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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6041 | 2026-05-30 |
Age-associated B cells (ABCs) develop from a CNS-localized progenitor pool into a pro-inflammatory phenotype after stroke
2026-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.02.709112
PMID:41847014
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研究论文 | 该研究鉴定出年龄相关B细胞在卒中后从中枢神经系统局部前体细胞库分化为促炎表型 | 首次发现中枢神经系统内存在独特的B1b前体细胞库,并揭示其向年龄相关B细胞(ABC)转化的轨迹,同时证实小鼠与人类组织中的保守性 | 未明确阐述研究局限性 | 阐明中枢神经系统中B细胞亚群的特征及其在衰老和卒中后的变化 | 老年雄性和雌性小鼠(未损伤和卒中后)的脑部B细胞,以及老年人类脑供体的脑实质组织 | 数字病理学 | 缺血性卒中 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、B细胞受体测序 | NA | NA | 老年小鼠(未损伤和卒中后)及老年人类脑供体组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6042 | 2026-05-30 |
Computational Approaches to Cancer Cell Dormancy: From Detection to Dynamic Modelling
2026-Apr-24, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16050633
PMID:42193984
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综述 | 综述计算方法在癌症细胞休眠研究中的应用,涵盖从检测到动态建模的各个环节 | 将癌症细胞休眠视为动态、多尺度的系统问题,而非静态细胞类型分类任务,并系统梳理了计算方法在推断休眠细胞身份、异质性、微环境调控、状态转换和再激活动力学方面的应用 | 操作定义碎片化、罕见状态检测困难、跨研究不兼容以及使用快照数据研究时间动态过程 | 探讨计算方法如何应用于癌症细胞休眠的检测、特征描述和动态建模,以推动该领域进展 | 癌症细胞休眠现象及其相关计算方法 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组学、谱系追踪、空间分析、多组学整合分析 | NA | 单细胞数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 6043 | 2026-05-30 |
TAF1 Suppresses MHC-I Expression and Correlates with Poor Immunotherapy Response in Small Cell Lung Cancer
2026-Apr-23, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14050973
PMID:42193300
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研究论文 | 通过系统筛选表观遗传调控因子,发现TAF1通过抑制MHC-I表达导致小细胞肺癌免疫治疗效果差 | 首次系统筛选796个表观遗传调控因子,鉴定TAF1为小细胞肺癌免疫治疗抵抗的关键调控因子,揭示了TAF1通过抑制MHC-I表达降低CD8 T细胞浸润的新机制 | 未提及具体限制 | 探究小细胞肺癌对免疫治疗内在抵抗的表观遗传调控机制 | 小细胞肺癌患者肿瘤样本及相关细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 测序数据 | 20例小细胞肺癌肿瘤的scRNA-seq数据,IMpower133队列的bulk RNA-seq数据,TU-SCLC队列的蛋白质组数据,以及一个独立的39例小细胞肺癌肿瘤的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 6044 | 2026-04-18 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies a Pivotal Role of SPHK1+ Macrophage-Driven Inflammation in Mechanism of Aortic Dissection and Highlights SPHK1 as a Therapeutic Target
2026-Apr-16, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-026-02505-7
PMID:41991732
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6045 | 2026-05-30 |
Hexokinase 3 promoted cytokine production of monocytes by targeting metabolic reprogramming and histone lactylation in sepsis
2026-Apr-10, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-026-02129-6
PMID:41964014
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研究论文 | 该文章研究了己糖激酶3(HK3)通过代谢重编程和组蛋白乳酸化促进脓毒症中单核细胞的细胞因子产生 | 首次发现HK3作为代谢检查点在脓毒症中通过H3K18乳酸化依赖性激活IL-6和TNF-α基因,驱动单核细胞过度炎症反应,并确定HK3为潜在的诊断标志物和治疗靶点 | 未提供具体局限性信息 | 阐明脓毒症中糖酵解相关调控基因在单核细胞免疫反应中的作用机制 | 脓毒症患者的外周血单核细胞及LPS诱导的单核细胞脓毒症模型 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序、ROC曲线分析、免疫细胞浸润分析 | NA | 基因表达数据 | 使用GEO数据库数据集,具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6046 | 2026-05-30 |
Splicing variants in MYRF cause partial loss of function in the retinal pigment epithelium leading to nanophthalmos
2026-Mar-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.194681
PMID:41746734
|
研究论文 | 研究揭示了MYRF基因的剪接变异体导致视网膜色素上皮细胞部分功能丧失,从而引发纳米眼 | 首次证明MYRF基因的C末端剪接变异体(如dG-MYRF)是功能减退等位基因,并解释了为何此类变异导致孤立性纳米眼而非综合征性疾病 | 未提及 | 探究MYRF基因C末端变异导致孤立性纳米眼与完全功能丧失变异导致综合征疾病的差异机制 | MYRF基因C末端剪接变异体(dG-MYRF, p.Gly1126fs30*, c.3376-1G>A)及两个产生非功能性亚型的MYRF剪接变异体 | 分子生物学 | 纳米眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人源化MYRF C末端小鼠模型(MyrfhumdG/humdG胚胎致死,MyrfhumWT/humWT存活)及KO RxCre;Myrffl/fl小鼠(E15.5和P0) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6047 | 2026-05-30 |
A single-nucleus and spatial transcriptomic atlas of poplar leaves reveals the regulation of leaf polarity and cuticle deposition
2026-Mar-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.03.015
PMID:41866110
|
研究论文 | 通过单核和空间转录组学构建杨树叶片的细胞图谱,揭示叶面极性及角质层沉积的调控机制 | 首次整合单核和空间转录组学解析杨树叶片近轴-远轴极性,发现MYC2作为角质层生物合成的关键调控因子,结合脂质合成和转运基因启动子并促进角质层增厚 | 研究主要基于杨树叶片,需验证MYC2在其他植物中的保守性及其在非生物胁迫中的具体功能 | 探究叶片近轴-远轴极性建立过程中转录组和代谢组的空间调控网络 | 杨树叶片细胞类群(叶肉细胞、表皮细胞、维管相关细胞)及其近轴-远轴亚型 | 数字病理学 | 不适用 | 单核RNA测序(snRNA-seq)、空间转录组学 | 不适用 | 基因表达数据、空间位置数据 | 杨树叶片样本 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单核RNA测序平台, 10x Visium空间转录组平台 |
| 6048 | 2026-05-30 |
Modeling cell-cell interactions to advance drug discovery in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.29.702646
PMID:41676623
|
研究论文 | 利用支架共培养类器官模型研究特发性肺纤维化中细胞间相互作用,并评估抗纤维化药物疗效 | 开发了一种基于支架的人源共培养肺泡类器官模型,结合IPF患者原代成纤维细胞和携带SFTPC 173T突变的多能干细胞衍生肺泡2型细胞,模拟疾病进展中的上皮-间质细胞通讯 | 模型可能无法完全复制体内复杂微环境,体外结果向临床转化存在局限 | 建立更贴近患者病情的模型以研究IPF发病机制和抗纤维化药物 | 人类原代肺成纤维细胞(健康与IPF)、多能干细胞来源的肺泡2型细胞(iAT2);包含SFTPC 173T突变及其同基因校正对照 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型、共培养系统 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本量,涉及多能干细胞系和原代成纤维细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 6049 | 2026-05-30 |
The unfolded protein response in progeria arteries originates from non-endothelial cell types
2026-02, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503485
PMID:41326174
|
研究论文 | 在早衰症动脉中,未折叠蛋白反应起源于非内皮细胞类型 | 首次通过内皮特异性HGPS小鼠模型,证明早衰症动脉中未折叠蛋白反应主要源于非内皮细胞,挑战了之前关于内皮细胞功能障碍的观点 | 未提及具体局限性 | 研究Hutchinson-Gilford早衰综合征中蛋白质稳态失衡对内皮细胞功能障碍的影响 | Hutchinson-Gilford早衰综合征小鼠模型的内皮细胞和主动脉组织 | 生物医学研究 | 早衰症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 早衰症小鼠主动脉组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序分析主动脉组织 |
| 6050 | 2026-05-30 |
Characterising the Periodontal Granulation Tissue Using scRNAseq
2026-02, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70048
PMID:41055332
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序表征牙周肉芽组织的细胞组成和分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序发现牙周肉芽组织中特有的NOTCH3阳性内皮细胞亚群,并揭示了其与骨化通路的关系;肉芽组织成纤维细胞呈现类似肿瘤相关成纤维细胞的前体状态 | 样本量较小(n=3),缺乏功能验证实验 | 揭示牙周肉芽组织形成的细胞组成和分子机制,寻找再生治疗的潜在靶点 | 牙周手术患者的肉芽组织样本 | 单细胞组学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例患者的牙周肉芽组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6051 | 2026-05-30 |
Periodontitis Induces Arterial Microbiota Shifts and Immune Dysregulation Contributing to Peripheral Vascular Inflammation
2026-02, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70055
PMID:41117288
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研究论文 | 探究牙周炎诱导的股动脉微生物群变化及其对免疫系统的影响,阐明牙周炎与外周动脉疾病之间关联的机制 | 首次揭示牙周炎通过改变动脉微生物群和免疫失调,特别是FABP4+内皮细胞在牙周炎与外周动脉疾病联系中的关键介导作用 | 仅使用小鼠模型,未在人体中验证结果;未详细探讨微生物群变化与免疫失调之间的直接因果关系 | 阐明牙周炎诱导外周血管炎症的机制,特别是动脉微生物群和免疫系统的变化 | 牙周炎模型小鼠的股动脉组织 | 机器学习 | 牙周炎,外周动脉疾病 | 2bRAD-M测序, 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 未明确提及样本数量 | Illumina | 2bRAD-M微生物组测序, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 2bRAD-M用于微生物组分析,单细胞RNA-seq用于免疫微环境表征 |
| 6052 | 2026-05-30 |
Thymic myeloid cells are heterogenous and include a novel population of transitional dendritic cells
2026-Jan-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250733
PMID:41123595
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研究论文 | 利用单细胞转录组学和谱系定义小鼠模型,发现胸腺髓系细胞具有异质性,并鉴定出一种新的过渡性树突状细胞群体 | 首次揭示传统认为的DC2细胞实际上由四个不同细胞谱系组成,并发现一种新型CX3CR1+过渡性树突状细胞 | 未明确指出,但可能涉及小鼠模型与人类的差异性及功能验证的局限性 | 探究胸腺髓系细胞的异质性、起源、发育和稳态维持机制 | 胸腺髓系细胞,包括树突状细胞和巨噬细胞 | 机器学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6053 | 2026-05-29 |
Single cell RNA sequencing revealed the mechanism underlying the increased osteogenic capacity of porcine BMSCs upon MSTN knockout
2026-Aug-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150202
PMID:42106014
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示MSTN基因敲除增强猪骨髓间充质干细胞成骨能力的机制 | 首次构建了早期培养猪BMSCs的单细胞转录组图谱,并在大型动物模型中阐明MSTN基因敲除增强BMSCs增殖和成骨潜能的机制 | 未提及明显局限性 | 研究MSTN基因敲除对猪骨髓间充质干细胞异质性和成骨能力的影响及机制 | 藏猪胫骨骨髓来源的骨髓间充质干细胞 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq, SCENIC, CellChat | NA | 单细胞转录组数据 | 来自野生型和MSTN基因敲除藏猪的BMSCs样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6054 | 2026-05-29 |
Immunoregulatory mechanisms underlying vitexin-mediated attenuation of concanavalin A-induced liver injury
2026-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158231
PMID:42054738
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞技术,揭示了牡荆素通过调节T细胞功能缓解ConA诱导的肝损伤的免疫调控机制 | 首次采用质谱流式与单细胞RNA测序联合策略,系统描绘牡荆素对肝脏免疫景观的重编程作用,特别是对T细胞亚群的转录异质性和通讯网络的精细解析 | 信息来源未提供具体局限性,可能包括动物模型与人类AIH的差异、剂量依赖性效应的明确机制等 | 探究牡荆素在自身免疫性肝炎中的免疫调节机制及治疗潜力 | ConA诱导的AIH小鼠模型中的肝脏免疫细胞,特别是T细胞亚群 | 数字化病理 | 自身免疫性肝炎 | 质谱流式细胞技术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 质谱流式细胞数据 | ConA诱导的AIH小鼠模型(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 采用质谱流式(CyTOF)与单细胞RNA测序(scRNA-seq)联合分析 |
| 6055 | 2026-05-29 |
Single-cell profiling uncovers kaempferol-mediated immunoregulation in the protection against experimental autoimmune hepatitis
2026-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158240
PMID:42066574
|
研究论文 | 通过单细胞分析揭示山奈酚在实验性自身免疫性肝炎中的免疫调节保护机制 | 首次利用单细胞RNA测序和CyTOF技术,在单细胞水平全面揭示山奈酚通过调控M2巨噬细胞扩增、上调Acod1和清除致病性CD8+记忆T细胞亚群缓解自身免疫性肝炎的免疫调节机制 | 基于小鼠模型,其结果向人类的转化需进一步验证;且未对山奈酚的剂量-效应关系及长期安全性进行探讨 | 探究山奈酚缓解实验性自身免疫性肝炎的治疗效果和免疫调节机制 | ConA诱导的实验性自身免疫性肝炎小鼠模型及其肝脏免疫微环境中的免疫细胞 | 免疫学,单细胞组学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序,CyTOF,抗体微阵列,多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,免疫细胞蛋白标志物数据,细胞因子数据 | 涉及ConA诱导的小鼠模型,具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用单细胞RNA测序和CyTOF技术,但未提及具体平台产品型号 |
| 6056 | 2026-05-29 |
Spatially resolved multi-omics reveals that paeoniflorin ameliorates IgA nephropathy via Oat, Aco1 and Fh-mediated metabolic reprogramming and tubuloimmune crosstalk
2026-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158263
PMID:42096999
|
研究论文 | 通过空间代谢组学和空间转录组学整合分析,揭示芍药苷通过Oat、Aco1和Fh介导的代谢重塑及肾小管-免疫交互改善IgA肾病的分子机制 | 首次采用空间多组学技术揭示芍药苷在IgA肾病中肾皮质区域特异的代谢重编程和转录调控机制,阐明了其通过干扰三羧酸循环及上调精氨酸和脯氨酸代谢发挥治疗作用 | 研究数据主要来源于大鼠模型,缺乏临床样本验证;空间多组学技术分辨率有限,可能遗漏部分细胞层面的异质性信息 | 阐明中药单体芍药苷治疗IgA肾病的空间分子机制 | IgA肾病大鼠模型及体外细胞实验 | 数字病理学 | IgA肾病 | 空间代谢组学、空间转录组学、多组学整合分析 | NA | 空间代谢数据、空间转录数据 | Wistar大鼠IgA肾病模型(具体数量未提及) | NA | 空间转录组学、空间代谢组学 | NA | NA |
| 6057 | 2026-05-29 |
Aqueous extract of Solanum nigrum L. restrains colorectal cancer progression by blocking cancer-associated fibroblast-induced STAT3-Annexin A2 signaling
2026-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158257
PMID:42097000
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现,龙葵水提物通过抑制STAT3-Annexin A2信号通路,阻断癌症相关成纤维细胞诱导的结直肠癌进展 | 首次整合单细胞RNA测序和TMT蛋白质组学,揭示龙葵活性成分(茄碱和茄边碱)通过直接靶向STAT3调控ANXA2转录,从而抑制结直肠癌转移的分子机制 | 未说明具体局限性 | 系统研究龙葵水提物的生物活性化学成分及其抗结直肠癌转移的分子机制 | 结直肠癌细胞及小鼠模型 | 机器学习 | 结直肠癌 | NGS, RNA-seq | NA | 图像, 文本 | 皮下异种移植瘤模型、APCMin/+小鼠、实验性转移模型等多种小鼠模型 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 散装RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | NA |
| 6058 | 2026-05-29 |
The Sig27 multigene stratifies breast cancer fatality risk via reflecting tumor-associated immune suppressive features
2026-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102820
PMID:42150332
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研究论文 | 本研究评估了源自前列腺癌的27基因面板Sig27在乳腺癌中的生物标志物潜力 | 首次证明Sig27多基因面板能够通过反映肿瘤相关免疫抑制特征来分层乳腺癌致死风险,并发现其预测价值在21种癌症类型中具有普适性 | 未提及具体局限性 | 评估Sig27基因面板在乳腺癌中的预后生物标志物潜力及其与免疫调控的关联 | 小鼠原位乳腺癌肿瘤、13,103例原发性乳腺癌、60例转移性乳腺癌、780例正常乳腺组织、肿瘤相关巨噬细胞、调节性T细胞和耗竭CD8⁺T细胞 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 13,103例原发性乳腺癌、60例转移性乳腺癌、780例正常乳腺组织、6734例批量RNA-seq样本、2716例乳腺癌样本 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6059 | 2026-05-29 |
Machine learning identifies key cells and therapeutic targets during ferroptosis after spinal cord injury
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00037
PMID:39104165
|
研究论文 | 利用机器学习识别脊髓损伤后铁死亡过程中的关键细胞及治疗靶点 | 首次通过机器学习算法(随机森林和LASSO)从转录组数据中筛选出Atf3和Piezo1作为脊髓损伤后铁死亡的关键基因,并结合单细胞RNA测序揭示其与巨噬细胞/小胶质细胞状态转变的密切关系,验证了低剂量环己酰亚胺的治疗效果 | 未提及明显局限性 | 探索脊髓损伤后铁死亡的细胞机制并寻找潜在治疗靶点 | 脊髓损伤后的巨噬细胞/小胶质细胞及其铁死亡相关基因表达 | 机器学习 | 脊髓损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接 | 随机森林, LASSO | 批量RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 | GSE47681、GSE5296批量RNA测序数据及GSE162610单细胞RNA测序数据;小鼠T8脊髓损伤模型 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6060 | 2026-05-29 |
RBAD: The first database dedicated alterations of blood RNA in individuals with Alzheimer's disease and their clinical relevance
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01165
PMID:40145964
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研究论文 | 开发了首个专注于阿尔茨海默病患者血液RNA变化的数据库RBAD,并分析了其临床相关性 | 首次构建了基于1468例血样、涵盖多种RNA测序数据的阿尔茨海默病血液RNA数据库,并整合了超过11百万次比较与关联分析 | 未在摘要中明确说明局限性 | 探究阿尔茨海默病患者血液RNA变化及其临床意义 | 阿尔茨海默病患者及小鼠模型的血液样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq, microRNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 1468例血液样本(来自人类和小鼠研究) | NA | bulk RNA-seq, microRNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |