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当前共找到 9441 篇文献,本页显示第 6101 - 6120 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
6101 2026-05-29
Single-cell profiling reveals that dynamic lung immune responses distinguish protection from susceptibility to tuberculosis
2026-04, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,揭示肺部免疫反应的动态变化如何区分对结核病的保护性与易感性 首次通过单细胞RNA测序,在多时间点、多小鼠品系和多结核分枝杆菌菌株下,系统比较了初次感染与已受控感染小鼠的肺免疫反应动态差异,发现保护性免疫依赖于免疫激活的时序和协调,而非单一反应的强度 研究中主要使用小鼠模型,结果向人类和灵长类的推广仍需进一步验证;且未深入探讨相关信号通路的分子机制 阐明肺结核保护性免疫的免疫相关因素,特别是时间动态和细胞协调机制 小鼠(未感染和已受控结核分枝杆菌感染的品系)及非人灵长类(静脉注射BCG疫苗后的样本) 数字病理学 结核病 单细胞RNA测序 NA 基因表达谱(单细胞转录组数据) 多个时间点、多个小鼠品系和多个结核分枝杆菌菌株的肺免疫细胞样本,以及非人灵长类样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 平台
6102 2026-05-29
Pulmonary fibroblast activation during Aspergillus fumigatus infection enhances lung defense via immunomodulation and tissue remodeling
2026-03-31, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 研究烟曲霉感染时肺成纤维细胞的激活及其通过免疫调节和组织重塑增强肺防御的机制 首次通过细胞谱系追踪、靶向细胞消融和单细胞RNA测序揭示成纤维细胞在烟曲霉感染中的保护性免疫调节作用 未提及具体局限性 探究烟曲霉引起的肺损伤中成纤维细胞的功能反应及其在宿主防御中的作用 免疫正常和免疫抑制宿主中的肺成纤维细胞 机器学习 肺曲霉病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 免疫正常和免疫抑制小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6103 2026-05-29
Perspectives from machine learning and multi-omics to decoding the effects of VDAC2 malignant subsets on tumor evolution
2026-Mar-31, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 利用机器学习和多组学分析解码VDAC2恶性亚型对肿瘤演化的影响 通过整合批量RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学数据,首次系统揭示了VDAC2在泛癌中的恶性功能及其通过VDAC2-BAK1-IFNγ通路促进肿瘤进展和免疫逃逸的机制 基于公开数据库的分析,缺乏大规模独立临床样本验证,且实验主要在体外细胞模型中进行 系统挖掘VDAC2在泛癌中的作用及其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 VDAC2基因在泛癌中的表达、功能及免疫调控机制 机器学习 泛癌 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、RT-PCR、细胞共培养、CCK-8实验、Transwell侵袭实验、ELISA NA RNA测序数据、空间转录组数据 泛癌数据集,具体样本数量未明确说明 NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
6104 2026-05-29
A spatiotemporal transcriptomic atlas of porcine (Sus scrofa) female early gonadal development
2026-Mar-30, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 利用高分辨率空间转录组技术解析猪雌性早期性腺发育过程中细胞类型及其空间动态 首次应用高分辨率空间转录组技术绘制猪早期性腺发育的时空图谱,阐明了支持细胞谱系中两波颗粒细胞的空间定位及其在生殖细胞发育中的调控作用,并发现BMP信号通路在原始生殖细胞向卵原细胞特化中的关键角色 空间转录组技术无法直接解析单细胞水平的基因表达,可能遗漏部分细胞类型的细微差异 揭示猪雌性早期性腺发育过程中原始生殖细胞向卵原细胞特化和进入减数分裂的时空动态机制 猪(Sus scrofa)雌性早期性腺组织中的原始生殖细胞、体细胞及各种细胞类型 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 猪早期性腺样本(具体数量未在标题和摘要中明确) NA 空间转录组学 NA 高分辨率空间转录组技术(具体平台未在摘要中说明)
