单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202601-202612] [清除筛选条件]
当前共找到 1772 篇文献,本页显示第 601 - 620 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
601 2026-02-03
DUSP22 dephosphorylates LGALS1 to enhance T cell-driven antitumor immunity
2026-Jan-28, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过全基因组筛选发现DUSP22通过去磷酸化LGALS1增强CD8+ T细胞浸润,提出了一种克服乳腺癌免疫检查点阻断耐药的新治疗策略 揭示了DUSP22-LGALS1这一新的磷酸化依赖性轴在重编程免疫抑制肿瘤微环境中的作用,并证明了靶向该轴可增强抗PD-1疗法的抗肿瘤反应 研究主要基于小鼠乳腺癌模型和人类样本分析,临床前模型的转化潜力需进一步验证 识别肿瘤细胞内在的T细胞浸润调控因子并阐明其作用机制,以改善癌症免疫治疗效果 小鼠乳腺癌模型、人类乳腺癌样本、CD8+ T细胞 癌症免疫学 乳腺癌 Sleeping Beauty转座子诱变筛选、质谱分析、共免疫沉淀、RT-qPCR、Western blotting、流式细胞术、免疫组织化学、多重免疫组化、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、生物信息学分析、磷酸模拟突变实验、体外T细胞跨内皮迁移实验 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、测序数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA NA
602 2026-02-03
Ligand-receptor hotspots in dendritic-T cell niches expose targets in autoimmunity
2026-Jan-28, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,识别了与自身免疫性皮肤炎症相关的树突状细胞-T细胞(DC-T)通讯介质,并突出了F11R作为疾病严重程度的潜在靶点 开发了一个空间框架来识别免疫通讯介质,首次将F11R的空间富集与自身免疫性皮肤炎症的严重程度联系起来,揭示了局部免疫放大的机制 研究主要基于转录组数据,功能验证有限;样本可能未覆盖所有疾病亚型;未在体内模型中验证F11R的靶向效果 识别与自身免疫性皮肤炎症相关的DC-T通讯新兴介质,并探索其临床意义 特应性皮炎(AD)和银屑病(PsO)患者的皮肤样本,以及关节炎形式的疾病样本 空间转录组学 自身免疫性皮肤炎症(包括银屑病和特应性皮炎) 空间转录组学,单细胞RNA测序(scRNA-seq),CITE-seq NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,CITE-seq数据 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA测序,CITE-seq NA NA
603 2026-02-03
MICALL2 promotes angiogenesis of colorectal cancer by regulating the EGFR/PI3K/AKT/KLF5/VEGFA axis
2026-Jan-28, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验发现MICALL2通过调控EGFR/PI3K/AKT/KLF5/VEGFA轴促进结直肠癌的血管生成 首次揭示MICALL2在结直肠癌血管生成中的关键作用及其通过稳定EGFR激活PI3K/AKT通路的新机制 未在人体临床试验中验证MICALL2靶向治疗的有效性,且未探讨MICALL2在其他癌症类型中的普遍性 探索结直肠癌血管生成的新机制和潜在治疗靶点 结直肠癌细胞、人脐静脉内皮细胞(HUVECs)、鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)模型和异种移植模型 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、免疫组织化学、体外功能实验、体内动物模型 NA 单细胞RNA测序数据、基因表达数据、图像数据 未明确具体样本数量,涉及结直肠癌细胞系、HUVECs、CAM模型和异种移植模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
604 2026-02-03
PM2.5 impairs gliovascular coupling via endothelial AHR-mitochondrial signaling in mice
2026-Jan-27, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1
