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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6021 | 2026-05-30 |
DNA Hypomethylation of MIR21 Drives Hsa-miR-21-5p Expression in High-Grade Meningiomas and Reshapes Transcriptomic Signatures of Oncogenic Pathways and Intercellular Communication
2026-May-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104403
PMID:42196381
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研究论文 | 本研究探讨了MIR21基因DNA低甲基化如何驱动高级别脑膜瘤中hsa-miR-21-5p的表达,并重塑致癌通路和细胞间通讯的转录组特征 | 首次揭示了MIR21基因的DNA低甲基化在高级别脑膜瘤中驱动hsa-miR-21-5p过表达,并通过影响多个靶基因和肿瘤微环境中边界相关巨噬细胞的通讯来促进肿瘤生长 | 未明确提及该研究的局限性 | 阐明MIR21基因DNA低甲基化在高级别脑膜瘤中调控hsa-miR-21-5p表达及其对致癌通路和细胞间通讯的影响 | 不同WHO分级的脑膜瘤组织样本及KT21-MG1脑膜瘤细胞系 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | NA | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 良性、非典型和间变性脑膜瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 6022 | 2026-05-30 |
Integrated Transcriptomic and Spatial Analyses Associate M2-like Myeloid Signatures with Neuroimmune Remodeling in Alzheimer's Disease
2026-May-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104430
PMID:42196404
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研究论文 | 通过整合转录组和空间分析方法,发现M2样髓系特征与阿尔茨海默病的神经免疫重塑相关 | 首次综合使用批量转录组、单细胞RNA测序和空间转录组数据,跨Braak分期和疾病状态系统表征AD相关的髓系免疫变化,并利用免疫特征分类器识别区分AD与对照的髓系相关变量 | 研究仅揭示相关性而非因果关系,M2样髓系特征作为候选神经免疫成分仍需在人类相关系统中进行实验验证 | 阐明阿尔茨海默病中巨噬细胞和髓系状态随疾病严重程度的变化及其在神经免疫重塑中的作用 | 阿尔茨海默病患者的脑组织样本及相关转录组数据 | 机器学习和生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 批量转录组分析、单细胞RNA测序、空间转录组学、CellChat分析 | NA | 基因表达数据(转录组数据) | 涉及多个数据集,具体样本量未在摘要中说明 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6023 | 2026-05-30 |
Ligand-Receptor Interaction Combined with Histopathology Improves Glioma Prognostic Model
2026-May-14, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14051110
PMID:42193434
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研究论文 | 开发了一种整合配体-受体相互作用和深度学习的多模态框架,用于构建胶质母细胞瘤预后模型 | 首次将配体-受体相互作用组学与基于深度学习的病理组学结合,构建多模态预后模型,揭示了胶质瘤细胞间通讯的分子和空间景观 | NA | 通过整合配体-受体相互作用和病理学特征,改善胶质母细胞瘤的预后模型 | 胶质母细胞瘤患者转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据及H&E染色组织切片 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 空间转录组学 | 深度学习模型, Logistic回归 | 转录组数据, 基因表达数据, 图像(H&E染色切片) | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6024 | 2026-05-30 |
Uncovering the Targets of Pueraria Associated with Programmed Cell Death and the Construction of a Diagnostic Model in Septic Cardiomyopathy
2026-May-14, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14051114
PMID:42193439
