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当前共找到 9441 篇文献，本页显示第 6161 - 6180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6161 | 2026-05-27 |
Charting spatial ligand-target activity using Renoir
2026-05-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72388-7
PMID:42086556
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研究论文 | 提出Renoir方法，用于在空间转录组数据中绘制配体-靶基因活性图谱，揭示组织微环境中的细胞间通讯 | 首次实现空间拓扑上配体-靶基因活性映射，能解析特定空间生态位中的配体-下游靶标关系，并识别具有不同配体-靶标相互作用的细胞生态位 | 未提及具体局限性 | 开发一种方法以在空间转录组数据中推断配体对下游靶基因的影响，并识别特定空间生态位中的细胞间相互作用 | 发育到疾病状态的各种空间转录组数据集，包括胎儿肝脏和肝细胞癌组织 | 计算机视觉, 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | 多个空间转录组数据集，涵盖不同分辨率和发育阶段至疾病状态 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6162 | 2026-05-27 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify immune-stromal interactions in cardiac allograft vasculopathy
2026-May, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-026-00813-7
PMID:42151633
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学整合分析，鉴定心脏同种异体移植血管病变（CAV）中免疫-基质细胞相互作用 | 首次在人体冠状动脉中结合单细胞RNA测序和空间转录组学，全面刻画CAV新内膜微环境，并发现IFN信号作为潜在治疗靶点 | 未提及具体局限性 | 阐明心脏同种异体移植血管病变（CAV）的关键细胞和分子机制 | 人体冠状动脉组织和CAV小鼠模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 包括CAV、动脉粥样硬化性冠状动脉疾病和非疾病对照的人体冠状动脉组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 单细胞RNA测序和空间转录组学平台，用于分析人体冠状动脉组织 |
| 6163 | 2026-05-27 |
Single-cell transcriptomics reveals lateral transfers of multiple functional genes from prokaryotes to free-living ciliated protists in detrital food webs
2026-May, Marine life science & technology
IF:5.8Q1
DOI:10.1007/s42995-026-00382-5
PMID:42186547
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了自由生活的原生生物在碎屑食物网中通过水平基因转移从原核生物获取多个功能性基因的机制 | 首次在自由生活的厌氧纤毛虫APM类群中基于单细胞转录组进行全基因组水平基因转移筛选，发现63个候选原核水平转移基因，其中多个形成降解复杂有机物的互联通路，并首次记录CPR细菌到真核生物的水平转移事件 | 研究基于有限的数据集（9种APM纤毛虫的36个组学数据集），且候选基因的功能预测主要依赖生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索侧向基因转移在自由生活的原生生物厌氧环境适应中的进化意义和生态角色 | 9种土壤/沉积物中的APM纤毛虫（包括Armophorea、Muranotrichea和Parablepharismea类群） | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 文本 | 36个组学数据集，涵盖9种APM纤毛虫 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6164 | 2026-05-27 |
A single-cell and spatial transcriptomic atlas of human tuberculous constrictive pericardium
2026-Apr, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106233
PMID:41875497
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研究论文 | 对人类结核性缩窄性心包炎进行了单细胞和空间转录组图谱分析 | 首次构建了结核性缩窄性心包炎的人体心包单细胞和空间转录组图谱，揭示了与肉芽肿形成、血管重塑和纤维化激活相关的异质性转录程序，并识别了MMP9+巨噬细胞、CCL19+成纤维细胞和S100A4+内皮细胞等关键细胞类型及其空间组织 | 样本量有限（6例患者和3例正常对照），可能无法完全代表疾病异质性；仅通过观察性分析提出细胞间相互作用，功能性验证尚需进一步研究 | 阐明结核性缩窄性心包炎中肉芽肿性炎症与心包纤维化之间的细胞结构和细胞间信号回路 | 手术切除的结核性缩窄性心包炎患者和正常对照的心包组织 | 数字病理学 | 结核病、心血管疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 6例结核性缩窄性心包炎患者和3例正常对照的81,634个细胞 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 6165 | 2026-04-12 |
Spatial Transcriptomics of the Cyst Microenvironment in an Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease Model
2026-Apr-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000001050
PMID:41920711
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6166 | 2026-05-27 |
Gsx2 regulates oligodendrocyte precursor formation in the zebrafish spinal cord
2026-03, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2026.01.001
PMID:41491310
|
研究论文 | 利用斑马鱼模型研究Gsx2基因通过单细胞多组学数据调控脊髓少突胶质前体细胞形成的作用机制 | 首次在斑马鱼脊髓中发现Gsx2在少突胶质前体细胞前体（pre-OPCs）中特异性表达，并通过基因敲除实验证明其调控OPC形成的时间窗口 | 仅基于斑马鱼模型验证，未在哺乳动物系统中进行功能验证；结论准确性和物种间保守性有待进一步确认 | 阐明神经前体细胞向少突胶质细胞谱系特化的分子调控机制，尤其关注Gsx2基因的功能 | 斑马鱼脊髓中的神经前体细胞（NPCs）及少突胶质前体细胞（OPCs） | 生物信息学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, 单细胞多组学 | NA | 基因组编辑数据, 单细胞转录组数据, 单核表观组数据 | 斑马鱼gsx2纯合突变体胚胎及对照胚胎（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 6167 | 2026-05-27 |
Uncovering causal relationships in single-cell omic studies with causarray
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag175
PMID:41985059
|
研究论文 | 提出causarray框架，用于在单细胞组学研究中通过伪批量与单细胞水平分析揭示因果关系 | 首次在单细胞组学数据中整合未测量混杂因素的广义调整方法与半参数推断，结合灵活机器学习技术以稳健估计处理效应 | 未在更多不同类型单细胞数据集或更大规模队列中验证方法的泛化能力 | 开发能有效消除选择偏倚和未测量混杂效应，从而在单细胞观察性数据中准确推断因果关系的计算框架 | 自闭症风险基因的小鼠胚胎脑内Perturb-seq数据集，以及阿尔茨海默病的人类脑转录组病例对照数据集 | 机器学习 | 阿尔茨海默病，自闭症 | 单细胞测序，CRISPR，Perturb-seq | 半参数模型，机器学习 | 单细胞转录组数据 | 两个单细胞基因组研究：小鼠胚胎脑Perturb-seq数据集和三个阿尔茨海默病人类脑转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6168 | 2026-05-27 |
The differentiation and function of heterogeneous thymic dendritic cell subsets require signals provided by distinct thymocyte cell types
2026-Feb, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02371-9
PMID:41507389
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和功能分析，鉴定七种胸腺常规树突状细胞亚群及其与胸腺细胞亚群的相互作用机制 | 首次全面鉴定七种胸腺常规树突状细胞亚群，并阐明CD4SP和CD8SP胸腺细胞亚群对cDC1和cDC2/pDC的差异化支持机制 | 未提及具体限制，可能包括样本量有限或未能完全模拟人类胸腺环境 | 探究胸腺树突状细胞亚群的异质性和功能分化机制 | 小鼠胸腺树突状细胞和胸腺细胞 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 小鼠胸腺样品，具体数量未提及 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 6169 | 2026-05-27 |
Immunometabolic reprogramming of macrophages: Emerging roles in skeletal muscle regeneration and therapeutic perspectives
2026-02, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.108109
PMID:41577156
|
综述 | 本文综述了巨噬细胞免疫代谢重编程在骨骼肌再生中的作用，以及在急性和慢性疾病中的治疗潜力 | 首次系统总结了单细胞和空间转录组学揭示的骨骼肌巨噬细胞异质性，并强调免疫代谢重编程作为巨噬细胞可塑性的关键驱动力 | 讨论了将免疫代谢重编程转化为肌肉萎缩疾病有效干预措施的主要挑战和未来方向 | 总结巨噬细胞免疫代谢在骨骼肌再生中的调控作用，并探讨通过重编程巨噬细胞代谢促进再生的新兴治疗策略 | 骨骼肌中的巨噬细胞及其免疫代谢过程 | 机器学习 | 肌肉萎缩疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞转录组, 空间转录组 | 10x Chromium, 10x Visium | 单细胞RNA测序, 空间转录组技术 |
| 6170 | 2026-05-27 |
SpaGene: A Deep Adversarial Framework for Spatial Gene Imputation
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0102
PMID:42146899
|
research paper | 提出一种名为 SpaGene 的深度学习框架，用于整合单细胞RNA测序数据和空间转录组数据，以预测空间转录组中缺失的基因表达 | 采用两个编码器-解码器对、两个转换器和两个判别器的对抗框架，有效填补空间转录组数据中的基因表达缺失 | 在受控基因保留评估协议下测试，可能未充分反映真实场景中的噪声和批次效应 | 开发一种方法整合单细胞和空间转录组数据，提高空间基因表达预测的准确性 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 | machine learning | 肺癌 | scRNA-seq， 空间转录组学 | GAN | 基因表达数据 | 多个数据集对，包括肺癌组织样本 | NA | scRNA-seq， spatial transcriptomics | NA | NA |
| 6171 | 2026-05-27 |
Trophoblast Fusion Deficiency in Placenta-Related Pregnancy Disorders
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-22637-2_6
PMID:42168741
