫细胞的重定位机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体验证;B细胞在CD4 T细胞缺失时对遏制结核的作用虽被排除,但其他免疫细胞类型的作用仍需进一步探索 | 探究在免疫抑制条件下维持潜伏结核感染(LTBI)遏制状态的免疫学相关因素 | 小鼠模型中局限的淋巴结核分枝杆菌感染及其在免疫抑制下的扩散 | 机器学习 | 结核病 | 空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 使用小鼠模型,包括免疫细胞缺陷小鼠、细胞耗竭和过继转移实验,具体样本数量未明确 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间基因表达平台 |