6105 2026-05-29
Same-Slide Spatial Multi-Omics Integration with IN-DEPTH Reveals Tumor Virus-Linked Spatial Reorganization of the Tumor Microenvironment
2026-Mar-24, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 提出IN-DEPTH工作流,实现同一玻片上的空间转录组和蛋白质组整合分析,结合SGCC框架揭示肿瘤微环境中的空间重排 开发了IN-DEPTH工作流,可在同一玻片上整合单细胞空间蛋白质组和转录组且无RNA信号丢失;提出SGCC框架用于跨模态整合,解析细胞间功能状态变化 新兴同玻片多组学方法在多重性、空间分辨率、信号保留和整合分析方面仍存在局限 实现空间多组学整合以揭示肿瘤微环境中的临床相关机制,并推动稳健的空间多模态AI模型发展 弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)组织样本 数字病理学 弥漫大B细胞淋巴瘤 空间转录组学、空间蛋白质组学、IN-DEPTH、SGCC NA 图像、空间转录组数据 EBV阳性和EBV阴性肿瘤样本 NA 空间转录组学,空间蛋白质组学 NA NA
6106 2026-05-29
FineST: contrastive learning integrates histology and spatial transcriptomics for nuclei-resolved ligand-receptor analysis
2026-Mar-16, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 FineST通过对比学习整合组织学和空间转录组学数据,实现核分辨率下的配体-受体分析 利用组织学基础模型的深度对比学习,实现核精度的RNA表达插补和细胞间通信分析,在VisiumHD和Xenium数据集上显著优于现有方法 主要聚焦于Visium平台,可能在其他平台上的泛化能力有限;数据稀疏性和分辨率限制在复杂组织中仍存在挑战 开发高分辨率空间转录组学分析方法以揭示细胞间通信模式 结直肠癌VisiumHD和乳腺癌Xenium数据集,以及多种癌症类型的肿瘤-免疫相互作用 计算机视觉, 机器学习, 数字病理学 结直肠癌, 乳腺癌, 鼻咽癌, 肝细胞癌 空间转录组学, 对比学习 对比学习模型 组织学图像, 空间转录组学数据 结直肠癌VisiumHD和乳腺癌Xenium数据集 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium, 10x VisiumHD, 10x Xenium 10x Visium平台用于空间基因表达分析,VisiumHD用于高分辨率数据,Xenium用于乳腺癌原位验证
6107 2026-05-29
BET inhibition blunts antibody production and macrophage-mediated fibrosis to restore lung function in murine cGVHD
2026-03-02, Blood IF:21.0Q1
研究论文 在慢性移植物抗宿主病模型中,BET抑制通过降低抗体产生和巨噬细胞介导的纤维化来恢复肺功能 首次揭示BET蛋白在慢性移植物抗宿主病肺部纤维化中调控抗体产生和巨噬细胞极化的新机制 主要基于小鼠模型,缺乏临床样本验证 研究BET抑制对慢性移植物抗宿主病相关闭塞性细支气管炎综合征的治疗效果和机制 慢性移植物抗宿主病小鼠模型中的免疫细胞(T细胞、B细胞、巨噬细胞)和肺组织 医学研究 移植物抗宿主病,闭塞性细支气管炎综合征 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 慢性移植物抗宿主病小鼠与对照小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6108 2026-05-29
Neuro-epithelial circuits promote sensory convergence and intestinal immunity
2026-03, Nature IF:50.5Q1
研究论文 发现TRPV1疼痛感知伤害感受器与化学感应上皮簇细胞协同,驱动2型炎症和肠道免疫的神经-上皮回路 首次揭示TRPV1伤害感受器通过CGRP信号调控上皮簇细胞增殖分化,形成神经-上皮回路整合感觉输入驱动2型免疫 未明确其他感觉神经元类型在该回路中的作用,且机制验证主要在小鼠模型中完成 阐明神经、上皮和免疫细胞如何协调感知输入以启动2型炎症反应 小鼠肠道中的TRPV1伤害感受器、上皮簇细胞及CGRP神经纤维 机器学习 寄生虫感染相关2型免疫疾病 空间转录组学、单细胞RNA测序、化学遗传学沉默/激活 NA 基因表达数据 小鼠肠道组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'端测序, 10x Visium空间基因表达分析
6109 2026-05-29
Single-cell profiling of HDAC inhibitor-induced EBV lytic heterogeneity defines abortive and refractory states in B lymphoblasts
2026-03, PLoS pathogens IF:5.5Q1
research paper 通过单细胞RNA测序揭示了HDAC抑制剂诱导的EBV溶解裂解异质性,定义了B淋巴母细胞中的流产和难治状态 首次在单细胞水平上解析HDAC抑制剂诱导EBV裂解反应的异质性,发现NF-κB及CD137信号轴在阻止成功裂解再激活中的作用 研究仅限于四种EBV阳性细胞系,且裂解再激活仅在少数细胞中成功,可能未全面反映体内微环境的影响 探讨HDAC抑制剂对EBV阳性恶性肿瘤的裂解再激活机制及宿主因素的作用 EBV阳性细胞系,包括P3HR1-ZHT Burkitt淋巴瘤、Jijoye Burkitt淋巴瘤、IBL-1免疫母细胞淋巴瘤和新生感染衍生的淋巴母细胞系 machine learning Burkitt淋巴瘤、Hodgkin淋巴瘤、鼻咽癌、胃癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 4种EBV阳性细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6110 2026-05-29
A Pan-Cancer Single-Cell Atlas to Evaluate Tumor Identity, Cell Line Concordance, and Dependency Mapping
2026-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞RNA测序构建泛癌图谱,评估肿瘤身份、细胞系一致性和依赖性图谱 开发了一种基于马氏距离的严格整合框架,优先考虑代表性恶性转录状态,构建高质量泛癌单细胞图谱,并利用该图谱推断肿瘤-细胞系一致性和癌症特异性基因依赖性 未在摘要中提及具体限制,如可变数据质量、注释不一致等问题仍可能存在 建立可扩展的泛癌单细胞图谱,用于肿瘤身份推断、癌症细胞系基准测试和系统识别遗传脆弱性 来自499个样本的135,424个高质量恶性细胞,涵盖36种成人和儿童癌症 数字病理学 泛癌(包括成人和儿童癌症) 单细胞RNA测序 ElasticNet 单细胞转录组数据 499个样本,135,424个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 基于马氏距离的批次校正潜在空间选择
6111 2026-05-29
Advances in single-cell transcriptomics: unraveling the pathogenesis of calcific aortic valve disease
2026-02-14, Cardiovascular research IF:10.2Q1
综述 综述了单细胞RNA测序在钙化性主动脉瓣疾病研究中的应用,揭示了细胞异质性、谱系分化和细胞间相互作用 全面总结了单细胞转录组学在CAVD研究中的最新进展,包括瓣膜细胞群体、疾病相关表型转变和分子通路,并探讨了单细胞技术的转化潜力 当前单细胞技术面临的技术挑战和未来发展方向 评估单细胞RNA测序在CAVD研究中的应用现状,为发现新治疗靶点提供依据 钙化性主动脉瓣疾病中的心脏瓣膜细胞 单细胞转录组学 钙化性主动脉瓣疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
6112 2026-05-29
Single-cell atlas of the transcriptome and chromatin accessibility in the human retina
2026-Feb, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 构建了人类视网膜的单细胞转录组和染色质可及性整合图谱 整合了来自125名捐赠者的约390万个细胞,包含已发表和未发表数据,鉴定出130多种细胞类型,并分析了跨细胞类型的转录组、染色质和基因调控网络差异 未明确提及局限性 创建全面的人类视网膜细胞图谱,促进对视网膜功能和病理的理解 人类视网膜细胞 单细胞组学 视网膜疾病 单细胞测序 NA 单细胞转录组和染色质可及性数据 约390万个细胞,来自125名捐赠者 NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq NA NA
6113 2026-05-29