研究论文 本研究揭示了PM2.5通过内皮细胞AHR-线粒体信号通路损害小鼠脑血管耦合的机制 首次将内皮细胞AHR确定为PM2.5的关键传感器,并阐明其通过线粒体应激和Parkin依赖性线粒体自噬导致脑血管功能障碍的系统性机制 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需进一步验证;慢性暴露的长期效应未完全阐明 探究PM2.5导致神经血管功能障碍的细胞机制 小鼠脑血管内皮细胞、星形胶质细胞及海马体等脑区 神经科学 神经退行性疾病 空间转录组学、高分辨率成像、体外实验 NA 空间转录组数据、成像数据、体外实验数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
605 2026-02-03
Multi-omics prediction of key proteases regulating scar formation and neural repair after spinal cord injury
2026-Jan-27, Neural regeneration research IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞测序和bulk RNA测序数据,识别了脊髓损伤后调控疤痕形成和神经修复的关键蛋白酶及其作用机制 首次结合多组学数据(单细胞测序与bulk RNA测序)系统识别脊髓损伤后关键蛋白酶,并通过体内外实验验证了选择性抑制关键蛋白酶(如Mmp12和Adam17)可减轻轴突脱髓鞘和纤维疤痕形成,为脊髓损伤治疗提供了新的治疗靶点 研究主要基于小鼠模型,其在人类中的转化应用仍需进一步验证;蛋白酶抑制剂的长期安全性和特异性有待评估 识别调控脊髓损伤后疤痕形成和神经修复的关键蛋白酶及其作用机制,并探索其作为治疗靶点的潜力 脊髓损伤小鼠模型、巨噬细胞、成纤维细胞、单核细胞等免疫与基质细胞 计算生物学与生物信息学 脊髓损伤 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 基因集变异分析, LASSO回归, 随机森林, 加权基因共表达网络分析, 分子对接, 体内外实验 LASSO回归, 随机森林, 机器学习算法 基因表达数据(单细胞与bulk RNA-seq) NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
606 2026-02-03
Macrophage membrane-biomimetic DNA nanocages deliver taurine to reprogram trained immunity for periodontitis therapy
2026-Jan-26, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1
研究论文 本研究开发了一种基于DNA纳米笼递送牛磺酸的仿生系统,用于通过重编程训练免疫来治疗牙周炎 开发了伪装有M2极化及训练免疫抑制性巨噬细胞混合细胞膜的DNA纳米笼,用于靶向单核细胞递送牛磺酸,以精确纠正失调的训练免疫状态 牛磺酸口服生物利用度低且缺乏靶向特异性的问题通过纳米递送系统得到解决,但临床前及临床疗效仍需进一步验证 开发一种针对慢性牙周炎的新型精准免疫治疗策略 牙周炎患者的外周血单个核细胞、单核细胞、巨噬细胞及牙周膜细胞 NA 牙周炎 单细胞测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
607 2026-02-03
BMP6 as a therapeutic target for preeclampsia: enhancing trophoblast invasion and vascular mimicry
2026-Jan-23, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 本研究探讨了BMP6通过ID1介导的SERPINE2和PlGF上调促进滋养层细胞侵袭和血管拟态,并发现早期补充BMP6可缓解大鼠子痫前期模型的相关表型 揭示了BMP6通过ID1-SERPINE2/PlGF轴调控滋养层细胞侵袭的新机制,并首次在体内模型中证明早期补充BMP6对子痫前期具有治疗潜力 研究主要基于体外细胞模型和啮齿动物模型,在人类妊娠早期的直接证据尚不充分 阐明BMP6在滋养层细胞侵袭和血管拟态中的调控机制,评估其作为子痫前期治疗靶点的潜力 人原代滋养层细胞、HTR8/SVneo细胞系、子痫前期患者胎盘组织、Ad Flt1诱导的子痫前期大鼠模型 生殖医学与发育生物学 子痫前期 RNA-seq, scRNA-seq, 腺病毒载体技术 NA 基因表达数据、蛋白质数据、生理表型数据 未明确样本数量,包含人类胎盘组织和大鼠模型 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
608 2026-02-03
Decoding metabolic reprogramming heterogeneity across bladder cancer stages using single-cell and spatial multi-omics approaches
2026-Jan-21, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1
研究论文 本研究利用单细胞和空间多组学方法解码膀胱癌不同阶段的代谢重编程异质性 首次结合单细胞测序、空间转录组和批量RNA测序数据,系统分析膀胱癌不同阶段代谢重编程异质性,并识别出核黄素代谢通路中的关键预后生物标志物 研究主要基于现有测序数据,实验验证部分相对有限,且样本量可能不足以覆盖所有膀胱癌亚型 分析膀胱癌不同阶段的代谢重编程及其对患者生存的影响 膀胱癌患者的上皮细胞及其亚群 数字病理学 膀胱癌 单细胞测序, 空间转录组测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化, 共定位分析 NA 单细胞测序数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
609 2026-02-03
Tumor-stroma contributes to immunotherapeutic resistance in non-small cell lung cancer via SEMA3C-mediated immunosuppressive tumor microenvironment
2026-Jan-19, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究探讨了肿瘤基质比例(TSP)在非小细胞肺癌(NSCLC)中作为免疫检查点阻断(ICB)耐药性独立预后生物标志物的作用,并揭示了SEMA3C通过促进免疫抑制性肿瘤微环境介导此过程的分子机制 首次将TSP与NSCLC的ICB耐药性联系起来,并鉴定出SEMA3C作为TSP轴中的关键介质,通过调节癌症相关成纤维细胞功能来重塑免疫抑制性肿瘤微环境 研究主要基于TCGA队列和体外实验,需要更多独立队列和体内模型验证TSP和SEMA3C的临床转化价值 阐明TSP影响NSCLC临床结局和ICB耐药性的分子机制 非小细胞肺癌患者样本、癌症相关成纤维细胞、肿瘤细胞、CD8⁺ T细胞 数字病理学 肺癌 H&E染色、转录组分析、单细胞RNA测序、功能验证实验 NA 图像数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 TCGA-NSCLC队列患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
610 2026-02-03
Integrated multi-omics analysis of prognostic model and immune microenvironment in intrahepatic cholangiocarcinoma
2026-Jan-19, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA-seq和空间转录组学数据,构建了肝内胆管癌的五基因预后模型,并揭示了免疫抑制性肿瘤微环境中的关键作用机制 首次整合单细胞RNA-seq、空间转录组学和机器学习方法,系统解析肝内胆管癌的免疫微环境并构建五基因预后模型,同时通过功能实验验证了MT1X的促癌作用 研究样本量有限,需要更大规模的外部验证;空间转录组学数据分辨率可能不足;功能实验主要在细胞水平进行,缺乏动物模型验证 阐明肝内胆管癌的免疫微环境特征并构建精准预后模型,为免疫治疗提供新靶点 肝内胆管癌患者组织样本及肿瘤微环境中的细胞亚群 数字病理学 肝内胆管癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 机器学习模型 单细胞RNA-seq数据, 空间转录组数据, 批量RNA-seq数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
611 2026-02-03
Silencing CCL5 suppresses ferroptosis to alleviate calcific aortic valve disease through chemokine pathway inhibition
2026-Jan-16, Atherosclerosis IF:4.9Q1
研究论文 本研究探讨了CCL5通过激活趋化因子信号通路诱导铁死亡,从而促进钙化性主动脉瓣疾病进展的机制 首次揭示了CCL5在CAVD中通过趋化因子信号通路调控铁死亡的作用机制 研究主要基于细胞和动物模型,缺乏临床样本的直接验证 探究CCL5在钙化性主动脉瓣疾病进展中的调控功能及机制 人主动脉瓣间质细胞、Apoe-/-小鼠 生物信息学 心血管疾病 单细胞RNA测序、生物信息学分析、酶联免疫吸附测定、Western blot NA RNA测序数据、病理染色图像、蛋白质印迹数据 未明确样本数量,涉及人主动脉瓣间质细胞和Apoe-/-小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
612 2026-02-03
Soluble guanylate cyclase deficiency drives retinal ganglion cell neurodegeneration with age in female mice through disrupted oxidative metabolism
2026-Jan-09, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究探讨了可溶性鸟苷酸环化酶(sGC)缺陷如何通过破坏氧化代谢导致雌性小鼠视网膜神经节细胞随年龄增长而退化 揭示了cGMP信号在维持视网膜代谢完整性和视网膜神经节细胞功能中的性别特异性作用,并首次将sGC-cGMP信号通路与雌性年龄相关视网膜神经退行性变联系起来 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且机制细节仍需进一步探索 探究sGC在年龄和性别依赖性视网膜神经节细胞功能中的作用及其与神经退行性疾病的关联 缺乏sGCα1催化亚基的雌性和雄性小鼠的视网膜神经节细胞 神经科学 青光眼 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, Western blotting, 线粒体超微结构分析, 视觉敏锐度测量, 视网膜氧化代谢体内测量 NA RNA测序数据, 蛋白质印迹数据, 超微结构图像, 生理测量数据 雌性和雄性sGCα1缺陷小鼠 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
613 2026-02-03
scXDR: drug response prediction across single-cell datasets via heterogeneous network transfer learning
2026-Jan-08, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究提出了一种名为scXDR的异质网络迁移学习模型,用于跨单细胞数据集的药物反应预测 通过异质网络整合药物、基因和细胞间的特征与关联,进行消息传递、特征与结构对齐、结构重建和药物-细胞评分预测,避免了传统方法依赖批量RNA测序与单细胞RNA测序数据整合的局限性 未明确提及模型在处理大规模数据集时的计算效率或对罕见细胞类型的预测能力 提高单细胞水平药物反应预测的准确性,为药物开发和精准治疗提供指导 药物、基因、细胞(包括个体细胞和细胞群) 机器学习 黑色素瘤 单细胞RNA测序 异质网络迁移学习模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
614 2026-02-03
Evaluating genetic ancestry inference from single-cell transcriptomic datasets
2026-Jan-08, HGG advances
研究论文 本文提出一个评估从单细胞转录组数据推断遗传祖先方法的框架,并应用于人类细胞图谱数据集 首次系统评估单细胞转录组数据中遗传祖先推断方法的准确性,并揭示了现有数据集中祖先代表性不平衡的问题 仅评估了10个数据集中的401名供体,样本多样性可能有限;未考虑不同测序深度对变异检测的影响 评估单细胞转录组数据中遗传祖先推断方法的准确性,促进遗传多样性在单细胞研究中的代表性 单细胞转录组数据集中的遗传多态性 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 ADMIXTURE等群体遗传学工具 单细胞转录组测序数据 来自10个人类细胞图谱数据集的401名供体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
615 2026-02-03
PAX6 Deficiency Compromises the Ability of Limbal Epithelial Stem Cells to Properly Differentiate Into Mature Corneal Epithelial Cells
2026-Jan-05, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了PAX6缺陷小鼠角膜/缘组织的转录组变化,揭示了PAX6缺乏导致缘上皮干细胞功能异常和角膜上皮细胞分化缺陷的分子机制 首次在单细胞分辨率下应用scRNA-seq技术,系统性地揭示了PAX6缺乏如何影响缘上皮干细胞向成熟角膜上皮细胞的分化过程,并识别了特定的细胞簇变化 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类患者样本,且样本量相对较小,可能限制了结果的普适性 探究PAX6缺乏在无虹膜相关角膜病变(AAK)中导致缘上皮干细胞功能异常的分子机制 野生型和PAX6杂合(Pax6 het)小鼠的角膜/缘组织 单细胞转录组学 无虹膜相关角膜病变 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫染色 NA 单细胞转录组数据,图像数据 野生型和PAX6杂合小鼠的角膜/缘组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
616 2026-02-03
Type I interferon drives dysfunction of a distinct CD8+ HLA-DRB1+ T cell subset in systemic lupus erythematosus
2026-Jan-03, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究全面表征了系统性红斑狼疮中一个独特的CD8+ HLA-DRB1+ T细胞亚群,揭示了I型干扰素如何驱动其功能失调状态 首次全面表征了SLE中一个独特的CD8+ HLA-DRB1+ T细胞亚群,揭示了I型干扰素通过促进耗竭和损害脱颗粒来驱动其功能失调的机制 研究主要基于外周血样本,对肾脏浸润细胞的验证依赖于现有数据集分析 旨在全面表征系统性红斑狼疮中CD8+ HLA-DRB1+ T细胞的功能和分子特征 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的外周血CD8+ T细胞 免疫学 系统性红斑狼疮 流式细胞术、单细胞RNA测序、TCR测序 NA 单细胞转录组数据、TCR序列数据、流式细胞数据 SLE患者和健康对照者的外周血CD8+ T细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
617 2026-02-03
Potential Key Genes for Giant Cell Arteritis Revealed Based on Single-Cell Sequencing and Mendelian Randomization Analysis
2026, International archives of allergy and immunology IF:2.5Q3
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序、表达数量性状位点和全基因组关联研究数据,采用双样本孟德尔随机化方法,识别了与巨细胞动脉炎风险降低相关的三个关键基因RCAN3、RPS6和HLA-DQB1 首次结合单细胞RNA测序数据和孟德尔随机化分析来探索巨细胞动脉炎的致病基因,并通过共定位分析验证了基因与疾病之间的因果关系 未在文中明确说明样本量或数据来源的具体限制,且研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 识别与巨细胞动脉炎相关的关键基因并探索其潜在致病机制 CD4+ T细胞中的标志基因与巨细胞动脉炎之间的因果关系 生物信息学 巨细胞动脉炎 单细胞RNA测序, 表达数量性状位点分析, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化, 共定位分析 孟德尔随机化模型 基因表达数据, 遗传变异数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
618 2026-02-03
Tissue-resident macrophage and dendritic cells drive type I IFN immunity to enteroviruses in the liver
2026-Jan, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 本研究通过结合表达人FcRn的小鼠模型和单细胞RNA测序,揭示了肝脏中库普弗细胞和树突状细胞亚群是驱动早期I型干扰素应答以抵抗艾柯病毒感染的关键先天免疫细胞 首次明确了在艾柯病毒肝脏感染中,库普弗细胞和特定树突状细胞亚群是启动早期I型干扰素应答的主要细胞来源,并证明肝细胞的保护依赖于这些免疫细胞产生的干扰素信号 研究主要基于小鼠模型,其免疫反应与人类可能存在差异;未详细探讨III型干扰素在保护中的具体作用机制 阐明在艾柯病毒肝脏感染中,负责启动抗病毒I型干扰素应答的特定先天免疫细胞类型及其保护机制 表达人FcRn的转基因小鼠、Ifnar1/Ifnlr1基因敲除小鼠、肝细胞条件性Ifnar1敲除小鼠及肝脏中的各类细胞(肝细胞、库普弗细胞、树突状细胞等) 免疫学 病毒感染(艾柯病毒) 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、条件性基因敲除小鼠模型、体内感染模型 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及多种基因工程小鼠品系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
619 2026-02-02
A single cell transcriptomics-based analysis provides mechanistic insights into the chronic low-concentration effects on hematopoietic disruption in zebrafish(Danio rerio) by Antinomy
2026-Mar-01, Chemico-biological interactions IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了低浓度锑暴露对斑马鱼造血功能的慢性影响及其机制 首次利用单细胞RNA测序技术系统解析低浓度锑暴露下斑马鱼造血细胞群体的变化,并阐明IL-17通路介导的炎症反应在锑毒性中的作用 研究仅基于斑马鱼模型,结果外推至哺乳动物或人类需谨慎;未探讨长期暴露后的恢复潜力 探究低浓度锑暴露对造血功能的慢性毒性效应及分子机制 斑马鱼(Danio rerio) 单细胞组学 造血功能障碍 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 斑马鱼暴露于0、5、50、500和5000 μg/L锑浓度28天 NA 单细胞RNA-seq NA NA
620 2026-02-02
Single-cell sequencing: accurate disease detection
2026-Feb, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
综述 本文综述了单细胞测序技术在疾病检测中的应用,特别是在神经系统疾病早期诊断中的潜力 突破了传统测序的局限,能在单细胞水平分析基因组和转录组,清晰展示细胞间异质性 面临数据处理复杂和检测成本高的挑战 探讨单细胞测序技术如何实现疾病的早期和准确检测 神经系统疾病中的神经细胞 数字病理学 神经系统疾病 单细胞测序 NA 基因组数据、转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部