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研究论文 | 本研究旨在揭示葛根在脓毒症心肌病中调节程序性细胞死亡的靶点,并构建诊断模型 | 首次整合14种程序性细胞死亡模式和171种机器学习算法组合,构建了基于葛根核心靶点的脓毒症心肌病诊断模型,并通过单细胞RNA测序揭示心肌免疫微环境中的细胞类型特异性表达 | 结论基于公开转录组数据集和有限的实验验证样本,模型在更大临床队列中的泛化性能需进一步评估 | 识别葛根在脓毒症心肌病中调节程序性细胞死亡的靶点,并构建可验证的诊断模型 | 脓毒症心肌病患者的血液样本和脂多糖诱导的脓毒症小鼠心脏组织 | 机器学习 | 脓毒症心肌病 | RNA-seq | 机器学习集成模型(171种算法组合) | 转录组数据 | 7个GEO转录组数据集、脓毒症心肌病患者血液样本、脂多糖诱导的小鼠心脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6025 | 2026-05-30 |
Temporally Resolved Single-Cell RNA Sequencing Reveals Pathogenesis and Immune Responses in Intracerebral Bacille Calmette-Guérin (BCG) Infection
2026-May-14, Pathogens (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/pathogens15050531
PMID:42198657
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研究论文 | 通过时间分辨的单细胞RNA测序揭示卡介苗颅内感染的发病机制和免疫反应 | 首次利用单细胞RNA测序技术时间分辨地解析了卡介苗颅内感染过程中细胞类型、通路和细胞间通讯的动态变化,并提出了血脑脊液屏障可能是分枝杆菌入侵的潜在途径 | 该研究仅在小鼠模型中进行,与人类颅内感染的相关性和差异尚需进一步验证 | 阐明卡介苗穿透中枢神经系统屏障的途径及感染过程中中枢神经系统免疫微环境的时间重塑模式 | 尾静脉注射卡介苗感染的小鼠脑组织 | 机器学习和单细胞组学 | 颅内感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠感染模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞测序平台用于全脑组织单细胞转录组分析 |
| 6026 | 2026-05-30 |
6-Bromoindole-3-acetonitrile Attenuates DSS-Induced Colitis by Inhibiting Epithelial Cell Pyroptosis
2026-May-12, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15101697
PMID:42195900
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研究论文 | 通过分析公共单细胞RNA测序数据,发现6-溴吲哚-3-乙腈通过抑制上皮细胞焦亡缓解DSS诱导的小鼠结肠炎 | 首次从海洋来源溴代吲哚中筛选出焦亡抑制剂6-溴吲哚-3-乙腈,并揭示其通过结合髓过氧化物酶(MPO)发挥抗炎作用的分子机制 | 研究基于临床前动物模型,结果需在临床环境中进一步验证 | 探索治疗溃疡性结肠炎的新策略,重点抑制上皮细胞焦亡 | DSS诱导结肠炎小鼠模型及小鼠结肠上皮细胞 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 公开数据集中的DSS诱导结肠炎小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 公开单细胞RNA测序数据集 |
| 6027 | 2026-05-30 |
Shared and Divergent Transcriptional Programs of Oligodendrocyte Differentiation Across Vertebrate Species Revealed by scRNA-seq Analysis
2026-May-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104283
PMID:42196265
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研究论文 | 通过跨物种单细胞转录组分析,揭示了脊椎动物少突胶质细胞分化的共享与分化转录程序 | 首次在五种脊椎动物(河豚、弹涂鱼、鸡、小鼠和人类)中系统比较少突胶质细胞分化轨迹,发现共享和物种特异的基因表达模块,并揭示羊膜动物在祖细胞阶段特异扩展的分化程序与陆地运动回路髓鞘形成需求相关 | 仅分析脊髓样本,未涵盖其他中枢神经系统区域;物种间细胞类型注释可能存在偏差;功能验证实验有限 | 解析少突胶质细胞分化程序在脊椎动物进化中的保守性和适应性变化 | 五种脊椎动物(河豚、弹涂鱼、鸡、小鼠和人类)脊髓中的少突胶质细胞谱系细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | CAME跨物种映射模型 | 单细胞转录组数据 | 五种脊椎动物脊髓样本(具体数量未在摘要中提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 6028 | 2026-05-30 |
Molecular Mechanism of POSTN Mediating M2 Polarization of Kupffer Cells to Promote Hepatic Fibrosis
2026-May-11, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph19050752
PMID:42198426
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研究论文 | 探讨POSTN介导库普弗细胞M2极化促进肝纤维化的分子机制 | 首次揭示POSTN通过调控库普弗细胞M2极化重塑肝脏微环境,并筛选出POSTN靶向抑制剂Rhodiosin | 未提及具体限制 | 研究POSTN在肝纤维化中的作用机制及潜在治疗靶点 | 库普弗细胞、LX-2细胞、POSTN条件敲除小鼠 | 机器学习 | 肝纤维化 | 单细胞测序、CCK-8实验、虚拟药物筛选 | CellChat | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6029 | 2026-05-30 |