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综述 | 本文综述了滋养层细胞融合在胎盘相关妊娠疾病中的缺陷及其分子机制 | 整合了多组学技术（如单细胞和空间转录组学）对滋养层融合的时空动态和分子复杂性进行了深入分析，并系统总结了从转录因子到代谢调控的多个层面的最新发现 | 缺乏能完全再现人类母胎界面结构和功能特征的模型，对翻译后修饰和时空调控机制的理解有限 | 阐明滋养层细胞融合缺陷在胎盘相关妊娠疾病（如子痫前期和胎儿生长受限）中的作用，并探索潜在的诊断和治疗创新 | 滋养层细胞融合过程及其相关分子机制，包括转录因子、融合蛋白、细胞骨架重塑、代谢重编程和免疫调节 | NA | 子痫前期, 胎儿生长受限 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 表观基因组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6172 | 2026-05-27 |
Autoencoder Denoising for Network-Based Spatial Transcriptomics Data with Applications for Cell Signaling Estimation
2026, Complex networks & their applications. International Conference on Complex Networks and Their Applications
DOI:10.1007/978-3-032-16719-4_16
PMID:42181748
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研究论文 | 提出一种基于自编码器的去噪框架，用于从空间转录组学数据中估计细胞信号，并通过网络邻接矩阵去噪和细胞信号估计两个组件进行验证 | 首次将神经网络应用于空间转录组学数据中基于网络的细胞信号估计，并系统比较了自编码器与奇异值分解在不同图模型下的去噪性能 | 未提及 | 开发一种去噪框架以改善从空间转录组学数据中估计细胞信号的准确性 | 空间转录组学数据中的网络邻接矩阵和细胞信号相互作用 | 机器学习 | 不适用 | 空间转录组学 | 自编码器 | 网络数据 | 不适用 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 6173 | 2026-05-27 |
Identification and validation of a seven-gene metastasis-associated prognostic model in breast cancer
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1770418
PMID:42186460
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研究论文 | 基于转移相关差异表达基因构建并验证了乳腺癌七基因预后模型，并发现了新的潜在治疗靶点 | 识别了两个此前未被充分研究的基因（RTN1和TLR10）作为肿瘤进展的潜在新驱动因子，并利用单细胞转录组学揭示了其细胞类型特异性表达模式 | 未在摘要中明确说明局限性 | 构建基于转移和癌症相关差异表达基因的预后特征，并识别潜在的新型治疗基因 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | Cox比例风险模型, LASSO回归 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自TCGA-BRCA、AURORA US Network、SCAN-B和GEO数据库的多组数据集 | 未在摘要中明确提及 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 未在摘要中明确提及 | 未在摘要中明确提及 |
| 6174 | 2026-05-25 |
Integrating tumor and immune cell transcriptomics to predict immune checkpoint inhibitor primary resistance in metastatic melanoma
2026-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2026.2650234
PMID:41913413
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研究论文 | 通过整合肿瘤和免疫细胞转录组学预测转移性黑色素瘤对免疫检查点抑制剂的原发性耐药 | 使用单细胞RNA测序指导的免疫解卷积方法，识别出四种免疫细胞亚群作为耐药预后指标，并构建了82基因转录组特征签名 | 样本量较小（46例发现队列和54例验证队列），且液态活检仅用于8例患者的scRNA-seq分析 | 基于新型基因表达特征预测免疫检查点抑制剂原发性耐药的生物标志物 | 转移性皮肤黑色素瘤患者治疗前的肿瘤微环境转录组和外周血单核细胞 | 机器学习 | 黑色素瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 46例发现队列FFPE RNA-seq样本，54例独立验证队列样本，8例scRNA-seq液态活检样本，46例流式细胞术样本 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |
| 6175 | 2026-05-25 |
Decoding the gut microbiota metabolite-matrix metalloproteinase-3 axis in breast cancer: a multi-omics and network pharmacology study
2026-Jun, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-025-11351-y
PMID:40946247
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研究论文 | 采用多组学整合框架，结合网络药理学、机器学习、SHAP分析和单细胞RNA测序，系统研究肠道菌群代谢产物与基质金属蛋白酶-3（MMP3）在乳腺癌中的相互作用 | 首次整合网络药理学、机器学习与单细胞测序揭示肠道菌群代谢物-MMP3轴在乳腺癌中的作用，发现8种无毒菌群代谢物具有靶向MMP3的治疗潜力 | 结果基于计算分析和数据库验证，尚未进行体外和体内实验验证，缺乏临床样本的直接证据 | 探索肠道菌群代谢产物与乳腺癌相关靶点（尤其是MMP3）的相互作用机制 | 乳腺癌相关的肠道菌群代谢产物及其靶点MMP3 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 网络药理学, 分子对接, 孟德尔随机化 | 机器学习模型（SHAP分析） | 基因表达数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6176 | 2026-05-25 |