Pharmacovigilance-Based Identification and Mechanistic Exploration of Periodontitis-Related Drugs
2026-01, Journal of clinical periodontology IF:5.8Q1
研究论文 基于药物警戒数据挖掘与单细胞RNA测序分析,识别与牙周炎相关的药物及其潜在分子机制 首次利用大型真实世界FAERS数据库联合四种信号检测算法及逻辑回归,系统识别与牙周炎显著相关的药物,并通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序验证候选基因VEGFA的因果作用及细胞类型特异性表达 因果关系需进一步验证,且数据来源可能受报告偏倚影响 从真实世界数据中识别牙周炎相关药物的潜在风险并探索其分子机制 牙周炎患者及药物相关蛋白靶点 自然语言处理 牙周炎 FAERS数据挖掘、孟德尔随机化、单细胞RNA测序 逻辑回归、信号检测算法 文本(药物不良反应报告)、基因表达数据 FAERS数据库大量报告,UKB-PPP和deCODE队列,牙龈及外周血单细胞RNA测序样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'试剂盒
6114 2026-05-29
Spatial Transcriptomic Assessments of Gene Expression Profiles in Human Peri-Implant Lesions
2026-01, Journal of clinical periodontology IF:5.8Q1
研究论文 通过空间转录组学、RNA测序和免疫组化分析人类种植体周围病变组织的基因表达谱 首次采用空间转录组学技术研究人类种植体周围炎病变的组织特异性基因表达模式,结合RNA测序和免疫组化进行多维度验证 样本量较小(空间转录组学n=4,RNA测序n=20),可能限制发现的广泛适用性 分析种植体周围炎和健康种植体部位人类组织样本的基因表达差异及其生物学通路 人类种植体周围软组织活检样本,包括严重种植体周围炎患者和相邻无炎症对照种植体 数字病理学 种植体周围炎 空间转录组学, RNA-seq, 免疫组化 NA 基因表达数据 空间转录组学4例,RNA测序20例,免疫组化38例 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台
6115 2026-05-29
Advancing lupus nephritis research through multi-omics and predictive modeling
2026 Jan-Dec, Innate immunity IF:2.8Q3
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,结合机器学习模型,揭示狼疮性肾炎的细胞和分子驱动因素 首次通过非负矩阵分解识别免疫元程序,并利用细胞间通讯网络分析,结合399种机器学习预测模型,实现高精度诊断 样本量限制可能影响模型泛化性,分子对接模拟结果仍需实验验证 解析狼疮性肾炎的细胞异质性和分子机制,构建精准诊断模型 狼疮性肾炎患者的肾活检组织及外部验证队列的批量转录组数据 机器学习 狼疮性肾炎 单细胞RNA测序、批量RNA测序、非负矩阵分解、细胞通讯分析、分子对接 机器学习预测模型(399种) 基因表达数据 狼疮性肾炎活检样本(具体数量未说明)及大规模批量RNA测序队列 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
6116 2026-05-29
Nitidine chloride suppresses polo-like kinase 1 via MYCN-associated transcriptional regulation in colorectal cancer: a multi-omics and spatial transcriptomics study
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究结合多组学和空间转录组学,揭示了氯化两面针碱通过MYCN相关转录调控抑制结直肠癌中PLK1的机制 首次通过多组学整合、单细胞和空间转录组学分析,系统阐明氯化两面针碱靶向PLK1并通过MYCN-PLK1轴发挥抗结直肠癌作用 尚未明确PLK1与MYCN之间的直接转录调控关系,以及NC在CRC中的其他潜在靶点 阐明氯化两面针碱在结直肠癌中的分子靶点及其作用机制 结直肠癌组织和细胞系(HCT116),以及异种移植肿瘤模型 数字病理学 结直肠癌 RNA测序、单细胞转录组学、空间转录组学、分子动力学模拟、ChIP-seq、AlphaFold-Multimer对接、RT-qPCR、免疫组化 GROMACS分子动力学模拟、AlphaFold-Multimer 基因表达数据、测序数据、分子结构数据、图像数据 3,513个标本(2,256个肿瘤和1,257个非肿瘤样本) NA 单细胞转录组学、空间转录组学 NA NA
6117 2026-05-29
Identification and preliminary clinical validation of type 2 diabetes signature genes through machine learning analysis of scRNA-seq data
2026, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序和机器学习分析,识别并验证了2型糖尿病的四个关键特征基因 首次将单细胞RNA测序与机器学习(LASSO回归)结合,在单细胞水平上识别2型糖尿病的特征基因,并揭示了Alpha和Beta细胞在糖尿病信号网络中的潜在核心作用 未提及 识别并验证2型糖尿病的关键特征基因,为疾病机制和生物标志物提供新见解 10种不同细胞类型的外周血样本,包括15名2型糖尿病患者和20名对照者 机器学习 2型糖尿病 单细胞RNA测序, qRT-PCR, LASSO回归 LASSO回归 基因表达数据 15名2型糖尿病患者和20名对照者的外周血样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6118 2026-05-29
Cell membrane-coated nanoparticles against non-alcoholic fatty liver disease via regulating endoplasmic reticulum stress
2026, Regenerative biomaterials IF:5.6Q1
研究论文 开发了一种细胞膜包被的纳米颗粒,通过调节内质网应激来治疗非酒精性脂肪性肝病 利用生物信息学分析单细胞RNA测序数据,识别出肝细胞是内质网应激的主要细胞类型,并设计了工程化巨噬细胞膜包被的纳米颗粒,通过GalNAc修饰增强对肝细胞的靶向性,利用褪黑素抑制内质网应激通路及其下游NF-κB信号级联,从而减轻炎症和脂质积累 未提及 开发一种针对非酒精性脂肪性肝病的纳米颗粒治疗策略,通过调节内质网应激来改善疾病进展 非酒精性脂肪性肝病动物模型中的肝细胞 机器学习 非酒精性脂肪性肝病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 动物模型样本(数量未明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
6119 2026-05-28
MDK promotes the mast cell activation and pancreatic fibrosis in mice with chronic pancreatitis via MDK-NCL signaling pathway
2026-Jul-01, Experimental cell research IF:3.3Q2
研究论文 本文通过单细胞RNA测序分析和小鼠模型研究,发现MDK-NCL信号通路促进慢性胰腺炎中胰腺星状细胞与肥大细胞的相互作用及纤维化 首次揭示MDK-NCL配体-受体对在慢性胰腺炎中调控胰腺星状细胞与肥大细胞间的相互作用,并验证其促纤维化和炎症的机制 未提及具体局限性 探究慢性胰腺炎的发病机制,特别是MDK-NCL信号通路在胰腺纤维化和炎症中的作用 人类慢性胰腺炎单细胞RNA测序数据(GSE208536)和二丁基二氯化锡诱导的慢性胰腺炎小鼠模型 机器学习和数字病理学 慢性胰腺炎 单细胞RNA测序、流式细胞术 NA 单细胞转录组数据 人类单细胞RNA测序数据(GSE208536)及小鼠模型样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6120 2026-05-28
Integrating spatial and single-cell transcriptomics via machine learning to characterize efferocytosis in hepatocellular carcinoma prognosis and immunotherapy
2026-Jul, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 通过机器学习整合空间与单细胞转录组学,表征肝癌预后与免疫治疗中的胞葬作用 首次将胞葬作用与肝细胞癌的空间微环境特征相结合,利用机器学习构建胞葬相关评分系统(ERG评分),揭示SPP1+巨噬细胞的空间分布与免疫抑制状态的关系 研究主要基于公开数据集,临床样本验证有限;体外实验仅验证了核心基因TPI1的表达,未进行体内功能验证 探究胞葬作用在肝细胞癌肿瘤微环境中的空间结构特征及对患者预后和免疫治疗的影响 肝细胞癌患者的单细胞RNA测序数据、空间转录组数据和批量转录组数据 机器学习 肝癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量转录组学、qRT-PCR、Western Blot 机器学习算法组合(101种算法) 基因表达数据 未明确提及具体样本量,但整合了多个公开数据集 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 NA NA
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