The Current Landscape of Metastatic Breast Cancer: A Pathology Guide on Emerging Biomarkers
2026-May-10, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18101544
PMID:42192904
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综述 | 本文综述了转移性乳腺癌生物标志物检测的当前景观,包括常规标志物和新兴标志物,以及液体活检等技术进展 | 本文全面整合了最新临床指南与文献,强调了液体活检(如ctDNA分析)在实时监测和耐药检测中的重要性,并展望了AI和空间转录组学将推动病理学从静态诊断向动态预测模型转变 | 作为综述,未提供原始实验数据;新兴生物标志物如AI和空间转录组学的临床应用仍处于早期阶段 | 全面合成转移性乳腺癌生物标志物检测的当前景观,详细说明哪些生物标志物需要检测及其临床依据 | 转移性乳腺癌(MBC)患者及相关生物标志物 | 数字病理学 | 乳腺癌 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6030 | 2026-05-30 |
The Role of Next-Generation Sequencing in Cardiovascular Disease: A New Era of Precision Cardiology
2026-May-10, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life16050796
PMID:42195352
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综述 | 本文综述了下一代测序(NGS)如何推动心血管疾病的精准医疗,包括分子诊断、风险预测和新兴治疗应用 | 系统总结了NGS从单基因分析向综合遗传变异评估的转变,并讨论了长读长测序和单细胞测序等新技术的前景 | 未提供具体临床试验数据,主要基于现有文献综述,缺乏实证验证 | 探讨NGS在心血管疾病精准诊疗中的应用现状与未来方向 | 心血管疾病相关遗传变异及临床应用 | 机器学习 | 心血管疾病 | NGS,长读长测序,单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6031 | 2026-05-30 |
Molecular Target Discovery and Systemic Mechanism Analysis of Teriflunomide for Dry Eye Disease
2026-May-09, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48050492
PMID:42193097
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research paper | 采用整合计算与转录组学框架,包括ADMET分析、多数据集转录组整合及单细胞RNA测序,鉴定特立氟胺治疗干眼病的多靶点机制 | 首次应用虚拟细胞模型AetherCell模拟靶点扰动与药物诱导反应的吻合度,揭示特立氟胺通过协调多靶点调控发挥治疗作用的新机制 | NA | 探究特立氟胺治疗干眼病的分子靶点及系统机制 | 干眼病相关上皮细胞和免疫细胞 | machine learning | 干眼病 | 单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟 | AetherCell虚拟细胞模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6032 | 2026-05-30 |
Systematic clustering alignment and feature characterization for single-cell omics using ACE-OF-Clust
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.09.710668
PMID:41959377
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研究论文 | ACE-OF-Clust实现单细胞组学数据的系统性聚类对齐与特征表征 | 引入直接比较聚类解决方案、评估与标注的一致性,并利用特征级聚类剖面优先区分细胞类型的基因,同时评估基因集对聚类模式的贡献 | NA | 解决单细胞聚类中的聚类对齐问题,提高聚类结果的可解释性、灵活性和鲁棒性 | 单细胞转录组数据(scRNA-seq)和空间转录组(ST)数据,包括PBMC scRNA-seq和乳腺癌ST数据,以及多组学单细胞数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学单细胞测序 | 混合成员聚类模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、单细胞多组学 | NA | NA |
| 6033 | 2026-05-30 |
Cellular Origins and Context-Dependent Prognostic Effects of Lactate Metabolism Genes Reveal Novel Molecular Subtypes in Gastric Cancer
2026-May-04, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48050477
PMID:42193082