Cre-dependent gene expression enables thymic development of autoreactive tumor-associated antigen targeting CAR-T cells
2026-Apr-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.12.047
PMID:41445186
|
研究论文 | 开发了一种通过基因工程造血干细胞在胸腺中持续生成CAR-T细胞的平台，并利用诱导型基因表达克服胸腺负选择 | 首次利用胸腺微环境持续生成CAR-T细胞，并通过诱导型基因表达系统绕过中枢耐受，实现自体更新的CAR-T细胞疗法 | NA | 解决CAR-T细胞体内持久性有限和肿瘤复发问题，开发可持续生成CAR-T细胞的平台 | 造血干细胞和祖细胞、CAR-T细胞、胸腺微环境 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6177 | 2026-05-25 |
AI-guided multi-omics analysis identifies NPC1-modulated susceptibility to SARS-CoV-2 infection under PM2.5 exposure
2026-Mar-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71196-3
PMID:41912520
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研究论文 | 研究利用AI引导的多组学分析，鉴定NPC1调节PM2.5暴露下SARS-CoV-2感染易感性的分子机制 | 首次通过微调的单细胞转录组基础模型整合PM暴露与SARS-CoV-2感染共享转录特征，并结合流行病学、GWAS和功能基因组学揭示NPC1调节的内体-溶酶体通路污染相关易感性机制 | NA | 阐明空气细颗粒物暴露增加SARS-CoV-2感染风险的分子机制 | SARS-CoV-2感染易感性、PM2.5暴露、NPC1基因调控 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、全基因组关联研究、功能基因组学 | 基础模型 | 转录组数据、遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 6178 | 2026-05-25 |
Cardiomyocyte-derived GPX4 stabilizes BNIP3 to facilitate mitophagy and mitigate myocardial ischemia/reperfusion injury
2026-Mar-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71232-2
PMID:41904174
|
研究论文 | 研究发现心肌细胞来源的GPX4通过稳定BNIP3促进线粒体自噬，减轻心肌缺血再灌注损伤 | 首次揭示GPX4通过其U46活性位点增强BNIP3与USP20相互作用，减少BNIP3的K131位泛素化，从而稳定BNIP3并促进线粒体自噬的新机制，将GPX4与铁死亡相关的线粒体损伤联系起来 | 未提及 | 阐明GPX4在心肌缺血再灌注损伤中的效应及分子机制 | 心肌细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞测序 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据, 单细胞测序数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium空间转录组学平台, Illumina NovaSeq测序平台 |
| 6179 | 2026-05-25 |
Single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization during CD4+ T cell activation reveals immune-mediated mechanisms and drug targets for neuropsychiatric disorders
2026-Mar-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09941-z
PMID:41904330
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研究论文 | 结合单细胞转录组学、表达数量性状位点鉴定、孟德尔随机化和共定位分析，识别神经精神疾病在CD4+ T细胞激活过程中的致病基因、通路和药物靶点 | 首次在动态T细胞激活状态下整合单细胞转录组学与孟德尔随机化，发现时间特异性因果模式，并优先考虑RAC1和PARP1等21个潜在药物重定位靶点 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量有限或因果推断的潜在混杂因素 | 阐明CD4+ T细胞激活在阿尔茨海默病和重度抑郁症免疫介导机制中的作用并识别药物靶点 | 阿尔茨海默病和重度抑郁症 | 机器学习 | 阿尔茨海默病, 重度抑郁症 | 单细胞RNA-seq, 表达数量性状位点分析, 孟德尔随机化 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6180 | 2026-05-25 |
The CD4+ T cell population partners with Tpex CD8+ T cells to mediate antitumor immunity in the tumor microenvironment
2026-Mar-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71161-0
PMID:41904165
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和质谱流式分析，发现CD4+ T细胞亚群Th7R与Tpex CD8+ T细胞在肿瘤微环境中协同作用，维持抗肿瘤免疫 | 首次鉴定出IL-7R CCR6+ Th1样CD4+ T细胞亚群（Th7R）作为Tpex的伴侣细胞，阐明其在三级淋巴结构中与Tpex共定位并支持抗肿瘤免疫的新机制 | 部分数据来自肾细胞癌样本，且主要基于肺癌患者，可能限制结论的普适性；小鼠模型为过继转移实验，人类研究为关联性分析，因果验证不足 | 探究肿瘤微环境中CD4+ T细胞如何与Tpex CD8+ T细胞协作以维持抗肿瘤免疫 | 肺癌患者（主要）和肾细胞癌患者的外周血、肿瘤和淋巴结样本 | 机器学习 | 肺癌, 肾细胞癌 | NA | NA | NA | 肺癌和肾细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, 质谱流式 | NA | NA |