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研究论文 | 通过乳酸代谢相关基因揭示胃癌新型分子亚型及其细胞起源和背景依赖性预后效应 | 首次通过单细胞RNA-seq整合分析,揭示乳酸代谢关键基因HK2和FABP4在不同细胞类型中的起源,并发现FABP4的预后效应具有背景依赖性,颠覆了传统预后模型固定效应的认知 | 跨平台预后模型验证失败,表明单队列来源的特征具有局限性;需要更多外部队列验证FABP4的细胞起源依赖性功能 | 解析胃癌异质性中乳酸代谢重编程的贡献,重点关注关键基因的细胞来源和背景特异性功能 | 胃癌患者肿瘤样本(TCGA队列375例)及单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 共识聚类 | 基因表达数据 | 375例胃癌患者样本(TCGA) | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6034 | 2026-05-30 |
Artificial Intelligence for Spatial Immunometabolic Analysis of the Tumor Microenvironment: Current Evidence and Future Directions
2026-May-03, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48050476
PMID:42193081
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综述 | 综述了人工智能在肿瘤微环境空间免疫代谢分析中的当前证据和未来方向 | 系统梳理了基于AI的空间免疫代谢研究,涵盖数字病理学、空间转录组学和多模态数据融合,并提出了多模态基础模型、联邦学习和空间解析靶点发现等新兴趋势 | 数据异质性、模型可解释性、泛化性和生物学验证等挑战仍需解决 | 全面概述基于AI的肿瘤微环境空间免疫代谢研究,探讨现有证据和未来发展方向 | 肿瘤微环境中的空间免疫代谢特征 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学、代谢组学、多重成像、AI | NA | 图像、空间转录组数据、代谢组数据、多模态数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6035 | 2026-05-30 |
Integrated Evolutionary and Multi-Omic Analysis of STAT Family Activation Across Solid Tumors
2026-May-03, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17050547
PMID:42195004
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研究论文 | 对STAT家族在实体瘤中的激活进行综合进化与多组学分析 | 首次整合进化分析与多组学数据(转录组、调控子、单细胞及染色质结合)来解析STAT家族在实体瘤中的作用,揭示了STAT1非经典DNA识别模式 | 仅基于公开数据集,染色质结合分析限于干扰素刺激的细胞系,未进行体内验证 | 阐明STAT转录因子家族在实体瘤中的进化保守性及激活机制 | 人类实体瘤样本及正常组织 | 生物信息学 | 实体瘤 | 进化分析、转录组分析、调控子分析、单细胞RNA-seq、ChIP-seq | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、染色质免疫沉淀测序数据 | TCGA实体瘤样本与GTEx正常组织样本;HNSCC单细胞数据集;HeLa和K562细胞系 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 6036 | 2026-05-30 |
A Synthetic Lethality-Informed Multi-Omic Framework for Identifying a Five-Gene Diagnostic Signature in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2026-May-02, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48050475
PMID:42193080
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研究论文 | 利用合成致死信息的多组学框架识别慢性阻塞性肺疾病的五基因诊断标志物 | 首次将合成致死相关基因优先排序与多组学整合及机器学习方法相结合,用于识别COPD的诊断标志物 | 未提及 | 为慢性阻塞性肺疾病早期诊断和风险分层识别可靠的分子生物标志物 | 慢性阻塞性肺疾病患者和健康对照者的转录组数据 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫浸润分析, 体外实验 | LASSO回归, 随机森林 | 转录组数据 | 训练队列:220例COPD和108例对照;外部验证队列:98例COPD和91例对照 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6037 | 2026-05-30 |
Identification of RPA3 as a Potential Functional Effector of Chromosome 7 Gain in Glioblastoma
2026-Apr-30, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14051014
PMID:42193341
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研究论文 | 本研究鉴定RPA3为胶质母细胞瘤中7号染色体获得性扩增的一个潜在功能效应因子 | 首次识别RPA3作为7号染色体获得性扩增中除经典位点外的剂量敏感候选基因,并证明其在胶质母细胞瘤恶性表型中的功能相关性 | 基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证及临床试验数据支持 | 鉴定胶质母细胞瘤中7号染色体获得性扩增相关的额外候选基因及其功能 | 胶质母细胞瘤肿瘤样本及U87、U118胶质瘤细胞系 | 机器学习和生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq,拷贝数分析,单细胞RNA-seq,siRNA敲低 | NA | 转录组数据,拷贝数数据,临床数据,单细胞RNA-seq数据 | TCGA-GBM和TCGA-LGG队列,CGGA-693队列,单细胞分析中chr7获得性和正常拷贝肿瘤亚克隆 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 6038 | 2026-05-30 |
Putative Self-Organizing Human Corneal Organoids Recapitulate Human Corneal Architecture and Cellular Diversity
2026-Apr-29, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering13050518
PMID:42194275
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研究论文 | 开发了一种使用人胚胎干细胞通过改良SEAM方案生成三维角膜类器官模型,该模型能重现人类角膜的多层结构和细胞多样性 | 首次通过自发三维球体培养方法生成具有角膜上皮、基质和内皮分层结构的角膜类器官,单细胞RNA测序揭示18个不同细胞簇,包括三种角膜上皮亚群和两种基质亚群 | 仅约20%的类器官形成透明区域,未来需要提高类器官形成效率和功能成熟度 | 建立能重现人类角膜复杂细胞架构和多样性的三维角膜类器官模型,用于角膜发育、疾病建模和再生医学研究 | 人胚胎干细胞来源的角膜类器官 | 数字病理学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | 三维角膜类器官模型 | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | 7-8周分化培养的类器官样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3端测序平台用于分析类器官细胞组成和基因表达模式 |
| 6039 | 2026-05-30 |
Integrative Multi-Omics and Machine Learning Analysis Identifies Therapeutic Targets and Drug Repurposing Candidates for Alzheimer's Disease
2026-Apr-27, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14050998
PMID:42193325
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研究论文 | 通过整合多组学数据和机器学习方法,识别阿尔茨海默病的诊断生物标志物和治疗靶点,并筛选药物重利用候选分子 | 首次整合转录组学、单细胞RNA测序、孟德尔随机化和分子对接等多层分析方法,构建定量多组学收敛框架,系统识别免疫相关的治疗靶点及药物重利用候选物 | 所有预测均需在生化及细胞模型中进行实验验证后方可得出临床结论 | 开发整合多组学计算流程,识别阿尔茨海默病的诊断生物标志物并优先排序可药物干预的治疗靶点 | 阿尔茨海默病患者与健康对照的转录组数据、单细胞核RNA测序数据及FDA批准药物库 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 加权基因共表达网络分析、机器学习、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、贝叶斯共定位、分子对接、分子动力学模拟 | LASSO, 随机森林, 支持向量机 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 药物分子结构数据 | 1047个转录组样本(547例AD,500例对照)及48,481个单细胞核 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6040 | 2026-05-30 |
Mechanism of Xiao-ai-fei Honey Ointment, a Traditional Uyghur Multi-Ingredient Medicinal Preparation, Against Cervical Cancer Based on Network Pharmacology and In Vitro Evaluation of Anti-Cancer Activity
2026-Apr-27, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph19050686
PMID:42198359
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研究论文 | 通过网络药理学、单细胞RNA测序及体外实验,揭示了传统维吾尔药复方制剂消炎蜂蜜软膏(XAFHO)对抗宫颈癌的分子机制 | 首次结合网络药理学、单细胞RNA测序和体外实验,系统阐明了XAFHO通过多靶点、多细胞途径抗宫颈癌的作用机制,并鉴定出11个基因的预后模型 | 研究主要依赖数据库分析和体外实验,尚缺乏体内动物实验及临床样本验证 | 探究消炎蜂蜜软膏(XAFHO)抗宫颈癌的潜在分子机制 | 宫颈癌细胞系(HeLa和SiHa)、TCGA及GEO数据库中的宫颈癌转录组数据 | 计算机视觉 | 宫颈癌 | NA | LASSO回归、Cox回归 | 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据 | TCGA数据库中的宫颈癌样本(未明确具体数量)及单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |